2不对称RNA 干扰研究进展
RNA干扰与基因沉默
RNA干扰与基因沉默RNA干扰(RNA interference, RNAi)是一种通过特定RNA分子介导的基因沉默机制,被广泛应用于生物学研究、基因治疗等领域。
本文将深入探讨RNA干扰的原理、应用及未来发展方向。
一、RNA干扰的原理RNA干扰是一种高度保守且广泛存在于真核生物中的生物学过程。
它主要通过三种类型的RNA分子实现基因沉默:microRNA (miRNA)、small interfering RNA(siRNA)和Piwi-interacting RNA (piRNA)。
其中,siRNA是最为常见和被广泛应用的一种。
在RNA干扰中,siRNA与RNA诱导酶复合物结合形成RNA诱导沉默复合物(RISC),RISC会通过碱基互补的方式与靶向RNA结合,并介导靶向RNA的降解,从而达到沉默该基因的效果。
这一过程使得基因的转录和翻译被有效地抑制,实现基因的沉默。
二、RNA干扰的应用1. 基因功能研究:RNA干扰技术被广泛应用于基因功能的研究中。
通过设计特定的siRNA,可以实现对目标基因的沉默,从而观察基因沉默对生物体的生理和生化过程产生的影响,揭示基因在细胞和生物体中的作用机制。
2. 疾病治疗:RNA干扰技术在基因治疗领域具有巨大潜力。
通过设计特异性的siRNA,可以实现对致病基因的沉默,从而治疗遗传性疾病、肿瘤和病毒感染等多种疾病。
此外,RNA干扰还可以用于研发新型药物和治疗手段。
3. 植物保护:在植物领域,RNA干扰技术也被广泛应用于植物保护。
通过设计特定的siRNA,可以实现对害虫和病原菌基因的沉默,从而提高作物的抗病虫性,减少对农药的依赖,实现绿色农业的发展。
三、RNA干扰的未来发展方向随着RNA干扰技术的不断发展,未来有望在以下几个方面取得重要进展:1. 靶向性增强:未来的RNA干扰技术将更加注重提高siRNA的靶向性,减少对非靶向基因的影响,从而提高沉黙效率和生物安全性。
2. 交叉学科应用:RNA干扰技术将与生物信息学、纳米技术等学科相结合,开拓全新的应用领域,如基因组编辑、精准医学等。
植物RNA编辑研究进展
植物RNA编辑研究进展随着基因编辑技术的不断发展,人们的生物学研究工作越来越高效和准确。
在动物和真菌中,基因的编辑都是依靠着Cas9酶等等基因编辑工具完成的。
然而,植物的基因编辑则更复杂,因为植物细胞壁的存在,阻挡了大多数基因编辑工具到达植物细胞内部的难度。
但是最近一篇发表在Nature Plants上的文章则展示了一种新的植物基因编辑方法——RNA编辑,文章名为 "CRISPR/Cas9-mediated RNA editing in plants"。
RNA编辑指的是通过修改RNA分子的化学结构来改变蛋白质的编码序列。
这个过程能够发生在 mRNA 还处于代表基因的双链脱氧核糖核酸(DNA)模板时,也能够发生在成熟的mRNA上。
相比于基因组编辑,RNA编辑的主要优势有两个:首先,无需修复 DNA 双链,这意味着过程中会有更少的误操作,避免了主要编辑误操作事件的风险,另外RNA编辑跨越了多个不对称的启动子和转录因子结合区域,可以捕获那些基因组编辑无法检测到的变异。
这样一来,RNA编辑法操作的多样性就大于基因组编辑法。
以下讲述最新RNA编辑工具的发展和研究进展。
首先是RNA编辑的关键工具——RNA编辑酶的发现。
RNA编辑酶主要包括腺苷酸脱氨酶(ADAR)和辅因子A腺嘌呤核苷酸酰化样蛋白(ADATs)。
其中ADAR 参与了对腺苷酸 (A) 的脱氨酶作用,所以其中的 A 的mRNA的编辑过程又被称为 A 至嘌呤酸(G)编辑, 这是一种普遍存在于动物mRNA上的后修饰,但在植物中这种修饰发现的较晚,直到2011年。
而 ADATs 则参与了对鸟嘌呤 (D) 和肉桂酸 (O) 的腺嘌呤核苷酸酰化作用,也能实现RNA编辑。
然而,目前植物中最为常用的 RNA编辑酶是 ADAR2 ,通过对其进行修饰,使其能够在植物体内工作。
因为植物RNA序列中 A 至 G 的发生率很低,所以这个系统需要与 CRISPR/Cas9相结合,来针对植物RNA序列中的蛋白质编码位点进行编辑。
RNA干扰技术在基因沉默与功能解析中的应用
RNA干扰技术在基因沉默与功能解析中的应用引言RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术是一种重要的基因调控方法,该技术可通过介导RNA的降解或抑制翻译的方式靶向沉默特定基因。
自从1998年发现RNA干扰的现象以来,科学家们已经广泛应用此技术在不同生物体系中研究基因功能。
本文将讨论RNA干扰技术在基因沉默与功能解析中的应用。
一、RNA干扰的基本原理RNA干扰是一种高度保守的生物学机制,在多种生物中都存在。
其基本过程分为两个阶段:小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)的产生和干扰复合体的形成。
小干扰RNA(siRNA)是RNA干扰的关键组分。
siRNA通过外源或内源方法产生,随后与RNA诱导沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC)结合。
RISC复合体能够识别和结合与siRNA互补的特定RNA,导致降解或抑制这些RNA的翻译过程,从而实现靶向基因的沉默。
二、RNA干扰技术的方法RNA干扰技术有两种主要的方法:siRNA转染和慢病毒载体介导的siRNA表达。
1. siRNA转染siRNA转染方法是通过将合成的siRNA直接导入靶细胞来实现基因沉默。
这种方法简单、快速且可靠,并且可以应用于各种细胞和生物体系。
转染过程中,siRNA进入细胞胞质,并与RISC复合体结合,从而引发基因沉默。
然而,这种方法的持续性较短,需要定期重新转染。
2. 慢病毒载体介导的siRNA表达慢病毒载体介导的siRNA表达是通过将siRNA基因插入慢病毒基因组中,然后利用慢病毒进行基因转导。
这种方法可以实现持续的基因沉默,并且适用于细胞和整个生物体内的基因沉默。
然而,该方法需要特殊实验环境和技术,且过程较为复杂。
三、RNA干扰技术在功能解析中的应用RNA干扰技术已广泛应用于功能基因组学和分子生物学研究中。
通过将其与高通量筛选等技术相结合,科学家们能够更好地理解基因的功能及其在生物体内的作用。
RNA干扰非特异性研究进展
