linux下Rosetta从头预测软件的安装使用
RoseHA For Linux (中思软件)
RoseHA(for Linux)快速安装指引1.安装前的准备工作A.确定主机、磁盘阵列的型号。
操作系统的版本,数据库的类型版本,卷管理软件的类型版本。
网卡(网口)的数量类型及用途,RS232串行口的数量及用途。
B.确定主机与磁盘阵列,网卡,RS232串行口的物理连接正确无误。
直连的网卡,RS232串行口均应该采用交叉线连接。
关于RS232串口线的做法是:如果两端都是 9 pin 的接头, 则 pin 2 (RD), pin 3 (TD) 交叉反接, pin 5 (GND)直连, 其它 pin 不连接:DB9 DB91 GND --------- 1 GND2 RD ---------3 TD3 TD --------- 2 RD5 GND --------- 5 GNDC.确定两台主机均能访问到相同的共享磁盘设备,注意有一些卷管理软件要求同一个共享磁盘设备在两台主机上必须使用相同的设备名称。
D.确定数据库已经安装完成,并且分别在两台主机上均能够独立的正常启动和停止,客户端能够正常访问数据库。
并且两台主机数据库用户和组必须一样,以及root用户的配置文件,和一些内核参数的修改。
并配合HA安装时,服务使用的活动IP是否已经加入到了/etc/hosts文件中。
2.安装RoseHA软件包A.将RoseHA安装介质CDROM放入主机光驱,系统一般会自动mount(手工mount 光盘的命令是:mount /dev/cdrom /mnt/cdrom)。
然后进入RoseHA的安装目录。
# cd /mnt/cdrom然后, 执行命令:# rpm -i *.rpm或者是选择相应的软件包单独安装,即可完成RoseHA软件包的安装。
B.如果用户的RoseHA采用的是 *.tar.gz格式的安装包,则可以使用install.sh进行RoseHA的安装(使用 uninstall.sh 进行反安装)。
C.RoseHA的所有文件均自动安装在目录:/opt/roseha下。
Rosetta Stone安装指南
Rosetta安装指南Rosetta简要安装指南:WINDOWS版本安装步骤及注意事项1. 确定任何杀毒软体已经禁用或关闭,并且保持到所有安装任务结束. 同时使用的WINDOWS账户具有管理员权限.2. 用虚拟光驱载入[罗赛塔石碑]Rosetta. Stone.3. 3. 7. (WinMac). iso(不要再解压缩了!!!),部分系统需要去除文档名中中文部分,并且安装於全英文目录下.3. 在安装后不要使安装程式启动罗赛塔石碑. 也不要手动启动.4. 复制下载的RosettaStoneVersion3.exe文档(破解补丁)并且覆盖罗赛塔石碑安装目录下的原文档.5. 点击RosettaStoneVersion3. exe启动罗塞塔石碑程式,并用虚拟光驱载入语言包镜像. 在程式中选择安装或卸载语言包并且安装. 程式会自主查找位於虚拟光驱中的镜像并安装. 安装过程佔据大量系统资源,建议尽量关闭其他程式并且在安装过程中双手离开键盘滑鼠.6. 语言包安装完毕. 再次进入时,程式提示更新点选不更新. 遇到请示注册选择不注册,遇到请求激活选择以后激活. 不论任何时候都是一样.7. 学吧.P.S. 从老版本罗赛塔石碑升级到本版本时注意预先卸载并清空所有软体文档以及语言文档.不然在安装新版本后会报错。
Rosetta安装方法详解可以使用光盘中附的虚拟光驱软件LevinISO(下面的图标就是)。
图11. 双击启动LevinISO。
图22. 在右下角托盘中找到LevinISO(图2)。
单击,选择创建虚拟光驱3. 继续选择[1个](多个也可以)。
4. 创建完成,会自动弹出加载镜像文件的对话框。
注意:以后需要加载其他镜像文件,可以重复步骤2,选择加载镜像文件。
(图3)图35. 点击浏览,找到Rosetta的主程序安装光盘镜像(文件名:[罗赛塔石碑]Rosetta.Stone.3.3.7.(WinMac)),打开,在加载镜像文件的对话框按确定。
linux下Rosetta从头预测软件的安装使用
1、(平台:Fedora10,gcc 版本为4.3.2)安装Rosetta 需要另外一个名为scons 的软件,到下载rpm 包,在根口令下安装(输入:rpm -ivh 软件包名称)进入/,点击software,在DownloadRosetta Software 下方点击Academic Users Logon (事先注册好非商业性邮箱得到帐号与密码,我注册的是雅虎邮箱,下载的版本是3.1,rosetta3.1_Bundles软件包);进入rosetta_source 目录下,输入:scons bin mode=release,即开始安装更多相关信息参考安装手册:/manuals/archive/rosetta3.1_user_guide/(特别要注意linux 及gcc版本问题)2、运行:cd rosetta_sourcecd bin将准备好的pdb 文件(示例:1l2y.pdb)和2个碎片文件放在Bin 目录下(碎片文件用来组装蛋白质的文件,可以由Rosetta的碎片库产生,也可以自己创建。
