实验十二质粒DNA的小量制备、电泳检测及细菌转化

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实验十二质粒DNA的小量制备、电泳检测及细菌转化
Ⅰ. 质粒DNA的小量制备
一实验目的
学习并把握质粒的小量制备技术。

二实验材料和用具
菌种:DH5α/pUC19
培育基:LB:Tryptone 1%,Yeast Extract %,NaCl 1%,
(Agar 2%);120℃灭菌20min。

D0001碧云天质粒小量抽提试剂盒(或其它公司的产品)
恒温培育箱、恒温摇床、超净工作台、台式高速离心机、台式小型振荡仪、EP管(Eppendorf管,微量离心管)、加样器、吸头等。

三原理
实验采纳国产的质粒小量抽提试剂盒。

它是一种新型的离子互换柱,在特定的条件下,使质粒能在离心过柱的刹时,结合到质粒纯化柱上,在必然条件下又能将质粒充分洗脱,从而实现质粒的快速纯化。

而且在提取进程中,无需酚-氯仿抽提、无需酒精沉淀,可在较短时刻内完成质粒的提取和纯化。

四实验内容
1.细菌培育及菌体的收成。

2.用试剂盒进行小量质粒制备。

五实验步骤
1. 将菌株接种到液体LB培育基中,加入氨苄青霉素至100μg/ml,150rpm振荡16h;
2. 吸取培育菌液与离心管中,13000rpm室温下离心2min。

倒掉上清,然后倒置于吸水纸
上,使液体流尽;
3. 加入150μl溶液Ⅰ,vortex或弹起沉淀,使完全散开,无絮块。

4. 加入200μl溶液Ⅱ,倒置离心管6~8次,使细菌完全裂解,溶液透明,注意不能振荡;
5. 加入500μl溶液Ⅲ,倒置6~8次,可见白色絮状物产生;
6. 13000rpm离心10min。

离心时预备好质粒纯化柱及最后的质粒搜集管;
7. 直接将上清液倒入质粒纯化柱,13000rpm离心1min,使质粒结合于纯化柱上;
8. 倒弃搜集管内的液体,在质粒纯化柱内加入750μl溶液Ⅳ,13000rpm离心1min,洗去
杂质;
9. 倒弃搜集管内液体,13000rpm离心1min,除去残留液体;
10. 将质粒纯化柱放在质粒搜集管上,加50ul溶液Ⅴ至管内柱面上,放置1min;
11. 13000rpm离心1min,所得液体确实是质粒。

质粒于-20℃冰箱保藏备用。

六注意事项
1.在利用前,在溶液Ⅳ(洗涤液)加入40ml无水乙醇或43ml95%乙醇,然后在瓶盖
上作好记号。

2.溶液Ⅱ在温度较低时,可能会产生沉淀,需先用水浴加热溶解,混匀后再利用。


液Ⅱ易被空气中的CO2酸化,用完后应当即盖紧瓶盖。

七试探题
1.加入溶液Ⅱ后,什么缘故不能猛烈振荡?
附录一:pUC19图谱
Ⅱ. 质粒DNA的电泳检测
一实验目的
学习并把握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的技术。

二实验材料
琼脂糖,TAE缓冲液,加样缓冲液,溴化乙锭(EB),标准分子量Marker
电泳仪、稳压电源、凝胶电泳成像仪等
三实验原理
琼脂糖电泳或聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离、鉴定和纯化DNA片段的有效方式。

琼脂糖凝胶的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范围较广。

用各类浓度的琼脂糖凝胶可分离长度200bp~50kb的DNA.。

琼脂糖凝胶通常采纳水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。

直接用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙锭进行染色,可确信DNA在凝胶中的位置。

四实验内容
对所提取的质粒DNA样品进行电泳检测。

五实验步骤
1. 制胶(见图3)
(1) 胶模两头用胶带封严,架好梳子备用;
(2) 称取的琼脂糖于100ml烧杯中,加入20mlTAE,加热熔化至无颗粒状琼脂糖,冷却
到60℃左右加入EB(终浓度μg/ml),摇匀,即倒入胶模中凝固30min以上;
(3) 临用前,撕去封口胶带,放入电泳槽中,倒入适量的电泳缓冲液TAE(淹过胶面),
拔取梳子备用。

2. 样品预备
取已提取好的质粒DNA 5μl于500μl指管中,加入1μl的加样缓冲液,混匀;
3. 电泳
(1) 将样品和5μl标准分子质量别离点样到梳孔中;
(2) 恒压50v,电泳60分钟左右;
(3) 电泳终止后关闭电源,掏出凝胶,用凝胶成像仪进行摄影和记录。