・综述与专论・生物技术通报B I O TECHNOLOGY BULL ET I N2009年第7期RNA 干扰非特异性研究进展韩继波 陈晨 陈始明 陶泽璋(武汉大学人民医院耳鼻咽喉2头颈外科,武汉430060) 摘 要: RNA 干扰(RNA i )靶向基因治疗是目前研究的热点,其依赖序列特异性的基因表达调节为生物学发展带来重大突破。
然而在应用RNA i 时所产生的一系列非特异性反应阻碍了RNA i 进一步的临床应用,这其中主要包括脱靶基因抑制和内在免疫副反应等。
主要从非特异性反应的产生机制、脱靶效应的预测和RNA i 非特异性的控制3个方面对近几年研究成果进行综述,探讨临床应用前景。
关键词: RNA 干扰 非特异性反应 脱靶效应 免疫副反应Advances of Non 2spec i fi c Effects on RNA iHan J ibo Chen Chen Chen Shi m ing Tao Zezhang(D epart m ent of O tolaryngology and Head 2N eck Surgery,Renm in Hospital of W uhan U niversity,W uhan 430060) Abs trac t: A t p resent,RNA interference is being the research f ocus for gene therapeutic app licati ons 1Des p ite the excite ment a 2bout this re markable bi ol ogical p r ocess for sequence s pecific gene regulati on,there are a nu mber of p r oble m s that need t o be overcome p ri or t o making RNA i as real therapeutic modality,which can include off 2target effects and activating innate i m mune res ponses 1This revie w discussed mechanistic as pects,p recauti on and contr ol of off 2target effects and gave a p r os pect f or clinical app licati on 1Key wo rd s: RNA i Non 2s pecific effects Off 2target effects I m munosti m ulati on收稿日期:2009204230基金项目:国家自然科学基金面上项目(30672313,30872851)作者简介:韩继波(19842),男,在读研究生,研究方向:头颈肿瘤;E 2mail:hjbjy7758521@1631com 通讯作者:陶泽璋(19542),男,教授,博士,Tel:02728804191126605,E 2mail:taozezhang@hot m ail 1com RNA 干扰以其序列特异性的优势被广泛应用于阻断或抑制基因表达,这也使得它成为强大的基因功能和基因治疗的研究工具。
rna干扰技术的原理及应用
RNA干扰技术的原理及应用1. 引言RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术是一种通过介导靶向特定基因的mRNA降解或抑制转录来实现基因沉默的技术。
其原理首次由Craig Mello和Andrew Fire于1998年提出,并因此获得了2006年诺贝尔生理学或医学奖。
RNA干扰技术已广泛应用于基因功能研究、疾病治疗和农业领域等。
2. RNA干扰技术的原理RNA干扰技术的原理基于转录后基因沉默的现象。
该技术通过使用双链小分子RNA(small interfering RNA,siRNA)或合成的微小干扰RNA(short hairpin RNA,shRNA)介导基因的沉默。
2.1 siRNA的介导siRNA是由20到25个核苷酸的dsRNA分子,其中一个链作为导向链,在靶向特异性基因上结合,并介导RNA酶复合物(RNA-induced silencing complex,RISC)的形成。
RISC使导向链与靶基因的mRNA亚区特异结合,导致mRNA降解或翻译抑制,最终达到沉默目标基因的效果。
2.2 shRNA的介导shRNA是由一个长的RNA分子,其中含有自身能够形成悬臂结构的序列和与目标基因对应的序列。
细胞内的RNA聚合酶可以识别和转录shRNA的模板,生成shRNA前体。
该前体在细胞中经过剪接和成熟,形成siRNA,进而介导目标基因的沉默。
3. RNA干扰技术的应用RNA干扰技术在许多领域中都有重要的应用,包括基因功能研究、疾病治疗和农业。
3.1 基因功能研究RNA干扰技术已被广泛应用于基因功能研究领域。
通过沉默特定基因,研究人员可以探索其在细胞过程和生物学中的作用。
该技术可以帮助研究人员确定基因的功能和相互作用,解析细胞信号传导途径,并识别可能与疾病相关的新靶点。
3.2 疾病治疗RNA干扰技术在疾病治疗领域表现出巨大的潜力。
通过选择性地沉默与病理过程相关的基因,可以为开发治疗癌症、遗传性疾病和病毒感染等疾病的新型治疗方法提供理论基础。
RNA干扰的研究进展
【摘要】rna干扰( rnai) 是指内源产生或人为转染进入细胞的小干扰双股rna在细胞内特异性地诱导同源互补的mrna 降解, 从而阻断相应基因表达的现象。
rnai在生物界中广泛存在, 其发生过程主要分为3个阶段:起始阶段、效应阶段和扩增阶段。
它在抵御病毒感染、维持基因组稳定、基因表达调控等方面发挥重要生物学作用。
随着人们对rnai研究的不断深入,rnai技术作为基因沉默的一个工具,已被广泛用于基因功能研究、疾病的靶点治疗等方面的研究。
【关键词】rnai;基因沉默;sirna;基因治疗【中图分类号】r394 【文献标识码】a 【文章编号】1008-6455(2012)02-0031-02rna干扰(rna interference, rnai)是近年来新发现的一种重要的基因表达调控方式,它是由内源产生或人为转染进入细胞的小干扰双股rna(small interfering double strand rna, sirna)诱导产生的一种转录后基因沉默(post2transcrip tional gene silencing, ptgs) 现象。
