耳聋基因检测

自愿选择， 知情同意
受检人群
检测医院
初筛 TEOAE/DPOAE
结果不通过

结果通过
复筛(TEOAE/DPOAE )+AABR/ABR 阈值)筛选听力异常
基因检测流程
采取最少3个采血斑
知情同意、自愿选择
5个工作日
临床检验中心 耳聋基因检测
检测医院确诊 出具确诊报告
随访 检测结果正常
出具检测报告
检测结果为杂合突 变或纯合突变
Mohr-Tranebjaerg 综 合 TIMM8A 征
特雷彻-柯林斯综合征 TCOF1 （ Treacher Collins syndrome）
Alport综合征（遗传性 COL4A3,COL4A4,C
肾炎）
OL4A5
Wolfram综合征1型
WFS1
单个耳聋基因全测序
检测基因
GJB2 GJB3 SLC26A4 测序采用sanger法，在以下情况可建议进行单
氨基糖甙类药 物性致聋，无
法逆反
GJB3
538C>T 547G>A
1p33-p35 缝隙连接蛋白 Connexin 31 常染色体显性遗 传。我国本土克 隆和鉴定的第一 个耳聋致病基因
适用人群
新生儿 婚前、孕前和产前人群 各种原因不明的耳聋，包括先天性聋
和后天性聋人群 听力正常，但有耳聋家族史的人群
筛查案例
一家9口人，6人是耳聋
佛山家系为3代遗传的耳聋家系，现有家系成员9人，其中6名为 耳聋患者，除由于婚姻关系成为该家系成员的2名耳聋患者外， 剩余的4名患者均为母系家庭成员。
家系基因
12SrRNA A1555G
GJB2 235delc
外婆 同质突变
外公 正常
祖父
祖母
杂合突变 杂合突变
姨妈 母亲重聋 父亲重聋
伴眼病
伴代谢性疾病
伴肌肉骨骼异常
综合征型 （66个基因）
伴泌尿生殖疾病 伴内分泌疾病
伴皮肤疾病
伴神经病变
伴心脏缺陷
线粒体遗传性
听力损失
-
基因数目
45 28 3 3 4 11 17 2 10 6 3 6 2 4
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遗传性耳聋基因检测技术
目标区域捕获测序
技术简介：采用新一代高通量测序技术，对受检者的耳聋相关基因区域进行检测和 分析。
占我国2780万听力残疾者的5-12%,意味着139-333万人可以通过用药警 示而避免致聋。
➢ 先天性重度耳聋(GJB2)： 占听力残疾者的20%,意味着556万人可以明确病因，早期发现，早期 干预，聋而不“哑”。
➢ 大前庭水管综合征(SLC26A4)： 占听力残疾者的16%,意味着445万人通过早期发现可以避免永久性听 力损失。
背景介绍——耳聋发病原因
新生儿听力损失中遗传 因素占据了65%的病因
在对四岁及四岁以内的听力损 失患儿病因进行分析时，遗传 因素所占比例为71%，高于出生 时
N Engl J Med, 2006. 354: p. 2151-2164.
背景介绍——流行病学的警示意义
确立了中国聋哑人群常见的3个易感基因及突变热点 ➢ 药物敏感性耳聋（mtDNA 1555A>G)：
纯音听阈 26～40dB 41～60dB 61～80dB 超过80dB
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耳聋分类
耳聋分为传导性耳聋、感音性耳聋、混合性耳聋
耳聋的致病因素
➢ 遗传因素； ➢ 母亲怀孕期间的药物使用史； ➢ 孕母宫内感染:如巨细胞病毒、疱疹、毒浆体原虫病； ➢ 母亲的生产史； ➢ 新生儿高胆红素血症； ➢ 颅面部畸形； ➢ 早产或体重低； ➢ 各种后天因素，如外伤
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我生育下一个孩子还会耳聋吗？
常染色体隐性遗传方式：有25%的几率 生育聋儿。
常染色体显性遗传：有50%的几率 生育聋儿。
线粒体母系遗传：母系成员 均会有聋病
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背景介绍——耳聋发病情况
• 听力障碍的发病率：新生儿1‰；青年人1%；45-64岁人
群14%；65-75岁为30%-60%；75岁以后达50%-70%存在不同 程度的听力损失。
