板栗过氧化氢酶基因CmCAT的克隆与原核表达

合集下载

《甜瓜CmHsp70-9及CmXTH28-2基因的克隆及其在果实发育中功能的初步鉴定》范文

《甜瓜CmHsp70-9及CmXTH28-2基因的克隆及其在果实发育中功能的初步鉴定》范文

《甜瓜CmHsp70-9及CmXTH28-2基因的克隆及其在果实发育中功能的初步鉴定》篇一摘要:本研究旨在克隆甜瓜中两个关键基因——CmHsp70-9和CmXTH28-2,并对其在果实发育过程中的功能进行初步鉴定。

通过生物信息学分析、基因克隆、表达模式分析以及转基因技术等手段,揭示了这两个基因在甜瓜果实发育中的潜在作用。

一、引言甜瓜作为重要的经济作物,其果实发育及品质形成过程一直是研究的热点。

近年来,随着分子生物学技术的飞速发展,越来越多的研究关注于甜瓜果实发育过程中的基因调控机制。

本研究以甜瓜为材料,对CmHsp70-9和CmXTH28-2两个基因进行克隆和功能分析,以期为进一步揭示甜瓜果实发育的分子机制提供理论依据。

二、材料与方法1. 材料来源实验材料取自于甜瓜果实发育不同时期的样品,包括未成熟果、成熟果以及衰老果等。

2. 基因克隆利用PCR技术,结合生物信息学分析,从甜瓜基因组中克隆出CmHsp70-9和CmXTH28-2两个基因的cDNA序列。

3. 表达模式分析通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,分析两个基因在甜瓜果实发育不同阶段的表达模式。

4. 转基因技术构建过表达和沉默这两个基因的转基因甜瓜植株,观察其果实发育过程中的表型变化。

三、实验结果1. 基因克隆结果成功克隆出CmHsp70-9和CmXTH28-2两个基因的cDNA序列,并进行了序列分析。

2. 表达模式分析qRT-PCR结果显示,两个基因在甜瓜果实发育的不同阶段表现出不同的表达模式,其中CmHsp70-9在果实发育早期高表达,而CmXTH28-2在果实成熟期表达量较高。

3. 转基因技术结果过表达和沉默这两个基因的转基因甜瓜植株在果实发育过程中表现出明显的表型变化。

过表达CmHsp70-9的植株果实发育速度加快,而过表达CmXTH28-2的植株果实品质得到改善。

相反,沉默这两个基因的植株则表现出果实发育受阻或品质下降的表型。

原核表达步骤

原核表达步骤

原核表达步骤实验方法与步骤1 表达质粒的构建及测序分析1.1 cofilin-1的片段的准备1.1.1 引物设计根据在GenBank上查找人源cofilin-1的基因序列,用Primer Premier 5.0软件进行上下游引物的设计,并送往上海生物工程技术服务有限公司合成的PCR 引物。

引物如下:引物名称序列F-cofilin-1 5′-AAGTCGACATATGGCCTCCGGTGTG-3′R-cofilin-1 5′-TCTCTCGAGGGCTCACAAAGGCTTG-3′将以上引物用灭菌的三蒸水稀释成10μmol/L,分装于Eppendorf管中,-20℃冰箱中保存备用。

1.1.2 cofilin-1片段PCR1 反应体系:2.5μlKOD polymerase(3’-5’核酸外切酶活性)KOD polymerase buffer 5μlMgSO4 2.5μlDMSO(“万能溶剂”)2.5μldNTPMix ture 5μlPrimerF(底物)1.5μlPrimerR 1.5μlTemplate(模板)5μlddH2O 25μlTotal 50μl2PCR反应条件:①94℃预变性3min②94℃退火30s③65℃延伸40s④68℃40s⑤go to②30个循环⑥68℃5min⑦4℃forever3 琼脂糖凝胶电泳对PCR产物进行检测(1)配置浓度为1%的凝胶。

称取琼脂糖0.3g,加入30ml 1×TAE电泳缓冲液(Tris-乙酸电泳缓冲液)中,用微波炉加热2min,待凝胶稍冷却,加入2μl EB(溴化乙锭,荧光染色剂)混匀后倾入凝胶铸槽中,插入梳子,并用玻璃棒驱除气泡,待凝胶完全凝结后拔除梳子。

(2)把凝胶置于1×TAE电泳缓冲液的电泳槽中,加样孔置于负极一侧,然后依次在加样孔中加入50μl Marker、50μl样品+10μl loading buffer(上样缓冲液,可以显示两条带,前面的蓝色的条带是溴酚蓝,代表的片段大小是300bp,后面的有点绿色的条带是二甲苯青,代表的片段大小在4000bp左右),盖上电泳盖,以100V电压进行电泳。

原核表达及一步法制备可溶性白喉毒素突变体CRM197

原核表达及一步法制备可溶性白喉毒素突变体CRM197
Abstract:Objective Toconstructanovelprokaryoticexpressionsystem,inwhichcrossreactingmaterial197 (CRM197)canbeexpressedinasolubleform inEscherichiacoli(E.coli)cytoplasm andpurifiedsimplybyone stepNiNTAaffinitypurification.Methods TheCRM197codingsequencewasclonedintotheprokaryoticexpres sionvectorpET32a(+)asanfusionproteinwithTrxtag,theHRV3C(humanrhinovirus3C)proteaserecognition sequenceand6histidinesequencewereaddedtotheNterminalofCRM197.HRV3Cproteasegenewasclonedinto anotherprokaryoticexpressionplasmidpGArasd.BothplasmidswerecotransformedintoE.coliOrigamiB(DE3) andinducedmildlyat15℃.CRM197recombinantproteinwaspurifiedbyNiNTA affinitymatrix.Results The freesolubleHistaggedCRM197proteinwasreleasedbycleavageoftheaccompanyingexpressedHRV3Cprotease aftertheCRM197fusionproteinwasexpressed.AfteronestepaffinitypurificationrecombinantCRM197protein withapurityofalmost95% wasobtained.OutcomingofthefinalpreparationincubatedwithDNAindicatedthepu rifiedCRM197recombinantproteinhasdeoxyribonucleaseactivity.Conclusions Byconstructinganoveldouble plasmidautocleavageprokaryoticexpressionsystem inthisstudy,theproductionprocessofobtainingsoluble

IL-1β的基因克隆及在原核中的表达

IL-1β的基因克隆及在原核中的表达

图0
!"#$ E
经 /"#$% !诱导的 +#$, 细胞培养上清对 12##$- 细胞的增殖作用
J?4 4334<@ 23 672/"347-@"2. 23 IJ99(C <4//1 1@"A=/-@4F L0 @?4 <=/@=74 12/=@"2. 23
!"!
重组人 )*&# !的高效表达 将 /K%, 按方法 -)M 节诱导工程菌表达。 N.N%&#OP 分析, 发现诱导 "质粒转化 .5* !
后在 -Q)*+. 处出现一条新蛋白质条带, 证实为重组蛋白 (图 6) 。薄层扫描分析表明, 重 组蛋白的含量约占菌体总蛋的 R(S 。 !"+ 重组蛋白的分离纯化 将菌体超声破菌后, 发现重组蛋白为胞内可溶性表达, 离 N.N%&#OP 分析上清和沉淀, 心收集上清液。由于大肠杆菌内多为酸性蛋白, 而 /K%的等电点为 左右, 因此我 1/M)* " 们将超声破菌后上清调 15 值至 *)Q, 用 ’T%>=1GB<D>=88 柱进行纯化, 大部分杂蛋白不被吸 附而穿过, 目的蛋白被吸附在柱上, 用 -JD@0K "B’@ 溶液梯度洗脱, 约在 ()6JD@0K "B’@ 浓度 时, 目的蛋白被洗脱下来。将洗脱样品用 O4* F9I= 柱脱盐后, 再用 .P#P%N=1GB<D>=88 柱做 进一步纯化, 流动相选择 15M)( 的 ()(4JD@0K $<9>%5’@ 缓冲液, 在这种 15 状态下, /K%"不 被吸附而穿过, 收集穿过峰样品, 在 -Q)*+. 左右明显可见目的蛋白条带 N.N%&#OP 分析, (图 R) , 经扫描分析, 纯度大于 UQS 。

长白落叶松过氧化氢酶LoCAT1基因克隆及表达分析

长白落叶松过氧化氢酶LoCAT1基因克隆及表达分析
(State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding? Northeast Forestry University, Harbin 150040)
06/3-)73 In order to know about genes of Larix olgensis catalase and determine the expression characteristics in different organs of L. olgensis under different stresses, a CATl gene was cloned based on specific primers designed according to the CATl gene sequences from transcriptome database of L. olgensis, named LoCATl. The complete length of open read frame( ORF) is 954 bp, encoding 3l7 amino acids. The results of phylogenetic tree analysis indicated that there was a closer relationship between LoCATl and Picea sitchensisand Ginkgo biloba. By real-time quantitative polymerase chain reaction ( qPCR) analysis, LoCATl is highly expressed in leaf, while less expressed in stems. The expressions of LoCATl were obviously difference in roots and stems and leaves of L. olgensis under abiotic stress. The expression patterns of LoCATl were not exactly similarity among these treatments. The expression levels of LoCATl in roots and stems of L. olgensis after the treatment of NaCl were down-regulated, with the lowest expression at l2 h. While expression level in leaves was significantly inhibited at 24 h, and then up-regulated, with the highest expression at 96 h. The expression levels of LoCATl in roots and stems of L. olgensis after the treatment of PEG6000 were significantly inhibited in the early stage and then up-regulated. While LoCATl expression level in leaves was up-regulated. It was suggested that LoCATl

大肠杆菌中人过氧化氢酶基因的克隆与表达

大肠杆菌中人过氧化氢酶基因的克隆与表达

大肠杆菌中人过氧化氢酶基因的克隆与表达摘要:在大肠杆菌中利用基因重组技术获得高效表达的人过氧化氢酶(catalase,CAT),即利用pMAL-c2x构建了从人cDNA文库中获得的CAT编码基因融合表达载体,并进行了表达。

使融合表达获得可溶性蛋白,为后续重组酶性质的研究和开发利用奠定了基础。

关键词:大肠杆菌;人过氧化氢酶基因;融合表达;表达1 过氧化氢酶的功能与来源在生物体的新陈代谢中,细胞有氧呼吸所消耗的O2约10%被还原成H2O2,而其很容易被细胞中各种还原剂还原成OH-和极毒的自由基·OH,它能氧化与它接触的几乎所有细胞组分,引起衰老、癌变及其它病症。

但生物体有自己的保护机制,体内存在的过氧化氢酶(catalase,CAT)能有效地催化细胞中产生的高浓度H2O2(2H2O2→O2+2H2O),使H2O2不至于与细胞有氧代谢中产生的超氧阴离子自由基O-2·进一步生成羟自由基·OH,从而防止自由基对细胞的损伤[1]。

此外,CAT还具有一些其它的生理功能。

它除了可调节体内H2O2水平外,还可充当Hb和其它含巯基蛋白质的保护剂。

主要与细胞内线粒体及过氧体结合,同D-氨基酸氧化酶等一系列需氧脱氢酶相偶联,从而迅速分解细胞代谢中产生的毒性物H2O2,起到解毒与保护巯基酶、膜蛋白等作用[2]。

商品化的过氧化氢酶主要来源于牛肝、微球菌和黑曲霉[3],多应用于工业生产[4]。

而对医药和保健来说,人源的CAT应用价值更高。

本研究利用基因重组技术将人CAT基因分别构建了融合和非融合表达载体,在大肠杆菌中实现了有生物活性的表达,为其开发利用奠定了基础。

2 人过氧化氢酶基因在大肠杆菌中的克隆与表达2.1 材料人cDNA文库(购自PROMEGA公司);菌种E.coli TB1、JM109,质粒pMAL-c2x、pBV221,抗MBP抗血清,Amylose Resin(购自NEB公司);TaqDNA聚合酶,限制性内切酶XbaⅠ、PstⅠ、NcoⅠ,DNA回收试剂盒,DL3000 DNA Marker,pMD19-T Vector(购自TaKaRa公司);Factor Ⅹa(购自BioLabs公司);二抗(羊抗兔),(购自北京百灵克生物公司)。