它是一种进化上保守的抵御转基因或外来病毒侵犯的防御机制,广泛存在于生物界,从低等原核生物,到植物、真菌、无脊椎动物,甚至近来在哺乳动物中也发现了此种现象,由于使用rnai技术可以特异性剔除或关闭特定基因的表达,所以被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的基因治疗等领域。
1 rnai的发现1990年,jorgensen等[1]将产生色素的基因导入矮牵牛中,试图加深花朵的颜色,结果很多花没有变成深紫色,反而成了花斑的甚至白的。
表明不仅导入的基因未表达,而且本身同源的基因失活。
从而发现在转基因植物中存在基因表达的共抑制现象,即转入的外源基因和本身的同源基因都被抑制,出现基因沉默现象。
后来发现在其它许多植物中也有类似的现象。
首次发现dsrna 能够导致基因沉默的线索来源于线虫的研究。
RNA干扰现象简介
RNA干扰现象简介RNA干扰(RNA interference,RNAi)是近年来生命科学领域最为重大的发现之一。
它是指小分子双链RNA可以特异性地降解或抑制同源mRNA表达,从而抑制或关闭特定基因表达的现象。
人们只要知道了某种疾病的致病基因,就可以设计出针对该基因mRNA的小分子干扰RNA(Small interfering RNA,siRNA),抑制或封闭该致病基因的表达,从而达到治疗疾病的目的。
显然,在理论上,通过siRNA 几乎可以治疗所有的疾病,包括肿瘤、传染病、遗传性疾病等等,因而RNAi受到学术界普遍的关注,是目前最为热门的生命科学研究领域,也是未来最有发展前途的新药开发领域。
除此之外,RNAi技术还可以广泛应用于农业、林业、畜牧业和渔业等多种领域,进行良种培育、良种筛选和疾病治疗等。
可见,RNAi的应用非常广泛,具有巨大的市场发展空间。
但是,由于RNAi现象刚被发现不久,仅仅才14年的时间,无论国外还是国内,目前都缺乏有效的siRNA载体,这大大制约了RNAi 的应用,包括实验研究和药物开发。
目前市场上主流的siRNA转染试剂是脂质体类的转染试剂,它能将siRNA转染入多种体外培养的细胞株,但原代细胞、悬浮细胞的转染效果不是很好。
由于它是脂质体类的转染试剂,因而对培养细胞有一定毒性。
而英格恩生物独辟蹊径,转染载体的材料不是用传统的脂质体,而是纳米聚合物材料。
这种材料对细胞几乎没有毒性,转染效率在多数细胞株都可达到90%以上,在很多原代细胞中,转染效果也比较好。
更为难得的是,该公司的体内RNA转染试剂Entranster-in vivo,和核酸混合后,便可注射进动物体内,完成动物体内RNA干扰实验,十分便捷,是动物体内RNA 干扰实验的新创举。
调控基因表达的RNA干扰技术
调控基因表达的RNA干扰技术RNA干扰技术是一种能够调控基因表达的方法,通过促进或抑制某些基因的表达,可以达到一系列的目的。
在这篇文章中,我们将探讨RNA干扰技术的原理、应用以及未来发展方向。
一、RNA干扰技术的原理RNA干扰技术是通过靶向基因转录产物(mRNA)来抑制或阻断其转录形成的特定蛋白质。
RNA干扰技术基于RNA的双链结构,使用小分子RNA或RNA类似物来靶向特定的mRNA,在细胞中调控该基因的表达。
RNA干扰技术由三部分组成:小分子RNA、蛋白质和RNA诱导的沉默复合物(RISC)。
在这个过程中,小分子RNA结合到RISC中,进而靶向特定mRNA的3'非翻译区域(也叫3'UTR) 。
绑定后,RISC可以通过水解的方式,将mRNA切断并阻止其翻译成蛋白质。
这个机制可以有效地调控特定的基因表达。
二、RNA干扰技术的应用RNA干扰技术作为一个新兴的基因调控技术,广泛应用于许多领域。
1、基因功能研究RNA干扰技术被广泛用于基因功能研究。
通过敲低或敲除某些基因,可以研究这些基因的作用,从而揭示新的细胞信号通路或生物学过程。
用RNA干扰技术进行基因敲除,可以避免扰乱复杂的基因调节网络,并且是一种经济高效的方法研究基因功能。
2、药物筛选RNA干扰技术能够高度选择性地抑制特定的基因,在药物筛选中也有广泛应用。
通过设计小分子RNA来抑制与某种疾病有关的基因表达,进而测试新药的功效。
这个过程也可以帮助我们发现新药物目标。
3、基因治疗RNA干扰技术在基因治疗中也有应用。
一个例子是使用RNA 干扰技术抑制患病基因的表达,治疗患有遗传疾病的患者。
通过敲低或敲除患病造成的基因表达,可能可以降低或缓解某些疾病的症状。
三、RNA干扰技术的未来发展RNA干扰技术作为一种新兴的基因调控技术,有着很多未来的发展方向。
1、靶向性RNA干扰技术的靶向性是非常重要的,因为小分子RNA对不同的基因具有不同的靶向性。
RNA干扰技术在菌类细胞生理学研究中的应用
RNA干扰技术在菌类细胞生理学研究中的应用RNA干扰技术是一种常用的基因沉默技术,可以通过引入特异性siRNA或shRNA等RNA片段来抑制目标基因的表达。
在生物研究中,RNA干扰技术被广泛应用于动植物、真菌、细菌等各种生物中,特别是在细胞生物学和分子生物学领域中。
本文主要探讨RNA干扰技术在菌类细胞生理学研究中的应用。
一、RNA干扰技术的基本原理RNA干扰技术是利用RNA诱导基因沉默的技术,其工作原理是通过引入特异性siRNA或shRNA等RNA片段来抑制目标基因的表达。
RNA干扰技术可以分为两种类型,即siRNA和shRNA。
siRNA是由21-23个核苷酸组成的双链RNA,通过介导RISC复合物(RNA诱导沉默复合物)的功能来沉默目标基因的表达。
在siRNA介导的RNA干扰中,双链RNA首先被核酸酶Dicer酶切成长约21-23个核苷酸的siRNA,然后siRNA与RISC复合物结合,导入到靶标RNA上,使其降解或翻译抑制。
siRNA的转染效率高,作用快,常用于临时性的基因沉默实验。
shRNA是基于RNAi机制的基因沉默技术之一,与siRNA相似,shRNA可以通过介导RISC复合物的功能来沉默目标基因的表达。
shRNA是由RNA聚合酶细胞内转录的单链RNA引物形成的RNA引物-靶标RNA复合物,其引物部分呈现结构上的环状,而靶标RNA部分则呈现双链结构。
