Week 11 计算机技术在生物学中的应用
生物医学大数据分析与挖掘ppt课件
报告内容
一、生物医学大数据分析挖掘的几个方向 二、基于流感大数据发展流感预测预警新方法
21
临床大数据分析与挖掘-流感危害性预测
y = 31.31 x - 8.85 R2=0.83
通过分析流感监测产生的大数据，社会经济大数据以及大 量基因序列，以及大量的相关性分析，发现了快速预测流 感病毒危害性的新方法
1，目前该方法已经申请了专利。 2，在使用我们的方法向WHO推荐疫苗参考株。 3，Nature Communcations, 2012.
28
X X
X
XX XX
XX
X
29
新华社发布的新闻：我国科学家发明流感 疫苗株快速选择新技术
30
我国2013年华东地区H7N9溯源
进化分析
大规模病毒采样 与基因测序
Based on 7 seasons during 2002-2009.
Du et al. Nature Communications析与挖掘-流感疫苗推荐
大规模病毒采样 与基因测序
流感病毒关联 网络
疫苗推荐
该工作发表在《Nature Communications》上， 被选为亮点文章，并且同期《Nature》杂志也对 该工作进行了报道
商业大数据 生物医学大数据
智能交通
天气预报
股票
? 智慧医疗和
个性化医疗
3
医院信息化产生海量临床数据
临床大数据
4
美国卫生信息化发展计划
2011年，美国卫生信息技术协调官办公室发布全国卫生信息化发展计划，计 划时限2011-2015
5
我国卫生信息化发展计划
35212工程
6
美国VS中国
美国 系统逐步成型、理念推广、政策制定、科 学研究
初一英语学科名称练习题40题(答案解析)
初一英语学科名称练习题40题(答案解析)1.I like English very much. What's your favorite ____?A.subjectB.sportC.colorD.fruit答案解析：A。
选项A“subject”是学科的意思；选项B“sport”是运动的意思；选项C“color”是颜色的意思；选项D“fruit”是水果的意思。
题干中提到喜欢英语，询问最喜欢的什么，在学校场景中最符合的是学科，所以选A。
2.We have many subjects at school. Which one is not a subject?A.mathB.musicC.swimmingD.Chinese答案解析：C。
选项A“math”是数学；选项B“music”是音乐；选项D“Chinese”是语文，这些都是学科名称。
而选项C“swimming”是游泳，是一项运动，不是学科，所以选C。
3.My brother is good at ____. He likes solving difficult problems.A.EnglishB.historyC.geography答案解析：D。
选项A“English”是英语；选项B“history”是历史；选项C“geography”是地理；选项D“math”是数学。
题干中说喜欢解决难题，在这些学科中数学通常有很多难题，所以选D。
4.____ is very interesting. We can learn about different countries.A.MusicB.PEC.GeographyD.Art答案解析：C。
选项A“Music”是音乐；选项B“PE”是体育；选项C“Geography”是地理，可以学习不同国家；选项D“Art”是美术。
所以选C。
5.We have ____ class on Monday. We can draw pictures.A.artB.musicC.mathD.science答案解析：A。
生命科学中的计算机技术应用
生命科学中的计算机技术应用随着计算机技术的迅速发展，其在生命科学领域的应用也变得越来越广泛。
计算机技术不仅可以帮助生命科学研究人员在实验过程中进行数据的管理和分析，还可以通过模拟和预测等方法揭示生命体的内部运作机理，推动生命科学领域的进一步发展。
首先，计算机技术在生命科学研究中的一个重要应用就是数据管理和分析。
生命科学实验产生的数据量庞大，涉及到各种生物分子的序列、结构、功能以及生物过程的动态变化等信息。
借助计算机技术，生命科学研究人员可以将这些数据进行整理、存储和管理，方便后续的分析和利用。
例如，基因组学领域中的基因组测序技术可以快速产生大量的基因序列数据，通过计算机技术可以对这些数据进行比对、组装和注释，从而揭示基因的结构和功能。
其次，计算机模拟在生命科学研究中也被广泛应用。
生命体的内部运作机理涉及到大量的生化反应、信号传递和调控等过程，借助计算机模拟的方法可以对这些复杂的生物过程进行模拟和预测。
例如，通过建立分子动力学模型，可以模拟蛋白质的结构变化和相互作用，以及药物分子与蛋白质的结合过程。
这些模拟结果可以帮助研究人员更好地理解生物分子的结构和功能，进一步指导药物设计和开发。
此外，计算机技术还可以在生物信息学领域进行基因组学和蛋白质组学的研究。
