NCBI数据库文献查找
NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦
NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦注：在本文中的叙述中，所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。
PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）提供，可通过NCBI网站的Entrez检索系统（Entrez retrieval system）进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。
此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。
PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。
其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。
如果该出版商有网站，则NCBI会提供相应的网络出口。
MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。
PubMed服务内容概括基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。
ncbi使用指导
ncbi使用指导【原创版】目录1.NCBI 的概述2.NCBI 的使用方法3.NCBI 的数据库资源4.NCBI 的实用工具5.NCBI 的注意事项正文CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心的缩写，是一个提供生物学和医学信息的数据库和工具的官方网站。
该网站由美国国家卫生研究院（NIH）建立，旨在为科学家、医生、研究人员和学生提供免费的生物学和医学信息。
以下是 NCBI 的使用指导：一、NCBI 的概述CBI 提供了多种数据库资源和实用工具，包括基因序列、蛋白质序列、基因组信息、生物学文献等。
这些资源对于生物学和医学研究非常重要。
二、NCBI 的使用方法1.访问 NCBI 的官方网站：https:///2.在主页上，你可以看到 NCBI 提供的各种数据库和工具的链接。
你可以点击链接进入相应的数据库或工具页面。
3.在数据库或工具页面，你可以使用各种搜索框和过滤器来查找你需要的信息。
例如，在基因序列数据库中，你可以输入基因名称或序列号来查找相关的基因序列信息。
三、NCBI 的数据库资源1.基因序列数据库（GenBank）：提供了全球各种生物的基因序列信息。
2.蛋白质序列数据库（Protein Database）：提供了全球各种生物的蛋白质序列信息。
3.基因组数据库（Genome Database）：提供了全球各种生物的基因组信息。
4.生物学文献数据库（PubMed）：提供了全球生物学和医学领域的文献信息。
四、NCBI 的实用工具1.BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）：用于比较基因序列或蛋白质序列的相似性。
2.Entrez：用于在 NCBI 的数据库中搜索和获取相关的生物学信息。
3.Coffee Break：用于查看和下载基因序列或蛋白质序列的图片。
五、NCBI 的注意事项1.在使用 NCBI 的数据库和工具时，请遵守相关的知识产权和版权规定。
NCBI数据库检索
如果想进行更精确的检索，可以用双引 号 将 作 者 名 引 起 来 ， 再 加 [au] ， 如 “ Liu C”[au]
四、PubMed的基本检索功能（三）
3、杂志名检索
在检索框中键入杂志全名molecular biology of the cell 也可以直接键入Medline的期刊标准缩写形式，如 ：mol boil cell， 键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码）进行检 索，如1059-1524。
每页显示数目
显示格式 符合条件的记录 数
mRNA数量
不同物种记录数
在线获取序列方法 2
显示格式 符合条件的记录 数
mRNA数量 不同物种记录数
在线获取序列 方法3
Accession number
序列长度 数据类型
Definition: 标题
物种名称
GI number
基因名称 编码蛋白名称
二 . Genome
即基因组数据库，提供了多种
基因组、完全染色体、临近序列图 谱以及一体化基因物理图谱。
三. Structures
即结构数据库或称分子模型数据
库（ MMDB ），包含来自 X 线晶体学
和三维结构的实验数据。 MMDB 的数
据从PDB（Protein Data Bank）获得。
四. Taxonomy
Financial
Int’l Legal & Regulatory
Tax & Accounting
Scientific
Healthcare
11,500 Employees
如何在ncbi上检索
如何在ncbi上检索NCBI包括五个部分，第一部分是欢迎进入NCBI，包括NCBI的最新信息、计划与活动、读者来信、服务地址和用户评论等。
第二部分是基因序列数据库(GenBank)，包括基因库概述、检索与投稿。
