中药色谱指纹图谱相似度评价系统
中药色谱指纹图谱相似度评价系统操作规范
2数据库功能：
数据库管理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10）和参照图谱建档功能（图11），便于用户信息管理。
图9
图10
图11
3谱图处理：
（1）数据剪切
采用数据剪切功能用户可以选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配（图12）。
图12
（2）色谱峰匹配
色谱峰匹配包括指定参照峰，指定基准峰和自动匹配。下面逐一介绍：
图28多点校正设定
图29多点校正后自动匹配结果
5对照图谱生成
图30
图31
图32
图33
图34
附常用色谱工作站格式文件的导出：
色谱工作站
1.打开色谱工作站；
2.进入数据处理（>>）；
3.调入要输出的色谱文件（>> …）；
4.进入数据输出窗口（>> >> …），进入方式如下图所示：
在弹出窗口中指定导出路径及文件名，确定。可导出格式文件。
用户通过“打印报告”功能将分析结果打印出来。打印报告中包括报表信息输入（图19）和分析报告两部分（图20和21）。其中分析报告包括原始指纹图谱，匹配后图谱和相似度评价结果。
图19
图20
图21
5帮助
为方便用户使用，本系统提供简洁完整的联机帮助。
6工具栏按钮简介：
工具栏按钮如图所示(图22)。
其中大部分按钮的功能在前面已经介绍过，不再赘述。这里将重点介绍“数据恢复”，“图谱间距”，“单谱显示”和x与y轴放大功能。
四卸载
在控制面板中，采用添加/删除程序卸载本程序。
五应用实例
为方便用户快速掌握本系统，我们以一例子加以介绍。
例：对获取的色谱指纹图谱建立对照图谱，进行相似度评价，并打印报告。
相似系统理论用于中药色谱指纹图谱的相似度评价
似度时， 不能保证 % & 3 ’ )" 对所 有的样 品 或 色 谱 峰 都适用。因此 3 ’ 的有些值大于 " ， 有些值小于 "， 经 求和平均计算之后， 部分差异就会被抵消。 ! ! 为了客观地评 价 中 药 色 谱 指 纹 图 谱 的 相 似 度， 我们对程度相似度的计算公式进行了改进。在改进 的程度相似 度 的 计 算 公 式 中， 以 &’ 2 (’ 表 示 相 似 要 说明两者的相似程 素的相似程度， 比值越接近于 " ， 度越高； 以 " ’ & ’ 2 ( ’ 表示 相 似 要 素 的 差 异。 为 了 解 决差异被抵消的问 题， 我们采用差异的绝对值进行 计算。将相似要素 的 差 异 取 绝 对 值 之 后 求 和， 即用
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其中 5 &’ 为 " 色谱图中 & ’ 峰的峰面积或 峰高， 5 (’ 为 # 色谱图中对应的色谱峰 ( ’ 的峰面积或峰高。
（!）
!" 实验研究
! ! #" 香丹注射液的实验研究 ! ! # ! #" 仪器与试剂 ! ! 高效 液 相 色 谱 （ -./0 ） 系 统： 岛 津 /01"% "234 高压泵， 岛 津 (.215"% "34 二 极 管 阵 列 检 测 器， 岛 津 0/"((134 工作 站； 柱 温 箱： 601"%% （ 天津市金洲 科学仪器有限公司） 。 ! ! 试剂： 甲醇 （ 色谱纯） ， 冰醋酸 （ 分析纯 ） ， 二次重 蒸水。 ! ! # ! !" 样品 ! ! 香丹注射液 （ 上海通用药业股份有限公司第三 %#"%""* ， %#"%""+ ， 公 司 ）"% 批，批 号 为 %#"%)! ， %#"%"!, ， %#"%+! ， %#"%*+ ， %#"%"", ， %#"%"#% ， %#"%"%+ 和 %#"%""! 。 ! ! # ! $" 色谱条件 ! ! 色谱条件参照文 献 ［#］ ， 并 进 行 了 方 法 学 考 察。 色谱 柱： "77+89% 0 ") 柱（ !( &9 : $- + 99 8- ’- ，( ， 柱温 #% ; 。 流 动 相： "， " <（ 体 积 分 数， 以下 !9） 同此） 冰 醋 酸 水 溶 液； #， " < 冰 醋 酸 甲 醇 溶 液； 采用 梯度洗脱 （ 程 序 为： "% < # , "%% < # （ % . (( 98) ） ， "%% < # , "% < # （ (( . +% 98) ） ， "% < # （ +% . *% 98) ） ） ； 流速为 "- % 9/ = 98) 。检 测波长 为 !)% )9 。 进样量为 !% ! / 。 ! ! # ! %" 供试品溶液的制备 ! ! 精 密 量 取 香 丹 注 射 液 %- (% 9/ 于 "% 9/ 量 瓶
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A
附录1：常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出
本软件系统的相似度运确实是按照峰的积分面积进行的。建议用户从色谱工作站导出AIA（*.cdf）数据文件之前，先对需要导出的数据进行积分处理，如此能够确保导出的AIA（*.cdf）数据文件包含积分数据信息。
Agilent色谱工作站
1.打开Agilent色谱工作站；
附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见咨询题及解答
简介
1．版本介绍：
本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。研究版要紧用于科学研究工作，具有生成对比图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对比图谱的功能。
2．系统运行环境要求：
(1).最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕辨论率800×600。
为了使用户尽快找到色谱峰的峰位置，进行匹配点的设置，能够点击“谱图处理”中的“显示色谱峰”（详见“3谱图处理中（5）显示色谱峰”，图20），如此所有样本图谱的所有色谱峰全部显示出来。
样本图谱数量较多时，有些峰面积较大峰的设置较为不变；或者所有样本图谱匹配点设置完毕，但又觉得某些样本图谱匹配点的设置不够理想，这时能够采纳“单谱显示”模式（详见工具栏中“单谱显示”按钮），逐个图谱进行设置和修正。
差不多流程图如下（图29）：
图29
1样本图谱数据导入（AIA格式（*.cdf）,图30和31）
图31
图32
2设参照图谱（图33）
图34
3自动匹配
图35自动匹配结果
4多点校正
图36多点校正设定
图37多点校正后自动匹配结果(图谱)
