系统性红斑狼疮基因表达差异分析及治疗中药预测

系统性红斑狼疮基因表达差异分析及治疗中药预测
刘瑞;曹双;张秋月;阴志刚;范长有;田花丽;黄冉涛
【期刊名称】《中国医药导刊》
【年(卷),期】2022(24)8
【摘要】目的:基于生物信息学的方法分析系统性红斑狼疮(SLE)患者与正常人的差异表达基因(DEGs),并预测潜在的治疗中药。

方法:利用edgeR分析数据集
GSE154851,获得DEGs,通过String构建蛋白互作(PPI)网络,使用Cytoscape的CytoHubba插件筛选关键基因,并进行GO功能及KEGG信号通路富集分析。

将
关键基因输入到Coremine Medical数据库筛选潜在治疗中药。

结果:筛选出228
个DEGs,其中有196个基因表达上调,32个基因表达下调。

筛选到的关键基因有DDX58、ISG15、STAT1、TRIM25、IRF7、IFIH1、NOD2、UBE2L6、NOD1、FLT3,GO分析显示关键基因参与的主要生物过程包括调节IFN-I、TNF、IL-6的产生,对病毒的应答等;KEGG分析显示主要涉及的信号通路有RIG-I-样受体信号通路、甲型流感、EB病毒感染等。

预测出治疗SLE的潜在中药有水牛角、赤芍、鳖甲、半夏、板蓝根、黄柏、独活、厚朴等。

结论:本研究通过分析SLE的基因表达数据,获得DEGs,从而筛选了治疗SLE的关键基因以及潜在的治疗药物,为探索治疗SLE
的药物选择提供了新思路。

【总页数】7页(P793-799)
【作者】刘瑞;曹双;张秋月;阴志刚;范长有;田花丽;黄冉涛
【作者单位】南阳市科学院;南阳市农业科学院
【正文语种】中文
【中图分类】R593.241
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