R语言在环境流行病学数据处理中的应用--以空气污染健康影响研究为例

R语言在环境流行病学数据处理中的应用--以空气污染健康影
响研究为例
汤文斌;李徐凤;王玉斐;杨亮;郑浩
【期刊名称】《环境卫生学杂志》
【年(卷),期】2024(14)1
【摘要】目的探索R语言tidyverse程序包(package)在环境流行病学数据处理中的应用,实现基于个人地址信息的空气污染个体暴露评估,交流tidyverse程序包使用经验。

方法计算机模拟南京市2017—2019年心脑血管死亡数据,从网络在线获取南京市2017—2019年气象、环境污染监测数据,通过tidyverse中dplyr程序包进行数据的筛选、连接、汇总等操作;使用tidyr程序包进行数据的变形和转换;使用purrr实现遍历循环;使用经纬度计算最近监测站点暴露和反距离插值暴露。

结果使用rvest程序包的爬虫技术批量获取气象、环境污染物监测数据等数据;使用tidy、purrr程序包进行数据清洗;使用geosphere程序包处理空间数据,通过计算最近站点和反距离插值的方式评估个体暴露。

结论R语言tidyverse相较于基础包拥有一致的语法、高效的数据处理能力、易于掌握等优点;在环境流行病学研究中使用tidyverse进行数据清洗、汇总统计、暴露计算等数据处理能有效地提高效率;本研究提供了采用R语言tidyverse程序包进行反距离加权计算等数据处理的计算机代码,实现了对个体逐日空气污染物暴露的评估方法,为进行空气污染物暴露评估提供了有效的工具。

【总页数】10页(P19-28)
【作者】汤文斌;李徐凤;王玉斐;杨亮;郑浩
【作者单位】常州市金坛区疾病预防控制中心;江苏省疾病预防控制中心
【正文语种】中文
【中图分类】R122
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