分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用
微生物生态学研究中的分子生物学方法
微生物生态学研究中的分子生物学方法微生物是地球上最为丰富、多样且广泛分布的生物,有着重要的生态功能。
在微生物生态学研究中,许多问题需要考虑微生物的多样性、生态学分布及其作用和适应性。
传统的微生物学研究通常依赖于纯培养和形态学特征进行分类和鉴定,但存在着很大的缺陷,许多微生物无法进行纯培养,而且在分布及功能上存在巨大的多样性和复杂性。
因此,利用分子生物学方法,在微生物生态学研究中推进更为深入的探索和解决问题尤为重要。
分子生物学方法已经成为微生物学研究中的常规手段。
其中,分子生态学作为微生物生态学研究的一个重要分支,是利用微生物群落的DNA序列来描述微生物的多样性和结构、分布模式、演化规律以及生态功能。
分子生态学是利用分子生物学技术,以微生物群落DNA为物质基础,分析微生物群落的结构及其变化和生态功能的研究领域。
常见的分子生态学方法有PCR-DGGE、PCR-SSCP、PCR-RFLP 等。
PCR-DGGE技术是一种评价微生物群落构成的分子生物学方法,也是分子生态学研究中最常采用的一种方法。
此技术通过扩增轮廓分析电泳,能够在不进行序列测定的情况下,迅速知道样品中微生物群落的构成情况。
DGGE是一种革命性的电泳技术,可以使得同样长度、不同序列的DNA分子发生不同程度的变性而达到不同的电泳迁移率,因此,能够从PCR扩增产物中分离出不同种群、不同数量的DNA序列,可用于分析种群的构成和动态变化。
PCR-SSCP技术是用来研究微生物群落中小亚基的分子生物学方法。
它可以通过分析不同峰的数量及大小,评估群落的多样性和结构。
其原理是在一定条件下,所有长度相同的PCR产物的突变体将由于核酸热变性、缺陷组态和电泳带电性质等不同而形成不同的电泳迁移率,从而显示在聚丙烯酰胺凝胶上。
PCR-RFLP技术是将PCR扩增的外显子或内含子序列用限制酶切法切开后,根据限制酶切后DNA片段的数目、大小、分布等特征,依据电泳迁移率或其他方式进行分离鉴定。
微生物多样性的分子生态学研究
微生物多样性的分子生态学研究微生物多样性是指各种形态、类型、数量和功能各异的微生物在自然环境中存在的程度和组成,包括细菌、真菌、病毒等。
微生物是地球上存在时间最长,数量最多,功能最丰富的物种。
微生物多样性是自然生态系统的重要组成部分,对于维持自然生态平衡、促进农业、医药、环保等方面都具有重要的价值。
因此,微生物多样性的研究一直是生态学和环境科学中的重要研究方向。
分子生态学是生态学的一个分支学科,主要是利用分子生物学技术解决生态学问题的一种方法。
分子生态学的关键是将生物多样性和生态系统的结构、功能及其相互作用联系起来,通过研究DNA、RNA、蛋白质和代谢物等分子水平的细节,从而更加全面地了解生态系统的复杂性。
微生物多样性的研究需要从分子生态学的角度进行,利用现代分子生物学技术,对细菌、真菌、病毒等微生物进行分离、纯化、鉴定以及对其功能进行分析。
在微生物多样性的研究中,分子生态学扮演了重要的角色。
在过去,人们从微生物的外在形态、结构、生长特性等宏观特征入手,来进行微生物多样性的研究。
但是,由于微生物的数量巨大,形态、特征、环境适应能力高度多样,因此无法用传统的分类学方法来进行鉴定和分类。
而分子生态学的出现,则提供了新的思路和技术手段。
目前,分子生态学在微生物多样性研究中的应用主要有以下几个方面。
一、16S rRNA测序16S rRNA是所有细菌和古菌都具有的基因,与其它部位不同的是,16S rRNA序列具有相对保守和相对变异的两个区域。
利用PCR方法扩增16S rRNA序列,根据序列分析可以区分菌种、菌株、类系等信息。
16S rRNA测序是微生物分类学中一种现代的化学发展出来的技术,通过在不同生态系统中分离出的微生物,提取出它们的16S rRNA序列,利用生物信息学分析手段对其进行分类、鉴定和多样性研究。
通过16S rRNA测序,可以系统地研究微生物的多样性,探究微生物在不同环境中的分布和变化规律,探明微生物群落的组成和结构,揭示不同微生物之间的生态关系。
分子生物学技术在临床微生物检验中的应用
分子生物学技术在临床微生物检验中的应用一个人如果出现感染之后,医生都会为病人先做微生物学感染诊断。
以明确疾病感染物。
以往的检验方式通常都是比较单一的,一般都是采用类似于酶活性等相关特征来进行检验。
这种检验手段很难满足现代微生物检验的需要,同时也很难达到预期检验要求。
可以说存在着一些弊端。
采用分子生物学技术来检验便能突破传统检验中的一些难题。
今天就为大家做一番介绍。
一、质粒指纹图分析法质粒指纹分析技术是目前临床微生物检验中最常用的一种技术,这种技术最大的优点就是能通过技术分析来病菌纹图来进行分析,然后再结合不同的病菌图纹来找出相对应的感染源。
因而,这一种检验方法,才能够被越来越多的人们所熟悉。
在进行检验检疫的过程中,医学人士首先对病人做抽提纯化质粒DNA工作,然后在对纯化质粒DNA做检验,经琼脂糖凝胶电泳之后的DNA分析,根据分子量大小来作分析,以质粒指纹图来做判断,这也是一个重要的一个标志。
这也帮助医学人士更好来做分析。
