代谢组学：基于质谱的研究方法-张富昌
质谱技术在蛋白质组学和代谢组学中的研究应用
１ 质 谱 分 析 技 术
解 析电离 质谱得 到蛋 白质 酶解后 的肽指纹 图谱 （ ｐ ｅ ｐ ｔ ｉ ｄ ｅ ｍ ａ ｓ ｓ
质谱 （ ｍａ ｓ ｓ ｓ ｐ ｅ ｃ ｔ ｒ ｏ ｍ ｅ ｔ ｒ ｙ ， ＭＳ ） 是带 电原 子 、分子或分子碎 ｉ ｆ ｎ ｇ ｅ ｒ ｐ ｒ ｉ ｎ ｔ ， Ｐ ＭＦ ） 。或 者用 电喷雾 串联 质谱 （ Ｅ Ｓ Ｉ — ＭＳ ／ ＭＳ ） 中得 片按质 荷 比 （ ｒ ｎ ／ ｚ ） 的大小 顺序 排列 的图谱 。质谱仪 是一 类能 到肽片段的进一 步裂 解谱 图。最后 用生物信息学 软件 处理质 使 物质粒子转化成 离子并通过适 当的 电场 、磁 场将 它们按空 谱数 据 ， 主要 通过检索蛋 白质或基 因数 据库鉴定蛋 白质 。
间位置 、时间先后 或者轨道稳 定与否实 现质荷 比分离 ， 并检 测强 度后 进行 物 质分 析 的仪器 。质 谱技 术是 研究 、分 析 和 鉴定 生 物大 分子 的前 沿 方法 ， 有 力地 推动 了蛋 白质组 学 的
研 究 …。可 以获 得样 品 的相对 分子 质量 、分子 式 、分子 中
・
５ ４・
继续医学教育２ ０ １ ４ 年１ 月
Ｍ ｅ ｄ ｉ ｃ ａ ｌ Ｅ ｄ ｕ ｃ ｍ ｉ ｏ ｎ ， Ｊ ａ ｎ ２ ０ １ ４ ， Ｖ ｏ １ ． ２ ８ ， Ｎ ｏ ． １
质谱 技 术在 蛋 白质 组 学和代 谢 组学 中的研 究应 用
张文 亮
（ 天津市安定 医院 ，天津 ３ ０ ０ ２ ２ ２ ）
Ｒ ａ ｂ ３ ７亚型 ２ 、Ｈ Ｐ蛋 白 、锌 指结构 ２糖 蛋 白等 ； ９种蛋 白
质谱代谢组学
三、发现代谢组学
二、GC-MS和LC-MS
2、代谢组学中所用的分离技术
气相色谱(GC) GC 要求挥发性，要用化学衍生化的样品 液相色谱(LC) 不能完全解决代谢组中亲水组分的分离问题 毛细管电泳(CE) 所用的缓冲液却不能与质谱仪的离子源兼容
亲水相互作用色谱(HILIC)
二、GC-MS和LC-MS
3、代谢组学的挑战
三、发现代谢组学
5、LC/MS
在
在发现代谢组学中的应用
寻找特征 方面：
安捷伦的MassHunt er LC/MS 工作站软件包含获得专利的分 子特征提取算法，专为精确质量LC/MS 飞行时间数据而设计， 能够识别与单一化合物相关的协变离子。此外，它还能识别和 解析常见的电喷雾干扰离子，如钠加合离子或二聚体的形成。 对这些离子鉴别和分组可以改善统计分析所用的定量估算， 并从随后的分析中除去伪数据
三、发现代谢组学
2、代谢谱分析，寻找有统计学意义的代谢物
分析重现性对表达谱分析至关重要------分析变异越小， 所需的重复数就越少 代谢谱分析是经过复杂的特征提取，对已知代谢物进行 靶向代谢谱分析，以寻找意外的代谢物------代谢物以其分子 特征为标志表示，包括保留时间、质量或质谱图及丰度 在代谢谱分析过程中，并不一定要知道该化合物/ 代谢 物是什么。但为了在不同次的样品分析之间跟踪这些化合物， 必需要用到其物理性质
三、发现代谢组学
高效液相色谱联用质谱技术在代谢组学中的应用研究
高效液相色谱联用质谱技术在代谢组学中的应用研究随着生物类疾病的不断增多，人们对疾病的研究越来越深入。
而代谢组学是近年来应用广泛的一种研究手段。
代谢组学主要研究生物系统内代谢物质的变化及其与疾病的关联。
而高效液相色谱联用质谱技术是其中的一种核心技术，其应用范围也越来越广泛。
第一部分：高效液相色谱联用质谱技术简介高效液相色谱联用质谱技术（HPLC-MS）是一种分析化学技术，它通过将固相柱层析和质谱检测有机物的灵敏性和选择性结合在一起，提供了在复杂矩阵中检测并鉴定分子的有力手段。
HPLC提供了化学分离的能力，而质谱则提供了结构分析和分子组分确定的能力。
HPLC-MS技术可以分为两种类型：电喷雾质谱法（ESI），磁共振光离子化质谱法（MALDI）。
ESI质谱法是一种常见的离子源技术，可以将高速电子轰击下的分子离子分离成单独的离子种，以便进行质量分析和结构分析。
而MALDI质谱法主要用于生物大分子（如蛋白质）的分析。
这两种技术都可以与HPLC技术组合使用，用于检测生物样本中的各种代谢产物。
第二部分：HPLC-MS在代谢组学中的应用代谢组学的主要研究对象是代谢产物。
代谢产物是把生物大分子、生命体征和营养物质转化成生物体能量和构造材料的化学物质。
代谢组学可以通过研究代谢产物之间的相互作用，揭示疾病的发展过程。
HPLC-MS技术可用于分析生物体内的代谢产物，进而了解生物体质的生理和病理状态。
例如，HPLC-MS技术可以用于检测血液、尿液、唾液等生物样本中的代谢产物，通过指纹图谱的比较，可以获得分类鉴别信息，用于疾病的检测和诊断。
在代谢组学研究中，HPLC-MS技术的优势是高度的灵敏度和选择性。
HPLC-MS技术是一种高通量的分析方法，可以在短时间内检测出多种代谢产物，从而作为研究疾病的生物标志物，为临床诊断和治疗提供重要的支持。
第三部分：HPLC-MS在糖尿病代谢组学中的应用糖尿病是一种代谢性疾病，其主要特征是胰岛素分泌不合理或作用异常，导致体内代谢失调。
基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析
基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析代谢组学是一门研究生物体内代谢产物组成变化的学科，其主要研究对象是生物体内代谢物质的种类、数量和相对丰度的变化规律。
在这个领域，高通量定量质谱技术是一个广泛应用的工具。
在这篇文章中，我们将深入探讨基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析的原理、应用和前景。