第三部分是数据库服务，包括免费的PubMed检索、Entrez 检索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务(详见本章第四节)、匿名FTP服务。
第四部分是NCBI的其它资源。
GenBank的检索在NCBI主页的第二部分点击"Searching GenBank"，即可进入GenBank的检索屏幕。
NCBI•提供了五种检索，即Entrez浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、dbSTS•检索和文本检索(Text Searching)。
一、Entrez浏览检索1.Entrez检索的数据库及其检索信息Entrez浏览器(Entrez Browser)可以检索以下与NCBI•链接的基因序列数据库的分子生物数据和书目文献资料。
••••(1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列; ••••(2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译的蛋白质序列; ••••(3) 基因和染色体图像数据; ••••(4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构; ••••(5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。
••••2.Entrez检索功能••••Entrez提供了以下三种检索功能。
•• (1)自由词检索功能•••用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。
截词用*号，期刊名必须用Medline刊名缩写，作者姓名必须是姓在前，名在后，用首字母缩写。
••••(2)索引词表(List Terms)检索功能••••索引词表检索是当你键入检索词，Entrez•在你选定的字段中显示从该检索词开始的一个索引词表窗口，这时，你可以选择一个或几个词进行检索，这对单词拼写不准确时非常有用。
NCBI-PubMed-检索简介与检索技巧集锦
NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦注：在本文中的叙述中，所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。
PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）提供，可通过NCBI网站的Entrez检索系统（Entrez retrieval system）进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。
此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。
PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。
其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。
如果该出版商有网站，则NCBI会提供相应的网络出口。
MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。
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NCBI检索方法
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追求至善凭技术开拓市场，凭管理增 创效益 ，凭服 务树立 形象。2020年12月11日星期 五上午9时13分 35秒09:13:3520.12.11
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严格把控质量关，让生产更加有保障 。2020年12月 上午9时 13分20.12.1109:13December 11, 2020
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作业标准记得牢，驾轻就熟除烦恼。2020年12月11日星期 五9时13分35秒 09:13:3511 December 2020
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相信命运，让自己成长，慢慢的长大 。2020年12月11日星 期五9时 13分35秒Friday, December 11, 2020
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爱情，亲情，友情，让人无法割舍。20.12.112020年 12月11日星期 五9时13分35秒20.12.11
谢谢大家！Biblioteka 专家库 相关信息准确且全面
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树立质量法制观念、提高全员质量意 识。20.12.1120.12.11Friday, December 11, 2020
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人生得意须尽欢，莫使金樽空对月。09:13:3509:13:3509:1312/11/2020 9:13:35 AM