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本 2004 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 A）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）图2图3图4 系统主界面系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1 文件打开 绘图区文件信息区（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本 2004 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 A）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）图2图3图4 系统主界面系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1 文件打开绘图区文件信息区（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版系统帮助A
2数据库功能:
数据库管理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10)和参照图谱建档功能（图11）,便于用户信息管理。
图9
图10
图11
3谱图处理:
（1）数据剪切
数据剪切功能可使用户选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配。
点击“谱图处理”中的“数据剪切”功能,系统会提示用户是否需要恢复原始数据，点击确定后进入“数据剪切”功能对话框，如图（12):
图2
图３
图４系统主界面
系统主界面中(图4),文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如(S1))及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号(如(Ｓ1２)）。
1文件打开
（１)打开文件(全谱导入)(图５):
图5
本系统支持三种格式文件的导入:AＩA(即*．cdｆ)文件,文本文件(*.txｔ)和Scp(*.Ｓcp)格式文件的导入(图５）。建议采用通用的AIA(*.ｃｄf）格式文件导入。注意ＡＩA（＊.cdf)文件中应包含样本图谱的峰面积信息，在色谱工作站导出AＩA(*．cdf)文件前应现进行积分。否则导出的AIA(*．cｄf)文件可能因不包含峰面积信息而无法导入。为了方便用户的使用，附录中给出了主要色谱工作站的（AGIＬＥＮT,WATＥRS，和ＳHIＭAＤZU）AIA(＊.ｃdf）数据格式的文件导出介绍。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A.．
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ﻩ
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范
(版本 2004A)
ＳOPof Simｉlａriｔy evaluａtｉoｎsysｔem foｒｃhromaｔoｇraｐhic fｉnｇｅrpｒinｔof TＣＭ（Version 20０4 A）
中药指纹图谱相似度评价方法的比较
中药指纹图谱相似度评价方法的比较一、本文概述中药指纹图谱作为一种全面、综合地反映中药内在质量的技术手段，已经在中药质量控制、真伪鉴别以及新药研发等领域得到了广泛应用。
指纹图谱相似度评价则是评估中药指纹图谱质量、稳定性的重要指标，其评价方法的优劣直接关系到中药质量评价的准确性。
本文旨在对现有的中药指纹图谱相似度评价方法进行比较分析，探讨各种方法的优缺点，以期为提高中药质量控制水平提供理论支持和实践指导。
本文将首先介绍中药指纹图谱相似度评价的基本概念和研究意义，然后重点阐述几种常用的相似度评价方法，包括夹角余弦法、相关系数法、谱峰匹配法等。
在此基础上，本文将通过对比分析这些方法的计算原理、适用范围、优缺点等方面，为读者提供一个全面、深入的相似度评价方法比较视角。
本文将展望中药指纹图谱相似度评价方法的未来发展趋势，以期为推动中药现代化、国际化进程提供有益参考。
二、中药指纹图谱相似度评价方法概述中药指纹图谱相似度评价是中药质量控制领域的一个重要研究方向，旨在通过科学、客观的方法来评估中药的内在质量。
随着现代分析技术的不断发展，越来越多的相似度评价方法被应用于中药指纹图谱的研究中。
这些方法大致可以分为以下几类：谱图直观比较法：这是最简单直接的相似度评价方法，通过直接观察指纹图谱的峰形、峰位和峰强度等信息，对中药样品进行直观的比较和判断。
这种方法简单易行，但主观性较强，容易受到观察者的经验和技能影响。
相似度计算法：这类方法通过数学公式或算法，对中药指纹图谱进行量化分析，从而得出样品间的相似度。
常用的相似度计算法包括相关系数法、夹角余弦法、欧氏距离法等。
这些方法具有客观性强、结果可重复等优点，但也需要选择合适的计算参数和阈值。
模式识别法：模式识别技术，如人工神经网络、聚类分析、主成分分析等，也被广泛应用于中药指纹图谱的相似度评价中。
这些方法能够通过学习和训练，自动识别指纹图谱中的特征信息，并对中药样品进行分类和识别。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版系统帮助A
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本 2004 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 A）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）图2图3图4 系统主界面系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名绘图区文件信息区称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1 文件打开（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统B版-系统帮助B
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本2004 B)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 B）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能比较简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统B版”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）。