《CmMATE28基因在甜瓜生长发育中的功能分析》范文

《CmMATE28基因在甜瓜生长发育中的功能分析》范文

《CmMATE28基因在甜瓜生长发育中的功能分析》篇一一、引言随着现代生物技术的快速发展,基因功能的研究已经成为植物生物学领域的重要课题。

甜瓜作为一种重要的经济作物,其生长发育过程中的基因调控机制研究显得尤为重要。

CmMATE28基因作为甜瓜基因组中的一员,其在甜瓜生长发育过程中可能发挥着关键作用。

本文旨在通过对CmMATE28基因的功能分析,揭示其在甜瓜生长发育中的重要作用。

二、材料与方法2.1 实验材料本实验所使用的甜瓜品种为‘夏甜一号’,CmMATE28基因的cDNA序列及蛋白质序列均来自公共数据库。

2.2 实验方法(1)基因克隆与表达分析:通过PCR技术克隆CmMATE28基因,并利用生物信息学方法对其序列进行分析。

通过实时荧光定量PCR技术,分析CmMATE28基因在不同生长发育阶段的表达情况。

(2)转基因技术研究:构建CmMATE28基因的过表达和沉默载体,通过农杆菌介导法将载体转入甜瓜植株,获得转基因甜瓜。

(3)表型分析:对转基因甜瓜与野生型甜瓜进行表型观察,包括生长速度、果实大小、品质等指标的对比分析。

(4)生理生化分析:通过测定转基因甜瓜与野生型甜瓜的相关生理生化指标,如光合作用、呼吸作用、抗逆性等,探究CmMATE28基因对甜瓜生长发育的影响。

三、结果与分析3.1 CmMATE28基因序列分析通过生物信息学方法对CmMATE28基因的序列进行分析,发现该基因编码一个膜转运蛋白,可能参与植物的生长发育过程。