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安全象只弓，不拉它就松，要想保安 全，常 把弓弦 绷。20.12.1109:13:3509:13Dec-2011-Dec-20
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加强交通建设管理，确保工程建设质 量。09:13:3509:13:3509:13Fri day, December 11, 2020
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安全在于心细，事故出在麻痹。20.12.1120.12.1109:13:3509:13:35December 11, 2020
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踏实肯干，努力奋斗。2020年12月11日上午9时13分 20.12.1120.12.11
ncbi的使用方法
ncbi的使用方法
1.功能：
-在NCBI网站的主页上，可以找到一个栏。
在栏中输入关键词，可以特定的基因、蛋白质、序列或文献等。
-在结果页面中，可以使用筛选器（过滤器）来缩小范围，例如按照物种、文章类型、出版日期等进行筛选。
2.数据库浏览：
- NCBI拥有多个数据库，包括GenBank、PubMed、Protein、Nucleotide等。
用户可以通过点击导航栏上的“主页”选择相应的数据库。
- 在每个数据库页面上，用户可以找到相关的方法和信息。
例如，在GenBank数据库页面上，用户可以和浏览基因序列的信息。
- NCBI 的PubMed数据库提供了数百万篇生物医学文献的摘要和全文信息。
用户可以通过在栏中输入关键词来特定的文献。
- 在结果页面上，用户可以点击文章标题来查看摘要，进一步点击“Full Text”或“PDF”链接来获取全文。
一些文章可能需要订阅或付费获取。
- 用户还可以使用PUBMED Central（PMC）数据库来获取免费的全文文章。
4.序列和分析：
- NCBI 的Nucleotide和Protein数据库提供了大量的基因和蛋白质序列。
用户可以通过在栏中输入基因或蛋白质的名称、序列号或其他相关信息来相应的序列。
- NCBI还提供了一些序列分析工具，例如BLAST（Basic Local Alignment Search Tool），可以对新序列进行比对和分析。
6.创建和保存历史：
7.利用NCBIAPI：。
NCBIPubMed检索简介与检索技巧集锦
NCBI PubMed检索简介与检索技巧集锦注：在本文中的叙述中，所有输入Pu bMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therap y"[MESH]>。
PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, Nation al Institu es of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medici n e）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, Nation al Center for Biotec hnol o g y Inform a tion）提供，可通过NCBI网站的E n trez检索系统（E ntrez retrie val system）进行MED L I NE和P reMED LINE引文数据库的在线免费检索。
此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。
PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。
NCBI检索
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图谱，分类学浏览器，同国立癌症研究所合作的癌症基因组剖析计划（CGAP）等数据库。GenBank以指数形式增长，核酸碱基数目大概每14个月就翻一个倍。
2. 纪录样本 - 关于GenBank的各个字段的详细描述，以及同Entrez搜索字段的交叉索引。
3. 访问GenBank - 通过Entrez Nucleotides来查询。用accession number，作者姓名，物种，基因/蛋白名字，还有许多其他的文本术语来查询。关于Entrez更多的信息请看下文。用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query和BLAST服务器。另外一种选择是可以用FTP下载整个的GenBank和更新数据。
向GenBank提交数据 ：
1. 关于提交序列数据，收到accession number，和对纪录作更新的一般信息。
2. BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。（请在提交前用VecScreen去除载体）
3. Sequin - 提交软件程序，用于一条或者很多条的提交，长序列，完整基因组，alignments，人群/种系/突变研究的提交。可以独立使用，或者用基于TCP/IP的“network aware”模式，可以链接到其他NCBI的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST。（请在提交前用VecScreen去除载体）