这种单链RNA与Dicer酶切割后形成双链RNA,进一步引导RISC复合物沉默特定mRNA。
由于shRNA的效果可以持久,所以在基因治疗领域中也被广泛研究和应用。
二、RNA干扰技术在菌类细胞生理学研究中具有重要的应用,特别是对细菌的基因转录和翻译机制、代谢途径、耐药性机制等方面的研究有着重要的帮助和启示。
1.基因沉默研究RNA干扰技术可以通过抑制目标基因的表达来研究细菌的基因功能和生理生化过程。
以嗜酸乳杆菌为例,研究者通过RNA干扰技术成功地沉默了其保护细胞免受胆汁酸作用的ggaABC基因群,结果发现对ggaABC基因群的抑制可明显增加对胆汁酸的敏感性,提示了ggaABC基因群在胆汁酸抗性机制中的重要性。
rna干扰
rna干扰RNA干扰技术是一种利用RNA分子干扰靶标基因表达的方法,该技术的研究与应用已经广泛扩展到生物学、医学以及生物技术领域。
本文将介绍RNA干扰技术的原理、应用和未来发展前景。
RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)是由RNA介导的靶向基因沉默的一种机制。
它最早在植物中被发现,后来也被发现在动物细胞中广泛存在。
RNA干扰通过靶向性介导的方法,降低或抑制特定基因的表达,从而实现对基因功能的研究和调控。
RNA干扰的基本原理是双链RNA(dsRNA)通过酶切分解为20-25个碱基对长的小干扰RNA(small interfering RNA,简称siRNA)。
siRNA与RNA诱导静默复合体(RNA-induced silencing complex,简称RISC)结合,将其中一条链引导到靶标mRNA上,并通过与该mRNA互补配对,发挥沉默作用。
引导链与靶标mRNA形成稳定的双链结构,进而被RISC酶降解,从而阻断了该mRNA的翻译过程或引起其降解。
通过RNA干扰技术,可以特异性地沉默特定基因的表达。
RNA干扰技术的应用非常广泛。
首先,它被广泛应用于基因功能研究。
通过对单个基因进行沉默,可以直接观察到其对细胞及生物体的影响,从而揭示其在生物过程中的作用。
其次,RNA干扰技术也可以用于治疗疾病。
对于一些基因异常表达导致疾病的情况,通过RNA干扰技术恢复正常的基因表达,可以有望治疗相关疾病。
此外,RNA干扰技术还可以用于抗病毒研究、农业作物改良等领域。
在临床应用方面,RNA干扰技术已取得了一些重要的突破。
例如,目前已经有一些RNA干扰基因药物进入了临床试验阶段。
这些基因药物通过RNA干扰技术沉默与疾病相关的靶标基因,为患者治疗提供了新的选择。
此外,RNA干扰技术还可以用于个体化医学,根据患者基因的特点制定个体化的治疗方案,提高治疗的效果。
然而,RNA干扰技术仍然面临一些挑战和限制。
RNA干扰现象的发现
在哺乳动物细胞中用siRNA (21-23核苷酸长的小分子干扰RNA 片段(small interfering RNAs,siRNAs,又被称为引导RNAs)。能 高效阻断某个特定基因的表达,这项技术在疾病的基因治疗上也有 光明的应用前景。特别可以用于阻断某些突变基因的表达,或者由
蛋白过量表达引起的疾病。
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RNAi-一种新的遗传工具
RNAi是植物、果蝇、线虫和很可能包括哺乳动物在内的许多生物 抵抗病毒感染和限制转座子运动的一种自然存在的防御机制。
RNAi可以作为一种简单、有效的代替基因敲除的遗传工具,来制 备特定基因缺失表型的个体, 从而研究该基因的功能.它正在功能 基因组学领域掀起一场真正的革命,并将彻底改变这个领域的研究 步伐,为此被SCIENCE评为2002年最重要的科研成果之一。
Hamilton等,率先在发生PTGS的西红柿中检测出与被沉默 基因同源的约25nt的短片段RNA,而未发生PTGS的西红柿则不能 检出25nt的RNA HamiltonAJetal. Science,1999,286(5441):950— 952
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RNA干扰现象的发现
线虫中首次发现了RNAi : 首次发现dsRNA能够导致基因沉默的线索来源于秀丽新
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Quelling现象
并非只有植物学家才注意到了这种意外的现象。 意大利的Cogoni等,将外源类胡萝卜素基因导
入 链 孢 霉 (Neurosporacrassa), 结 果 转 化 细 胞
中内源性的类胡萝卜素基因也受到了抑制。而 在真菌转基因实验中这种共抑制现象被称为 “quelling”。
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RNA干扰技术的应用
RNA干扰技术的应用近年来,RNA干扰技术(RNAi)被广泛应用于生物学和医学研究中。
它是利用小的干扰RNA(siRNA)切断或抑制靶向基因的转录和翻译,从而影响基因表达和功能的一种基因沉默技术。
RNAi不仅重要的是基础研究工具,也具有广泛的应用前景,可用于研究基因功能、治疗疾病、植物育种等领域。
在这篇文章中,我将讨论RNA干扰技术的一些应用和未来发展。
1. 基因功能研究RNAi可应用于对物种基因组篡改进行研究,因为它易于特异地沉默基因。
研究人员可使用siRNA或shRNA来沉默基因表达,并探索其功能。
此外,siRNA靶向序列可根据特定的基因序列设计,为研究不同基因家族和生物过程提供了便捷的工具。
因此,RNAi在植物学、昆虫学、神经科学和生长发育等领域的基础研究中广泛应用。
2. 疾病治疗RNAi对治疗疾病的作用越来越多地展现出来。
RNAi技术可用于治疗许多遗传性和获得性疾病,如癌症、肺炎、病毒感染、高胆固醇、遗传性失明等。
该技术可以通过制造专门定制的siRNA 来对特定的靶向基因进行沉默。
在靶向治疗中,研究人员可将siRNA送入人体或动物体内,治疗疾病中编码靶向基因的细胞。
已有很多研究表明RNAi可用于抑制癌症的转移和侵袭,并已开发出临床应用前景广的RNAi疗法。
但是,RNAi仍然面临许多挑战,例如递送难以克服,RNAi非特异性靶向靶标,以及宿主免疫反应等等。
3. 植物育种RNAi技术也在植物育种中发挥了重要作用。