生物信息学是生命科学研究中一个重要的交叉学科，它通过生物数据分析和算法设计等手段，研究基因组和蛋白质组的结构、功能和演化。
计算机技术在这个领域的应用包括基因组的序列比对、蛋白质的结构预测、基因网络的构建和分析等。
这些方法可以帮助研究人员对生物信息进行挖掘和解读，发现新的基因和蛋白质，以及揭示它们在生物过程中的功能和调控机制。
最后，计算机技术还可以在药物研发和临床医学中发挥重要作用。
通过对药物分子的结构和相互作用进行计算机模拟和预测，可以加速新药的研发过程。
同时，计算机技术还可以帮助医生对患者进行个体化治疗，根据患者基因组和临床特征进行诊断和治疗方案的选择。
生物学网站汇总
生物学常用网站science杂志美国生物技术信息中心(NCBI)nature杂志人类基因组数据库(NCBI)/dBest/index.htmlCMS MBR 生物网站/srs5bin人类基因组数据库(NCBI)/web/Genbank/index.htmlpubmed医学文献检索/PubMed/medline.html日本DNA数据库(DDBJ)http://www.ddbj.nig.ac.jpscience online国内镜像/蛋白质信息资源(PIR)/Dan/proteins/pir.htmlCell杂志/基因组数据库(GDB)http://www.gdb/org/美国科学院院刊PNAS网址(免费）/蛋白质结构数据库(PDB)/网上全文的生物学期刊/bio/journal.htmSander蛋白质二级结构数据库http://www.sander.embl-heidelberg.de/国家自然科学基金委员会/Rutgers大学核酸数据库工程/上海生化所/蛋白质科学网络服务器/中国微生物信息网络/chinese/chinese.html蛋白质科学网络服务器/中文科技期刊/periodical/index.htmPangea公司生物信息学服务台器/HIV基因数据库生物科学综合站点互联网上的生物学网站http://www.biologie.de/home.html该网站链接到生物学新闻、生物学历史和动物系统科学等方面的网站。
网上生物技术该网站提供与互联网生物技术和药物学研究等相关方面的信息和服务。
生物学资料传输该网站提供新闻资源、生物学产品与服务和互联网资源的一览表，可查询生物技术信息。
生物学管理虚拟信息中心[url=/biocontrol/biocontrol.html]/biocontrol/bioc ontrol.html[/url]该网站提供生物学管理组织、资料库和有关网站的链接目录表生物学空间该网站介绍与生物技术产业有关的在线贸易展示会和电子出版物。
计算机技术在生物学科的应用
计算机技术在生物学科的应用1.序列比对序列比对其意义是从核酸、氨基酸的层次来比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性，进而推测其结构功能及进化上的联系。
研究序列相似性的目的是通过相似的序列得到相似的结构或功能，也可以通过序列的相似性判别序列之间的同源性，推测序列之间的进化关系。
序列比对是生物信息学的基础，非常重要。
序列比对中最基础的是双序列比对，双序列比较又分为全局序列比较和局部序列比较，这两种比较均可用动态程序设计方法有效解决。
在实际应用中，某些在生物学上有重要意义的相似性不是仅仅分析单条序列，只能通过将多个序列对比排列起来才能识别。
比如当面对许多不同生物但蛋白质功能相似时，我们可能想知道序列的哪些部分是相似的，哪些部分是不同的，进而分析蛋白质的结构和功能。
为获得这些信息，我们需要对这些序列进行多序列比对。
多重序列比对算法有动态规划算法、星形比对算法、树形比对算法、遗传算法、模拟退火算法、隐马尔可夫模型等，这些算法都可以通过计算机得以解决。
2.数据库搜索随着人类基因组计划的实施，实验数据急剧增加，数据的标准化和检验成为信息处理的第一步工作，并在此基础上建立数据库，存储和管理基因组信息。
这就需要借助计算机存储大量的生物学实验数据，通过对这些数据按一定功能分类整理，形成了数以百计的生物信息数据库，并要求有高效的程序对这些数据库进行查询，以此来满足生物学工作者的需要。
数据库包括一级数据库和二级数据库，一级数据库直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释；二级数据库是对基本数据进行分析、提炼加工后提取的有用信息。
分子生物学的三大核心数据库是GenBank核酸序列数据库，SWISS-PROT蛋白质序列数据库和PDB生物大分子结构数据库，这三大数据库为全世界分子生物学和医学研究人员了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息提供了必要的支撑。
但是用传统的手工分析方法来处理数据显然已经无法跟上新时代的步伐，对于大量的实验结果必须利用计算机进行自动分析，以此来寻找数据之间存在的密切关系，并且用来解决实际中的问题。
单招模拟试卷六
单招模拟试卷六2024年单招模拟试卷六单招考试是一种针对特定人群的考试，旨在测试考生的专业技能和知识水平。