如:医学人士可以利用紫外灯来进行光照检测,而在等下可看见菌群下呈现一条条,或者是多条质粒带构成突破。
这即是质粒指纹图形。
质粒指纹技术可用于检测多种不同的病菌,同时还能够用于分析类似于革兰阴性菌在不同的属的、种间之间的传播,目前也主要用到革兰阳性菌之中,如:金黄色葡萄球菌等。
主要还是因为凝固酶阴性葡萄球菌常含有数个不同的质例等。
质粒指纹图分析主要原理是根据质粒大小与数理相同的菌株,这其中还是有很多相似的图形,即质粒指纹图。
当细菌有多个质粒,特别就是在分子量还较小的时候,质粒指纹图就成为一个相对的稳定的标志。
二、染色体DNA指纹图分析染色体DNA指纹图分析是一种现代生物检验技术,这种技术最早被著名遗传学家Jefferys及其合作者所发明出来,当时,Jefferys与众多学者在前人的研究基础上,将离析的提取出来的人源小卫星DNA使用到检验当中,即采用基因探针检验,然后,与人体里面所提取出来的的核DNA的酶切片段作杂交处理,最终获取了几个位点上的等位基因组成的长度不相等的杂交带图纹,这一种图纹一般来说都是很少出现完全相同的图谱,因而也就能够帮助医学人士开展医学研究工作,因此在当时也被称之为"DNA指纹"。
分子生物学在微生物检验中的应用(精)
分子生物学在微生物检验中的应用南京军区福州总医院全军临床检验研究所兰小鹏21 世纪是以分子生物学为代表的生命科学的时代,近年来,随着现代生物技术的快速发展,人类基因组计划的完成,尤其是生物化学、免疫学、生物仪器及计算机理论与技术的进步,分子生物学技术在医学、遗传学、法医学、生物学等各个领域广泛应用, 新的诊断技术和方法不断涌现并被广泛应用于微生物检测,为传染病的流行病学调查、基因的多样性、微生物的生物学特性、微生物的致病性和药物的耐受性、微生物的生物降解能力等各个方面提供了重要的信息。
一.核酸杂交法最初应用于微生物检测的分子生物学技术是基因探针方法,它是用带有同位素标记或非同位素标记的DNA 或RNA 片段来检测样本中某一特定微生物核苷酸的方法。
核酸杂交有原位杂交、打点杂交、斑点杂交、Sorthern杂交、Northern杂交等,核酸分子探针又可根据它们的来源和性质分为DNA探针、cDNA探针、RNA探针及人工合成的寡聚核苷酸探针等。
其原理是通过标记根据病原体核酸片段制备的探针与病原体核酸片段杂交,观察是否产生特异的杂交信号。
核酸探针技术具有特异性好、敏感性高、诊断速度快、操作较为简便等特点。
目前,已建立了多种病原体的核酸杂交检测方法,尤其是近年来发展起来的荧光原位杂交技术(FISH) 更为常用。
二.质粒DNA图谱分型技术细菌质粒分析是较早被使用的对病原微生物流行病学进行调查的分子分型技术。
这种技术包括萃取质粒DNA ,通过琼脂糖凝胶电泳分离DNA。
由于不同菌株质粒DNA序列和大小不同,通过琼脂糖凝胶电泳分离得到的DNA质粒图谱也将不同,因此,与流行病相关的分离株能够被分类分型。
质粒图谱分析的再现性和分辨力可通过限制性内切酶消化质粒而提高。
虽然2个不相关质粒有相同的分子量, 但性内切酶位点的位置和频率是不同的。
但质粒是可移动的非染色体遗传物质,细菌能自发的失去或很容易的获得,结果流行病相关的菌株可以展示不同质粒指纹图谱。
分子生物学方法在微生物多样性
第三节 基因重组和杂交育种
微生物在生物圈的化学平衡中起着十分重 要的作用,但我们对于维持这种平衡的微生 物生态系统的构造和动力学参数知之甚少. 其中最大的原因就是:研究方法的局限性。第三节 基因重组和杂来自育种传统研究方法的局限性
1.
2.
3.
第三节 基因重组和杂交育种
PCR - SSCP 分析主要包括PCR 扩增和凝胶分离两 步骤,经典的PCR - SSCP 分析需要在PCR 反应体 系中加入放射性r - 32p - ATP 标记引物(labled primer PCR) 或加入α- 32p - dCTP 标记底物 (LN - PCR) 进行扩增,扩增产物经凝胶分离后,经 放射自显影显示SSCP. 这种方法费时、耗钱、操 作复杂、限制了该技术的广泛应用. 后来,人们将 此技术进一步改进,成功地将银染显色和溴化乙锭 染色法用于此技术分析,直接在聚丙烯酰胺凝胶上 显示SSCP ,以取代同位素标记引物或底物,实现 SSCP 的非放射性同位素检测,从而使该技术更加 简便,快速有效.
第三节 基因重组和杂交育种
原位杂交
对环境样品直接作原位杂交( in situ hybridization) ,是细胞学方法与分子杂 交技术相结合的产物:利用荧光标记的具 有特异性的核酸片段为探针,与中期细胞的 染色体或间期细胞核的DNA 杂交,在染色体 上或核中显示与探针同源的DNA片段的位置, 从而将这段DNA 序列定位在细胞中。此技 术可获得未知菌的微生物多样性的大量信 息,如微生物的形态特征和丰度以及在样品 上的空间分布和动态。
第三节 基因重组和杂交育种
第三节 基因重组和杂交育种
分子生物学技术在海洋微生物多样性研究中的应用
分 子 生 物 学 技 术 在 海 洋 微 生 物 多样 性 研 究 中的 应 用 士
AP L CAT oN oF M oL UL I E P I I EC AR B oT CHN QUE N R I S I E.