患儿：SLC26A4基因1174A>T+2168A>G复合突变； 患儿父亲： SLC26A4基因1174A>T杂合突变； 患儿母亲： SLC26A4基因2168A>G杂合突变。
临床案例
患儿 父亲
SLC26A4基因 1174A>T杂合突变
患儿 母亲
SLC26A4基因 2168A>G杂合突变
IVS15+5G>A
1494C>T 1555A>G
13q11-12
7q31
mtDNA
缝隙连接蛋白
多次跨膜蛋白
Connexin 26
Pendrin
常染色体隐性遗传。 常染色体隐性遗传。
变异较大，可由轻度 先天性或后天性耳聋，
到极重度，但多数为 耳聋发生或加重与外
重度或极重度耳聋
伤、感冒有关
线粒体功能损 失
• 中国残疾人联合会公布： 1987年的第一次全国残疾人抽样调查各类残疾人总数
约为5164万，其中听力言语残疾为1770万人，占总残疾人总 数的34.28%，是各类残疾的首位。
2006年的第二次全国残疾人抽样调查，全国各类残疾 人总数为8296万人，听力残疾2004万人占残疾人总数24.16%， 位于第二位，仅次于肢体残疾。
服务流程
✓ 检测时间：35个工作日（7周） ✓ 检测样本：全血：5ml，EDTA抗凝 (紫盖)；
DNA：6ug，OD在1.7-2.0，未降解 ✓ 运输条件：冰袋+干冰运输 ✓ 检测结果：形成报告文件
血样接收
样本处理
样本检测
数据分析
报告发送
解读咨询
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适用条件
主要适用于以下情况： 1：通过热点突变检测未能发现致病原因 的耳聋患者 2：非综合征型耳聋，无法确定致病基因 及遗传方式的 3：综合征型耳聋患者 4：存在耳聋家族史的人群
患儿
SLC26A4基因 1174A>T+2168 A>G复合突变
AT AG AT AG
指导婚育案例
？
客户为待孕女士，与前夫生了一个耳聋孩子，组成新的家庭后担心是否 还会生一个耳聋的孩子，特来做孕前基因诊断
确诊结果 正常
随访
确诊结果为 突变
干预追踪
听力及基因联合筛查的临床实施模式
51个基因+2个位点
PCR、 第一代测序
目标区域捕获、 第二代高通量
测序
适用范围：
1）基因诊断：对于临床表 型难以确诊的病例给予分 子水平的鉴别诊断；
2）携带者筛查：对于无临 床表型的致病突变携带者 进行基因筛查；
检测周期：35工作日
个基因全测序 1）耳聋患者检测某个耳聋基因杂合子突变， 为明确病因做该基因的全测序 2）若胎儿母亲为某个耳聋基因的携带者，为 了评估胎儿患有耳聋的风险，对父亲做该耳聋 基因的全测序。
遗传因素的具体分析
先天性耳聋
（1/1000~3/1000）
遗传因素 （65%）
非遗传因素 （35%）
综合征型（SHL） （30%）
耳聋基因检测
主要内容
➢ 背景介绍 ➢ 耳聋基因检测的意义 ➢ 产品介绍 ➢ 案例分享
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什么是耳聋？
• 听觉障碍，不能听到外界声响的表现，轻者听而不真，重者 不闻外声。
• WHO 耳聋分级标准：
级别 轻度聋 中度聋 重度聋 全聋
表现 近距离听一般谈话无困难 近距离听话感到困难 在耳边大声呼喊方能听到 听不到耳边大声呼喊的声音
叔叔
同质突变 同质突变 纯和突变 纯和突变
女：1555A纯和 235delc杂合
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启示
非常值得警惕的是：这个 孩子通过了听力筛查，如 果没有做基因筛查，一旦 误用了氨基糖苷类药物将 一针致聋，导致严重后果
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临床案例
➢ 患儿杜某，女，11岁； ➢ 自述4岁左右，“感冒”后出现耳聋症状； ➢ 临床诊断：大前庭水管综合征； ➢ 否认孕期病毒感染及耳聋家族史； ➢ 检测结果：
综合征型耳聋
基因
Waardenburg （ 瓦 登 伯 EDN3,EDNRB,MITF,
格）综合征
PAX3,SNAI2,SOX10
遗 传 性 共 济 失 调 性 多 PEX1,PEX2,PEX26 发性神经炎样病 （Refsum综合征）
尤塞氏综合征
