PubMed数据库检索

PubMed基本检索
smith j
作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写)， 之间不用标点 键入作者姓名
PubMed基本检索
"smith j"[au]
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换，实 现精确查找
PubMed基本检索
期刊检索
在检索框中键入期刊名，如：molecular biology of the cell， 系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成mol biol cell[journal] 进行检索。 也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式，如：mol biol cell，或者是输入刊物的ISSN（国际标准出版物代码）进行检 索，如：1059-1524。
PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题检索 临床查询检索
PubMed 基本检索
• 在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写均可），点击GO按钮， PubMed系统会自动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中查询 与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的“自动词汇匹配功能”。
PubMed基本检索
bacter*[TI]
截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。
PubMed基本检索
字段限制检索 采用字段限制方式进行检索，其规则是： 检索词1[字段标识] 逻辑运算符 检索词2[字段标识] 如：查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献. DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
PubMed基本检索
强制检索 "single cell"
普通检索
single cell
PubMed高级检索
PubMed高级检索
检索详情
高级检索界面 下可以看到明 细栏，预览， 检索史，限定 和组合检索等
检索史
PubMed主题词检索
《医学主题词表》数据库(MeSH Database) 利用主题词进行检索 方法: 1、点击主页右下角的MeSH Database进入主题词检索界面； 2、输入检索词后，点击go按钮，系统将显示与该词有关主题词； 3、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树状结构、组配的副主题词； 4、选择合适的主题词与副主题词后，点击send to按钮，进入检索表达式浏览 窗口； 5、点击Search PubMed将显示检索结果。
PubMed基本检索
字段限制检索 其规则是：检 索词+[字段 标识]
DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
Fra Baidu bibliotek
PubMed基本检索
常用检索字段描述和标识 Title[ti]：篇名字段 Abstract[ab]：摘要字段 Affiliation [ad]：著者地址字段。 Author name[au]：文章的作者，检索格式：姓+名。如："smith ja"[au] Journal title[ta]：期刊名称。如：cell[ta] Language[la]：论文出版语种。语种检索时可只输入前3个字母， 如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la] 比如：检索文章题目中含有高血压的中文文献 检索式:hypertension[ti] AND chi[la]
PubMed 数据库检索 石金
PubMed 数据库检索
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PubMed及NCBI相关数据库 认识PubMed PubMed检索方法 PubMed定题推送服务
PubMed 及相关数据库
• NCBI(National Center for Biotechnology Information，美国国立生物 技术信息中心)
www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
认识PubMed
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Summary
检索提示
作者AU 篇名TI 出处SO
文献类型(状态)
显示摘要
排序模式 显示数量
调整显示设置 可改变显示模 式，显示数量 及检索结果排 序
PubMed基本检索
hypertension[mh] AND 1995/01:1996/12[DP] AND review[pt]
检索 1995 年 到 1996 年出 版的关于高血 压方面的综述 性文献
PubMed基本检索
强制检索功能
PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。
如：在PubMed主页的检索提问框中键入“single cell”，并用 双引号引起来。点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分 割的词组在数据库的全部字段中进行检索。 如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2个词： single和cell检索，其检索表达式为：single AND cell. 很明显这 样的检索结果是不符合要求的。
如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancer， science，cell等，PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的 主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理，即 在杂志名后面加[TA]。如："cell"[ta]
PubMed基本检索
Eur J Immunol
期刊的一般检 索，是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号
• 例如：检索肿瘤 (cancer)方面的文章。 • 在检索框中输入：“cancer”，再点击“Go”按钮。 PubMed将自动 地利用它的“自动词汇匹配”功能将重要的词语结合在一起，并将不规范 的词语转换成MeSH词表中规范的用词进行检索，比如，检索“cancer” 将自动转换为："neoplasms"[MeSH Terms] OR "neoplasms"[All Fields] OR "cancer"[All Fields]