一、高通量定量质谱技术的基本原理高通量定量质谱技术是一种旨在快速准确地分析每种化学分子在样品中的含量的科学方法。
不同于定性分析技术，高通量定量技术可以定量地测定大量的代谢产物。
这些代谢产物可以从任何类型的样品（例如血液、组织样本、生物体培养基、土壤或水体等）中提取，并在代谢组学分析中得到进一步研究。
高通量定量质谱技术的基本原理是利用质谱（MS）的原理来实现。
质谱可通过将输入样品的某一化学分子分离出来，并对其进行量化分析，以确定该化学物质的质量。
通过将分离出的化学分子可进行碎片分析，再通过定量测量联合分析中每个碎片的相对丰度和数量，从而使高通量定量质谱技术具有高度精确、高通量的技术特点。
二、基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析的应用领域基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析广泛应用于生物医学研究、新药开发、生态环境和营养研究等多个领域。
生物医学研究：通过代谢组学分析技术，可以比较研究对象之间代谢产物的差异。
如糖尿病病人与非糖尿病病人之间代谢产物的差异；癌症病人与无癌症病人之间代谢产物的变化等。
这些应用都为临床治疗和疾病预防提供了重要线索。
新药开发：代谢组学分析技术可用于目标物理解、药效研究和代谢物筛选。
这对于药物开发和营销都至关重要，可以帮助研发人员快速评估目标化合物的药效和代谢产物。
生态环境：代谢组学分析技术可用于生物标志物研究和环境污染研究。
通过分析代谢产物的变化，可以发现环境中的污染物，以及其对生物的影响。
此外，代谢组学也可以被用来识别环境污染物暴露的生物标志物。
营养研究：代谢组学分析技术可用于研究人类和动物营养与代谢之间的关系。
质谱技术在代谢组学研究中的应用
质谱技术在代谢组学研究中的应用质谱技术是一种先进的分析技术，在生命科学领域得到广泛应用。
在代谢组学研究中，质谱技术可以帮助研究者更深入地了解生物体内代谢物的种类和含量，进而为疾病诊断和治疗提供基础数据。
本文将介绍质谱技术在代谢组学研究中的应用，以及其在生物发育、环境毒理学、药理学等多个领域的应用。
一、代谢组学研究中质谱技术的应用1. 代谢物种类、含量和结构的分析质谱技术可以对生物体内的代谢物进行快速、准确地鉴定和定量。
例如，通过多重反应监测（MRM）等技术，可以定量分析多种代谢物的含量，进而了解生物体内的代谢通路和代谢产物。
同时，质谱技术还可以用来鉴定和确定代谢物的结构，从而为代谢通路的解析提供基础数据。
2. 代谢物与生物发育的关系代谢组学研究也可以用来探究代谢物与生物发育的关系。
例如，研究者可以通过比较不同发育阶段的生物体内代谢物的含量变化，来了解代谢物在生物发育过程中的作用和调控机制。
同时，代谢组学研究也可以用来探究代谢异常与生物发育缺陷之间的关系。
3. 代谢物与环境毒理学的关系质谱技术在代谢组学研究中还可以用来探究代谢物与环境毒理学的关系。
例如，研究者可以通过监测生物体内代谢物的含量变化来了解环境因素对生物体内代谢通路的影响，或者通过比较正常和受到某种毒物污染的样本内代谢物的差异性，来确定这种毒物的毒性机制。
4. 代谢物与药理学的关系质谱技术在代谢组学研究中也可以用来探究代谢物与药理学的关系。
例如，研究者可以通过比较使用某种药物前后生物体内代谢物的变化情况，来确定这种药物对代谢通路的影响和调控机制。
同时，代谢组学研究还可以用来评估药物的药效和药物代谢动力学等方面的问题。
二、质谱技术在代谢组学研究中的发展和趋势随着代谢组学研究的不断深入和发展，质谱技术在代谢组学研究中的应用也不断增强和完善。
未来的发展趋势主要包括以下几个方面：1. 高通量、高分辨率的代谢组学分析技术随着高通量和高分辨率代谢组学分析技术的不断发展，质谱技术在代谢组学研究中的应用也会更加广泛和深入。
代谢组学质谱检测原理
代谢组学质谱检测原理代谢组学质谱检测原理引言代谢组学是研究在生物体内发生的化学反应和代谢产物的整体组成、结构和变化的学科领域。
它涉及到从生物样本中测量大量的小有机分子，并通过分析这些代谢物的组成和浓度变化来获得对生物体代谢状态的了解。
质谱（Mass Spectrometry, MS）是代谢组学中常用的技术手段之一。
本文将详细介绍质谱技术在代谢组学中的原理和应用。
一、质谱技术概述质谱技术是一种分析化学方法，它通过将化学物质转化为电离态，并利用质谱仪对质量-电荷比进行分析，从而确定分子的分子量、结构和组成。
质谱仪通常由四个主要部分组成：进样装置、电离源、质量分析器和检测器。
1.1 进样装置进样装置用于将待测样品引入到质谱仪中。
常见的进样方式包括固相微萃取（Solid Phase Microextraction, SPME）、气相色谱（Gas Chromatography, GC）-质谱联用、液相色谱（Liquid Chromatography, LC）-质谱联用等。
通过进样装置，待测样品被引入到电离源中。
1.2 电离源电离源是质谱仪中的核心部件，它用于将待测化合物转化为带电粒子，以便进行质量分析。
常见的电离方式包括电子轰击电离（Electron Impact, EI）、化学电离（Chemical Ionization, CI）和电喷雾电离（Electrospray Ionization, ESI）等。
其中，电喷雾电离是代谢组学质谱检测中最常用的电离方式之一。
1.3 质量分析器质谱仪中的质量分析器用于分离并测量不同离子的质量-电荷比。
常见的质量分析器包括飞行时间质量分析器（Time-of-flight Mass Analyzer, TOF）、质量分析滤波器（Quadrupole Mass Filter, QMF）和磁扇质谱仪（Magnetic Sector Mass Analyzer）等。
