高三生物一轮复习PCR知识总结

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高考生物PCR的过程及应用考点归纳总结
一、基础考点
1.名称:多聚酶链式反应
2.原理:DNA双链复制(DNA的半保留复制)、DNA的热变性原理
3.前提:要有一段已知目的基因的核苷酸序列
4.过程:PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:会解释三个步骤
①变性:当温度上升到90℃以上时,双链DNA解聚为单链
②复性:当温度下降到50℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链结合;
③延伸:当温度上升到72℃左右时,溶液中的4种脱氧核苷酸再耐高温的DNA 聚合酶的作用下,根据碱基互补配原则合成新的DNA链
④重复:第一轮循环的产物作为第二轮的模板:重复循环变性—复性--延伸三过程。

5.PCR反应体系的成分及作用
DNA模板:从样本或细胞中提取的微量总DNA
原料∶dNTP(dATP、dGTP、dCTP、TTP),提供原料和能量
酶∶Taq聚合酶(热稳定DNA聚合酶,从嗜热菌中分离得到)
引物∶一小段能与DNA母链的一段碱基序列互补配对的短单链核酸
(注意:引物与目的DNA片段两条母链各自的3’端序列互补)
Mg2+:维持酶活性所必需
PCR缓冲液∶维持pH,保护Taq酶
6.DNA在体内复制的条件
模板∶DNA分子的每条链
酶∶解旋酶、DNA聚合酶、DNA连接酶
原料、能量∶dATP、dGTP、dCTP、dTTP
引物∶RNA引物,温和的反应条件
7.总结:PCR与体内DNA分子复制的不同点:
PCR DNA复制复制起点无有
复制叉无有
场所及条件体外;
控制3个不同温度体内细胞核、线粒体、叶绿体;温和条件
步骤变性、退火、延伸起始、延伸、终止
酶Taq酶解旋酶、DNA聚合酶、DNA连接酶引物2种,一小段与DNA母链的
一段碱基序列互补配对的
短单链DNA;人工合成
多种RNA做引物;自行合成
引物是否去除否是
变性的条件90℃以上的高温解旋酶
结果短时间内快速扩增目的基
因片段
复制完整的DNA分子
特点
半保留复制
两条链连续合成半保留复制半不连续复制
8.PCR技术在基因工程中的应用:
(1)特异性、快速扩增目的基因获取目的基因(2)目的基因的检测与鉴定
9.用PCR技术可以扩增mRNA吗?
不可以;在逆转录酶的作用下,需以mRNA为模板按照碱基互补配对的原则合成cDNA再进行扩增
10.提取mRNA扩增目的基因的过程:
第一步:逆转录酶以RNA为模板合成一条与RNA互补的DNA链,形成RNA-DNA杂交分子
第二步:核酸酶H降解RNA-DNA杂交分子中的RNA链,使之变成单链DNA;
第三步:以单链DNA为模板,在DNA聚合酶的作用下合成另一条互补的DNA链,形成双链DNA分子
第四步:以双链DNA分子为模板,经过③变性、④复性、⑤延伸,循环扩增形成目的基因产物
11.cDNA中缺少真核生物基因的哪些结构:
启动子、内含子、终止子
12.目前在PCR反应中使用Taq酶而不使用大肠杆菌DNA聚合酶的主要原因是:Taq酶热稳定性高,而大肠杆菌DNA聚合酶在高温下会失活
13.PCR产物的影响因素:模板DNA的量、脱氧核苷酸的量、引物的量、酶的数量和活性、循环次数、Mg2+的浓度
14.PCR后期,反应速率下降的原因:酶的活性降低、引物和dNTP浓度降低、反应产物增多
15.变性温度过低会导致双链不能充分解开;
16:PCR扩增中预变性的目的:
预变性破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。

使DNA充分变性解旋为单链,有利于引物与模板的正确结合
17.PCR反应体系实际操作时,加入的是4种脱氧核苷三磷酸(dATP dGTP dCTP dTTP),每掺入一个核苷酸,伴随着两个特殊化学键(高能磷酸键)的断裂,由此释放的能量满足核苷酸聚合反应的需求
18.内参蛋白的作用:排出细胞取样、实验操作等对实验结果的影响
(内参蛋白是用来确保蛋白上样量一致性,量化目的蛋白的表达情况,是对实验结果定量分析或定性比较的重要标尺)
19.内参蛋白的选择:细胞内稳定存在和高表达的蛋白质
二、有关引物的考点总结:影响PCR的各种因素中,引物的设计最为重要
1.引物的作用:使DNA聚合酶能够从引物的3′端开始延伸DNA链
2.需要引物的原因:DNA聚合酶不能从头开始合成DNA,而只能从3’端延伸DNA 链,因此DNA的复制需要引物
3.设计两种引物的原因:基因的两条反向平行链都做模板,其碱基序列不同,且DNA聚合酶只能从3’端延伸子链,用2种引物才能确保DNA两条链同时被扩增
4.需要大量引物的原因:子链是在引物的引导下合成的,引物随子链DNA数量的增多而被消耗
5.需要引物的数量:(2n-1)×2
若扩增4次,共产生16个DNA时,消耗30个引物。

