PK法提全血DNA步骤
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
PK法提全血DNA(蛋白酶K法)
一、试验原理:
苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA 的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋白中游离出来。
DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。
蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。
当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。
离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。
酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。
氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。
抽提后的DNA 溶液用2倍体积的无水乙醇在1/10 3mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。
二、步骤:
1、1ml EDTA-Na2抗凝血于10ml离心管中,加3体积1×RBC裂解液混匀,冰浴30min.
2、4度10000 rpm离心10min,弃上清,加入1ml 1×细胞核裂解液(混匀,把沉淀摇起来),再加2ml 1×细胞核裂解液和150µl 20%SDS 摇匀,直至出现粘稠透明状,加20µl 16mg/mlPK,摇匀,37度消化6h以上或者过夜(摇床160r/min).
3、加等体积饱和酚,轻摇混匀,室温10000rpm 10min.
4、用去头的吸头小心将上清液移至另一离心管中(宁少勿多),加等体积(吸下层)酚/氯仿(1:1 V/V)混匀,4度10000rpm 10min.
5、小心移上清液,若上清液不清亮透明,则用等体积氯仿再抽提一次。
6、将上清液移入另一离心管中,加入2倍体积无水乙醇,摇匀,见白色絮状DNA,10000rpm 10min.
7、去掉大部分上清,摇匀,将DNA转到EP管中,12000rpm 10min.
8、去上清,用70%乙醇洗(加1ml, 12000rpm 10min)2次.
9、室温干燥5min,再将DNA溶于50µl 1×TE中。
(TE溶解4度可存放一年,若需长期保存,则需加2倍体积无水乙醇-70度保存)注:
1、20%SDS用之前应先放到水溶锅溶解沉淀
2、饱和酚是用Tris饱和的,Tris碱和HCL混合得Tris-HCL,pH 在8.0左右,可用来调pH.
3、酚/氯仿(1:1 V/V)混合液分两层,应吸下层氯仿。
试剂配方:
10×RBC裂解液:
NH4Cl 8.29g
KHCO3 1.0g
EDTA 0.037g
加ddH2O至100ml
高压灭菌,4度保存
1×细胞核裂解液:
2Mol Tris-HCL Ph 8.2 0.5ml
4Mol NaCl 10ml
2mMol EDTA 0.4ml
加ddH2O至100ml
高压灭菌,4度保存
10×TE(Tris-HCl-EDTA):
Tris-HCl(pH 8.0) 1mol/L 100ml
EDTA 1mmol 500mmol/L 20ml
加蒸馏水至1L,高压灭菌,室温保存
(学习的目的是增长知识,提高能力,相信一分耕耘一分收获,努力就一定可以获得应有的回报)。