图2图3图4系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名绘图区文件信息区称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1 文件打开（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5 必须先导人对照图谱文件（*.Scp）图6再导人图谱文件（*.cdf或*.txt）在2004 B版中，必须先打开对照图谱文件（*.Scp）,然后才能打开AIA文件（*.cdf），见图5和6。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版 系统帮助A
.~中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范)A(版本 2004SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM （Version 2004 A）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答.~一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）2图.~3图系统主界面4 图绘图区文件信息区））及文件的路径名4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1图系统主界面中( S12称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（））。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统
中药色谱指纹图谱相似度评价系统国家药典委员会翟为民背景国家食品药品监督管理局于2000年先后下达“关于加强中药注册管理有关事宜的通知”（国药管注［2000］157号）和关于印发《中药注射剂色谱指纹图谱研究的技术要号）和“关于印发《中药注射剂色谱指纹图谱研究的技术要求》的通知”（国药管注［2000］348号）文件。
国家药典委员会负责组织实施“已批准生产的中药注射剂质量标准的提高完善及指纹图谱工作”及牵头组织“已批准多家生产的中药注射剂，其指纹图谱联合起草工作”。
国家药典委员会从2000年12月起开始组织实施，进行了可行性调研、规范性技术文件起草与研究、同布进行了科技部立项。
从中药注射剂的指纹图谱研究质量标准提高逐步从中药注射剂的指纹图谱研究、质量标准提高，逐步成熟、扩展，到2010版药典，部分提取物和中成药标准中都收载了指纹图谱项目，为发挥着积极的作用。
1、论证1论证首先进行调研，多次召开研讨会，代表涉及科研院所、中央和省级药品检验所及企业科技人员。
形成共识：央和省级药品检验所及企业科技人员形成共识：①重点-色谱指纹图谱；②理论上可行。
②理论上可行③通过实践，检验可行性，不断完善。
2、修订《中药注射剂指纹图谱研究技术要求》（国药谱管注［2000］348号）①优化、方法验证，细化参数、明确要求。
②解决手工计算“共有峰”、“非共有峰”面积工作中大量的人为因素，改变“只见树木不见森林”的局面，力求量的人为因素改变“只见树木不见森林”的局面力求反映整体质量特性。
二规范性技术文件起草与研究工作二、规范性技术文件起草与研究工作1、修订修订稿就原料药材、半成品、成品的样品收集、制备、参照物的选择，指纹图谱试验条件，对实验室的要求，对仪器的要求，试验方法和试验条件的建立及验证，色谱条件的优选，指纹图谱的建立和验证、识别、计算和复核，标准书写格式指纹图谱的建立和验证识别计算和复核标准书写格式等进行了详尽的细化规定，起草稿经广泛征求意见，先后进行了多次修改得以完成。
如何自己处理数据使能导入中药指纹图谱相似度系统进行分析
如何自己处理数据使能导入中药指纹图谱相似度系统进行分析我处理过安捷伦GC-MS，岛津LC-MS，主要目的是建立一个使中药色谱指纹图谱相似度评价系统能导入的TXT文件。
TXT文件中的主要内容有：（1）指纹图谱采样信号数据时间[min] 信号[mV]2.622 63324032.623 63992652.625 64661282.627 65329902.628 65372882.63 65415862.632 65458842.633 65501812.635 65544792.637 65587772.638 6563075（2）指纹图谱积分数据峰序保留时间[Min] 峰高峰面积1 2.633 6380302 679104752 2.785 21290379 2486595143 3.3 18345770 2519271244 3.497 29802449 3251832055 4.084 11453886 1533077476 4.267 8355683 750681907 4.677 17372755 4570443398 5.701 13256559 434419438（1）和（2）两部分的数据缺一不可。
（1）部分的数据主要通过色谱图信号导出，就会有时间和信号的数据，这些数据可以画出色谱图来。
（2）能过积分后，我们可以得到积分结果，将这两部分的数据合起来就是我们所要建立TXT文本了。
首先可以将两部分数据复制到Excel中，如下图所式注意上面的文字是少不了的，一定要写上哦。
第二步是新建一个TXT文本，分别将（1）（2）的数据复制到这个TXT文本中。
复制完（1）的数据按enter在第二行复制（2）的数据就可以了。
第三步是将TXT中“指纹图谱采样信号数据”和“指纹图谱积分数据”后面的空格选中后，按Delete，删除。
最后保存一下TXT文本，你就可以导入中药色谱指纹图谱相似度评价系统进行分析了。
文- 汉语汉字编辑词条文，wen，从玄从爻。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范版本 2004 ASOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint ofTCMVersion 2004 A目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA.cdf格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释;新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版2004 A和检验版2004 B..研究版主要用于科学研究工作;具有生成对照图谱功能..检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作;功能简化;不具有生成对照图谱的功能..2．系统运行环境要求：1. 最低配置：CPU主频533 MHz以上;内存64M;硬盘剩余最小空间100M;操作系统Windows 98以上;屏幕分辨率800×600..2. 推荐配置：PVI以上CPU;内存128M;硬盘空间20G;操作系统Windows 2000以上;屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击后;进入安装程序;如果无其他特殊需要;可以直接点击下一步至安装结束..图 1三．功能本软件系统包括文件导入;数据库管理;谱图处理;分析检验和帮助等功能..