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应 富 营 养 条 件 的 菌 种 成 为 优 势 种 . 度 . 因 此 在 近 3年 来 被 广 泛 应 用 取 代 了 自然条 件 下 的优 势 种 I 认 。 识 到 以 上 问题 .人 们 试 图 采 用 其 他
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究 建 立 在 传 统 的 微 生 物 培 养 技 术 传 统 的 培 养 方 法 或 其 它 不 依 赖 培 镜 技 术 或 放 射 自 显 影 技 术 对 微 生 的 基 础 上 。然 而 由于 培 养 条 件 与 自 养 技 术 的 方 法 相 比 显 示 出 明 显 的 物 的 群 落 结 构 进 行 研 究 。与 后 面将 然 条 件 的差 异 ,实 际 上 培 养 所 得 到 优 越 性 .推 动 了微 生 物 多样 性 研 究
的 只 是 自 然 环 境 中 的 少 部 分 菌 种 的 快 速 发 展 。 1 9 9 7年 “u等 在
分子生物学技术在微生物检测中的应用
分子生物学技术在微生物检测中的应用随着科学技术的不断进步,人们对于微生物的研究也越来越深入。
微生物是指生物体中最小的生物单位,包括细菌、真菌、病毒、寄生虫等。
微生物在生命体系中扮演着至关重要的角色,对于人类的生产和生活都有着非常重要的影响。
同时,各种疾病的发生也与微生物的种类和数量密切相关。
为了探究微生物的特性以及准确地检测出微生物所带来的风险,分子生物学技术已经开始广泛应用于微生物检测中,而其应用也为微生物学的研究带来了巨大的推动。
一、分子生物学技术的基本原理分子生物学技术(Molecular Biology Techniques)是指对于生物分子结构和功能进行的研究和操作。
由于分子生物学技术能让科学家对生物分子进行精细的操作和分析,从而更好地研究和掌握生命体系。
而在微生物学领域中,分子生物学技术也成为一种非常有用的工具。
具体而言,分子生物学技术包括多种方法,其中最常见的就是PCR扩增(polymerase chain reaction)和基因测序(gene sequencing)。
PCR扩增是一种利用DNA聚合酶对DNA进行增量复制的方法,可以让微生物的DNA样本得以在体外大量扩增,从而在检测和分析时能够提高检出率。
而基因测序则是对于DNA分子进行精细扫描的方法,能够让科学家知晓微生物的基因组结构和功能等特征。
二、1. 污染环境中微生物的检测在环境控制和保护方面,对于微生物的检测至关重要。
例如,在我们的饮用水、食品和药物中,都需要完成对于微生物的检测,以保障其安全性。
而分子生物学技术则可以为这些领域提供非常有用的技术手段。
例如,PCR扩增技术可以为环境检测等领域提供非常高的敏感度和特异性。
如果检测样本中存在目标微生物的DNA,则利用PCR扩增可以扩大目标DNA的数量,从而更容易被检测到。
同时,由于PCR扩增技术中的反应链式反应过程可以被多次迭代,因此也能够实现迅速的检测效果。
2. 食品安全领域中微生物的检测除了环境领域之外,分子生物学技术还可以应用于食品和药品等领域中。
微生物多样性研究的进展
微生物多样性研究的进展微生物生活在地球上的每一个角落,是地球生态系统中最丰富和多样化的基础。
与此同时,它们还发挥着许多重要的作用,如保持土壤质量、控制疾病、促进植物生长等。
因此,微生物多样性的研究变得越来越受到科学家们的关注。
本文介绍微生物多样性的研究进展以及它们对人类的影响。
一、微生物多样性研究的历史微生物多样性研究已经有数十年的历史。
早在19世纪,科学家们就通过显微镜观察了微小的微生物,如细菌、真菌和原生动物等。
随着科学技术的不断发展,人们开始利用分子生物学技术来研究微生物的多样性。
这些技术包括PCR、DNA芯片和高通量测序等。
这些技术使得科学家们可以更准确地识别和分类微生物,并了解它们的生态和功能。
二、微生物多样性的重要性微生物多样性的重要性不可低估。
微生物是地球上最基本的生物单元,负责维持生态系统的平衡。
它们处于食物链的基础地位,与植物共生共存,参与土地、水体和大气环境中的生态作用。
此外,微生物还可以在农业和医学领域中发挥很重要的作用,如制造工业酶、抗生素、和治疗疾病等。
三、微生物多样性研究的进展近年来,微生物多样性研究取得了重要进展,它们主要体现在以下几个方面。
1.分子生物学技术的不断发展随着分子生物学技术的快速发展,研究人员可以更准确地识别和分类微生物,了解它们的生态和功能。
高通量测序技术的引入探索了大量尚未解析的微生物序列,进一步扩大了我们对微生物多样性的理解。
2.微生物生态学的研究微生物生态学研究主要关注微生物的生态学角色,发掘微生物在生态系统中的作用。
这一研究领域涵盖了多个专业领域,包括生态学、微生物学、气象学、物理学等。
它们的合作为我们提供了深入了解微生物多样性的机会。
3.全球微生物多样性计划(Microbial Global Biodiversity Initiative)全球微生物多样性计划是一个由国际微生物学联合会领导的系统性研究计划,旨在系统性地研究全球各地的微生物多样性,为生态学研究、工业开发和公共卫生等领域提供更多的知识。
分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用
生物多样性 第8卷,第3期,2000年8月CHIN ESE BIODIV ERSIT Y 8(3):337~342,August,2000分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用Ξ杨永华 姚 健(南京大学生物科学与技术系, 南京 210093)摘 要 微生物多样性是生物多样性的重要组成部分。
由于微生物和大生物(动、植物)相比,存在着多种显著差异,因此其多样性研究、保护及利用也有所不同,尤其是研究方法亟待完善、提高。
近年来,分子生物学方法广泛用于微生物多样性的研究并取得了一系列研究成果。
本文从四个方面加以介绍:1)微生物总DNA制备及其遗传多样性检测方法;2)16S rRNA基因序列研究;3)核酸杂交分析技术;4) DNA动力学的研究。
今后的发展趋势是加强这些方法间及其与传统方法的有机结合,并发展新的方法,促进微生物多样性研究的深入开展。