GenBank的检索
NCBI的检索NCBI包括五个部分，第一部分是欢迎进入NCBI，包括NCBI的最新信息、计划与活动、读者来信、服务地址和用户评论等。
第二部分是基因序列数据库(GenBank)，包括基因库概述、检索与投稿。
第三部分是数据库服务，包括免费的PubMed检索、Entrez检索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务（详见本章第四节）、匿名FTP服务。
第四部分是NCBI的其它资源。
GenBank的检索在NCBI主页的第二部分点击“Searching GenBank”，即可进入GenBank的检索屏幕。
NCBI•提供了五种检索，即Entrez浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、dbSTS•检索和文本检索(Text Searching)。
一、Entrez浏览检索1.Entrez检索的数据库及其检索信息Entrez浏览器(Entrez Browser)可以检索以下与NCBI•链接的基因序列数据库的分子生物数据和书目文献资料。
••••(1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列；••••(2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译的蛋白质序列；••••(3) 基因和染色体图像数据；••••(4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构；••••(5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。
••••2.Entrez检索功能••••Entrez提供了以下三种检索功能。
••••(1)自由词检索功能••••用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。
截词用*号，期刊名必须用Medline刊名缩写，作者姓名必须是姓在前，名在后，用首字母缩写。
••••(2)索引词表(List Terms)检索功能••••索引词表检索是当你键入检索词，Entrez•在你选定的字段中显示从该检索词开始的一个索引词表窗口，这时，你可以选择一个或几个词进行检索，这对单词拼写不准确时非常有用。
NCBI应用之PubMed文献查找[1]
![NCBI应用之PubMed文献查找[1]](https://img.taocdn.com/s3/m/2714ee343968011ca3009129.png)
NCBI应用之PubMed文献查找来源：easylabs原创,转载请注明发布时间：2009-09-26 查看次数：1288先给大家一段查询语言：(myocardial[Title/Abstract] AND infarction[T itle/Abstract]) AND ("loattrfull text"[sb] AND "2008/09/26"[PDat] : "2009/09/25"[PDat] AND English[lang] AND Review[ptyp])。
能看懂吗，是不太复杂了？其实就是查询近一年的关于心肌梗死的英文综述。
所幸的是，我们不需要记这样的查询语言，有了PubMed，我们完全可以简单的操作就可查到想要的目标文献。
呵呵，有点像做广告哈。
先介绍一下pubmedPubMed包括MEDLINE和PREMEDLINE的完整内容。
它还包括一些被ME DLINE认为超出范围的文章和杂志，（这些文章或杂志）由于内容或在某一时期不在索引范围内。
因此PubMed是比MEDLINE的更大的集合。
看一下它所收录的数据库：PubMed现已有19 million文章信息（文章的名称，发布日期杂志，摘要，全文链接以及与要查询内容相关的文章），最早的文章可追塑到1948年。
另外，PubMed Central还能提供大概300000篇免费全文。
因此，PubMed是科研过程中文献查找的一个最重要的工具，就我个人而言，一般是先在PubMed中找到全文链接，然后再上相应的数据库查找。
下面我们就一步步的教大家如何有效应用该资源。
首先，进入PubMed的首页面，网址是/pubmed/,如果从NCBI首页进入，Search的地方选择PubMed就可进入了。
页面介绍：最上面一行为查询框，在首页的文字部分给出了三种查询方式：1、topic主题检索。
很简单，在查询框输入主题词（如：心肌梗死myocardi al infarction），点右边的“go”就OK了；2、authors著者检索。
pubmed检索式
pubmed检索式Pubmed检索式是一种在PubMed上检索可供参考的文献的方法。
Pubmed（又称NCBI共媒体数据库）是美国国家生物技术信息中心（NCBI）维护和发布的一个在线免费文献数据库，包括医学、生物、药物和其他专业和技术领域的科学文献。
这些文献也可以从别的在线免费文献数据库中找到，但是 Pubmed据库检索式有其独特的优势。
首先，Pubmed检索式可以搜索文献的元数据，包括作者、出版年份、期刊名称等信息。
这样就容易找到符合条件的文献，而不是搜索整个文献全文，从而节省搜索时间。
其次，Pubmed检索式可以使用贴合度运算符和逻辑运算符来实现复杂的查询。
例如，可以使用“ OR运算符来将搜索词组合在一起，以找到包含其中一个搜索词的文献；也可以使用“ AND运算符来搜索同时包含多个搜索词的文献。
