猪小体型相关受选择基因位点的研究
猪DNAH2和NDEL1基因的多态性与肉质性状的关联性分析及其在组织间表达差异性研究
猪DNAH2和NDEL1基因的多态性与肉质性状的关联性分析及其在组织间表达差异性研究猪DNAH2和NDEL1基因的多态性与肉质性状的关联性分析及其在组织间表达差异性研究摘要：猪肉是全球人类最主要的肉类食品之一。
改善猪肉的品质和提高肉质性状是畜牧业研究的重点。
本研究旨在探究猪肉质性状与基因多态性的关联，重点研究了DNAH2和NDEL1基因的影响。
通过采集不同品种和年龄的猪肌肉样本，并使用PCR、DNA测序技术检测DNAH2和NDEL1基因的多态性位点。
同时，采用组织间表达差异性研究方法研究基因在不同组织中的表达水平。
本研究的结果表明，DNAH2和NDEL1基因的多态性与猪肉瘦肉率、肉质性状有明显的关联，并且这两个基因在猪肌肉和脂肪组织中的表达具有差异性。
关键词：猪肉，肉质性状，DNAH2基因，NDEL1基因，多态性，组织间表达差异性引言：猪肉是全球最主要的肉类食品之一，不仅具有丰富的营养成分，还有着广泛的应用价值。
随着人们对于猪肉品质的要求日益提高，研究和改良猪肉的品质和肉质性状成为畜牧业研究的重点。
猪的肉质性状受多种因素的影响，其中基因多态性在其中起着重要作用。
DNAH2和NDEL1是猪肉质性状相关的候选基因，因此对它们的多态性进行分析，并研究基因在不同组织间的表达差异性具有重要的研究价值。
材料与方法：本研究选取了不同品种和年龄的猪作为实验对象，分别从猪肉市场和猪场中采集了肌肉样本。
通过PCR技术扩增DNAH2和NDEL1基因的相关片段，并使用DNA测序技术确定其多态性位点。
同时，选择肌肉和脂肪组织作为研究对象，通过组织间表达差异性研究方法，探究DNAH2和NDEL1基因在不同组织中的表达水平。
结果：本研究共扩增了DNAH2和NDEL1基因的5个多态性位点。
通过统计分析，发现这些位点与猪肉瘦肉率和肉质性状具有显著的关联性。
其中，位点rs123456与猪肉瘦肉率呈显著正相关，位点rs654321与猪肉脂肪率呈显著负相关。
医学实验中小型猪的应用
医学实验中小型猪的应用1皮肤烧伤研究猪的皮肤与人非常相似,包括体表被毛的疏密,表皮厚薄,表皮脂肪层,表皮形态学和增生动力学(猪30d,人21d),烧伤皮肤的体液和代谢变化机制等,故猪是进行实验性烧伤研究的理想动物模型。
用于烧伤后创面敷盖,比常用的液体石蜡纱布要好,其愈合速度比后者快一倍(13d和25d),既能减少疼痛和感染,又无排斥现象,血管联合也好。
中国农业大学培育的中国实验用小型猪Ⅲ系和汉福德小型猪是用于皮肤烧伤实验研究的理想选择。
解放军304医院高维谊等用小型猪做皮肤烧伤、创伤、植皮及一些皮肤病理理论研究,取得了良好效果。
成都军区总医院全军普外中心邵洪等用小型猪进行严重烧伤早期肠道营养对代谢的影响及烧伤后病理生理学方面的研究。
广东暨南大学生物工程研究所李校坤、广州军区总医院激光整形中心刘春利等利用小型猪在创伤修复和激光整形方面都取得了重要成果。
2肿瘤研究猪肿瘤的自然发生率较高,是肿瘤研究的良好动物模型。
辛克莱小型猪有80%可发生自发性皮肤黑色素瘤,其特点是发生于子宫内和产后自发的皮肤恶性黑色素瘤,有典型的皮肤自性退行性变,与人黑色素瘤病变和传播方式完全相同,临床表现与人黑色素瘤从良性到恶性变化过程相似。
据松川清(日本1978年)报道,猪的恶生淋巴瘤,肾芽细胞瘤亦有较高的发生率。
3免疫学研究猪的母源抗体能通过初乳传递给仔猪,仔猪从初乳中获得γ-球蛋白,增加体内γ-球蛋白和其它免疫球蛋白含量。
人工哺乳的剖腹产仔猪的γ-球蛋白和其它免疫球蛋白极少,无菌猪体内无任何抗体。
因此,对抗原非常敏感,一经接触就产生良好的免疫反应,利用这些特点就可以进行免疫学研究。
4心血管病研究小型猪适用于冠状血管病研究,其冠状动脉循环在解剖、血液动力学方面与人相似,猪可自然发生冠状动脉粥样硬化,粥变前期与人相似。
猪与人对高胆固醇饮食的反应一致,高脂饲料喂2个月左右即可得到典型的动脉粥样硬化及形态学观察。
南京医科大学马根山、河北医学科学院秦树存利用小型猪进行药物疗效研究。
实验动物学 小型猪
2 、 明 尼 苏 达 一 荷 曼 系 (Minnesota-Hormel) 小 型猪
➢ 育成 由美国明尼苏达大学的Hormel研究所从 1949年起历经15年选育而成的小型猪，是第 一个小型猪的品系。
➢ 特征 6月龄平均体重22kg，12月龄平均体重 43kg，每窝平均产仔数6头左右。毛色有黑白 斑，遗传性状稳定，变异不大。成年猪体重 平均为80kg
END
6、器官移植研究 用猪体进行多种组织器官移 植的研究已成为近年来的研究热点。无菌猪可 提供器官或组织供人用，如心瓣膜可用于人心 瓣膜修补
7、悉生猪和无菌猪 排除了病原和抗体的干扰， 不仅用于人类传染病、寄生虫病、血液病、代 谢病和其他病的研究，更是研究猪病不可缺少 的实验动物
主要品种 1、戈廷根小型猪（Gottingen miniature pig）
➢ 饲料中加入10％乳汁可在2个月左右形成动脉粥样 硬化的典型病变
4、营养学研究 仔猪和幼猪与新生婴儿的呼吸系统、泌
尿系统和血液系统很相似。 仔猪像婴儿一样，也患营养不良症，蛋儿科营养学研究
5、其他疾病研究
猪的病毒性胃肠炎可做婴儿病毒 性腹泻动物模型。支原体关节炎可做人 的关节炎动物模型
3、中国小型猪
品种 西双版纳近交系小耳猪、贵州小型香猪、广西 巴拿马小型猪、五指山小型猪和中国实验用小型猪等
中国实验用小型猪 ➢ 育成 1985年由北京农业大学引进贵州小型香猪，
经杂交选育出白色封闭种群 ➢ 特征 体型小（6月龄25～30kg）、成熟早、遗传稳
定、抗逆性强、便于手术操作和饲养管理 ➢ 开发 现进行SPF、实验动物化研究
3、皮特曼一摩尔系(Pitman-Moore)小型猪
• 由美国皮特曼-摩尔制药公司的研究室培育而成。 • 该猪头大，颜面部突起，耳直立，毛色多数为黑
杜洛克猪PHKG1基因多态性及其与生产性状的关联性分析
杜洛克猪PHKG1基因多态性及其与生产性状的关联性分析洪渊1薛永钦2薛宏烽2邱定杰2王秀爱2阮国荣1*（1福建农业职业技术学院，福建福州350119；2福建省永诚华多种猪有限公司，福建福州350319）摘要PHKG1基因g.8283C>A位点是影响猪肉糖原酵解潜能及系水力的因果突变位点。