3.2 CmMATE28基因表达分析实时荧光定量PCR结果表明,CmMATE28基因在甜瓜的不同生长发育阶段表达量存在差异,尤其在果实发育期表达量较高,表明该基因可能参与果实的发育过程。

3.3 转基因技术研究成功构建了CmMATE28基因的过表达和沉默载体,并获得转基因甜瓜。

过表达CmMATE28基因的甜瓜表现出较强的生长势和果实大小增加;而沉默CmMATE28基因的甜瓜则表现出生长缓慢和果实变小。

《甜瓜CmBAG6-2基因在其果实发育中功能的初步分析》范文

《甜瓜CmBAG6-2基因在其果实发育中功能的初步分析》范文

《甜瓜CmBAG6-2基因在其果实发育中功能的初步分析》篇一一、引言甜瓜作为一种重要的经济作物,其果实发育过程中的品质和风味直接影响其市场价值。

近年来,随着分子生物学技术的飞速发展,基因功能的研究逐渐成为作物品质改良的重要手段。

本文旨在初步分析甜瓜CmBAG6-2基因在其果实发育过程中的功能,为甜瓜品质的遗传改良提供理论依据。

二、材料与方法1. 材料选取不同发育阶段的甜瓜果实作为实验材料,包括未成熟、成熟和过熟期果实。

同时,收集甜瓜的基因组数据和转录组数据。

2. 方法(1)生物信息学分析:利用生物信息学软件对CmBAG6-2基因的序列进行注释和功能预测。

(2)基因克隆与表达分析:通过PCR技术克隆CmBAG6-2基因,并利用实时荧光定量PCR技术分析其在不同发育阶段果实中的表达水平。

(3)转基因技术:构建CmBAG6-2基因的过表达和敲除载体,利用转基因技术获得转基因甜瓜。

(4)果实发育相关指标的测定:测定转基因甜瓜果实的大小、重量、可溶性糖含量、风味物质含量等指标。

三、结果与分析1. 生物信息学分析结果CmBAG6-2基因编码一个BAG家族蛋白,该蛋白在植物细胞中具有分子伴侣的作用。

通过序列比对和功能预测,发现CmBAG6-2基因可能与甜瓜果实发育过程中的某些生物过程相关。

2. 基因表达分析结果实时荧光定量PCR结果显示,CmBAG6-2基因在甜瓜果实发育的不同阶段表达水平存在显著差异,尤其在成熟期表达量较高。

这表明CmBAG6-2基因可能参与甜瓜果实的成熟过程。

3. 转基因技术及果实发育相关指标测定结果(1)过表达载体和敲除载体的构建成功,并获得了转基因甜瓜。

(2)与野生型甜瓜相比,转基因甜瓜在果实大小、重量、可溶性糖含量、风味物质含量等方面表现出显著差异。

过表达CmBAG6-2基因的转基因甜瓜果实品质得到改善,而敲除该基因的转基因甜瓜果实品质下降。

这表明CmBAG6-2基因在甜瓜果实发育过程中具有重要作用。

《CmMATE28基因在甜瓜生长发育中的功能分析》范文

《CmMATE28基因在甜瓜生长发育中的功能分析》范文

《CmMATE28基因在甜瓜生长发育中的功能分析》篇一一、引言随着生物科技的进步,植物基因的功能研究已经成为现代农业和园艺学领域的研究热点。

CmMATE28基因作为一种新型基因,其在甜瓜生长发育中的具体功能尚未完全明了。

本研究以甜瓜为研究对象,对CmMATE28基因的功能进行深入分析,旨在为甜瓜的遗传育种和栽培管理提供理论依据。

二、材料与方法1. 材料本实验以甜瓜为研究对象,选用CmMATE28基因的纯合转基因株系及野生型作为实验材料。

2. 方法(1)基因克隆与序列分析:利用PCR技术克隆CmMATE28基因,进行序列分析,明确其编码的氨基酸序列及结构特点。

(2)转基因操作:构建CmMATE28基因的过表达和沉默载体,利用农杆菌介导法将其转入甜瓜中,获得转基因株系。

(3)生长指标测定:测定转基因株系与野生型在生长过程中的表型、产量等指标。

(4)生理生化分析:通过测定相关生理生化指标,如光合作用、呼吸作用、抗逆性等,探究CmMATE28基因在甜瓜生长发育过程中的作用机制。

(5)qRT-PCR技术:运用qRT-PCR技术分析CmMATE28基因在不同组织器官及不同发育阶段的表达模式。

三、结果与分析1. 基因克隆与序列分析通过PCR技术成功克隆了CmMATE28基因,并进行了序列分析。

结果表明,CmMATE28基因编码的氨基酸序列具有典型的跨膜结构域特征,属于膜蛋白家族成员。

2. 转基因操作与生长指标测定成功构建了CmMATE28基因的过表达和沉默载体,并将其转入甜瓜中,获得了转基因株系。

与野生型相比,转基因株系在生长过程中的表型、产量等指标有所差异。

其中,过表达CmMATE28基因的转基因株系表现出更好的生长势和产量优势。

3. 生理生化分析通过测定相关生理生化指标发现,过表达CmMATE28基因的转基因株系具有更高的光合作用效率和更强的抗逆性。

此外,CmMATE28基因的表达水平与甜瓜的呼吸作用、营养吸收等生理过程密切相关。

板栗CmWRKY基因的克隆、序列分析与原核表达

板栗CmWRKY基因的克隆、序列分析与原核表达

华北农学报 2019ꎬ34(4):37 ̄45收稿日期:2019-03-17基金项目:国家自然科学基金项目(31400547)作者简介:刘裕峰(1991-)ꎬ男ꎬ四川泸州人ꎬ在读博士ꎬ主要从事林木病理与分子生物学研究ꎮ通讯作者:韩㊀珊(1978-)ꎬ女ꎬ宁夏吴忠人ꎬ副教授ꎬ博士ꎬ主要从事林木病理与分子生物学研究ꎮ板栗CmWRKY基因的克隆㊁序列分析与原核表达刘裕峰ꎬ朱天辉ꎬ刘应高ꎬ谯天敏ꎬ李姝江ꎬ龙旭梅ꎬ韩㊀珊(四川农业大学林学院ꎬ四川成都㊀611130)㊀㊀摘要:为深入研究板栗WRKY转录因子基因在板栗抗病过程中的分子作用机制ꎬ根据板栗转录组数据库分析获得EST序列ꎬ利用RT ̄PCR技术ꎬ克隆板栗WRKY转录因子cDNA(CmWRKY)序列ꎬ分析CmWRKY基因及其编码蛋白的相关信息并进行原核表达研究ꎮ结果表明ꎬCmWRKY基因为1437bpꎬ编码479个氨基酸ꎬ推测蛋白分子质量为52.12896kuꎬ理论等电点为9.15ꎬ具有2个WRKY保守结构域和2个C2H2锌指结构域ꎬ属于WRKY家族的第Ⅰ组ꎬ基因登录号为KY312850.1ꎮCmWRKY核苷酸序列与巴旦木等植物的WRKY基因一致性均在80%以上ꎬ与西班牙栓皮栎WRKY基因一致性最高ꎬ达到97%ꎮ同源建模表明ꎬCmWRKY蛋白三级结构与拟南芥AtWRKY1蛋白结构相似ꎬ推测其可能与AtWRKY1具有相似的调控功能ꎮ分子进化分析显示ꎬ板栗CmWRKY与西班牙栓皮栎及核桃WRKY蛋白亲缘关系最近ꎮSDS ̄PAGE蛋白电泳分析表明ꎬCmWRKY蛋白最佳诱导表达条件为0.2mmol/LIPTG在30ħ下诱导10hꎬ蛋白分子质量为56kuꎬ其主要以可溶性蛋白的形式存在ꎮ为板栗CmWRKY基因的生物学功能研究及应用奠定基础ꎮ关键词:板栗ꎻCmWRKYꎻ基因克隆ꎻ序列分析ꎻ原核表达中图分类号:Q785ꎻQ786ꎻS664.03㊀文献标识码:A㊀文章编号:1000-7091(2019)04-0037-09doi:10.7668/hbnxb.201751408CloningꎬSequenceAnalysisandProkaryoticExpressionofCmWRKYfromCastaneamollissimaBLLIUYufengꎬZHUTianhuiꎬLIUYinggaoꎬQIAOTianminꎬLIShujiangꎬLONGXumeiꎬHANShan(CollegeofForestryꎬSichuanAgriculturalUniversityꎬChengdu㊀611130ꎬChina)Abstract:TheESTsequenceofWRKYgenewasobtainedbasedonthetranscriptomedatabaseofCastaneamollissimaBLꎬandthecDNA(CmWRKY)sequenceofWRKYtranscriptionfactorinchestnutwasclonedbyRT ̄PCR.TheinformationofCmWRKYgeneanditsencodingproteinwereanalyzedandthegeneexpressioninthepro ̄karyoticcellwascarriedout.TheresultsshowedthatCmWRKYgenewas1437bpinlengthꎬencoding479aminoacidswithacalculatedmolecularweightof52.12896kuandtheoreticalisoelectricpointof9.15.IthadtwoWRKYconserveddomainsandtwoC2H2zincfingerdomainsꎬbelongingtoGroupⅠoftheWRKYfamilyꎬanditsgeneaccessionnumberwasKY312850.1.AtthenucleotidelevelꎬthesimilarityoftheCmWRKYgenewiththecor ̄respondingsequenceofPrunuspersicawasover80%ꎬandthehighestsimilaritywiththeQurcussuberWRKYgenewas97%.HomologymodelingindicatedthatthetertiarystructureofCmWRKYproteinwassimilartoWRKY1pro ̄teinofArabidopsisthalianaꎬsuggestingthatitmighthavethesimilarregulatoryfunctionasAtWRKY1did.Molecu ̄larevolutionanalysisshowedthatchestnutCmWRKYwascloselyrelatedtotheWRKYofQurcussuberandJuglansregia.SDS ̄PAGEanalysisshowedthattheoptimalexpressionconditionofCmWRKYproteinwas0.2mmol/LIPTGinducedat30ħfor10hꎬandthemolecularweightoftheproteinwasabout56kuꎬmainlyintheformofsolubleprotein.TheresultslaidthefoundationforfurtherstudyingthebiologicalfunctionandapplicationofCmWRKYgene.Keywords:CastaneamollissimaBLꎻCmWRKYꎻGenecloningꎻSequenceanalysisꎻProkaryoticexpression38㊀华㊀北㊀农㊀学㊀报34卷㊀㊀植物已进化出各种防御机制以对抗病原微生物ꎬ在被病原体感染后ꎬ植物调节大量防御相关基因的转录表达[1]ꎮ其中ꎬ一些编码具有抗微生物特性的病原体相关蛋白ꎬ例如葡聚糖酶和几丁质酶ꎬ或参与抗微生物化合物(例如植物抗毒素)的生物合成的酶ꎬ从而有助于整体防御反应ꎮ其他基因编码在引发植物防御反应的信号转导途径中起作用的蛋白质ꎮ在植物中ꎬ对防御相关基因的及时转录调控对于击败病原体至关重要ꎮWRKY家族蛋白是参与植物防御反应途径调节的转录因子[2]ꎮWRKY转录因子构成信号网络的组成部分ꎬ调节许多植物过程ꎬ如叶子衰老[3]㊁种子发育[4]和植物对各种胁迫的反应ꎬ如生物胁迫和非生物胁迫[5-6]ꎮWRKY转录因子含有1个或2个保守的DNA结合区域ꎬ称为WRKY结构域[7]ꎮWRKY结构域长约60个氨基酸残基ꎬ其N ̄末端含有高度保守的氨基酸基序WRKYGQKꎬC ̄末端含有非典型的锌指结构基序[8]ꎮ锌指结构是C ̄X4-5C ̄X22-23 ̄H ̄X ̄H或C ̄X7 ̄C ̄X23 ̄H ̄X ̄C[9]ꎮ重要的是这2个基序对于WRKY蛋白特异性结合称为W ̄box的DNA序列基序(C/T)TGAC(C/T)至关重要[10]ꎬ其发生在WRKY蛋白质控制下的基因启动子中ꎮ许多与防御有关的基因ꎬ包括PR基因ꎬ在其启动子区域含有W ̄box[9]ꎮ病原体调节和/或水杨酸(SA)调节的拟南芥WRKY基因的启动子基本上富含W ̄box[11]ꎬ表明WRKY基因的防御调节表达涉及转录激活和通过自我调节机制介导的抑制ꎮ使用遗传学和分子生物学方法逐渐阐明了各种WRKY转录因子的功能ꎮ越来越多的证据表明它们参与调节植物防御反应[12]ꎮ例如ꎬ病原体感染或用激素处理迅速诱导几种植物物种中的WRKY基因表达ꎮ在黄瓜中ꎬ有4个WRKY基因的表达在植株遭受镰刀菌酸(FA)处理后受到差异调节[13]ꎮ在马铃薯中ꎬ过表达StWRKY1的品系显示出对致病疫霉的抗性增强[14]ꎮ过量表达西兰花BoWRKY6的突变体表现出对霜霉病(Hyaloperonosporaparasiti ̄ca)的高度抗性[15]ꎮ香蕉MaWRKY18基因可能在香蕉与病原菌(Fusariumoxysporum)互作过程中介导抗病性[16]ꎮ除了防御反应ꎬWRKY转录因子也参与调节某些非生物应激反应ꎮ例如ꎬ在寒冷胁迫下水稻OsWRKY71过表达株系中2种冷应答基因Os ̄TGFR和WSI76的表达升高ꎬ表明OsWRKY71是耐寒性的正调节因子[17]ꎮWRKY基因的功能在各种植物中广泛研究ꎮ板栗(CastaneamollissimaBL)属壳斗科(Fa ̄gaceae)栗属(Castanea)植物ꎬ世界重要的干果之一ꎬ具有较高的营养价值ꎮ然而ꎬ栗疫病(Cryphonectricaparasitica)的出现ꎬ严重阻碍了其发展ꎮ通过基因工程的手段能够提高板栗的抗病性ꎬ而WRKY转录因子在抗病过程中起着重要作用ꎮ目前为止ꎬ还未见到板栗WRKY基因的相关研究报道ꎮ本研究以板栗大红袍为研究对象ꎬ从中分离了WRKY转录因子ꎬ并对其进行生物信息学和原核表达分析ꎬ旨在为该基因表达蛋白的纯化㊁功能研究以及探讨该基因在板栗抗病过程中的调控作用奠定基础ꎮ1㊀材料和方法1.1㊀试验材料板栗(大红袍)幼苗来自四川农业大学林学院ꎻpMD19 ̄T载体㊁反转录试剂盒购于TaKaRa公司(大连)ꎻDNA凝胶回收纯化试剂盒购于索莱宝科技有限公司(北京)ꎻ质粒提取试剂盒购于天根生化科技有限公司(北京)ꎻ感受态细胞DH5α及BL21(DE3)购于全式金生物技术有限公司(北京)ꎻBamHⅠ㊁XhoⅠ限制性内切酶㊁T4DNA连接酶购于NEB有限公司(北京)ꎻpET ̄28a载体由四川农业大学林木病理实验室提供ꎮ1.2㊀板栗总RNA提取及cDNA合成取100mg健康板栗幼叶ꎬ经液氮充分研磨后ꎬ使用多糖多酚植物总RNA提取试剂盒提取总RNAꎬ提取的RNA通过紫外分光光度法测定其浓度和纯度ꎻ板栗cDNA的合成参照TaKaRa公司反转录试剂盒说明书ꎮ1.3㊀CmWRKY基因的克隆参照板栗转录组数据库(http://www.fagaceae.org/)和NCBI中其他树种WRKY基因保守序列设计特异性引物CmWRKY ̄F1:5ᶄ ̄ATGGATACCAAAGAAGCAGAGAG ̄3ᶄꎬCmWRKY ̄R1:5ᶄ ̄TCATCGTCGCTTGTCTTTACTT ̄3ᶄꎮ扩增反应程序为:94ħ预变性5minꎻ94ħ变性30sꎬ55ħ退火30sꎬ72ħ延伸2minꎬ40个循环ꎮ使用DNA胶回收试剂盒纯化回收目的片段ꎬ回收片段与pMD19 ̄T载体16ħ过夜连接ꎬ连接产物转化DH5α感受态细胞ꎬ于Amp/X ̄gal/LB平板上进行蓝白斑筛选ꎬ随机挑取经PCR鉴定后的阳性克隆菌液ꎬ送上海美吉生物医药科技有限公司测序ꎮ1.4㊀CmWRKY基因的序列生物信息学分析通过Blast进行基因序列同源性比对分析ꎻ分别运用ProtParam和ProtScale分析其编码蛋白的理化性质和疏水性ꎻ利用ScanProsite分析编码蛋白的功4期刘裕峰等:板栗CmWRKY基因的克隆㊁序列分析与原核表达39㊀能位点及功能域ꎻ通过SPOMA和SWISS ̄MODEL对蛋白的二级结构和三级结构进行预测ꎻ分别使用TMHMMServerv.2.0和SignalP4.1Server预测编码蛋白的跨膜区和信号肽ꎻ利用MEGA6.05绘制系统进化树ꎮ1.5㊀原核表达载体的构建及鉴定根据板栗CmWRKY基因序列设计1对引物CmWRKY ̄F2:5ᶄ ̄CGGGATCCATGGCTTTCCGGCCTCTAT ̄3ᶄ(下划线为BamHⅠ酶切位点)ꎬCmWRKY ̄R2:5ᶄ ̄CCGCTCGAGTCAAGGGCATTCTTTCTCA ̄3ᶄ(下划线为XhoⅠ酶切位点)ꎮ以pMD19T ̄CmWRKY质粒为模板ꎬ进行PCR扩增ꎬ反应程序同1.3ꎮPCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后ꎬ纯化回收目的片段ꎮ使用BamHⅠ和XhoⅠ内切酶分别酶切目的片段与pET ̄28a载体ꎬ酶切产物回收后16ħ连接12hꎮ重组质粒pET28a ̄CmWRKY转化BL21(DE3)感受态细胞ꎬ经卡那抗性筛选后ꎬ挑取单菌落于LB液体培养基扩增培养后进行PCR鉴定ꎬ提取阳性菌液质粒ꎬ经BamHⅠ和XhoⅠ双酶切鉴定后ꎬ送上海美吉生物医药科技有限公司测序ꎮ1.6㊀CmWRKY蛋白的诱导表达将pET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)单菌落接种于LB液体培养基(含Kanꎬ100μg/mL)中ꎬ于37ħ㊁180r/min振荡培养12hꎮ菌液扩增培养(V/Vꎬ1ʒ100)ꎬ当菌液OD600值约为0.6~0.8时ꎬ进行蛋白的诱导表达ꎮ以终浓度为0.2ꎬ0.4ꎬ0.6ꎬ0.8ꎬ1.0mmol/LIPTG诱导6hꎬ收集1mL菌液进行SDS ̄PAGE电泳检测ꎬ筛选最优IPTG诱导浓度ꎻ以上述最优IPTG浓度分别进行2ꎬ4ꎬ6ꎬ8ꎬ10h不同时间长度的诱导ꎬ筛选最优诱导时间长度ꎻ最后ꎬ分别以25ꎬ30ꎬ37ħ进行诱导表达ꎬ筛选最优诱导温度ꎮ以上述最优条件诱导表达CmWRKY蛋白ꎬ吸取1mL菌液ꎬ12000r/min室温离心10min收集菌体ꎬ加入60μLPBSBuffer(pH值7.4)重悬后ꎬ再次加入适量溶菌酶ꎬ利用液氮反复冻融6~8次ꎬ12000r/min4ħ离心20minꎮ分别收集上清和沉淀(用8mol/L尿素4ħ螯合30min)ꎮ加入20μL4ˑProteinsds ̄pageloadingBuffer混匀ꎬ煮沸10minꎬ冷却后12000r/min4ħ离心10minꎬ取10μL上清进行蛋白电泳检测ꎮ2㊀结果与分析2.1㊀板栗CmWRKY基因克隆以板栗幼苗叶片cDNA为模板进行PCR扩增ꎬ核酸电泳检测显示ꎬ在约1500bp位置处可见1条清晰的条带(图1)ꎮ该条带纯化回收后ꎬ与pMD19 ̄T载体连接ꎬ转化产物经过菌落PCR筛选阳性克隆ꎬ将鉴定的阳性克隆进行测序ꎮ测序结果通过生物信息学验证ꎬ发现获得1437bp的CmWRKY基因片段ꎮM.DL2000ꎻ1.以cDNA为模板的PCR产物ꎮM.DL2000ꎻ1.PCRproductofcDNA.图1㊀CmWRKY基因PCR扩增产物Fig.1㊀ThePCRamplificationproductofCmWRKYgene2.2㊀板栗CmWRKY基因的核苷酸序列分析DNAMAN序列分析表明ꎬ该基因的开放阅读框(ORF)为1437bpꎬ编码479个氨基酸(图2)ꎬ将其核苷酸序列提交GenBankꎬ基因登录号:KY312850.1ꎮBlastN比对结果显示ꎬ该序列与巴旦木(Prunusper ̄sica)等植物的WRKY基因一致性均在80%以上ꎬ其中与西班牙栓皮栎(Quercussuber)WRKY基因一致性最高ꎬ达到97%ꎬ表明CmWRKY基因属于板栗WRKY基因家族成员ꎮ2.3㊀板栗CmWRKY蛋白的氨基酸序列分析使用在线工具ExPASyProtParam对CmWRKY蛋白质序列进行相关信息分析ꎬ结果表明:CmWRKY蛋白分子式为C2242H3589N675O734S12ꎬ分子质量为52.12896kuꎻ理论等电点为9.15ꎻ在组成CmWRKY蛋白的所有氨基酸中ꎬ丙氨酸(Ala)比例最高ꎬ占总氨基酸量的7.1%ꎬ蛋氨酸(Met)和色氨酸(Trp)比例最低ꎬ均为总氨基酸量的0.6%ꎻ其含有53个负电性氨基酸残基(Asp+Glu)ꎬ66个正电性氨基酸残基(Arg+Lys)ꎻ脂肪族氨基酸指数60 17ꎬ总平均疏水指数-0.872ꎬ属于亲水性蛋白ꎮ在线工具Motif发现ꎬCmWRKY蛋白序列含有2个WRKY保守结构域ꎬ2个C2H2锌指结构域(C ̄X4 ̄C ̄X22-23 ̄H ̄X ̄H)ꎬ属于WRKY家族的第Ⅰ组(图2)ꎬBlastP分析进一步表明其属于WRKY家族(图3)ꎮ利用ClustalX1.81和ESPript3.0软件对Cm ̄WRKY及与其具有较高一致性的同源基因进行氨基酸序列上的比对分析ꎬ结果如图4所示ꎬCm ̄40㊀华㊀北㊀农㊀学㊀报34卷WRKY与西班牙栓皮栎(Quercussuber)㊁核桃(Jug ̄lansregia)㊁哥伦比亚锦葵(Herraniaumbratica)及可可树(Theobromacacao)WRKY功能区域的氨基酸序列高度保守ꎬC2H2锌指结构域也较为保守ꎬ推测CmWRKY与其高度同源的基因在调控特定的基因中发挥着相似的功能ꎮ灰色区域.WRKY转录因子的特征序列WRKYGQKꎻ下划线.锌指结构域C2H2ꎬ其中C和H残基用方框标出ꎻ∗.终止密码子ꎮThegreyregion.CharacteristicsequenceWRKYGQKoftheWRKYtranscriptionfactorꎻTheunderlinedportionzincfingerdomainC2H2ꎬwhereintheCandHresiduesareindicatedbyboxesꎻ∗.Thestopcodon.图2㊀CmWRKY基因核苷酸序列及其所推导的氨基酸序列Fig.2㊀NucleotidesequenceanditsdeducedaminoacidsequenceofCmWRKYgene图3㊀CmWRKY蛋白保守功能域Fig.3㊀TheconserveddomainsofWRKYprotein4期刘裕峰等:板栗CmWRKY基因的克隆㊁序列分析与原核表达41㊀图4㊀CmWRKY与其他植物WRKY蛋白质序列多重对比Fig.4㊀MultiplealignmentofthededucedproteinofCmWRKYwithotherplantWRKYproteins2.4㊀板栗CmWRKY蛋白的结构预测在线软件SignalP4.1Server对CmWRKY蛋白的氨基酸序列进行分析ꎬ发现CmWRKY蛋白不含信号肽ꎬ不属于分泌型蛋白ꎮ通过TMHMMServerv.2.0预测CmWRKY蛋白跨膜区域ꎬ结果表明ꎬ该蛋白不含跨膜区域ꎮ利用SOPMA软件分析ꎬ发现CmWRKY蛋白二级结构中ꎬ不规则卷曲结构(Ran ̄domcoil)所占比例最大ꎬ为73.01%ꎻα ̄螺旋(Alphahelix)次之ꎬ为12.55%ꎻ延伸链结构(Extendedstrand)比例为11.09%ꎻβ ̄转角(Betaturn)最少ꎬ仅为3.35%(图5)ꎮCmWRKY蛋白的三级结构分析表明ꎬ该转录因子的WRKY结够域与AtWRKY1非常相似[18](图6)ꎬ推测CmWRKY蛋白可能具有与AtWRKY1相类似的调控功能ꎮ同时ꎬ其结构域主要最长竖线.α ̄螺旋ꎻ第2长竖线.延伸链ꎻ第3长竖线.β ̄转角ꎻ最短竖线.无规则卷曲ꎻ横向数值.氨基酸位置ꎮThelongestverticalbars.α ̄helixꎻThesecondlongestverticalbars.ExtendedstrandꎻThethirdlongestverticalbars.BetaturnꎻTheshortestverticalbars.RandomcoilꎻThehorizontalnumbers.Thepositionofaminoacid.图5㊀CmWRKY蛋白二级结构Fig.5㊀ThesecondarystuctureoftheCmWRKYprotein42㊀华㊀北㊀农㊀学㊀报34卷由4个β ̄折叠组成ꎬ依次为β ̄折叠1:WRKYGQKꎻβ ̄折叠2:RSYYKCꎻβ ̄折叠3:KKKVERꎻβ ̄折叠4:AEIVYKꎮβ ̄折叠1.WRKYGQKꎻβ ̄折叠2.RSYYKCꎻβ ̄折叠3.KKKVERꎻβ ̄折叠4.AEIVYKꎮβ ̄strand1.WRKYGQKꎻβ ̄strand2.RSYYKCꎻβ ̄strand3.KKKVERꎻβ ̄strand4.AEIVYK.图6㊀CmWRKY蛋白三维结构Fig.6㊀Thethree ̄dimensionalstructureofCmWRKYprotein2.5㊀板栗CmWRKY蛋白的同源进化分析为了解CmWRKY蛋白和其他植物WRKY蛋白之间的进化关系ꎬ利用系统进化分析软件Mega6 05ꎬ通过邻接法(Neighbor ̄Joining)方法构建Cm ̄WRKY与NCBI数据库中29种植物WRKY的系统进化树(图7)ꎮ系统进化树分析结果显示ꎬ蔷薇目(Rosales)㊁金虎尾目(Malpighiales)㊁锦葵目(Mal ̄vales)㊁无患子目(Sapindales) ̄(芸香科ꎬRutaceae)㊁壳斗目(Fagales) ̄(壳斗科ꎬFagaceae)植物分别聚集在一起ꎻ其中ꎬ蔷薇目下的榆科(Ulmaceae)㊁蔷薇科(Rosaceae)及豆科(Fabaceae)植物又分别聚集在一起ꎬ相比豆科植物ꎬ榆科植物与蔷薇科植物亲缘关系更近ꎻ金虎尾目下的大戟科(Euphorbiaceae)植物聚集在一起ꎮ同时ꎬ葡萄(Vitisvinifera)和猕猴桃(Ac ̄tinidiachinensis)由于均为藤本植物而聚集在一个分支ꎮ这些结果都符合植物的生物进化规律ꎮ板栗与同为壳斗科的西班牙栓皮栎亲缘关系最近ꎬ其次为核桃ꎬ与芸香科植物亲缘关系也较近ꎮ这与CmWRKY和它们之间的氨基酸序列同源性较高相符合ꎮ图7㊀Neighbor ̄joining(NJ)方法构建CmWRKY蛋白与其他植物WRKY蛋白的系统进化树Fig.7㊀PhylogenetictreebetweenCmWRKYproteinandotherplantWRKYproteinbyNeighbor ̄Joining(NJ)method4期刘裕峰等:板栗CmWRKY基因的克隆㊁序列分析与原核表达43㊀2.6㊀原核表达载体的构建及鉴定带酶切位点的板栗CmWRKY基因片段和pET ̄28a载体经BamHⅠ和XhoⅠ酶切后ꎬ回收酶切产物ꎬ产物通过T4DNA连接酶构建重组表达载体ꎬ转化大肠杆菌BL21(DE3)ꎮ提取阳性菌液重组质粒ꎬ通过双酶切鉴定可见预期大小的片段(图8)ꎮ测序结果进一步表明ꎬpET28a ̄CmWRKY原核表达载体构建成功ꎮM.DL5000ꎻ1.重组质粒pET28a ̄CmWRKY双酶切产物ꎻ2.重组质粒pET28a ̄CmWRKYꎮM.DL5000ꎻ1.DoubleenzymeproductofpET28a ̄CmWRKYꎻ2.pET28a ̄CmWRKYplasmid.图8㊀重组质粒pET28a ̄CmWRKY的双酶切鉴定Fig.8㊀DoubleenzymeidentificationofpET28a ̄CmWRKY2.7㊀pET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)的诱导表达及条件优化为进一步CmWRKY蛋白的功能研究提供试验基础ꎬ对该蛋白进行原核诱导表达ꎮIPTG浓度对CmWRKY蛋白表达的影响ꎮ选择0.2ꎬ0.4ꎬ0.6ꎬ0.8ꎬ1.0mmol/L5个不同的IPTG浓度ꎬ在37ħ下诱导6hꎬ经SDS ̄PAGE电泳分析显示(图9 ̄A)ꎬ在各IPTG浓度下均能诱导表达出一条预期大小的融合蛋白ꎬ分子质量约为56ku(CmWRKY蛋白52ku+His ̄tag标签蛋白4ku)ꎬ且对照组均无目的蛋白表达ꎬ但不同IPTG浓度间表达量无明显差异ꎮ以0.2mmol/LIPTG作为最优诱导浓度ꎮ诱导时间对CmWRKY蛋白表达的影响ꎮpET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)分别诱导2ꎬ4ꎬ6ꎬ8ꎬ10hꎮ结果显示ꎬ不同诱导时间长度对该蛋白的表达量影响较为明显ꎬ随时间的增加ꎬCmWRKY蛋白的表达量逐渐增加ꎬ在10h蛋白的表达量达到最大(图9 ̄B)ꎮ因此ꎬ选择诱导10h作为最优诱导时间ꎮ诱导温度对CmWRKY蛋白表达的影响ꎮpET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)加入0.2mmol/LIPTG分别在25ꎬ30ꎬ37ħ下诱导10hꎮ结果显示(图9 ̄C)ꎬ25ħ诱导条件下几乎无目的蛋白产生ꎻ30ħ诱导条件下有目的蛋白产生且主要以可溶性蛋白的形式存在ꎻ37ħ条件下诱导的目的蛋白可溶性量较少ꎬ主要以包涵体的形式存在ꎮ因此ꎬ选择30ħ作为pET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)最优诱导温度ꎮM.蛋白质分子量标准ꎻA.IPTG诱导浓度的优化:1.pET28a ̄BL21(DE3)未诱导ꎻ2.pET28a ̄BL21(DE3)诱导(0.6mmol/LIPTG)6hꎻ3-8.终浓度为0ꎬ0.2ꎬ0.4ꎬ0.6ꎬ0.8ꎬ1.0mmol/LIPTGꎻB.诱导时间的优化:1.pET28a ̄BL21(DE3)未诱导ꎻ2.pET28a ̄BL21(DE3)诱导(0.2mmol/LIPTG)6hꎻ3-8.诱导0ꎬ2ꎬ4ꎬ6ꎬ8ꎬ10hꎻC.诱导温度的优化:1.pET28a ̄BL21(DE3)未诱导ꎻ2.pET28a ̄BL21(DE3)诱导(0.2mmol/LIPTG)10hꎻ3.未诱导ꎻ4.25ħ诱导上清ꎻ5.25ħ诱导沉淀ꎻ6.30ħ诱导上清ꎻ7.30ħ诱导沉淀ꎻ8.37ħ诱导上清ꎻ9.37ħ诱导沉淀ꎮM.ProteinMarkerꎻA.OptimizationofIPTGinducedconcentration:1.pET28a ̄BL21(DE3)withoutIPTGinductionꎻ2.pET28a ̄BL21(DE3)wasin ̄ducedfor6h(0.6mmol/LIPTG)ꎻ3-8.pET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)wasinducedby0ꎬ0.2ꎬ0.4ꎬ0.6ꎬ0.8ꎬ1.0mmol/LIPTGꎻB.Optimizationofinductiontime:1.pET28a ̄BL21(DE3)withoutIPTGinductionꎻ2.pET28a ̄BL21(DE3)wasinducedfor6h(0.2mmol/LIPTG)ꎻ3-8.pET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)wasinducedfor0ꎬ2ꎬ4ꎬ6ꎬ8ꎬ10hꎻC.Optimizationofinductiontemperature:1.pET28a ̄BL21(DE3)withoutIPTGinductionꎻ2.pET28a ̄BL21(DE3)wasinducedfor10h(0.2mmol/LIPTG)ꎻ3.pET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)withoutIPTGinductionꎻ4.SupernatantofpET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)wasinducedat25ħꎻ5.PrecipitateofpET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)wasinducedat25ħꎻ6.SupernatantofpET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)wasinducedat30ħꎻ7.PrecipitateofpET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)wasinducedat30ħꎻ8.SupernatantofpET28a ̄Cm ̄WRKY ̄BL21(DE3)wasinducedat37ħꎻ9.PrecipitateofpET28a ̄CmWRKY ̄BL21(DE3)wasinducedat37ħ.