碎片库是Rosetta 从头预测的核心,碎片用来组装蛋白质,Rosetta 中碎片文件的基本格式是:{series}{pdb}{chain}{size}_{strategy}.{depth}_{version}./AbinitioRelax.linuxgccrelease @flags -database'/home/yaoda/rosetta3.1_Bundles_FILES/rosetta_database'(这是rosetta 中命令的基本格式)flags:(Flag file 的作用是将要执行的命令参数集中到一个文件中,那么输入的时候就只需要一个命令行就行,flags 文件也需要复制在bin 目录下)-in:file:native inputs/1l2y.pdb(输入的原始文件)-in:file:frag3 inputs/aa1l2yA03_05.200_v1_3(3 个残基长度的碎片文件)-in:file:frag9 inputs/aa1l2yA09_05.200_v1_3(9 个残基长度的碎片文件)-out:nstruct 1(每次输入的pdb 文件数)-out:file:silent 1l2y_silent.out(默认输出的文件名称)-no_prof_info_in_silentout-mute core.io.database然后终端中显示整个预测过程:预测完毕,产生2个文件:1)1l2y_silent.out:内容如下(包含很多结构信息)SEQUENCE: NLYIQWLKDGGPSSGRPPPSSCORE: score vdw cenpack pair env cbeta rg hs_pair ss_pair rsigma sheet rms maxsub clashes_total clashes_bb descriptionSCORE: 19.207 0.207 -7.272 -2.443 -0.562 6.940 23.449 0.000 -1.365 -0.977 1.232 5.479 15.000 0.000 0.000 S_00000001ANNOTATED_SEQUENCE:从左到右依次是:残基序列号二级结构Phi Psi Omega Ca-x y z1 E -163.878 158.811 173.187 1.458 0.000 0.000 S_000000012 E -115.316 109.518 -179.124 3.954 2.843 0.346 S_000000013 E -118.431 162.412 172.839 6.093 3.394 -2.749 S_000000014 E -90.526 114.960 -173.298 8.367 6.146 -4.047 S_000000015 E -101.333 123.803 175.454 6.598 7.842 -6.950 S_000000016 E -76.432 123.783 -177.749 8.518 9.705 -9.650 S_000000017 L -65.809 -36.420 -177.194 6.788 12.988 -10.476 S_000000012)score.fsc(fullatom score):内容如下SEQUENCE: NLYIQWLKDGGPSSGRPPPSSCORE: score vdw cenpack pair env cbeta rg hs_pair ss_pair rsigma sheet rms maxsub clashes_total clashes_bb descriptionSCORE: 19.207 0.207 -7.272 -2.443 -0.562 6.940 23.449 0.000 -1.365 -0.977 1.232 5.479 15.000 0.000 0.000 S_00000001。
Linux终端命令软件安装教程
Linux终端命令软件安装教程在Linux操作系统中,终端命令是非常重要的工具,它可以实现各种功能和操作。
而为了满足不同的需求,我们经常需要在Linux系统中安装各种不同的终端命令软件。
本文将介绍一些常见的Linux终端命令软件的安装方法。
一、软件包管理器安装大多数Linux发行版都提供了软件包管理器来方便用户安装和升级软件。
常用的软件包管理器有apt、yum、dnf等。
下面以Debian/Ubuntu系统为例,介绍使用apt命令来安装软件的方法。
1. 打开终端命令行界面。
2. 输入以下命令更新软件源:```sudo apt update```3. 输入以下命令进行软件安装:```sudo apt install 软件名称```其中,软件名称是你需要安装的软件的名称,可以在官方网站或者其他渠道获取。
二、源码编译安装有些软件并没有提供预编译的二进制包,但是它们提供了源代码,这时我们就需要使用源码编译的方式来安装软件。
1. 下载软件源代码,并将其解压到一个目录中。
2. 打开终端命令行界面。
3. 进入源代码所在的目录,并执行以下命令:```./configuremakesudo make install```其中,./configure命令用于配置源代码文件,make命令用于编译源代码,sudo make install命令用于安装编译好的软件。
三、手动安装有些软件并没有提供软件包管理器安装或者源代码编译的方式,这时我们只能选择手动安装。
1. 下载软件的安装包,并将其解压到一个目录中。
2. 打开终端命令行界面。
3. 进入解压后的目录,并查找是否存在安装说明文件,通常为README或INSTALL。
4. 按照安装说明文件中的步骤进行安装。
四、其他注意事项1. 安装软件时,请确保你具有足够的权限。
如果需要以管理员身份进行安装,请使用sudo命令。
2. 在安装软件之前,建议先查找官方文档或者其他可靠资源,了解该软件的安装要求和注意事项。
rose在linux环境下的安装