它可用于基因沉默,改变花卉、果实及蔬菜的颜色和外观。
在转基因植物育种领域中,RNAi尤为有用。
组织特异性且RNA干扰剂高度专一的性质也适用于农业生产,如促进作物抗性和产量增加。
最近的一项研究表明,靶向抑制油菜花内皮细胞EXPANSIN基因,可以在根部形成大量侧根,从而提高即将到来的作物产量以及对营养和水分的利用率。
4. 稍微未来的展望RNAi仍需要在许多方面进行改进。
在临床应用中,RNAi限制因素的最大是如何递送siRNA和shRNA。
RNA干扰技术对基因表达调控机制揭示原理
RNA干扰技术对基因表达调控机制揭示原理RNA干扰技术是一种重要的基因沉默技术,它通过特异性的RNA分子介导靶向切割靶基因的mRNA,从而抑制基因的转录和翻译,进而对基因表达进行调控。
RNA干扰技术的发现和应用极大地推动了基因功能研究和潜在疾病治疗的发展。
在本文中,我们将探讨RNA干扰技术的基本原理、主要研究方法及其在揭示基因表达调控机制方面的应用。
RNA干扰技术的基本原理是通过特定的RNA分子抑制靶基因的表达。
在RNA干扰中,主要有两种RNA分子参与:小干扰RNA(siRNA)和微小干扰RNA(miRNA)。
这两种RNA分子均具有双链结构,其中一条链具有与目标mRNA的特定序列互补的碱基。
当这些RNA分子进入细胞后,它们会与RNA诱导的沉默复合物(RISC)相结合。
RISC会解旋RNA双链,并选择其中的一条链作为信使RNA(mRNA)的模板进行靶向切割或抑制翻译。
为了实现RNA干扰技术,研究人员首先需要合成具有与目标基因互补序列的siRNA或miRNA。
在siRNA合成过程中,可以通过化学合成或转录方式将两个互补的单链RNA合成为双链RNA。
miRNA通常由细胞内的RNA聚合酶II转录产生。
而且,在miRNA的成熟过程中,由核酸酶Dicer催化生成合适长度的miRNA。
在RNA干扰技术的实验中,研究人员通常使用细胞系或动物模型进行研究。
最常用的方法是将设计好的siRNA或miRNA转染到靶细胞中,使其与目标mRNA 结合,从而达到基因沉默的目的。
此外,研究人员还可以通过合成包含siRNA或miRNA序列的质粒,并转染到细胞中以实现基因沉默。
除了细胞系外,还可以通过转基因动物模型来研究RNA干扰技术的应用和基因调控机制的揭示。
RNA干扰技术的应用十分广泛,特别是在基因表达调控机制的研究中。
通过使用RNA干扰技术,研究人员可以选择性地抑制一个或多个基因的表达,进而研究目标基因在生物学过程中的功能。
RNA干扰技术
4、每个细胞仅需要少量siRNA分子就可对大量mRNA发挥 作用,提示存在某些放大和/或催化活性的因素在起作用
例如: 依赖RNA的RNA聚合酶 (RdRP)的发现 线虫中的随机降解性PCR模型
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RdRP ----- 依赖RNA的RNA聚合酶
1、多种遗传学实验证实了RdRP在基因沉默中的重要作用, 其活性是基因沉默机制中不可缺少的组分。 (首先在线虫和果蝇中获证)
RNA 干 扰 技 术
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RNA 干扰(RNA interference, RNAi)
RNA干扰:一些小的双链RNA(siRNA)可以通过促使特定基因的mRNA 降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺 失的表型。
RNA 干扰的发展简史:
近几年来RNAi研究取得了突破性进展,被《Science 》杂志评为2001年的十大科学进展之一,并名列 2002年十大科学进展之首。由于使用RNAi技术可以 特异性剔除或关闭特定基因的表达,所以该技术已 被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤 的基因治疗领域。
96年前后,研究发现 注入反义RNA及正义链RNA都能 抑制线虫par-1 基因的表达;三年后,首次将双链RNA注入 到线虫中,结果表现出比单独注射正义链或者反义链都要强 得多的基因沉默效果,这种技术的成熟使得大规模筛选线 虫RNAi诱导的功能缺失突变体成为可能,并引发后继的大 量针对这种模式生物基因敲除的研究 。
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2006年的诺贝尔生理学奖获得者:
Andrew Z. Fire Craig C. Mello
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Glossary (术语)
RNAi----- RNA interference (RNA干扰) siRNAs-----Small interfering RNAs (小干扰性RNA)
RNA干扰技术的研究进展
◇讲座与综述◇RNA 干扰技术的研究进展秦玉新,蒙凌华,丁 健(中国科学院上海药物研究所,上海 201203)收稿日期:2006-11-07,修回日期:2007-01-20基金项目:国家自然科学基金资助项目(No 30271513)作者简介:秦玉新(1979-),男,博士生,Tel:0212508066022417,E 2mail:yxqin@jding .dhs .org;丁 健(1953-),男,研究员,博士生导师,研究方向:肿瘤药理学,Tel:02125080660021305,E 2mail:jding @mail .shcnc .ac .cn中国图书分类号:R 205;R 32912;R 34212;R 39413;R 39412文献标识码:A 文章编号:1001-1978(2007)04-0421-04摘要:RNA 干扰是一项新的分子生物学技术,是外源和内源性双链RNA 在生物体内诱导同源靶基因的mRNA 特异性降解,从而导致转录后基因沉默的现象。
尽管RNA 干扰发现的时间较短,但由于其具有操作简单、成本低、特异性高和高效性等特点,因而发展迅速,目前对于它的机制已有初步的了解,同时RNA 干扰在功能基因组学以及疾病的基因干预治疗方面也有一定的进展。
该文就RNA 干扰技术的历史、作用机制、生物学意义及应用作简要概述。