安装完本系统后;运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序;进入登陆界面图2;这时需要用户输入用户名和相应的密码现暂无设置密码..点击确定进入启动界面图3;三秒钟后自动进入本系统运行主界面..若用户不想在启动界面等待三秒钟;可以直接点击启动界面图3;这样可以快速进入系统主界面图4图2图3图4 系统主界面系统主界面中图4;文件信息区即图谱列表显示样本编号如S1及文件的路径名称等信息;绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号如S12..1 文件打开1打开文件全谱导入图5：图5本系统支持三种格式文件的导入：AIA 即.cdf 文件;文本文件.txt 和Scp.Scp 格式文件的导入图5..建议采用通用的AIA.cdf 格式文件导入..注意AIA.cdf 文件中应包含样本图谱的峰面积信息;在色谱工作站导出AIA.cdf 文件前应现进行积分..否则导出的AIA.cdf 文件可能因不包含峰面积信息而无法导入..为了方便用户的使用;附录绘图区文件信息中给出了主要色谱工作站的AGILENT;WATERS;和SHIMADZUAIA.cdf数据格式的文件导出介绍..文本文件.txt的导入需要采用特殊的格式;可以参考本系统导出的文本文件格式..Scp.Scp;即Standard Chromatographic Project的简写是本系统为生成的对照图谱的导入提供的一种特殊的文件格式..2导出文件保存图谱本系统支持将导入的图谱数据文件以文本文件.txt导出保存图6..图63导出图象将导入绘制的色谱图谱可以图象形式存放;文件格式为.bmp图7..图74图谱删除本系统提供谱图删除功能图8..可以选中某一图谱删除“删除当前图谱”功能;也可将导入的图谱全部删除“清除所有图谱数据”..在文件信息区选中某一样本图谱;然后在文件菜单栏中点击“删除当前图谱”;即可将选中的样本图谱删除..若点击“清除所有图谱数据”;所有样本图谱全部删除..图82 数据库功能：数据库管理包括药材信息建档图9、制剂信息建档图10和参照图谱建档功能图11;便于用户信息管理..图9图10图113 谱图处理：（1）数据剪切数据剪切功能可使用户选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配..点击“谱图处理”中的“数据剪切”功能;系统会提示用户是否需要恢复原始数据;点击确定后进入“数据剪切”功能对话框;如图12：图12 数据剪切功能对话框通过该对话框用户可以剪切样本图谱起始阶段的溶剂峰;也可剪切样本图谱尾部阶段的“杂峰”..在对话框中输入剪切溶剂峰的“终止时间”系统默认为5分钟和尾部剪切的“起始时间”系统默认为60分钟;可以将所有样本在剪切溶剂峰的“终止时间”前和尾部剪切的“起始时间”后的图谱数据剪切掉..（2）放大和缩小本系统提供了两种图谱放大和缩小功能..一种为“信号放大一倍和缩小一倍”图13;另一种为信号的直接拖放放大..这里只介绍“信号放大一倍和缩小一倍”功能..“信号放大一倍和缩小一倍功能”使得当前显示图谱的沿y轴方向成比例放大和缩小一倍;便于用户观察图谱信号的整体概貌和细节部分..连续点击“信号放大一倍”两次;即将原始图谱沿y轴方向放大四倍..图13 谱图处理包含的功能3色谱峰匹配色谱峰匹配包括指定参照峰;指定基准峰和自动匹配..下面逐一介绍：指定参照图谱：用户可以任意选择一条色谱图谱作为指定参照图谱..点击“谱图处理”“色谱峰匹配”中的“指定参照图谱”;弹出如图14所示的对话框;选择参照图谱编号“确定“后即可将该编号对应的图谱指定为参照图谱..图谱颜色变为红色;以区别于其他图谱..在此对话框中还提供了“对照图谱的生成方法”和“时间窗宽度”的参数设置..“对照图谱的生成方法”详见“3 谱图处理中4生成对照图谱、单独显示对照图谱及导出对照图谱”;这里只介绍“时间窗宽度”的参数设置..时间窗宽度是指相对于参照图谱峰位置的可选保留时间范围;其单位根据横坐标轴的单位而定这里是分钟..时间窗宽度越大;可选的时间范围就越大..在色谱峰匹配时;选择一个合适的时间窗宽度是非常重要的..一般情况下;时间窗宽度在较小范围内变化如;自动匹配结果变化较大..时间窗宽度在较大范围内变化如;自动匹配结果比较稳定..建议：先在一定范围内逐渐增加时间窗宽度如;然后观察匹配结果可以通过相似度的计算结果确定..若时间窗宽度增加到一定数值后;匹配结果比较稳定相似度计算结果稳定;这时对应的时间窗宽度参数较为适合..图14 参数设置对话框多点校正即设置匹配点或设置Mark峰：系统支持“多点校正”功能..点击“谱图处理”“色谱峰匹配”中的“多点校正”或直接点击状态栏中的“多点校正”按钮;系统进入“多点校正”模式;这时鼠标变成“＋”..用户根据需要直接在图谱上设置匹配点匹配点数不限;设置后的匹配点为红色点表示;详见图36和37进行多点校正..若设置结果不满意;可以再次点击设置的匹配点即可取消已设置的匹配点..为了使用户尽快找到色谱峰的峰位置;进行匹配点的设置;可以点击“谱图处理”中的“显示色谱峰”详见“3 谱图处理中5显示色谱峰”;图20;这样所有样本图谱的所有色谱峰全部显示出来..样本图谱数量较多时;有些峰面积较大峰的设置较为不变；或者所有样本图谱匹配点设置完毕;但又觉得某些样本图谱匹配点的设置不够理想;这时可以采用“单谱显示”模式详见工具栏中“单谱显示”按钮;逐个图谱进行设置和修正..若对所有样本图谱设置的匹配点Mark峰不满意;希望重新设置;可以通过以下两种方法实现：①直接点击右键;弹出对话框图15图15点击“确定”后即可取消所有样本图谱已经设置的匹配点;然后再重新设置..②点击工具栏中“数据恢复”按钮图16;图16点击“是”后;样本图谱恢复到匹配点设置以前的状态..自动匹配：本系统提供自动匹配功能;可实现色谱峰的自动匹配..自动匹配时;需要用户设置时间窗宽度;系统默认值为图14..用户可以调节此参数以调整色谱峰的匹配结果..图17 自动匹配结果匹配结果以蓝色虚线将匹配的色谱峰联接起来表示见图17..用户也可点击工具栏中“匹配数据”按钮;直接观察样本图谱的匹配结果详见6工具栏中的“匹配数据”按钮介绍..一般情况下;若导入的样本图谱视觉上排列整齐;较为相似;可以直接进行自动匹配..4生成对照图谱、单独显示对照图谱及导出对照图谱对照图谱的生成需要先进行谱峰匹配然后才能生成对照图谱..其生成方法包括均值法和中位数法..用户可以根据需要选择合适的方法生成对照图谱可以在图14所示的对话框中选择方法..生成对照图谱的编号为R见图18中图谱;并可单独显示点击“谱图处理”中的“单独显示对照图谱”;见图19;便于用户观察..生成的对照图谱以特殊格式导出对照图谱不能在“文件”菜单中以“导出文件”导出;必须以图13所示菜单中“导出对照图谱”..对于注射剂建议采用均值法产生对照指纹图谱；对于中药材;建议采用中位数法产生对照指纹图谱..图18图19 对照图谱的单独显示5显示色谱峰“显示图谱峰”功能使绘图区的样本图谱的色谱峰以点标记的方式显示出来如图20;便于用户设置匹配点和观察分析..