6.PCR扩增的产物的特异性:由引物的特异性决定;引物是根据目的基因两端的核苷酸序列设计的
例:PCR技术扩增干扰素基因时,设计引物序列的主要依据是有一段已知干扰素基因的核苷酸序列。

(2020山东高考)通过PCR技术可在总cDNA中专一性的扩增出Wx基因的cDNA,例:
原因是________________________________________。

答案:引物是根据Wx基因的一段已知序列设计合成的(或:引物能与Wx基因的cDNA特异性结合)
7.两引物间固定长度(等长)的DNA序列在PCR扩增3次后首先出现
8.复制方向:是沿子链5’→3’,从引物的3’端延伸子链
9.)如果需要在引物上加限制酶的识别序列:需要在引物的5’加
10.在引物的5’端设计两种限时酶识别序列的原因:便于目的基因和载体的定向正确连接
注:
(1)引物的5'端可以修饰,引物的5'端决定着PCR产物的长度,它对扩增特异性影响不大。

因此,可以被修饰而不影响扩增的特异性。

引物5'端修饰包括:加酶切位点,加标记荧光,引入点突变、插入突变、缺失突变序列;引入启动子序列等。

(2)引物的3'端不可修饰;引物的延伸是从3'端开始的,不能进行任何修饰。

11.设计引物时,引物自身不能有碱基互补配对的序列:避免引物自连,不能得到目的产物
12.设计引物时,两引物之间不能有碱基互补配对的序列:防止两引物之间结合形成双链,降低引物与DNA模板链结合的效率
13.引物设计不能太短:防止非目的基因的获得
例:为方便构建重组质粒,设计引物时需要增加适当的_________位点。

设计引物时需要避免引物之间形成_______________________,而造成引物自连。

(答案:限制酶碱基互补配对)
例:为便于扩增的DNA片段与表达载体连接,需在引物的_______端加上限制性酶切位点,且常在两条引物上设计加入不同的限制性酶切位点,主要目的是_____________________________________________。

(答案:5,使DNA片段能定向插入表达载体,减少自连)
14.复性的温度取决于:引物的长度、碱基组成、浓度及靶基因序列的长度。

如果引物中GC含量较高,可适当提高退火温度
15.复性温度过高,得不到产物的原因:引物不能稳定的与模板结合
16.延伸温度过高不利于引物与模板链的结合;
17.延伸的时间根据待扩增片段长度而定,延伸时间过长会导致非特异性扩增。

例:进行扩增时,反应的温度和时间需根据具体情况进行设定,下列选项中____的设定与引物有关,____的设定与扩增片段的长度有关。

①变性温度②退火温度③延伸温度
④变性时间⑤退火时间⑥延伸时间
答案:②⑥
18.退火温度过高会导致引物不能充分与模板链结合,导致目标产物的量减少
三、PCR技术与电泳技术结合的相关考点总结:选择性必修三P84
1.方法:琼脂糖凝胶电泳—鉴定并分离DNA
2.原理:DNA具有可解离的基团,在一定的PH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。

在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动
3.迁移速率的影响因素:凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象
(1)凝胶浓度:凝胶浓度的高低影响凝胶介质孔隙的大小,浓度越高,孔隙越小,DNA迁移受到的阻力越大,速率越慢,离点样孔越近;根据分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配置琼脂糖溶液,浓度0.8%-1.2%(琼脂糖溶液加热融化、冷却后加核酸染料)。

(2)DNA分子的大小:DNA的分子量越大,迁移速率越慢,离点样孔越近
(3)DNA分子的构象:
具有三种构像的质粒在琼脂糖电泳的前后顺序:环形超螺旋>线形>开环;
环形超螺旋(DNA两条链都是完整的质粒,就是超螺旋),结构紧致,受到的阻力小,迁移速率最快;完全断裂的线性DNA,迁移速率次之;环形松弛(DNA双链断了一条,质粒DNA就失去超螺旋,成为松弛的环),迁移速率最慢
4.仪器:PCR仪、微量离心管、微量可调移液器、电泳装置(电泳仪、水平电泳槽等)
试剂:购买的PCR试剂盒、配方参考教材或试剂盒说明书
电泳试剂:电泳缓冲液、凝胶载样缓冲液、琼脂糖、核酸染料等
5.步骤及注意事项:
★步骤:
1.用微量移液器按照右栏中的配方活PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各种组分。

PCR反应体系的配方
10倍浓缩的扩增缓冲液5μL
20mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液1μL
20mmol/L引物Ⅰ 2.5μL
20mmol/L引物Ⅱ 2.5μL
O28~33μL
H
2
1~5U/μL的TaqDNA聚合酶1~2U
模板DNA5~10μL
总体积50μL
注:模板DNA的用量为1pg~1μg
2.待所有组分都加入后,盖严离心管的盖子。