关键词:RNA i;si RNA;m i RNA;R I S C;D icer;基因沉默 RNA 干扰(RNA i )是近几年发展起来的新技术,是外源和内源性双链RNA 在生物体内诱导同源靶基因的mRNA 特异性降解,导致转录后基因沉默的现象,被《Science 》杂志评为2001年十大科技突破之一,名列2002年十大科学之首。
《Science 》杂志预测的2006年世界科研八大热点,RNA 干扰技术位列其中。
由于RNA 干扰可以阻断特定基因表达,因此在阐述基因功能以及蛋白质相互作用等方面,展示了诱人的前景,同时RNA 干扰在基因治疗中也有巨大潜力,一些公司正在研究应用该项技术治疗黄斑变性、乙肝和神经系统疾病,结果将初见分晓。
RNA干扰技术在生物领域中的应用
RNA干扰技术在生物领域中的应用近年来,随着科技的不断升级,越来越多的新技术被应用于生物学研究中,其中RNA干扰技术就是其中一种非常重要的技术。
那么,什么是RNA干扰技术呢?它又有哪些应用呢?本文将简单介绍一下RNA干扰技术及其在生物领域中的应用。
一、RNA干扰技术简介RNA干扰技术又称RNAi技术,是一种革命性的基因沉默技术。
它利用RNA分子的特定序列来识别和逐步降解特定基因的mRNA分子,从而抑制这些基因的表达。
RNA干扰技术最初是在简单生物体中发现的,但目前已经广泛应用于大多数生物体的基因功能研究。
二、RNA干扰技术的原理RNA干扰技术的实现需要借助siRNA和miRNA这两种RNA分子。
siRNA是双链RNA分子,可以通过RNA依赖性RNA酶(cleavage-specific ribonuclease)的作用切割自由的mRNA,从而防止mRNA被转录成蛋白质。
miRNA是较短的小分子RNA,与特定mRNA的3'非翻译区域结合,从而防止mRNA进一步被转录成蛋白质,从而实现基因表达的抑制。
三、RNA干扰技术的应用RNA干扰技术可以在不同层面上影响基因表达,因此可以用于许多生物学实验中。
以下是RNA干扰技术在生物领域中的几个应用:1.重点基因的沉默RNA干扰技术可以针对特定基因进行沉默,从而研究这些基因在生理过程中扮演的角色。
例如,破坏某些基因可使显眼的突变发生,这有助于揭示该基因在发育和其他生物过程中的作用。
2.病理物质的抑制RNA干扰技术可以用于识别并抑制某些病理物质。
根据预测,RNAi技术在基于RNA的疗法方面有非常重要的应用前景。
例如,RNA干扰技术可以在肝炎、病毒感染、癌症和糖尿病等疾病的治疗中发挥作用。
3.药物筛选RNA干扰技术可以用于筛选潜在的治疗物质。
比如,在研究基因和药物之间的相互作用时,可以先沉默某个基因,然后观察药物对该基因表达的影响。
4.转基因作物的研究RNA干扰技术也有可能用于转基因作物的研究。
RNA干扰技术的研究和应用
RNA干扰技术的研究和应用RNA干扰技术是一种利用RNA颗粒干扰基因表达的技术,近年来在基因学和生命科学领域得到了广泛的研究和应用。
本文将探讨RNA干扰技术的基础知识、其研究进展和应用前景。
一、RNA干扰技术的基础知识RNA干扰技术是利用RNA分子干扰基因表达的一种方法,可分为siRNA和miRNA两种类型。
siRNA(小干扰RNA)是由20~25个核苷酸组成的短RNA分子,与mRNA互补配对,从而导致靶基因的降解。
miRNA(微小RNA)是由22个核苷酸组成的短RNA分子,通过与mRNA部分匹配后,抑制靶基因的翻译过程。
这种RNA干扰过程被称为RNAi(RNA干扰)。
当siRNA或miRNA结合到靶基因mRNA时,RNAi复合物会切割靶基因mRNA分子,从而阻止蛋白质的合成,从而有效抑制基因表达。
此外,miRNA还能通过其他机制调节基因表达,如影响RNA稳定性和细胞内RNA转运等。
二、RNA干扰技术的研究进展RNA干扰技术自从1998年发现以来,受到了广泛的研究。
随着RNA干扰技术的发展,研究人员越来越能够研究和控制生物系统的表达和功能,开展了许多与调控基因表达相关的研究。
1. 基因治疗:RNAi技术可用于治疗各种疾病,如癌症和遗传疾病等。
例如,通过RNAi技术降低病毒蛋白的表达,可以延迟病毒的复制和扩散,从而达到治疗的效果。
2. 基因表达调控:RNAi技术可用于研究基因表达调控机制及新型基因治疗等。
研究团队可以通过设计不同的siRNA/miRNA靶向靶基因,来研究影响基因表达的因素和机制。
此外,RNAi技术还可用于设计新的靶向治疗模型,发现新的药物和治疗方法。
3. 基因组学研究:RNAi技术可应用于基因组学研究,例如针对遗传缺陷疾病,利用siRNA靶向特定基因进行修饰。
通过这种方法,研究人员可以探究靶向基因对生物发育、病理生理等方面的影响,为基因组学研究提供了较为便捷的工具。
三、RNA干扰技术的应用前景RNA干扰技术在许多领域都有着广泛的研究和应用前景。
关于RNA干涉沉默现象改进方法
关于RNA干涉沉默现象改进方法RNA干涉沉默(RNA interference, RNAi)作为一种广泛应用于基因功能研究和药物开发的技术,已经在科学研究领域取得了巨大的进展。
然而,尽管RNAi在基因敲除和基因表达调控等方面发挥着重要作用,但在实际应用中仍然存在一些问题。
本文将讨论如何改进RNA干涉沉默现象的方法,以期提高其效率和特异性。
首先,关于RNAi干涉沉默的改进方法之一是优化siRNA的设计。
siRNA作为介导RNAi的关键分子,其设计质量直接关系到RNAi效果的好坏。
当前,通过结合大规模的功能基因组学研究和算法模型开发,已经可以预测有效的siRNA序列。
例如,可以利用生物信息学工具对目标基因进行序列分析,并筛选出具有高效敲除目标基因表达的siRNA序列。
此外,通过引入化学修饰或不对称的siRNA设计,可以增强siRNA的稳定性和特异性,从而提高RNAi的效率和特异性。
其次,改进RNA干涉沉默现象的方法还包括引入新的siRNA传递技术。
目前,常用的siRNA传递技术包括转染和病毒载体介导的方法。
然而,这些方法存在一些局限性,如细胞毒性、特异性和效率等问题。
为了解决这些问题,一些新的siRNA传递技术已经被开发出来。
例如,利用纳米颗粒载体可以提高siRNA的转染效率和稳定性,从而增强RNAi的效果。
此外,还可以利用脂质体、聚合物或天然载体等新型传递技术,实现对特定细胞类型或组织的靶向传递,从而提高RNAi的特异性。
此外,改进RNA干涉沉默现象的方法还包括优化siRNA输送的靶细胞内部环境。