图206着色当前谱图和随机着色谱图：用户根据需要可以选择某一图谱进行着色;也可对图谱进行随机着色图13..4 分析检验：1相似度计算：对照图谱生成后;用户通过“相似度计算”功能进行色谱图谱样本与对照图谱的相似度评价..评价结果以表格形式显示;并可保存;或将结果拷贝到剪贴板上;再粘贴到Excel表格中以方便用户使用图21和22..图21图22 相似度计算结果2打印报告：用户通过“打印报告”功能将分析结果打印出来图21..打印报告中包括报表信息输入图23和分析报告两部分图24和25..其中分析报告包括原始指纹图谱;匹配后图谱和相似度评价结果..图23图24图255 帮助为方便用户使用;本系统提供简洁完整的联机帮助..6 工具栏按钮简介：工具栏按钮如图所示图26..其中大部分按钮的功能在前面已经介绍过;不再赘述..这里将重点介绍“数据恢复”;“匹配数据”;“图谱间距”和“单谱显示”功能..1数据恢复“数据恢复”功能是使当前处理结果恢复到图谱数据刚刚导入的状态..2匹配数据：“匹配数据”按钮可使用户直接观察峰匹配的结果图27..非共有图27 匹配数据结果在匹配结果中;共有峰白色和非共有峰灰色以不同颜色表示;便于用户观察..匹配结果也可保存为文本文件;或拷贝到剪贴板上;再粘贴到Excel表格中以方便用户使用类似于“相似度计算”结果..3图谱间距“图谱间距”可以调节绘制图谱间的距离;便于用户观察和分析..点击工具栏上“图谱间距”按钮;弹出“设置谱图间距”对话框图28;输入相应数值以调整谱图间距..4单峰显示“单峰显示”可使选中的图谱单个显示;便于用户观察和分析单个样本图谱..四卸载可以采用本系统提供的卸载程序进行卸载..也可在控制面板中;采用添加/删除程序卸载本程序..五应用实例为方便用户快速掌握本系统;我们以一例子加以介绍..例：对获取的色谱指纹图谱建立对照图谱;进行相似度评价;并打印报告..基本流程图如下图29：123 自动匹配图35 自动匹配结果4多点校正多点校正图36 多点校正设定图37 多点校正后自动匹配结果图谱图38 匹配数据结果5 对照图谱生成对照图图396相似度计算结果图407打印报告图41图42附录1：常用色谱工作站AIA.cdf格式文件的导出本软件系统的相似度计算是根据峰的积分面积进行的..建议用户从色谱工作站导出AIA.cdf数据文件之前;先对需要导出的数据进行积分处理;这样可以确保导出的AIA.cdf数据文件包含积分数据信息..Agilent 色谱工作站1. 打开Agilent 色谱工作站；2. 进入数据处理View>>Data Analysis；3. 调入要输出的色谱文件File>>Load Signal…；4. 进入数据输出窗口File>>Export File>>AIA File…;进入方式如下图所示：在弹出窗口中指定导出路径及文件名;确定..可导出AIA 格式文件..5. 若选择输出文本格式文件File>>Export File>>CSV File…;会弹出数据输出窗口..在数据输出窗口中;选中Signal 选项;在File Name 输入框中输入相应的文件名及文件保存路径..点击 OK..在Signal Export 窗口下;选中Times axis 及Y axis 两选项;点击OK 后即可.. 6. 重复以上操作;依次输出..Waters M32 色谱工作站建立输出方法登陆M32;右击Browse Data 小窗口;选择相应的Project..在Project 窗口中选定Results标签页面下要输出的某个数据点黑方法一：在File 菜单下;选New Method 下的Export Method…以建立输出方法模板方法二：在Database 菜单下;选Export Data…;在Export 窗口下点击Edit Method按钮..方法一：方法二：或选中需要输出的数据文件;选择或建立输出Export Method Editor在随后出现的Save current Export Method 窗口下的Name 框中填入输出方法名Raw Data 标签选择输出格式选择ASCII格式数据输出完关闭Export Method Editor 界面方法一：回到在Project 窗口;选中要输出的一个或多个数据；在Tools 菜单下选Export；在随后出现的Background Processing and Reporting 界面下确认Exporting 项下的Export 框打勾;在Use specified export method 框下选建立过的输出方法名点OK 键完成数据的输出到Windows 的数据输出目的目录下可看到输出的文件;此文件格式为.arw 或.cdf.. Shimadzu Class-VP 色谱工作站1、文件栏中Method→Advanced…弹出窗口：选择光谱输选择AIA.CDF输出AIA 文件；选择ASCII 输出文本格式.acs..2、关闭窗口后;再进行数据分析..分析结束后;即可以在指定的输出路径检查输出的文件..附录2：本软件涉及术语的注释 1 共有峰：指在相同的色谱条件下;不同批次或产地等的某种中药色谱图所共同具有的色谱峰..2 对照图谱：由原始实验数据经软件系统生成的具有代表性的特征图谱..其产生方法包括均值法和中位数法..3 参考色谱图：色谱峰匹配时;用户指定的保留时间固定且用于其它样本色谱峰的保留时间校正的某一样本色谱图..4 样本供试品色谱图：由原始实验数据形成的色谱图..5 时间窗宽度：时间窗宽度是指相对于参照图谱峰位置的可选保留时间范围;其单位根据横坐标轴的单位而定..新增功能解释：1 “十选一”的功能：对照图谱也可选择其中一个样本图谱作为对照图谱..该功能称为“十选一”的功能..用户只要选择一个谱图后;在“文件”菜单中的“导出文件保存图谱”的对点击加指定输出路话框中选择.Scp格式即可..2 设置当前谱图编号：用户根据实际需要设置当前谱图编号..当用户导入谱图之后可以通过“谱图处理”菜单中的“设置当前谱图编号”项来输入谱图批号见下图;也可以直接双击左侧列表中的谱图名称来输入谱图批号..3 缩放功能的更新：重新更换了原有的图谱缩放功能;改为拖放式的放大..用户根据需要自由拖放..放大倍数基本“无限制”..放大后的图谱可以通过鼠标双击恢复成原始大小..4 图谱列表显示：当用户在图谱列表即文件信息区中选中某一谱图时;当前图谱颜色加重;即显示为双线..5 图谱坐标的实时显示功能：状态栏实时显示鼠标在作图区的实际坐标见下图..鼠标坐6 色谱峰信息显示：在显示色谱峰的状态下;双击色谱峰时;显示出该色谱峰相关信息..7 打开报表功能：本软件系统可以将已存储的报表文件打开;方便用户调用和查阅..在“文件”菜单中点击“打开报表”即出现如下对话框;选中需要打开的报表文件点击“打开”即可..常见问题及解答：1 对照图谱“假峰”的解决方案样本图谱进行自动匹配时;有些色谱峰在现有的参数条件仍没有得到较好的匹配;使得一些色谱峰出现“错位”现象;导致生成的对照图谱含有比样本图谱更多的色谱峰;在这些色谱峰中;有些可以通过视觉判断发现它们可能是由于匹配结果不理想而造成的“假峰”..解决方案：可以采用“多点校正”功能多增加一些匹配点的设置;有效避免一些色谱峰出现“错位”现象;以改善匹配结果..这样生成的对照图谱的峰数与样本图谱相比不会偏差过多..2 AGILENT;WATERS;和SHIMADZU导出的图谱数据相互比较应注意的问题AGILENT;WATERS给出的色谱峰的强度一般采用吸光度表示AU或mAU;本系统已对这两种色谱工作站给出的色谱峰强度进行了单位统一..SHIMADZU色谱工作站给出的色谱峰强度既可以电压表示;也可以吸光度mAU表示..对于吸光度表示的色谱峰强度;本系统已进行了单位统一;但对于电压表示的色谱峰强度还需用户根据实际情况调整相关参数..本系统提供了相应的对话框;在导入以电压表示的色谱峰强度的数据时;该对话框会自动弹出;用户根据相同样本即同一注射剂在不同仪器上色谱峰强度的差异确定参数的设置..。