在本文中，我们将提供一份2024年单招模拟试卷六，并给出相应的答案和解析。
一、选择题1、下列哪个城市不属于中国的三大“火炉”城市？ A. 重庆 B. 武汉 C. 南京 D. 西安答案：D2、下列哪个国家拥有世界上最长的海岸线？ A. 美国 B. 俄罗斯 C. 加拿大 D. 澳大利亚答案：C3、下列哪个星座不属于北半球星空？ A. 天秤座 B. 双子座 C. 狮子座 D. 处女座答案：A二、填空题4、在二进制中，1101=（）2。
答案：1101=11012=13。
41、我们日常使用的电流电压是_____V。
答案：220411、青藏高原是世界上最高的高原，它的面积大约是_____万平方公里。
答案：250三、解答题7、请简述互联网对于现代社会的重要性。
答案：互联网已成为现代社会的重要组成部分，它提供了各种各样的信息和服务，包括新闻、社交、娱乐、教育、商业等。
互联网使得人们能够更加方便地获取和分享信息，促进了社交和人际交往，提高了工作效率和便捷性，推动了社会的发展和进步。
71、请简述气候变化对地球生态系统的影响。
答案：气候变化可能导致全球气温升高、海平面上升、极端天气事件增多等。
这些变化会对地球生态系统产生深远的影响，包括改变生物种群分布、破坏生态环境、破坏生态平衡等。
气候变化还可能对人类社会产生重大影响，如影响农业生产、水资源管理、能源政策等。
因此，应对气候变化和采取相应的环境保护措施至关重要。
711、请简述中国古代四大发明。
答案：中国古代四大发明包括造纸术、印刷术、火药和指南针。
这些发明对于中国古代的政治、经济、文化等方面都产生了重要的影响，同时也对世界文明的发展产生了巨大的贡献。
造纸术和印刷术促进了文化知识的传播和发展，火药在军事上被广泛应用，指南针则为航海和地理探索提供了重要的支持。
四、论述题10、请论述人工智能对于未来的影响。
生物技术专业学什么
生物技术专业学什么生物技术作为一门新兴的交叉学科，涵盖了生物学、化学、生物信息学、计算机科学等多个学科领域。
这门学科从传统的研究和实验方法中发展出了许多新的技术和方法，广泛应用于医药、农业、环境保护、食品科学等领域。
那么，作为生物技术专业的学生，他们具体学习什么呢？首先，生物技术专业的学习会涉及到生物学的基础知识。
生物学是生物技术的基础，理解生物学的基本原理对于后续的学习和实践非常重要。
学生需要学习细胞生物学、分子生物学、遗传学、生态学等方面的知识，以了解生物体的组成和功能。
其次，生物技术专业的学习也会涉及到化学的基本知识。
生物技术往往需要进行一系列化学反应和分离纯化的过程，因此，学生需要学习有关有机化学、无机化学和分析化学等方面的知识。
此外，生物技术还会涉及到生物化学、药物化学等交叉学科的知识。
另外，生物技术专业的学习也会涉及到生物信息学方面的知识。
生物信息学是将计算机科学应用于生物学领域的学科，它可以帮助研究人员进行大规模基因数据的整理和分析。
学生需要学习相关的编程语言、数据库的使用和基因组学、蛋白质组学等方面的知识。
此外，生物技术专业的学习还会包括实验技术的培训和研究方法的学习。
生物技术的研究往往需要进行一系列的实验和技术操作，因此，学生需要学习实验室的操作技巧、仪器设备的使用以及实验设计和数据分析的能力。
在课程设置方面，生物技术专业通常包括以下一些核心课程：生物化学、微生物学、分子生物学、生物信息学、遗传学、生物工程学等。
此外，还会有一些专业选修课程，如克隆技术、基因工程、细胞培养技术等，以满足学生的个人需求和兴趣。
除了课程学习外，生物技术专业还注重实践能力的培养。
学生会参与实验室的科研项目，进行实验操作和数据分析。
通过实践，学生可以锻炼自己的科学思维能力和实际动手能力，培养解决问题和创新的能力。
综上所述，生物技术专业的学习涉及领域广泛，包括生物学、化学、生物信息学和实验技术等方面的知识。
关于课程的英文单词
关于课程的英文单词一、学科类。
1. mathematics [ˌmæθəˈmætɪks] (n.)- 释义：数学。
- 例句：Mathematics is not an easy subject for some students.（对一些学生来说，数学不是一门容易的学科。
）2. physics [ˈfɪzɪks] (n.)- 释义：物理学。
- 例句：He is interested in physics and wants to be a physicist.（他对物理感兴趣，想成为一名物理学家。
）3. chemistry [ˈkemɪstri] (n.)- 释义：化学。
- 例句：We have a chemistry experiment tomorrow.（我们明天有一个化学实验。
）4. biology [baɪˈɒlədʒi] (n.)- 释义：生物学。
- 例句：Biology helps us understand the living things around us.（生物学帮助我们理解我们周围的生物。
）5. history [ˈhɪstri] (n.)- 释义：历史。
- 例句：History is full of interesting stories.（历史充满了有趣的故事。