不同的质谱分析器有各自的特点和应用领域，在代谢组学中的选择需要根据具体实验的要求来确定。
代谢组学研究方法
代谢组学研究方法代谢组学是一种研究生物体在特定条件下代谢物组成和变化的科学方法。
它通过对生物体代谢产物的全面分析，来了解生物体在不同生理、病理状态下的代谢反应和变化规律，从而为疾病诊断、预测和治疗提供重要依据。
以下是几种常见的代谢组学研究方法。
1. 质谱法：质谱法是代谢组学最常用的研究手段之一。
它主要通过质谱仪来检测物质分子的相对分子质量（m/z）和相对丰度，并将其转化为代谢物的质谱图谱。
其中，质谱法可以分为核磁共振质谱（NMR）和质谱质谱（MS/MS）等多种技术。
2. 核磁共振法：核磁共振法是一种通过检测样品中氢、碳、氮等核的共振信号来确定代谢物结构和含量的方法。
它具有非破坏性、高分辨率和高灵敏度等优点，对于样品含量丰富的代谢物的分析效果较好。
3. 比色法和荧光法：比色法和荧光法是通过测量代谢物的吸收光谱和荧光光谱来定量和鉴定代谢物。
这种方法通常适用于含量较高的代谢物或者需要迅速分析的情况。
4. 气相色谱-质谱联用（GC-MS）：GC-MS是常用的代谢组学分析方法之一，它结合了气相色谱和质谱两种技术。
GC-MS 可以将混合物中的代谢物分离并鉴定，进而分析代谢物的相关信息。
5. 液相色谱-质谱联用（LC-MS）：LC-MS的原理与GC-MS类似，只是它将气相色谱替换为液相色谱。
LC-MS具有高灵敏度、高选择性和高分辨率等优点，适用于分析样品中极性和非极性的代谢物。
除了以上几种常见的代谢组学研究方法，还有基因芯片、生物传感器等其他技术也被应用于代谢组学研究中。
随着科学技术的不断进步，代谢组学研究方法也在不断更新和发展，相信将来会有更加高效和精确的方法出现，为生物医学研究提供更多的帮助。
代谢组学基于质谱的研究方法
代谢组学基于质谱的研究方法代谢组学是一种研究生物体内代谢物的高通量分析方法，通过对代谢物在生物体内的组成和变化进行定性和定量的分析，以揭示生物体在不同生理和病理状态下的代谢特征和变化规律。
质谱技术是代谢组学中最常用的分析方法之一，其具有高选择性、高灵敏度和多样化的分析能力。
本文将介绍基于质谱的代谢组学研究方法。
基于质谱的代谢组学研究方法主要包括样品前处理、代谢物的分离和鉴定以及数据分析三个步骤。
首先，样品前处理是整个代谢组学研究的重要环节。
在代谢组学研究中，样品多为复杂的生物体组织或生物体液，如血清、尿液和唾液等。
这些样品中的代谢物种类多样且浓度差异大，因此需要对样品进行前处理，以提取和富集代谢物。
常用的样品前处理方法包括蛋白质沉淀、固相萃取、超滤和溶剂萃取等。
这些方法可以去除样品中的干扰物，同时也使代谢物浓缩，提高检测的灵敏度。
其次，代谢物的分离和鉴定是基于质谱的代谢组学研究的核心。
代谢物的分离可以通过色谱技术实现，如气相色谱（GC）和液相色谱（LC）。
GC质谱联用（GC-MS）是常用的分析方法之一，适用于气相稳定的代谢物的研究，如有机酸、氨基酸和小分子醇等。
LC质谱联用（LC-MS）可用于水溶性代谢物的分析，如糖类、核苷酸和多肽等。
此外，质谱技术还包括离子迁移谱（IMS）、飞行时间质谱（TOF-MS）和串联质谱（MS/MS）等不同工作方式的仪器，可用于不同类型的代谢物分析。
最后，数据分析是基于质谱的代谢组学研究的重要环节。
质谱数据常为高维度、复杂且多变的数据，因此需要进行数据处理和统计分析才能提取有效信息。
常用的数据处理方法包括去噪、峰识别和对齐等，以消除数据中的噪声和对应不同实验之间的差异。
统计分析方法包括多变量分析和生物信息学分析等，可用于特征筛选和模式识别，以找出与不同生理状态相关的代谢标志物，并揭示其潜在的代谢途径和生物过程。
总的来说，基于质谱的代谢组学研究方法可用于揭示生物体代谢的多样性和复杂性。
质谱代谢组学
EI 电离经常会导致分子离子的丢失------找不到匹配
的EI谱------缺少的分子离子的质量信息将使可能的化合物的数 量变得非常庞大 因此，GC/MS最适合对已知的或预期的代谢物进行分析
5、LC/MS 分析
二、GC-MS和LC-MS
液相色谱可以分离无挥发性和未衍生化的代谢物。因此， LC/MS可以分析的化合物种类范围比GC/MS 更广
2、代谢组学的一般流程
一、代谢组学基本知识
代谢组学
发现代谢组学
靶向代谢组学
3、发现代谢组学的一般流程
一、代谢组学基本知识
代谢谱分析（也称为差异表达分析），在一组实验和对 照样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物
鉴定，进行代谢谱分析后，测定这些代谢 物的化学结构
解释，研究流程的最后一步，解释所发现的 代谢物与生物过程或生物状态之间的关联
而且重现性好，而且不会受离子抑制的影响
简单的鉴定方法只需要扣除了背景的EI 图谱，和一个通用 EI谱库检索，如NIST 谱库。更有效的鉴定方法是采用包含了 预期的化合物保留时间和EI 图谱的特定应用数据库同时对分 析物的色谱保留时间和质谱图进行检索
4、GC/MS 分析
EI源的缺点
二、GC-MS和LC-MS
三、发现代谢组学
3、发现代谢组学有以下六个步骤
3、数据标准化，对保留时间和响应的漂移给予必要的校正
三、发现代谢组学
4、统计分析，用于发现样品组别之间的统计学差异
5、鉴定，GC/MS 所得的EI 图谱非常适合进行谱库检索 6、解释，一旦代谢物被鉴定出来，就需要通过解释实验结 果，推断其在代谢的生物通路中的地位
代谢组学：基于质 谱的研究方法
汇报人：张富昌 指导教师：田中民 西安交通大学 2014年4月13日
质谱技术在代谢组学研究中的应用
质谱技术在代谢组学研究中的应用代谢组学是一项关注代谢产物的综合性研究。
通过对代谢物的分析，可以了解机体在特定生理或病理情况下的代谢过程，也可用于寻找疾病的生物标志物。