此外，还可以使用括号和近义词来实现高级搜索功能，如联合搜索、排除搜索和并列搜索。
此外，Pubmed检索式还可以使用语言、文献类型、国家和地区的制约条件来限定搜索结果。
例如，可以使用“ Journal:制约条件来搜索某期刊的文献，或使用“ Language:制约条件来搜索某一种语言的文献。
样做可以帮助搜索者更快地找到符合条件的文献，而不必逐论搜索。
最后，Pubmed检索式还可以自动搜索引用文献。
使用 Pubmed索式搜索找到的文献后，可以自动搜索引用文献，以查找文献中提及的其它文献。
这样可以帮助读者了解更多关于特定主题的研究方法和结果，从而更好地理解特定的研究领域。
综上所述，Pubmed检索式可以帮助搜索者在 PubMed据库中更有效、更全面地搜索文献，而不必花费大量精力。
因此，Pubmed检索式对于科学家和研究者而言，是一种十分有用的工具。
NCBIPubMed检索简介与检索技巧集锦
NCBIPubMed检索简介与检索技巧集锦NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦注：在本文中的叙述中，所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。
PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）提供，可通过NCBI网站的Entrez检索系统（Entrez retrieval system）进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。
此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。
PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。
其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。
如果该出版商有网站，则NCBI会提供相应的网络出口。
MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。
ncbi数据库使用方法
ncbi数据库使用方法NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation）是美国国立卫生研究院（NIH）管理的一个综合性生物技术信息数据库，是一个综合生物技术信息服务平台，收录了丰富多样的生物信息，其内容以生物分子为主，记录着世界上每一种分子的完整和准确的数据，所有的信息均可以以多种方式被检索和查询。
因此，NCBI数据库的使用从生物技术的学习与应用、生物多样性的研究、药物开发、医疗健康以及基因组研究等等，都影响着各个领域的发展。
NCBI数据库的使用分为“检索”和“查询”两种方式，“检索”即通过NCBI的简单检索界面，综合利用键入的词式或设置的限定条件，检索指定的研究数据；“查询”则要求用户掌握NCBI数据库所支持的语法，通过相关的脚本文件，查询指定的研究数据。
文章首先介绍了NCBI数据库的概况，以及对研究及应用的影响。
接着介绍了NCBI数据库的使用，其分为“检索”和“查询”两种方式。
“检索”虽然不复杂，但在实际操作中可能会受到限制，而“查询”则需要用户具备一定的专业技能，并且需要花费更多的时间才能完成，因此工作者在使用时应当合理选择使用的方式。
此外，使用NCBI数据库的工作者还可以利用其他一些相关的辅助工具，如统计工具、建模工具以及模拟工具等，用于收集、分析和处理信息数据，以提高数据生产率和分析效率。
此外，有必要使用一些可靠的网络资源，不仅可以提高工作效率，还可以获得更优质的科学数据。
对于使用NCBI数据库的工作者来说，应当加强数据分析、理解数据库的结构和查询方式，并熟悉相关的统计工具和建模工具的使用，以提高分析效率；此外，还要注意网络资源的可靠性，避免出现错误信息，以求获得更优质的科学数据。
NCBI数据库是目前影响许多领域发展的一个平台，但使用它的同时也应具备相应的操作技巧，以便更有效地使用之。
因此，深入了解NCBI数据库的使用，充分发挥它的价值和作用，不但有助于工作者提高效率、节省时间，同时也会为研究及应用提供更优质的科学数据，为科学的发展作出补充。
如何在ncbi上检索
如何在ncbi上检索NCBI包括五个部分，第一部分是欢迎进入NCBI，包括NCBI的最新信息、计划与活动、读者来信、服务地址和用户评论等。
第二部分是基因序列数据库(GenBank)，包括基因库概述、检索与投稿。
第三部分是数据库服务，包括免费的PubMed检索、Entrez 检索、BLAST序列族性检索、电子邮件服务(详见本章第四节)、匿名FTP服务。
第四部分是NCBI的其它资源。
GenBank的检索在NCBI主页的第二部分点击"Searching GenBank"，即可进入GenBank的检索屏幕。
NCBI•提供了五种检索，即Entrez浏览检索、BLAST序列类似性检索、dbEST检索、dbSTS•检索和文本检索(Text Searching)。
一、Entrez浏览检索1.Entrez检索的数据库及其检索信息Entrez浏览器(Entrez Browser)可以检索以下与NCBI•链接的基因序列数据库的分子生物数据和书目文献资料。