）6. geography [dʒiˈɒɡrəfi] (n.)- 释义：地理学。
- 例句：Geography includes the study of landforms and climates.（地理学包括对地形和气候的研究。
）7. English [ˈɪŋɡlɪʃ] (n.)- 释义：英语。
- 例句：English is an international language.（英语是一门国际语言。
）8. Chinese [ˌtʃaɪˈniːz] (n.)- 释义：汉语；语文（学科）。
计算机技术在生物学中的应用教案
计算机技术在生物学中的应用-教案章节一：引言1.1 教学目标：了解计算机技术在生物学中的重要性和应用领域。
激发学生对计算机技术在生物学中应用的兴趣和好奇心。
1.2 教学内容：计算机技术的定义和发展历程。
生物学与计算机技术的交叉领域。
计算机技术在生物学中的重要应用案例。
1.3 教学方法：讲座式教学，介绍计算机技术在生物学中的应用。
互动讨论，引导学生思考计算机技术在生物学中的潜在应用。
章节二：基因组学与生物信息学2.1 教学目标：了解基因组学的概念和重要性。
掌握生物信息学的基本原理和方法。
2.2 教学内容：基因组的定义和结构。
基因组学的研究方法和应用。
生物信息学的基本概念和方法。
2.3 教学方法：讲座式教学，介绍基因组学的基本概念和应用。
案例分析，分析具体的基因组学研究案例。
章节三：生物信息学工具与技术3.1 教学目标：掌握生物信息学中常用的工具和技术。
能够运用生物信息学工具进行生物学数据分析和解读。
3.2 教学内容：生物信息学工具的分类和介绍。
生物信息学技术的基本原理和方法。
实际操作生物信息学工具进行数据分析和解读。
3.3 教学方法：讲解和示范生物信息学工具的使用方法。
学生实际操作练习，进行生物学数据分析。
章节四：计算机模拟与分子建模4.1 教学目标：了解计算机模拟在生物学中的应用。
掌握分子建模的基本原理和方法。
4.2 教学内容：计算机模拟的定义和原理。
分子建模的基本概念和方法。
计算机模拟在生物学研究中的应用案例。
4.3 教学方法：讲座式教学，介绍计算机模拟和分子建模的基本概念。
学生实际操作练习，进行简单的分子建模和模拟。
章节五：图像处理与生物识别技术5.1 教学目标：了解图像处理在生物学中的应用。
掌握生物识别技术的基本原理和方法。
5.2 教学内容：图像处理的基本概念和方法。
生物识别技术的定义和应用领域。
生物识别技术在生物学研究中的应用案例。
5.3 教学方法：讲解和示范图像处理的基本方法。
学生实际操作练习，进行生物图像的处理和识别。
生物计算机
生物计算机简介生物计算机是指利用生物学原理和方法来设计和构建计算机系统的一种新型计算机。
它借助生物体内部自然发生的生物化学反应，将生物分子作为信息处理的基本元件。
与传统计算机相比，生物计算机具有更高的并行性、更低的功耗和更强的智能计算能力。
生物计算机在生物信息学、医学、环境科学、人工智能等领域有着广泛的应用前景。
原理生物计算机的工作原理是利用生物学反应中的酶、DNA、RNA等生物分子进行信息储存和处理。
它将信息编码成基因的序列，然后利用生物反应来实现信息的处理和计算。
生物计算机的核心组成部分包括生物传感器、生物处理器和生物存储器。
生物传感器生物传感器是生物计算机的输入部分，它能够感知和接收外界的生物信号。
生物传感器可以通过测量细胞内的电位、浓度变化、光反应等方式来获取信息。
常用的生物传感器包括基因传感器、蛋白质传感器和细胞传感器等。
生物处理器生物处理器是生物计算机的核心部分，它负责对输入的生物信号进行处理和计算。
生物处理器利用生物分子的特性和反应来实现逻辑运算、模拟计算和优化求解等功能。
生物处理器的设计需要考虑生物分子的稳定性、反应速度和可靠性等因素。
生物存储器生物存储器是生物计算机的存储部分，它用于储存计算过程中产生的中间结果和最终结果。
生物存储器可以利用DNA、RNA等生物分子来储存信息，具有高密度、长寿命和并行读写的优势。
生物存储器的设计需要考虑信息的读写速度、稳定性和易用性等因素。
应用生物计算机在生物信息学、医学、环境科学和人工智能等领域有着广泛的应用前景。
生物信息学生物计算机在生物信息学中可以用于模拟和分析生物体内的生物化学反应，实现基因组数据的处理和分析。
通过生物计算机，可以更加高效地进行基因序列比对、基因功能预测和蛋白质结构预测等任务。
医学生物计算机在医学领域可以用于研究和治疗疾病。
通过利用生物计算机模拟和分析疾病的发生和发展过程，可以为疾病的预防和治疗提供理论依据。
同时，生物计算机还可以用于设计和控制靶向药物的释放系统，实现精准医疗。
计算机技术在生物学中的应用-教案