如何自己处理数据使能导入中药指纹图谱相似度系统进行分析
如何自己处理数据使能导入中药指纹图谱相似度系统进行分析我处理过安捷伦GC-MS，岛津LC-MS，主要目的是建立一个使中药色谱指纹图谱相似度评价系统能导入的TXT文件。
TXT文件中的主要内容有：（1）指纹图谱采样信号数据时间[min] 信号[mV]2.622 63324032.623 63992652.625 64661282.627 65329902.628 65372882.63 65415862.632 65458842.633 65501812.635 65544792.637 65587772.638 6563075（2）指纹图谱积分数据峰序保留时间[Min] 峰高峰面积1 2.633 6380302 679104752 2.785 21290379 2486595143 3.3 18345770 2519271244 3.497 29802449 3251832055 4.084 11453886 1533077476 4.267 8355683 750681907 4.677 17372755 4570443398 5.701 13256559 434419438（1）和（2）两部分的数据缺一不可。
（1）部分的数据主要通过色谱图信号导出，就会有时间和信号的数据，这些数据可以画出色谱图来。
（2）能过积分后，我们可以得到积分结果，将这两部分的数据合起来就是我们所要建立TXT文本了。
首先可以将两部分数据复制到Excel中，如下图所式注意上面的文字是少不了的，一定要写上哦。
第二步是新建一个TXT文本，分别将（1）（2）的数据复制到这个TXT文本中。
复制完（1）的数据按enter在第二行复制（2）的数据就可以了。
第三步是将TXT中“指纹图谱采样信号数据”和“指纹图谱积分数据”后面的空格选中后，按Delete，删除。
最后保存一下TXT文本，你就可以导入中药色谱指纹图谱相似度评价系统进行分析了。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范
中药色谱指纹图谱类似度评价体系的操纵规范【1 】(版本 2004 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 A）一．简介1．版本介绍：本软件体系包含两个运用版本：研讨版（2004 A）和磨练版（2004 B）.研讨版重要用于科学研讨工作,具有生成对比图谱功效.磨练版着重于色谱指纹图谱的磨练工作,不具有生成对比图谱的功效.2．体系运行情况请求：(1). 最低设置装备摆设：CPU主频533 MHz以上,内存64M,硬盘残剩最小空间100M,操纵体系Windows 98以上,屏幕分辩率800×600.(2). 推举设置装备摆设：PVI以上CPU,内存128M,硬盘空间20G,操纵体系Windows 2000以上,屏幕分辩率1024×768二．装配办法点击setup.exe后,进入装配程序,假如无其他特别须要,可以直接点击next至装配停止.图 1三．功效本软件体系包含文件导入,数据库治理,谱图处理,剖析磨练和帮忙等功效.装配完本体系后,运行“中药色谱指纹图谱类似度评价体系”履行程序,进入登陆界面（图2）,这时须要用户输入用户名和响应的暗码（现暂无设置暗码）.点击肯定进入启动界面（图3）,三秒钟后主动进入本体系运行主界面.图2图3图4画图区文件信息区体系主界面中,文件信息区显示文件的路径名称等信息,画图区显示响应的色谱指纹图谱的图形.1 文件打开（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5本体系支撑三种格局文件的导入：AIA(即*.cdf)文件,文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格局文件的导入（图5）.为了便利用户的运用,附录中给出了重要色谱工作站的（AGILENT,W ATERS,和SHIMADZU）AIA数据格局的文件导出介绍.（2）导出文件（保管图谱）本体系支撑将导入的图谱数据文件以文本文件（*.txt）导出保管（图6）.图6（3）导出图象将导入绘制的色谱图谱也可以图象情势存放,文件格局为*.bmp（图7）.图7（4）图谱删除本体系供给谱图删除功效（图8）.可以选中某一谱图删除（删除当前图谱功效）,也可将导入的谱图全体删除（消除所有图谱数据）.图82 数据库功效：数据库治理包含药材信息建档（图9）.制剂信息建档（图10）和参照图谱建档功效（图11）,便于用户信息治理.图9 图10图113 谱图处理：（1）数据剪切采取数据剪切功效用户可以选择一准时光规模内的色谱数据进行匹配（图12）.图12（2）色谱峰匹配色谱峰匹配包含指定参照峰,指定基准峰和主动匹配.下面一一介绍：•指定参照图谱：用户可以随意率性选择一条色谱图谱作为指定参照图谱.在图所示的对话框中输入参照图谱编号肯定后即可将编号对应的图谱指定为参照图谱（图13）.该图谱变成红色,以差别于其他图谱.图13•多点校订：体系支撑“多点校订”功效.用户依据须要直接在图谱上设置匹配点（匹配点数不限）进行多点校订.若设置成果不满足,再点击设置的匹配点即可撤消以前设置的匹配点.（图14）图14•主动匹配：本体系供给主动匹配功效,可实现色谱峰的主动匹配.主动匹配时,须要用户设置时光漂移,体系默认值为0.1（图13）.用户可以调节此参数以调剂色谱峰的匹配成果.（4）生成对比图谱对比图谱的生成须要先辈行谱峰匹配然后才干生成对比图谱.其生成办法包含均值法和中位数法（图13）.用户可以依据须要选择适合的办法生成对比图谱（见图15中标识为R的图谱）,并以特别格局导出（图14和16,对比图谱不克不及在“文件”菜单中以“导出文件”导出,必须以图14所示菜单中“导出对比图谱导出”）.对于打针剂建议采取均值法产生对比指纹图谱;对于中药材,建议采取中位数法产生对比指纹图谱.图15图16 （5）随机着色谱图：用户可以对绘制图谱的色彩进行随机着色（图14）.4 剖析磨练：（1）类似度盘算：对比图谱生成后,用户经由过程“类似度盘算”功效进行色谱图谱样本与对比图谱的类似度评价.评价成果以表格情势显示,并可保管（图17和18）.或将成果拷贝到剪贴板上以便利用户运用.图17图18（2）打印陈述：用户经由过程“打印陈述”功效将剖析成果打印出来.打印陈述中包含报表信息输入（图19）和剖析陈述两部分（图20和21）.个中剖析陈述包含原始指纹图谱,匹配后图谱和类似度评价成果.