关键词 微生物多样性,DNA扩增,遗传多样性,16S rRNA基因序列,核酸杂交,DNA动力学Molecular techniques and their application to the study of microbial diversity/YANGYong2H u a,YAO Jian Abstract Microbial diversity is an important part of biodiversity.Microbial diversity research and its conser2 vation and utilization are quite different from those of macroorganisms including animals and plants.In particu2 lar,it is necessary to develop new techniques suitable for microbial diversity research.Recently,as the devel2 opment of modern molecular biology,several molecular techniques have been used to study microbial diversity, including1)total DNA extraction of microbe and its genetic diversity assay,2)16S rRNA gene sequence anal2 ysis,3)nucleic acid hybridization,and4)DNA kinetics.In order to promote extensive and intensive research on microbial diversity,it’s necessary to integrate these methods to enhance a combination of traditional and modern techniques,and to develop novel method.K ey w ords microbial diversity,DNA amplification,genetic diversity,16S rRNA gene sequence,nucleic acid hybridization,DNA kineticsAuthor’s address Department of Biological Sciences and Technology,Nanjing University,Nanjing 210093微生物包括了从原核到真核的不同类群的生物:细菌、放线菌、原生动物、真菌、部分藻类和病毒,是生物多样性的重要组成部分。
微生物的分子生物学及其应用研究
微生物的分子生物学及其应用研究微生物在自然界中具有广泛的分布和多样性,它们是生态系统中不可缺少的组成部分。
微生物分子生物学是研究微生物遗传信息、代谢途径和分子机制等方面的学科,对于理解微生物的结构和功能具有重要意义。
同时,微生物分子生物学的发展也为微生物的工业生产、医学治疗和环境监测等领域提供了新的思路和方法。
1.微生物分子生物学研究的进展自20世纪60年代以来,微生物分子生物学的研究逐渐得到发展。
首先是微生物遗传学的进展,我们逐渐认识到微生物基因的转移和表达机制,研究了大量的质粒和细菌基因组,包括多重抗药性、生物合成和降解等基因。
另外,在微生物代谢途径的研究方面,我们也有了更深入的了解。
主要是从分子水平来探究微生物代谢途径,未来将重点关注于扩展系统的代谢和使用微生物酶功能。
2.微生物分子生物学的应用领域微生物分子生物学的应用领域非常广泛,涉及农业、食品、医学、环保领域等多个领域。
(1)农业微生物在农业中发挥着巨大的作用,如农业生物技术在提高植物转基因技术,寻找农作物抗性,保护环境及促进农作物改良方面有广泛的应用。
农业微生物进一步促进了环保和食品生产。
未来,我们将探索更多的农业生物技术应用,以改善食品卫生和质量。
(2)医学应用微生物的分子生物学对医学具有重要的意义。
如治疗传染病,探究微生物感染机制,开发新的抗微生物药物等。
未来还需更深入的研究微生物与人体的相互作用,为疾病诊断和治疗提供更好的方法。
(3)环境监测微生物在环境监测中发挥着重要作用,如污染检测、生物防治等。
未来,我们将探索更多的水质和大气污染物的生物检测方法。
同时,微生物在植物、土地、水等领域的生态作用研究也将受到重视,以打击生态灾难并保护生态系统。
3.微生物分子生物学的未来未来微生物分子生物学研究还将继续向更加深入和细致的方向发展。
我们将更注重拓展数据的规模,增加微生物结构和功能的研究,并探索新的技术以突破技术瓶颈。
未来,微生物的分子生物学研究还将广泛应用于食品科学、化学等领域,并促进微生物在面向全球化的大环境下的绿色可持续发展。
分子生物学技术在微生物鉴定和分类中的应用
分子生物学技术在微生物鉴定和分类中的应用近年来,随着分子生物学技术的不断发展,微生物鉴定和分类的方法也在不断更新。
传统的微生物鉴定和分类技术主要依赖于形态和生化特性进行检测,这种方法需要耗费大量的时间和精力,并且存在误判的问题。
而分子生物学技术,具有技术先进、灵敏度高、特异性强和快速等特点,因此被广泛应用于微生物鉴定和分类。
1. PCR技术在微生物鉴定和分类中的应用PCR技术是一种基于DNA扩增的技术,具有敏感、快速、高效等特点。
在微生物鉴定和分类中,PCR技术被广泛应用于细菌、真菌和病毒等微生物的检测。
在细菌的鉴定和分类中,PCR技术可以利用细菌特异性DNA片段进行扩增,从而实现特异性检测。
例如,肺炎链球菌是引起肺炎和中耳炎的主要病原菌之一,传统的鉴定方法需要通过培养和生化特性进行检测,而PCR技术可以通过扩增肺炎链球菌的DNA片段进行特异性检测,不仅提高了检测的敏感性和特异性,还可以节省时间和精力。
在真菌的鉴定和分类中,PCR技术也被广泛应用。
例如,快速鉴定真菌的方法是基于ITS(内转录间隔区)序列扩增的PCR技术,通过对ITS序列进行PCR扩增和测序,可以快速鉴定真菌的物种和亚种,同时也可以对真菌的种类进行分类。
2. 序列分析技术在微生物鉴定和分类中的应用序列分析技术是一种基于DNA序列的分析方法,通过对DNA序列进行比对和分析,可以快速鉴定和分类不同种类的微生物。
在细菌的鉴定和分类中,序列分析技术主要基于16S rRNA基因的序列比对进行鉴定和分类。
16S rRNA基因是所有细菌都具有的基因,因此可以通过对16SrRNA基因的序列进行分析,快速鉴定和分类不同种类的细菌。
同时,由于16S rRNA基因在不同细菌中的序列差异较大,因此可以利用这些序列差异进行微生物的分类和鉴定。
在真菌的鉴定和分类中,序列分析技术主要基于ITS序列的比对。
与16S rRNA基因类似,ITS序列也是真菌中高度可变的DNA序列,因此可以通过对ITS 序列的比对和分析,快速鉴定和分类不同物种的真菌。
分子生物学方法在微生物生态学研究中的应用