首先将光盘放进光驱计算机—CD-ROM双击打开将三个文件复制到系统的某个文件夹下或是将光驱mount到/mnt系统工具—终端(将光驱挂载到mnt文件夹下)在终端窗口下一次键入:# mount –t iso9660 /dev/cdrom /mnt (挂载设备)# cd /mnt (进入mnt文件夹)# ls (查看mnt下的文件)安装ROSEHA,进入到mnt目录下运行# ./install.sh可检查/opt/roseha/bin里面是否有文件存在两个较为重要的文件NewPass修改密码(第一次运行需要修改密码)运行# ./NewPass按照下图进行按照提示首先User : ha (管理员的用户名) New password :密码Re-enter new password 重新输入密码在进入系统之前我们来设置一下系统的相关信息如下图所示:/etc/hosts设置完毕后重新引导系统确定starting RoseHA dearm服务启动正常在/opt/roseha/bin下运行#./hacon运行ROSEHA的管理界面进入控制界面首先敲击回车选择Connect进入系统User 是上面我们设置的用户名Password也是我们设置的密码全部输完“OK”出现如下界面说明连接正常当我们没有拿到正式的licence授权之前我们就可以先享受30天的使用期,可是也需要设置一下只要移动Tab键在HostName:处将本机的主机名和对端主机名填写正确就可以了“OK“两边机器都需要进行设置出现下图所示的License Information success说明我们可以用试用版了只要在一个月内注册正式版产品就可以了!两边的服务器都需要做相同的设置二、配置Rose HA1、管理界面的启动# hacon2、连接:进入Tools---Connect,输入Server:localhostUser:rootPassword:root3、license号输入:进入Tools---License,输入HostName:左边为本机主机名,右边为远程主机名。
linux系统安装软件教程
linux系统安装软件教程在Linux系统中,安装软件可以有多种方式,比如使用包管理器、源代码编译和二进制文件安装等。
下面是一个简单的Linux系统安装软件教程,以包管理器为例:1. 打开终端在Linux系统中,可以通过快捷键Ctrl+Alt+T打开终端。
2. 更新软件源在开始安装软件之前,建议先更新软件源以获取最新的软件包列表。
执行以下命令:```sudo apt update```3. 搜索软件包使用包管理器的搜索功能可以方便地找到需要安装的软件包。
执行以下命令进行搜索:```sudo apt search 软件名称```4. 安装软件包找到需要安装的软件包后,执行以下命令进行安装:```sudo apt install 软件名称```在安装过程中,系统会提示输入管理员密码进行验证。
输入密码后,软件包将开始下载和安装。
5. 卸载软件包如果需要卸载已安装的软件包,可以执行以下命令:```sudo apt remove 软件名称```类似地,系统会提示输入管理员密码进行验证,然后软件包将被卸载。
6. 更新已安装的软件包在系统中安装的软件包可能会有更新版本,为了保持软件的安全性和功能性,建议定期更新已安装的软件包。
执行以下命令进行更新:```sudo apt upgrade```系统会列出所有可更新的软件包,并询问是否进行更新。
确认后,系统会自动下载并安装更新。
除了使用包管理器安装软件,还可以使用其他方法,如通过源代码编译和二进制文件安装等。
这些方法较为复杂,适合有一定Linux系统经验的用户。
要了解更多详细信息,可以查阅Linux系统相关的使用手册和文档。
希望这个简单的Linux系统安装软件教程对你有所帮助!。
linux安装软件教程
linux安装软件教程Linux是一种开源的操作系统,不仅功能强大,还拥有庞大的软件资源库供用户选择。
在Linux上安装软件相比其他操作系统可能稍显复杂,但只要按照以下步骤进行,就能顺利安装你想要的软件。
第一步:确定软件包管理器Linux发行版使用不同的软件包管理器来安装和管理软件。
常见的软件包管理器有apt、yum、dnf等。
在安装软件之前,我们需要确定所使用的发行版所使用的软件包管理器。
第二步:更新软件包列表在安装软件之前,我们应该首先更新软件包列表。
打开终端窗口,并输入以下命令(以apt为例):sudo apt update这将会更新软件源中的软件包列表,保证我们安装的软件是最新的版本。
第三步:查找并安装软件接下来,在终端窗口中输入以下命令来查找需要安装的软件(以安装谷歌浏览器为例):sudo apt search google-chrome这将会列出与谷歌浏览器相关的软件包。
找到合适的软件包并记下名称,然后使用以下命令进行安装:sudo apt install package-name替换"package-name"为实际的软件包名称。
第四步:输入密码并等待安装在执行安装命令时,系统可能会要求输入管理员密码。
输入密码后,按下回车键,然后等待软件安装完成。
第五步:启动软件安装完成后,你可以在应用程序菜单中找到刚刚安装的软件,并双击打开它。
总结这篇教程介绍了在Linux系统上安装软件的步骤。
首先,我们需要确定所使用的软件包管理器,然后更新软件包列表。
接着,我们可以使用软件包管理器的搜索功能来查找并安装所需软件。
最后,输入密码等待安装完成并启动软件。
虽然Linux安装软件可能与其他操作系统不同,但只要掌握了这些基本步骤,你就能轻松地在Linux系统上安装各种软件,满足不同需求。
rosetta使用手册