图19图20图215 帮忙为便利用户运用,本体系供给简练完全的联机帮忙.6 对象栏按钮简介：对象栏按钮如图所示(图22).个中大部分按钮的功效在前面已经介绍过,不再赘述.这里将重点介绍“数据恢复”,“图谱间距”,“单谱显示”和x与y轴放大功效.（1）数据恢复“数据恢复”功效是使当前处理成果恢复到图谱数据刚导入的状况.（2）图谱间距“图谱间距”可以调节绘制图谱间的距离,便于用户不雅察和剖析.（3）单峰显示“单峰显示”可使选中的图谱单个显示,便于用户不雅察和剖析单个样本图谱. （4）x与y轴放大功效经由过程此功效可以对图谱的x和y轴进行放大和缩小,体系默认值为100％. 四卸载在控制面板中,采取添加/删除程序卸载本程序.五运用实例为便利用户快速控制本体系,我们以一例子加以介绍.例：对获取的色谱指纹图谱树立对比图谱,进行类似度评价,并打印陈述.根本流程图如下（图23）：图231 样本图谱数据导入（AIA格局）图24图25 2 设参照图谱图263 主动匹配图27 主动匹配成果4多点校订多点校订（这里为2点）图28 多点校订设定图29 多点校订后主动匹配成果5 对比图谱生成图30 图31 图32 对比图谱非共有峰图33图34附经常运用色谱工作站AIA格局文件的导出：Agilent 色谱工作站1. 打开Agilent 色谱工作站;2. 进入数据处理（View>>Data Analysis）;3. 调入要输出的色谱文件（File>>Load Signal…）;4. 进入数据输出窗口（File>>Export File>>AIA File…）,进入方法如下图所示：在弹出窗口中指定导出路径及文件名,肯定.可导出AIA 格局文件.5. 若选择输出文本格局文件（File>>Export File>>CSV File…）,会弹出数据输出窗口.在数据输出窗口中,选中Signal 选项,在File Name 输入框中输入响应的文件名及文件保管路径.点击 OK.在Signal Export 窗口下,选中Times axis 及Y axis 两选项,点击OK 后即可.6. 反复以上操纵,依次输出.Waters M32 色谱工作站树立输出办法登陆M32,右击Browse Data 小窗口,选择响应的Project.在Project 窗口中选定Channels 标签页面下要输出的某个数据（点黑）办法一：在File 菜单下,选New Method 下的Export Method…以树立输出办法模板办法二：在Database 菜单下,选Export Data…,在Export 窗口下点击Edit Method 按钮.办法一：办法二：或选中须要输出的数据文件,选择或树立输出办法在随后消失的Save current Export Method 窗口下的Name 框中填入输出办法名封闭Export Method Editor 界面办法一：回到在Project 窗口,选中要输出的一个或多个数据;在Tools 菜单下选Export;在随后消失的Background Processing and Reporting 界面下确认Exporting 项下的Export 框打勾, 在Use specified export method 框下选树立过的输出办法名点OK 键完成数据的输出到Windows 的数据输出目标目次下可看到输出的文件,此文件格局为*.arw 或*.cdf. Shimadzu Class-VP 色谱工作站1.文件栏中Method→Advanced…弹出窗口：选择AIA（*.CDF）输出AIA 文件;选择ASCII 输出文本格局（*.acs）.2.封闭窗口后,再进行数据剖析.剖析停止后,即可以在指定的输出路径检讨输出的文件.。
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中药色谱指纹图谱相似度评价系统国家药典委员会翟为民背景国家食品药品监督管理局于2000年先后下达“关于加强中药注册管理有关事宜的通知”（国药管注［2000］157号）和关于印发《中药注射剂色谱指纹图谱研究的技术要号）和“关于印发《中药注射剂色谱指纹图谱研究的技术要求》的通知”（国药管注［2000］348号）文件。
国家药典委员会负责组织实施“已批准生产的中药注射剂质量标准的提高完善及指纹图谱工作”及牵头组织“已批准多家生产的中药注射剂，其指纹图谱联合起草工作”。
国家药典委员会从2000年12月起开始组织实施，进行了可行性调研、规范性技术文件起草与研究、同布进行了科技部立项。
从中药注射剂的指纹图谱研究质量标准提高逐步从中药注射剂的指纹图谱研究、质量标准提高，逐步成熟、扩展，到2010版药典，部分提取物和中成药标准中都收载了指纹图谱项目，为发挥着积极的作用。
1、论证1论证首先进行调研，多次召开研讨会，代表涉及科研院所、中央和省级药品检验所及企业科技人员。
形成共识：央和省级药品检验所及企业科技人员形成共识：①重点-色谱指纹图谱；②理论上可行。
②理论上可行③通过实践，检验可行性，不断完善。
2、修订《中药注射剂指纹图谱研究技术要求》（国药谱管注［2000］348号）①优化、方法验证，细化参数、明确要求。
②解决手工计算“共有峰”、“非共有峰”面积工作中大量的人为因素，改变“只见树木不见森林”的局面，力求量的人为因素改变“只见树木不见森林”的局面力求反映整体质量特性。
二规范性技术文件起草与研究工作二、规范性技术文件起草与研究工作1、修订修订稿就原料药材、半成品、成品的样品收集、制备、参照物的选择，指纹图谱试验条件，对实验室的要求，对仪器的要求，试验方法和试验条件的建立及验证，色谱条件的优选，指纹图谱的建立和验证、识别、计算和复核，标准书写格式指纹图谱的建立和验证识别计算和复核标准书写格式等进行了详尽的细化规定，起草稿经广泛征求意见，先后进行了多次修改得以完成。
以《中药注射剂色谱指纹图谱试验研究操作规程指南》（试行）的名义发布，作为局颁“技术要求”的补充。
2、计算机辅助中药指纹图谱相似度计算软件的研究开发对于成药而言，如何控制批与批之间质量的稳定，这就要求需采用某种手段能定量地表征各样品间的相似程度(或差异性)而不是真伪鉴别，从整体性考虑，采用指纹图谱，在批间稳定等方面能够发挥积极作用。
也就需要建立一套能整体反应各样品指纹图谱之间相似程度的计也就需要建立套能整体反应各样品指纹图谱之间相似程度的计算方法，但原版“技术要求”采用共有峰和非共峰之比值的人工计算方法，该方法仅考虑了人为选定的几个特征峰的相似性，即将一个完整的事物割裂开进行比对，是不全面的，未能将中药内在成分的整体特性表达出来，因此，要创建一套能定量比对整体上反映中药内含成分指纹图谱相似程度的工具上反映中药内含成分指纹图谱相似程度的工具。
•国家药典委员会组织沈阳药科大学、浙江国家药典委员会组织沈阳药科大学浙江大学、中南大学、清华大学、北京大学医学部医药科技开发中心、西北大学、中国学部药科技发中北大学中国药品生物制品检定所、第二军医大学八家单位，于2004年集中测试修改定型《计算机辅助中药指纹图谱相似度计算软件》。
•软件的开发过程与中药注射剂指纹图谱的科研工作直保持了同步。
这种同步的应科研工作一直保持了同步。
这种同步的应用也给软件的测试使用创造了条件。
