生化(蛋白质生物合成)

1. 30S-IF3复合物的形成 (30S-IF3)
IF3作用于 70S核糖体,使它解离成50S大亚基和30S小亚基, IF3 与小亚基结合,形成30S-IF3复合物 2. 30S起始复合物的形成 (mRNA- 30S-IF3)
小亚基识别mRNA,与mRNA的SD序列结合 3.70S起始复合物的形成 (fMet-tRNAfMet – mRNA-70S)
第三节 转移RNA的功能
tRNA是蛋白质合成中氨基酸的特异运载工具,按照mRNA碱基 A 离开核糖体。 20种氨基酸都各有其特写的tRNA，1种氨基酸常有数种tRNA，
但1种tRNA只能与特定的氨基酸结合。
结合部位：tRNA分子3’-末端有-CCAOH结构，活化的氨基酸 以酯键的形式连接在其上。 每个tRNA都有反密码子，由3个核苷酸组成，反密码子与 mRNA上密码子之间遵循碱基配对原则结合。
4 密码子的通用性与线粒体密码的特殊性 遗传密码子在长期的进化过程中保持不变 第二节 核糖体 核糖体是肽链合成的场所 核糖体结构:由大小不同的两个亚基组成 小亚基功能:专一性地结合模板mRNA 大亚基功能:具转肽酶的活性,催化肽键的形成
核糖体上还有P位和A位
P位(肽酰位)是结合肽酰-tRNA的部位 A位(氨酰位)是结合氨酰-tRNA的部位
密码子共同特点有：
1 密码子的方向性 起始密码在5´端，终止密码在 3´端
密码子5´→ 3´的核苷酸顺序决定了多肽链氨基端到羧
基端的氨基酸顺序 2 密码子的连续性
从起始密码正确起始依次连续3个1组往下阅读翻译，直
至终止密码 3 密码子的简并性 多种密码子编码1种氨基酸的现象，称为密码的简并性 密码子的专一性由前两个碱基决定，第三个碱基与tRNA 反密码子的第一个碱基配对不十分严格，称为摆动现象
第十一章 蛋白质的生物合成
DNA具有两种主要生物学功能 1 在遗传中起传代作用（复制） 2 基因表达的功能，即决定生物体内蛋白质的生物合成 （表达）
DNA（亲代） 复制 DNA（子代） 转录 表 mRNA mRNA的合成方向5´→ 3´ 达 转译 mRNA的解读方向5´→ 3´
Protein
蛋白质合成方向：N-端 → C-端
（五）多聚核糖体 概念：蛋白质生物合成中，在1条mRNA链上，常有多个核糖体呈
串珠状排列，称为多聚核糖体。
意义：多个核糖体在1条mRNA同时进行翻译可大大加速蛋白质合成 的速度mRNA得到充分利用。
（六）新生肽链的修饰和改造
1 切除肽链氨基末端的甲酰甲硫氨酸
2 在蛋白质结构空间位置相邻的2个半胱氨酸残基被氧化形成 二硫键
在IF1、 IF2和GTP参与下，形成70S起始复合物
（三）肽链的延长
肽链的延长过程中需延长因子EFTu和EFTs参与，分4个步骤： 1 进位（注册）
GTP供能，氨酰-tRNA进入核糖体A位
2 转肽 A位上的氨酰-tRNA上的氨基与P位上的肽酰-tRNA的羧基之 间形成肽键，由存在于大亚基上的转肽酶催化。 3 脱落 P位上无负载的tRNA脱落，空出P位 4 移位 GTP供能， 核糖体向mRNA的3’端移动一个密码子的距离， 使原来处于大亚基上A位上的二肽酰-tRNA移至P位。
⑷ 肽链合成的终止和释放 ⑸ 肽链的折叠和加工处理
（一）氨基酸的激活（氨基酸与特写tRNA形成氨酰tRNA）
氨基酸 + ATP + 酶 氨酰-AMP-酶 + tRNA
Mg 2+
氨酰-AMP-酶 + ppi 氨酰-tRNA + AMP + 酶
（氨酰-tRNA合成酶）
氨酰-tRNA合成酶种类较多，具有绝对专一性 氨酰-tRNA书写形式：Met-tRNAMet （真核生物起始氨基酸） fMet-tRNAfMet（原核生物起始氨基酸） fMet：N-甲酰甲硫氨酸 （二）肽链合成的起始 （形成70S起始复合物） 起始时需要3种起始因子，分别为IF-1、IF-2、IF-3
3 某些氨基酸侧链的修饰和结合蛋白质的形成
4 长链多肽的切除 5 亚基聚合
第五节 真核生物与原核生物蛋白质合成的差异
此部分内容见教材表格
摆动现象：密码子的第三位碱基与反密码子的第一位碱基不严 格配对互补也能互相辩认，tRNA分子中，次黄嘌呤（I） 常出现于反密码的第一位，可以与mRNA密码的第三位A、 C、U配对。 第四节 蛋白质生物合成的分子机制
蛋白质合成的过程大致分为5个阶段：
⑴ 氨基酸的激活 ⑵ 肽链合成的起动
⑶ 肽链的延长
第一节 遗传密码
mRNA中每三个连续的核苷酸序列是蛋白质合成中某 一特定氨基酸的密码单位，所以这三个相邻的核苷酸 也称为三联体密码或密码子 一 遗传密码的破译
二 遗传密码的特点
61编码氨基酸 密码子数目 43 = 64 3个终止密码（UAA、UAG、UGA） 1个起始密码（AUG）（又编码Met）
按进位 → 转肽 →脱落 →移位过程不断重复，使肽链不断
延长，核糖体阅读mRNA的密码是5’ → 3’方向，肽链合成 是从N端向C端方向进行，每形成一个肽键需四个高能键。 （四）肽链合成的终止与释放 RF识别终止密码
大亚基上的转肽酶活性变构为水解酶活性
水解酶水解新合成肽链与tRNA之间的酯键 消耗GTP，使核糖体上的tRNA和RF脱落。