牙鲆抗淋巴囊肿病相关SSR标记的筛选与鉴定

牙鲆抗淋巴囊肿病相关SSR标记的筛选与鉴定
范彩霞;陈松林;王磊;刘洋;张英平
【期刊名称】《水产学报》
【年(卷),期】2014(038)004
【摘要】为了筛选出中国牙鲆群体的抗淋巴囊肿病相关SSR标记,实验采用分群分析法对102个牙鲆个体(感病56个,抗病46个)进行了抗淋巴囊肿病相关SSR标记的筛选.首先构建了抗、感基因池(抗病个体和感病个体各15个),并利用178对微
卫星引物对其进行了扫描;对于在抗、感池间扩增出差异条带的引物,用构建基因池
的30个个体对其进行了第一次单个体验证;对于在第一次单个体验证中差异显著的引物用102个个体进行了第二次验证.结果显示,有4对引物(scaffold440_22585、scaffold826_5003、scaffold703_4284和scaffold 185 _597)在抗、感基因池间扩增出了差异条带;经第一次单个体验证,表明scaffold826_5003(P=0.023)和scaffold 185_597(P178却=0.028,P173bp=0.009)的差异条带在抗、感个体中呈显著性差异;经第二次单个体验证,发现scaffold185 _597的差异条带在抗、感个体中出现的频率分别为60.9％和14.3％ (P =0.001),差异显著;对scaffold185_597
在10个抗病个体中扩增出的差异条带进行了克隆并测序,经BLAST比对,证实其为黄海水产研究所水产基因组与细胞工程研究室公布的牙鲆微卫星标记scaffold
185 _597中的一段,同源性达到96％.研究表明,微卫星标记scaffold185_597可能与牙鲆抗淋巴囊肿病相关.
【总页数】7页(P577-583)
【作者】范彩霞;陈松林;王磊;刘洋;张英平
【作者单位】中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东青岛266071;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东青岛266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东青岛266071;河南师范大学水产学院,河南新乡 453007;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东青岛266071;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东青岛266071;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306
【正文语种】中文
【中图分类】S941.41
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