计算机技术在生物学中的应用-教案第一章：计算机技术在生物学研究中的概述1.1 计算机技术的发展简史1.2 计算机技术在生物学中的重要性和必要性1.3 生物学与计算机技术的融合1.4 生物学研究中的计算机技术应用领域第二章：生物信息学基础2.1 生物信息学的定义和发展2.2 生物信息学中的数据类型与格式2.3 生物信息学常用的分析工具与软件2.4 生物信息学在生物学研究中的应用实例第三章：基因组学与计算机技术3.1 基因组学概述3.2 基因组测序技术及其计算机分析3.3 基因组注释与基因组浏览器3.4 基因组学在生物学研究中的应用实例第四章：蛋白质组学与计算机技术4.1 蛋白质组学概述4.2 蛋白质组学分析技术与方法4.3 计算机技术在蛋白质组学中的应用实例4.4 蛋白质组学与基因组学的整合研究第五章：计算生物学与系统生物学5.1 计算生物学的定义与发展5.2 系统生物学的原理与方法5.3 计算机技术在系统生物学中的应用实例5.4 计算生物学与系统生物学在生物学研究中的应用前景第六章：分子建模与计算机模拟6.1 分子建模的基本概念6.2 计算机模拟在生物分子研究中的应用6.3 分子动力学模拟及其在生物学研究中的应用6.4 分子对接与虚拟筛选技术第七章：与机器学习在生物学中的应用7.1 与机器学习的基本原理7.2 机器学习在生物信息学中的应用实例7.3 深度学习在生物学研究中的应用7.4 技术在生物医学研究中的未来趋势第八章：生物统计与数据分析8.1 生物统计学的基本概念与方法8.2 常见生物统计分析方法及其应用8.3 计算机技术在生物统计与数据分析中的应用8.4 生物统计在生物学研究中的重要性第九章：可视化技术在生物学中的应用9.1 可视化技术的基本概念9.2 生物信息学数据的可视化方法与工具9.3 生物学研究中的三维可视化技术9.4 可视化技术在生物学教学与科研中的应用实例第十章：计算机技术在生物学教育中的应用10.1 计算机辅助教学在生物学教育中的优势10.2 生物学教育软件与在线资源10.3 虚拟实验室与远程实验教学10.4 未来生物学教育的发展趋势与挑战重点和难点解析重点环节一：计算机技术在生物学研究中的概述补充说明：强调计算机技术在生物学研究中的核心地位，解释为何计算机技术对生物学研究至关重要，以及如何实现生物学与计算机技术的有效结合。
计算机技术在生物学中的应用教案
计算机技术在生物学中的应用-教案第一章：计算机技术在生物学研究中的概述1.1 教学目标让学生了解计算机技术在生物学研究中的重要性。
让学生了解常见的计算机技术在生物学中的应用。
1.2 教学内容计算机技术的发展简史。
计算机技术在生物学研究中的应用领域。
计算机技术对生物学研究的贡献。
1.3 教学方法采用讲解和案例分析相结合的方式，让学生了解计算机技术在生物学中的应用。
引导学生思考计算机技术在生物学中的未来发展。
第二章：生物信息学与基因组学2.1 教学目标让学生了解生物信息学的基本概念。
让学生了解基因组学的基本概念。
2.2 教学内容生物信息学的定义、发展与研究内容。
基因组学的定义、发展与研究内容。
2.3 教学方法采用讲解和案例分析相结合的方式，让学生了解生物信息学和基因组学的基本概念。
引导学生思考生物信息学和基因组学在生物学研究中的应用。
第三章：生物信息学与蛋白质组学3.1 教学目标让学生了解蛋白质组学的基本概念。
让学生了解生物信息学在蛋白质组学研究中的应用。
3.2 教学内容蛋白质组学的定义、发展与研究内容。
生物信息学在蛋白质组学研究中的应用。
3.3 教学方法采用讲解和案例分析相结合的方式，让学生了解蛋白质组学和生物信息学在蛋白质组学研究中的应用。
引导学生思考蛋白质组学和生物信息学在生物学研究中的未来发展。
第四章：生物信息学与系统生物学4.1 教学目标让学生了解系统生物学的基本概念。
让学生了解生物信息学在系统生物学研究中的应用。
4.2 教学内容系统生物学的定义、发展与研究内容。
生物信息学在系统生物学研究中的应用。
4.3 教学方法采用讲解和案例分析相结合的方式，让学生了解系统生物学和生物信息学在系统生物学研究中的应用。
引导学生思考系统生物学和生物信息学在生物学研究中的未来发展。
第五章：计算机技术在生物学实验中的应用5.1 教学目标让学生了解计算机技术在生物学实验中的重要性。
让学生了解常见的计算机技术在生物学实验中的应用。
间歇有氧运动通过激活前额叶皮质线粒体自噬改善衰老模型大鼠学习记忆能力
间歇有氧运动通过激活前额叶皮质线粒体自噬改善衰老模型大鼠学习记忆能力*张金梅1，2， 伍怡1， 刘仁凡1， 吕丽婷1， 高巧婧1， 高骏1，李雪1， 金毓1， 王璐1△（1成都体育学院，四川 成都 610041；2巢湖学院，安徽 合肥 238000）［摘要］ 目的：探讨间歇有氧运动对D -半乳糖（D -Gal ）致衰老模型大鼠前额叶皮质（PFC ）线粒体自噬及空间学习记忆能力的影响。
方法：8周龄SPF 级Sprague -Dawley （SD ）大鼠随机分为对照（control ）组、衰老（aging ）组和aging+运动（Exe ）组，每组10只。
aging 组和aging+Exe 组进行6周的D -Gal 注射（control 组注射等体积的生理盐水）；之后aging+Exe 组进行8周的间歇有氧运动干预，45 min/d ，每周5 d （期间control 和aging 组自然饲养）。