在RNAi过程中,siRNA需要进入细胞质,并与RNA诱导沉默复合体(RISC)结合,才能完成对靶基因的沉默。
因此,优化细胞内的siRNA输送和RISC复合体形成的环境是改善RNAi效果的关键。
一种方法是通过调节细胞外环境的pH值、温度或离子浓度等因素,来增加siRNA的细胞内摄取和释放效率。
另一种方法是通过引入siRNA融合蛋白或合成小分子,增强RISC复合体的形成和稳定性。
RNA干扰及其在植物中的研究进展
28卷05期Vol.28,No.05草 业 科 学PRA TACUL TU RAL SCIENCE823-83005/2011 RNA干扰及其在植物中的研究进展张森浩,严学兵,王成章,文开新,许来俊(河南农业大学牧医工程学院,河南郑州450002)摘要:RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种由双链RNA(double2stranded RNA,dsRNA)介导、能够特异沉默靶基因的转录后基因沉默现象,为植物基因功能的研究开辟了新途径。
本研究主要综述了RNA干扰现象的发现、RNA干扰的过程及其特点、RNA干扰在植物中的诱导方法及载体构建、近年来RNA干扰在植物基因功能和抗病性等方面的研究进展,以及对该技术的理论研究和应用展望,以期对RNA干扰技术在植物中的深入研究提供指导。
关键词:RNA干扰;双链RNA;靶基因;植物中图分类号:Q946 文献标识码:A 文章编号:100120629(2011)0520823208① 2006年10月2日,瑞典皇家卡罗琳医学院的诺贝尔大会宣布,本年度诺贝尔生物医学奖由美国马萨诸塞医学院的克雷格・梅洛(Craig C.Mello)教授和斯坦福大学医学院教授安德鲁・法尔(Andrew Z.Fire)分享,以表彰他们发现RNA干扰现象的贡献[1]。
RNA干扰是指外源或内源性的双链RNA 进入细胞后引起与其同源的RNA特异性降解,从而抑制相应基因表达,表现出特定基因缺失的现象,它与植物中的共抑制(co2suppression)或转录后基因沉默(po stt ranscriptional gene silencing,P T GS)、真菌中的基因阻抑(quelling)一样,均是生物体内普遍存在的一种生理机制[2]。
RNA干扰现象普遍存在于动植物中[3]。
在过去的20年,RNA干扰作为沉默基因表达的本能机制而出现,这种古老的抗病毒反应可以用来特定地抑制某种目的基因功能, RNA干扰正在成为一个非常有效的研究工具用于揭示许多基因的功能[4]。
2-不对称RNA 干扰研究进展
aiRNA 的前景
siRNA 和aiRNA 技术比较具有:1.特异性高,2.抑 制率高,3.渗透性好,4.稳定性好,5.安全性好,6.合成 或导入工艺成熟。 aiRNA 的诸多优点,有利于充分发掘RNA 干扰技 术的潜力,尤其是RNA 干扰疗法的应用。随着研 究的进一步深入,相信aiRNA 的优点更能体现和 发挥,在将来可能取代siRNA 而广泛应用于创新 药物研究和临床应用中。
参考文献
[1] Sun X, Rogoff HA, Li CJ. Asymmetric RNA duplexes mediate RNA interference in mammalian cells [J]. Nature Biotechnology, 2008, 26(12): 1379-82. [2] Elbashir SM, Harborth J, Lendeckel W, et al. Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells [J]. Nature, 2001, 411(24): 494–8. [3] Zamore PD, Tuschl T, Sharp PA, et al. RNAi: doublestranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals [J]. Cell, 2000, 101(1): 25-33. [4] Elbashir SM, Martinez J, Patkaniowska A, et al. Functional anatomy of siRNAs for mediating efficient RNAi in Drosophila melanogaster embryo lysate [J]. EMBO J, 2001, 20: 6877–88. [5] Kim DH, Behlke MA, Rose SD, et al. Synthetic dsRNA Dicer substrates enhance RNAi potency and efficacy [J]. Nat Biotechnol, 2005, 23(2): 222–6. [6] Siolas D, Lerner C, Burchard J, et al. Synthetic shRNAs as potent RNAi triggers [J]. Nat Biotechnol,2005, 23(2): 227–31
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aiRNA 的前景
❖ siRNA 和aiRNA 技术比较具有:1.特异性高,2.抑 制率高,3.渗透性好,4.稳定性好,5.安全性好,6.合成 或导入工艺成熟。
❖ aiRNA 的诸多优点,有利于充分发掘RNA 干扰技 术的潜力,尤其是RNA 干扰疗法的应用。随着研 究的进一步深入,相信aiRNA 的优点更能体现和 发挥,在将来可能取代siRNA 而广泛应用于创新药 物研究和临床应用中。
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❖ 1 siRNA 与aiRNA ❖ 2 小于19bp 的小双链RNA 引发基因沉默 ❖ 3 反义链较长的aiRNA 引起RNA 干扰活性 ❖ 4 aiRNA 的干扰作用机制和siRNA 相同 ❖ 5 aiRNA 可以降低正义链介导的脱靶效应 ❖ 6 aiRNA 的前景 ❖ 7 参考文献
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siRNA 与aiRNA
