一种用最近邻检索实现的蛋白质亚细胞定位预测方法[发明专利]

专利名称：一种用最近邻检索实现的蛋白质亚细胞定位预测方法
专利类型：发明专利
发明人：薛卫,王雄飞,赵南,任守纲
申请号：CN201510411973.9
申请日：20150714
公开号：CN105046106A
公开日：
20151111
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：一种用最近邻检索实现的蛋白质亚细胞定位预测方法，该方法包括以下步骤：（1）、以AAC特征向量作为蛋白序列的特征，用LSH方法将训练集中的各蛋白序列的AAC特征向量存放在多个哈希表中；（2）、预测时，用LSH方法计算出目标序列AAC特征向量在每一个哈希表中对应的哈希值，得到相似序列向量的集合；（3）、从得到的相似序列向量的集合中选取离目标序列AAC特征向量欧氏距离最近的Q个向量，用全局比对动态规划法计算目标序列AAC特征向量与前述Q个向量的向量间蛋白序列期望距离，将Q个向量中与目标序列期望距离最高的序列蛋白对应区间作为预测区间。

申请人：南京农业大学
地址：211225 江苏省南京市溧水区白马镇国家农业科技园南京农业大学基地
国籍：CN
代理机构：南京天华专利代理有限责任公司
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