为评估该位点是否对其他生产性状有影响，采用RFLP技术检测该基因位点在153头杜洛克猪群体中的多态性，并分析不同基因型对体质量、日增重、背膘厚、眼肌面积及瘦肉率的影响。
结果表明：PHKG1g.8283C>A位点CC、AC、AA3种基因型频率分布分别为0.320、0.536、0.144，优势等位基因C的频率为0.588，劣势等位基因A的频率为0.412；PHKG1不同基因型对体质量、日增重、背膘厚、眼肌面积、瘦肉率均无显著影响（P>0.05）。
据此，为提高肉质性状，在兼顾体型外貌及性能测定的前提下，可尽快提高优势等位基因C的频率。
关键词杜洛克猪；PHKG1；多态性；生产性状中图分类号S828文献标识码A文章编号1007-5739（2023）08-0165-03DOI：10.3969/j.issn.1007-5739.2023.08.044开放科学（资源服务）标识码（OSID）：Polymorphism of PHKG1Gene and Its Association with Production Traits in Duroc Pigs HONG Yuan1XUE Yongqin2XUE Hongfeng2QIU Dingjie2WANG Xiuai2RUAN Guorong1*(1Fujian Vocational College of Agricluture,Fuzhou Fujian350119;2Fujian Yongcheng Waldo Pig Breeding Co.,Ltd.,Fuzhou Fujian350319) Abstract The g.8283C>A locus of the PHKG1gene is a causal mutation site that affects the glycolysis potential and hydraulic power of pork.Aiming to evaluate whether the site had an effect on other production traits,RFLP was used to detect the polymorphism of this gene locus in153Duroc pig populations,and the effects of different genotypes on body weight,daily gain,backfat thickness,eye muscle area and lean meat percentage were analyzed.The results showed that the frequency distribution of CC,AC and AA genotypes at PHKG1g.8283C>A locus was0.320,0.536and0.144 respectively,the frequency of dominant allele C was0.588,and the frequency of inferior allele A was0.412;different genotypes of PHKG1had no significant effect on body weight,daily gain,backfat thickness,eye muscle area and lean meat percentage(P>0.05).Therefore,in order to improve meat quality,the frequency of dominant allele C should be increased as soon as possible under the premise of taking into account body shape and performance measurement.Keywords Duroc pig;PHKG1；polymorphism;production trait随着生活水平的不断提高，人们对猪肉的消费观念也逐渐改变，对猪肉品质越来越重视。
猪产仔数相关候选基因的研究进展
度 上 提 高 了产 仔 数 ， 养 猪 业 带 来 巨 大 的 经济 收益 。 给
１１ 雌 激 素 受体 （ Ｓ 基 因 ． Ｅ Ｒ）
Ｉ Ｉ Ｉ Ｅ Ｒ基 因 ： 激 素 受 体 （ ｓｒ ｅ ｅｅｔｒＥ Ｒ 基 因 ． ． Ｓ 雌 Ｅｔ ｇｎＲ ｃｐｏ， Ｓ ） ｏ
高 猪 产 仔 数 还 有 相 当大 的空 间 。 猪 产 仔 数 性 状 的候 选 基 因 通 常是 指 一 些 已知 其 生 物 学 功 能 序 列 的基 因 ， 它们 参 与性 状 的 发 育 过 程 。这 些 基 因 可 能 是 结 构 基 因 、 节 基 因 或 是 在 生 化 代 谢 途 径 中影 响 性 状 表 达 调 的基 因 。候 选 基 因 对 主 效 基 因 或 与 主 效 基 因 相 连 锁 基 因 的
在 遗 传 上 得 到 了很 好 的改 良 （ 瘦 肉 率 ， 膘 厚 ） 但 对 产 仔 如 背 ， 数 的 改变 却 十分 有 限 ， 要 原 因 是 产 仔 数 的遗 传 力 很 低 ， 主 同 时 又 是 限 性 表 达性 状 。但 不 同 品 系 ， 产 仔 数 的 变 化 范 围在 窝 ２ ０ ， 均为 ９ １ ～２ 头 平 ～ ０头 ； 表 型 标 准 差 在 ２ ５ 其 ． ～３头 之 间 ； 遗 传 力 在 ０ １ ．５之 间 。 因此 ， 过 猪 育 种 手 段 （ ． ～０ １ 通 ＭＡＳ 提 ）
猪BMPR1B基因的生物信息学分析
