外文译文 鉴定一个非天然氨基酸中细菌铁载体的结构

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酶催化中心 非天然氨基酸

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非天然氨基酸是指不常见于自然界中的氨基酸。

acutalibacteraceae 中文

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acutalibacteraceae 中文Acutalibacteraceae(真杆菌科)Acutalibacteraceae是真杆菌目(Acidimicrobiales)中一科细菌,该科细菌的特点和分类地位受到科学界的广泛关注。

本文将介绍Acutalibacteraceae的分类、形态特征、生态学意义和研究进展。

一、分类Acutalibacteraceae是真杆菌目中的一科,目前已发现的属包括Acutalibacter、Georgenia和Zygomonas三个。

这些属的分类地位仍有争议,有学者根据16S rRNA基因序列进行系统发育分析,提出了将Acutalibacter和Zygomonas合并为一个属的建议。

未来的研究将进一步明确Acutalibacteraceae的分类地位。

二、形态特征Acutalibacteraceae的细菌是革兰氏阳性的厌氧菌,细胞呈直杆状。

细胞壁主要由肽聚糖和胆固醇构成,使得细菌在某些环境条件下具有高温和低pH的耐受能力。

在培养基上观察到的菌落通常呈乳黄或灰白色。

此外,Acutalibacteraceae的细胞内还发现有颗粒状的聚合物,可能与其生活方式和生态学意义相关。

三、生态学意义Acutalibacteraceae的细菌在自然环境中广泛存在,包括土壤、水体和肠道等生境。

它们对环境中的有机物分解和矿物质转化具有重要作用。

研究发现Acutalibacteraceae中的一些细菌能够利用复杂的多糖类物质,如纤维素和半纤维素,参与到生物地球化学循环中。

此外,Acutalibacteraceae的细菌还能够产生一些有益的代谢产物,如酸和酶等,对环境中其他微生物的生长和代谢有一定影响。

四、研究进展对Acutalibacteraceae的研究主要集中在菌株的分离与鉴定、生物学特性的研究和生态功能的解析等方面。

近年来,随着高通量测序技术的发展,基于其16S rRNA基因的环境DNA测序分析为Acutalibacteraceae的研究提供了新的方法和思路。

acutalibacteraceae 中文

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Acutalibacteraceae是一类细菌的科,属于拟杆菌目,Rdp本人I亚目,RdpI小亚目,Acutalibacterales科。

这类细菌通常具有革兰氏阴性细胞壁结构,是一类广泛存在于自然界中的微生物。

以下是有关Acutalibacteraceae的一些重要信息:1. 分类与命名Acutalibacteraceae是根据其特征和进化关系进行分类的。

该科下包括了一些重要的细菌属,如Acutalibacter,Aliidongia等。

这些细菌在形态、生理和生态特征上有一定的相似性,因此被归类到同一科中。

2. 形态特征Acutalibacteraceae细菌的形态多样,有些是直线状,有些是弯曲的,而且在培养基上生长的菌落也有所不同。

这些细菌的形态特征对于其鉴定和分类都具有重要意义。

3. 生理特征Acutalibacteraceae细菌在生理特征上也有一些共同点。

它们通常是革兰氏阴性细菌,具有氧化酶、嗜热蛋白等生理活性物质。

它们对于一些特定的营养物质和环境条件也有一定的需求和偏好。

4. 生态分布Acutalibacteraceae细菌广泛分布于自然界中,包括土壤、水体、动物肠道、植物根际等环境中。

它们在这些生态系统中发挥着重要的生物学作用,与其他微生物相互作用,参与物质循环和能量流动等过程。

Acutalibacteraceae是一类重要且广泛存在的细菌科,具有多样的形态和生理特征,对于生态系统的稳定和功能发挥着重要作用。

对其进行深入的研究和了解,有助于揭示微生物世界的奥秘,为人类利用和保护自然资源提供科学依据。

Acutalibacteraceae细菌科是一类具有重要生态学意义的细菌,其广泛的生态分布和多样的形态与生理特征使其在自然界中扮演着重要的角色。

不同种属的Acutalibacteraceae细菌在不同环境中显示出了独特的适应性和生物学特性,对于理解微生物群落的结构和功能以及推动生态学和环境保护领域的研究具有重要意义。

cutibacterium avidum中文 -回复

cutibacterium avidum中文 -回复

cutibacterium avidum中文-回复研究表明,Cutibacterium avidum是一种常见的人体皮肤表面菌群中的一种细菌。

它广泛存在于人类的皮肤表面,并在一定程度上与人体的健康有关。

Cutibacterium avidum属于革兰氏阳性细菌,是一种非常有趣的研究对象。

它的中文名称为“阿维杜拟杆菌”。

阿维杜拟杆菌以其对人体健康的贡献和与皮肤疾病的关联而引起了科学界的广泛兴趣。

在本文中,我们将一步一步回答关于Cutibacterium avidum的相关问题,从整体了解到其对人体的影响和相关研究的进展。

1. Cutibacterium avidum是什么?Cutibacterium avidum是一种革兰氏阳性细菌,属于Corynebacteriaceae科。

它广泛存在于人类的皮肤表面,特别是处于油脂分泌较多的区域。

它是一种氧耐受菌,也可以在低氧环境中生存。

2. Cutibacterium avidum的生物学特性Cutibacterium avidum是一种糖类非发酵菌,并产生酸性产物。

它具有多种酶活性,如脂酶、过氧化物酶和皮脂酸酶等。

这些酶的存在可能与其对皮肤健康的影响有关。

3. Cutibacterium avidum在皮肤健康中的角色Cutibacterium avidum存在于皮肤的表面和毛囊中,它可以通过多种途径与人体皮肤的相互作用。

一方面,Cutibacterium avidum可以通过与其他细菌的竞争,保持皮肤的微生物平衡和健康。

另一方面,它还能够参与皮脂代谢,并与皮肤的天然免疫系统相互作用。

4. Cutibacterium avidum与皮肤疾病的关联尽管Cutibacterium avidum在皮肤健康中发挥了一定的积极作用,但也与一些皮肤疾病的发生和发展相关。

例如,Cutibacterium avidum可以分解皮肤表面的脂肪酸并产生一些不利于皮肤健康的代谢产物,从而引发痤疮等疾病。

非天然氨基酸嵌入原理

非天然氨基酸嵌入原理

非天然氨基酸嵌入原理嘿,朋友们!今天咱就来讲讲非天然氨基酸嵌入原理。

这玩意儿啊,就像是搭积木,只不过我们搭的不是普通的积木,而是有着特别功能的“神奇积木”。

你想想看,氨基酸就像是一个个各具特色的小零件,它们组合起来就能形成各种各样的蛋白质。

而天然氨基酸呢,就像是我们常见的那些积木块,能搭出一些常见的形状。

但非天然氨基酸可不一样啦,它就像是突然出现的新奇积木,能给我们的“建筑”带来意想不到的变化。

比如说,我们身体里的蛋白质就像是一部精密的机器,天然氨基酸让它正常运转。

但有时候呢,我们想要这部机器有一些特别的功能,这时候非天然氨基酸就闪亮登场啦!它能让这部机器变得更厉害、更独特。

这就好像你本来有一辆普通的自行车,只能骑着到处跑。

但如果你给它装上一些特别的零件,比如能发光的轮子或者带音响的把手,那这辆自行车不就变得超级酷炫了嘛!非天然氨基酸就是这样的特别零件呀。

那它是怎么嵌入进去的呢?这就像是一个巧妙的拼图过程。

细胞这个“大工厂”里有一套机制,能识别这些非天然氨基酸,然后把它们准确地放到该放的地方。

就好像你在拼拼图的时候,知道每一块应该放在哪里,才能拼出完整的画面。

而且哦,这可不是随随便便就能做到的。

这需要科学家们像侦探一样,仔细研究、精心设计。

他们要搞清楚非天然氨基酸的性质,还要找到合适的方法让细胞接受它们。

这可不是一件容易的事儿啊!想想看,如果我们能随心所欲地把非天然氨基酸嵌入到蛋白质里,那能做出多少神奇的东西来呀!说不定能制造出能在黑暗中发光的蛋白质,或者能自动分解垃圾的蛋白质呢!这多有意思呀!咱再打个比方,非天然氨基酸就像是给蛋白质这个“大舞台”增添了新的“演员”,这些“演员”有着独特的技能和魅力,能让整个“表演”更加精彩绝伦。

总之,非天然氨基酸嵌入原理就像是打开了一扇通往新世界的大门,让我们看到了无数的可能和惊喜。

虽然研究它的过程充满了挑战,但一旦成功,那带来的回报可原创不易,请尊重原创,谢谢!。

非天然β-氨基酸的合成

非天然β-氨基酸的合成

本科毕业设计(论文)题目: 非天然β-氨基酸的合成学院: 南方学院专业: 高分子材料与工程班级: n1111023 学号: n111102318 学生姓名:徐海健指导教师: 雷萌职称:副教授二○一四年十二月二十一日非天然β-氨基酸的合成摘要β-氨基酸因为其独特的化学性质在医药行业中有着广泛的应用,在医药开发和生物化学研究中有有着重要的用途,近些年来人们在该领域展开了很多工作,并取得了一定的进展。

得到β-氨基酸主要有五种方法:化学拆分、手性色谱柱拆分、Amdt-Eistert反应[1]、不对称合成[2]和酶催化合成。

关键词:β-氨基酸化学拆分手性色谱柱拆分Amdt-Eistert反应不对称合成酶催化合成Synthesis of Non-natural β-Amino AcidsABSTRACTβ-amino acid because of its unique chemical properties in the pharmaceutical industry has a wide range of applications.In the pharmaceutical development and biochemical research have important use.In recent years, people carry out a lot of work in the field, and has made certain progress in.To obtain beta amino acids are mainly five kinds of methods: Chemical resolution、Chiral chromatographic separation、Amdt-Eistert reaction、Asymmetric synthesis、Enzyme catalyzed synthesis.Key words:β-amino acid Chemical resolution Chiral chromatographic separation Amdt-Eistert reaction Asymmetric synthesis Enzyme catalyzed synthesis.目录1 前言 (4)1.1 氨基酸概要 (4)1.2 天然的β-氨基酸 (4)1.3 医药中应用的β-氨基酸 (5)2 获取β-氨基酸的主要方法 (5)2.1 化学拆分法 (5)2.2 膜拆分发 (6)2.3 手性色谱柱拆分法 (6)2.4 酶拆分法 (7)2.5 Arndt- Eistert 反应法 (8)2.6 不对称合成法 (9)3 β-氨基酸的研究进展 (10)参考文献 (12)1.前言1.1 氨基酸概要和-COOH的两性化合物,氨基酸是既有酸性,又有碱性,分子中同时含有-NH2是组成蛋白质的基本单位,被称为“生命之源”[3]。

