第2章生物信息学的计算机基础3(2)
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信息在计算机内得以组织并通过网络加以利 用，数字图书馆带有选择信息、组织信息、 存储信息和发布信息的程序。
2019/11/26
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建立数字图书馆的主要原因是人们相信 数字图书馆能够比过去的模式更好地应用信 息。其潜在的优点有:
2019/11/26
4
www(world wide web)
由欧洲粒子研究中心发起。
其初衷是为了让科学家们以更方便的方式彼此
交流思想和研究成果，目前已成为一种最受欢
迎的游览工具。 WWW主要由一些应用软件以及一系列协议和
约定组成，使用超文本和多媒体技术，在计算 机网络上进行超文本信息的发布019/11/26
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3、HTTP：是WWW浏览器和服务器之间传 送消息的协议，它基于客户机/服务器模型的 信息分布方式，按原本设计意思“请求/响应 模型”，即信息文件存放在服务器上，用户 通过程序向服务器发出请求并访问服务器上 的数据。
分配B类IP地址的国际组织有三个：ENIC负责 欧洲地区的分配工作，InterNIC负责北美地区，设 在日本东京大学的APNIC负责亚太地区。我国的 Internet地址由APNIC分配(B类地址)，由邮电部数 据通信局或相应网管机构向APNIC申请地址。
3)分配C类地址。
由地区网络中心向国家级网管中心(如 CHINANET的NIC)申请分配。
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域名系统（domain name system, DNS）
域名末尾部分为一级域，代表国家或机构等节 点； 域名的倒数第二部分为二级域，代表部门或隶 属于一级域的下级机构； 如：, 其中
•cn为最高域，代表中国 •为第二级域，代表中国教育与科研网 •为第三级域，代表南京林业大学
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从WWW到XML (extensible markup
language)
以XML为基础的新一代WWW环境可以更好 地实现Web中的信息共享与交换，XML可看 作一种半结构化的数据模型，可以很容易地 将XML的文档描述与关系数据库中的属性对 应起来，实施精确的查询与模型抽取。
2019/11/26
2
2.2.7 与Internet的连接方式
拨号上网连接
用户终端
电话线
Modem
Modem
局域网直接连接
远程服务器
局域网
2019/11/26
路由器
专用通信线路 远程服务器
3
2.2.8 Internet 提供的服务
主机远程登录 FTP：远程文件传送 E-mail FTP (文件转输协议) 安装和使用Serv-U (Ftp服务器软件) 安装和使用AbsoluteFtp （Ftp客户端软件） USENET：电子公告板
2019/11/26
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4. MINE类型：计算机上的数据文件只是二进 制数位的集合，必须经过解释才有用。例如， 为了正确显示文件“index.html "，浏览器必 须知道它是HTML格式。
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5、网页网页是用户通过客户端浏览器 观察到的超文本信息内容。
简单的静态网页 图文并茂网页 动态网页
HTML可以说明文字、图形、动画、声音、表格、 链接等。
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2、URL（uniform resource locator，统一资 源定位器)是WWW上简单的寻址机制，使得 W能够连接世界各地计算机上的信息。URL 的格式从左到右由下面各部分组成：模式、 服务器地址、端口、路径等组成。
2019/11/26
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XML是由W3C设计的一种元标注语言，可提供资料 的结构化描述能力。具体来说，XML类似于HTML， 被设计用来描述数据，但XML提供了一种独立的运 行程序的方法来共享数据。
XML与HTML更大的区别可能体现在它明确地区分 了文档的内容和表现这两个概念。XML文档专注于 内容，而这些内容的表现则有相应的扩展样式表 XSL来规定。因此，同样的内容可以有不同的表现， 甚至还能够对内容进行不同的取舍。
2019/11/26
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在寻求有效管理网上海量信息的探索中，人 们还提出了数字图书馆的解决方案。数字图 书馆可理解为有组织的信息收藏及相关服务， 信息以数字化形式保存，并通过网络进行访 问。数字图书馆包含各式各样的可用数据， 供不同用户使用，规模可大可小，并可使用 各类计算设备和相关软件。但所有数字图书 馆都有着共同的特点：
2019/11/26
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2.3 Internet 上的高级信息管理
Web上的数据最大特点就是结构化特征较 弱.往往是半结构化的，有时还可能是无结 构的。
为有效利用WWW上的数据，需要处理半 结构化数据源，解决半结构化数据的查询 与集成问题。寻找一个半结构化的数据模 型是解决问题的关键所在。
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提供： 文本、图像、声音和视频等信息 也提供基本的Internet服务
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WWW使用的几项关键技术和基本元素包括:
1. HTML ( hypertext markup language ,超文本标记 语言)
设计HTML语言的目的是为了能把存放在一台电 脑中的文本或图形与另一台电脑中的文本或图形方 便地联系在一起，形成有机的整体，人们不用考虑 具体信息是在当前电脑上还是在网络的其他电脑上。 这样你只要使用鼠标在某一文档中点取一个图标， Internet就会马上转到与此图标相关的内容上去，而 这些信息可能存放在网络的另一台电脑中。
IP地址由国际组织按级别统一分配，机构用户在申 请入网时可以获取相应的IP地址。
1)Network Information Center(NIC)。
最高一级IP地址由国际网络信息中心(NIC)负
责分配。其职责是分配A类IP地址、授权分配B类
IP地址的组织并有权刷新IP地址。
2)InterNIC、APNIC和ENIC。
