芥菜型油菜A09染色体BAC重叠群的构建及分析

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２３６
ＣＲＯＰＲＥＳＥＡＲＣＨ
２０１４，２８（３）
芥菜型油菜Ａ０９染色体ＢＡＣ重叠群的构建及分析
刘旭东，陆赢，刘显军，胡学芳，徐海鹏，刘芳瑛，刘忠松
（湖南农业大学油料作物研究所，长沙４１０１２８）摘要：利用定位在芥菜型油菜Ａ０９染色体上的分子标记对芥菜型油菜（Ｂｒａｓｓｉｃａ皿Ｍｅ筛选出７２５个ＢＡＣ，测定了３１５个ＢＡＣ的末端序列，获得５６４条ＢＡＣ末端序列，ＢＬＡＳＴ分析表明这些末端序列对应白菜（Ｂｒａｓｓｉｃａｒａｐａ）基因组序列支架４５、支架８１、支架４０，支架１３４、支架１４５和支架５９的同源区域，构建了芥菜型油菜Ａ０９染色体大约６．３Ｍｂ的ＢＡＣ重叠群，为芥菜型油菜Ａ０９染色体物理图谱构建奠定
ｐａ’ Ｓｇｅｎｏｍｉｃｓｅｑｕｅｎｃｅ
，
ｓｃａｆｆｏｌｄ４５，ｓｃｆａｆｏｌｄ８１，ｓｃａｆｆｏｌｄ４０，ｓｃｆａｆｏｌｄ１３４，ｓｃｆａｆｏｌｄ１３５ａｎｄｓｃｆａｆｏｌｄ５９．ＴｈｅＢ．ｊｕ，￣ｅａＢＡＣ
ｃｏｎｔｉｇｓ，ａｂｏｕｔ６．３Ｍｂｉｎｌｅｎｇｔｈｉｎｔｏｔａｌ，ｗｅｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ，ｗｈｉｃｈｐｒｏｖｉｄｅｄｂａｓｉｓｆｏｒｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎｏｆｐｈｙｓｉｃａｌｍａｐｏｆｃｈｒｏｍｏ —
（ＯｉｌｓｅｅｄＣｒｏｐｓＩｎｓｔｉｔｕｔｅ，ＨｕｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｓｈａ，Ｈｕｎａｎ４１０１２８，Ｃｈｉｎａ）
ＣｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎａｎｄＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＢＡＣＣｏｎｔｉｇｓｏｎｔｈｅ
ＣｈｒｏｍｏｓｏｍｅＡ０９ｉｎＢｒａｓｓｉｃａｊｕｎｃｅａ
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙ．ｍａｒｋｅｒｓｌｏｃａｔｅｄｏｎｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅＡ０９ｏｆＢ．ｊｕｎｃｅａｗｅｒｅｕｓｅｄｔｏｓｃｒｅｅｎＺＢｊｕＨＢＡＣｌｉｂｒａｒｙｂｙＰＣＲ
ｗａｌｋｉｎｇｓｃｒｅｅｎｉｎｇ．７２５ＢＡＣｓｗｅｒｅｓｃｒｅｅｎｅｄｏｕｔ，ｅｎｄｓｅｑｕｅｎｃｅｏｆ３１５ＢＡＣｓｗｅｒｅｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ，ａｎｄ５４Ｂ６ＥＳｓｗｅｒｅ
了基础染色体；ＢＡＣ重叠群；ＰＣＲ步移筛选中图分类号：￥５６５．４０３．２；Ｑ７８文献标识码：Ａ
ＤＯｌ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００１．５２８０．２０１４．０３．０２文章编号：１００１－５２８０｛２０１４）０３－０２３６０６－
ｇａｉｎｅｄ．ＴｈｅＢＬＡＳＴａｎａｌｙｓｉｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｏｓｅＢＡＣｃｏｎｔｉｇｓｗｅｒｅｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇｔｏｓｅｖｅｎｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓｒｅｇｉｏｎｓｏｆＢｒａｓｓｉｃａｒａ —
ＬＩＵＸｕ — ｄｏｎｇ，ＬＵＹｉｎｇ，ＬＩＵＸｉａｎ — ｊｕｎ，ＨＵＸｕｅ・ｆａｎｇ，ＸＵＨａｌ — ｐｅｎｇ，ＬＩＵＦａｎｇ — ｙｉｎｇ，ＬＩＵＺｈｏｎｇ — ｓｏｎｇ
ｓｏｍｅＡ０９ｏｆＢ．￡，ｅ Ⅱ ．
Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｂｒａｓｓｉｃａｃｅ。；Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ；ＢＡＣｃｏｎｔｉｇｓ；ＰＣＲｗａｌｋｉｎｇｓｃｒｅｅｎｉｎｇ