2024届高考二轮复习生物课件(新教材):病毒

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3.寨卡病毒是一种单股正链RNA(+RNA)病毒。RNA复制时,先以+RNA为 模板合成-RNA,再以-RNA为模板合成新的+RNA,其增殖过程如图所示。 下列相关说法错误的是( D )
A.寨卡病毒的遗传信息在传递过程中不可能发生碱基A与T的配对 B.寨卡病毒的+RNA上有密码子,而-RNA上则无密码子 C.+RNA的嘧啶碱基数与-RNA的嘌呤碱基数相等 D.寨卡病毒在宿主细胞内增殖时,体内含有逆转录酶
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二、非选择题 4.甲型流感病毒为RNA病毒,易引起流感大规模流行。我国科学家发明了 一种制备该病毒活疫苗的新方法,主要环节如下。 (1)改造病毒的部分基因,使其失去在正常宿主细胞内的增殖能力。以病毒 RNA为模板,逆转录成对应DNA后,利用 PCR 技术扩增,并将其中某 些基因(不包括表面抗原基因)内个别编码氨基酸的序列替换成编码终止 密码子的序列。与改造前的基因相比,改造后的基因表达时不能合成完整 长度的 多肽(或蛋白质) ,因此不能产生子代病毒。将该改造基因、表面 抗原等其他基因分别构建重组质粒,并保存。
热点专题练1 病毒
一、选择题 1.(2023·山西太原二模)甲型流感病毒是一种RNA包膜病毒,其包膜上含有 血凝素(HA)等抗原蛋白,人体感染该病毒后,可能会出现高烧、肌肉酸痛、 咽痛、咳嗽等症状。下列叙述正确的是( C ) A.该病毒的RNA中含有其遗传信息和反密码子 B.该病毒作为分解者,属于生命系统中最基本的层次 C.免疫细胞需要膜表面的受体来识别病毒的HA等抗原蛋白 D.辅助性T细胞裂解被该病毒感染的咽喉细胞并将病毒清除
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解析 T是DNA所特有的碱基,U是RNA所特有的碱基,寨卡病毒(遗传物质 是RNA)的遗传信息在传递过程中不可能发生碱基A与T的配对,整个过程 都是A与U配对,A项正确;据图可知,寨卡病毒是以+RNA为模板翻译出结构 蛋白的,所以+RNA上有密码子,而-RNA上则无密码子,B项正确;由于-RNA 是以+RNA为模板合成的,二者的碱基互补配对,因此+RNA的嘧啶碱基数 与-RNA的嘌呤碱基数相等,C项正确;寨卡病毒属于RNA病毒,遗传信息在 传递过程中没有逆转录过程,所以其体内没有逆转录酶,D项错误。

制备非天然氨基酸的蛋白质表达研究

制备非天然氨基酸的蛋白质表达研究

制备非天然氨基酸的蛋白质表达研究蛋白质是生物体内构成组织和发挥功能的基本单位,其合成主要依赖于细胞内的蛋白质合成机器——核糖体。

然而,天然界中存在的氨基酸种类有限,难以满足对特定非天然氨基酸的需求。

为了克服这一限制,科学家们进行了制备非天然氨基酸的蛋白质表达研究,以期扩展蛋白质的结构和功能。

一、引言蛋白质是生命体重要的组成部分,不仅参与细胞结构的建立,还调控许多生物过程。

然而,天然界中的20种天然氨基酸种类有限,无法满足研究者对特定非天然氨基酸的需求。

因此,制备含有非天然氨基酸的蛋白质对于拓展蛋白质的结构和功能具有重要意义。

二、非天然氨基酸合成为了制备非天然氨基酸的蛋白质,首先需要合成目标非天然氨基酸。

通常,科学家采用化学合成或生物合成的方法进行非天然氨基酸的制备。

化学合成方法要求高纯度的试剂和复杂的合成步骤,对于大规模合成来说往往成本较高。

而生物合成方法则利用代谢工程技术将非天然氨基酸的生物合成途径引入大肠杆菌等常见表达宿主中,使其具备合成目标非天然氨基酸的能力。

三、非天然氨基酸的遗传密码在表达非天然氨基酸的蛋白质之前,科学家们需要保证细胞能够识别和翻译非天然氨基酸的密码。

通过工程化转录和翻译系统,科学家们成功地将非天然氨基酸的密码引入细胞,使其能够正常合成蛋白质。

四、非天然氨基酸的蛋白质表达为了实现非天然氨基酸的蛋白质表达,科学家们开展了一系列的改造工作。

首先,需要设计并合成含有目标非天然氨基酸的启动子和密码子。

接着,将其导入表达宿主中,并通过选择性培养基筛选出能够表达目标蛋白质的细胞株。

最后,利用蛋白质纯化技术获得纯净的非天然氨基酸蛋白质。

五、非天然氨基酸蛋白质的应用非天然氨基酸的蛋白质不仅可以扩展蛋白质的结构和功能,还有许多其他的应用。

例如,通过插入荧光标记的非天然氨基酸,可以实现对蛋白质的原位观察和跟踪;通过插入化学反应基团的非天然氨基酸,可以实现对蛋白质的定向修饰;同时,通过改变天然氨基酸的物理化学性质,还可以改变蛋白质的稳定性、溶解度等特性。