CDH23,CLRN1,GPR
（Usher syndrome） 98,USH2A
非综合征型 (NSHL)（70%）
常染色体隐性 （75~85%）
常染色体显性 （15~24%）
X-连锁 （1~2%）
GJB2/DFNB1 （50%）
其他DFNB （50%）
遗传性耳聋基因检测内容
疾病分类
疾病中类
常染色体隐性
非综合征型 （72个基因）
常染色体显性 X-连锁
大前庭水管综合征
听神经病
伴外耳畸形
检测流程
医院就诊
样本采集DNA提取制备发送报告亲属验证
数据分析
高通量测序
检测周期：35个工作日
检测基因/位点
疾病
基因
ACTG1,CCDC50,CDH23,CLD N14,COCH,DFNB31,DFNA5,D FNB59,DIAPH1,ESPN,ESRRB, EYA4,GJB2,GJB3,GJB6,GRHL 2,GRXCR1,HGF,KCNQ4,LHFP L5,LOXHD1,LRTOMT,MARVE 非综合征型耳聋 LD2,MIR96,MYH14,MYH9,MY O15A,MYO1A,MYO3A,MYO6, MYO7A,OTOA,OTOF,PCDH15 ,POU3F4,POU4F3,PRPS1,RD X,SIX1,SLC17A8,SLC26A4,SL C26A5,STRC,TECTA,TMC1,T MIE,TMPRSS3,TPRN,TRIOBP, USH1C,WFS1,m.1555A>G,m.1 494C>T
背景介绍——干预措施
助听器： 纯音测听，阈值在40～90dB（中度~重度耳聋）都应建议
配用。 人工耳蜗移植 ➢目前对于感音神经性重度耳聋的有效治疗方法-人工耳蜗植 入手术，20万元/只 ➢ 适应症： 1）先天性双耳重度-极重度感音性耳聋； 耳蜗移植的最佳时 间是：2岁以内（Audiol Neurootol. 2004 Jul-Aug;9(4):224-33）。 2）语后聋及成年患者有基本语言识别能力及辨音能力且佩戴 助听器无效者。
检测基因及位点
突变 基因
突变 位点
染色体 表达蛋白 临床表现
GJB2
SLC26A4 (PDS) 12S rRNA
35delG、 167delT、 176-191del16、 299_300delAT、
235delC
281C>T、 589G>A、 IVS7-2A>G、 1174A>T、 1226G>A、 1229C>T、 1975G>C、 2027T>A、 2162C>T、 2168A>G、
四个基因20个位点-飞行时间质谱 (MALDI-TOF-MS)技术原理
ddCTP
ddTTP
ddGTP
ddATP
G C
单碱基延伸技术 （iPLEX™）
Base Molecular Weight A 313.21 C 289.18 G 329.21 T 304.19
技术特点
➢ 检测位点多：可同时检测20个基因位点； ➢ 灵敏度高：能分辨质量差别为1 Da的分子； ➢ 准确率高：>99%； ➢ 通量大：每天可检测3000份以上； ➢ 自动化程度高：检测数据自动分析； ➢ 检测周期短：收到样本后5个工作日可出报告。
耳聋基因检测意义
• 节省财政支 出
• 提高出生缺 陷防治水平； 同时推进计 生、卫生服 务水平
• 分析耳聋基因在 当地的流行病学 分布
• 发现的药物敏感 性耳聋和迟发性 耳聋的个体提高 诊断效率，减少 漏诊率
• 指导婚育。实现优生优育 • 早发现、早干预，实现聋而不哑
产品汇总
遗传性听力损失基因检测-127 非综合征型耳聋基因检测-51 三个耳聋基因高通量测序 单个耳聋基因sanger全测序 4个基因20个位点
我国本土克隆和鉴定的第一个耳聋致病基因适用适用人群人群各种原因不明的耳聋包括先天性聋和后天性聋人群听力正常但有耳聋家族史的人群受检人群检测医院teoaedpoae结果不通过结果通过复筛teoaedpoaeaabrabr阈值筛选听力异常知情同意自愿选择采取最少3个采血斑自愿选择知情同意临床检验中心耳聋基因检测出具检测报告检测结果正常检测结果为杂合突变或纯合突变随访检测医院确诊出具确诊报告确诊结果为突变确诊结果正常干预追踪随访基因检测流程5个工作日听力及基因联合筛查的临床实施模式听力及基因联合筛查的临床实施模式5151个基因个基因22个位点个位点pcr第一代测序目标区域捕获第二代高通量测序适用范围