质谱技术可以精确地分离和鉴定代谢物，因此在代谢组学研究中得到广泛应用。
代谢组学中的质谱技术可以分为两种类型：非定向代谢组学和定向代谢组学。
非定向代谢组学是指在不预设任何代谢产物的情况下，对所有代谢物进行全面的分析。
定向代谢组学则是在预设的分析目标基础上进行检测，因此具有更高的鉴定准确性。
非定向代谢组学中常用的质谱技术包括液质联用质谱（LC-MS/MS）、气质联用质谱（GC-MS）和液质联用高分辨质谱（LC-HRMS）。
这些技术的优势在于可以同时检测多种代谢物，从而发现代谢物之间的关系。
定向代谢组学则部分依赖先验知识。
对于预设的分析目标，可以使用靶向代谢物分析进行鉴定。
这种方法需要准确的内标方法和确认分析，以确保分析准确性。
靶向代谢物分析的优势在于能够更准确地检测代谢产物和药物，是一种成熟的技术，用于检测代谢物和药物的代谢在毒理学和药理学方面得到了广泛应用。
质谱技术在代谢组学研究中的应用非常广泛，例如在检测肿瘤、代谢综合征和糖尿病等方面。
它为寻找新的生物标志物提供工具，为个性化医疗提供了基础，并有助于疾病预测和疾病管理。
除了生物医学方面，质谱技术在环境污染检测和食品品质监测中也有广泛的应用。
总之，质谱技术在代谢组学研究中的应用已经展现出巨大的潜力。
通过不断优化技术，探寻更多可能的代谢物标志物，可以为疾病的早期诊断和治疗提供帮助。
它是一种非常重要的工具，将在医学和生物科学的领域得到广泛应用。
代谢组学的研究方法和研究流程
代谢组学的研究方法和研究流程分子微生物学１12３０0０0３林兵随着人类基因组计划等重大科学项目的实施，基因组学、转录组学及蛋白质组学在研究人类生命科学的过程中发挥了重要的作用，与此同时, 代谢组学(ｍｅtaｂoloｍiｃs）在2０世纪90年代中期产生并迅速地发展起来，与基因组学、转录组学、蛋白质组学共同组成系统生物学。
基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等各种组学0在生命科学领域中发挥了重要的作用，它们分别从调控生命过程的不同层面进行研究, 使人们能够从分子水平研究生命现象, 探讨生命的本质, 逐步系统地认识生命发展的规律.这些组学手段加上生物信息学, 成为系统生物学的重要组成部分。
代谢组学的出现和发展是必要的, 同时也是必须的。
对于基因组学和蛋白质组学在生命科学研究中的缺点和不足, 代谢组学正好可以进行弥补。
代谢组学研究的是生命个体对外源性物质（药物或毒物)的刺激、环境变化或遗传修饰所做出的所有代谢应答, 并且检测这种应答的全貌及其动态变化。
代谢组学方法为生命科学的发展提供了有力的现代化实验技术手段, 同时也为新药临床前安全性评价与实践提供了新的技术支持与保障.1 代谢组学的概念及发展代谢组学最初是由英国帝国理工大学Ｊereｍｙ N ichｏｌson教授提出的，他认为代谢组学是将人体作为一个完整的系统，机体的生理病理过程作为一个动态的系统来研究, 并且将代谢组学定义为生物体对病理生理或基因修饰等刺激产生的代谢物质动态应答的定量测定。
20０0年，德国马普所的Fｉeｈn等提出了代谢组学的概念，但是与Ｎ ichoｌs ｏn提出的代谢组学不同, 他是将代谢组学定位为一个静态的过程，也可以称为/代谢物组学, 即对限定条件下的特定生物样品中所有代谢产物的定性定量分析。
同时Ｆieｈn还将代谢组学按照研究目的的不同分为4类: 代谢物靶标分析，代谢轮廓（谱)分析, 代谢组学，代谢指纹分析。
现在代谢组学在国内外的研究都在迅速地发展, 科学家们对代谢组学这一概念也进行了完善, 作出了科学的定义: 代谢组学是对一个生物系统的细胞在给定时间和条件下所有小分子代谢物质的定性定量分析，从而定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的科学。
代谢组学研究的试验方法
GC-MS联用仪器
HEWLETT PACKARD 5972A Mass Selective Detector
1.0 DEG/MI N
MS
HEWLETT PACKARD
5890
Sample
Gas Chromatograph (GC)
B
Mass Spectrometer
A B C D
D A
A C
C B
四级离子阱质谱仪 离子回旋共振质谱仪
质谱注意事 项 进样系统 离子源
质量分析器
检测器
质谱仪器中凡有样品分子和离子的地方必须抽成真空状态， 即质谱仪的离子源、质量分析器及检测系统都必须处于真 空状态下工作（一般为1.333×10-4～1.333 ×10-6Pa ）。 质谱仪的真空系统要求残余气体中不能留有对测定不利的 气体成分，要求本底小，否则：空气中的氧会烧坏离子源 的灯丝；会引起额外的离子－分子反应，使质谱复杂化， 且干扰离子源中电子束的正常调节，影响一起的分辨率； 真空度低会使本底增高，干扰质谱图。
255.1 230.9 247.0
311.0 321.0
373.0
240 260 m/z, amu
280
300
320
340
360
380
400
检测硝基呋喃类代谢物
色谱分析的发展 HPLC-MS（高效液相色谱质谱联用技术）:凭借其分离效能高，分析速度快， 灵敏度高及应用范围广等优势，在代谢组学研究中占有较大比重。 同时该方法可以实现对复杂基质中结构相似的化合物的同时分析可以同时额定 生物样品中的已知和未知化合物。 缺点：分析过程中对化合物的偏向性，极性化合物难以保留在柱上，无法被检 测，缺乏可供定性参考的规模数据库。 UPLC-MS（超高效液相色谱质谱联用技术）：UPLC系统是利用创新技术进 行整体设计从而大幅改善色谱分离度、样品通量和灵敏度的最新液相色谱技 术，相较目前分析最快的HPLC，UPLC分析速度提高了9倍，分辨率提高了 2倍，灵敏度提高了3倍，一次分析得到的信息量远远超过了高效液相色谱.
