R语言初步 统计绘图与编程

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r语言编程例子

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r语言编程例子标题:R语言编程例子1. 使用R语言进行数据清洗和处理R语言是一种广泛应用于数据分析和统计建模的编程语言。

通过使用R语言,我们可以对数据进行清洗和处理,以便进行进一步的分析和建模。

例如,我们可以使用R语言来删除缺失值、处理异常值、标准化数据等。

2. 使用R语言进行数据可视化R语言提供了丰富的数据可视化功能,可以帮助我们更好地理解数据和发现其中的模式和趋势。

例如,我们可以使用R语言绘制折线图、柱状图、散点图等来展示数据的分布和关系。

3. 使用R语言进行回归分析回归分析是统计学中常用的一种方法,用于研究因变量与一个或多个自变量之间的关系。

通过使用R语言,我们可以进行简单线性回归、多元线性回归等分析,并得出相应的模型和结果。

4. 使用R语言进行分类和聚类分析分类和聚类分析是机器学习和数据挖掘中常用的方法,用于将数据样本划分为不同的类别或群组。

通过使用R语言,我们可以进行K 均值聚类、层次聚类、支持向量机等分析,并得出相应的分类或聚类结果。

5. 使用R语言进行时间序列分析时间序列分析是研究时间相关数据的一种统计方法,常用于预测和模型建立。

通过使用R语言,我们可以进行时间序列的平稳性检验、自相关分析、移动平均模型等分析,并进行相应的预测。

6. 使用R语言进行机器学习机器学习是一种通过训练模型来使计算机能够自动学习和改进的方法。

通过使用R语言中的机器学习库,如caret、randomForest等,我们可以进行分类、回归、聚类等任务,并得出相应的模型和预测结果。

7. 使用R语言进行文本挖掘文本挖掘是从大量的文本数据中发现有用信息的一种方法。

通过使用R语言中的tm、wordcloud等库,我们可以进行文本的清洗、分词、主题建模等分析,并得出相应的结论。

8. 使用R语言进行网络分析网络分析是研究网络结构和关系的一种方法,常用于社交网络、互联网等领域。

通过使用R语言中的igraph、network等库,我们可以进行网络的可视化、中心性分析、社区发现等分析,并得出相应的结论。

RStudioR语言与统计分析实验报告

RStudioR语言与统计分析实验报告

RStudioR语言与统计分析实验报告1. 实验目的本实验旨在介绍RStudio软件和R语言在统计分析中的应用。

通过本实验,可以了解RStudio的基本功能和操作,掌握R语言的基本语法和常用函数,并在实际数据分析中应用所学知识。

2. 实验环境与工具本实验使用RStudio软件进行实验操作。

RStudio是一个集成开发环境(IDE),专门用于R语言编程和统计分析。

它提供了代码编辑器、调试器、数据可视化工具等一系列功能,便于用户进行数据处理和分析。

3. 实验步骤本实验分为以下几个步骤:3.1 安装R和RStudio在开始实验之前,需要先安装R语言和RStudio软件。

R语言是一种统计分析和数据挖掘的编程语言,而RStudio是R语言的集成开发环境。

3.2 RStudio界面介绍在打开RStudio后,可以看到主要分为四个区域:代码编辑器、控制台、环境和帮助。

代码编辑器用于编写R语言代码,控制台用于执行和查看代码运行结果,环境用于查看和管理数据对象,帮助用于查阅R语言文档和函数说明。

3.3 R语言基础研究R语言的基本语法和常用函数是使用RStudio进行统计分析的基础。

实验中将介绍R语言的数据类型、赋值操作、条件语句、循环语句等基本概念,并演示常用函数的使用方法。

3.4 实际数据分析应用通过实际数据分析案例,将R语言和RStudio运用到实际问题中。

根据给定的数据,使用R语言进行数据处理、探索性分析和统计模型建立,并通过可视化工具展示分析结果。

4. 实验总结通过完成本实验,我们了解了RStudio软件和R语言在统计分析中的应用。

掌握了RStudio的基本功能和操作,熟悉了R语言的基本语法和常用函数。

通过实际数据分析案例的应用,提高了数据处理和统计分析能力。

5. 参考资料。

R统计分析教程

R统计分析教程

R统计分析教程第一章:介绍R统计分析工具R是一种免费且开源的统计分析工具,广泛应用于数据科学、机器学习和统计学等领域。

它具有强大的数据处理和可视化能力,以及丰富的统计函数库,可以处理各种复杂的统计分析任务。

本教程将详细介绍R的基本用法和常用统计分析技巧。

第二章:R语言基础在开始R统计分析之前,我们首先需要了解一些基础的R语言知识。

R语言是一种面向数据分析的编程语言,具有数据结构、条件判断、循环和函数等基本语法。

本章将介绍R语言的基本数据类型、变量赋值、运算符和逻辑控制等内容。

第三章:数据导入和处理在进行统计分析之前,我们通常需要将数据导入到R中并进行预处理。

本章将介绍如何使用R中的函数来读取和导入常见的数据文件,如CSV、Excel和数据库等。

同时,还将介绍数据清洗、缺失值处理和异常值检测等常用数据处理技巧。

第四章:数据可视化数据可视化是数据分析过程中非常重要的一步,它可以帮助我们更好地理解数据的特征和趋势。

R提供了多种绘图函数,可以生成各种类型的图表,如散点图、折线图、柱状图和箱线图等。

本章将详细介绍如何使用R进行数据可视化,以及如何调整图形的样式和布局。

第五章:描述统计分析描述统计分析是对数据进行总结和描绘的一种方法,它包括均值、中位数、标准差、百分位数等统计指标的计算,以及频数分布表和直方图的绘制等内容。

本章将介绍R中常用的描述统计分析函数和技巧,并通过实例演示其应用。

第六章:推断统计分析推断统计分析是用于从样本数据中推断总体特征的一种方法。

它包括假设检验、置信区间估计和相关性分析等内容。

本章将介绍R中常用的推断统计分析函数和技巧,并通过实例演示如何对样本数据进行推断。

第七章:线性回归和方差分析线性回归和方差分析是常用的统计建模方法,用于研究变量之间的关系和差异。

本章将介绍如何使用R进行线性回归分析和方差分析,并解释如何解释模型结果和进行假设检验。

第八章:其他常用统计方法除了以上介绍的统计分析方法外,R还提供了许多其他常用的统计方法,如非参数检验、逻辑回归和时间序列分析等。

R语言入门(经典)