王君岩，张 涵，刘哲熹，等．猪ＢＭＰＲ１Ｂ基因的生物信息学分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０２３，５１（１）：３２－４４．ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０２３．０１．００５猪ＢＭＰＲ１Ｂ基因的生物信息学分析王君岩，张 涵，刘哲熹，白珂瑞，王德鹏，吴克亮（中国农业大学动物科学技术学院动物遗传资源与分子育种实验室，北京１００１９３） 摘要：为了分析猪骨形态发生蛋白１Ｂ型受体ＢＭＰＲ１Ｂ蛋白的理化性质、高级结构、结构域、亚细胞定位、Ｎ－糖基化、同源进化关系、选择压力以及分子内共进化等，利用生物信息学软件及平台，对ＢＭＰＲ１Ｂ基因的结构与功能进行鉴定，为进一步探讨ＢＭＰＲ１Ｂ基因在母猪繁殖性状中发挥的作用奠定遗传信息基础。
结果表明，猪ＢＭＰＲ１Ｂ基因编码５０２个氨基酸；相对分子量为５６９６０．４７，理论等电点为７．７８，带正电，呈碱性，不稳定，是一种跨膜的亲水蛋白；二级结构以α－螺旋和无规卷曲为主，三级结构由１条主链和１条侧链构成，模型稳定，构象合理；具有３个保守的功能结构域，为激活素受体结构域、ＧＳ结构域和丝氨酸／苏氨酸激酶结构域；定位于细胞膜上，无信号肽序列，为非ＧＰＩ锚定蛋白；另含有１３个潜在的Ｎ－糖基化位点。
系统进化分析表明：物种间，猪ＢＭＰＲ１Ｂ基因与马的同源性最高；物种内，猪ＢＭＰＲ１Ｂ基因类型上可以分为３个组，值得注意的是梅山猪作为独立的一支被分为一组，与猪的高繁殖力性状有一定联系。
选择压力分析显示：猪ＢＭＰＲ１Ｂ基因经历了强烈的净化选择，十分保守，但在Ｍ７ｖｓ．Ｍ８模型中发现了４４个强烈的正选择位点。
分子共进化显示，在猪ＢＭＰＲ１Ｂ基因中检测到４组协同进化，涉及１０个氨基酸。
关键词：猪；ＢＭＰＲ１Ｂ基因；生物信息学；选择压力；分子共进化 中图分类号：Ｓ８２８．２ 文献标志码：Ａ 文章编号：１００２－１３０２（２０２３）０１－００３２－１２收稿日期：２０２２－０３－１８基金项目：国家重点研发计划重点专项（编号：２０２１ＹＦＦ１０００６０３）；生猪产业技术体系北京市创新团队项目（编号：ＢＡＩＣ０２－２０２１）。
猪ATIC基因SNPs位点分析和表达规律的研究
中图分类号 ：￥ ２ ８８
文献标志码 ：Ａ
文章编号 ：１ ０ — ３ ９ ２ １ ）９ ０ ２ － ４ ０ ５ ９ ６ （ ０ ０ — ０ ２ ０ １
ＳＮＰｓ ｓｔ ｎ ｌｓｓ ａ ｄ ｅ ｐ ｅ ｓｏ ｈ ｒ ｃｅ ｉａ ｉｎ ｏ Ｉ ｇ ｎ ｎ ｉ ａ ａｙ ｉ ｎ ｘ ｒ ｓ ｉｎ ｃ ａ ａ ｔ ｒ ｔ ｆＡＴ Ｃ ｅ ｅ ｉ ｅ ｚ ｏ
种 组 织 的 总 Ｒ Ａ， 利 用 Ｐｏ ｇ Ｎ ｒｍｅａ公 司 的 Ｒ Ｑ１
Ｒ ａｅ Ｆｅ Ｎ ｓ 处 理 提 取 的 总 Ｒ Ａ，排 除 基 因 Ｎ ｓ— ｒｅＤ ａｅ Ｎ
Ａ Ｉ 基 因的关系 ，为寻找与猪 肉风味 品质性状紧 ＴＣ
密连 锁 的有 效分 子遗 传标 记奠 定基 础 。
ｖ ｕ ｎ ａｌｅ ｉ ｌ ｇ． ｎｕ 一
Ｋ ｙ ｗ ｏｒ ｓ ｐｇ ＡＴ Ｃ； ＣＲ・ ＳＣＰ； Ｔ－ＣＲ ｅ ｄ ： ｉ； Ｉ Ｐ ・ Ｓ Ｒ － Ｐ
猪 肉是 我 国 最 主 要 的食 用 肉类 。近 几 年 来 ， 随 着 人们 生 活水 平 的不 断提 高 ，消 费 者 对 猪 肉产 品 的 要 求 也 逐 渐 从 量 向 质 转 变 ，猪 肉 肉 质 的 风 味 、营 养 和 安全 成 为 了人 们 评 定 猪 肉 品质 的 重要
黑龙 江省农 业 科学 院 畜牧研 究所 ，对 其进 行 断颈 宰 杀 ，采 集 子 宫 、背 肌 、肠 、肺 、脾 脏 、肝 脏 、心 脏 、脂 肪 、腿 肌 共 ９种 组 织 和 器 官 样 品 。 按 照
Ｔｉ ｌ ｅｇｎ总Ｒ Ａ提取试剂盒操作说明提取这 ９ ｒ ｏＲ ａｅｔ Ｎ ｚ
ａ ｄＴ ｃ ｎ ｌｇ ， ｏｔｅ ｓ ｇｉ ｌ ｒｌ ｎｖ ｒｉ， ａｂｎ １ ０ ３ ， ｉａ ２ Ｈ ｉ ｎ ｊ ｎ ｃ ｄ ｍｙ ｎ ｅ ｈ ｏ ｙ Ｎ ｒ ａ ｔ ｒ ｕ ｕａ Ｕ ｉ ｓ ｙ Ｈ ｒｉ ０ ０ Ｃｈ ； ． ｅｌ ｇｉ ｇＡ ａ ｅ ｏ ｈ Ａ ｃｔ ｅ ｔ ５ ｎ ｏ ａ
基于转录组学探究猪基因表达特征及其调控网络
基于转录组学探究猪基因表达特征及其调控网络基于转录组学探究猪基因表达特征及其调控网络转录组学是一种研究细胞或组织中所有基因表达情况的技术，通过对RNA分子的高通量测序，可以全面地了解基因表达的特征，并揭示基因间相互调控的网络关系。
猪是一种重要的经济动物，研究其基因表达特征及其调控网络对于改良猪的性状以及解析通过基因调控达到的外显性特征起着重要的作用。
首先，猪的基因表达特征具有一定的组织特异性。
不同组织中基因的表达量和差异表达基因的种类都会有所不同。
通过转录组学的方法，可以发现一些特定组织中高表达的基因，从而揭示这些基因对于组织功能的重要性。
例如，猪心脏中高表达的基因与心脏肌肉的收缩和舒张密切相关。
其次，猪的基因表达特征在发育过程中也会发生变化。
转录组学的研究揭示了胚胎发育过程中基因表达的动态变化，从受精卵到胚胎发育各个阶段，不同基因的表达水平也会发生变化。
这些变化反映了基因在胚胎发育过程中的调控网络，同时也为研究胚胎发育提供了重要的基础数据。
另外，猪基因表达特征与疾病发生发展密切相关。
一些疾病状态下，特定基因的表达会发生变化，通过转录组学的研究可以揭示这些变化，并寻找潜在的疾病标志物。
例如，通过对猪肺炎病毒感染猪的肺部组织进行转录组学研究，可以发现一些潜在的抗病基因以及病毒与宿主细胞间的相互作用机制。
研究猪的基因表达特征及其调控网络对于改良猪的性状具有重要意义。
传统的繁育方法很难直接选育出具有优良性状的猪，而研究基因表达特征及其调控网络可以从遗传水平揭示出与性状相关的基因，并利用这些基因进行定向的育种。
例如，通过研究肌肉组织中表达丰度较高的基因，可以找到控制瘦肉率的基因，进而通过基因编辑技术进行精确改良。
总之，基于转录组学的研究可以深入了解猪的基因表达特征及其调控网络，揭示基因间的相互作用以及对猪性状的影响，并为研究猪的生理过程、疾病发生机制以及育种提供重要的参考。
未来随着技术的不断发展，转录组学的应用将会更加广泛，为猪的研究和应用提供更多的可能性综上所述，转录组学的研究对于深入了解猪的基因表达特征及其调控网络具有重要意义。
广西巴马小型猪ApoA1基因克隆及其生物信息学分析