基于质谱技术的代谢组学研究
基于质谱技术的代谢组学研究代谢组学是一门研究生物体内代谢物的整体组成和变化的学科。
通过对生物体内代谢产物的分析，可以了解生物体的生理状态、疾病发生机制以及药物的代谢过程等。
而质谱技术作为代谢组学研究中的重要手段之一，为代谢物的鉴定、定量和分析提供了强大的工具。
质谱技术的原理是将样品中的化合物通过质谱仪分离和检测。
其中，液相色谱质谱联用技术（LC-MS）和气相色谱质谱联用技术（GC-MS）是代谢组学研究中常用的两种质谱技术。
液相色谱质谱联用技术适用于极性和中性化合物的分析，而气相色谱质谱联用技术适用于挥发性和疏水性化合物的分析。
在代谢组学研究中，质谱技术可以实现对代谢物的高通量分析。
通过对样品进行质谱分析，可以同时检测和鉴定上千种代谢物。
这为生物体内代谢物的全面分析提供了可能，有助于揭示代谢物之间的相互作用和调控关系。
此外，质谱技术还可以定量分析代谢物的浓度，从而研究代谢物在不同生理状态或疾病状态下的变化规律。
质谱技术在代谢组学研究中的应用广泛而深入。
例如，在疾病诊断中，代谢组学研究可以通过分析患者体液中的代谢物，寻找与疾病相关的生物标志物。
这些生物标志物可以用于早期诊断、疾病分型和预后评估等。
同时，代谢组学研究还可以揭示疾病的发生机制，为疾病的治疗和药物开发提供新的思路和靶点。
除了疾病诊断和治疗，质谱技术在食品安全和环境监测等领域也有重要应用。
通过对食品中的代谢产物进行分析，可以评估食品的质量和安全性。
同时，质谱技术还可以用于环境中有害物质的检测和监测，为环境保护和健康评估提供科学依据。
然而，质谱技术在代谢组学研究中仍面临一些挑战。
首先，质谱技术对样品的前处理要求较高，需要对样品进行提取、纯化和浓缩等步骤。
其次，质谱技术在代谢物的定性和定量方面仍存在一定的局限性，需要结合其他分析方法进行验证和补充。
此外，质谱技术的高通量分析也导致数据量庞大，对数据处理和分析的要求较高。
综上所述，基于质谱技术的代谢组学研究在生物医学、食品安全和环境监测等领域具有广阔的应用前景。
质谱分析在代谢组学研究中的应用
质谱分析在代谢组学研究中的应用随着科学技术的进步，越来越多的研究方法和技术被应用到生物医学领域中，代谢组学就是其中一种研究技术。
代谢组学是通过对生物体内代谢产物的定量和定性分析，以研究生物体内化学反应网络及生物学过程的方式。
而质谱分析则是代谢组学中不可或缺的技术之一。
一、质谱分析的基本原理质谱分析是一种以质谱仪为核心，通过对物质的质量、结构和数量等方面进行研究和分析的技术手段。
在分析过程中，样品通过某种方式离子化，并在质谱仪中产生离子束，进入质谱分析器中进行分析。
在质谱分析器中，离子束会先经过一个质量筛，筛选出不同质谱/电荷比的离子，然后进入离子检测器中进行检测。
离子检测器一般采用的是离子倍增管、微波离子探测器等设备，根据离子的数量及其比例输出信号，进而对样品进行分析。
二、质谱分析作为一种分析技术，在生物质谱学和代谢组学研究领域中具有广泛的应用。
代谢组学研究是通过对体内代谢产物的定量和定性分析，揭示生物学上的差异性，如生物活性、生长、饮食习惯、环境因素等。
质谱分析则是在代谢组学研究中强有力的检测和定量技术。
质谱分析是代谢组学研究中最常用的技术之一，尤其是高分辨率质谱技术在该领域中应用广泛。
通过对代谢产物进行高分辨率质谱检测，可以快速、准确地分析样品中所有的化合物，包括大多数生物标志物，如氨基酸、脂肪酸、核酸和神经递质等。
通过对这些代谢产物的定量和定性分析，可以更好地了解生物体的代谢状态，从而指导药物研发、生命周期评估及健康状况检测等方面的工作。
三、代谢组学研究中质谱分析的实际应用代谢组学研究中质谱分析的应用非常广泛，以下是一些实际应用的案例：1、糖尿病代谢组学研究糖尿病是一种代谢紊乱性疾病，通过对糖尿病患者及对照组样本中代谢物的分析，可以确定糖尿病患者中代谢产物的特征性差异，从而较准确地预测其患病风险。
研究人员使用高分辨率质谱技术分析了500多个患有和不患有糖尿病的人群的血清标本，并得出了患病个体与健康个体之间的差异代谢物。
代谢组学质谱检测原理
代谢组学质谱检测是一种分析生物体内代谢产物的方法，它利用质谱技术对生物体内代谢产物进行分析。
代谢组学质检测原理主要包括以下几个方面:
质谱技术:质谱技术是一种分离和鉴定化合物的技术，它通过将样品离子化并将其注入到高能量电场中，使其离子化并分离成不同的离子形式，然后通过对这些离子的质荷比进行测量和分析，来鉴定样品中的化合物。
代谢产物:代谢产物是指生物体内产生的各种化学物质，包括代谢产物、中间产物和毒性物质等。
这些代谢产物是生物体在生命活动中产生的物质，其种类和数量反映了生物体的代谢状态和生理状态。
质谱谱图:质谱谱图是质谱技术中用于表示样品中不同化合物的质荷比分布的图形。
质谱谱图可以显示样品中的不同离子形式和峰，从而帮助鉴定样品中的化合物。
质谱数据库:质谱数据库是一个存储了各种化合物的质荷比和结构的数据库。
质谱数据库可以用于帮助鉴定样品中的化合物，并提供质谱谱图的分析和解释。
药物分析中的质谱代谢组学技术研究
药物分析中的质谱代谢组学技术研究质谱代谢组学技术在药物分析中的应用质谱代谢组学技术是一种将质谱技术与代谢组学相结合的方法，广泛应用于药物分析领域。
通过分析药物在生物体内的代谢产物，可以帮助了解药物的代谢途径、代谢产物的结构以及代谢物对机体的毒性等信息。
本文章将重点探讨质谱代谢组学技术在药物分析中的研究进展和应用前景。
一、质谱代谢组学技术简介质谱代谢组学技术是一种将质谱技术与代谢组学相结合的方法，通过分析生物体内代谢物的种类和相对丰度，以及代谢产物的结构和代谢途径，可以对药物进行全面、系统的评估。
质谱代谢组学技术通常包括样品前处理、质谱分析和数据分析三个步骤。
1.1 样品前处理样品前处理是质谱分析中的重要环节，可以通过提取、富集等方法，将目标分子从复杂的生物基质中分离出来。
常用的样品前处理方法包括液液萃取、固相萃取和固相微萃取等。
1.2 质谱分析质谱分析是质谱代谢组学技术的核心环节，通过质谱仪器对代谢物进行分析和鉴定。
