基于小胸鳖甲转录组的免疫相关基因发掘

基于小胸鳖甲转录组的免疫相关基因发掘
李洁琼
【期刊名称】《湖北农业科学》
【年(卷),期】2022(61)22
【摘要】利用小胸鳖甲(Microdera punctipennis)的转录组数据注释并筛选出其免疫相关基因。

在获得的198206个unigene中,共注释49034个基因,占转录组总unigene的24.74%,通过注释信息和手动筛选获得了107个免疫相关基因的1750个同源unigene,这些基因主要编码模式识别受体、免疫信号转导及调控因子和免疫效应因子。

结果表明,在小胸鳖甲Toll、MAPK-JNK-p38和JAK-STAT免疫通路大多数是完整和保守的,其免疫相关的细胞过程,如自噬、凋亡和RNA干扰及其调节剂大部分也是保守的,同时具有多种免疫效应物,如抗菌肽、热休克蛋白、溶菌酶、酚氧化酶、几丁质酶和抗氧化酶等。

然而,其他昆虫中普遍存在的IMD、FADD和Dome等保守免疫相关基因在小胸鳖甲中没有找到。

根据筛选的免疫相关基因初步绘制了昆虫小胸鳖甲免疫通路图。

建立的小胸鳖甲免疫系统的框架可为非果蝇类昆虫免疫相关基因的研究提供借鉴。

【总页数】14页(P181-194)
【作者】李洁琼
【作者单位】新疆农业职业技术学院生物科技分院
【正文语种】中文
【中图分类】Q966;S433.5
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