运动干预结束后各组进行Morris 水迷宫行为学训练和测试；ELISA 试剂盒测定PFC 中超氧化物歧化酶（SOD ）、谷胱甘肽过氧化物酶（GSH -Px ）及丙二醛（MDA ）水平；甲苯胺蓝染色观察PFC 神经元形态；透射电镜观察线粒体微观结构和自噬情况；Western blot 检测线粒体自噬相关蛋白PTEN 诱导激酶1（PINK1）、parkin 和微管相关蛋白1轻链3（LC3）的表达。
结果：（1）与control 组比较，aging 组大鼠PFC 中SOD 和GSH -Px 水平显著下调（P <0.01），MDA 含量显著增加（P <0.01），Morris 水迷宫定位航行实验中逃避潜伏期延长，穿越原平台的次数显著减少（P <0.01），证明衰老模型建成；aging 组大鼠PFC 神经元损伤显著，尼氏体数量减少，线粒体出现损伤；线粒体自噬相关蛋白PINK1和parkin 表达受到抑制（P <0.05或P <0.01），LC3-II/LC3-I 比值下降（P <0.01）。
生物信息学和计算机技术在生物学研究中的应用
生物信息学和计算机技术在生物学研究中的应用随着科技发展，生物学研究不再依赖实验室中的手工操作和纸质记录，而是利用计算机技术进行高效、精确的数据处理和分析。
这就是生物信息学和计算机技术在生物学研究中的应用。
生物信息学是对生物学数据进行处理、存储和分析的学科。
生物信息学家使用计算机软件和数据库来分析生物学中的实验数据，从而获得新的科学发现。
生物信息学可以应用于基因序列、蛋白质结构、代谢通路、表观遗传学等方面的研究。
计算机技术是生物信息学的核心。
计算机技术能够大幅提高生物学实验的效率，例如，通过生物信息学分析可以得出某些特定的生物序列，这样就可以避免多次实验重复。
而且通过计算机处理的数据更加精确，数据的误差减少。
这进一步提高了实验结果的准确度。
生物信息学在基因的研究中起着重要的作用，因为基因是生物体遗传信息的载体。
通过生物信息学的方法，可以对基因进行序列分析，比如通过比对基因序列找出相关基因。
此外，基因比对可以丰富对基因背景的认识，同时也有利于研究不同世代的基因变化。
另外，生物信息学在蛋白质结构研究中也发挥了作用。
研究蛋白质结构的目的是了解这些分子如何进行生理作用，发现这些作用的机理后，我们就能够设计新的药物。
生物信息学可以通过多种方法分析蛋白质的结构，例如3D模拟和分子动力学模拟，进而寻找新的药物。
此外，生物信息学对代谢通路的研究也起着关键作用。
代谢通路是指细胞内各种化学反应的有序连续。
代谢通路有助于了解细胞并为药物研究提供基础。
利用生物信息学的方法可以确定代谢途径中关键酶，同时，可以快速预测代谢产物，这些预测结果能更好地回答“代谢产物的生成顺序如何”的问题。
最后，生物信息学的出现还可以更好地开展表观遗传学等方面的研究。
表观遗传学是指细胞基因的不同活性状态。
过去人们对表观遗传学的理解有限，但现在，生物信息学的方法被应用于表观遗传学中。
通过基因测序和生物信息学技术，我们现在可以更好地了解基因调节和染色质结构等方面的知识。
lincRNA-p21_在酒精性肠道损伤中的作用
lincRNA -p21在酒精性肠道损伤中的作用孙楠1，张超2，王标3，张沁雨4，张淑惠1，赵敬杰11 山东大学第二医院检验医学中心，济南250033；2 青岛市市立医院医学检验部；3 北京大学人民医院青岛医院检验科；4 山东中医药大学康复医学院摘要：目的 探讨基因间长链非编码RNA -p21（lincRNA -p21）在酒精性肠道损伤中的作用。
方法 将15只C57BL /6Cnc 小鼠适应性喂养一周，随机取10只，随机分为lincRNA -p21过表达组和对照组各5只，分别于尾静脉注射lincRNA -p21-over -AAV8-U6-GFP 病毒、control -AAV8-U6-GFP 病毒；以5只Trp53cor1基因敲除C57BL /6小鼠（lincRNA -p21-/-）为突变组，以5只C57BL /6Cnc 小鼠作为野生组。
各组分别予含5%酒精的液体饲料连续喂养4周，最后3天同时予40%酒精5 g /kg 灌胃，建立酒精性损伤模型。
模型构建成功后，处死小鼠，留取小肠组织，采用RT -qPCR 法检测小肠组织lincRNA -p21表达；HE 染色，观察小肠组织病理形态变化；免疫组化法检测小肠组织紧密连接蛋白claudin -1、ZO -1表达；取盲肠内容物，提取其微生物DNA ，并进行16S 扩增子测序，分析菌群多态性和组成等。
结果 lincRNA -p21过表达组小肠组织lincRNA -p21相对表达量高于对照组（t =5.31，P <0.05）；突变组lincRNA -p21相对表达量低于野生组（t =3.95，P <0.01）。
HE 染色显示，各组均出现肠道损伤，肠黏膜可见粒细胞、单核细胞浸润。
与对照组比较，lincRNA -p21过表达组肠道损伤较重，肠绒毛空泡化增多，肠黏膜细胞结构较紊乱，肠壁水肿和肠壁隐窝损伤较重；与野生组比较，突变组肠绒毛空泡化减少，肠黏膜细胞结构较条理，肠壁水肿和肠壁隐窝损伤较轻。
计算机生物方向研究生
计算机生物方向研究生
计算机生物方向研究生主要研究如何利用计算机技术解决生物学问题，主要包括生物信息学和计算生物学等领域。