常用的质谱仪器包括气相色谱-质谱联用仪（GC-MS）、液相色谱-质谱联用仪（LC-MS）以及飞行时间质谱仪（TOF-MS）等。
1.3 数据分析数据分析是质谱代谢组学技术中不可或缺的一步，通过对质谱数据进行处理和解读，可以获得代谢物的信息，并分析代谢物的相对丰度差异、代谢途径以及代谢产物的结构等。
常用的数据分析方法包括多变量统计分析、主成分分析和层次聚类分析等。
二、质谱代谢组学技术在药物分析中的应用研究2.1 药物代谢途径研究质谱代谢组学技术可以帮助揭示药物在体内的代谢途径。
通过对药物代谢产物的结构和相对丰度的分析，可以明确药物被代谢成哪些代谢产物以及代谢产物之间的关系。
这对于评估药物的代谢特性、副作用和药动学参数具有重要意义。
2.2 代谢产物的结构鉴定质谱代谢组学技术可以帮助确定药物代谢产物的结构。
通过质谱仪器对代谢产物进行分析，可以得到其质荷比、质谱图谱等信息，进而推导出代谢产物的分子式和结构。
质谱学原理与同位素质谱分析方法_重新改_
目录质谱学原理与同位素质谱分析方法霍卫国张福松第一节质谱学概论一、质谱学的发展二、质谱分析技术的应用三、质谱分析技术与同位素水文学第二节质谱仪的工作原理、结构和主要性能指标一、质谱仪的工作原理二、同位素质谱仪的基本结构三、同位素质谱仪的主要性能指标第三节气相轻元素的稳定同位素分析概要一、气相稳定同位素质谱仪二、δ值的概念三、关于稳定同位素标准四、稳定同位素分析基本流程和测量结果的误差分析第四节用于同位素测定的样品制备系统和质谱分析方法一、同位素样品的制备1.水中δD、δ18O测定的样品制备2.水中δ13C测定的样品制备3.水中δ34S测定的样品制备4.水中δ15N测定的样品制备二、同位素质谱分析1.H2中δD的质谱分析2.N2中δ15N的质谱分析3.CO2中δ13C、δ18O的质谱分析4.SO2中δ34S的质谱分析质谱学原理与同位素质谱分析方法第一节质谱学概论一、质谱学的发展质谱学在现代科学仪器领域中占有重要位置，质谱仪器已成为推动科学技术发展的最重要工具之一。
在近百年发展历史中，科学家们以质谱仪器作为主要研究工具和手段，先后在不同的科学研究领域中造就出10名诺贝尔奖获得者，从而反映出质谱技术在整个科学技术发展中所作出的重要贡献。
质谱学是1898年英国著名物理学家J.J.Tnomson“阴极射线”研究的产物，他采用短的横电场和横磁场的平行组合作为质量分析器，利用辉光放电得到离子，采用照相法记录，给出了抛物线形的质谱图，第一次发现了氖的二种同位素20Ne、22Ne的存在。
1918年美国芝加哥大学物理学家A.J.Dempster研制成功第一台采用180°均匀磁场作为质量分析器的方向聚焦型质谱仪并发现了Ae、Zn、Ca元素的同位素，他于1918年至1924年先后分析了53个元素的同位素并制定出了第一个同位素丰度表。
与此同期英国剑桥大学物理学家F.W.Aston于1919年发表了他的第一台速度聚焦型质谱仪，用高频火花源给出单一方向的离子束，得到了与光谱相似的质量谱图，并于1924年至1937年三次改进了自己的仪器，使其质量分辨本领从130提高到2000，第一次证明了原子质量亏损，证实了爱因斯坦相对论的公式。
基于液相色谱-质谱联用技术的代谢组学方法研究薄荷烟对大鼠代谢的影响
基于液相色谱-质谱联用技术的代谢组学方法研究薄荷烟对大鼠代谢的影响石先哲;何智慧;窦阿波;张凤霞;练文柳;许国旺【期刊名称】《色谱》【年(卷),期】2010(28)8【摘要】将基于液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术的代谢组学分析平台用于薄荷烟对大鼠代谢影响的研究.分析了3组大鼠的尿样,包括对照大鼠、吸食普通烟大鼠和吸食薄荷烟大鼠,并采用主成分分析(PCA)方法对数据进行模式识别.PCA得分图表明吸食薄荷烟大鼠与对照组大鼠尿样的代谢差异要小于吸食普通烟大鼠.从PCA载荷图中找到并鉴定了犬尿喹啉酸等8种重要代谢物.通过考察代谢物在对照大鼠、吸食薄荷烟大鼠和吸食普通烟大鼠尿样中的相对含量变化,进一步说明了烟草中添加薄荷醇可减少烟草对大鼠代谢的影响.【总页数】4页(P765-768)【作者】石先哲;何智慧;窦阿波;张凤霞;练文柳;许国旺【作者单位】中国科学院大连化学物理研究所,中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁,大连,116023;湖南中烟工业有限责任公司技术中心,湖南,长沙,410007;中国科学院大连化学物理研究所,中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁,大连,116023;中国科学院大连化学物理研究所,中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁,大连,116023;湖南中烟工业有限责任公司技术中心,湖南,长沙,410007;中国科学院大连化学物理研究所,中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁,大连,116023【正文语种】中文【中图分类】O658【相关文献】1.基于超高效液相色谱-高分辨质谱联用技术的桑黄干预后大鼠尿液代谢组学分析[J], 董宇;俞忠明;李洪玉;赵丽沙;寿旦2.基于液相色谱-质谱联用技术的代谢组学方法用于中药通心络和人参对过度疲劳大鼠干预作用的评价 [J], 戴伟东;张凤霞;贾振华;魏聪;高鹏;路鑫;吴以岭;许国旺3.基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用技术的血瘀模型大鼠血浆代谢组学分析 [J], YANG Xiujuan;YANG Zhijun;LI Shuo;DENG Yi;YANG Yanze;MAN Qiong;LI Pengjie4.基于液相色谱-质谱联用技术的心肌缺血大鼠血清和心肌组织代谢组学 [J], 尹春园; 孙明谦; 金龙; 林力; 苗兰; 刘建勋5.基于液相色谱-质谱联用技术的代谢组学分析方法研究进展 [J], 徐天润; 刘心昱; 许国旺因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