••••(1) GenBank、EMBL、DDBJ中的DNA序列; ••••(2) SWISS-PROT、PIR、PRF、PDB中的蛋白质序列以及DNA序列数据库中翻译的蛋白质序列; ••••(3) 基因和染色体图像数据; ••••(4) PDB以及收入NCBI分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构; ••••(5) 通过PubMed检索Medline和PreMedline数据库。
••••2.Entrez检索功能••••Entrez提供了以下三种检索功能。
•• (1)自由词检索功能•••用户可以通过文本词、关键词、截词、期刊名或文献的作者检索Entrez数据库。
截词用*号，期刊名必须用Medline刊名缩写，作者姓名必须是姓在前，名在后，用首字母缩写。
••••(2)索引词表(List Terms)检索功能••••索引词表检索是当你键入检索词，Entrez•在你选定的字段中显示从该检索词开始的一个索引词表窗口，这时，你可以选择一个或几个词进行检索，这对单词拼写不准确时非常有用。
NCBI数据库的使用与功能介绍
数据下载与保存
数据下载
用户可以下载NCBI数据库中的数据，支持多种数据格式，如FASTA、 GenBank、GFF等，方便用户进行数据分析和处理。
数据保存
用户可以将检索到的数据保存到本地计算机中，方便随时查看和使用。同时， NCBI数据库还支持数据导出功能，方便用户将数据分享给其他研究人员。
数据可视化
蛋白质组学研究中的应用
蛋白质序列
NCBI数据库收录了大量蛋白质序列，为蛋白质组学研究提供了基础数据。
蛋白质功能研究
通过NCBI数据库，研究人员可以了解蛋白质的结构、相互作用和功能，从而深入探究生命活动的本质。
生物信息学研究中的应用
基因组学与蛋白质组学数据整合
NCBI数据库提供了多种生物信息学工具，可以将基因组学和蛋白质组学数据进行整合， 为系统生物学和药物研发等领域提供支持。
04
NCBI数据库的案例分析
基因组学研究中的应用
基因组测序
NCBI数据库提供了大量基因组测序数 据，包括人类、动物、植物和微生物 等物种，为基因组学研究提供了丰富 的资源。
基因注释
研究人员可以利用NCBI数据库中的基 因注释信息，了解基因的功能、位置 和表达情况，为基因功能研究和疾病 治疗提供依据。
发展
NCBI数据库不断发展壮大，推出了多个知名的子数据库和工具，如GenBank、PubMed、PubMed Central、Gene、NCBI Taxonomy等，为生物医学研究提供了全方位的信息支持。同时，NCBI数据 库也不断更新和改进检索和分析工具，提高数据质量和用户体验。
02
NCBI数据库的使用方法源自新技术与新方法的融合新技术应用
NCBI需要关注新兴技术的发展，如人工智 能、云计算等，将这些技术应用于数据处理 、分析和管理中，提高数据库的技术水平和 应用范围。
pubmed主题词检索的主要步骤
pubmed主题词检索的主要步骤
步骤一：访问PubMed数据库
打开浏览器，访问https://，进入PubMed数据库的官方网站。
步骤二：选择检索类型
根据需要，选择合适的检索类型，如文章标题、摘要、作者等。
步骤三：输入主题词
在搜索框中输入相关的主题词或关键词，例如疾病名称、药物名称等。
步骤四：设置检索条件
根据需求，设置检索条件，如时间范围、文章类型等。
步骤五：点击搜索按钮
点击搜索按钮开始检索相关的文献。
步骤六：查看检索结果
浏览PubMed数据库返回的检索结果，并根据需要进行筛选和排序。
步骤七：阅读文献摘要
点击感兴趣的文献标题，阅读文献的摘要部分，了解文献的内容和结论。
步骤八：获取全文
如有需要，点击文献页面提供的全文链接，获取完整的文献。
NCBI_功能详细介绍
NCBI_功能详细介绍NCBI（National Center for Biotechnology Information，国家生物技术信息中心）是美国国立卫生研究院（NIH）的一个部门，旨在为科学家、研究者和医生提供生物信息学数据库和工具，以促进生物医学研究和医疗实践的发展。
NCBI提供了一系列的数据库和工具，涵盖了基因组学、遗传学、生物技术和生物信息学的多个领域，为用户提供了许多功能和资源。
以下是NCBI提供的一些主要功能：1. PubMed：PubMed是一个免费的生物医学文献数据库，收录了来自全球各地的医学和生物医学研究的学术文章和论文摘要。
它是全球最大的生物医学文献数据库之一，每年更新数量庞大的文献。
研究人员、医生和学生可以使用PubMed来查找相关的研究论文，以支持他们的研究和临床实践。
3. BLAST：BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一个用于比对和分析生物序列的工具。
它可以对输入的DNA或蛋白质序列与数据库中的序列进行比对，以寻找相似的序列片段或相应的功能注释。
BLAST被广泛用于基因组学、生物技术和分子生物学的研究中。
4. Entrez：Entrez是一个综合性引擎和浏览器，用于访问NCBI提供的不同数据库中的信息。
用户可以使用Entrez工具来查找特定的文章、序列、结构、基因、文献、蛋白质、基因组、生物样本等信息，并浏览相关的文献和数据。
6. dbSNP：dbSNP是一个单核苷酸多态性数据库，记录了人类和其他物种的基因组中的单核苷酸变异信息。
它是一个重要的资源，用于研究人员研究遗传变异与疾病风险和治疗反应之间的关系，以及个体间的遗传差异。
总之，NCBI提供了许多重要的生物信息学数据库和工具，为科学家、研究者和医生提供了进行生物医学研究和临床实践所需的关键资源。
它在基因组学、遗传学、生物技术和生物信息学的研究中起到了非常重要的作用，并对生物医学领域的发展做出了巨大贡献。