panel测序原理
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panel测序原理
Panel测序是一种通过同时测序多个目标区域的方法,其原理
可以分为三个主要步骤:目标片段选择、文库构建和高通量测序。
首先,在Panel测序中,需要选择一组目标片段来进行测序。
这些目标片段通常是人们感兴趣的特定基因、突变位点等。
选择目标片段的方法有多种,其中一种常用的方法是使用导引RNA (guide RNA) 或引物 (primer) 来选择目标。
导引RNA是
一种专门设计用于靶向并结合到特定DNA或RNA序列上的
分子,通过与Cas蛋白质复合物相互作用,可引导Cas蛋白质进行靶向切割。
引物则是一段能够与目标DNA序列互补配对
的DNA片段,在PCR (聚合酶链式反应) 过程中与目标DNA
序列发生特异性的互补配对,从而使得该片段得以扩增。
接下来,经过目标片段选择后,需要构建文库来准备DNA样
本进行测序。
文库构建的过程中,首先需要将样品DNA进行DNA片段打断,即将DNA切割成较短的片段。
这可以通过机械力量、酶切或超声波等方法实现。
然后,使用目标片段选择步骤中设计的导引RNA或引物来选择目标区域片段,并使用
特定的连接酶将目标片段与测序适配体连接在一起,形成单链DNA适配体。
这些适配体在PCR过程中作为引物与样品
DNA片段进行扩增。
扩增后的DNA片段可以进行纯化和定量,准备高通量测序。
最后,进行高通量测序的步骤。
高通量测序采用不同的测序技术,如Illumina测序技术、Ion Torrent测序技术等。
这些技术
通常共同使用DNA聚合酶、引物和荧光标记的核苷酸等试剂。
在测序过程中,首先通过将DNA模板固定在一个表面上,形
成一个DNA聚集物。
然后,采用测序引物使DNA合成扩增,并与顺序反应中荧光标记的核苷酸结合。
合成DNA时,每个
核苷酸会释放出一个荧光信号,将这些信息整合起来,就可以获得目标DNA片段的序列。
Panel测序的优势在于其高效性和经济性。
通过同时测序多个
特定目标区域,可以在一次测序实验中同时获得多个基因或突变位点的信息。
这样不仅高效地节省了时间,还可以节约成本,减少实验重复。
此外,Panel测序还具有高灵敏度和高度定量
的特点,使得其在医学研究、临床诊断和个体化治疗等方面具有广泛的应用潜力。