基于飞行时间质谱的代谢组学分析
基于飞行时间质谱的代谢组学分析代谢组学（Metabolomics）是研究生体代谢产物（通常为小分子代谢产物）的系统、高通量、高灵敏度的方法和技术。
代谢组学在生物医学研究中具有广泛应用，包括疾病的诊断、治疗和预防等领域。
飞行时间质谱（ToF-MS）是一种高分辨率、高精度、高灵敏度的质谱分析技术，利用时间区间测量质荷比，是代谢组学分析的核心技术之一。
本文将就基于飞行时间质谱的代谢组学分析进行探讨。
一、基于飞行时间质谱的代谢组学分析的原理质谱技术是代谢组学中的常用工具，通过对代谢产物进行质谱分析，可以为研究生物学过程和疾病发生机制提供关键信息。
而ToF-MS是质谱技术中的一种，其原理是将样品离子化，然后在电场作用下通过飞行管（Drift tube）进行离子传输，不同离子根据其质荷比在飞行过程中表现出的时间差异，达到离子的分离与检测。
在待测样品进入ToF-MS之前，需要经过一定前处理步骤如样品收集、提取、衍生化等，使待测样品中的小分子代谢产物更易于检测。
接着，待测样品将进入ToF-MS，当样品进入离子源时，样品中的小分子代谢产物将通过化学游离或电离来产生离子，离子荷量（m/z值）将根据待测代谢产物而产生。
离子流经简单对轴的栅栏后，离子将进入高速飞行管（Drift tube），在飞行管中离子将根据复杂的离子输运过程而达到分离。
到达检测器时，积累离子的信号强度将被记录下来，从而得到离子的质荷比。
从离子到检测的整个过程是很短的，特征的离子信号将被记录在3-7微秒之内，这种技术使ToF-MS特别适合于大样本量的代谢组学分析。
二、基于飞行时间质谱的代谢组学分析的应用1. 代谢物鉴定ToF-MS作为代谢组学中常用的辨识和分类工具，主要应用于小分子代谢物的构成分析和代谢物鉴定。
通过ToF-MS技术，可以对高通量的小分子代谢产物进行定量或半定量分析，不但能够检测大量的代谢产物，同时还能够区分不同生理状态和疾病的代谢差异等。
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汇报人：张富昌 指导教师：田中民 西安交通大学 2014年4月13日
内容提要
一、代谢组学基本知识
二、 GC-MS和LC-MS
三、发现代谢组学
一、代谢组学基本知识
1、什么是代谢组学
代谢组学是通过比较对照组和实验组的代谢组 （metabolomes，某一生物的所有代谢物组分），以寻 找其它代谢谱差异的研究方法。这些差异可能与临床 生物标志物发现中研究的某些疾病相关，也可能与药 物研发毒理研究中候选药物摄入后的代谢改变有关。
1、典型的代谢组学实验需大量样品才能得到精确统计的结果 2、代谢组学研究通常需要多种技术；某种类型的样品往往比其 他样品更适合采用某种特定的分析技术 3、需要高度灵敏和精确的仪器
4、强大的软件工具对处理实验所产生的大量数据非常重要 处理GC/MS 和LC/MS 数据的色谱解卷积程序、寻找有意义 代谢物的一系列统计分析工具、帮助鉴定代谢物的代谢物数据库， 以及最终绘制分子间相互作用网络图的生物信息学软件等。
二、GC-MS和LC-MS
6、LC/MS 、GC/MS分析化合物的范围
三、发现代谢组学
1、发现代谢组学的概念
发现代谢组学主要是将对照组和实验组的代谢组（某一生物 体的全部代谢物）进行比对，以找出其代谢谱的差异。 发现代谢组学分析一般包括以下几个步骤： • 代谢谱分析（也称为差异表达分析），在一组实验和对照 样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物 • 鉴定，进行代谢谱分析后，测定这些代谢物的化学结构 • 解释，研究流程的最后一步，解释所发现的代谢物与生物 过程或生物状态之间的关联
三、发现代谢组学
5、LC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 解释 方面：
安捷伦Mass Prof iler 专业软件的通路分析功能，可以利用已 知的或独特的、用户基于已有数据设定的通路进行解释，大大 简化了生物通路过程
二、GC-MS和LC-MS
4、GC/MS 分析
气相色谱和质谱(GC/MS)是分析挥发性化学物质的有效组合。
气相色谱使用运载气推动分析物通过涂渍的熔融石英毛细管。
基于分析物在气相和毛细管内涂层之间的不同分配实现分离。
二、GC-MS和LC-MS
4、GC/MS 分析
电子轰击电离(EI)是GC/MS 最常用的电离技术，非常耐用
电喷雾(ESI) 和大气压化学电离(APCI)是LC/MS 最常用的两
种电离技术-----ESI 和APCI 都可能出现离子抑制，因此共洗脱 化合物可能被低估甚至检测不到
二、GC-MS和LC-MS
5、LC/MS 分析
目前没有可用于LC/MS 鉴定的谱库。但由于LC/MS 分析中 通常都有分子离子，其质量可以用代谢物数据库进行检索，如 METLIN 数据库 Q-TOF可以通过分子离子计算出经验式 LC/MS 最适合作为未知代谢物研究中的探索方法，或者在多 种目标代谢物由于挥发性问题不能用GC/MS 进行分析时采用
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 数据标准化和统计学分析 方面： 统计学分析软件需要具备以下功能： • 从大样本组和复杂的实验设计中，对数据（包括元数据）进 行轻松输入、标准化和对比 • 发现复杂的实验设计中数据间的联系—不局限于两两对比 • 鉴定后能够通过通路分析进行生物学解释 安捷伦的Mass Profiler 专业软件让您能够轻松输入、标准化、 比较并图形化显示大样本组的GC/MS 和LC/MS 数据，从而 快速发现代谢物标志物，并支持元数据分析。我们用的是 SIMCA-P
三、发现代谢组学
2、代谢谱分析，寻找有统计学意义的代谢物