20 0 7年 8月 第2 6卷 第 4期
重 庆 文理 学 院学 报 ( 自然 科学 版 ) Ju a o h nqn nvrt f r n cecs( aua i c dt n o r l f o gigU i syo t adS i e N trl e eE io ) n C ei As n c S n i
研 究的分 子方 法 , 为微 生态的研 究 开辟 了新 的途径 , 已经得到 广 泛的应 用. 并
[ 关键 词 ] 生物生 态 学; 微 分子 生物 学技 术 ; 核酸 杂 交 ;C P R—D G R L ;FS G E; F P IH [ 中图分类 号 ] 98 [ 献标识 码 ] [ Q3 文 A 文章编 号 ]63—8 1 (0 7 0 0 5 0 一 17 02 20 )4— 07— 4
在 D &分子 技术 出现之前 , N 人们 对微 生物 的认识 基序列 所决 定的. 因此 , 即使 是大小相 同 , 碱基排列 有 但 差异 的 D A片段 , N 在不 同浓 度梯度 的变性剂 ( 脲素 和 甲 酰胺 )凝胶 中电泳 , 根据部分解离 的条件不同 , 移动速 其 度不 同而得 到分 离. 过染 色后可 以在凝 胶上呈现 为分 通 散 的条带. 因此 , 该技术可 以分辨具有相 同或相近分子量
[ 摘
要] 由于传统分 离培养微 生物的局限, 分子生物学技术避开 了传统微 生物培养分析的环
节, 直接 从样 品 中抽 取 总 D A, N 然后 通过 P R扩 增及其 相 关技 术 、 酸杂 交技 术 、 N C 核 R A基 因序
列分析等 方 法对直接 提取 的 总 D A进 行 分析 , N 了解其 中微 生 物信 息. 些通 过 遗传 物 质进 行 这
分子生态学及其在微生物生态研究中的应用
mi c r o o r ga n i s m a n d a b f o l o g i c a l e n v i r o n me n t. T h e m o l e c u l a r e c o l o g y h a s ma d e t h e gr e a t b r e a k t h r o u g h
m i c r o o r g a n i s m a n d e n v i r o n me n t ,e t c ,h a s p r o m o t e d
mi c r o b i a I e c o l o g y t O e n t e r a n e w d e v e l o p i n g p e r i o d. T h e c o n c e p t i o n, ma i n t e c h n o l o g y m e t h o d a n d t h e a p p l i c a t i o n O n mi c r o b i a J e c o l o g y o f m o l e c u l a r e c o l o g y
关键 词
分 子 生 态 ;土 壤 微 生 物 ;微 生 物 生 态 ;
1 6 S r g NA; D GGE
Ab s t r a c t
T h e mo l e c u l a r e c o l o g y i s t h e i n t e r d i s c i p l i n a r y f i e l d b e t we e n mo l e c u l a r t e c h n i q u e s a n d e c o l o g y. 1 t
分子生物学方法在微生物遗传学中的应用
分子生物学方法在微生物遗传学中的应用微生物是地球上最早出现的生命形式之一,以其简单、多样的遗传学特征备受研究者关注。
在微生物遗传学的传统研究中,遗传元件的克隆、探究以及遗传改造主要依靠转座子、限制性内切酶和自然转化等常规手段。
然而,分子生物学方法的出现,为这一研究领域带来了新的发展机遇。
1. PCR在微生物遗传学中的应用聚合酶链反应(PCR)是一种极为敏感的 DNA扩增技术,可从体外扩增少量DNA。
在微生物遗传学研究中,PCR技术得到广泛应用。
以大肠杆菌为例,通过PCR扩增菌株的某些特殊基因,可实现本地化定位并鉴定与该基因有关的新的突变变异体或插入元件。
此外,PCR可利用不同的引物对微生物进行快速、准确的鉴别。
例如,以内源性16S rRNA基因为靶标,反向PCR检测革兰氏阴性或革兰氏阳性菌群的草案已被广泛报道。
2. 基于CRISPR-Cas系统的遗传改造普通的CRISPR-Cas系统可用于检测外来 DNA和转染物。
基于CRISPR-Cas系统的遗传编辑技术使科学家们可以将外源或内源 DNA序列精确地插入到一个特定的位点中,从而实现微生物遗传学上的新改造。
例如,利用Cas9核酸作为核酸坑,并指定特异性guide RNA,可使肠杆菌中的β-内酰胺酶基因轻松地发生点突变。
3. 基于高通量测序的菌株鉴定高通量测序技术是一种快速、高效测序方法,可用于对微生物的遗传信息进行全面、准确的阅读和解码。
在微生物遗传学的研究中,高通量测序可以作为一种强大的分子分析技术,准确地鉴别菌株并建立其基因组信息的蓝图。
同时,它还可以使用元数据分析法检测菌株与人类、环境等资源之间的相互作用。
4. 基因工具箱的应用近年来,一些基因工具箱逐渐进入微生物遗传学的研究中心,提供了许多实用的工具用于微生物的遗传研究。
例如,竞争-传递系统可用于揭示某些群体中基因的横向转移,DNA序列基因辨识器可帮助快速鉴定遗传元件中的真正基因。
总之,分子生物学方法在微生物遗传学中的应用不断发展,推动了这个领域的各种改进和新文件的出现。
微生物多样性的研究方法和应用
微生物多样性的研究方法和应用微生物是指眼不能见的微小生物,包括细菌、真菌、病毒和藻类等。
微生物广泛存在于地球上的各个角落,是地球上最重要的生物群落之一。
微生物的多样性研究对生态学、生物技术、医学等领域具有重要意义。
本文将介绍微生物多样性的研究方法和应用。
一、微生物多样性研究方法1、分子生物学方法分子生物学方法是对微生物多样性研究的主要方法之一。
该方法主要是通过分析微生物的DNA序列进行分类。
例如,通过对16S rRNA基因序列的测序可以研究并鉴定微生物群落中的细菌。
16S rRNA基因是细菌中所有菌种都具有的基因,其序列的差异可以用来辨识不同的菌属和种类,因此被广泛应用于微生物多样性研究中。
2、传统的形态学方法传统的形态学方法是对微生物多样性研究的常用方法之一。
这种方法通过研究微生物在形态上的差异进行分类。
例如,通过观察细菌在显微镜下的形态特点,可以分辨出不同的菌属和种类。
但是,这种方法的主要缺点是不能对细菌进行详细的鉴定和分类。
3、生化反应试验生化反应试验是对微生物分类和鉴定的重要方法之一。