图3 灌制水平琼脂糖凝胶
六实验结果
将质粒DNA条带与DNA MW Marker进行比对,对证粒提取结果进行分析。

七注意事项
溴化乙锭是强诱变剂,并有中度毒性,取用含有这一染料的溶液时务必戴上手套,这些溶液经利用后应按下面介绍的方式进行净化处置。

附录一
溴化乙锭稀溶液的处置
(适用于含有 g/ml的溴化乙锭的电泳缓冲液)
方式一
1.每100ml溶液中加入Amberlite XAD-16,这是一种非离子型多聚吸附剂,可向Rohm
& Haas公司购买;
2.于室温放置12小时,不时摇动;
3.用Whatman 1滤纸过滤溶液,抛弃滤液;
4.用塑料袋封装滤纸和Amberlite 树脂,作为有害废物予以抛弃。

方式二
1.每100ml溶液中加入100mg粉状活性炭;
2.于室温放置1小时,不时摇动;
3.用Whatman 1号滤纸过滤溶液,抛弃滤液;
4.用塑料袋封装滤纸和活性炭,作为有害废物予以抛弃。

附录二
1. 电泳缓冲液
Tris-乙酸(TAE):L Tris-乙酸,L EDTA。

浓储藏液液(50×TAE):每升含有242g Tris碱,冰乙酸,10ml L EDTA()
2. L EDTA()
在80ml蒸馏水中加入EDTA-Na·2H2O,在磁力搅拌器上猛烈搅拌,用NaOH调剂溶液的pH值至,然后定容至1000ml,分装后灭菌备用。

Ⅲ大肠杆菌的转化实验
一实验目的
学习并把握大肠杆菌感受态细胞的制备及外源基因导入细胞的技术。

二实验材料和用具
菌种:DH5α;
质粒:pUC19;
培育基:LB:
1.LB液体试管:5ml/管;
2.LB液体三角瓶:20ml/250ml三角瓶;
3.LB+Amp平板:Ampicillin 加量100μg/ml;
器材:恒温培育箱、恒温摇床、离心机、超净工作台、高压蒸汽灭菌锅、涂布棒、EP 管、
可调移液器、吸头等。

三实验原理
转化活性是检测质粒生物活性的重要指标。

用于转化的受体细胞一样是限制-修饰系统缺点的变异株,以避免对外源DNA的切割。

质粒可否进入受体细胞取决于该细胞是不是处于容易吸收外源DNA的感受态。

细胞的感受态能够通过理化因素诱导产生。

大肠杆菌是经常使用的受体菌,其感受态一样是通过用CaCl2在0℃条件下处置细胞而形成。

细胞处于0℃的CaCl2低渗溶液中,会膨胀成球形,细胞膜的通透性发生改变,转化混合物中的质粒DNA 形成抗Dnase的羟基-钙磷酸复合粘附于细胞表面,经42℃短时刻热激处置,增进细胞吸收DNA复合物,在LB培育基上培育数小时后,球形细胞恢复并增殖,在选择培育基上即可取得所需的转化子。

四实验内容
1.制备DH5α的感受态细胞;
2.进行质粒pUC19的转化
五操作步骤
1. 菌种在LB液体培育基中活化,37℃,150rpm振荡培育留宿;
2. 转接到新鲜LB液体培育基中,接种量5%;
3. 37℃,150rpm培育至OD600=~;
4. 将培育液放入冰浴冷却10min;
5. 取培育液于6500rpm离心5min,弃上清液;
6. 加冰凉CaCl2溶液(50mmol/LCaCl2,10mmol/L Tris,),用混匀器混匀或用手指弹离
心管混匀;
7. 将离心管置于冰浴45min;
8. 6500rpm 5min离心搜集细胞;
9. 将细胞警惕悬浮于冰凉CaCl2溶液中(用移液器警惕混匀);
10. 加1 l质粒,警惕混匀,置冰浴45min;
11. 将离心管置于42℃恒温水浴热处置2min(准确!);
12. 加1mlLB液体培育基后于37℃、150rpm振荡培育1h;
13. 取培育液涂布至LB+Amp平板上;
14. 将平板倒置于37℃恒温培育箱中培育留宿。

六实验结果
观看转化结果,并进行分析。

七试探题
1. 本实验成功的关键是什么?
2. 什么是感受态细胞,用什么方式取得感受态细胞?
3. 本实验中转化的原理是什么?pUC19质粒有何特点?。

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