图9㊀重组表达质粒pET28a ̄CmWRKY诱导条件的优化Fig.9㊀OptimizationofinductionconditionofpET28a ̄CmWRKYplasmid44㊀华㊀北㊀农㊀学㊀报34卷3㊀结论与讨论植物中WRKY蛋白基于存在的WRKY结构域的数量和锌指的类型ꎬWRKY蛋白质已被分类为Ⅰ㊁Ⅱ和Ⅲ组ꎬ具有2个WRKY结构域的WRKY蛋白质属于第Ⅰ组ꎬ具有一个WRKY结构域的蛋白质基于锌指基序的特征属于第Ⅱ组或第Ⅲ组[19]ꎮ通过氨基酸序列分析ꎬ本研究所克隆的CmWRKY蛋白具有2个WRKY结构域和2个锌指结构ꎬ属于第Ⅰ组ꎮCmWRKY三级结构以AtWRKY1蛋白为模板同源建模获得ꎬDuan等[18]发现在AtWRKY1中ꎬ转录因子AtWRKY1与DNA的结合能力是由β2与β3之间的β折叠区域决定的ꎬ推测其与拟南芥At ̄WRKY1蛋白具有相似的功能ꎮAgarwal等[20]研究发现ꎬWRKY结构域由4条β ̄折叠组成ꎬ锌配位Cys/His残基形成锌结合口袋ꎬ而本研究获得的Cm ̄WRKY三级结构ꎬ也由4条β ̄折叠组成ꎬ与其研究结果一致ꎮ系统进化分析表明ꎬCmWRKY蛋白与其他物种间的WRKY蛋白同源性较高ꎬ与同为壳斗科的西班牙栓皮栎亲缘关系最近ꎬ其次为核桃ꎬ聚集为一个分支ꎮ西班牙栓皮栎QcWRKY蛋白功能未见相关报道ꎬ核桃JrWRKY4参与低温胁迫反应[21]ꎬ推测CmWRKY可能也参与低温胁迫的生理过程ꎮ为进一步研究板栗CmWRKY蛋白的生物学功能ꎬ利用基因工程技术构建了pET28a ̄CmWRKY原核表达载体ꎬ转入BL21(DE3)后进行原核表达ꎬ获得了分子质量约为56ku的目的蛋白ꎬ比预测分子质量略大ꎬ主要是由于His ̄tag标签序列造成的[22]ꎮ大肠杆菌作为常用的原核表达系统ꎬ除了选择合适的载体和表达菌株之外ꎬIPTG浓度㊁诱导时间及诱导温度等培养条件对其蛋白表达也具有较大的影响[10]ꎮ本研究也从这3个方面对CmWRKY蛋白的诱导表达进行优化ꎬ以期获得最大量的目的蛋白ꎮSDS ̄PAGE分析显示ꎬ不同IPTG浓度下均能诱导表达出预期大小的融合蛋白ꎬ且不同诱导浓度间表达量并无差异ꎬ而低浓度IPTG诱导有助于可获得较多的可溶性蛋白[10]ꎬ因此ꎬ选择低浓度IPTG(0.2mmol/L)诱导ꎮ随着诱导时间的增加ꎬCm ̄WRKY蛋白表达量逐渐增加ꎬ在10h时表达量达到最大ꎮ本研究发现ꎬCmWRKY蛋白在较高温度(37ħ)诱导下ꎬ主要以包涵体的形式存在ꎮ研究表明ꎬ高温条件下ꎬ蛋白表达过快ꎬ不能正常折叠ꎬ容易形成包涵体[23]ꎮ但在较低温度(25ħ)诱导下ꎬ几乎无目的蛋白产生ꎬ可能是温度过低的原因ꎮ而在30ħ诱导温度下ꎬCmWRKY蛋白主要以可溶性蛋白的形式存在ꎮ因此ꎬ利用大肠杆菌表达系统ꎬ在30ħꎬ0.2mmol/LIPTG诱导表达菌株10h能获得最大量的可溶性CmWRKY蛋白ꎮ本研究成功从板栗中克隆了一个CmWRKY基因ꎬ其氨基酸序列中含有2个WRKY保守结构域和2个C2H2锌指结构域ꎬ属于WRKY家族的第Ⅰ组ꎮ利用多种生物信息学软件分析了CmWRKY基因的同源性㊁蛋白质结构㊁系统进化等相关信息ꎮ初步探索了CmWRKY基因的原核表达情况ꎬ为其蛋白功能研究奠定了基础ꎬ也为揭示该基因在板栗抗病过程的分子调控打下基础ꎮ参考文献:[1]㊀TaoYꎬXieZYꎬChenWQꎬGlazebrookJꎬChangHSꎬHanBꎬZhuTꎬZouGZꎬKatagiriF.QuantitativenatureofArabidopsisresponsesduringcompatibleandincompati ̄bleinteractionswiththebacterialpathogenPseudomonassyringae[J].PlantCellꎬ2003ꎬ15(2):317-330.doi:10.1105/tpc.007591.[2]㊀赵曾强ꎬ韩泽刚ꎬ李会会ꎬ李潇玲ꎬ张析ꎬ张薇.棉花GhWRKY44基因的克隆与表达分析[J].西北植物学报ꎬ2015ꎬ35(1):10-15.doi:10.7606/j.issn.1000 ̄4025.2015.01.0010.ZhaoZQꎬHanZGꎬLiHHꎬLiXLꎬZhangXꎬZhangW.CloningandexpressionanalysisofGhWRKY44inCot ̄ton[J].ActaBotanicaBoreali ̄OccidentaliaSinicaꎬ2015ꎬ35(1):10-15.[3]㊀TanXLꎬFanZQꎬLiLLꎬWuYꎬKuangJFꎬLuWJꎬChenJY.Molecularcharacterizationofaleafsenes ̄cence ̄relatedtranscriptionfactorBrWRKY75ofChinesefloweringcabbage[J].HorticulturalPlantJournalꎬ2017ꎬ2(5):272-278.doi:10.1016/j.hpj.2017.01.003.[4]㊀ChenLGꎬSongYJꎬLiSꎬZhangLPꎬZouCSꎬYuDQ.TheroleofWRKYtranscriptionfactorsinplantabiot ̄icstresses[J].BiochimicaetBiophysicaactaꎬ2012ꎬ1819(2):120-128.doi:10.1016/j.bbagrm.2011.09.002.[5]㊀DangFFꎬWangYNꎬSheJJꎬLeiYFꎬLiuZQꎬEul ̄gemTꎬLaiYꎬLinJꎬYuLꎬLeiDꎬGuanDYꎬLiXꎬYuanQꎬHeSL.OverexpressionofCaWRKY27ꎬasub ̄groupIIeWRKYtranscriptionfactorofCapsicumannu ̄umꎬpositivelyregulatestobaccoresistancetoRalstoniasolanacearuminfection[J].PhysiologiaPlantarumꎬ2014ꎬ150(3):397-411.doi:10.1111/ppl.12093.[6]㊀LiuQLꎬXuKDꎬPanYZꎬJiangBBꎬLiuGLꎬJiaYꎬZhangHQ.Functionalanalysisofanovelchrysanthe ̄mumWRKYtranscriptionfactorgeneinvolvedinsalttol ̄erance[J].PlantMolecularBiologyReporterꎬ2014ꎬ32(1):282-289.doi:10.1007/s11105 ̄013 ̄0639 ̄3.[7]㊀LiuJJꎬEkramoddoullahAKM.Identificationandchar ̄acterizationoftheWRKYtranscriptionfactorfamilyinPi ̄nusmonticola[J].Genomeꎬ2009ꎬ52(1):77-88.doi:10.1139/G08 ̄106.[8]㊀冯光燕ꎬ王学敏ꎬ付媛媛ꎬ方志红ꎬ高洪文ꎬ张新全.紫花苜蓿MsWRKY33转录因子的分离及遗传转化研究[J].草业学报ꎬ2015ꎬ24(11):48-57.doi:10.11686/cyxb2015131.4期刘裕峰等:板栗CmWRKY基因的克隆㊁序列分析与原核表达45㊀FengGYꎬWangXMꎬFuYYꎬFangZHꎬGaoHWꎬZhangXQ.IsolationofMsWRKY33transcriptionfactoranditsgenetictransformationinMedicagosativa[J].Ac ̄taPrataculturaeSinicaꎬ2015ꎬ24(11):48-57.[9]㊀RushtonPJꎬSomssichIEꎬRinglerPꎬShenQJ.WRKYtranscriptionfactors[J].TrendsinPlantScienceꎬ2010ꎬ15(5):247-258.doi:10.1016/j.tplants.2010.02.006.[10]㊀刘玉忠ꎬ申业ꎬ荣齐仙ꎬ吴文燕ꎬ李瑞博ꎬ吴志刚ꎬ陈敏.丹参转录因子SmWRKY1蛋白的表达和纯化条件优化研究[J].中国中药杂志ꎬ2014ꎬ39(7):1214-1219.doi:10.4268/cjcmm20140713.LiuYZꎬShenYꎬRongQXꎬWuWYꎬLiRBꎬWuZGꎬChenM.OptimizationofexpressionandpurificationofrecombinantSalviamiltiorrhizaWRKY1proteininEscherichiacoli[J].ChinaJournalofChineseMateriaMedicaꎬ2014ꎬ39(7):1214-1219.[11]㊀DongJXꎬChenCHꎬChenZX.ExpressionprofilesoftheArabidopsisWRKYgenesuperfamilyduringplantde ̄fenseresponse[J].PlantMolecularBiologyꎬ2003ꎬ51(1):21-37.doi:10.1023/A:1020780022549.[12]㊀LimJHꎬParkCJꎬHuhSUꎬChoiLMꎬLeeGJꎬKimYJꎬPaekKH.CapsicumannuumWRKYbtranscrip ̄tionfactorthatbindstotheCaPR ̄10promoterfunctionsasapositiveregulatorininnateimmunityuponTMVin ̄fection[J].BiochemBiophysResCommunꎬ2011ꎬ411(3):613-619.doi:10.1016/j.bbrc.2011.07.002.[13]㊀MaoYZꎬJiangBꎬPengQWꎬLiuWRꎬLinYꎬXieDSꎬHeXMꎬLiSS.CloningandcharacterizationofWRKYgenehomologsinChieh ̄qua(BenincasahispidaCogn.var.Chieh ̄quaHow)andtheirexpressioninre ̄sponsetofusaricacidtreatment[J].Biotechꎬ2017ꎬ7(1):86.doi:10.1007/s13205 ̄017 ̄0711 ̄z.[14]㊀ShahzadRꎬHarlinaPWꎬXieCHꎬEwasMꎬNishawyEꎬPanZYꎬFolyMM.Overexpressionofpotatotran ̄scriptionfactor(StWRKY1)conferredresistancetoPhy ̄tophthorainfestansandimprovedtolerancetowaterstress[J].PlantOmicsJournalꎬ2016ꎬ9(2):149-158.doi:10.21475/poj.160902.p7649x.[15]㊀JiangMꎬLiuQEꎬLiuZNꎬLiJZꎬHeCM.Overex ̄pressionofaWRKYtranscriptionfactorgeneBoWRKY6enhancesresistancetodownymildewintransgenicbroc ̄coliplants[J].AustralasianPlantPathologyꎬ2016ꎬ45(3):327-334.doi:10.1007/s13313 ̄016 ̄0416 ̄5.[16]㊀贾彩红ꎬ王卓ꎬ金志强ꎬ李健平ꎬ徐碧玉.香蕉MaWRKY18的克隆及表达特征分析[J].植物病理学报ꎬ2016ꎬ46(5):653-661.doi:10.13926/j.cnki.apps.2016.05.010.JiaCHꎬWangZꎬJinZQꎬLiJPꎬXuBY.CloningandexpressionanalysisofMaWRKY18frombanana[J].ActaPhytopathologicaSinicaꎬ2016ꎬ46(5):653-661.[17]㊀KimCYꎬVoKTXꎬNguyenCDꎬJeongDHꎬLeeSKꎬKumarMꎬKimSRꎬParkSHꎬKimJKꎬJeonJS.Functionalanalysisofacold ̄responsivericeWRKYgeneꎬOsWRKY71[J].PlantBiotechnologyReportsꎬ2016ꎬ10(1):13-23.doi:10.1007/s11816 ̄015 ̄0383 ̄2.[18]㊀DuanMRꎬNanJꎬLiangYHꎬMaoPꎬLuLꎬLiLFꎬWeiCHꎬLaiLHꎬLiYꎬSuXD.DNAbindingmecha ̄nismrevealedbyhighresolutioncrystalstructureofAra ̄bidopsisthalianaWRKY1protein[J].NucleicAcidsRe ̄searchꎬ2007ꎬ35(4):1145-1154.doi:10.1093/nar/gkm001.[19]㊀LiJBꎬLuanYS.Molecularcloningandcharacteriza ̄tionofapathogen ̄inducedWRKYtranscriptionfactorgenefromlateblightresistanttomatovarietiesSolanumpimpinellifoliumL3708[J].PhysiologicalandMolecularPlantPathologyꎬ2014ꎬ87:25-31.doi:10.1016/j.pmpp.2014.05.004.[20]㊀AgarwalPꎬReddyMPꎬChikaraJ.WRKY:itsstruc ̄tureꎬevolutionaryrelationshipꎬDNA ̄bindingselectivi ̄tyꎬroleinstresstoleranceanddevelopmentofplants[J].MolecularBiologyReportsꎬ2011ꎬ38(6):3883-3896.doi:10.1007/s11033 ̄010 ̄0504 ̄5.[21]㊀徐丽ꎬ陈新ꎬ魏海蓉ꎬ张力思ꎬ王甲威ꎬ宗晓娟ꎬ刘庆忠.核桃WRKY4基因的克隆与表达分析[J].核农学报ꎬ2014ꎬ28(7):1188-1196.doi:10.11869/j.issn.100 ̄8551.2014.07.1188.XuLꎬChenXꎬWeiHRꎬZhangLSꎬWangJWꎬZongXJꎬLiuQZ.CloningandexpressionanalysisofWRKY4genefromJuglansregiaL.[J].JournalofNu ̄clearAgriculturalSciencesꎬ2014ꎬ28(7):1188-1196.[22]㊀唐威华ꎬ张景六ꎬ王宗阳ꎬ洪孟民.SDS ̄PAGE法测定His ̄tag融合蛋白分子量产生偏差的原因[J].植物生理学报ꎬ2000ꎬ26(1):64-68.doi:10.3321/j.issn:1671 ̄3877.2000.01.012.TangWHꎬZhangJLꎬWangZYꎬHongMM.Thecauseofdeviationmadeindeterminingthemolecularweightofhis ̄tagfusionproteinsbySDS ̄PAGE[J].Ac ̄taPhytophysiologicaSinicaꎬ2000ꎬ26(1):64-68.[23]㊀BaneyxF.RecombinantproteinexpressioninEscherich ̄iacoli[J].CurrentOpinioninBiotechnologyꎬ1999ꎬ10(5):411-421.doi:10.1016/S0958 ̄1669(99)00003 ̄8.。