R语言入门(经典)
以vegan包为例,CRAN提供了: Package source: vegan_1.15-3.tar.gz MacOS X binary: vegan_1.15-3.tgz Windows binary: vegan_1.15-3.zip Reference manual: vegan.pdf 等 Window平台下程序包为zip文件,安装时不要解压缩。
查看帮助文件
1 help("t.test") 2 ?t.test 3 help.search("t.test") 4 apropos("t.test") 5 RGui>Help>Html help 6 查看R包pdf手册
帮助文件的内容
以lm函数为例: lm(stats) #函数名及所在包 Fitting Linear Models # 标题 Description #函数描述 Usage # 默认选项 Arguments # 参数 Details # 详情 Author(s) # 作者 References # 参考文献 Examples # 举例
boxplot(count ~ spray, data = InsectSprays) boxplot(count ~ spray, data = InsectSprays, col = "red")
R函数调用及其选项
函数的调用方法, 函数名+() 如 plot(), lm(),并 将对象放入括号中,“=”表示设定参数。例如:
txt文件,制表符间隔 csv文件,逗号间隔 一些R程序包(如foreign)也提供了直接读取 Excel, SAS, dbf, Matlab, spss, systat, Minitab文件的函数。

R语言学习笔记内附实例及代码

R语言学习笔记内附实例及代码

R语言入门R是开源的统计绘图软件,也是一种脚本语言,有大量的程序包可以利用。

R中的向量、列表、数组、函数等都是对象,可以方便的查询和引用,并进行条件筛选。

R具有精确控制的绘图功能,生成的图可以另存为多种格式。

R编写函数无需声明变量的类型,能利用循环、条件语句,控制程序的流程。

R网络资源:R主页:R资源列表NCEASR Graphical Manual统计之都:QuikR丁国徽的R文档:R语言中文论坛一、用函数install.packages(),[直接输入就可以联网,第一次的话之后选择镜像,然后选择包下载即可]如果已经连接到互联网,在括号中输入要安装的程序包名称,选择镜像后,程序将自动下载并安装程序包。

例如:要安装picante包,在控制台中输入install.packages("picante")已经安装了?二. 安装本地zip包路径:Packages>install packages from local files选择本地磁盘上存储zip包的文件夹。

(文件,运行R的脚本,选择所在文档)三.调用程序包在控制台中输入如下命令library(“picnate”)程序包内的函数的用法与R内置的基本函数用法一样。

四.程序包内部都有哪些函数?分别有什么功能?查询程序包内容最常用的方法:1 菜单帮助>Html帮助;2 查看pdf帮助文档五.查看函数的帮助文件函数的默认值是什么?怎么使用?使用时需要注意什么问题?需要查询函数的帮助。

1 ?t.test 直接打开相关函数的说明和使用模板。

2 RGui>Help>Html help 同样的效果,同上3 apropos("t.test")合理使用T 检验,五种模式的T 检验4 help("t.test")帮助同1-25 help.search("t.test")有关T 检验的一切东西都可以查出来。

