华大基因研究所暑期实习总结

文献查找与阅读
查找有用的文献：比如，PubMed检索摘要 (abstract),先看摘要，感兴趣，再看全文 有用的翻译词典：生物医药大词典在线版，金山 词霸 术语的英汉翻译：中英结合。比如，gene ontology,在Google输入gene ontology 基因， 就可大致知道该术语为基因注释之意。 阅读：精读和泛读。对入门文献、文献中最感兴 趣内容精读，其余了解大意（主要内容，使用软 件，分析方法，优缺点）即可。
对华大认识
理念：解读生命奥妙，谱写生命华章， 体验精彩人生 氛围：大学校园氛围 ，亲和、自由、朴实、严谨 、 高效、紧张、压力。 人：朴实、没架子 ，可以自由请教问题 食住：自助餐大锅饭，4人宿舍，有班车接送 招聘：1/3来自名校， 1/3重点工程学校， 1/3普 通学校（我们的属于普通学校） 有数据才是硬道理，编程是为数据分析服务
对华大认识
研究领域涉及交叉学科，聚集物理、化学、生物、 数学、计算机等年轻有为的精英。 在特种兵团干得出色的专业排行榜： 1，物理。（综合能力强，重实用） 2，生物。（有扎实生物基础知识，会写基本程序，可以分析解释数据） 3，数学。（容易不切实际，简单事复杂化） 4，计算机。（会学程序，但不会用生物知识解释）
暑假实习是个不错的学习、锻炼机会，应努力争 取。在简历中，应尽量表明自己的诚意及信心， 扬长避短，他们需要什么，在自己也具备的前提 下，尽量列出来。 在面试中，尽量表现自己的诚意。华大会就一些 生物基础知识、数理统计知识、计算机某个知识 点提问，问的都是一些基础知识，不会很难。当 遇到自己不会的，尽量绕过，转移到自己擅长的 地方来。
必备7种能力
在特种兵团必备的7大武器： 生物基础知识 《基因的分子生物学》 计算机能力 （Perl,R） 数理统计背景（T检验，卡方分布，多元统计） 英语 文献阅读能力 团队合作（多沟通、交流） 个人努力（化压力为动力、勤奋）
Perl学习
Perl在Windows下运行：安装Perl，打开“运 行”，输入Dos命令“cmd”，把perl程序放在所 示路径下“C:\Documents and Settings\Admistrator”，输入perl +“程序名 （.pl后缀)”，回车即可运行 教材：东南大学出版社Perl第五版，答案在英文 版第5版 重点：哈希Hash，正则表达式 （前5张是基础，练习选做，hash、正则练习全做、 第9章以后可不用看）
对华大认识
来到华大后，听了不少介绍华大的讲座，对华大事业单位的性质 、独 特的经营模式、创新培养人才理念有个认识，华大敢走常人不敢走之 路，引领国内基因组研究，这在国内是很罕见的。现消除之前对华大 认识的一些偏差： 1，华大最大优势不在于测序能力，而在于强大的分析能力，有自己 独立研发的分析软件SOAP。华大精明之处在于扬长避短。我国测序 仪器开发起步晚，发展慢，在国际上没有竞争力。因此，华大避开走 研发测序仪器这条路，而采用美国先进测序仪器，将重点放在生物数 据的分析上，并想通过建立基因与健康（疾病）之间关系的数据形成 自己的下一步核心竞争力。 2，天才只是个例，华大主要队伍还是勤奋、肯努力奋斗的人。就连 领头羊李英睿自己都曾说，假如不是李英睿，也一定会有另一个人来 代替他的角色。科学特种兵团在工作中的价值是：让每一位员工都觉 得自己是重要的，但又不是不可替代的。
常用生物软件使用
阅读《常用生物软件使用》。在Linux系统下安 装使用这些软件不太现实（所要下载软件太大， 电脑内存太小）的话，重点看原理、简介部分。 熟悉3大数据库使用（NCBI，EMBL、DDBJ）， 掌握BLAST，熟悉blast m8格式，GenBank格 式，fasta格式， MEGA等 对当前测序原理和方法有个了解 华大培训资料挑着看
Βιβλιοθήκη Baidu
Perl学习
实战：实践_编程题.rar，附有答案，做完再对 空余，还可自学R作图，shell命令， 2010 Computational Phyloinformatics Course Wiki （华大内部培训资料）
Linux系统安装、学习
由于没有大型机账号，我们在windows下安装 Linux：VMware（虚拟机）+ubuntu（Linux系 统） 步骤：打开VMware-workstation-full-7.1.0261024.exe，安装，密码在 vmware7keygen.rar解压后 vmware7keygen.exe中，重启后，打开，勾第2 框，导入ubuntu-10.04-desktop-i386.iso安装 （硬盘大于20G），skip表可跳过。约30min。 操作：在application-/-terminal（终端）运行， perl+程序名,回车，运行。
华大暑期实习总结
Outline
对华大认识 必备7种能力 Perl学习 Linux系统安装、学习 常用生物软件使用 文献查找与阅读 对有志于华大的同学提一些建议 附：简历制作、面试经验
对华大认识
之前对华大认识存在一些偏差，主要有： 1，以为华大“财大气粗”，华大最厉害之处是靠 这些昂贵的测序仪器，提供测序服务； 2，以为华大员工中作出突出贡献的都是一些鬼才、 怪才、天才。
对有志于华大的同学提一些建议
常关注华大官网，对华大有个大概了解 平时有意识促进自己往7种能力发展 扎实基础，不落下学习，成绩过得去 关注华大招聘要求，需要什么，自己也侧重往这 方面发展 如果可能的话，可在课余时间做些小课题，比如， 黄仲曦老师最后的微阵列大实验就是一个锻炼
附：简历制作、面试经验
Linux系统安装、学习
Ubuntu提供windows操作界面及Linux，在练习 过程中尽量使用Linux命令，因为Linux具有无比 优点：稳定，高效，免费，开源，安全，多任务、 多用户等 Vi（Linux常用文本编辑器）常用命令学习： vi+“文件名”，即可创建一个vi操作文件，常用 命令在网上可搜索 Linux常用命令学习