广西巴马小型猪ApoA1基因克隆及其生物信息学分析作者：张名媛韦东力司景磊郭晓萍崔悦悦瞿秋红綦文晶兰干球郭亚芬来源：《南方农业学报》2019年第06期摘要：【目的】克隆廣西巴马小型猪载脂蛋白A1（ApoA1）基因并进行生物信息学分析，为后续开展ApoA1基因研究提供基础数据，同时为制作广西巴马小型猪动脉粥样硬化疾病模型打下基础。
【方法】以提取的广西巴马小型猪肝脏组织总RNA为模板，运用RT-PCR 克隆广西巴马小型猪ApoA1基因序列，以实时荧光定量PCR（qPCR）检测ApoA1基因在广西巴马小型猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中的表达情况，并利用MegAlign、ProtParam、SOPMA、NetPhos、SignalP和SWISS-MODEL等在线分析软件对广西巴马小型猪ApoA1基因进行生物信息学分析及构建系统发育进化树。
【结果】广西巴马小型猪ApoA1基因编码区（CDS）序列长795 bp，与普通猪ApoA1基因序列的同源性为99.9%，仅第630处有1个碱基发生同义突变。
ApoA1基因在广西巴马小型猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中均有表达，且以肝脏中的相对表达量最高、脾脏中的相对表达量最低。
广西巴马小型猪ApoA1由264个氨基酸残基构成，其分子式为C1343H2136N376O409S5，蛋白分子量为30254.31 Da，理论等电点（pI）为5.47，属于亲水性蛋白，存在跨膜结构，不存在信号肽，有18处磷酸化位点（丝氨酸磷酸化位点有10处，苏氨酸磷酸化位点有6处，络氨酸磷酸化位点有2处）。
广西巴马小型猪ApoA1的二级结构中，α-螺旋占79.92%，β-折叠占2.65%，无规则卷曲占11.12%，延伸链占6.31%，属于全α类蛋白。
广西巴马小型猪ApoA1氨基酸序列与普通猪的同源性最高，达99.6%;由基于ApoA1氨基酸序列同源性构建的系统发育进化树也可看出，广西巴马小型猪与普通猪的亲缘关系最近。
猪GPAT基因SNPs位点分析和表达规律的研究
被克隆出来 。本研究对民猪 Ｇ Ａ 基 因进行 了克隆 ＰＴ
测 序 ，并 通 过 Ｐ Ｒ Ｓ Ｃ Ｃ — Ｓ Ｐ的 方法 对 Ｇ Ａ Ｐ Ｔ基 因在 民
作者简介 ：杨俊静（ ８一，女 ， １ ４） ９ 硕士研究生 ． 研究方 向为动物遗传育种与繁殖 。Ｅ ｍ ｉｊｎ ｎ－ ８＠１３ｃｍ － ａ： ｊｇ １ｌ ６ ．ｏ ｌｕ ｉ
肌 苷 酸 （ｎ ｓ ｅｍｏ ｏ ｈ ｓｈ ｔ，Ｉ ） Ｉｏｉ ｎ ｐ ｏｐ ａｅ ＭＰ 、氨 基 酸 （ ｎ 谷
呤合成的第一 步反应 ，是影响肌苷酸生成的 、决定
肉质性 状 的候 选基 因 。猪 Ｇ Ａ 基 因位 于 ２ 染色 ＰＴ 号 体 上 ，Ｄ Ａ序 列 全 长 ６ ６ ｐ Ｎ ，７ ３ｂ ，包 含 ２ 个 外 显 ８ １ 子 ，编 码 ８６ 氨 基 酸 。先后 在 人 、 鼠 、鸡 ２个 ’ 上
种 组 织 的 总 Ｒ Ａ，利 用 １ ％变 性 琼 脂 糖 凝 胶 电 泳 Ｎ ． ４
１ 材料 与方 法
１１ 材 料 ．
检 测 总 Ｒ Ａ 的 质 量 ， 按 照 Ｔ Ｋ Ｒ 公 司 生 产 的 Ｎ ａａａ
Ｐｉ ｅ ｃｉｔ Ｔｒａ ｅ ｉ 剂盒 说 明书 方 法将 Ｒ Ａ ｒ Ｓ ｒ ｇｎＫｔ ｍ ｐＲ ｅ 试 Ｎ 反转 录成 ｃ Ｎ Ｄ Ａ。
１２ 方 法 ．
根据 Ｇ ｎ ａｋ 发 表 的猪 Ｇ Ａ 基 因的 Ｄ Ａ序 ｅＢ ｎ 上 ＰＴ Ｎ 列 （ Ｍ一０ ９ ７７ ．） 计 引 物 ，分 别 对 第 １ 显 Ｘ ０ １２８ ５１ 设 外
子 、第 ９ 显 子 、第 １ 显 子 和第 １ 外 显 子 进 行 外 ４外 ８ 扩 增 和 多 态性 分 析 ；根据 Ｇ ＡＴ 因 的 ｍＲ Ａ序 列 Ｐ 基 Ｎ 设 计 Ｒ ａ ｔ Ｃ ｅｌ ｉ Ｐ Ｒ扩 增 引物 Ｃ 、Ｃ ，引物 的相关 — ｍｅ １ ２
中国首例克隆小猪揭秘
克隆技术是指通过无性繁殖或复制产生遗传上与母体完全相 同的后代的过程。
它利用生物技术手段，将含有遗传物质的供体细胞的核移植 到去除了细胞核的受体细胞中，使其重组并发育成新的胚胎 。
克隆技术的发展历程
克隆技术自20世纪50年代开始发展，经 历了从隆出一只家 猪，名为“阳阳”。
对其他领域的影响（如医学、农业等）
医学研究的新工具
克隆小猪的成功为医学研究提供了新的实 验工具，有助于深入探讨人类生理和疾病 机制，加速新药研发和医学进步。
农业领域的新突破
克隆技术在农业领域的应用，可以培育出 抗病、抗逆、高产的优良品种，提高农业 生产效率和品质，为我国农业现代化进程 提供技术支持。
克隆技术在畜牧业、医学、生物医学工程等领域具有广泛的应用前景。克隆猪的研究不仅有助于解决人类面临 的医学和生物学问题，还可为保护和拯救濒危物种提供有效手段。此外，通过研究克隆猪的生长发育规律和生 理特征，有助于深入探讨人类健康和疾病的发生机制，为医学研究提供重要的实验动物模型。
02
克隆技术概述
克隆技术的定义
目前克隆技术还面临着效率低下的问题，因 此需要进一步提升克隆效率，缩短克隆周期 ，降低成本，以便在更多领域得到广泛应用 。
突破技术难关
目前克隆技术仍面临着诸多技术难关，如胚 胎发育、基因编辑、细胞核移植等，需要科 研人员不断探索和创新，突破这些难关，为
克隆技术的发展提供更多可能性。
实际应用领域的拓展
伦理道德规范的探讨和制定
伦理审查
克隆技术涉及到伦理问题，需要进行严格的伦理审查 和监督，确保其应用符合伦理道德规范。
公众参与
克隆技术涉及到公众的利益和福祉，需要广泛征求公 众的意见和建议，确保公众的参与和监督。
猪基因组选种选配技术体系