r语言编程例子

r语言编程例子

r语言编程例子R语言是一种用于数据分析和统计建模的编程语言,它提供了强大的数据处理和可视化能力。

下面是一些以R语言编程为题的例子,旨在描述如何使用R语言解决各种实际问题。

1. 数据清洗和处理在数据分析过程中,数据清洗和处理是非常重要的一步。

通过使用R语言的各种数据处理函数和包,可以对数据进行去重、缺失值处理、异常值处理等操作。

例如,可以使用dplyr包中的filter()函数来筛选出符合特定条件的数据,使用tidyr包中的gather()函数将宽表转换为长表等。

2. 数据可视化R语言提供了丰富的数据可视化函数和包,可以帮助我们将数据转化为图表、图形等形式,更直观地展示和传达数据的含义。

例如,可以使用ggplot2包来创建各种类型的图表,如散点图、折线图、柱状图等,以及使用ggmap包来绘制地理信息图。

3. 统计分析R语言是一种广泛应用于统计建模和数据分析的语言。

通过使用R 语言的统计分析函数和包,可以进行各种统计分析,如描述性统计、假设检验、回归分析等。

例如,可以使用lm()函数进行线性回归分析,使用t.test()函数进行单样本或双样本t检验等。

4. 机器学习R语言也是一种常用于机器学习的语言,提供了许多机器学习算法的实现。

通过使用R语言的机器学习包,可以进行分类、聚类、预测等任务。

例如,可以使用caret包来进行特征选择、模型训练和评估等。

5. 文本挖掘R语言也可以用于文本挖掘和自然语言处理。

通过使用R语言的文本挖掘包,可以对文本数据进行分词、情感分析、主题建模等操作。

例如,可以使用tm包进行文本预处理,使用topicmodels包进行主题建模等。

6. 时间序列分析R语言提供了丰富的时间序列分析函数和包,可以用于分析和预测时间序列数据。

例如,可以使用forecast包进行时间序列预测,使用tseries包进行时间序列模型诊断等。

7. 数据交互和数据库操作R语言支持与各种数据库进行交互和操作。

使用R语言进行数据分析和统计建模

使用R语言进行数据分析和统计建模

使用R语言进行数据分析和统计建模R语言是一种统计与数据分析的编程语言,广泛应用于各个领域的数据分析和建模工作中。

它提供了丰富的数据处理、统计推断、机器学习和可视化的功能,使得数据分析和统计建模变得更加高效和准确。

本文将介绍R语言的基本用法,并结合实例演示如何使用R语言进行数据分析和统计建模。

1. 数据准备在进行数据分析和统计建模前,首先需要准备好需要分析的数据。

数据可以来自于各种渠道,比如文件导入、数据库连接、API接口等。

R语言提供了多种读取数据的函数和包,可以方便地导入各种数据格式,如CSV、Excel、数据库等。

在导入数据后,一般需要对数据进行一些预处理,包括数据清洗、缺失值处理、异常值处理等。

R语言中有丰富的数据处理函数和包,可以帮助我们完成这些工作。

2. 数据分析数据分析是对数据进行统计、计算和可视化的过程,旨在发现数据中的规律和趋势。

R语言提供了多种数据分析的函数和包,可以进行描述性统计、概率分布、假设检验、回归分析等各种分析方法。

例如,我们可以使用summary()函数获取数据的基本统计信息,hist()函数画出数据的直方图,cor.test()函数进行相关性检验等。

3. 统计建模统计建模是基于数据进行模型构建和参数估计的过程,旨在通过建立数学模型来解释和预测数据。

R语言提供了多种统计建模的函数和包,可以进行线性回归、逻辑回归、决策树、聚类分析等各种建模方法。

例如,我们可以使用lm()函数进行线性回归建模,glm()函数进行逻辑回归建模,rpart()函数进行决策树建模等。

4. 结果可视化结果可视化是将统计分析和模型建模的结果通过图表、图像等形式进行展示和解释的过程。

R语言提供了多种数据可视化的函数和包,可以通过绘制直方图、散点图、折线图、箱线图等方式直观地展示数据。

例如,我们可以使用ggplot2包进行数据可视化,通过ggplot()函数创建图层,再结合不同的geom函数绘制不同类型的图形。

R语言是什么R语言简介

R语言是什么R语言简介

R语⾔是什么R语⾔简介⽬录1、什么是R语⾔?2、R语⾔能⼲什么?3、R语⾔有什么优势?补充5、为什么使⽤R ?6、R语⾔学习路线图7、R语⾔参考资料R是由Ross Ihaka和Robert Gentleman在1993年开发的⼀种编程语⾔,R拥有⼴泛的统计和图形⽅法⽬录。

它包括机器学习算法、线性回归、时间序列、统计推理等。

⼤多数R库都是⽤R编写的,但是对于繁重的计算任务,最好使⽤C、c++和Fortran代码。

R不仅在学术界很受欢迎,很多⼤公司也使⽤R编程语⾔,包括Uber、⾕歌、Airbnb、Facebook等。

⽤R进⾏数据分析需要⼀系列步骤:编程、转换、发现、建模和交流结果R 语⾔是为数学研究⼯作者设计的⼀种数学编程语⾔,主要⽤于统计分析、绘图、数据挖掘。

如果你是⼀个计算机程序的初学者并且急切地想了解计算机的通⽤编程,R 语⾔不是⼀个很理想的选择,可以选择 Python、C 或Java。

R 语⾔与 C 语⾔都是贝尔实验室的研究成果,但两者有不同的侧重领域,R 语⾔是⼀种解释型的⾯向数学理论研究⼯作者的语⾔,⽽ C 语⾔是为计算机软件⼯程师设计的。

R 语⾔是解释运⾏的语⾔(与 C 语⾔的编译运⾏不同),它的执⾏速度⽐ C 语⾔慢得多,不利于优化。

但它在语法层⾯提供了更加丰富的数据结构操作并且能够⼗分⽅便地输出⽂字和图形信息,所以它⼴泛应⽤于数学尤其是统计学领域。

1、什么是R语⾔?R是⽤于统计分析、绘图的语⾔和操作环境。

R是属于GNU系统的⼀个⾃由、免费、开源的软件,它是⼀个⽤于统计计算和统计制图的优秀⼯具。

R语⾔是主要⽤于统计分析、绘图的语⾔和操作环境。

R本来是由来⾃新西兰奥克兰⼤学的Ross Ihaka和Robert Gentleman 开发。

(也因此称为R)现在由“R开发核⼼团队”负责开发。

R是基于S语⾔的⼀个GNU项⽬,所以也可以当作S语⾔的⼀种实现,通常⽤S 语⾔编写的代码都可以不作修改的在R环境下运⾏。

R语言入门基础教程

R语言入门基础教程

R语言入门基础教程R语言是一种广泛使用的数据分析和统计编程语言,它提供了丰富的函数库和强大的数据处理能力。

本教程将向您介绍R语言的基础知识,包括变量和数据类型、向量和矩阵、条件控制和循环、函数和图形绘制等内容。

1.变量和数据类型在R语言中,可以用来存储数据的基本单元是变量。

变量可以存储不同类型的数据,如整数、浮点数、字符等。

例如,可以使用以下语句将一个整数赋值给变量x:x<-10可以使用print(函数显示变量的值:print(x)R语言支持多种数据类型,常见的有整数(integer)、浮点数(numeric)、字符(character)、逻辑(logical)等。

2.向量和矩阵向量是一种用于存储一维数据序列的数据结构。

可以使用c(函数创建向量,例:vector <- c(1, 2, 3, 4, 5)也可以使用冒号运算符创建数值序列:vector <- 1:5矩阵是一种用于存储二维数据的数据结构。

可以使用matrix(函数创建矩阵,例:matrix <- matrix(c(1, 2, 3, 4, 5, 6), nrow=2, ncol=3)可以使用dim(函数获取矩阵的维度:dim(matrix)3.条件控制和循环R语言提供了if-else语句和for循环等条件控制和循环结构。

如下面的例子所示,该代码将根据条件判断输出不同的结果:x<-10if (x > 0)print("x is positive")} elseprint("x is negative")可以使用for循环来遍历集合或执行重复操作。

如下面的例子所示,该代码将打印出1到5的数字:for (i in 1:5)print(i)4.函数和图形绘制R语言中函数是一组用于执行特定任务的代码块,它可以接受输入参数并返回输出结果。

