大肠杆菌的genotype说明，看懂大肠杆菌菌株的genotype

大肠杆菌的genotype说明，看懂大肠杆菌菌株的genotype 总结了一些关于大肠杆菌基因型的资料，和大家分享一下。

大肠杆菌基因型说明
hsdR 有利于非甲基化DNA（如PCR扩增产物）的有效转化。

mcrA 有利于甲基化DNA（如基因组）的有效转化。

acZΔM15 用于蓝白斑筛选。

endA1 无Endonuclease I 酶活性，有利于质粒的纯化。

recA1 减少克隆DNA的非特异性重组。

DE3 编码T7 RNA聚合酶，用于诱导T7-启动的表达系统的表达。

DeoR 可以高效吸收大片段DNA，有利于文库的构建。

Tn10 含有四环素抗性的转座子。

OmpT 表明大肠杆菌缺乏外膜蛋白酶。

缺乏外膜蛋白酶的菌株可以降低表达的外源蛋白在细菌中被降解的程度，有利于获得完整的重组蛋白。

PLys 含编码T7溶菌酶的质粒；通过抑制T7 RNA聚合酶基础表达水平来降低T7启动的表达体系的基础表达水平。

ArgF 由于突变细菌不能利用arginine。

F’一个低拷贝可移动的质粒，当被M13噬菌体侵染时，可产生单链DNA。

LacI 编码lac抑制子，用于蓝白斑筛选时需加入IPTG，才可启动表达β-gal。

dam/dcm 消除了内源腺苷和鸟苷的甲基化。

在此种细菌中繁殖的DNA不被甲基化
F-，F 因子缺失
φ80dlacZΔM15，lacZDM15（Lactose）Map position：8 min 功能：lacZM15是表达β-半乳糖苷酶α片断的一段基因，当M15缺
失（△M15）时，lacZ基因虽然能表达ω片断，但不能表达α片断，β- 半乳糖苷酶没有活性。

当带有lacZ（α片断）基因的lac操纵子通过载体DNA（如pUC19 DNA）转化到lacZ△M15基因型的细胞(如E.coli JM109）时，在有IPTG (异丙基-β-D-1-硫代半乳糖苷) 存在的情况下, β-半乳糖苷酶表现出活性,它能分解X-gal (半乳糖类似物)，使其呈现蓝色。

因此可以通过平板上的蓝白菌落进行克隆体的鉴定。

Δ(lacZYA-argF)U169，
deoR，功能：deoR 是大肠杆菌中deo 操纵子的调节基因，它表达的阻遏蛋白对deo 操纵子具有重
要的调控作用。

deo 操纵子位于大肠杆菌基因图谱100 min 的位置，它含有deoA、deoB、
deoC 和deoD 等结构基因，分别表达DNA 代谢所需的酶类，即胸腺嘧啶磷酸化酶、磷酸
转位酶、脱氧核糖磷酸醛缩酶和嘌呤核苷磷酸化酶。

deoR 基因的变异，使deo 操纵子的阻
遏蛋白不能表达，宿主细胞合成大量的dCTP，可以选择性地改善大分子DNA 的转化。

recA1，recA (Recombination) 减少克隆DNA的非特异性重组。

功能：recA 基因表达ATP 依赖型DNA 重组酶，它在λ-噬菌体与基因组DNA 的溶原重组
时起作用，同时具有对DNA 放射性损伤的修复功能。

由recA 基因的变异所产生的基因型
使同源或异源DNA 的重组不能进行，保持插入DNA 的稳定性，对DNA 的转化有利。

一个
菌株的基因型如果是recA，则说明此菌株的表现型是重组缺陷的。

endA1，endA (Endonuclease) 无Endonuclease I 酶活性，有利于质粒的纯化。

功能：endA 基因表达非特异性核酸内切酶I，它能使所有DNA 双链解开，在DNA 的复制
和重组中起重要作用。

endA 基因的变异将使插入的外源DNA 更
加稳定，提取的质粒纯度
更高。

hsdR17(rk-，mk+)，
限制缺陷，修饰正常可使 DNA 甲基化，但不限制外源 DNA 。

hsdR (Host specificity defective)
功能：hsdR 基因表达I 型限制酶EcoK (K12 株) 或EcoB (B 株)，在大肠杆菌细胞中起到
一种“抗体”的作用，对外来的各种DNA 有严格的限制。

HsdR 基因的变异导致菌株细胞
内的I 型限制酶EcoK 或EcoB 活性缺失，这对于外来基因的导入及质粒转化是有利的。

hsdS20 (rB-、mB-)，其中S20 代表特异性识别蛋白发生变异，()中的 rB-、mB-表示由于S20 的变异而导致B 株来源的hsdR 和hsdM 的功能缺失。

phoA，
supE44，supE (Suppressor)
功能：supE 基因表达的阻遏蛋白与停止密码子UAG 结合，使蛋白质合成停止。

supE 基因
发生变异时，不能表达正常的阻遏蛋白，即使遇到停止密码子UAG，蛋白质合成仍能继续，
并使UAG 作为一个密码子来编码谷氨酰胺（Glutamine），从而使发生了琥珀突变（AAG
→UAG）的基因对蛋白质表达得以延续，因此称supE 为琥珀突变抑制因子。

supE44（sup 基因座E 的44 位突变）。

如果不知道几个等位基因中哪一/几个发生了功能性突变，则用连字符“-”代替大写字母，如trp-31。

λ-，
thi-1，功能：thi 基因包含有thiA、thiB、thiC、thiD、thiK、thiL 等。

thiA 表达硫氨素噻唑转运蛋白、thiB 表达硫氨素磷酸盐焦磷
酸化酶、thiC 表达硫氨素嘧啶转运蛋白、thiD 表达磷酸甲基化嘧啶激酶、thiK 表达硫氨素激酶、thiL 表达硫氨素甲磷酸激酶。

thi 的变异使硫氨素的生物合成不能进行，最小培养基中必须添加硫氨素（VB1），细胞才能正常生长。

硫胺素代谢突变在基本培养基上的生长需硫胺素的存在。

gyrA96，gyrA（Gyrase）
功能：gyrA 基因表达DNA 促旋酶A 亚基。

DNA 促旋酶在DNA 复制时具有使DNA 解旋和回旋的作用。

萘啶酮酸(Nalidixic acid)、4-喹啉（4-Quinoline）等抗生素抑制DNA 促旋酶的活性是通过与促旋酶复合体(A2B2)中的A 亚基的结合实现的。

gyrA 基因的变异使DNA促旋酶A 亚基不能正常表达，萘啶酮酸和荧光喹啉等失去结合目标，从而使该基因型的菌株具有了对萘啶酮酸（Nalr）和荧光喹啉的抗性。

relA1relA（Relaxed）
功能：relA 是松弛调节基因，对RNA 的合成具有调节抑制作用。

同时relA 基因还表达ATP：
GTP3'-焦磷酸转移酶，负责在氨基酸饥饿状态下鸟苷3'，5'-二磷酸 (ppGpp) 的合成，以适
应饥饿环境。

relA 基因的变异对目的基因的转录有利。