抗真菌肽Drosomycin在原核生物表达系统中的可溶性表达

抗真菌肽Drosomycin在原核生物表达系统中的可溶性表达

抗真菌肽Drosomycin在原核生物表达系统中的可溶性表达作者:吴文梅等来源:《广东蚕业》 2016年第3期吴文梅李彩婷杨婉莹*(华南农业大学动物科学学院,广州510642)摘要广谱性抗真菌肽Drosomycin的成熟肽由44个氨基酸组成,其中8个半胱氨酸形成4对二硫键,结构复杂。

在原核表达该蛋白时容易形成包涵体,不利于实际利用。

本研究希望通过与转铁蛋白TF融合表达的方式提高其可溶性表达。

首先以果蝇DNA为模板扩增目的基因Drs,克隆至pColdTF载体,转化进大肠杆菌BL21(DE3),通过IPTG诱导进行表达,利用SDS-PAGE及Westernblot鉴定表达产物。

结果表明重组表达质粒pColdTF-Drs构建成功,转化大肠杆菌后能正常表达,且目的产物为可溶性表达。

这一结果为抗真菌肽Drosomycin实现生产上的利用奠定基础。

关键词Drosomycin;pColdTF;基因重组;原核表达中图分类号:Q966文献标识码:A文章编号:2095-1205(2016)03-15-06真菌是生物界中很大的一个类群,现已发现对人类有致病性的真菌约有300多个种类[1]。

市面上所用抗真菌类药物,副作用大,易产生抗药性[2]。

而抗真菌肽却有望解决这些弊端。

抗真菌肽Drosomycin来自于果蝇,属于天然蛋白质,相对分子质量小,热稳定性好,遇水易溶解,可作为抗生素的替代品,为我们解决抗生素耐药性提供新材料[3][4]。

杨婉莹等从2002年开始对抗真菌肽及其家族蛋白的研究,结果表明Drosomycin对丝状病原真菌具有广谱的抑制活性,可以作为新的抗真菌药物的靶标[5][6][7]。

但Drosomycin在果蝇体内含量极微,天然资源有限,提取步骤烦琐、成本高,得率低,不利于工业生产[8]。

因此利用分子生物学技术进行体外表达成为研究热点。

Drosomycin成熟肽包括44个氨基酸,其中8个半胱氨酸形成4对二硫键,由于结构的复杂性,在利用原核系统表达该蛋白时往往形成包涵体,后续纯化复性步骤复杂,不利于实际利用。

坛紫菜过氧化氢酶基因的克隆及表达特征

坛紫菜过氧化氢酶基因的克隆及表达特征

坛紫菜过氧化氢酶基因的克隆及表达特征仵燕青;肖海东;许凯;徐燕;纪德华;陈昌生;谢潮添【摘要】过氧化氢酶(CAT)是植物细胞抗氧化酶的主要成员,在逆境胁迫下的活性氧(ROS)清除中发挥着重要的作用.本研究采用RACE扩增技术克隆获得了坛紫菜CAT基因的全长,被命名为PhCA及Genbank收录号:KM655303).该基因全长1983 bp,可编码包含542个氨基酸的多肽,与条斑紫菜CAT基因的序列相似性为83.08%.多序列比对和系统进化树分析结果确认PhCAT属于CAT基因家族.PhCAT基因定量分析结果显示,失水胁迫条件下,PhCAT的基因表达水平只在失水率≥60%时才显著上调;不同时间水平的高温胁迫条件均可诱发PhCAT基因的上调表达.而CAT酶活测定结果却显示,各种水平的失水胁迫条件下,坛紫菜细胞内的CAT酶活水平均显著低于正常条件下的酶活水平;高温胁迫24 h时,CAT酶活水平显著增强,而其余时间点的酶活水平则显著降低.研究表明CAT酶在坛紫菜高温胁迫应答中发挥着重要作用,但在失水胁迫应答中却没有发挥明显作用.【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2016(040)010【总页数】10页(P1576-1585)【关键词】坛紫菜;过氧化氢酶;基因克隆;表达分析【作者】仵燕青;肖海东;许凯;徐燕;纪德华;陈昌生;谢潮添【作者单位】集美大学水产学院,福建厦门361021;集美大学水产学院,福建厦门361021;集美大学水产学院,福建厦门361021;集美大学水产学院,福建厦门361021;集美大学水产学院,福建厦门361021;集美大学水产学院,福建厦门361021;集美大学水产学院,福建厦门361021【正文语种】中文【中图分类】Q785;S917.4O2是生命活动过程中物质和能量循环不可缺少的物质之一,但其在参与新陈代谢的过程中易被活化成为超氧阴离子自由基(O2-·)、羟基自由基(·OH)、H2O2、脂质过氧化物和单线态氧等活性氧(ROS)物质,这些ROS物质如不能被及时清除,将会对植物的生长发育产生严重的毒害作用,如降低植物细胞膜脂流动性、破坏蛋白质功能,损伤叶绿体和线粒体结构,最终导致代谢功能不可修复的丧失和细胞的死亡[1]。

水稻细胞分裂氧化酶的原核表达

水稻细胞分裂氧化酶的原核表达

水稻细胞分裂氧化酶的原核表达吴云华;方玉姣【摘要】The total RNA from var nipponbare was extracted and the cytokinin oxidase gene( CKO)was amplified by PCR using the reverse product cDNA as template,then CKO was ligated to vector pET-28a after restriction and a recombinant plasmid pET 28a-CKO was constructed. Finally the rice cytokinin oxidase was expressed in E. coli BL21. The results showed that the recombinant plasmid pET-28a-CKO was successfully constructed and the prokaryotic expression of rice cytokinin oxidase was achieved.%从水稻日本晴幼叶中提取 RNA,以反转产物 cDNA 为模板 PCR 扩增得到了细胞分裂素氧化酶基因(CKO),酶切连接到 pET-28a载体上,构建了重组载体 pET-28a-CKO,在大肠杆菌 BL21中表达了细胞分裂素氧化酶。