可以使用function(函数定义一个函数。

R软件画图常用函数及参数

R软件画图常用函数及参数

R软件画图常用函数及参数R语言是一种强大的统计和绘图语言,它提供了丰富的函数和参数来进行数据可视化。

下面是一些常用的R软件画图函数及其参数的介绍:1. plot(函数:plot(函数是R中最基本的绘图函数之一,可以绘制散点图、折线图、柱状图等各种类型的图形。

参数:-x:要绘制的数据的x轴值-y:要绘制的数据的y轴值- type:图形类型,例如"p"代表散点图,"l"代表折线图- main:图形的主标题- col:点或线的颜色- pch:点的形状- lwd:线的宽度- xlim:x轴的范围- ylim:y轴的范围2. hist(函数:hist(函数用于绘制直方图,可以展示数据的分布情况。

参数:-x:要绘制直方图的数据- breaks:直方图的分割数,或者是分割点的向量- main:图形的主标题- col:直方图的颜色- xlim:x轴的范围- ylim:y轴的范围3. boxplot(函数:boxplot(函数用于绘制箱线图,可以显示数据的分布、中位数、四分位数等统计信息。

参数:-x:要绘制箱线图的数据- main:图形的主标题- col:箱线图的颜色- xlim:x轴的范围- ylim:y轴的范围4. barplot(函数:barplot(函数用于绘制柱状图,可以展示不同组别之间的比较。

参数:-x:柱状图的高度或数据- main:图形的主标题- col:柱状图的颜色- xlim:x轴的范围- ylim:y轴的范围5. plotly(函数:plotly(函数用于创建交互式的图形,可以通过鼠标和键盘进行缩放、旋转和放大等操作。

参数:-x:要绘制的数据的x轴值-y:要绘制的数据的y轴值- type:图形类型,例如"scatter"代表散点图,"line"代表折线图- mode:交互模式,例如"lines"代表线条,"markers"代表点- marker:点的样式参数,如颜色、大小等- hoverinfo:鼠标悬停时显示的信息。

r语言编程例子

r语言编程例子

r语言编程例子介绍R语言是一种用于统计分析和数据可视化的编程语言。

它提供了丰富的函数库和工具包,使得数据分析和数据处理变得更加简单和高效。

本文将通过一些具体的例子,详细介绍R语言的编程特点和常用技巧。

R语言基础安装和环境配置为了使用R语言进行编程,首先需要安装R并配置好开发环境。

可以从[R官网](下载R的安装包,并按照指示进行安装。

安装完成后,可以使用RStudio等集成开发环境来编写和运行R代码。

数据类型和变量R语言支持多种数据类型,包括数值型、字符型、逻辑型等。

在R中,可以使用赋值运算符<-来定义变量,并对变量进行赋值操作。

例如,我们可以定义一个数值型变量x,并将其赋值为10:x <- 10数据结构和操作在R语言中,有多种数据结构可以用来存储和处理数据,常见的有向量、矩阵、数组、列表和数据框。