生物信息学是生物学与计算机科学交叉形成的新兴学科，它利用计算机科学和数学的方法和手段，对生物学数据进行处理、分析和解释，以揭示生命现象的本质和规律。
生物信息学的研究领域包括基因组学、蛋白质组学、系统生物学等方面，其应用范围涵盖了医学、农业、生物技术等多个领域。
计算生物学是生物学的一个分支，它利用数学建模和计算机仿真技术等手段，对生物学、行为学和社会群体系统进行研究。
计算生物学的研究范围非常广泛，包括生物系统的数学建模、计算机模拟、系统生物学等方面。
计算机生物方向的研究生需要掌握计算机科学、数学、生物学等多方面的知识和技能，包括数据挖掘、机器学习、统计分析等方面的技能。
同时，他们还需要具备独立思考和解决问题的能力，以及对生物学的深入理解和对生命现象的敏锐洞察力。
就业方面，计算机生物方向的研究生具有广阔的就业前景，可以在政府机构、科研机构、生物技术公司等单位从事研究、教学、开发和应用等方面的工作。
同时，随着大数据和人工智能技术的不断发展，该领域对于高端人才的需求也越来越高，因此该领域的研究生具有较高的职业发展前景。
计算机技术在生物学中的应用
《计算机技术在生物学中的应用》一、课程基本信息课程编号：2512290课程中文名称：计算机技术在生物学中的应用课程英文名称：Apply of computer technique in biology课程类型：选修课总学时：36学分：2适用专业：生物科学、生物技术、生物工程、水产养殖学先修课程：计算机文化基础开课院系：生命科学学院二、课程性质和任务《计算机技术在生物学中的应用》是计算机技术与现代生物学研究相结合的一门课程。
通过该课程的学习，使学生了解计算机技术与生物学科学研究的关系；重点强调学生计算机技术应用能力的培养；让学生熟悉网络技术在生物学研究中的作用；通过教学让学生熟悉和了解生物学主要研究领域中的一些常用生物学应用软件的功能及应用范围。
为今后的学习和工作培养必要的计算机应用能力。
三、课程教学目标在学完本课程之后，学生能够：1．掌握和了解现代生物学研究中计算机技术的应用领域。
2．了解现代网络技术对生物学各领域科学研究的重要作用，能高效快速的运用计算机技术和网络技术为科研服务。
3．了解常用生物学专业软件在分子生物学、生物统计学、图像计量学、生物信息学等领域的应用。
四、理论教学环节和基本要求绪论基本要求：1．计算机硬件知识回顾，简要了解计算机基本原理和发展历史。
2．学习和提高计算机应用能力的主要途径。
3．重要生物学软件信息交流网站介绍。
重点和难点：各种生物学信息的数字化方法，专业网站的注册与信息交流方法。
主要内容：计算机知识背景；生物学工作者提高计算机应用水平的途径；几个重要的生物医学网站，如：生物软件网、生物谷、分子生物学个人交流网、小木虫、丁香园等主要栏目介绍。
第一章信息技术与电子计算机基本要求：理解信息技术的概念，了解计算机发展历史，掌握计算机工作原理和数据的表示方法、信息数字化的基本原理，了解计算机安全及保密的一般技术。
重点和难点：信息数字化、文字编码、静态图象、视频、音频的编码。
主要内容：1．信息技术与信息社会：信息技术；信息社会。
计算机技术在生物学中的应用
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计算机生物方向研究生
计算机生物方向研究生计算机生物方向研究生是一门融合计算机科学和生物学的学科，旨在利用计算机技术解决生物学领域中的问题。
作为一名计算机生物方向的研究生，我将研究计算机科学和生物学的交叉领域，探索计算机如何模拟和分析生物系统。
在计算机生物方向的研究中，我们主要关注的是如何利用计算机技术处理和分析生物数据。
生物数据可以包括基因组数据、蛋白质结构数据、生物分子的相互作用数据等。
通过开发高效的算法和工具，我们可以将这些数据转化为有意义的信息，并从中挖掘出生物学领域的重要发现。
在我所研究的项目中，我将使用计算机技术来分析基因组数据。
基因组是生物体内的遗传信息库，包含了组成我们身体的蛋白质编码。
通过分析基因组数据，我们可以了解生物体的遗传特征，寻找与疾病相关的基因变异，并为个性化医疗提供支持。
为了分析基因组数据，我将使用各种计算机科学的技术和方法。
例如，我将使用机器学习算法来识别基因组中的关键序列，以及预测这些序列的功能。
我还将开发基于图像处理技术的算法，来分析基因组的三维结构，以了解基因之间的相互作用。
除了基因组数据的分析，我还将研究计算机辅助药物设计。
药物设计是一项复杂的任务，需要考虑到药物与生物分子之间的相互作用。
通过使用计算机模拟和分析药物与生物分子的结合过程，我们可以预测药物的效果，并设计出更有效的药物。
在计算机生物方向的研究中，我们不仅仅关注技术的应用，还需要理解生物学的基本原理。
只有深入理解生物学的基础知识，才能更好地利用计算机技术解决生物学领域中的问题。
作为一名计算机生物方向研究生，我将不断学习和探索，致力于将计算机科学和生物学相结合，为解决生物学领域中的难题做出贡献。
我相信，在计算机生物的研究中，我们可以为人类的健康和生命质量带来积极的影响。