蛋白质标记方法非天然氨基酸

蛋白质标记方法非天然氨基酸

蛋白质标记方法非天然氨基酸
引入非天然氨基酸的蛋白质标记方法有多种应用。

例如,可以
使用含有荧光素衍生物的非天然氨基酸来标记蛋白质,从而实现荧
光显微镜下的实时观察。

此外,还可以利用含有生物素或抗原标记
的非天然氨基酸来进行免疫检测或亲和纯化。

另外,通过引入化学
交联剂的非天然氨基酸,可以实现蛋白质与其他分子的特异性结合,从而用于研究蛋白质的相互作用。

除了在实验室研究中的应用,蛋白质标记方法非天然氨基酸还
在生物药物研发和生物制药生产中发挥着重要作用。

例如,通过引
入特定的非天然氨基酸,可以提高蛋白质的稳定性和活性,从而改
善生物药物的药效和安全性。

此外,还可以利用非天然氨基酸来实
现蛋白质的特异性修饰,从而提高生物制药的纯度和稳定性。

总的来说,蛋白质标记方法非天然氨基酸是一种强大的工具,
可以为生物化学、生物医学研究和生物制药领域提供多种创新应用。

通过引入特定的非天然氨基酸,可以实现对蛋白质的精准控制和定位,从而拓展了蛋白质工程和应用的可能性。

非天然氨基酸在蛋白质结构和功能修饰方面的应用潜力

非天然氨基酸在蛋白质结构和功能修饰方面的应用潜力

非天然氨基酸在蛋白质结构和功能修饰方面的应用潜力引言:蛋白质是生命活动的基础,扮演着细胞结构、代谢调控和信号传递等关键角色。

然而,传统的天然氨基酸构成的蛋白质只能提供有限的功能和结构多样性。

近年来,科学家们开始关注非天然氨基酸在蛋白质结构和功能修饰方面的应用潜力。

非天然氨基酸的引入可以扩展蛋白质的功能和结构空间,为生物医学研究、药物设计和生物工艺等领域提供了新的机会和挑战。

一、非天然氨基酸的引入与蛋白质结构修饰1. 引入非天然氨基酸可以改变氨基酸侧链性质。

a. 不同的非天然氨基酸具有不同的侧链结构,在一定程度上可以调整蛋白质中氨基酸侧链的物理、化学性质,从而改变蛋白质的结构和功能。

b. 通过引入更大、更小或更为疏水的非天然氨基酸,可以调节蛋白质的空间构型和稳定性。

2. 引入非天然氨基酸可以改变蛋白质的折叠速率和动力学性质。

a. 添加具有特定物理或化学性质的非天然氨基酸,可以增强或减弱蛋白质折叠的动力学过程,从而改变其折叠速率。

b. 通过调节蛋白质表面的非天然氨基酸分布情况,可以影响蛋白质的稳定性和动态性。

3. 引入非天然氨基酸可以增强蛋白质的酶活性或催化效率。

a. 利用非天然氨基酸的独特性质,可以设计出具有特定催化活性的蛋白质。

b. 引入非天然氨基酸可以改变酶活性中心的结构和环境,从而提高酶的催化效率。

二、非天然氨基酸的应用与蛋白质功能修饰1. 引入非天然氨基酸可以实现蛋白质荧光标记。

a. 利用非天然氨基酸的特殊性质,可以在蛋白质中引入荧光标记物,实现对蛋白质的定位和可视化监测。

b. 这种方法可以用于研究蛋白质的定位、迁移和相互作用等重要的生物学过程。

2. 引入非天然氨基酸可以实现蛋白质的化学修饰。

a. 利用非天然氨基酸上特定官能团的反应性,可以在蛋白质上进行化学修饰。

b. 这种化学修饰可以引入特定的化学结构或功能团,从而拓展蛋白质的应用范围,如构建特定的蛋白质骨架、增加蛋白质的稳定性或改善药物递送系统等。

不同培养基对荧光假单胞菌产铁载体的影响

不同培养基对荧光假单胞菌产铁载体的影响

不同培养基对荧光假单胞菌产铁载体的影响作者:陈绍兴, 何明涛, 谢志雄, CHEN Shao-xin, HE Ming-tao, XIE Zhi-xiong作者单位:陈绍兴,何明涛,CHEN Shao-xin,HE Ming-tao(红河学院生命科学与技术学院,云南,蒙自,661100), 谢志雄,XIE Zhi-xiong(武汉大学生命科学学院,武汉,430072)刊名:红河学院学报英文刊名:JOURNAL OF HONGHE UNIVERSITY年,卷(期):2008,6(2)1.Manuela Di Lorenzo;Sophie Poppelaars;Michiel Stork A nondbosomal peptide synthctase with a novel domain organization is essential for siderophore biosynthesis in Vibrio anguillarum 20042.Scher F M;Baker R Effect of Pseudomonas put.ida and a synthetic irom chelator on induction of soil suppressiveness to Fusarium wilt pathogens 19823.王平小麦根圈细菌铁载体的检测 19944.Barhgouthi R Y;Olson M O J;Arceneaux L A Amonabactin,a novel tryptophan-or phenylalanine-containing phenolate siderophore in Aeromonas hydrophila 19895.Frederick M Ausubel.short protocols in molecular biolagy 19956.赵翔;陈绍兴;谢志雄高产铁载体荧光假单胞菌 Pseudomonas fluoreseens sp-f的筛选鉴定及其铁载体特性研究[期刊论文]-微生物学报 2006(05)7.陈绍兴细菌铁载体测验方法[期刊论文]-红河学院学报 2005(06)1.陈绍兴.费宗伟.何明涛.沈萍.谢志雄.CHEN Shao-Xing.FEI Zong-Wei.HE Ming-Tao.SHEN Ping.XIE Zhi-Xiong 假单胞菌荧光与非荧光铁载体对铁离子的应答差异[期刊论文]-微生物学通报2008,35(10)2.方涛.李道季.余立华.FANG Tao.LI Dao-ji.YU Li-hu海洋微生物铁载体的研究[期刊论文]-海洋科学2007,31(10)3.陈绍兴.谢志雄铁离子对荧光假单胞菌生长及产铁载体的影响[期刊论文]-江苏农业科学2008(4)4.李明.张灼钾细菌JF88菌株解钾作用及应用研究[期刊论文]-生物学杂志2001,18(2)5.谢小军.王敬国.XIE Xiao-Jun.WANG Jing-Guo一株细菌儿茶酚型铁载体分泌的影响因素研究[期刊论文]-微生物学通报2006,33(1)6.王颜萍.何鹰.郑晓玲.陈发荣.黎先春.王小如.WANG Yan-ping.HE Ying.ZHENG Xiao-ling.CHEN Fa-rong.LI Xian-chun.WANG Xiao-ru分析技术在海洋浮游生物铁载体研究中的应用[期刊论文]-海洋科学进展2005,23(2)7.郑传进.涂国全.ZHENG Chuan-jin.TU Guo-quan酸盐细菌解钾能力研究[期刊论文]-韶关学院学报(自然科学版) 2005,26(6)8.王平.李慧.邱译萱.邢佳.肖明.WANG Ping.LI Hui.QIU Yi-xuan.XING Jia.XIAO Ming荧光假单胞菌株P13分泌铁载体抑制油菜菌核病菌[期刊论文]-上海师范大学学报(自然科学版)2010,39(2)9.陈绍兴.赵翔.沈萍.谢志雄.CHEN Shao-Xing.ZHAO Xiang.SHEN Ping.XIE Zhi-Xiong高灵敏假单胞菌铁载体的平板检测方法[期刊论文]-微生物学通报2006,33(3)10.赵翔.谢志雄.沈萍高产铁载体菌的筛选及鉴定[会议论文]-2003引用本文格式:陈绍兴.何明涛.谢志雄.CHEN Shao-xin.HE Ming-tao.XIE Zhi-xiong不同培养基对荧光假单胞菌。