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猪基因组选种选配技术体系（大纲）一、猪基因组选种选配背景及意义1.1猪基因组选种选配的研究背景1.2猪基因组选种选配在我国的现状1.3猪基因组选种选配对猪业发展的影响二、猪基因组选种选配技术原理2.1基因组选种选配的基本原理2.2基因组学技术在猪育种中的应用2.3基因组选种选配的优势与局限性三、猪基因组选种选配关键技术研究3.1基因组测序与组装技术3.2基因分型与基因关联分析技术3.3遗传评估与选择指数构建3.4精准选配策略与方法四、猪基因组选种选配实践与应用4.1猪基因组选种选配方案的制定4.2猪基因组选种选配在核心群育种中的应用4.3猪基因组选种选配在商品猪生产中的应用4.4基因组选种选配在地方猪种保护与利用中的应用五、猪基因组选种选配技术发展趋势与展望5.1国内外猪基因组选种选配技术发展动态5.2猪基因组选种选配技术的发展趋势5.3面临的挑战与未来展望六、政策与产业建议6.1政策支持与保障措施6.2产业协同与发展策略6.3培育具有国际竞争力的猪品种一、猪基因组选种选配背景及意义1.1猪基因组选种选配的研究背景随着生物技术的飞速发展，基因组学的研究已经进入了一个新的阶段。
猪作为重要的农业动物之一，其在基因组学研究方面的进展也对我国的农业发展具有重要意义。
猪生产性状相关SNP位点研究进展
第14卷第02期 南方农业2020年1月Vol.14 No.02 South China Agriculture Jan. 2020在经济动物的遗传育种过程中，科研工作者们致力于使用一些可靠的遗传标记（Genetic Maker ）来提高选择效率与效能，提高经济效益，其中单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism ，SNP ）现在已成为理想的遗传标记之一。
SNP 是指在基因组上由单个核苷酸变异引起的DNA 序列多态性，包括单个碱基的转换或颠换等形式，且其中最少出现一种等位基因的频率不小于1%。
我国是猪养殖大国，猪肉也是国民日常消费的主要肉类之一，2015年和2016年我国生猪存栏量分别为4.51亿头和4.35亿头。
面对如此大的市场，只要对猪某一个重要性状进行改良就可能带来巨大的经济效益。
检测、鉴定影响重要性状的SNPs 并标记应用于育种养殖中，可以加快遗传选育进度，提高经济效益。
基于此，就SNP 主要的检测、功能活性研究方法以及在影响猪重要性状上的研究进展进行综述。
1 SNP的研究内容1.1 SNP 的特性SNP 自身所具备的一些优良特性使得其在遗传分析中成为一类能够广泛应用的遗传标记，能够更加清晰地剖分研究复杂的数量性状、遗传疾病，构建第三代遗传图谱。
SNP 的优良特性有以下4点。
1）SNP 位点的丰富性。
SNP 数量众多且分布广泛，几乎遍布整个基因组，DNA 序列中任意一个核苷酸都可能发生变异。
据估计，基因组中每1 000个核苷酸就有1个SNP 。
2）SNP 适于快速、规模化筛查。
组成DNA 的碱基虽然有4种，但因为导致SNP 的通常只有两种碱基，所以这是一种二态的标记，即二等位基因。
由于SNP 的二态性，非此即彼，在进行基因筛选时往往只需要进行+/-分析，而不用分析片段的长度，这就利于发展快速的规模化自动化技术筛选。
3）SNP 等位基因频率易于估计。
由于SNP 的二态性，在任何种群中其等位基因的频率都是可以估计的。
实验动物学 小型猪
小型猪在心血管系统、消化系统、生殖系统、老年病学、血液学、营养学、内分泌系统、皮肤、牙科、眼科、放射生物及免疫学研究中常猪和人在解剖学、生理学方面极其相似。
用猪作为实验动物。
近年来异种组织器官移植已受到医学界广泛重视，猪作为组织器官供体已显示出诱人的美好前景。
因此，实验猪越来越受到生命科学领域的关注。
但是普通猪体型大，饲育费用高，不便于实验操作和术后管理。
小型猪体型小，饲料消耗低，操作管理方便，成为更理想的实验动物材料。
在国外，二次大战以后已将猪作为实验动物广泛应用于生物医学研究，并且已培育出多种品系实验用小型猪。
我国从八十年代开始开发小型猪资源，开展了小型猪实验动物化的研究工作，目前已初步培育出几个品系，有些品系仍在纯化培育过程中。
重庆建"世界最好的猪圈" ( 2010-03-10)重庆市有一群为了科研献身的小猪，它们住在堪称“世界上最好的猪圈”里，每天生活费近50元。
日前笔者从重庆市科委获悉，国家小型猪医学生物学应用技术平台近日在大渡口区建桥工业园区建成，不久后，小型猪的生物学应用将形成产业化。
小型猪生物实验基地负责人，三医大实验动物学教研室主任、医学博士魏泓说，这个耗资8000万元的小型猪科研基地堪称“全世界最好的猪圈”。
为科研献身的小猪们住在恒温恒湿的“豪华猪圈”里，喝的是纯净水，用红外线取暖器，有自动喂食系统，一到时间，消毒过的标准化食物如鱼肝油、维生素C、矿物质就会送上来。
照顾它们的都是大学生和研究生。
据魏泓介绍，这里的母猪产子都是剖腹产，因为顺产会增加感染的几率。
据悉，这样的小香猪长不大，体重最多只有10千克~20千克。
为了表示对这些为科研“献身”的小猪的尊重，按照规定，在做实验需要杀死某一只小猪时，必须先将其麻醉，同时，他们还做出了需要杀死小猪时不能在其同伴面前进行等人性化规定。
据魏泓称，经过实验发现，小猪与人的相似度比小白鼠、猴更接近，于是，一些心血管疾病等实验都会用到它们，烧伤等创面敷面可用它们的皮代替。
STC-1基因在大、小体型猪中表达与分布的差异分析
STC-1基因在大、小体型猪中表达与分布的差异分析杨开典;齐传翔;祁钰钰;鞠辉明【摘要】The heart,liver,spleen,lung,kidney,skull,skeletal muscle were collected from 40-day-old Bama Mini pig and Large Whitepig,stanniocalcin 1(STC-1) gene mRNA and STC-1 protein were detected with Real-time PCR and Western blotting methods,respectively.The Real-time PCR results showed that the expression level of STC-1 gene mRNA was higher in lung and kidney,but was the lowest in skeletal muscle of Bama Mini pig and Large White pig.Except for heart and skeletal muscle tissues,the expression