可以使用不同的操作符和函数对这些数据结构进行操作和处理。

以下是一些常用的数据结构和操作:•向量(Vector):向量是由一组相同类型的元素组成的数据结构。

可以使用c()函数来创建向量,并使用索引访问向量中的元素。

# 创建向量vec <- c(1, 2, 3, 4, 5)# 访问向量中的元素vec[1] # 输出 1•矩阵(Matrix):矩阵是由多行多列的相同类型的元素组成的数据结构。

可以使用matrix()函数来创建矩阵,并使用索引访问矩阵中的元素。

# 创建矩阵mat <- matrix(1:6, nrow = 2, ncol = 3)# 访问矩阵中的元素mat[1, 2] # 输出 2•数组(Array):数组是由多维的相同类型的元素组成的数据结构。

可以使用array()函数来创建数组,并使用索引访问数组中的元素。

# 创建数组arr <- array(1:8, dim = c(2, 2, 2))# 访问数组中的元素arr[1, 1, 1] # 输出 1•列表(List):列表是由任意类型的元素组成的数据结构。

使用R语言进行数据分析与统计建模的步骤与技巧

使用R语言进行数据分析与统计建模的步骤与技巧

使用R语言进行数据分析与统计建模的步骤与技巧数据分析与统计建模是现代科学研究和商业决策中不可或缺的环节。

而R语言作为一种功能强大且开源的数据分析工具,被广泛应用于各个领域。

本文将介绍使用R语言进行数据分析与统计建模的基本步骤与技巧。

一、数据准备与清洗数据准备是数据分析的第一步,它包括数据收集、数据导入和数据清洗。

首先,我们需要确定所需的数据,并选择合适的数据源进行收集。

然后,将数据导入R语言的工作环境中,常用的数据导入函数有read.csv()、read.table()等。

导入数据后,我们需要进行数据清洗,包括处理缺失值、异常值和重复值等。

R语言提供了一系列函数和包,如na.omit()、complete.cases()等,可用于数据清洗。

二、数据探索与可视化数据探索是数据分析的重要环节,它可以帮助我们了解数据的基本特征和分布情况。

在R语言中,可以使用summary()函数和str()函数来查看数据的概要信息和结构信息。

此外,还可以通过绘制直方图、散点图、箱线图等图表来可视化数据。

R语言中的ggplot2包提供了丰富的绘图函数和美观的图形效果,可以帮助我们更好地理解数据。

三、数据预处理与特征工程在进行统计建模之前,我们通常需要对数据进行预处理和特征工程。

预处理包括标准化、归一化、离散化等操作,以便使数据符合模型的假设和要求。

R语言中的scale()函数和normalize()函数可以帮助我们实现数据的标准化和归一化。

特征工程是指通过特征选择、特征变换和特征构建等手段,提取和构建对模型有意义的特征。

R语言中的caret包和dplyr包提供了丰富的函数和方法,可用于特征选择和特征变换。

四、建立统计模型与模型评估建立统计模型是数据分析的核心环节,它包括选择适当的模型、拟合模型和评估模型。

在R语言中,我们可以使用lm()函数、glm()函数和randomForest()函数等来建立线性回归模型、逻辑回归模型和随机森林模型等。

入门级R语言编程教程

入门级R语言编程教程

入门级R语言编程教程R语言是一种广泛应用于数据分析和统计建模的编程语言。

它的开源性质和丰富的功能使得它成为数据科学家和统计学家们的首选工具。

本文将为大家介绍入门级的R语言编程教程,帮助初学者快速上手。

一、R语言的基本语法和数据类型R语言的基本语法与其他编程语言相似,但也有一些特殊之处。

首先,R语言是一种解释型语言,可以逐行执行代码。

其次,R语言是一种向量化语言,可以对整个向量进行操作,而不需要使用循环语句。

这使得R语言在处理大规模数据时非常高效。

R语言支持多种数据类型,包括数值型、字符型、逻辑型等。

数值型数据用于存储数值,字符型数据用于存储文本,逻辑型数据用于存储逻辑值(TRUE或FALSE)。

此外,R语言还支持向量、矩阵、数据框等复杂数据结构,方便数据的存储和处理。

二、R语言的基本操作和函数在R语言中,可以使用赋值操作符(<-或=)将数据存储到变量中。

例如,x <- 10将数值10存储到变量x中。

可以使用print()函数输出变量的值,例如print(x)将输出10。

R语言提供了丰富的函数用于数据处理和分析。

例如,sum()函数用于计算向量或矩阵的和,mean()函数用于计算向量或矩阵的平均值,sd()函数用于计算向量或矩阵的标准差。

此外,R语言还提供了一些专门用于统计建模的函数,如lm()函数用于拟合线性回归模型,glm()函数用于拟合广义线性模型。

三、R语言的数据可视化R语言提供了强大的数据可视化功能,可以帮助用户更好地理解数据。

ggplot2是R语言中最常用的数据可视化包,它提供了一套灵活的绘图语法。

使用ggplot2包,可以通过几行代码生成各种精美的图形,如散点图、折线图、柱状图等。

除了ggplot2包,R语言还提供了其他一些数据可视化包,如plotly、ggvis等。

这些包提供了更多的交互式和动态可视化功能,可以帮助用户更好地探索数据。

四、R语言的扩展包和社区资源R语言的强大之处在于其丰富的扩展包和活跃的社区资源。

R语言初步

R语言初步

R语言初步1第一节基本知识一、界面介绍R语言是一种自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。

R 语言最早由新西兰奥克兰大学的Ross Ihaka和Robert Gentleman开发,所以命名为R语言。

R语言是免费下载的,可以在网站Http:\\/中找到适合自己的镜像网站,下载R语言安装包和其他文件。

R的界面大致如下图所示,包括菜单、快捷键、命令窗口和图形输出窗口。

R主要通过在命令窗口中输入命令来进行操作,菜单能够提供的功能很少,因此学习R 需要记住一些常用的命令,更多的命令则需要常备一份命令手册,以便查询。

R的命令窗口中有一个红色的“>”符号,操作命令即写在这个符号的后面,完成一条命令后,用回车结束。

用getwd()可以知道R的工作路径,也就是操作过程中的数据、文件等所存储的目录。

一般默认的目录为用户的Document目录。

为了避免大量的文件混淆,可以专门为R的操作设定一个工作目录。

假定在C盘上建立一个名叫“R”的目录,用以下命令进行设定:setwd("c:\\R"),如图:在这里注意一下,当引用一个路径时,R中需要用到双斜线来表示路径引用,如上文中的c:\\R,这是R的一个特殊情况。

再比如以下操作:1参考薛毅,陈立萍(2014):R语言实用教程,清华大学出版社>x1<-c(10,12,14,16,18)>y1<-c(2.5,2.6,3.1,4.6,3.8)>plot(x1,y1)注意几点:(1)式子中的“<-”表示赋值,也就是把右边的数值赋予左边的变量名。

(2)R语言中对于字母的大小写非常敏感,变量名可以用大写也可以用小写,但用大写字母命名的变量如果改用小写来调用,会无法识别。

(3)如果觉得命令窗口上的内容太多,可以用Ctrl-L来清屏幕。

(4)如果要重新调用此前用过的命令,可以用上箭头回溯此前的命令,也可以用history()来查看历史记录。

5-R语言统计绘图基础

5-R语言统计绘图基础
Eg:
条形图、箱线图和饼图
进一步 如果height是一个矩阵而不是一个向量,则绘图结果将是一幅堆砌条形图或分组条形图 (1)若beside=FALSE(默认值),则矩阵中的每一列都将生成图中的一个条形,各列中的值将给 出堆砌的“子条”的高度。 (2)若beside=TRUE,则矩阵中的每一列都表示一个分组 ,各列中的值将并列而不是堆砌。
● x:是数据向量. ● scale:控制绘出茎叶图的长度. ● Width:绘图的宽度
应用举例如右图:
核密度图
■核密度图 :用来估计随机变量概率密度函数
的一种非参数法,核密度图是一种用来观察连续 型变量分布的有效办法。
其绘图函数为:
Plot(density(x),col,main,…)
x :为一个数值型向量
● x: 数值矩阵或数据框; ● full:为图形形状,TRUE为圆形 ,FALSE为半 圆; ●draw.segments:为分支形状:TRUE为圆形,False为半圆
应用举例:
直方图、星相图、茎叶图
■茎叶图: 茎叶图包含原始数据的所有信息, 很直观的展现数据,其函数为:
stem(x, scale,width)
■应用举例:正太随机数排序连线
> x<-c(1:10) > y<-sort(rnorm(10)) > par(mfrow=c(1:2)) > plot(x,y,col=4,pch=11) > i<-c(1:10) > segments(x[i],y[i],x[i+1],y[i+1],col=1:3,lwd=2) > plot(x,y,col=4,pch=11) > arrows(x[i],y[i],x[i+1],y[i+1],col=1:3,lwd=2) >