streptavidin 结构

streptavidin 结构

streptavidin 结构
streptavidin是一种外源的细菌蛋白,由Streptomyces avidinii 产生。

它是一种四聚体蛋白,每个亚单位具有128个氨基酸残基,总分子量约为53kDa。

streptavidin与生物素(也称为维生素H)之间形成非共价的高亲合力结合。

streptavidin的四个亚单位之间通过非共价作用力(主要是疏水作用力)结合在一起,形成一个稳定的四聚体。

每个亚单位具有一个生物素结合位点,因此整个streptavidin四聚体可以同时结合四个生物素分子。

streptavidin和生物素之间形成的结合是非常强的,具有极高的亲和力和专一性,常用于多种实验技术和应用中。

它被广泛用于免疫检测、蛋白质纯化、细胞标记等领域。

streptavidin的结构已经通过X射线晶体学和核磁共振等技术进行了详细研究。

它的核心结构由七个螺旋组成,其中六个螺旋形成一个椭圆柱形的核心结构,第七个螺旋位于中心孔内。

生物素结合位点位于核心结构表面的一个凹陷区域。

streptavidin的结构稳定并具有较高的热稳定性,在常见的实验条件下不易变性。

非天然β氨基酸的合成.

非天然β氨基酸的合成.

本科毕业设计(论文)题目: 非天然β-氨基酸的合成学院: 南方学院专业: 高分子材料与工程班级: n1111023 学号: n111102318 学生姓名:徐海健指导教师: 雷萌职称:副教授二○一四年十二月二十一日非天然β-氨基酸的合成摘要β-氨基酸因为其独特的化学性质在医药行业中有着广泛的应用,在医药开发和生物化学研究中有有着重要的用途,近些年来人们在该领域展开了很多工作,并取得了一定的进展。

得到β-氨基酸主要有五种方法:化学拆分、手性色谱柱拆分、Amdt-Eistert反应[1]、不对称合成[2]和酶催化合成。

关键词:β-氨基酸化学拆分手性色谱柱拆分Amdt-Eistert反应不对称合成酶催化合成Synthesis of Non-natural β-Amino AcidsABSTRACTβ-amino acid because of its unique chemical properties in the pharmaceutical industry has a wide range of applications.In the pharmaceutical development and biochemical research have important use.In recent years, people carry out a lot of work in the field, and has made certain progress in.To obtain beta amino acids are mainly five kinds of methods: Chemical resolution、Chiral chromatographic separation、Amdt-Eistert reaction、Asymmetric synthesis、Enzyme catalyzed synthesis.Key words:β-amino acid Chemical resolution Chiral chromatographic separation Amdt-Eistert reaction Asymmetric synthesis Enzyme catalyzed synthesis.目录1 前言 (4)1.1 氨基酸概要 (4)1.2 天然的β-氨基酸 (4)1.3 医药中应用的β-氨基酸 (5)2 获取β-氨基酸的主要方法 (5)2.1 化学拆分法 (5)2.2 膜拆分发 (6)2.3 手性色谱柱拆分法 (6)2.4 酶拆分法 (7)2.5 Arndt- Eistert 反应法 (8)2.6 不对称合成法 (9)3 β-氨基酸的研究进展 (10)参考文献 (12)1.前言1.1 氨基酸概要和-COOH的两性化合物,氨基酸是既有酸性,又有碱性,分子中同时含有-NH2是组成蛋白质的基本单位,被称为“生命之源”[3]。

生物专业英语第三版蒋悟生编__课文翻译

生物专业英语第三版蒋悟生编__课文翻译

Inside the Living Cell: Structure andFunction of Internal Cell Parts Cytoplasm: The Dynamic, Mobile Factory细胞质:动力工厂Most of the properties we associate with life are properties of the cytoplasm. Much of the mass of a cell consists of this semifluid substance, which is bounded on the outside by the plasma membrane. Organelles are suspended within it, supported by the filamentous network of the cytoskeleton. Dissolved in the cytoplasmic fluid are nutrients, ions, soluble proteins, and other materials needed for cell functioning.生命的大部分特征表现在细胞质的特征上。

细胞质大部分由半流体物质组成,并由细胞膜(原生质膜)包被。

细胞器悬浮在其中,并由丝状的细胞骨架支撑。

细胞质中溶解了大量的营养物质,离子,可溶蛋白以及维持细胞生理需求的其它物质。

The Nucleus: Information Central(细胞核:信息中心)The eukaryotic cell nucleus is the largest organelle and houses the genetic material (DNA) on chromosomes. (In prokaryotes the hereditary material is found in the nucleoid.) The nucleus also contains one or two organelles-the nucleoli-that play a role in cell division. Apore-perforated sac called the nuclear envelope separates the nucleus and its contents from the cytoplasm. Small molecules can pass through the nuclear envelope, but larger molecules such as mRNA and ribosomes must enter and exit via the pores.真核细胞的细胞核是最大的细胞器,细胞核对染色体组有保护作用(原核细胞的遗传物质存在于拟核中)。

