NCBI序列比对方法与实例操作
合集下载
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
相似序列一：番茄ch07染色体全基因组
相似序列二：潘那丽番茄ch07染色体全基因组
序列编号
对比空白
匹配序列长度
匹配 范围
输入序列被随机搜索出来 的概率，该值越小越好
相似序列，即输入序列 和搜索到序列的匹配率
分数越高，则同源性越好
空白
询问序列和数据库 里面序列的互补链 匹配
ZB04091969(MALINGSHU)-A68-M13+_D09
预测：马铃薯 单酰基甘 油脂酶 ABHD-6相似 mRNA
ZB04091969(MALINGSHU)-A69-M13+_E09
番茄ch03染色体全基因组
潘那丽番茄ch07染色体全基因组能找到其它的匹配序列其背后的含义就是匹配序列其背后的含义就是e值越少匹配度越好值越少匹配度越好序列编号匹配序列长度匹配范围匹配范围对比空白相似序列即输入序列和搜索到序列的匹配率相似序列即输入序列和搜索到序列的匹配率输入序列被随机搜索出来的概率该值越小越好输入序列被随机搜索出来的概率该值越小越好询问序列和数据库里面序列的互补链匹配询问序列和数据库里面序列的互补链匹配分数越高则同源性越好空白zb04091969malingshua68m13d09预测
点击 进入
点击此处进入核酸序列比对
将FASTA格式的序列输入 这里
此处可自动识别比对序 列名称
点击此处进入序列比对
已知序列编号 数据库名称 比对序列长度 所查询分子类型
序列相似性比对图谱
序列长度
不同颜 具有的 例如， 核酸序 是相同
序列相似性比对结果
类似性 积分
相似度
数据库相似序列名称 数据库 标识 E值为匹配期望 值。说明可以找 到与搜索序列相 匹配的其它序列 的几率。E值越 接近零，越不可 能找到其它的匹 配序列，其背后 的含义就是E值 越少，匹配度越 好