rosetta使⽤⼿册Rosetta的使⽤⼿册波兰⼯业⼤学计算机科学研究所智能决策⽀持系统实验室设计的RSES系统作为可选组件,被嵌⼊其计算核⼼。
本⽂中与其相关的算法带有前缀“RSES”。
简介:本⽂件构成了技术参考了Rosetta软件⼿册。
对主要算法及其选项进⾏简要介绍,并给出相关的引⽤⽂献。
本⼿册不应孤⽴的阅读。
读者应参考相关⽂献和相关理论背景。
⼿册中使⽤通⽤的符号和术语。
本⼿册是在假定读者已具有数据挖掘和知识发现的基础。
此外,还必须了解典型的经验模型是如何实现的334。
在参考⽂献[26]中,有Rosetta应⽤的⼩例⼦,还有其如何使⽤等知识,包括对数据分类的验证。
在在Rosetta图形⽤户界⾯,相同的菜单项出现了许多不同类型的对象。
例如,所有的对象在他们的弹出式菜单项都有⼀个“注解... ”。
Rosetta图形界⾯细节:⼀个决策系统可以通过“Open”被读⼊新⼯程中,它将会出现在“Structure”的⼯程树下。
⼯程树的节点可以被收起或打开。
3⼯程项⽬:⼯程描述:项⽬对象是项⽬树顶层结构对象。
根项⽬不能从图形界⾯中删除。
⼀个项⽬可能有数个⼦项⽬。
3.1 ODBC项⽬:ODBC决策表导⼊描述:允许从各种数据源通过“开放式数据库互连”的⽅法导⼊表格数据,如电⼦表格、关系数据库等。
对话框:图1、图23.2 报告描述:这类算法输出关于项⽬的信息和元信息。
该算法函数只做简单的转换,是该算法的附加功能。
可输出XML、HTML格式3.3 注释注释包括⼀般标注信息和⼀个历史记录列表。
部分信息会⾃动⽣成,这有助于⽣成Rosetta系统⽂件。
注释还拥有⼀个⽂件名。
当使⽤保存时,该对象被保存到这个相应位置。
4 决策表信息系统和决策系统都代表相同的结构。
在表中,所有的所有属性值集以整数表⽰。
因此,信息系统在本质上可被看作⼀个整数的矩阵。
表中整数和其在模型中意义的映射关系由和每个信息系统相关的数据字典处理。
关于数据字典的描述见4.1节。
Rosetta Stone 安装说明
重要:如果你的电脑使用的是国产杀软,尤其是瑞星,请务必先禁用杀软,再安装!安装过程提示升级是请勿升级,不然会被提示为盗版而不能使用。
(软件及附带的激活补丁可能会跟国内的杀软产生冲突,属误报,绝对不是病毒,也不会对电脑产生任何影响,请放心使用)如果你下载的是rosettaruanjian.rar跟rosettaEN.rar请先解压,只解压一次,里面的iso文件不要解压了。
1.安装虚拟光驱程序(deamon),完成后屏幕右下角会多出一个红色图标即为虚拟光驱图标。
2.右击该图标,依次点击虚拟CD/DVD-ROM→设置设备参数→4台驱动器,打开我的电脑会发现多出4个驱动器盘符,我的依次是G、I、J、K3. 就用这四个虚拟驱动器依次载入所下载的四个文件,左键单击红色图标,依次选择一个盘符载入一个文件即可。
如:设备0:[G:]空载入罗塞塔安装软件设备1:[I:]空载入罗塞塔英语(美国)一级设备2:[J:]空载入罗塞塔英语(美国)二级设备3:[K:]空载入罗塞塔英语(美国)三级4. 一般安装程序会自动运行,如果没有,则可打开“我的电脑”,找到罗塞塔的光盘图标双击即可。
5. 选择安装文件夹,如C:\Program Files\Rosetta Stone\Rosetta Stone V3,记住这个位置,开始安装6. 启动罗塞塔(开始,程序,rosetta),可能会提示你更新,选择不更新,如果提示注册,选择从不注册,点击添加语言级别→继续7. 软件自动搜索载入的语言等级8. 三个语言级别都装好后,就可开始创建用户了,之间如有更新选项选择不更新,注册选项选择从不注册,产品激活选项选择“已激活的产品”,继续9. 创建用户、选择课程进入后,会有一些课程模块是灰色的,此时需要打上激活补丁。
10. 先退出罗塞塔程序,找到安装说明(必读)中的罗塞塔激活补丁程序,将该程序拷贝到罗塞塔软件的安装文件夹。
如C:\Program Files\Rosetta Stone\Rosetta Stone V3,并双击运行,点击Patch即可11. 重新打开罗塞塔程序,会提示发生轻微错误,不予理会,设置好课程就可以开始学习了!《罗赛塔石碑常见问题与解决方案》1. Windows Installer 软件包存在问题问题描述:安装接近结束时,“Rosetta Stone V3 安装程序信息”提示:"Windows Installer 软件包存在问题。
RoseMirrorHA 3.1.1 for Linux快速安装文档
RoseMirrorHA Linux 快速安装说明目录第一章安装前的准备工作 (3)1.1 系统和硬件要求 (3)1.2 依赖的软件包 (3)第二章软件的安装 (3)第三章卸载RoseMirrorHA软件包 (5)第四章软件的配置 (5)4.1 基础设置 (5)4.2 RoseMirrorHA服务启动和停止 (5)4.3 管理工具的启动 (6)4.4 配置相关应用服务 (6)..4.4.1 向导首页 (6)..4.4.2 选择应用服务类型 (7)..4.4.3 选择活动主机 (8)..4.4.4 选择备用主机 (9)..4.4.5 设置License (10)..4.4.6 选择私有网类型 (10)..4.4.7 设置私有网参数 (11)..4.4.8 设置绑定数据 (12)..4.4.9 设置虚拟IP (13)..4.4.10 设置代理参数 (14)..4.4.11 应用服务详细配置信息 (15)第一章安装前的准备工作1.1 系统和硬件要求在安装软件前,确保RoseHA、等类似的软件已经卸载;至少应该在每台主机上配置两片网卡或更多网卡,并且每片网卡的IP地址设置在不同网段。