非天然氨基酸置换在蛋白质设计中的应用案例

非天然氨基酸置换在蛋白质设计中的应用案例

非天然氨基酸置换在蛋白质设计中的应用案例蛋白质是生命体中不可或缺的重要分子,它们在细胞功能、结构和代谢中起着重要的作用。

传统上,蛋白质的构建主要依赖于天然氨基酸,然而,随着科技的发展和对蛋白质结构与功能理解的深入,人们开始尝试引入非天然氨基酸来设计蛋白质,以探索新的结构和功能。

本文将介绍非天然氨基酸在蛋白质设计中的应用案例,并讨论其对科学研究和应用的重要意义。

一、非天然氨基酸的概述非天然氨基酸是指在自然界中不存在或极少存在的一类氨基酸,常见的非天然氨基酸包括β-氨基酸、D-氨基酸和氧化半胱氨酸等。

相比于天然氨基酸,非天然氨基酸具有结构多样性、化学活性独特以及体内外的生物相容性等特点,这使得它们在蛋白质设计中展现出了巨大的应用潜力。

二、非天然氨基酸的应用案例1. 抗体工程中的非天然氨基酸设计抗体是一种免疫分子,能够特异性地识别并结合到抗原物质上,因此在免疫疾病治疗和肿瘤治疗中具有重要的应用价值。

然而,传统的抗体工程受到天然氨基酸的限制,对抗原的特异性结合和稳定性存在一定的局限性。

通过引入非天然氨基酸,可以改变抗体的结构和功能,提高其亲和力和稳定性,从而得到更好的治疗效果。

2. 蛋白质药物的优化设计蛋白质药物是目前药物研发领域的热点,然而,由于蛋白质的天然结构和稳定性的限制,往往存在药代动力学和免疫原性等问题。

在蛋白质药物的优化设计中引入非天然氨基酸,可以改善药物的稳定性、药代动力学和生物相容性,从而增强其在治疗中的疗效和安全性。

3. 酶的改造与优化酶是催化生物反应的生物催化剂,对于化学合成和环境保护等领域具有广泛的应用前景。

然而,天然酶往往存在活性低、稳定性差以及对底物的专一性等问题。

通过引入非天然氨基酸,可以改变酶的立体结构和微环境,提高其催化活性和稳定性,扩展其底物范围和反应特异性。

三、非天然氨基酸在蛋白质设计中的意义非天然氨基酸的引入拓宽了蛋白质设计的空间,为科学研究和应用创造了新的可能性。

细菌鉴定中英文 - ATB

细菌鉴定中英文 - ATB

Stenotrophomonas maltophilia 嗜麦芽寡养单胞菌(=嗜麦芽黄单胞菌) (=Xanthomonas maltophilia) Sphingobacterium Spiritivovum 嗜神鞘氨醇杆菌
ID 32 GN 革兰氏阴性杆菌鉴定试条
Budvicia aquatica Burkholderia cepacia (=Pseudomonas cepacia) Burkholderia gladioli (=Pseudomonas gladioli) Burkholderia pseudomallei (=Pseudomonas pseudomallei) Buttiauxella agrestis Cedecea davisae Cedecea lapagei Cedecea neteri CDC gr.IV C-2 Cedecea spp Citrobacter amalonaticus (+/Citrobacter amalonaticus) Cedecea farmeri (+/-Cedecea amalonaticus) Cedecea freundii group (=Cedecea freundii) Cedecea koseri (=Cedecea diversus) Edwardsiella hoshinae Edwardsiella tarda Enterobacter aerogenes Enterobacter amnigenus Enterobacter gergoviae Enterobacter intermedius Enterobacter sakazakii 水生布戴约维采菌 洋葱伯克霍尔德菌(=洋葱假单胞菌) 唐菖蒲伯克霍尔德菌(=唐菖蒲假单胞菌) 假鼻疽伯克霍尔德菌(=假鼻疽假单胞菌)

internal_ribosome_entry_site名词解释_概述及解释说明

internal_ribosome_entry_site名词解释_概述及解释说明

internal ribosome entry site名词解释概述及解释说明1. 引言1.1 概述在分子生物学领域,internal ribosome entry site (IRES,内源性核糖体进入位点)是一种与蛋白质合成调控相关的结构元素。

它存在于某些RNA分子中,可以使核糖体在缺少5'端7-甲基鸟苷帽(m7G)的情况下进入并开始翻译蛋白质编码区域。

这种非经典的转录起始机制通过使部分mRNA分子直接与核糖体结合而绕过了传统上依赖5'端mRNA减数带(untranslated region,UTR)的转录起始点。

1.2 文章结构本文将介绍和解释IRES的定义、功能和作用,并对其发现和研究历程进行概述。

随后,我们将重点讨论IRES的基本结构和特点,以及它与蛋白质合成调控之间的关系。

此外,我们还将介绍IRES在疾病相关性研究方面的最新进展。

文章最后将总结IRES在生物学中的重要性和应用前景,并提供关于未来研究方向的展望和建议。

1.3 目的本篇文章的目的是全面介绍和解释IRES的相关知识,使读者了解其在蛋白质合成调控中的重要作用。

通过阐述其基本结构、功能和与疾病相关性的研究进展,我们希望引发对IRES的深入研究,并为未来的科学探索提供新的思路和方向。

2. internal ribosome entry site名词解释2.1 定义Internal ribosome entry site(IRES)是一段能够在核糖体无需首先依赖5'端启动子的情况下直接招募和定位核糖体的RNA序列元素。

它可以让核糖体直接从内部某个位置进入mRNA,从而实现蛋白质的合成。

2.2 功能和作用IRES在蛋白质合成中起到了重要的作用。

通常,蛋白质合成依赖于mRNA 5'端的启动子来引导核糖体开始转录过程。

然而,对于一些具有IRES元素的mRNA,它们可以通过一种另类的启动机制进行蛋白质合成,而不需要依赖于传统的5'端启动子。

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毕业设计(论文)外文资料翻译题目: 鉴定一个非天然氨基酸中细菌铁载体的结构院系名称:生物工程专业班级: 2学生姓名:学号:指导教师:教师职称:副教授起止日期: 2011.1-2011.2 地点: 9435 附件: 1.外文资料翻译译文;2.外文原文。