R语言的绘图功能及应用案例

R语言的绘图功能及应用案例

R语言的绘图功能及应用案例R语言是一种统计分析软件和编程语言,而且R语言还拥有强大的绘图功能,可以帮助用户可视化数据,发现隐藏在数据背后的规律和趋势。

下面将介绍R语言的绘图功能及应用案例。

一、R语言的绘图功能1. plot(:绘制散点图或折线图。

可以通过该函数创建直方图和饼图。

2. hist(:绘制直方图。

直方图是表示数据变量频率分布的图形。

3. boxplot(:绘制盒图。

盒图可以反映数据的分散程度和异常值。

4. barplot(:绘制条形图。

用于比较不同类别之间的数值,例如不同产品的销售额等。

5. pie(:绘制饼图。

饼图可以显示不同类别的占比情况。

除了以上基本绘图函数外,R还有很多其他高级绘图函数,例如:1. ggplot2包:ggplot2是R语言中非常著名的绘图包,可以绘制出更美观且富有层次感的图形。

2. lattice包:lattice是另一个常用的绘图包,可以绘制出多面板的散点图、线图、柱状图等。

3. heatmap函数:可以绘制热力图,用于显示数据的关联程度。

4. ggmap包:可以基于地理坐标数据,绘制地图和地理信息图。

二、R语言绘图的应用案例1.数据可视化数据可视化是R语言绘图最常见的应用之一、例如,我们可以使用R 语言中的绘图函数将公司的销售额数据制作成折线图或者柱状图,从而直观地了解销售额的变化趋势和不同产品的销售额情况。

2.统计分析的结果展示R语言在统计分析领域非常流行,其绘图功能可以用来展示统计分析的结果。

例如,在进行回归分析时,我们可以使用R语言绘制出散点图、拟合曲线图等,从而直观地展示出自变量和因变量之间的关系。

3.地理信息可视化4.生物信息学数据可视化生物信息学是一个涉及大量数据的领域,而R语言的绘图功能可以帮助生物信息学研究人员将复杂的数据可视化。

例如,我们可以使用ggplot2包将基因表达数据制作成热图,从而显示出不同基因在不同条件下的表达水平。

综上所述,R语言的绘图功能非常强大,可以将数据以直观的方式展示出来,帮助用户更好地理解数据背后的规律和趋势。

RStudio统计编程软件使用教程

RStudio统计编程软件使用教程

RStudio统计编程软件使用教程第一章:RStudio简介RStudio是一个强大的开源集成开发环境(IDE),用于进行统计分析和数据可视化。

它是基于R语言的核心并提供了一些方便的功能和工具,使得数据科学家和统计分析人员能够更轻松地处理和分析数据。

在本章中,我们将介绍RStudio的基本功能和界面。

RStudio的界面分为四个主要区域:源代码编辑器、工作区、控制台和文件相关工具。

源代码编辑器是主要工作区,用于编写和调试R代码。

工作区可用于查看和管理数据、环境变量和图形等对象。

控制台是R解释器的主要接口,可用于执行代码和查看输出。

文件相关工具提供了文件浏览器、包管理器和版本控制等功能。

第二章:RStudio的安装和配置在本章中,我们将介绍RStudio的安装和配置步骤。

首先,您需要从RStudio的官方网站(https:///)下载适合您操作系统的安装程序。

然后,按照安装向导的指示进行安装。

在完成安装后,打开RStudio并进行必要的配置。

在配置RStudio之前,您需要安装R语言环境。

可以从R官方网站(https:///)下载适合您操作系统的R安装程序。

安装R后,打开RStudio并进行以下配置:1. 设置默认工作目录:通过点击“工具”>“全局选项”>“一般”来设置默认工作目录。

选择您想要的目录,并确保在启动RStudio时自动设置。

2. 配置R库路径:通过点击“工具”>“全局选项”>“Packages”来配置R库路径。

您可以添加多个路径,以便RStudio能够搜索和加载您的R包。

3. 配置R解释器:通过点击“工具”>“全局选项”>“R”来配置R 解释器。

选择正确的R解释器路径,以确保RStudio正确连接到R 语言环境。

第三章:RStudio的基本操作在本章中,我们将介绍RStudio的基本操作。

1. 创建和运行脚本:在源代码编辑器中,使用新建文件按钮或快捷键Ctrl + Shift + N来创建一个新的脚本文件。

R语言编程基础 第5章 初级绘图

R语言编程基础 第5章 初级绘图
集的速度与刹车距离的散点图
> plot(cars[, 1], cars[, 2]) # > plot(cars) # 效果同上
22
分析数据间的关系
散点矩阵图
如果数据框是多维数据,那么plot函数将绘制出两两之间散点图组合成为散点矩阵图(matrix of scatterplots)。散点矩阵图将多个散点图组合起来,以便可以同时浏览多个二元变量关系,一定程度上 克服了在平面上展示高维数据分布情况的困难。
R语言里,提供的绘制饼图函数为pie函数,其具体用法如下所示。
pie(x, labels = names(x), radius = 0.8,...)
12
饼图
pie函数参数
参数
参数解释
x
非负的数值向量,x中的值表示饼图切片的区域 标签,一个或多个给切片命名的表达式或者字符串
labels
radius
freq
是否以频数作图,默认 TRUE,画出频数直方图,取值 FALSE
时画频率直方图
7
直方图
示例:cars数据集中speed的直方图
> hist(cars$speed)
8
分析数据分布情况
条形图
条形图(Bar Chart)是用一个单位长度表示一定的数量,根据数量的多少画成长短不同的直条,然后把 这些直条按一定的顺序排列起来。从条形统计图中很容易看出各种数量的多少。 在R中,可以使用barplot函数绘制条形图,展示各类数据的数量分布情形。条形图的x轴是数据类别,y轴 是相应类别的频数。barplot函数的具体用法如下所示。 barplot(height, beside =, horiz =, , ...)

