家畜育种学实验七畜群近交程度的计算

家畜育种学实验七畜群近交程度的计
算
实验七畜群近交程度的计算
和群体有效含量的计算
一、实习目的
掌握畜群近交程度的估算方法
熟悉并掌握不同情况下的群体有效含量计算方法。

二、内容与方法
畜群近交程度的估算
公母畜群不等、随机留种情况下的群体有效含量
公母比例相等而留种方式不同的情况下的群体有效含量
公母畜群不等、各家系等数留种情况下的群体有效含量
(一)畜群近交程度的估算
1.畜群规模不大，求出每个个体的近交系数，再计算其平均值。

2.当畜群很大时，可用随机抽样的方法，抽取一定数量的家畜，逐个计算其近交系数，然后用样本平均数来代表畜群的平均近交系数。

3.将畜群中的个体按近交程度分类(抽样或全体)，求出每类的近交系数，再以其加权平均数，来代表畜群的平均近交系数。

4.对于多年不引进种畜的闭锁畜群，平均近交系数可采用下面的近似公式进行估计：
：表示畜群平均近交系数的每代数量；
NS：表示每代参加配种的公畜数；
ND：表示每代参加配种的母畜数。

畜群中的母畜数，一般数量较大，所以值很小，当母畜在12头以上时，以部分可忽略不计，此时的公式可简化成：
所以，只要能知道该畜群的种公畜数NS，就可以计算每代近交系数的增量，也就是畜群中基因纯合的分数。

例如当：NS=1，则=12.5%NS=2，则=6.25%
NS=3，则=4.17%NS=4，则=3.13%
NS=5，则=2.5%
(二)公母畜群不等、随机留种情况下的群体有效含量
当公母畜两性数目相差很大的情况下，此时即可计算其调和均数，取调和
均数的2倍，就得到有效头数。

Ne：代表群体有效含量；
NS：代表公畜数量：
ND：代表母畜数量：
：代表近交速率，亦即每代近交增量。

示例：试计算一个10头公猪50头母猪的猪群，它的群体有效含量与近交
增量?
代入公式后则得：
这一有效含量33.3的意思是说，这猪群的公母猪总数虽为60(Nb=60)头，但由于两性数目不等(10♂：50♀)，其基因丢失概率与近交速率，和总数只有33.3头且公母各半的理想群体相同。

因此，只有把两性数目控制在1：1的情况下，才能作到Ne=Nb。

留种方式有随机留种和各家系等数留种两种。

由于留种方式不同，不同父母所留下的后代数有多有少，这就会直接影响群体有效含量的大小。

这时计算群体有效含量大小的公式是：
(三)公母比例相等而留种方式不同的情况下的群体有效含量
N：代表群体实际含量，公母畜各半。

：代表各家系的子代在留种群体中供量的方差。

1.随机留种时.
各个家系留下的后代数目的多少是一个普哇松分布，即可估计其方差等于各家系留种的平均数，即为2，这时：
其结果是群体有效大小，即为繁殖群体的大小。

2.各家系等数留种时.
每家系都留一公一母，彼此间的供量没有差异，
=0，这时：
其结果是群体有效含量增加1倍。

(四)公母畜群不等、各家系等数留种情况下的群体有效含量
在生产中采用公母畜各半的留种方式，经济上很不合算，谁都打算公畜少留一些假如两性的数目不等，公的NS头，母的ND头，但选留作种用的个体，在数目上和性别比例上，仍然保持各家系相同，这时各家系供量的方差仍然是0，于是可用下列公式求得群体有效含量。

示例：仍以10头公猪和50头母猪的猪群为例。

已知，当采用随机留种法时，算得的群体有效含量是33.3头，每代近交增量是1.5%。

今拟改用各家系等数留种法，其群体有较含量和每代近交增量应是多少?
通过比较可以看出，采用随机留种时的群体有效含量，只相当于采用各家系等数留种法时的2/3，因而近交系数随世代上升的速度也要加快50%。

这就说明，为欲取得保种的成功，以采用各家系等数留种法为好。

三、作业
(一)在一个100头牛的畜群中，按近交程度分类，属于祖孙交配的17头，半同胞交配的有35头，全同胞交配的有28头，父女交配的有8头，其余全为叔侄或姑侄交配，试计算其畜群平均近交系数。

(二)在一个50头乳牛的牛场，计划将畜群的近交系数增量控制在每代
3.2%，试问需要利用几头公牛才能达到此目的?试问当畜群近交系数增加到10%时，需要经过多少年?
(三)今有一个由2000头母牛和20头公牛组成的封闭牛群，
试计算(1)当20头公牛都用于本交时的牛群有效含量；
(2)采用人工授精后配种公牛减至5头时的牛群有效含量；
(3)采用和不采用人工授精时的近交速率。