单细胞转录组学的技术及应用
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单细胞转录组学的技术及应用随着科技发展的不断推进,人们对于生物学领域的研究也越来
越深入。
在这个领域中,单细胞转录组学技术是一个备受关注的
革命性技术,可以为生物学研究提供更加深入细致的了解与理解。
一、单细胞转录组学技术的定义和意义
单细胞转录组学技术(Single-cell transcriptomics)是一种能够
对单个细胞进行分析的生物信息学技术,可以测定其转录组水平,因此也又被称为转录组测序技术。
这种技术能够对细胞的基因表
达进行高通量、高灵敏的研究,其主要应用领域是生物医学、致
病机制的解析以及个性化医疗的发展等领域。
单细胞转录组学技术的意义在于:在了解每一个细胞的基础上,可以更加感性地了解组织和系统方面的更多相关信息。
比如疾病
的研究,单细胞转录组学就可以从一个个细胞的角度看到病变细
胞和正常细胞之间的差异。
这可以为转化医学研究提供重要的基
础数据。
二、单细胞转录组学技术的研究方法
单细胞转录组学技术要求对细胞进行隔离或者微量处理后,通过高通量测序技术获取每个单独细胞的转录本信息,从而建立一个具有生物学意义的单细胞图谱。
这种方法主要有以下几种:
1. 微流控技术
微流控技术是目前应用比较广的单细胞分离技术,可以将单个细胞分离到微小单元中,进一步完成单细胞转录组学研究。
该技术在去年发表在Nature上的文章中,首次使用混合式多层微流控芯片,实现了超过6万个肺癌瘤细胞(filter cells)的测序,并对这些细胞进行了分类。
2. 磁性珠技术
磁性珠技术利用通过连接到表面上的选择性抗体来挑选出感兴趣的单个细胞,这样可以保证筛选出的细胞单一性。
但是该技术在筛选过程中也会影响单细胞的RNA浓度。
因此在使用这种技术时,需要充分考虑上述问题。
3. 转移部分细胞原型
尽管微流控和磁性珠技术在单细胞分离上表现出色,但分离效
率相对不太高。
因此,一些新兴技术引人注目,例如SPOT,即区分细胞不同阶段的技术。
相比Sanger技术和Illumina高通量测序,该技术在处理细胞材料方面具有明显优势。
三、单细胞转录组学技术应用示例
1. 人类大脑皮层的细胞异质性
2017年,斯坦福大学的孟德尔博士等人通过单细胞转录组学技术,研究证明人类大脑皮层细胞异质性更为丰富,甚至一个单独
神经元都具有其独特的表达谱。
这种细胞荟萃会影响神经元和脑
回的发育,从而影响人类的行为和认知能力。
2. 肿瘤发展中的单个细胞
针对肿瘤发展中的单个细胞的研究所使用的单细胞转录组学技术,能够在更好地了解肿瘤的轨迹以及突变环境。
这些信息对于
治疗策略的选择、患者的转化癌症研究以及疾病发展的监测,都
有着非常重要的意义。
四、未来趋势
目前,单细胞转录组技术的发展方向主要是在技术层面上不断
提高高通量测序技术的灵敏度和特异性,并尝试将微分子分子分
析和高分辨率成像技术进行结合,以获得更为精确的数据。
同时,应向发生时间上进行进一步研究,并应用在整体的趋势研究和网
络重构分析中。
总的来说,单细胞转录组学技术不断的发展与完善,使研究者
可以更加全面的了解生物体的发育、疾病等重要方面,预测未来
发展趋势,对人类健康和医疗事业的推进提供了有益的参考和帮助。
未来更好的发展,还需要整合更多技术手段,更好的突破其
不足,走向真正的全面、深入的研究。