附件1:外文资料翻译译文鉴定一个非天然氨基酸中细菌铁载体的结构:假单胞菌 NCPPB2 192铁载体-脓菌素Pt的结构,和荧光假单胞菌铁载体CCM2798脓菌素Pf的结构,摘要:绿脓菌素NCPPB 2192中分离并鉴定有A.B两种,荧光假单胞菌CCM 2798(脓菌素Pf/1,Pf/2,Pf,Pf/3/1,Pf/3/2)在缺铁的环境中培养,它们的结构通过使用FAB-MS核磁共振和CD技术。

这些嗜铁素都是多肽,出了绿脓菌素pf313,在肽链的氨末端,在绿脓菌素pa中,从恶臭假单胞菌ATCC 15692中分离和假单胞菌素B10。

从假单胞菌素B10中获得。

这个菌从2.3-双羟基喹啉平皿中筛选。

Pt绿脓菌素多肽与一个线性肽链结合,D-ser-l-lys-l-ser-D-ser-l-thr-D-ser-l-OHO-l-thr-D-ser-D-OHO(环状),它的碳末端被一个环状D-N6-羟乌氨酸阻断,在绿脓菌pf中,多肽链是线性的,Ser-CTHPMD-gly-l-ser-D-threo-OHASP-L-Ala-gly-Dala-gly-l-OHOra(环状)且含有一个特殊的氨基酸。

由于1molde 丝氨酸和1mol2-4二氨丁酸,形成了环状胺绿脓素pt仅仅是由于多肽链上E3N上的六级键不同。

PtA中是琥珀酸。

绿脓素中的琥珀酸和α酮戊二酸是c-s与多肽结合在绿脓菌素B中,同样的绿脓素pf11绿脓素pf12.绿脓素pf(主要结构物)和绿脓素Pf/3/2。

由l-苹果酸,琥珀酸,l苹果酰胺和琥珀酰胺。

绿脓素Pf/3/3有同样的多肽,如菌素…这些绿脓素与假单胞菌素B10很相似,假单胞菌B10的嗜铁素,他们是线性多肽含有三个二齿螯合物与三价铁离子强力结合,在氨端由邻间苯二酚复合物结束,碳端以环N6-羟乌氨酸结束。

它们不同于其他绿脓菌素。

引言当微生物生长于缺铁的环境中,它们会产生一种叫嗜铁素的小分子,他通过自己高的亲和力将铁离子转运至细胞内部。

这些运铁载体是一个能包含铁的稳定的八面体复合结构,荧光假单胞菌和恶臭简单胞菌对植物的生长有促进作用,也是人尽皆知。

这些细菌存在植物的根除,还可以把他们叫做促植物生长根际微生物。

这种现象已经有了合理的解释,很多文献中都提到过,这是一个由菌株生产的绿脓素能力的过程。

嗜铁素的这种强吸附能力对植物病菌有很强的抗性。

他们使病菌很难得到基础元素铁。

Lemanceau和Sumson通过研究发现嗜铁素会在绿豆植物病原菌与一些荧光假单胞菌的相互作用中出现。

特别是,他们发现一些荧光假单胞菌,NCPPB2192能非常有效的阻止Pultimum的生长。

在外实验环境中,对真菌生长抑制的主要因素是PtA.P.toloasii三种嗜铁素的一种。

荧光假单胞菌CCM2798是革兰氏阴性菌,属于荧光假单胞菌B型。

在缺铁的环境中,这个细菌合成黄绿水溶性复合物,绿脓素Pf.他们就是微生物代谢的嗜铁素。

主要的嗜铁素绿脓素Pf,对铜绿假单胞菌的生长有抑制作用。

Merger和Abdallah揭示了复合物的物理化学性质。

他们指出这种多肽含有生色团,可以从2-3多咪唑-6-6二羟基喹啉中获得。

然而,绿脓菌素Pf的全部结构还没有得到。

文献中,我们阐明它的结构用FAB多光谱,核磁共振和CD技术。

阐述了由P.toloasiiNCPPB2192分泌的三种绿脓素和存在于荧光假单胞菌中,CCM2798中的五种绿脓素。

我们和已经公布的绿脓素结构进行比较,我们还揭示了Pf绿脓菌素含有一个特殊氨基酸,这个氨基酸含有环状酰胺结构。

材料与方法菌株与培养基:P.toloasii strain NCPPB2192,Pfluoreseen2798和PfluosescensCCM2799有氧环境下培养。

就像Merger之前描述的那样,培养基每升含有成分如下:K2HPO4,6g,KH2PO4,3g,(NH4)2SO4.1g,Mgso4.7h2o,0.2g.琥珀酸4g.无菌前PH值调到7.0.绿脓菌素的分离与纯化,菌体用锥形瓶75℃培养,每瓶有0.5L培养液且加有机械搅拌。

48h后,总共45L培养液离心,绿脓素用疏水层析。

如有需要,Fe3+吸收复合物制备可加入每等效绿脓菌素液中加5倍的二氨化铁溶液。

纯化就按下面的绿脓菌素复合物纯化方法。

通过CM-Sephaelox柱状层析获得的三种物质,用高级层析发现的是纯的。

从Pfluoreseen2798的发酵物中,得到了三个产物,绿脓素pf11绿脓素pf12绿脓素pf13.然而最后的产物与Merger和Abdallah的初期培养相同,通过高效液相色谱分析时含有三种复合物。

它溶于sml的水并用1L2mol的Fecl3处理,这个产物用葡聚糖凝胶柱纯化,用PHSO的梯度乙酸液脱液。

产生三种纯的铁复合物。

绿脓素PfFe(Ⅲ),绿脓素Pf13/2-FeⅢ,绿脓素Pf13/3-FeⅢ用5羟基喹啉来处理,PfFe(Ⅲ),并用葡聚糖的过程,产生了纯白Pf,光谱分析绿脓素Pf和铁复合物可以从图中看出。