•开发初期设计思路是将色谱数据导入MATLAB 开发初期设计思路是将色谱数据导入的专业数据处理的软件中进行相似度的计算。
后考虑到知识产权保护的问题，采用自主编程，将指纹图谱数据导入，数据库管理，计算方法选择，谱图处理等功能综合考虑，设计开发而成。
计开发而成软件基本算法与版本一、算法选择简介二、修订改版工作三、2.0版的介绍•一、首要问题是选择算法•课题组同步进行了《指南》的制定与算法的评价与选择，通过大量计量化学方面的研讨与对比验证，选择了夹角余弦法。
研讨与对比验证选择了夹角余弦法中药指纹图谱是表征中药复杂成分与其质量关系的重要手段中药指纹图谱是表征中药复杂成分与其质量关系的重要手段。
在表征过程中程中，，相似度评价起着关键作用相似度评价起着关键作用。
目前常用的相似度评价方法主要有峰重叠率评价方法比较与算法选择简介法（Nei Nei系数法系数法））,相关系数法相关系数法,,距离系数法距离系数法,,向量夹角余弦法与峰重叠率和共有峰强度结合法有峰强度结合法（（改进的改进的Nei Nei系数法系数法））。
指纹图谱波动对各种评价方法的影响:.1.00 A B C 750.800.850.90095r i t yD E550.600.650.700.S i m i l a 0.000.050.100.150.200.450.500.F l u c t u a t i n g I n t e n s i t yA.夹角余弦法B.相关系数法C.距离系数法D. Nei 系数法E.改进的Nei 系数法由于药材的产地来源储藏条件和加工工艺的不同以及仪器设备的稳定性等原结果表明：A 方法受指纹图谱波动的影响最小由于药材的产地、来源、储藏条件和加工工艺的不同，以及仪器设备的稳定性等原因使得指纹图谱产生一定的波动。
举例：向痛必定粉针制剂高效液相色谱指纹图谱中随机地加入一定强度的波动，以考查波动对相似度评价方法的影响。
结果如上图。
小峰的缺失的影响：091.0AB 0.70.80.9C D Ei m i l a r i t y040.50.6S 0.30.40~5%0~3%The scope of lost peaks in fingerprint0~1%A.夹角余弦法B.相关系数法C.距离系数法D. Nei 系数法E.改进的Nei 系数法在药材加工和提取过程中，药材中的某些成分往往会有一定的损失，导致结果表明：A 方法受小峰缺失的影响最小在药材加工和提取过程中，药材中的某些成分往往会有定的损失，导致指纹图谱出现峰的缺失。
假设峰的缺失主要为峰面积较小的峰，以5％作为阈值，将缺失峰分成0～1％，0～3％和0～5％三组进行考察。
大峰的缺失的影响1.0 AB C 大峰的缺失的影响：0.80.9a r i t yD E0.60.7S i m i l 01230.40.5o f la r g e r p e a k s lo s t in f in g e r p r in tN u m b e r o la p lo t in f A.夹角余弦法B.相关系数法C.距离系数法D. Nei 系数法E.改进的Nei 系数法结果表明结果表明：A 方法受大峰缺失的反映较“灵敏”在药材加工和提取过程中，指纹图谱中大峰的缺失并不常见。
而对于同属不同种的药材，大峰的差异是有可能的。
考察了大峰缺失的影响举例。
数据标准化处理的影响：数据标准化处理一般会影响各种方法的相似度评价结果。
若处理前后样本的相似度评价结果的大小（等级）顺序变化较小，说明标准化处理对样本的亲疏远近关系影响较小反之影响较大采用相关系数进行检验Influence of data autoscaling on different methods较小，反之影响较大。
采用Spearman 相关系数进行检验。
g for evaluating similarity距离系数相关系数夹角余弦Spearman 系数 0.827 1 0.927( = 0.01, 2-tailed, r s =0.735)0.842 0.795 0.790数据标准化对表中三种评价方法所得结果影响较小关于对照模式的计算x …•平均矢量（重心）= j (x 1j ,x 2j ,…,x nj )/m •中位数矢量=median((x 1j ,x 2j ,…,x nj ))两种对照模式•批样品中不存在离群(outlier)样本时，一般推荐使用平均矢量（重心）作为对照模式矢量•样品中存在离群样本时，推荐使用具有稳健(robust)性质的中位数矢量来作为共有模式矢量，这种情况可能在计算原料药材样本时的共有模式出现。
出现•采用具有稳健性质的中位数矢量来作为对照模式，就不会因为原料药材样本中出现了一个离群样本就不会因为原料药材样本中出现了个离群样本时而影响整个药材的对照模式。
值得指出的是如果不存在离群样本时两种方•值得指出的是，如果不存在离群样本时，两种方法所得结果应该基本一致。
一、2004年版软件与算法简介•版本:研究版（2004A）•研究版（2004 A）•检验版（2004 B）研究版（2004 A ）检验版（2004 B ）应用范围科学研究指纹图谱的检验工作功能具有生成对照图谱功能不具有生成对照图谱功能研究版（2004A 2004B 18结论2004 A ）的功能较多，且函盖了检验版（2004 B ）具有的功能•2004版以后，根据使用情况，验证并确认保持核算法不变保持核心算法不变。
•根据使用中收集的反馈意见，补充必要的需求，按照软件编制规范，彻底梳理并重需求按照软件编制规范彻底梳理并重新编写了全部代码，在人机交互方面进一步完善，并且为了适应管理需要增加了相步完善并且为了适应管需要增加了相应的功能。
进行了不同范围的测试，形成了2.0版。
业已获得软件著作权证书。
2.0版介绍20版介绍•运行环境硬件•1、硬件：•最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，屏幕分辨率硬盘剩余最小空间100M屏幕分辨率800×600。
•2、软件环境：2软件环境•支持的操作系统：windows 98，windows 2000、windows 2003、windows XP。
windows7（32位）（64位）•下载： fp chp org cn •安装：•操作流程•生成对照图谱•检验主界面•文件列表区：显示打开的图谱文件列表。
•文件详细信息区：显示选中文件信息。
•绘图区：绘制图谱，标注色谱峰。
•状态栏：显示工作状态、当前用户、登录时间等信息。
•快捷工具栏：常用按钮：•鼠标有提示•工作状态切换•注意提示：•全谱导入（单、多个多个）：*.cdf*.txt *.SCP *.XSCP*SCP*XSCP•可打开三种格式的报表：式的报表*.rdf*.qrp.XQRP*.XQRP导出文件（图谱）图谱*.txt*S *.Scp导出图像*bmp *.bmp*.wmf参照图谱信息删除选定的图谱•（可多选）•删除所有图谱•多一项确认，再•删除单个或多个图谱。
多项确认，再清除。
•也可以选定列表中的文件，直接按DEL键。
视图菜单图谱间距调整图谱间距•放大图谱、缩小图谱、原始大小•快捷工具栏或者菜单中选择、鼠标单谱显示多谱显示显示或隐藏色谱峰菜单、右键，显示或隐藏。