1.2 依赖的软件包在安装RoseMirrorHA前检查相应的软件包是否安装,如果没有安装通过系统安装盘进行安装。
要正常的运行RoseMirrorHA需要安装了以下软件包:RedHat Enterprise Linux 2.1 平台compat-glibc-6.2-2.1.3.2.rpmgcc-2.96-116.7.2.rpmncurses-5.x-xx.rpmreadline-4.2-xx.rpmlibtermcap-2.0.8-xx.rpmRedHat Enterprise Linux 3.0 平台glibc-2.3.2-95.xx.rpmgcc-3.2.3-xx.rpmncurses-5.x-xx.rpmreadline-4.3-xx.rpmlibtermcap-2.0.8-xx.rpmSuse Enterprise 9.0 平台ncurses-5.2-28.rpmreadline-4.3-3.rpmlibtermcap-2.0.8-31.rpm第二章软件的安装A、将RoseMirrorHA安装介质CDROM放入主机光驱,然后使用Mount命令挂载CDROM,如:# mount /dev/cdrom /mnt/cdrom然后,将安装包拷贝到临时目录进行解压缩。
ROSE+HA双机软件全程图解安装配置(基于linux下)
如何在Linux环境下安装Rose HA。
本文假设环境为Linux操作系统,采用9.2版本的oracle 数据库。
下面我们看看,在Linux Oracle环境下如何安装和配置Rose HA。
首先将光盘放进光驱计算机— CD-ROM 双击打开将三个文件复制到系统的某个文件夹下或是将将光驱mount 到/mnt 下。
系统工具—终端(将光驱挂载到mnt 文件夹下)在终端窗口下一次键入:# mkdir -p /mnt/cdrom --创建/mnt/cdrom目录#mount /dev/cdrom /mnt/cdrom—将CD挂入/mnt/cdrom文件夹内# cd /mnt/cdrom (进入mnt的cdrom 文件夹)# ls ( 查看mnt 下的文件)安装ROSEHA ,进入到mnt 的cdrom目录下运行# ./install.sh可检查/opt/roseha/bin 面是否有文件存在两个较为重要的文件NewPass 修改密码(第一次运行需要修改密码)运行# ./NewPass 按照下图进行按照提示首先User : ( 管理员的用户名) New password : 密码Re-enter new password 重新输入密码到这里,Rose HA的安装基本结束,但是不要心急,我们会还需要一些步骤来设置Rose HA 的初始化。
初始设置Rose软件在进入系统之前然我们来设置一下系统的相关信息如下图所示:/etc/hosts注释:将两台机器的心跳线网址输入,例如:10.0.0.1 HD110.0.0.2 HD2再输入两台机器对外网的地址,例如:192.168.1.2 server1192.168.1.3 server2再输入两台机器对外的虚拟IP地址,例如:192.168.1.1 server注意:在输入的时候心跳网址要在同一IP段内,对外IP和虚拟IP必须在同一IP段。
设置完毕后重新引导系统确定starting RoseHA dearm 服务启动正常在/opt/roseha/bin 下运行# ./hacon 运行ROSEHA 的管理界面进入控制界面首先敲击回车选择Connect 进入系统,User 是上面我们设置的用户名Password 也是我们设置的密码全部输完“ OK”出现如下界面说明连接正常当我们没有拿到正式的licence 授权之前我们需要在licence设置里面把hostid号抄下来,两台机器都要抄,然后在ROSEHA序列号申请表上面把相关的信息录入并且传给负责人。
linux系统如何安装软件(详细文字教程)
linux系统如何安装软件 (详细文字教程)在Linux中安装软件时,我们经常要考虑到这样几个个问题:(1).怎样安装软件;(2).软件安装在什么地方;(3).如何卸载删除不要的软件......下面,我们就一起来认识一下这些方面的问题。
一.认识Linu x应用软件安装包通常Linu x应用软件的安装包有三种:1) tar包,如softw are-1.2.3-1.tar.gz。
它是使用UN IX系统的打包工具t ar打包的。
2) rpm包,如softw are-1.2.3-1.i386.rpm。
它是Redh at Linux提供的一种包封装格式。
(现在用的全称叫RPMPackag e Manage r,以前叫Red hat Packag e Manage r)3) dpkg包,如softw are-1.2.3-1.deb。
它是Deba in Linux提供的一种包封装格式。
而且,大多数Lin ux应用软件包的命名也有一定的规律,它遵循:名称-版本-修正版-类型例如:1) softwa re-1.2.3-1.tar.gz 意味着:软件名称:softwa re版本号:1.2.3修正版本:1类型:tar.gz,说明是一个t ar包。
2) sfotwa re-1.2.3-1.i386.rpm软件名称:softwa re版本号:1.2.3修正版本:1可用平台:i386,适用于Int el 80x86平台。
类型:rpm,说明是一个r pm包。
注:由于rpm格式的通常是已编译的程序,所以需指明平台。
在后面会详细说明。
而softw are-1.2.3-1.deb就不用再说了吧!大家自己练习一下。