编程模板-R语言脚本写作:最简单的统计与绘图,包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出

编程模板-R语言脚本写作:最简单的统计与绘图,包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出

编程模板-R语言脚本写作:最简单的统计与绘图,包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出写在前面本文上周五发布过,为什么要重发。

原因有三,一是忘记勾选原创,无法保护内容,也不方便授权同行公众号转载;二是公众号内容无法修改,只有重发才能修正文章的bug;三是忘记勾选打赏,几位朋友发现这一问题并积极留言(如下图)。

不常用R的朋友,可能并不能意识到好的编辑模板带来的长期效率提高和代码重用性,非计算机专业科研人员且需要使用R语言,此文会对您有帮助。

个人认为:是否能熟悉使用Shell(项目流程搭建)+R(数据统计与可视化)+Perl/Python等(胶水语言,数据格式转换,软件间衔接)三门语言是一位合格生物信息工程师的标准。

之前分享过我个人的《Shell语言》和《Perl语言》脚本写作模板(蓝色字为链接直达),今天再分享一下我的R语言模板,一次性解决困扰新手的众多问题,如包安装、命令行参数解析、文件读取、Anova组间统计和箱线图展示、表格和矢量图输出等。

希望对新手有所帮助!老司机尽情拍砖,指导我写出更好用、更规范的脚本。

模板主要内容此模板主要以下分为5部分:1. 程序功能描述和分析思路每次写脚本,一定要写清楚程序的功能、实现的主要步骤,每个参数的详细说明和使用示例。

如果英语描述不方便理解,建议中英文全写,方便自己和同行快速理解。

千万要认识写清楚这些,现点养成好习惯,将来节省的时间会更多。

2. 依赖关系检查、安装和加载R己有过万的可用包,很少需要我们开发新功能。

每次需要加载需要的包,但没有会报错,直接安装又不会提醒导致重复安装浪费时间。

我添加判断R包是否安装的代码,当R包缺失时会自己动从CRAN安装。

对于CRAN没有的包,也提供了Bioconductor和Github安装代码,只需手动修改包名安装即可。

此步还包括加载了optparse包后,对命令行的解析,以及在屏幕上显示参数,让用户校验是否正确。

r 语言入门与实践

r 语言入门与实践

r 语言入门与实践R语言是一种广泛应用于数据分析和统计建模的编程语言。

它的设计初衷是为了提供一个易于学习和使用的工具,以支持数据科学家和统计学家的工作。

本文将介绍R语言的入门知识和实践应用。

我们来了解一下R语言的基本特点和优势。

R语言是一种免费的开源软件,拥有庞大的社区支持和丰富的扩展包。

它可以在各种操作系统上运行,并且可以与其他编程语言(如Python和Java)进行交互。

由于R语言专注于数据分析和统计建模,它提供了许多强大的统计函数和图形绘制工具,使得数据分析变得更加简单和高效。

要使用R语言进行数据分析,首先需要了解基本的语法和数据结构。

R语言支持向量、矩阵、数组、列表和数据框等数据结构,可以方便地存储和操作数据。

此外,R语言还提供了丰富的数据处理和转换函数,使得数据的清洗和整理变得更加容易。

在R语言中,可以使用赋值操作符将数据存储在变量中,并使用逻辑运算符和条件语句进行数据筛选和处理。

在R语言中,数据可视化是一项重要的任务。

R语言提供了多种绘图函数和图形库,可以绘制各种类型的图表,如散点图、折线图、柱状图、饼图等。

通过数据可视化,可以直观地展示数据的分布、趋势和关系,帮助我们更好地理解数据和发现规律。

除了基本的数据分析和可视化功能,R语言还支持各种统计建模和机器学习算法。

R语言提供了许多统计函数和包,可以进行回归分析、分类和聚类等常见的统计任务。

此外,R语言还集成了机器学习库,如caret和mlr,可以进行复杂的机器学习模型训练和评估。

在实际应用中,R语言被广泛用于各个行业和领域。

例如,在金融领域,R语言可以用于风险管理、投资组合优化和金融模型建立。

在医疗领域,R语言可以用于临床试验分析和疾病预测。

在市场营销领域,R语言可以用于客户细分、推荐系统和营销模型构建。

总之,R语言的应用领域非常广泛,几乎涵盖了所有需要进行数据分析和建模的领域。

要学习和掌握R语言,可以通过多种途径。

首先,可以参考R语言的官方文档和教程,了解R语言的基本语法和函数。

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col=“red”
xlab=“Virus” ylab=“days”
箱线图为红色
横轴名称为Virus 纵轴名称为days
40
练习二:查询函数帮助
查看boxplot的帮助文件 ?boxplot 查看最后的examples
将帮助文件中的内容粘贴到控制台中,运行并观看运行结果。
boxplot(count ~ spray, data = InsectSprays, col = "lightgray") 参数更改 boxplot(count ~ spray, data = InsectSprays, col =
37
R有哪些函数?
查询的方法:Help>Html help>packages binom.test()
log()
log10() exp() sin() cos()
fisher.test()
chisq.test() glm(y ~ x1+x2+x3, binomial) friedman.test()
12
菜单栏 快捷按钮
控制台 光标:等待输入
图 4 R登陆界面(Windows版)
路径: 开始>所有程序>R 2.11.0
13
图 5 R Gui 的File菜单
14
图 6 R Gui 的Edit菜单
15
图 7 R Gui 的Packages菜单
16
图 8 R Gui 的Help菜单
17
R程序包(R Packages)
2 安装本地zip包
路径:Packages>install packages from local files 选择本地磁盘上存储zip包的文件夹。
25
程序包使用
程序包的中函数,都要先导入,再使用,因此导入程序包是第一步。 在控制台中输入如下命令: library(vegan) library(ade4) 程序包内的函数的用法与R内置的基本函数用法一样。 library(vegan) This is vegan 1.17-2
UNIX等。
命令行驱动 R即时解释,输入命令,即可获得相应的结果。
6
为什么选择R?
• 丰富的资源
涵盖了多种行业数据分析中几乎所有的方法。
• 良好的扩展性 十分方便得编写函数和程序包,跨平台,可以胜任复杂的数据分析、 绘制精美的图形。 • 完备的帮助系统
每个函数都有统一格式的帮助,运行实例。