生化反应试验的主要原理是当微生物接受某些化合物时,会发生特定的反应,如乳糖分解、葡萄糖分解等。
这些反应的差异可以用来辨识不同的微生物种类。
二、微生物多样性研究应用1、环境保护微生物在土壤、水体中具有重要的功能,如分解污染物和提高土壤肥力。
研究微生物多样性可以为环境保护提供重要的科学依据。
例如,通过分析水体中微生物的群落结构,可以推测出水体中的特定物质浓度和水质等级。
2、临床医学微生物是人类身体内的常见细菌,它们既能够维持生理平衡,也会引起人体多种疾病。
针对于微生物的研究在临床治疗和预防感染病方面具有很大的意义。
例如,通过研究肠道微生物群落的结构和功能,可以提供新的方法来治疗一些肠道相关疾病。
3、食品工业食品行业中的微生物研究主要是针对于食品中自然存在的微生物及与食品科学相关的新型微生物进行的。
这些研究可以提供新的方法,使食品更加安全。
微生物多样性评价方法与应用
微生物多样性评价方法与应用微生物是地球上最古老、最多样化和最重要的生物之一。
它们广泛存在于自然界的各个环境中,不仅维系着全球的生态平衡,还具有广泛的应用价值。
因此,微生物多样性评价方法与应用是一个备受关注的问题。
本文将探讨微生物多样性评价的方法和应用,并阐述在不同场景下如何选择合适的评价方法。
一、微生物多样性评价的方法微生物多样性评价方法可以分为三类:统计学方法、分子生物学方法和生态学方法。
其中,统计学方法主要用于评价微生物群体的多样性和结构,包括Alpha多样性、Beta多样性和Gamma多样性等指标,以及相关的生态位模型;分子生物学方法则可用于研究微生物的系统进化、物种鉴定和遗传多样性;生态学方法则重点研究微生物的功能和生态学特性。
1. 统计学方法Alpha多样性指微生物群体中个体之间的多样性,反映了一个生态系统中的微生物物种数目和相对丰度等指标;Beta多样性反映了不同样地或生态系统微生物群体之间的相似性或差异性,可以用于研究物种组成、生境分布格局等问题;Gamma多样性反映了整个区域内微生物群体的物种多样性,往往被用来研究不同生境下物种丰富度的大小和相似性。
多样性指数常常与丰度-多样性曲线和稀疏-多样性曲线一起使用,帮助定量评价不同生态系统的微生物群落多样性。
2. 分子生物学方法分子生物学方法主要的应用是微生物的系统发育和物种鉴定。
其中最常用的方法是基因序列分析,包括16S rDNA和ITS序列分析等手段。
这些分子生物学方法除了可以对微生物进行系统发育分析,还可以对物种进行指纹图谱分析,进一步研究微生物的遗传多样性。
3. 生态学方法生态学方法是评价微生物多样性和功能的重要手段,包括种间相互作用、功能分析和群落结构等。
生态学方法侧重于研究微生物的生态功能和其对环境的拓扑作用。
在研究微生物功能时,需要采取各种高通量测序技术,如基因组学、转录组学和代谢组学,以鉴定和定量微生物的功能及其生态功能。
琼脂糖凝胶电泳技术在微生物多样性研究中的应用前景展望
琼脂糖凝胶电泳技术在微生物多样性研究中的应用前景展望随着科技的不断发展,微生物多样性研究已成为生命科学领域的热门课题之一。
而琼脂糖凝胶电泳技术作为一种传统的分子生物学实验方法,其在微生物多样性研究中的应用也逐渐显现出巨大的潜力。
本文将就琼脂糖凝胶电泳技术在微生物多样性研究中的应用前景做出展望。
1. 琼脂糖凝胶电泳技术简介琼脂糖凝胶电泳技术是一种通过电场作用将DNA、RNA或蛋白质等生物大分子在琼脂糖凝胶上进行分离和分析的方法。
其基本原理是根据生物大分子的电荷、大小和形状差异,通过应用电场使其在琼脂糖凝胶中进行迁移,从而实现分离和鉴定。
2. 微生物多样性研究的重要性微生物是地球上最基本、最古老的生命形式之一,对地球生态系统的平衡和稳定起着至关重要的作用。
微生物多样性研究可以帮助我们了解微生物的分类、进化和功能,揭示微生物在生态系统中的作用机制,对于环境保护、农业生产、医药发展等领域具有重要的指导意义。
3. 琼脂糖凝胶电泳技术在微生物多样性研究中的应用3.1. 核酸分析琼脂糖凝胶电泳技术在微生物多样性研究中最常见的应用就是核酸(DNA或RNA)分析。
通过将微生物样品中的核酸提取出来,并利用琼脂糖凝胶电泳技术进行分离和鉴定,可以获得微生物的基因型信息,进而了解其遗传变异情况、进化关系、种群结构等。
此外,琼脂糖凝胶电泳技术还可以帮助参与微生物多样性研究的科学家们分析微生物群落的结构和变化,从而深入探究微生物在生态系统中的角色和功能。
3.2. 蛋白质分析除了核酸分析,琼脂糖凝胶电泳技术还可以用于微生物蛋白质的分析。
蛋白质是微生物生命活动的重要组成部分,分析微生物蛋白质组成有助于了解微生物的代谢途径、信号传递和调控机制等方面的信息。
利用琼脂糖凝胶电泳技术,可以将微生物中的蛋白质进行分离和可视化,从而比较不同微生物样品中蛋白质的差异性和数量变化,为微生物多样性研究提供更多的信息。
4. 琼脂糖凝胶电泳技术在微生物多样性研究中的优势4.1. 简单易行琼脂糖凝胶电泳技术相对于一些先进的分析方法,如PCR-DGGE、高通量测序等,操作简单、设备要求不高,适用于各种实验室条件,降低了门槛,提高了微生物多样性研究的普及性和实用性。
分子生态学中的生物多样性研究
分子生态学中的生物多样性研究生物多样性是生命科学研究的一个重要方向。
随着基因组技术和分子生物学的发展,分子生态学成为研究生物多样性的新方法。
分子生态学是将分子生物学与生态学相结合,通过研究生物分子标记来揭示种群结构、种间亲缘关系以及生物地理分布的变化规律。
生物多样性研究的重点在于识别已知物种和发现新物种,阐明物种多样性的原因和机理。
分子生态学中的常用技术包括PCR扩增、基因测序、分子标记和系统发育分析等。
其中,分子标记是常用的方法之一。
分子标记指的是通过特殊基因序列或DNA片段的遗传变异来识别某个群体或物种的分子生物学标志。
分子标记可以反映物种的遗传多样性、种群结构和种间亲缘关系等。
常用的分子标记包括DNA微卫星、核糖体DNA、线粒体DNA等。
分析分子标记可以探究物种的遗传多样性,从而反映出不同环境下的生物多样性。
在生物多样性研究中,分子生态学的一个重要应用是研究物种的遗传结构。
物种的遗传结构是指在不同地理位置或环境条件下,同一物种的基因频率和遗传变异程度。
通过研究物种的遗传结构,可以了解一些在自然界中无法观测到的生物学特性,例如繁殖策略、生物地理分布和迁移模式等。
同时,遗传结构还可以为开展物种保护提供数据支持和途径。
分子生态学的另一个应用是识别物种。
物种的识别一直是生物分类学领域的一个重要问题。
在传统分类学中,物种主要是通过形态学特征被识别为不同的类群。
然而,传统的形态学分类法存在一定的局限性,例如相近物种间形态上的相似性非常高,很难分辨;同时,某些生物的形态变异很大,难以准确描述物种的特征。