分析重现性对表达谱分析至关重要------分析变异越小， 所需的重复数就越少 代谢谱分析是经过复杂的特征提取，对已知代谢物进行 靶向代谢谱分析，以寻找意外的代谢物------代谢物以其分子 特征为标志表示，包括保留时间、质量或质谱图及丰度 在代谢谱分析过程中，并不一定要知道该化合物/ 代谢 物是什么。但为了在不同次的样品分析之间跟踪这些化合物， 必需要用到其物理性质
二、GC-MS和LC-MS
2、代谢组学中所用的分离技术
气相色谱(GC) GC 要求挥发性，要用化学衍生化的样品 液相色谱(LC) 不能完全解决代谢组中亲水组分的分离问题 毛细管电泳(CE) 所用的缓冲液却不能与质谱仪的离子源兼容
亲水相互作用色谱(HILIC)
二、GC-MS和LC-MS
3、代谢组学的挑战
三、发现代谢组学
5、LC/MS
在
在发现代谢组学中的应用
寻找特征 方面：
安捷伦的MassHunt er LC/MS 工作站软件包含获得专利的分 子特征提取算法，专为精确质量LC/MS 飞行时间数据而设计， 能够识别与单一化合物相关的协变离子。此外，它还能识别和 解析常见的电喷雾干扰离子，如钠加合离子或二聚体的形成。 对这些离子鉴别和分组可以改善统计分析所用的定量估算， 并从随后的分析中除去伪数据
三、发现代谢组学
3、发现代谢组学有以下六个步骤
1、 分析，包括代谢物的分离和检测，一般采用GC/MS 或 LC/MS
2、 寻找特征，包括寻找样品中的所有代谢物。一个代谢 物检测不到，就意味着丧失了一次机会；因此尽可能多地检 测出样品中的代谢物至关重要
三、发现代谢组学
3、发现代谢组学有以下六个步骤
EI 电离经常会导致分子离子的丢失------找不到匹配
的EI谱------缺少的分子离子的质量信息将使可能的化合物的数 量变得非常庞大 因此，GC/MS最适合对已知的或预期的代谢物进行分析
二、GC-MS和LC-MS
5、LC/MS 分析
液相色谱可以分离无挥发性和未衍生化的代谢物。因此， LC/MS可以分析的化合物种类范围比GC/MS 更广
三、发现代谢组学
3、发现代谢组学有以下六个步骤
3、数据标准化，对保留时间和响应的漂移给予必要的校正
4、统计分析，用于发现样品组别之间的统计学差异
5、鉴定，GC/MS 所得的EI 图谱非常适合进行谱库检索 6、解释，一旦代谢物被鉴定出来，就需要通过解释实验结 果，推断其在代谢的生物通路中的地位
三、发现代谢组学
三、发现代谢组学
5、LC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 鉴定 方面：
METLIN数据库：
安捷伦METLIN 个人代谢物数据库软件是目前最全面的代谢 物数据库 可以根据关键词、分子式、化合物名称，或K E G G 、C A S 、 HMP 或METLIN 编号进行信息查询
该数据库软件能够与MassHunt er Prof iler 专业软件无缝整合， 共同进行统计学处理和通路分析
一、代谢组学基本知识
2、代谢组学的一般流程
代谢组学
发现代谢组学
靶向代谢组学
一、代谢组学基本知识
3、发现代谢组学的一般流程
代谢谱分析（也称为差异表达分析），在一组实验和对 照样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物
鉴定，进行代谢谱分析后，测定这些代谢 物的化学结构
解释，研究流程的最后一步，解释所发现的 代谢物与生物过程或生物状态之间的关联
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 分析 方面： • 良好的重现性，以便对大量样品进行比对和校正 • 卓越的可靠性，最大限度地延长正常运行时间，分析大量样品 • 高灵敏度，能够检测复杂样品中的低水平代谢物，动态范围 超过6 个数量
三、发现代谢组学
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
三、发现代谢组学
5、LC/MS 在要： • 良好的LC 和MS 重现性，以便对大量样品进行比对和校正 • 卓越的可靠性，最大限度地延长正常运行时间，分析大量样 品 • 高灵敏度，能够检测复杂样品中的低水平代谢物，动态范围 超过5 个数量级
在 寻找特征 方面： 安捷伦提供自动化质谱解卷积和鉴定软件(AMDIS) 进行解卷 积，该软件是NIST 谱库检索软件包的一部分。AMDIS 软件 包设计用于： • 发现相关的协变离子，用单组分色谱峰表示 • 从复杂的GC/MS 数据中提取出单纯组分质谱图 • 重建用于EI 谱库检索的质谱图
三、发现代谢组学
一、代谢组学基本知识
4、靶向代谢组学的一般流程
靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异 样本，验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行 定量分析。
一、代谢组学基本知识
5、代谢组学的一般流程
二、GC-MS和LC-MS
1、质谱在代谢组学中的应用
质谱(MS)因具有广泛的动态范围、能进行可重现的定 量分析，而且能够分析非常复杂的生理体液，已被用于 代谢组学的研究中。由于这类样品的复杂性，为了尽可 能多地检测代谢物，在质谱分析之前常常还要进行分离 （气相色谱、液相色谱或毛细管电泳）
三、发现代谢组学
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 数据标准化和统计学分析 方面：
三、发现代谢组学
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 解释 方面：
安捷伦Mass Prof iler 专业软件的通路分析功能，可以利用 已知的或独特的、用户基于已有数据设定的通路进行解释，大 大简化了这一过程
而且重现性好，而且不会受离子抑制的影响
简单的鉴定方法只需要扣除了背景的EI 图谱，和一个通用 EI谱库检索，如NIST 谱库。更有效的鉴定方法是采用包含了 预期的化合物保留时间和EI 图谱的特定应用数据库同时对分 析物的色谱保留时间和质谱图进行检索
二、GC-MS和LC-MS
4、GC/MS 分析
EI源的缺点