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第三章 搜索引擎及生物学资源介绍
第三节 非WWW生物资源检索
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1. 常用FTP搜索引擎
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1. 常用FTP搜索引擎
44
2. 常用生物学FTP网站 北京大学生物信息中心
45
2. 常用生物学FTP网站 NCBI
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3. 新闻组
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第三章 搜索引擎及生物学资源介绍
第四节 一些生物学习资源
48
1. 生物学软件站点
49
1. 生物学软件站点
50
1. 生物学软件站点
51
2. 一些生物学学习站点
52
2. 一些生物学学习站点
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2. 一些生物学学习站点
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2. 一些生物学学习站点
55
2. 一些生物学学习站点
56
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2. 主题目录
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2. 主题目录
28
2. 主题目录
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2. 主题目录
30
2. 主题目录
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2. 主题目录
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2. 主题目录
33
3. 导航站点
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3. 导航站点
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3. 导航站点
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3. 导航站点
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3. 导航站点
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3. 导航站点
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3. 导航站点
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3. 导航站点
6
第三章 搜索引擎及生物学资源介绍
第二节 WWW生物资源的查询
7
1. 搜索引擎
搜索引擎的原理
万维网（WWW） 网络自动索引软件（Robots、Spiders、Worm）
1. 信息的采集和存储：自动
2. 建立索引 3. 建立检索界面 4. 检索结果的处理
8
1. 搜索引擎
9
1. 搜索引擎
10
1. 搜索引擎
文摘：索引+文章摘要
三级文献：大百科全书、辞典等
4
网上生物信息资源分类 按信息类型分类
电子公告 电子出版物：电子书、期刊、报纸等 数据库 视听资料及计算机软件
按查询方式分类：
Email、新闻组、远程登录、FTP、WWW
按内容分类：Yahoo的分类目录
5
Yahoo的分类目录
专利：工程技术方面
学位论文：独创性和学术性 政府出版物 报纸及新闻稿 其他（产品说明书、技术标准等）
3
科技文献的级别 按内容性质分为： 一级文献：期刊论文、会议论文、研究报告、 专利、技术标准等 二级文献：检索工具书和网上检索引擎
索引：篇名+作者+期刊名称+卷次页码
计算机技术在生物学中的应用
第三章 搜索引擎及生物学资源介绍
内容提要
1
网上生物信息学信息资源
WWW生物资源的查询 非WWW生物资源检索 一些生物学习资源
2
3
4
2
传统文献资源
学术图书：系统全面 时效性不强 学术期刊：科技情报的主要组成部分 时效性强 科技报告：保密性 会议文献：最新研究成果
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
161. 搜索引擎来自171. 搜索引擎18
1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎
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1. 搜索引擎