基于分子生态学技术的物种识别方法,则可有效解决这些问题。
通过分析物种的基因序列信息,确定物种之间的系统发育关系,就可以识别物种并分析其演化历史。
最近几年,分子生态学在基因组学、环保、物种保护、自然资源管理等领域得到广泛应用。
这里我将结合自己的研究经验,介绍一下分子生态学在海洋生物多样性研究中的应用。
海洋生物多样性是现代生物学研究的重要领域之一。
分子生物学在微生物生态学中的应用
分子生物学在微生物生态学中的应用摘要:本文针对于分子生物学技术在微生物生态学中的研究进展进行了各方面的分析,首先探索了分子生物学技术的基本内容,并对微生物生态学中的一些问题进行了重点分析,接着便对分子生物学技术在微生物生态学中的研究进展进行了深刻的探索,对未来的发展情况做出了一系列的畅想。
关键词:分子生物学;微生物生态学;研究进展引言:其实探索分子生物学技术在微生物生态学中的研究进展,要对各方面情况进行重点探索。
首先要明白什么是分子生物学技术,自诞生以来有着怎样的重大突破,而微生物生态学中的主要问题主要矛盾又是什么,相对应的分子生物学技术有哪些应用,这样才能够相对应的去联系分子生物学技术,在微生物生态学中的研究进展。
1.分子生物学技术简介其实可以从一些基本的例子来分析,这样有助于更好的分析分子生物学的技术概念,在分子生物学诞生之前,在分析个体的时候,从最初的精神面貌以及身体状况来分析,其实这也就是从人体的一些表面来探索是否发生疾病,是否有一些潜在的问题。
而判断一个人是否健康,在分析各种各样生物的过程中也都是如此,如果一个生物的身体情况表现不佳,精神状态不好,就可以初步的判断其存在一定的疾病,或者是身体出现一定的问题,这种办法是比较科学的,但是相对来说依然是不够准确的。
在分析问题的时候,仅仅从表面来看是很难看到实质的,也很难针对性的进行分析,往往能够判断人们的疾病却不能够更好的治疗人们的疾病。
对于生物学的研究也是如此,很难有大的突破,但是在近些年来我们会发现,人们可以通过各种各样的方式来研究身体内的一些物质,可以通过手术的方式来研究身体内脏的病变以及动物的发展原理,也包括生物的进化情况。
在这一层次上分析则能够更好的去分析病灶,更好的去抓住问题,也能够进行相对应的治疗。
从最基本的概念入手,从最基本的内容入手,能够有效的发现问题,也能够有效的进行改善,这对于生物学的研究进展有着巨大的突破。
人们对于蛋白质体系,蛋白质核算体系,蛋白质脂质体系有了新的认识,在未来的几十年内,发展进一步有了新的突破,人们也能够更好的认识到生物学的本质。
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2017年04月分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用张晨曦(上海师范大学,上海200235)摘要:微生物多样性研究是生物多样性研究中的重要内容,由于微生物与动植物相比,存着这许多不同之处,因此其多样性研究也存在着许多不同之处,尤其是研究方法仍有待提升。
近些年来,越来越多的研究通过分子生物学方法观察微生物并取得了一定的成效。
因此,文章主要针对分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用价值展开分析。
关键词:分子生物学方法;微生物多样性;遗传多样性微生物主要包括细菌、放线菌、原生动物、真菌、部分藻类和病毒,是构成自然界的重要组成部分,其具有代谢多样性和遗传多样性,使得微生物在许多极端环境中都能够生存、繁衍。
微生物是生物链中的重要成员,对于动植物的生长发育、生态循环以及污染物的自然降解具有重要作用[1]。
微生物种类数量仅次于昆虫,但目前已知微生物种类占其总估计量的比重仍较低,目前生物界中已知的细菌、真菌以及病毒占其总种类的比重仅有6%、11%和5%,微生物多样性的研究滞后于其他生物群。
1微生物多样性研究的重要性微生物在维持生态平衡中具有重要作用,但是我们对于维持生态平衡的微生物系统的结构以及有关参数知之甚少,究其原因是由于传统微生物培养方法是通过获得培养菌株才能了解其特征,但是在自然界中能够培养的微生物数量还不到微生物总量的百分之一。
传统微生物研究主要是通过观察菌株的表性特征以及细胞的性质(包括细胞形态学、生理生化反应以及细胞组成成分等方面)[2]。
由于实验室培养是观察这些微生物特征的重要前提,因此这使得许多无法培养的微生物都不能被具体描述。
此外,这种研究方式对于微生物的进化关系没有有效的作用,因此微生物进化研究受到影响,从而无法对微生物进行准确的分类以及系统关系图的创建。
DNA 技术以及微生物分子学的出现为微生物研究提供了新的道路,有助于现代微生物多样性研究的良好开展。
从理论层面上分析,微生物进化之间的关系主要是由于基因组的结构决定的,通过比较微生物基因序列之间的不同能够有助于分析微生物之间的进化关系,比较简单的方法就是比较不同微生物类似基因之间的碱基序列,碱基序列之间的差距越大,说明微生物之间的进化关系也就越小。
该方法可以用于分析不同微生物之间的进化距离,从而用于构建进化关系树或微生物图谱[3]。
在微生物多样性研究中发现,16S rRNA 以及18S rRNA 的变化速率较低慢,常用于微生物进化关系分析的检验中。
近些年来,随着微生物DNA 技术的不断发展,以核酸基因序列为依据的微生物进化研究获得了有效的进步。
现代分子生物学技术的出现突破了传统研究技术的限制,从遗传角度上能够分析出微生物的种类以及遗传多样性。
2分子生物学方法在微生物多样性研究中的理论基础2.1“三界”理论的提出生物学界在对古化石标本研究中发现,早在30亿年前地球上就有自养细菌的存在,20多亿年前地球上出现了蓝细菌,15亿年前真核生物首次出现在地球上,也就是说原核生物比真核生物出现的要更早,真核细胞是由原核细胞进化而来也是一种比较科学的结论,这也是生物学界早期生命进化的主流理论[4]。
这一学说认为所有的生命都可以划分为这两种类型,且如今的真核生物就是由原核生物进化发展而来。
分子生物学方法的应用对于改正现代微生物种类划分以及进化关系等方面具有较好的效果。
进三十年来,大量的细胞生物学研究和分子生物学的研究证实,原核生物早在数亿年前就已经分化为真细菌和古细菌这两大类。
过去在建立微生物进化树时,主要是根据微生物细胞色素C 中氨基酸组成变化的特点,这主要是由于真核生物与大部分原核生物都有细胞色素C 。
但是在研究中发现,有些古细菌没有细胞色素C ,而有些细菌虽然有细胞色素C ,但是其氨基酸组成之间的差异过大,无法确定其是否有着进化关系[5]。
通过rRNA 的序列结构确定微生物之间的进化关系为微生物多样性的研究提供了更广阔的空间。