二、了解包里的内容:一个Linu x应用程序的软件包中可以包含两种不同的内容:1) 一种就是可执行文件,也就是解开包后就可以直接运行的。
Linux下RoseMirrorHA实施文档
Enter键进行下一步安装
8 RoseData Confidential
指定软件使用的字符集,可以按照操作系统字
符集设置进行选择,按Enter键进行下一步安 装
9 RoseData Confidential
选择主机支持使用NIS服务的环境,缺省为
None,按Enter键进行下一步安装
10 RoseData Confidential
4.卸载RoseMirrorHA 软件包
20 RoseData Confidential
进入到软件包的安装目录,运行uninstall脚本
即可卸载RoseMirrorHA软件包
21 RoseData Confidential
选择需要卸载的软件模块,即可卸载完成
22 RoseData Confidential
RoseMirrorHA安装程序将在安装过程中创建两个用户 组:rradmin和rrmonitor。 rradmin用户组:root用户将由安装程序自动添加到 此用户组中,此用户组中的所有用户均具有 RoseMirrorHA管理员权限。 rrmonitor用户组:rrmonitor用户组中的所有用户均 具有RoseMirrorHA监控权限,但无管理权限,即无法 对RoseMirrorHA中的对象、资源进行修改,新增,删 除等操作。
5 RoseData Confidential
进入到安装目录,执行install脚本进行安装,
选择需要安装的软件模块进行安装
6 RoseData Confidential
选择需要安装的软件模块,按Enter键进行下
一步安装
7 RoseData Confidential
指定软件安装路径,缺省安装到/opt/,按
如何在Linux终端中安装软件和程序
如何在Linux终端中安装软件和程序在Linux终端中安装软件和程序可以通过多种方法实现。
本文将介绍三种常用的安装方式:使用包管理器、使用源代码进行编译安装以及使用二进制文件进行安装。
第一种方式是使用包管理器进行软件安装。
在大多数Linux发行版中,都有自带的包管理器,如Debian和Ubuntu使用的是apt,CentOS和Fedora使用的是yum。
首先,打开终端,并以管理员权限登录。
然后,使用相应的命令更新包管理器的软件源,如apt-get update或yum update。
接下来,可以使用包管理器的搜索命令来查找需要安装的软件,如apt-cache search软件名或yum search软件名。
最后,使用安装命令来进行安装,如apt-get install软件名或yum install软件名。
包管理器会自动解析软件包的依赖关系并进行安装,安装完成后即可在终端中使用该软件。
第二种方式是使用源代码进行编译安装。
有些软件在官方软件源中可能没有提供或版本较旧,此时可以选择通过源代码进行编译安装。
首先,从官方网站或开源社区下载源代码包,并解压到本地目录。
然后,打开终端,进入源代码目录,并按照官方提供的文档进行编译和安装。
通常包括以下步骤:配置编译选项(./configure),编译代码(make)和安装程序(make install)。
编译安装时需要注意查看终端输出的错误信息,缺少依赖库或配置错误可能导致编译失败。
完成编译安装后,即可在终端中使用该软件。
第三种方式是使用二进制文件进行安装。
有些软件官方提供了预编译的二进制文件,可以直接下载并安装。
通常在官方网站的下载页面可以找到适用于不同Linux发行版和硬件架构的二进制文件。
首先,打开终端,进入下载目录,并使用wget或curl等命令下载二进制文件。
然后,使用解压命令解压文件,并将可执行文件复制到系统的可执行路径下(如/usr/bin)。
最后,可以在终端中直接使用该软件。
rosetta罗塞塔安装使用必读
如果您对使用罗塞塔不熟悉,对安装不熟悉,请耐心参照本文:云端软件适用平台:Windows 2000 / xp / 2003/ Vista / 2008 / Win7 32位如果您使用的是32位win7,那么云端可以使用,需要右键单击云端图标,选择以管理员身份运行即可;如果您使用的是64位win7,那么现在这个版本的云端,将无法使用。
需要更新最新版本的云端。
或回到其他系统。
先安装好,云端软件!然后双击,下载好的罗塞塔英语,我们已英式英语为例(我们提供的罗塞塔系列,都是这么安装)双击后,会出现以上画面,先点击更改解压位置,看看解压的硬盘,剩余空间是否足够点击后,会出现以下画面,这图里的软件解压位置,意思就是,罗塞塔英语将会被安装在D盘CloudCache文件夹,15.11G是可用剩余空间/54.99G是硬盘总大小,一般最好要6G剩余空间以上。
如果剩余空间不够,罗塞塔将会中断安装,那就点击那个向下的箭头,选择其他盘安装。
确定剩余空间足够,点击开始解压等到解压完成100%成功然后双击打开云端软件,在我的软件内,找到解压好的罗塞塔英语(RosettaStoneVersion3)双击就能使用.如果在我的软件内没有找到,解压好的罗塞塔,请去安装盘D盘CloudCache文件夹,里面有个这样的文件,双击,选择导入然后等待导入成功,再去云端内-我的软件-肯定会有导入后的罗塞塔系列了。
注意:如果你已经在云端内,安装了2~3个软件,一下子无法分出,哪个是新安装的软件,请找到这个.lva文件,因为它的大小跟新安装的软件,大小是差不多的,所以你可以很容易的指导是哪个了。
比如罗塞塔英式英语下载好的软件是 1.2G,那它的.Lva文件,是1.26G,基本是差不多大的,依此类推。