【期刊名称】《中南民族大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2015(000)004【总页数】4页(P37-40)【关键词】细胞分裂素氧化酶;原核表达;载体pET-28a;日本晴【作者】吴云华;方玉姣【作者单位】中南民族大学生命科学学院,武陵山区特色资源植物种质保护和利用湖北省重点实验室,武汉430074;中南民族大学生命科学学院,武陵山区特色资源植物种质保护和利用湖北省重点实验室,武汉430074【正文语种】中文【中图分类】Q51细胞分裂素作为一种植物激素,是目前人们已经知道的5大类植物激素(即生长素、赤霉素、细胞分裂素、脱落酸和乙烯)之一,它具有腺嘌呤环结构.这类物质的共同特点是在腺嘌呤环的第六位置氨基上有特定的取代物,对细胞的分裂、芽的分化、侧芽的发育、果实的发育等起重要作用.植物中细胞分裂素(CTK)[1]的分解,很大程度上依赖于一种特殊酶的作用实现.这种酶以分子氧为氧化剂,催化CTK的N6上不饱和侧链裂解而使其彻底丧失活性,此反应不可逆,这种酶是细胞分裂素氧化酶(cytokinin oxidase,CKO),它能作用于体内CTK代谢和调节CTK与生长素之间的平衡等.玉米[2]、拟南芥[3]、石斛兰[4]、大麦[5]、小麦[6]等的细胞分裂素氧化酶基因目前已经被克隆.转基因实验表明:通过改变植物细胞分裂素氧化酶基因的表达可以调控内源激素CTK的含量,进而影响植物的发育.Ashikari M等[7]发现在水稻花序分生组织中的细胞分裂素氧化酶基因OsCKX2的表达受抑制时,会导致细胞分裂素水平增加、发育旺盛、穗粒数明显增多,从而提高水稻产量.但目前关于水稻细胞分裂素氧化酶CKO的原核表达并未见报道,本文利用pET-28a为载体,探索水稻细胞分裂素氧化酶CKO在大肠杆菌BL21中的表达,为细胞分裂素氧化酶CKO生物传感器的制备和应用研究奠定基础.1.1 材料和仪器水稻日本晴种子、载体pET-28a、大肠杆菌E.coli.DH5α和E.coli.BL21(DE3) 由中南民族大学武陵山区特色资源植物种质保护和利用湖北省重点实验室提供. Trizol Reagent(Ambion),RevertAid First Strand cDNA SynthesisKit(Thermo scientific),限制性内切酶Nde I、EcoR I、Xho I, T4 DNA连接酶、DNA Maker、蛋白Maker(TaKaRa),KOD-plus-试剂盒(TOYOBO司),DNA凝胶回收试剂盒、DNA清洁回收试剂盒(AXYGEN),卡那霉素(上海生工公司),二硫苏糖醇(DTT)和异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG, Alfa Aesar),苯甲基硫酰氟(PMSF,丁香园),引物合成和基因测序(擎科生物有限公司),其他试剂均为国药集团化学和天津市广成化学试剂有限公司等的分析级AR试剂.PBS缓冲液(pH 7.0, 1 L):0.27 g KH2PO4,1.42 g Na2HPO4,8 g NaCl,0.2 g KCl,加ddH2O至900 mL混匀,调节pH至7.0,再加ddH2O定容至1L,高压灭菌.Buffer A(1 L):171.1 g蔗糖,0.186 g EDTA·2Na,12.1 g Tris溶于900 mL ddH2O混匀,用冰乙酸调pH至7.6,再定容至1 L,过滤除菌,存于4℃备用. Buffer B(1 L):加少量ddH2O溶解1.286 g四水乙酸镁,加入200 mL甘油,13.4 mL 1mol/L KH2PO4, 86.8 mL 1mol/L K2HPO4,加ddH2O至900 mL混匀,调节pH至7.6,再加ddH2O定容至1L,存于4℃备用[8].精密电子天平(ME204E /02, 上海梅特勒-托利多仪器有限公司),PCR仪(PTC-200, 美国Bio-Rad公司),琼脂糖胶电泳仪(DYY-5, 北京六一仪器厂),恒温摇床(HQ45Z, 武汉中科仪技术有限公司),凝胶成像系统(TEL-40Gelvue UV Transilluminator, 英国),核酸蛋白测定仪(HD-4, 上海泸西分析仪器厂有限公司),PH计(pHS-3C, 上海仪电科学仪器股份有限公司).1.2 原核表达载体pET-28a-CKO的构建用水泡适量日本晴种子,待其发芽后移栽到土中生长,待长出5~6片幼叶后,取日本晴新鲜幼叶,用Trizol法提取叶片的RNA,用反转试剂盒将RNA反转,用水稻Actin引物对cDNA进行检测,以该cDNA为模板,用设计的特异性引物F(5′-ATCCAT ATGGAGGTTGCCATGGTCTGC-3′)和R(5′-CCGCTCGAGGCTATAGCTTGCAAATGCGCC-3′),设计的酶切位点是Xho I和Nde I,用KOD-plus-试剂盒进行PCR扩增,将扩增所得产物与质粒pET-28a一起先用Nde I在37 ℃酶切过夜,酶切后片段用清洁回收.再分别用Xho I进行37 ℃酶切6 h,酶切的目的片段用清洁回收,质粒pET-28a酶切产物切胶回收后,用T4连接酶将载体和目的片段于16 ℃连接12 h,构建出重组体pET-28a-CKO[9]. 将重组体pET-28a-CKO和空载pET-28a分别通过热激转化法转化到相应的感受态细胞E.coli.BL21(DE3)中,其中空载作为对照,分别取200 mL菌液涂布到含抗性的LB平板(含50 μg/mL卡那霉素)上,37 ℃培养箱中过夜培养(12~18 h),挑取单克隆菌落进行菌落PCR检测,菌落PCR有目的带后对应的单克隆再提取质粒,进行质粒PCR和双酶切鉴定,检测正确的质粒测序.鉴定正确的重组体挑取单克隆于3 mL LB液体培养基(含50 μg/mL卡那霉素)中,在摇床中以37℃、180r/min培养过夜,将培养好的3 mL菌液接种于500 mL TB(含卡那霉素)液体培养基中,培养2~3 h检测其OD值,使其OD600达到约0.6,加入1 mol/L IPTG 使其终浓度为1 mmol/L,15℃、180 r/min诱导表达8 h.1.3 重组蛋白的提取及SDS-PAGE、Western-blot检测分析于15 ℃8 h,诱导50 mL的菌液,菌液于4℃、5000 g离心15 min,弃上清,收集菌体.冰浴放置30 min后,在4℃、5000 g离心20 min,弃上清,收集菌体,加入Buffer A重悬 (70 mg湿细胞/ mL),再加入与Buffer A等体积的无菌水,同时加入溶菌酶至其终浓度为0.1 mg/mL,用移液器吹打混匀,冰浴在摇床上轻摇80 r/min 30 min,于4℃、5000 g离心20 min后,弃上清,沉淀中加入Buffer B重悬(0.5 g湿细胞/mL),并现加DTT至终浓度为0.01 mmol/L,备用的蛋白冻存于-80 ℃.待破碎的,加PMSF至终浓度为1 mmol/L,在冰浴条件下超声破碎,功率为16 W,每次破碎4 s,间歇6 s,一共破碎处理约8 min,使其成为均一的液体.破碎产物于4℃、 14000 r/min离心10 min,吸取出上清备用,沉淀加入PBS缓冲液(pH 7.0),在冰上放置1 h,对处理好的的上清、混合、沉淀进行SDS-PAGE分析检测和Western-blot分析检测[10].2.1 目的片段CKO的扩增用Trizol法从日本晴叶片提取RNA,经反转录试剂盒反转出产物cDNA,用水稻actin引物进行检测,检测结果(见图1)正确,可作为扩增模板用于目的片段的扩增.以检测好的cDNA为模板,用KOD-plus-酶扩增CKO片段,由于第1次扩增的片段很弱,以第1次PCR产物为模板进行第2次PCR条件摸索后,第2次PCR产物的浓度可用于后续的实验(见图2).2.2 构建原核表达载体pET-28a-CKO提取载体质粒pET-28a,用EcoR I单酶切检测.用Nde I分别酶切目的片段和载体质粒pET-28a,37℃过夜,回收第一次酶切产物;再用Xho I酶切6h,将第二次酶切的产物回收后,用T4连接酶16℃连接过夜,连接产物和空载pET-28a分别热激转化大肠杆菌DH5a感受态细胞.对长出的单菌落进行构建载体重组体的检测,结果见如图3.将构建好的载体经菌落和质粒PCR检测,目的片段大小约为1500 bp,再将重组载体用Nde I和Xho I双酶切检测,结果显示有约5500 bp和1500 bp的条带(见图4),将鉴定正确的重组载体测序,测序结果100%正确,可用于后续实验. 2.3 CKO蛋白的SDS-PAGE和Western-blot分析15 ℃下用1 mmol/L IPTG诱导原核表达菌体表达8 h,以空载pET-28a为对照,诱导蛋白通过SDS-PAGE检测,与对照相比,可见蛋白大小在55~70 kDa,进一步进行Western-blot分析检测,分析结果在55~70 kDa处有带His标签的融合蛋白,该蛋白就是目的蛋白CKO,说明CKO重组蛋白成功得到了表达(见图5). 本研究利用水稻日本晴为材料,成功构建了pET-28a-CKO重组载体, 采用大肠杆菌菌株BL21(DE3)作为表达菌株,实现了水稻细胞分裂素氧化酶(CKO)的原核表达.表达产物经SDS-PAGE检测和Western-blot分析,目的蛋白获得了成功表达.本研究为后续结合纳米材料放大效应,构建相应的生物传感器和蛋白生理功能研究奠定了基础.[1] 邓江明,潘瑞炽.细胞分裂素氧化酶[J].植物生理学通讯,1997,33(5):370-375.[2] Houba-Hérin N, Pethe C, Alayer J, et al. Cytokinin oxidase from Zeamays: purification, cDNA cloning and expression inmoss protoplasts[J].Plant J, 1999, 17(6): 615-626.[3] Bilyeu K D, Cole J L, Laskey J G, et al. Molecular and biochemical characterization of a cytokinin oxidase from maize[J].Plant Physiol, 2001, 125(1):378-386.[4] Yang S H, Yu H, Goh C J. Functional characterisation of a cytokinin oxidase gene DSCKX1 in Dendrobium orchid[J].Plant Mol Biol, 2003,51: 237-248.[5] Petr G, Jitka F, Tomas W, et al. Cytokinin oxidase/dehydrogenase genes in barley and wheat: Cloning and heterologous expression[J]. FEBS J, 2004, 271(20): 3990-4002.[6] 马信, 林爱玲, 封德顺,等. 小麦细胞分裂素氧化酶基因TaCKX1原核表达载体的构建及表达[J]. 生物技术, 2009, 19(1):10-13.[7] Ashikari M, Sakakibara H, Lin S, et al. Cytokinin oxidase regulates rice grain production[J].Science, 2005, 309(5735): 741-745.[8] Li Z, Liu X, Wang C, et al. Expression, purification and direct eletrochemistry of cytochrome P450 6A1 from the house fly, Musca domestica[J]. Protein Expres Purif, 2010,71(1):74-78.[9] 陈思礼,梅菊.鱼腥藻PCC 7120染色体上relBE同源基因的克隆及表达[J].中南民族大学学报: 自然科学版, 2012, 31(1):16-19.[10] 吴云华, 邓欢. 尖镰胞菌细胞色素 P450 55a1 基因超表达载体的构建和水稻日本晴遗传转化[J]. 中南民族大学学报: 自然科学版, 2014, 33(2): 32-35.。

茶树过氧化氢酶基因CsCAT1克隆与生物信息学分析

茶树过氧化氢酶基因CsCAT1克隆与生物信息学分析

茶树过氧化氢酶基因CsCAT1克隆与生物信息学分析王仲;赖钟雄;郭玉琼【摘要】为了解茶树过氧化氢酶( CAT)基因的相关信息,以茶树叶片为原始材料,克隆获得茶树CsCAT基因全长,并进行生物信息学分析。

结果表明:茶树CsCAT基因cDNA全长1682 bp,完整的开放阅读框(ORF)长度为1479 bp,共编码492个氨基酸。

生物信息学分析显示:CAT蛋白分子量为56�81kD,理论等电点( pI)6�78,总平均疏水系数为-0�546,预测亚细胞定位于过氧化物酶体,为稳定的酸性亲水蛋白。