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建立数字图书馆的主要原因是人们相信 数字图书馆能够比过去的模式更好地应用信 息。其潜在的优点有:
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www(world wide web)
由欧洲粒子研究中心发起。
其初衷是为了让科学家们以更方便的方式彼此
交流思想和研究成果，目前已成为一种最受欢
迎的游览工具。 WWW主要由一些应用软件以及一系列协议和
约定组成，使用超文本和多媒体技术，在计算 机网络上进行超文本信息的发布019/11/26
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3、HTTP：是WWW浏览器和服务器之间传 送消息的协议，它基于客户机/服务器模型的 信息分布方式，按原本设计意思“请求/响应 模型”，即信息文件存放在服务器上，用户 通过程序向服务器发出请求并访问服务器上 的数据。
分配B类IP地址的国际组织有三个：ENIC负责 欧洲地区的分配工作，InterNIC负责北美地区，设 在日本东京大学的APNIC负责亚太地区。我国的 Internet地址由APNIC分配(B类地址)，由邮电部数 据通信局或相应网管机构向APNIC申请地址。
3)分配C类地址。
由地区网络中心向国家级网管中心(如 CHINANET的NIC)申请分配。
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域名系统（domain name system, DNS）
域名末尾部分为一级域，代表国家或机构等节 点； 域名的倒数第二部分为二级域，代表部门或隶 属于一级域的下级机构； 如：, 其中
•cn为最高域，代表中国 •为第二级域，代表中国教育与科研网 •为第三级域，代表南京林业大学
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从WWW到XML (extensible markup
language)
以XML为基础的新一代WWW环境可以更好 地实现Web中的信息共享与交换，XML可看 作一种半结构化的数据模型，可以很容易地 将XML的文档描述与关系数据库中的属性对 应起来，实施精确的查询与模型抽取。
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2.2.7 与Internet的连接方式
拨号上网连接
用户终端
电话线
Modem
Modem
局域网直接连接
远程服务器
局域网
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路由器
专用通信线路 远程服务器
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2.2.8 Internet 提供的服务
主机远程登录 FTP：远程文件传送 E-mail FTP (文件转输协议) 安装和使用Serv-U (Ftp服务器软件) 安装和使用AbsoluteFtp （Ftp客户端软件） USENET：电子公告板
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4. MINE类型：计算机上的数据文件只是二进 制数位的集合，必须经过解释才有用。例如， 为了正确显示文件“index.html "，浏览器必 须知道它是HTML格式。
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5、网页网页是用户通过客户端浏览器 观察到的超文本信息内容。
简单的静态网页 图文并茂网页 动态网页
HTML可以说明文字、图形、动画、声音、表格、 链接等。
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2、URL（uniform resource locator，统一资 源定位器)是WWW上简单的寻址机制，使得 W能够连接世界各地计算机上的信息。URL 的格式从左到右由下面各部分组成：模式、 服务器地址、端口、路径等组成。
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XML是由W3C设计的一种元标注语言，可提供资料 的结构化描述能力。具体来说，XML类似于HTML， 被设计用来描述数据，但XML提供了一种独立的运 行程序的方法来共享数据。
XML与HTML更大的区别可能体现在它明确地区分 了文档的内容和表现这两个概念。XML文档专注于 内容，而这些内容的表现则有相应的扩展样式表 XSL来规定。因此，同样的内容可以有不同的表现， 甚至还能够对内容进行不同的取舍。
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在寻求有效管理网上海量信息的探索中，人 们还提出了数字图书馆的解决方案。数字图 书馆可理解为有组织的信息收藏及相关服务， 信息以数字化形式保存，并通过网络进行访 问。数字图书馆包含各式各样的可用数据， 供不同用户使用，规模可大可小，并可使用 各类计算设备和相关软件。但所有数字图书 馆都有着共同的特点：
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2.3 Internet 上的高级信息管理
Web上的数据最大特点就是结构化特征较 弱.往往是半结构化的，有时还可能是无结 构的。
为有效利用WWW上的数据，需要处理半 结构化数据源，解决半结构化数据的查询 与集成问题。寻找一个半结构化的数据模 型是解决问题的关键所在。
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提供： 文本、图像、声音和视频等信息 也提供基本的Internet服务
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WWW使用的几项关键技术和基本元素包括:
1. HTML ( hypertext markup language ,超文本标记 语言)
设计HTML语言的目的是为了能把存放在一台电 脑中的文本或图形与另一台电脑中的文本或图形方 便地联系在一起，形成有机的整体，人们不用考虑 具体信息是在当前电脑上还是在网络的其他电脑上。 这样你只要使用鼠标在某一文档中点取一个图标， Internet就会马上转到与此图标相关的内容上去，而 这些信息可能存放在网络的另一台电脑中。
IP地址由国际组织按级别统一分配，机构用户在申 请入网时可以获取相应的IP地址。
1)Network Information Center(NIC)。
最高一级IP地址由国际网络信息中心(NIC)负
责分配。其职责是分配A类IP地址、授权分配B类
IP地址的组织并有权刷新IP地址。
2)InterNIC、APNIC和ENIC。