他们被认为与绿脓素Pa相似,且与假单胞菌素B10也相似,这些相似性有力的证明力绿脓素Pt的生色团与绿脓素Pa相似。

绿脓素Pt和铁复合物的分子质量用FAB量光谱检测。

小分子物质可以在m/2 142s 1453 1424分别检测为PtA,绿脓素PtB, 绿脓素Pt.明显的在m/2,1478,1506,1477检测到贴的复合物。

在1453条件下,自由配体和铁复合物的化学量是1:1,且绿脓素Pa和绿脓素PtA与绿脓素相差的量分别是28个单位和一个量单位。

三种绿脓素的水解含有三种相同的成分,苏氨酸,丝氨酸,赖氨酸N6-羟乌氨酸。

通过HI水解被降解为乌氨酸。

结果和讨论(1)绿脓素PtA的结构,PtA主要从pt的发酵上获得。

它是一种稳定的化合物。

(2)PtA核磁共振,表一中列出了核磁共振普,生色团的化学结构与Demange 报道的绿脓素相似。

绿脓素PtA的核磁共振图有三个直接的结构域,羟基结构域,芬香族结构域,脂肪族结构域。

羟基信号共振,在1692和1839ppm之间。

在1736和1769ppm之间有11个信号,分为氨基酸的10个信羟基和生色团的羟基。

这些分布用他们的化学键与文献中已报道的进行对比,在1804和1839的共振信号与羧酰基团和琥珀酸上的羧酰基团分别与生色团链相连。

169.2和172.2的信号分布为乙酰基团的羧基与分子共价结合,它的形成有N6-羟乌氨酸形成羟配对复合物的参与。

这两种信号都有显示,与一些标准乙酰胺进行比对。

顺和反氧酸盐异构体,九个芳香族碳的共振信号在102.9和159.8ppm.有三个碳在102.8(c-8) 115.5(C-5) 141.9(c-4)ppm和6个4碳116.0(c-10) 115,4 (c-3)135.8 (c-9)145.2(c-6) 151.9 (c-2)159.8(c-7).这些化学键绿脓素Pa生色团非常相似,这意味着两种生色团有同样的结构。

脂肪端碳原子在21.6和70.00ppm的化学键结构在表三中呈现。

从上面的实验中,我们可推断出绿脓素pta是由十个氨基酸肽与生色团结合而成生色团从2.3-6.7双羟基喹啉获得。

另外一个乙酰基团与N6-羟乌氨酸和琥珀酰乙酰成一个氨基集团,可能氨基酸在生色团碳3位置上。

(3)肽链的顺序,氨基酸肽链的顺序是由FAB量光谱检测,N末端和C末端分布在表四和表五中。

乙酰基团的自然特性通过在m/z1383的峰值可以确定。

与乙酰基团中获取一个乙稀酮酸在m/z1325也有峰值。

与一个琥珀酰基团的丢失有关,在峰值m/z1475处的分子中获得,通过分析,可以确定和说明z和A的序列。

用乙酰酸和脱水乙酰的混合物的甲酸溶液和pta作用5五分钟,可以在m/z1551,1554,1557.产生信号。

这是由于嗜铁素上加上了乙酰基团。

然而,被标记型应该有三个1:1标记的集团,那么是1:3:3:1,但是相近类型却表现出扭曲的1:4:6:4:1型。

这与样品中含有乙酰基团且部分被替换是一致的。

绿脓素ptA在5条件的反应中可迅速酯化,在m/z1439和1442产生单酯,30分钟后,第二个双线在m/z1457和1460c且有三线在m/z1471,1474,1477.这表明了在单酯上加了一个水分子,在酯化过以后,在酸功能形成酯化物形成后进行环状羟乌氨酸水解。

绿脓素的酸水解可用FAB量光谱检测,第一步的水解一分子水加入产生信号为m/z1443,与末端环状N6-羟基呱嗪有关,这些信号与核磁共振ptA的波普一直,羟基呱嗪可以在Cα和Cζ上检测到不同。

进一步的水解在m/z1401he 1383处给出峰值。

20分钟后,肽键的进一步水解发生了。

给出分子包含一些有用的序列,在m/z829处有一个附加信号分布是Hzn-ser-ser-thr-ser-n8-OHOrn-COOHO水解片段的发生来源于赖氨酸和丝氨酸酰键断裂。

这是ptA水解中最先发生的,片段。

水解实验的数据定义了z结构,OHOrn-thr,并且绿脓素ptA的全序列应为Chr-ser-lys-ser-ser-thr-ser-OHOrn-thr-ser-OHOrn ptA生色团和氨基酸的结构,生色团的化学结构是由其环状二色性光谱决定的,这与已报道的paA的光谱是一致的,还有假单胞菌素B10后边的结构有x光来决定。

然而生色团的手性中心为s结构,氨基酸的结构由手性气象色谱决定。

用的是壶状手性柱。

研究发现赖氨酸,一个丝氨酸和两个苏氨酸结构型是L型,其他四个丝氨酸的构型是D型,羟基乌氨酸有反向构型。

部分水解片段被分离纯化是为了定位L丝氨酸和LN6-羟基乌氨酸在与生色团键连的十肽菌素中,水解条件产生了大量的低分子水解片段。

粗水解产物4偶氧苯-异流氨酸方法来处理。

制备由高效液相层析固定相。

获得了两个类型的水解片段。

它们在380mm处有吸光值,DABIIC试剂的加入没有产生衍生作用。

他们含有ptA的生色团,没有自由氨端,主要片段是chr-ser-lys-OH。

有lys-2和ser-3片段产生。

片段的化学结构分析表示lyshe是L型丝氨酸是D型。

肽片段与DABITC作用。

在426nm处是最大吸光值。

绿脓素pt的量比绿脓素ptA少一个量单位暗示他是一个琥珀酰代替绿脓素ptA 上的琥珀酸,绿脓素pt是由细菌合成的最初的主要的嗜铁素,但是培养基中PH逐渐升高,这种复合物迅速降解为绿脓素ptA,通过内部分子反应,绿脓素ptB是28个学位,高于绿脓素ptA,与生色团中α酮六糖的琥珀酰次级学位相当。

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