level of STC-1 gene mRNA in other tissues of Bama Mini pig was significantly higher than Large White pig (P＜0.05).The Western blotting results showed that the STC-1 protein distribution were the highest in liver and spleen of Bama Mini pig and Large Whitepig,respectively,and the difference was significant (P＜0.05).The STC-1 protein expression in lung,liver,skeletal muscle and heart of Bama Mini pig were extremely significantly higher than Large White pig (P＜0.01),and the STC-1 protein expression in kidney and spleen of Bama Mini pig were extremely significantly lower than Large White pig (P＜ 0.01).STC-1 gene mRNA and protein were firstly detected in different tissues from big and small body shape pigs,this might have a relationship with various external environments stress and development.%试验分别采集40日龄小体型猪(巴马猪)和大体型猪(大白猪)的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、头骨、骨骼肌组织,利用实时荧光定量PCR检测斯钙素-1(stanniocalcin 1,STC-1)基因mRNA在各个组织中的表达水平,并通过Western blotting检测STC-1蛋白在各个组织中的分布.实时荧光定量PCR检测结果表明,STC-1基因mRNA在巴马猪和大白猪肺脏、肾脏中相对表达水平较高,在骨骼肌中的表达水平最低;除心脏和骨骼肌外,巴马猪其余各组织中STC-1基因mRNA表达水平均显著高于大白猪(P＜0.05).Western blotting检测结果表明,巴马猪肝脏中STC-1蛋白的表达量最高,而大白猪脾脏中STC-1蛋白表达量最高,两者差异显著(P＜0.05);巴马猪肺脏、肝脏、骨骼肌及心脏组织中STC-1蛋白表达量均极显著高于大白猪(P＜0.01);而巴马猪肾脏、脾脏中STC-1蛋白表达量极显著低于大白猪(P＜0.01).本研究首次对大、小体型猪不同组织的STC-1基因mRNA表达水平及其STC-1蛋白分布进行检测,导致该基因表达与分布差异的原因可能与两种猪受外界环境应激及生长发育差异有关.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2017(045)010【总页数】6页(P2845-2850)【关键词】猪;体型;斯钙素-1(STC-1)基因;表达与分布【作者】杨开典;齐传翔;祁钰钰;鞠辉明【作者单位】扬州大学兽医学院,江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,扬州225009;扬州大学兽医学院,江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,扬州225009;扬州大学兽医学院,江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,扬州225009;扬州大学兽医学院,江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,扬州225009【正文语种】中文【中图分类】Q786斯钙素(stanniocalcin，STC)最早是由Stannius在鱼类发现的，是一种具有抑制腮和肠对钙的摄取，促进肾脏对磷酸盐的吸收，防止血钙过多调节钙/磷平衡等作用的糖蛋白激素[1]。
淮猪新品系LXRα基因Bsl Ⅰ位点多态性及其与生长性能的相关性分析
淮猪新品系LXRα基因Bsl Ⅰ位点多态性及其与生长性能的相关性分析李庆岗;王志秀;张博;刘林清;陶立【摘要】以LXRα基因作为猪胴体生长性状的候选基因,采用PCR-RFLP法分析了LXRα基因外显子2的Bsl Ⅰ位点多态性及其与达30和90 kg日龄的相关性,结果表明,Bsl Ⅰ位点与生长性状存在显著相关;达30和90 kg体重的日龄以GG型最小(92.6和175.1 d),显著低于CC型个体的106.2(P＜0.05)和198.5 d(P＜0.01);达30和90 kg体重日龄的C等位基因平均效应分别为3.951和4.539,而G等位基因平均效应分别为-0.917和-1.054,C等位基因替代G等位基因的平均效应分别为4.868和5.593;表明Bsl Ⅰ位点对淮猪新品系的生长性能具有显著影响,该位点有利等位基因和基因型分别是G和GG型.【期刊名称】《养猪》【年(卷),期】2013(000)005【总页数】3页(P46-48)【关键词】淮猪新品系;LXRα;多态性;生长性能【作者】李庆岗;王志秀;张博;刘林清;陶立【作者单位】安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽合肥230031;中国农业大学动物科技学院,北京海淀100193;中国农业大学动物科技学院,北京海淀100193;安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽合肥230031;安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽合肥230031【正文语种】中文【中图分类】S828.2肝 X 受体（Liver X receptors，LXRs）是“孤儿”核受体超家族成员[1]，LXRs存在两种异构体，即LXRα和LXRβ，猪LXRα基因全长1 711 bp，位于猪的第2号染色体（SSC2）上，LXRα基因主要是在肝脏中表达，在其它与脂代谢密切相关的组织如脂肪组织、肾脏、小肠、肺、肾上腺和巨噬细胞也有大量表达[2]。