技术支持QQ:744142802 旺旺:云的彼端sunny罗塞塔使用介绍:罗塞塔美式英语1~5级,英式英语1~3级,区别是,发音不同,内容一样的,但美式英语内容更多,以美语为例:1~2级是基础入门。
Rosetta Stone软件详细安装教程
为了照顾不同朋友的需要,以下安装教程中,每一个安装步骤都截图演示了,只要根据教程一步一步操作就可以。
因为安装教程很详细,看似繁杂,但并不复杂的!请耐心看一遍。
如果觉得安装麻烦,可以直接联系我远程帮您安装。
一、安装虚拟光驱。
(已经安装过虚拟光驱的,不用再安装。
)下载“虚拟光驱.zip”之后,解压缩文件,双击“虚拟光驱.exe”。
1.下一步2.我同意3.请选择“免费许可”4.记得不要去掉“文件关联”的勾!(请根据下图把中间四个的勾去掉!)5.允许MountSpace 使用加载统计6.安装位置可自行选择,可以不安装在C盘。
7.安装中8.安装完成(备注;虚拟光驱安装完后如果提示有新版本,可以更新,也可以取消,不更新。
)二、运行虚拟光驱,如图。
选择“添加映像”。
(下图最左边那个)之后会弹出对话框,让您选择语言文件。
找到您语言文件所在的位置,单击语言文件,然后点击右下角“打开”按钮。
(是载入语言文件,iso后缀的!)添加完毕后,请双击所添加的文件,让它在“最近使用的映像”出现,这样就把语言文件加载到虚拟光驱里面了,以备之后安装语言文件。
(注意:虚拟光驱每次只能打开1个镜像文件,所以之后安装语言级别时,请1级1级分别安装。
)另外一个使用虚拟光驱的方法:如果下载完的语言文件直接以虚拟光驱的格式显示,如下图(而不是压缩包格式显示),则可以直接双击语言文件,需要安装哪一级别,就双击打开哪一级别即可。
三、安装罗赛塔石碑的主程序文件1.打开文件所在的文件夹,找到“【主程序】RosettaStone3.4.7.rar”压缩包,右击解压缩。
(解压缩时,请选择“解压到当前文件夹”)2.解压之后,选择“Rosetta Stone3.4.7”,双击进行安装。
(请注意:是双击下图中的第一个文件“Rosetta Stone 3.4.7.exe”)3.双击后,出现如下对话框,单击“确定”。
(除了中文页面之外,还有其它7种语言页面可供选择)。
RoseHA 8.8 for Linux快速安装说明
目录一安装前准备工作 (2)1RoseHA集群的拓扑结构 (2)2安装前的注意事项 (3)二软件的安装 (6)三卸载RoseHA软件 (6)四软件的配置 (7)1启动RoseHA的服务 (7)2 设置RoseHA GUI的用户名和口令 (7)3 获取License (7)4启动管理工具 (8)5连接HA服务 (9)6 设置License (10)7创建心跳 (12)8获取网卡信息 (14)9配置应用服务 (16)10手动测试 (22)五验证RoseHA的配置 (24)1手工切换测试 (25)2关机测试 (25)3拔线测试(公网) (25)4杀进程测试 (26)一安装前准备工作1 RoseHA集群的拓扑结构RoseHA集群环境的拓扑结构,如下图所示。
如上图所示,硬件服务器A和B,1台磁盘阵列;在2台服务器上分别部署操作系统和应用服务,操作系统和应用服务按照相同的方式部署,并且应用服务的数据存放至磁盘整列(共享存储)。
确认两台服务器上应用服务分别能够正常启动、停止、运行之后,再在两台服务器上部署RoseHA集群软件,以实现RoseHA 保护应用服务连续工作。
每台服务器至少配置2片以上物理网卡,服务器之间推荐配置2条以上的直连心跳,具体的接入方式说明如下。
如每台服务器有3片以上的物理网卡:两台服务器之间,建议使用2条网线直连做冗余的心跳。
如果物理网卡条件允许还可以再添加1条直连的RS232串口心跳线,以上实现不同类型的心跳通信,提高心跳通信的可靠性。
如每台服务器仅有2片物理网卡:每台服务器之间,使用1条网线直连作为1条心跳;并且,需在添加1条直连的RS232串口心跳线,以实现冗余的直连心跳。
每台服务器的公网网线接入局域网中的网络交换机(如果物理条件允许,每台服务器公网接入不同的网络交换机,以防止单个网络交换机故障导致整个集群不可用)。
服务器1:网卡一地址设置:10.0.0.1 255.0.0.0(心跳线网卡)网卡二地址设置:192.168.3.243 255.0.0.0(数据网卡,地址为外网地址)主机名为:suse1服务器2:网卡一地址设置:10.0.0.2 255.0.0.0(心跳线网卡)网卡二地址设置:192.168.3.189 255.0.0.0(数据网卡,地址为外网地址)主机名为:suse2Active IP地址设置为:192.168.3.1992 安装前注意事项A.在实施前,请先备份数据;以免出现异常情况,引起数据安全风险。
RoseTTAFold安装
4. 环境配置 (1). 数据库调用 由于数据库太大(~1.5T),使用公用数据库软链接调用 IP: 172.16.2.207 $ ln -s /data0/wangq/Databases/bfd [target dir] $ ln -s /data0/wangq/Databases/pdb100 [target dir] $ ln -s /data0/wangq/Databases/UniRef30 [target dir] (2). Psipred运行报错 https:///wq242424/p/15037069.html
5. 运行
1 run_[pyrosetta, e2e]_ver.sh input.fa [dir]
LOG: Running Hhblits Running PSIPRED