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aiRNA 的干扰作用ห้องสมุดไป่ตู้制和siRNA 相同
❖ aiRNA 和siRNA 引起的RNA 干扰机制是相同的,都 是通过与同源的mRNA 特异性结合,使mRNA 降解, 从而发生转录后基因沉默。
❖ 导入细胞内的siRNA或aiRNA与RNA 诱导沉默复合 体结合,解旋成单链,反义链与靶mRNA 结合,切 割靶基因的mRNA。
不对称RNA干扰研究进展
2011/11/16
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什么是RNA干扰?
❖ RNA干扰(RNAi)在实验室中是一种强大的实验工 具,通过这种方式,利用具有同源性的双链RNA (dsRNA)诱导序列特异的目标基因的沉默,迅速 阻断基因活性。目前哺乳动物细胞和临床研究中的 siRNA 是由长度19~21bp且两条链长度相等的对称 小干扰RNA 介导。
图1 siRNA 和aiRNA 的结构
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小于19bp 的小双链RNA 引发基因沉默
❖ siRNA 的长度一般在19bp 以上,且一般末端为平整结 构,以往认为,用小于19bp 的平整末端或对称结构的 siRNA去进行RNA 干扰,不能使靶基因沉默。但有研究 者用小于19bp的双链不对称的小双链RNA有RNA 干扰 活性,可以对目的基因的mRNA 产生干扰。因此, 19bp 并不是靶向所有基因所必需的,小于19bp 的小双 链RNA 亦可以引起RNA 干扰,使靶基因沉默。
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Abstract
❖ RNA 干扰是生物医学研究,特别是基因功能 研究中的重要工具。目前在哺乳细胞和临床 研究中的RNA 干扰技术主要由相同长度对称 的双链小干扰RNA(siRNA)介导。正义链 和反义链长度不一致的不对称双链小干扰 RNA(aiRNA)能更有效地使相应的靶基因 沉默,并且降低脱靶效应,提高体内外稳定 性,成为疾病治疗的新希望。
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aiRNA 可以降低正义链介导的脱靶效应
❖ 在RNA 干扰设计时,siRNA 解旋后的两条单链,反 义链与靶mRNA 结合引起基因沉默,而在细胞内,正 义链也有可能与序列特异性的mRNA 结合,从而引起 脱靶效应。而aiRNA 解旋成单链后,15nt 或小于15nt 的单链RNA 与mRNA 的结合能力降低,从而减少了 其脱靶效应。
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反义链较长的aiRNA 引起RNA 干扰活性
❖ 反义链比正义链长的aiRNA 可以使靶基因沉默,而正义 链比反义链长的aiRNA 不能表现RNA 干扰功能。目前, 产生这种现象的具体的机制尚不完全清楚,可能是因为 RNA 诱导沉默复合体(RNA -induced silencing complex,RISC)与siRNA 或aiRNA 的两条链的结合 是有选择性的,RISC 对链的选择性取决于链末端2nt 突出结构,末端2nt 碱基突出结构的链与RISC 的结合 更加容易。siRNA 链的末端热力学稳定性可以影响到 siRNA 的稳定性,对链的选择没有很大影响,反义链上 末端的突出结构使得其更容易与RISC 结合,进而通过 RNA 干扰途径抑制靶基因表达。
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参考文献
[1] Sun X, Rogoff HA, Li CJ. Asymmetric RNA duplexes mediate RNA interference in mammalian cells [J]. Nature Biotechnology, 2008, 26(12): 1379-82. [2] Elbashir SM, Harborth J, Lendeckel W, et al. Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells [J]. Nature, 2001, 411(24): 494–8. [3] Zamore PD, Tuschl T, Sharp PA, et al. RNAi: doublestranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals [J]. Cell, 2000, 101(1): 25-33. [4] Elbashir SM, Martinez J, Patkaniowska A, et al. Functional anatomy of siRNAs for mediating efficient RNAi in Drosophila melanogaster embryo lysate [J]. EMBO J, 2001, 20: 6877–88. [5] Kim DH, Behlke MA, Rose SD, et al. Synthetic dsRNA Dicer substrates enhance RNAi potency and efficacy [J]. Nat Biotechnol, 2005, 23(2): 222–6. [6] Siolas D, Lerner C, Burchard J, et al. Synthetic shRNAs as potent RNAi triggers [J]. Nat Biotechnol,2005, 23(2): 227–31
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什么是不对称RNA干扰?
❖ 2008年12 月Sun [1]等人提出正义链和反义链 长度不一致的不对称双链小干扰RNA (asymmetric interfering RNA, aiRNA)可以 更加有效地使哺乳细胞中相应的靶基因沉默, aiRNA 将可能取代siRNA 广泛用于创新药物 的研究。