“三界”理论是由学者沃瑟提出的,其认为原核生物应分为古细菌与真细菌两界,但两界彼此之间有着很大的差异,也就是说古细菌、真细菌与真核生物三者是相互平行的,三者都起源于共同的原始细胞。
三界学说随着研究的进步而不断发展,大量古标本生物分子研究证实了古核生物遗传基因与真核生物有相似之处,古细菌与真核生物从进化学角度来看比原核生物更加密切,因此近些年来有越来越多的学者支持真核生物起源于古细菌的学说,认为真细菌是最先从古细菌与真核生物的生物干线中分离出来的。
“三界”理论的提出为为生物多样性的研究提供了全新的视角,并提示微生物遗传多样性具有普遍性。
2.216S rRNA 基因序列在分子生物学中的应用佩斯等人首次通过rRNA 基因鉴定样本中微生物的类别,利用5S rRNA 基因序列分析微生物的演变与进化。
该方法取得了一定的成效并且很快被用于研究微生物多样性。
但是由于5S rRNA 的基因序列相对较小,仅有120个核苷酸,携带信息不多,在微生物多样性研究领域起到的作用有限,而16S rRNA 基1242017年04月因序列与5S rRNA 基因序列相比,其携带信息更多,有1500个核苷酸,在分析微生物多样性方面的作用与效率更高。
16S rRNA 是原核生物中的一种RNA ,具有种类少且范围广的优点,约有80%细菌RNA 中含有16S rRNA ,适用于所有的生物中,从结构和功能上来看具有较强的保守型,被称为细菌化石。
16S rRNA 既能够表现出不同菌属之间的差异,同时又能够被分子生物技术所测量,因此得到了生物学家的广泛支持。
细菌16S rRNA 中的可变区序列都是根据细菌的菌属来确定的,恒定区序列相对比较稳定,因此可以利用恒定区序列将16S rRNA 片段进行扩增处理,利用不同细菌的可变区序列进行菌属和菌种的鉴定。
通过对16S rRNA 基因序列的分析,从而判断不同菌属、菌种之间进化关系的密切程度。
16S rRNA 序列同源性分析是推断细菌进化和发展的重要方法。
3分子生物学技术在微生物多样性研究中的应用随着科学技术的不断发展,DNA 技术成为遗传学研究中的重要方法。
近些年来,从样本中采集和提取DNA 的方法不断改进,从而对样本中的微生物进行聚合酶链式反应扩展,推动了微生物多样性研究的发展。
因此,文章针对分子生物学技术在微生物多样性研究中的应用展开阐述。
3.1分子杂交技术分子杂交技术是出现于1970年的分子生物学技术,其主要利用DNA 分子碱基相互配对的原理,利用特异性C DNA 探针与样本中的DNA 或RNA 形成杂交分子,其具有较高的特异性和敏感度,在微生物多样性研究中得到了广泛的应用。
目前实验中主要使用的探针有双链DNA 、单链DNA 和RNA 、寡核苷酸探针这三种,能够对微生物能否存在于特定环境、分布特点以及元素丰度等方面进行确定。
对采集到的微生物进行印迹杂交,能够获得特定DNA 序列的信息,主要原理是利用16S rRNA 基因探针与采集的为神武进行杂交,16S rRNA 相对丰度能够通过两者之间的杂交信号确定,从而间接反应微生物细胞的数量和生理特征。
对采集样本直接进行原位杂交,然后利用具有荧光标记的核酸片段作为探针,与样本染色体和细胞核进行DNA 杂交,就能够寻找到同源DNA 片段所在位置,实现了细胞DNA 序列的定位。
该技术能够从未知菌种获得大量的信息,包括微生物形态以及生物结构等方面的信息。
但是由于是对环境样本的检测,所获得的理论更加能够凸显自然环境中微生物的特点。
这种方法应用的关键是前期探究工作的不断累积,尤其是对已知微生物。
全细胞杂交比印迹杂交更加直观,其主要是通过放射性标记rRNA 探针来检查单个微生物细胞。
3.2PCR 技术PCR 技术也就是聚合酶链式反应技术,其主要利用双链DNA 变性与复性及分子杂交技术。
PCR 技术是一种快速扩增特定基因或DNA 序列的方法,能够将少量DNA 特异性扩增,通过多次解链以及反复循环,能够将基因或DNA 序列扩增十几倍,从而对采集DNA 样本进行分析,包括基因分析、序列分析以及进化分析等。
目前学界采用最广的是以16S rRNA 基因为基础的PCR 扩增,对微生物基因序列的扩增有助于分析微生物进化的多样性。
PCR 技术仅需要少量DNA 即可进行检测。
所选取的扩增模版DNA 片段要符合规范,若扩增不科学,可导致推断错误,一般来说,引物应当出现于分析基因序列的高度保守区,多在15~30bp 区间。
采用双链产物作为PCR 扩增模版,通过控制两种引物的含量,能够扩增出特定的DNA 序列。
单链构象多态技术主要是根据不同构象的DNA 单链在中性物质中的变迁率来观察DNA 基因的多样性。
若单链DNA 出现单碱基缺失时,迁移率会产生相应的变化,从而在谱带中出现多样性变化。
该技术所采用的方法主要分为PCR 扩增和凝胶分离这两方面,典型的单链构象多态技术需要在PCR 扩增中加入典型ATP 标记引物或CTP 标记引物才能进行扩增,扩增完毕之后通过放射观察单链构象的多态变化。
但是这种方法花费的时间与经费较大,且操作复杂,随着近些年的技术改进,采用印染显色以及溴化乙锭染色能够直接在中性凝胶中显示单链构象多态性,并且能够采用同为标记引物进行测验,使得该技术更加快捷和有效。
单链构象多态技术的优点在于:①能够检测到单碱基的基因突变;②方便快捷,适用于多样本筛查中。
但是该技术也有一定的缺陷,即其对小片段PCR 扩增产物较为敏感,对于大片段PCR 扩增产物的检验需要采用双向凝胶电泳进行分析。
4结语微生物多样性的传统研究方法是提取为环境样本中的微生物进行实验室培养和鉴定,但是自然界中的微生物种类非常多,能够采集到的微生物有限,且能够进行实验室培养的微生物更是少之又少,仅为微生物的1%。
近些年来随着DNA 技术的不断发展,通过DNA 技术来观察微生物菌属和种类的研究得到了较大的发展,这为微生物多样性的研究提供了新的方向。
参考文献:[1]杨永华,姚健.分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用[J].生物多样性,2014,8(3):337-342.[2]谭益民,何苑皞,郭文平等.基于分子技术的土壤微生物多样性研究进展[J].中南林业科技大学学报,2014,23(10):1-9.[3]卢莉琼,徐亚同,梁俊等.分子生物学方法在微生物多样性及微生物生态研究中的应用[J].应用与环境生物学报,2014,10(6):826-830.[4]燕艳,陈健,燕昌江等.利用分子生物学技术鉴定土壤微生物的方法[J].东北农业大学学报,2014,39(3):129-133.[5]李慧,陈冠雄,张颖等.分子生物学方法在污染土壤微生物多样性研究中的应用[J].土壤学报,2014,41(4):612-617.作者简介:张晨曦男汉族籍贯:河南省周口市在读上海师范大学研究生三年级、微生物学专业、研究方向:分子生物学、邮编:200235125。