将微量离心管放入离心机,离心约10s,使反应液几种在管的底部
3.按照下表的参数,设置好PCR仪的循环程序。

将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。

循环程序变性复性延伸
预变性94℃,5min//
30次94℃,30s55℃,30s72℃,1min
最后1次94℃,1min55℃,30s72℃,1min
4.根据待分离的DNA片段的大小,用电泳缓冲液配置琼脂糖溶液,一般配置质量体积比为0.8%-1.2%的琼脂糖溶液。

在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。

稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。

5.将温热的琼脂糖溶液迅速导入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。

6.待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。

7.将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。

8.将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。

留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物。

9.接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一半1~5V/cm。

待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳。

10.观察电泳鉴定结果:取出凝胶至于波长为300_nm的紫外灯下观察并照相。

★注意事项:
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。

2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。

使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。

3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。

4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。

★结果分析:
一次性成功的DNA片段扩增应该产生与预期大小一致的DNA片段。

若出现与预期不一致的结果,可尝试从以下几个方面进行分析:模板DNA的制备、引物的质量与特异性、酶的质量以及PCR循环的条件。

1.未出现扩增条带的原因:
(1)模板:模板DNA含有杂蛋白或Taq酶的抑制剂、模板DNA污染。

若反应系统中污染了蛋白酶及核酸酶,应在未加Taq酶以前,将反应体系95℃加热5~10分钟。

(2)酶:Taq酶失活或在反应体系中未加入酶。

(3)引物:引物特异性不强,浓度不合适。

检查引物特异性或重新设计引物;引物浓度过高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。

(4)变性温度是否准确:过高酶在前几个循环就迅速失活;变性温度低,变性时间短则模板变性不彻底。

(5)Mg2+浓度过低,扩增的产物过少;
(6)4种dNTP浓度过低,扩增的产物过少;
(7)目的序列变异
2.扩增产物出现多条带(杂带)的原因:
(1)模板:模板DNA污染。

确保操作的洁净。

(2)酶:酶的用量偏高或酶的质量不好,应降低酶量或调换另一来源的酶。

(3)引物:引物用量偏大,引物的特异性不高,或形成引物二聚体,特别是引物的3′短互补,易形成引物二聚体,产生非特异性扩增条带;
(4)复性温度偏低,复性及延伸时间偏长:应提高复性温度,减少变性与延伸
时间
(5)Mg2+浓度过高,反应特异性降低,会引发非特异性扩增
(6)4种dNTP浓度不相等:任意一种浓度过高或过低,都会引发错配,扩增的产物过少;
(7)循环次数过多
(8)延伸时间过长会导致非特异性扩增
★对照的作用:
阳性对照:用于检测PCR体系是否正确及扩增效率,确保不是DNA凝胶和PCR程序的问题
阴性对照:用于检测是否存在含有目的序列的DNA污染
阴性对照出现条带:试剂,枪头,工作台污染。

四、DNA片段的扩增及电泳鉴定实验的问题串
1.PCR扩增的原理:
2.DNA分子带电的原因:
3.DNA在电场中的移动方向:
4.PCR产物鉴定方法:
5.凝胶中DNA分子迁移速率的影响因素:
6.凝胶中DNA用什么染色:
7.凝胶中DNA的检测:
8.实验器材、试剂:
9.PCR反应体系的配方:
加入的顺序:
10.各种组分加入什么器材中?操作时应注意什么?
11.依据什么配置琼脂糖溶液?用什么配置琼脂糖溶液?体积比一半为多少?
12.配置好的琼脂糖如何操作?能否加热后直接加入核酸染料?
13.向模具中倒琼脂糖的注意事项?如何制作加样孔?
14.什么时候拔出梳子?凝胶制备成功后放入什么溶液中?
15.电泳槽中的液体是什么?深度如何?
16.加样孔中加什么?用什么仪器加入?注意什么?能否将所有的加样孔都加满?
17.标准参照物是什么:
18.根据什么设定电压?一般为多少?什么时候停止电泳?
19.取出凝胶后如何观察:
20.PCR使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等如何处理?目的是什么?
21.缓冲液和酶应该如何储存?使用前如何操作?
22.向离心管中添加组分时,移液器的枪头是否需要更换?是否吸取一次后就更换?
23.操作时,手部如何处理?
五、判断
1.在溶有DNA的NaCl溶液中,加入二苯胺试剂即呈蓝色()
2.DNA不溶于酒精,但某些蛋白质溶于酒精()
3.进行DNA片段的扩增及电泳鉴定实验所需的缓冲液和酶应分装成小份,并在20℃储存()
4.在凝胶中DNA分子的迁移速率只与DNA分子的大小相关()
5.为了节约资源,移液器上的枪头在实验过程中不必更换()
6.PCR所用的缓冲液和酶从冰箱拿出之后,迅速融化()
7.进行电泳时,带电粒子会向着与其所带电荷相同的电极移动()答案:×√×××××。

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