茶树CAT氨基酸序列与棉花、毛果杨、胡麻的相似性分别为93%、92%、91%。

%In order to know about genes of teatree catalase, a CsCAT gene was cloned and analyzed bio-informatically using leaves of tea trees. The results show that the length of CsCAT gene cDNA is 1 682 bp, the complete length of open read frame ( ORF) is 1 479 bp, encoding 492 amino acids. Bioinformatics analysis shows that the protein molecular mass is 56.81 kD, isoelectric point ( pI) is 6.78, and total average dewatering coefficient is -0.546. It is estimated that subcellular fraction lies in peroxysome, being a stable acidic hydrophilic protein. The similarity of tea trees’ CAT amino acid sequence to cotton, western balsam poplar and flax are 93%, 92% and 91% respectively.【期刊名称】《龙岩学院学报》【年(卷),期】2016(034)002【总页数】5页(P111-115)【关键词】铁观音茶树;CsCAT;过氧化氢酶;基因克隆【作者】王仲;赖钟雄;郭玉琼【作者单位】福建农林大学福建福州 350002;福建农林大学福建福州 350002;福建农林大学福建福州 350002【正文语种】中文【中图分类】S571.1过氧化氢酶(CAT)是一种广泛存在于植物体内的末端氧化酶,具有催化过氧化氢降解为分子氧和水的功能,对维持植物细胞内的氧化还原平衡具有重要作用[1]。

幽门螺杆菌ahpC基因的克隆与原核表达

幽门螺杆菌ahpC基因的克隆与原核表达

时间:2021年3月29日学海无涯页码:第1页共6页幽门螺杆菌ahpC基因的克隆与原核表达幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)是一种定植于人类胃黏膜的革兰染色阴性、螺旋状、微需氧菌,是慢性胃炎、消化性溃疡的病原体,也与胃腺癌及黏膜相关性淋巴瘤的发生密切相关[1-4]o全世界范围内Hp的感染率超过50%[5]。

Hp是一种对氧敏感的微需氧菌,菌体内还有多种抗氧化蛋口,其中烷基过氧化氢物还原酶(Ahp)最为丰富, 其作用是通过在高氧化环境中还原有毒的氢化氧化物来实现的。

Ahp 由ahpC基因编码,是抗氧化酶家族peroxiredoxins(prxs)的成员之一⑹。

木研究利用基因克隆技术,将编码Hp ahpC外膜蛋白的基因经PCR扩增后,构建重组载体,并在E.coli BL21(DE3)中进行表达和纯化, 为进一步研究奠定基础。

1材料与方法1.1材料幽门螺杆菌中国分离株MEL-Hp27(简称Hp27)及质粒pET-30a 由木实验室培养和保存;線柱、大肠杆菌DH5a、BL21 (DE3)购自创生公司;限制性核酸内切酶Nde I和Xho I、pMD18-T Vector> Protein marker、T4 DNA连接酶均购自大连TaKaRa公司;Taq DNA聚合酶、dNTP、DNA marker.细菌基因组DNA抽提试剂盒、DNA电泳胶回收、质粒抽提试1剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司。

引物合成由北京赛百盛生物工程公司完成,DNA测序由北京三博远志生物有限责任公司完成。

其他试剂均为国产分析纯。

1.2方法1.2.1Hp基因组DNA的提取刮取经3d培养的Hp培养板上的Hp,以12000r/min离心lmin,取沉淀按细菌基因组抽提试剂盒操作方法提取Hp DNAo1.2.2AhpC编码基因的扩增根据GenBank上公布的Hp ahpC基因序列,利用引物设计软件primer5.0设计ahpC基因的引物P1和P2。

相关主题
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

收稿日期:2018-07-04基金项目:国家自然科学基金(31400547)。

作者简介:刘裕峰,博士研究生。

*责任作者:韩珊,副教授,研究方向为林木病理与分子生物学,E-mail :hanshan6618@ 。

板栗过氧化氢酶基因CmCAT 的克隆与原核表达刘裕峰,朱天辉,刘应高,谯天敏,李姝江,龙旭梅,韩珊*(四川农业大学林学院,成都611130)摘要:【目的】旨在克隆板栗CmCAT 基因全长cDNA 序列,分析其编码蛋白相关信息并进行原核表达研究。

【方法】采用RT-PCR 技术从板栗品种“石丰”中克隆获得CmCAT 基因,用生物信息学方法对获得的cDNA 序列及推定的氨基酸序列进行分析。

构建原核表达载体pET28a-CmCAT ,经PCR 和酶切鉴定后转入大肠杆菌BL21(DE3)中进行诱导表达。

【结果】板栗CmCAT 基因开放阅读框(ORF )为1479bp ,共编码492个氨基酸,推测蛋白分子质量为56.883kDa ,理论等电点pI 为5.83,GenBank 登录号为KY312851。

其核苷酸序列与核桃(Juglans regia )CAT 基因序列相似性最高,为85%。

遗传进化分析表明,板栗CmCAT 与核桃的亲缘关系最近。

SDS-PAGE 电泳分析表明,在30℃条件下,0.2mmol/L IPTG 诱导6h 表达量最佳,诱导的目的蛋白分子量约为60kDa ,其主要以包涵体的形式存在。

【结论】成功克隆了板栗CmCAT 基因,并对其编码蛋白的理化性质进行了预测分析,在大肠杆菌中获得了大量的表达,为其进一步的生物学功能研究奠定了基础。

关键词:板栗;过氧化氢酶;基因克隆;原核表达中图分类号:S763曰Q786文献标志码:A文章编号:1000-2650(2019)02-0168-09Cloning and Prokaryotic Expression of Catalase Gene CmCAT fromCastanea mollissima BLLIU Yufeng ,ZHU Tianhui ,LIU Yinggao ,QIAO Tianmin ,LI Shujiang ,LONG Xumei ,HAN Shan *(College of Forestry ,Sichuan Agricultural University ,Chengdu 611130,China )Abstract:【Objective 】The aim to clone the full-length cDNA of CmCAT gene from Castanea mollissima ,and to analyze its protein-related information and to study its prokaryotic expression.【Method 】The CmCAT gene was cloned from Castanea mollissima ‘Shifeng ’by RT-PCR ,and the obtained cDNA se -quence and the deduced amino acid sequence were analyzed by bioinformatics method.The prokaryotic expression vector pET28a-CmCAT was constructed and then transferred into E.coli BL21(DE3)by PCR and restriction enzyme digestion.【Result 】The open reading frame (ORF)of CmCAT gene was 1479bpand encoded 492amino acids.The molecular weight of the protein was 56.883kDa ,the theoretical iso -electric point (pI)was 5.83,and the GenBank accession number was KY312851.The CmCAT nucleotide sequence shared the highest homology (85%)with that in Juglans regia .Genetic evolution analysis showed that CmCAT had the closest genetic relationship with Juglans regia .SDS-PAGE analysis showed that the optimal expression conditions of gene were 6h under 30℃by 0.2mmol/L IPTG inducing.The molecular weight of the target protein was about 60kDa ,which was mainly in the form of inclusion body.【Conclusion 】The CmCA T gene from Castanea mollissima was successfully cloned ,and its physicochem -ical properties were predicted and analyzed.CmCAT protein was expressed in BL21(DE3)largely.Which laid the foundation for further biological function research.Keywords :Castanea mollissima BL ;catalase (CAT);gene cloning ;prokaryotic expression第37卷第2期2019年4月Vol.37No.2Apr .2019四川农业大学学报Journal of Sichuan Agricultural University首次发现动植物组织能够分解过氧化氢产生氧气可追溯到1811年,后被发现可能是某种酶起作用,直到1901年,该酶被命名为过氧化氢酶(hudrogen peroxidase),又名触酶(catalase,CAT)[1]。

现已发现在动物、植物及微生物体内均含有大量的CAT。

病原菌的入侵会打破超氧阴离子(O2-)、过氧化氢(H2O2)和羟自由基(·OH)等活性氧类(reactive oxygen species,ROS)物质的动态平衡,导致活性氧物质在植物体内大量积累,长时间的积累而得不到有效的清除,会损伤植物细胞膜系统,破坏蛋白质功能,严重时导致植株死亡[2]。

CAT作为植物体内主要的抗氧化酶之一,它能够催化植物光呼吸、线粒体电子传递及脂肪酸氧化等过程中产生的H2O2生成O2和H2O[3]。

有报道称[4],一分子CAT每分钟能将大约6×106个H2O2分子转化成H2O和O2。

因此,CAT对H2O2的清除具有较高的特异性,并且在去除H2O2过量中起关键作用[5],使得植物不受伤害。

大量研究表明,CAT与植物的抗病性存在着紧密的联系。

Pei Z.M.等[6]研究发现,缺失CAT基因的烟草体内H2O2含量增加,导致细胞死亡;Jiang M.等[7]发现,植物的CAT活性能够被水杨酸抗病因子抑制,导致过多的ROS产生,进而引起植物系统性的防御反应;病原菌浸染植物的初期阶段,CAT催化H2O2生成O2,触发苯甲酸生成水杨酸,导致系统性防卫反应的发生[8];转玉米CAT2基因的烟草遭受病原菌侵染后,诱发严重的超敏反应,进而有效地控制细菌的进一步感染[9];转基因烟草植株体内酵母CAT1基因的过量表达,能够提高转基因植株的抗病毒侵染能力[10]。

植物CAT基因家族由多个基因编码,其表达受病原、温度、光照、干旱等多种因子的调控[11]。

目前,已从火龙果[12]、人参[13]、甘薯[14]、南瓜[15]、水稻[16]、坛紫菜[17]等多种植物中克隆获得CAT基因并进行相关分析。

但目前关于板栗CAT基因的相关研究较少,异源表达方面的研究尚属空白。

本研究在板栗转录组学研究[18]的基础上,利用RT-PCR技术克隆获得板栗CAT基因全长cDNA序列,并进行了相关生物信息学分析,同时构建pET28a-CmCAT原核表达载体,在大肠杆菌中进行了融合表达,旨在了解其基因结构和功能,为进一步研究板栗抗病的分子机理奠定基础。

1材料和方法1.1试验材料供试板栗品种为“石丰”,种植于四川农业大学林学院崇州基地;植物RNA提取试剂盒购自北京华越洋生物科技有限公司;PCR反转录试剂盒、pMD19-T载体购自大连TaKaRa公司;DNA纯化回收试剂盒、质粒提取试剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司;表达载体pET-28a由四川农业大学林学院林木病理学实验室提供;大肠杆菌DH5α、BL21(DE3)购自北京全式金生物技术有限公司;限制性内切酶EcoR I、Xho I、T4DNA连接酶购自NEB (北京)有限公司;其他试剂为进口或国产分析纯。

1.2总RNA的提取与cDNA的合成以板栗幼叶作为RNA提取材料,使用植物多糖多酚RNA提取试剂盒(北京华越洋生物)提取总RNA。

提取的总RNA经BioMate3S(BioMate3S,Thermo Scientific)及1%的琼脂糖凝胶电泳检测其浓度和完整性。

cDNA第一链的合成使用PrimeScript TM Ⅱ1st Strand cDNA Synthesis Kit试剂盒(TaKaRa,大连),具体操作步骤参照说明书进行。

合成的cDNA 保存于-80℃,用于后续试验。

1.3CmCAT基因的克隆根据NCBI数据库中已公布的其他植物CAT 基因核苷酸序列,将其与板栗基因组数据库(http:// /)进行同源比对,寻找并分析板栗CAT基因EST序列,使用Primer Premier 5.0软件设计一对特异性引物CmCAT-F:5'-ATG GATCCCTACAAGTACCG-3',CmCAT-R:5'-TCA CATTGTTGGCCTCAC-3'。

以反转录的板栗cDNA 为模板,进行PCR扩增,反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,55℃复性30s,72℃延伸2min,35个循环;72℃终延伸7min。

相关文档
最新文档