• GNU软件 免费、软件本身及程序包的源代码公开。
程序包是什么?
R程序包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。 Window下的R程序包是经过编译的zip包。 每个程序包包含R函数、数据、帮助文件、描述文件等。 为什么要安装程序包?
R程序包是R功能扩展,特定的分析功能,需要用相应的程序包实现。
例如:系统发育分析,常用到ape程序包,群落生态学vegan包等。
2. 不能用数字作为变量,对象也不能用数字开头,但是数字可以放在 中间或结尾,如2result与result2,后者是合法的。 3. 建议不要用过短的名称。可以用”.”作为间隔,例如 anova.result1。
4. 不要使用保留名:
NA, NaN, pi, LETTERS, letters, month.abb,
#详情
#作者 #参考文献 #举例
30
练习一 安装R并导入程序包
1. 安装R软件、熟悉菜单
2. 安装程序包
3. 调用程序包,查看程序包的帮助 library(vegan) library(ape) 查找ape包中plot.phylo函数的帮助 输入 ?plot.phylo 将其中的Example粘贴到控制台中,查看运行的结果。
18
常用R程序包(I)
ade4 adephylo ape apTreeshape boot cluster ecodist 利用欧几里得方法进行生态学数据分析 系统进化数据挖掘与比较方法 系统发育与进化分析 进化树分析 Bootstrap检验 聚类分析 生态学数据相异性分析
FD
geiger
功能多样性分析
31
R图形界面:R commander
• R commander是R的图形界面之一,是John Fox教授编写的,适用于 不希望R编程的用户。随着用户的操作,其窗口还可以显示出相应操 作的R程序,对于初学者可能会有帮助。
• 安装R commander
• install.packages("Rcmdr") • R将自动下载并安装Rcmdr所需的所有程序包
线性模型 lm(y~x, data=test)
36
R的函数
每一个函数执行特定的功能,后面紧跟括号,例如:
平均值
求和 绘图 排序
mean()
sum() plot() sort()
除了基本的运算之外,R的函数又分为”高级”和”低级”函数, 高级函数可调用低级函数,这里的”高级”函数习惯上称为泛型函数。 如plot()就是泛型函数,可以根据数据的类型,调用底层的函数, 应用相应的方法绘制相应的图形。这就是面向对象编程的思想。
tan()
asin() acos()
mean()
sd() var()
38
R函数调用及其选项
图13 箱线图修饰前后(左:默认值,右:修改属性后)
函数的调用方法, 函数名() 如 plot(), lm(),并将对象放入括号 中。
39
R函数调用及其选项
箱线图绘制函数的调用 boxplot(day~type, data=bac, col="red", xlab="Virus", ylab="days") day~type,以type为横轴,day为纵轴绘制箱线图。 data=bac 数据来源bac
20
常用R程序包(III)
picante raster seqinr 群落系统发育多样性分析 栅格数据分析与处理 DNA序列分析
sp
spatstat splancs stats SDMTools
空间数据处理
空间点格局分析,模型拟合与检验 空间与时空点格局分析 R统计学包 物种分布模型工具
vegan
要学习R编程,首先要了解R的函数、对象及其操作。
34
二 函数与对象
35
R的函数
R是一种解释性语言,输入后可直接给出结果。 功能靠函数实现。 函数形式: 函数(输入数据,参数= ) 如果没有指定,则参数的以默认值为准。 例如: 平均值 mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)
语言初步
— 数据处理、绘图与编程
张金龙
jinlongzhang01@
June 3, 2010
1
报告内容
一 R简介
二 函数与对象
三 脚本编程
四 R绘图
五 编写函数
六 数据保存
2
一 R 简介
3
什么是R?
The R Project for Statistical Computing
物种形成速率与进化分析
19
常用R程序包(II)
Graphics
lattice maptools
绘图
栅格图 空间对象的读取和处理
mefa
mgcv mvpart nlme ouch pgirmess phangorn
生态学和生物地理学多元数据处理
广义加性模型相关 多变量分解 线性及非线性混合效应模型 系统发育比较 生态学数据分析 系统发育分析
具有良好的扩展性,在国外学术界应用很广。 1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Ihaka, 基于S语言的源代码,编写了一能执行S语言的软件,并将该软件的源代 码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。
5
R的特点
多领域的统计资源
目前在R网站上约有2400个程序包,涵盖了基础统计学、社会学、 经济学、生态学、空间分析、系统发育分析、生物信息学等诸多方面。 跨平台 R可在多种操作系统下运行,如Windows、MacOS、多种Linux和
7
R与其他统计软件比较
• SAS: 速度快,有大量统计分析模块,可扩展性稍差,昂贵。 • SPSS:
复杂的用户图形界面,简单易学,但编程十分困难。
• Splus: 运行S语言,具有复杂的界面,与R完全兼容,昂贵。 ……
8
R的缺点
• 用户需要对命令熟悉
与代码打交道,需要记住常用命令。
• 占用内存 所有的数据处理在内存中进行,不适于处理超大规模的数据。 • 运行速度稍慢 即时编译,约相当于C语言的1/20。
26
查看程序包帮助文件
vegan 程序包内部都有哪些函数?分别有什么功能? 查询程序包内容最常用的方法: 1 菜单 帮助>Html帮助
2 查看pdf帮助文档
27
查看函数的帮助文件
函数的默认值是什么? 怎么使用? 使用时需要注意什么问 题? 需要查询函数的帮助。 1 ?t.test 2 RGui>Help>Html help 3 apropos("t.test") 4 help("t.test") 5 help.search("t.test") 6 查看R包pdf手册
Hale Waihona Puke "red", xlab="spray", ylab="counts")
41
赋值与注释
在控制台中键入如下命令
2 + 2 a <- 2
赋值符号
<-也可用=, 甚至->代替
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