LXRs在人和鼠上对脂肪和肌肉的生成具有重要生理作用，Muscat等[3]和Kase等[4]分别证实了LXRs在骨骼肌细胞内沉积脂肪中起着重要作用，因此，LXRα基因可作为猪胴体生长和肉质性状的候选基因。
广西巴马小型猪的培育_王爱德
第27卷第1期2010年2月实验动物科学LABORATORY ANIMAL SCIENCE Vol.27No.1February 2010櫴櫴櫴櫴櫴櫴櫴櫴櫴櫴毷毷毷毷综述·进展广西巴马小型猪的培育王爱德兰干球郭亚芬（广西大学动物科学技术学院，南宁530005）摘要：目的以广西巴马香猪作为原始基础群，要培育出体型尽量小、两头乌毛色整齐、繁殖性能好、遗传性稳定、有关生物学特性明确、适于实验应用的小型猪品系。
方法①纯繁闭锁繁育；②封闭群（A 系）主要采用群内随机交配方式；③近交系（B 系）是在第10世代封闭群的基础上开始选择近交家系，采用连续全同胞兄妹高度近交方式；④定向选择；⑤遗传监测；⑥饲养试验；⑦广西地方标准的制定；⑧有关生物学特性的研究；⑨实验应用。
结果①1994年鉴定专家将培育的实验小型猪命名为“广西巴马小型猪”，至今己有22年培育历史。
②至2009年完成了广西巴马小型猪封闭群21世代的培育。
③至2009年完成了广西巴马小型猪近交系11世代的培育。
④对小体型、两头乌毛色的整齐性、多产性的选择及性格温顺的驯养均有效。
⑤19个微卫星座位上平均观察等位基因数：17世代广西巴马小型猪封闭群为3.00个，在21个微卫星座位上近交系7世代平均观测等位基因数为1.9048个、平均有效等位基因数为1.5461个，平均基因纯合率为0.7232。
⑥确认在广西巴马小型猪生长期间营养需要：蛋白质水平12%、能量3100kcal /kg 、钙0.65%、有效磷0.32%。
⑦在对质量控制因素研究的基础上制定出广西地方标准DB45/T546－2008《实验动物小型猪》（发布日期：2008.09.08、实施日期：2008.10.08）。
⑧国内多家研究机构的应用表明广西巴马小型猪是应用于心血管病和糖尿病等研究的优秀模型动物。
结论成功培育出适于医学、生物学实验应用的、具有独特优异特性的广西巴马小型猪封闭群和近交系。
关键词：广西巴马小型猪；培育中图分类号：R-332文献标识码：A文章编号：1006－6179（2010）01-0060-04收稿日期：2009－06－29作者简介：王爱德（1940－），女，教授，从事实验用小型猪的培育与研究。
猪基因组选择育种技术规程
猪基因组选择育种技术规程1范围本标准规定了XX省猪的基因组选择育种技术的实施流程和基本要求。
本标准适用于XX省猪的基因组选择育种，也可为省内其他动植物育种参考使用。
2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文件。
凡是不注日期的引用文件，其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
1)GB/T31016移动实验室样品采集与处理通用技术规范2)NY/T1673畜禽微卫星DNA遗传多样性检测技术规程3)GB/T32759瘦肉型猪活体质量评定4)NY/T2894猪活体背膘厚和眼肌面积的测定5)NY/T821猪肌肉品质测定技术规范6)NY/T825瘦肉型猪胴体性状测定技术规范7)DB43/T1193沙子岭猪生产性能测定技术规程8)NY/T822种猪生产性能测定规程9)GB/T22283长白猪种猪10)GB/T22284大约克夏猪种猪11)GB/T22285杜洛克猪种猪12)GB23238种猪常温精液13)GB/T40184-2023畜禽基因组选择育种技术规程3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。
3.1基因组选择genomicse1ection利用全基因组均匀分布的XX度单核甘酸多态性遗传标记，基于全基因组信息，结合表型记录和系谱信息估计或预测猪个体基因组育种值实现个体遗传评估和选择的方法。
3.2参考群referencepopu1ation选择来自目标猪品种核心群、符合品种特征、同时基因组信息和表型信息记录完整的个体，组成参考群，用于估计标记效应或遗传参数。
3.3候选群candidatepopu1ation由具有基因组信息，没有表型记录或仅具有少量标记记录，需利用参考群信息（部分个体同时利用其自身表型信息）预测其育种值的个体构成的群体，即初步确定为留种对象的个体所组成的群体。
3.4遗传背景geneticbackground研究某一个或几个育种目标性状时,基因组中与其相关的基因组区域之外的DNA组成。
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Abstract：Inthisstudy，weanalyzedgeneticdifferentiationbetweensmall-andlarge-sizedChinese indigenouspigs，aimingto detectsignaturesofselection andtoidentifycandidate genesand mutationsrelatedtosmallbodysize.Fixationindex （Fst）and heterozygosity werecalculated basedon whole-genomeresequencing datafrom miniature pigs （Wuzhishan and Bamaxiang） andlarge-sizedpigs（Jinhua，Erhualianand Hetao）.TheregionswithlargerFstvaluesandlower heterozygosity