Running hhsearch Predicting distance and orientations Running parallel RosettaTR.py Running DeepAccNet-msa Picking final models Final models saved in: ./model Done
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1、(平台:Fedora10,gcc 版本为4.3.2)
安装Rosetta 需要另外一个名为scons 的软件,到
下载rpm 包,在根口令下安装(输入:rpm -ivh 软件包名称)
进入/,点击software,在Download
Rosetta Software 下方点击Academic Users Logon (事先注册好非商业性邮箱得到帐号与
密码,我注册的是雅虎邮箱,下载的版本是3.1,rosetta3.1_Bundles软件包);
进入rosetta_source 目录下,输入:scons bin mode=release,即开始安装
更多相关信息参考安装手册:
/manuals/archive/rosetta3.1_user_guide/(特别要注意
linux 及gcc版本问题)
2、运行:cd rosetta_source
cd bin
将准备好的pdb 文件(示例:1l2y.pdb)和2个碎片文件放在Bin 目录下(碎片文件用来组装蛋白质的文件,可以由Rosetta的碎片库产生,也可以自己创建。
碎片库是Rosetta 从头预测的核心,碎片用来组装蛋白质,Rosetta 中碎片文件的基本格式是:
{series}{pdb}{chain}{size}_{strategy}.{depth}_{version}
./AbinitioRelax.linuxgccrelease @flags -database
'/home/yaoda/rosetta3.1_Bundles_FILES/rosetta_database'
(这是rosetta 中命令的基本格式)
flags:(Flag file 的作用是将要执行的命令参数集中到一个文件中,那么输入的时候就只
需要一个命令行就行,flags 文件也需要复制在bin 目录下)
-in:file:native inputs/1l2y.pdb(输入的原始文件)
-in:file:frag3 inputs/aa1l2yA03_05.200_v1_3(3 个残基长度的碎片文件)
-in:file:frag9 inputs/aa1l2yA09_05.200_v1_3(9 个残基长度的碎片文件)
-out:nstruct 1(每次输入的pdb 文件数)
-out:file:silent 1l2y_silent.out(默认输出的文件名称)
-no_prof_info_in_silentout
-mute core.io.database
然后终端中显示整个预测过程:
预测完毕,产生2个文件:
1)1l2y_silent.out:内容如下(包含很多结构信息)
SEQUENCE: NLYIQWLKDGGPSSGRPPPS
SCORE: score vdw cenpack pair env cbeta rg hs_pair ss_pair rsigma sheet rms maxsub clashes_total clashes_bb description
SCORE: 19.207 0.207 -7.272 -2.443 -0.562 6.940 23.449 0.000 -1.365 -0.977 1.232 5.479 15.000 0.000 0.000 S_00000001
ANNOTATED_SEQUENCE:
从左到右依次是:
残基序列号二级结构Phi Psi Omega Ca-x y z
1 E -163.878 158.811 173.187 1.458 0.000 0.000 S_00000001
2 E -115.316 109.518 -179.124 3.954 2.84
3 0.346 S_00000001
3 E -118.431 162.412 172.839 6.093 3.39
4 -2.749 S_00000001
4 E -90.526 114.960 -173.298 8.367 6.146 -4.047 S_00000001
5 E -101.333 123.803 175.454 6.598 7.842 -6.950 S_00000001
6 E -76.432 123.783 -177.749 8.518 9.705 -9.650 S_00000001
7 L -65.809 -36.420 -177.194 6.788 12.988 -10.476 S_00000001
2)score.fsc(fullatom score):内容如下
SEQUENCE: NLYIQWLKDGGPSSGRPPPS
SCORE: score vdw cenpack pair env cbeta rg hs_pair ss_pair rsigma sheet rms maxsub clashes_total clashes_bb description
SCORE: 19.207 0.207 -7.272 -2.443 -0.562 6.940 23.449 0.000 -1.365 -0.977 1.232 5.479 15.000 0.000 0.000 S_00000001。