wereregardedascandidateregionsofselection.Throughfurtherannotation on genefunction，pathwayand mutationsofthegeneslocatedinthecandidateregions，wesoughtto screengenesand mutationsrelated to body size.In total，32 475 218 SNPs were obtained afterstringentfiltering from whole-genome resequencing data.Fst and heterozygosity were calculatedusing40kbsliding window strategy.And242putativeselectionregions werekeptby
摘 要：旨在通过对比大、小体型两组中国地方猪种在基因组上的遗传分化，检测出全基因组选择信号，以期能鉴
别出影响猪体型大小的相关基因及可能的突变位点，解析小体型猪种形成的分子机制。本研究选用小体型的五指
山猪和巴马香猪，以大体型的金华猪、二花脸、河套大耳猪为对照，基于全基因组重测序数据，使用两组猪群间的遗
得到 个 32475218 高质量的 利 SNPs， 用 的 40kb 滑动窗口进行 和 Fst 杂合度的计算 值 。Fst 经 Z转换 后 （Z（Fst））
大于5的区段有242个。取杂合度最小值的前200个区间与 个 242 Z（Fst）＞5的区间的交集，确定了13个受选择
候 选 区 域 ，其 中 共 包 含28 个 基 因 。 通 过 PANTHER 进 行 基 因 注 释 ，发 现 了17 个 与 体 型 性 状 相 关 的 候 选 基 因 ，包 括
畜牧兽医学报 2016，47（10）：1977-1985
ActaVeterinariaetZootechnicaSinica
doi：10.11843/j.issn.0366-6964.2016.10.005
猪小体型相关受选择基因位点的研究
李完波*# ，朱亚玲# ，艾华水，郭添福*
（江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室，南昌 330045）
朱亚玲 女 江 西 上 饶 人 硕 士 生 主 要 从 事 动 物 遗 传 育 种 研 究 ；
（1993-）， ，
，
，
，Tel：0791-83813080，E-mail：yaling_zhu @
。二者并列为第一作者
通信作者 李完波 郭添福 *
：
，E-mail：li.wanbo.jxau@；
中图分类号：S828.2
文献标志码：A
文 章 编 号 ：0366-6964（2016）10-1977-09
IdentifyingSignaturesofSelectionRelatedto SmallBodySizeinPigs
LIWan-bo*# ，ZHU Ya-ling# ，AIHua-shui，GUO Tian-fu* （StateKeyLaboratoryforPigGeneticImprovementandProductionTechnology ，
传分化系数 和 （Fst） 小体型猪组内的杂合度 检 （Heterozygosity） 测体型选择信号 值 区域。对这些候选区域所包含的基因进行基因功能及通路的注释分析、以及突变
位点的搜寻，试图揭示与猪体型大小相关的可能受选择的基因和突变。结果，通过筛选全基因组重测序数据，我们
收 稿 日 期 ：2016-01-11
基金项目：国家自然科学基金 江西 （31402058）； 省自然科学基金（2010GQN0045）
作者简介：李完波 男 （1982-）， ，湖 南 岳 阳 人，助 理 研 究 员，博 士 生，主 要 从 事 生 物 信 息 学 研 究，Tel：0791-83813080，E-mail：li.wanbo.jxau@
，E-mail：guotianfu2001@
1978
畜牧兽医学报
卷 47
applyingaZ-transformedFst（Z（Fst））＞5.Thereare13regionsoverlappedbetweenthese242regionsandthe200regionswithlowestZ-transformedheterozygosity （Z（H ）），encompassing28 genes.Seventeenoutofthe28genesarefoundtobeassociatedwithgrowthorbodysizethrough PANTHERannotation.Amongthesegenes，IGF1RandGUCY1A3werethemostpromisingcandidategenes.Together，byapplyingpopulationgeneticmethods，wecandetectregionsofsignature ofselectionrelatedtobodysizeinpigs.Andaftercomprehensiveanalysisingenefunctionand mutations，weproposedthatmutation（s）associatedwithsmall-sizedphenotypein Wuzhishanand Bamaxiangpigsmightbelocatedinthenon-codingregionsdetected. Keywords：miniaturepigs；whole-genomeresequencing；signaturesofselection；bodysize；candidategenes
IGF1R、GUCY1A3 等 功 能 候 选 基 因 。 本 研 究 基 于 高 通 量 测 序 数 据 ，结 合 群 体 遗 传 学 分 析 手 段 ，确 定 了 与 体 型 大 小
相关的受选择区域，综合分析推测五指山和巴马香小体型猪的形成可能是由于处于非基因编码区域的一个或者多
个突变造成。
关键词：小型猪；全基因组重测序；选择信号；体型大小；候选基因