PubMed基本检索
hypertension[ti] AND chi[la]
检索文章题目 中含有高血压 的中文文献
PubMed基本检索
常用检索字段描述和标识 Publication date[dp]: 出版日期。 日期检索的形式为：YYYY/MM/DD[DP] 检索一段时期内的文章，日期之间可以加冒号，如： 1993/01:1995/06[DP] Publication type[pt]: 出版类型。有综述，新闻，传记，临床试验等。 如：review[pt] MeSH terms[mh]：主题词字段。如：hypertension[mh] Subheadings[sh]: 副主题词。与主题词组配检索. 比如：检索1995年到1996年出版的关于高血压方面的综述性文献 hypertension[mh] AND 1995/01:1996/12[DP] AND review[pt]
PubMed基本检索
自由词检索时 PubMed自动 将不规范的词 转换成规范的 词进行检索
自动词汇转换
PubMed基本检索
逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B
A B 布尔逻辑组合 检索，常用的 逻辑关系词有 AND，OR， NOT等
逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B A B
• 提供生物医学的分析与计算工具，协助研究人员了解生物的语言--DNA在健 康与疾病中所扮演的角色 • 发展新技术协助了解调控健康与疾病的基本分子与遗传过程， 包括建立储 存与分析分子生物、生化与遗传学知识的自动系统；促进研究与医学社群使 用数据库与软件；协调生物技术信息的传递与管理；执行以计算机为基础的 进阶信息分析过程，用以分析生物重要分子的结构与功能。
– NCBI是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一，其成立的原因 是为已故的参议院议员Claude Pepper发现计算信息处理方法对生物医 学研究的重要性，因此，在1988年11月4日成立NCBI。NCBI是 National Institutes of Health（NIH）底下的National Library of Medicine （NLM）的部门之一。由于NLM具有建立与维护生物医学数据库经 验，且因它是NIH的单位，因此可执行计算分子生物计划。NIH目前 是全世界最大的生物医学研究单位。 – NCBI成立的主要任务为：
可检索的数据库
• Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 • Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、临床与文献相关数据 • Conserved Domain Database（CDD），蛋白质功能区块保留序列数据库 • 3D Domains，蛋白质功能区块立体结构数据 • Gene，包含许多物种的基因数据库 • Genome，包含超过800种物种的基因组数据库 • GENSAT，小鼠中枢神经系统基因表现图谱 • GEO Datasets，基因表现实验与生物芯片数值结果数据 • GEO Profiles，基因表现图谱 • HomoloGene，同源基因批注数据库 • Journals，期刊文献（包含PubMed） • MeSH，医学主题词数据库 • NCBI Web Site，所有NCBI网页 • NLM Catalog，美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 • Nucleotide sequence database，核酸序列数据库（包含GenBank、RefSeq和PDB等三大序列 数据库）
PubMed基本检索
"cell"[ta]
期刊的标准检 索，是在期刊 名后面加字段 限定[TA]. 比 如:"cell"[ta]
PubMed基本检索
期刊数据库在 PubMed首页 导航栏的右下 角部分
期刊数据库
PubMed基本检索
截词检索 截词检索的作用：扩大检索范围，提高查全率。 截词符：用*表示，代表多个字符，将*加在检索词后可以表 示对所有以该词开头的词进行检索。 如：bacter*，可以检出bacter，bacteria， bacteriophage ， bacterium，等最多600个单词。
逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。 如：A NOT B A B
PubMed基本检索
作者姓名检索 按照姓+名缩写（不用标点）的格式键入作者姓名，如： smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第一 个字母可用大写也可用小写，姓前名后,姓用全称，名字一般用 缩写。 考虑到作者姓名的不同形式，PubMed采用自动转换功能进 行作者姓名检索，如：smith j将检索成smith ja, smith jb, smith jr 等。 精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段 限定[AU]，如："smith j"[au]，这样可避免PubMed自动转换，实 现精确查找。
可检索的数据库
• Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)，人类遗传疾病相关文献数据库 • PopSet，族群演化分析相关研究资料 • Protein sequence database，蛋白质序列数据库（包含Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等数 据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质序列资料） • PubChem BioAssay，化学成分之生物活性筛选资料 • PubChem Compound，小分子化学物质结构 • PubChem Substance，具生物活性之化学物质筛选数据 • PubMed，科学文献报导数据库 • PubMed Central，科学文献数字全文数据库 • Site Search，可搜寻NCBI的网页与FTP • SNP，单点核酸多样性数据库(dbSNP) • Structure，分子模型数据(MMDB) • Taxonomy，以核酸或蛋白质为基础的分类学信息 • UniGene，人类unique基因序列数据库 • UniSTS，unique序列卷标地址数据库
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电子优先
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2009年5月
2008年9月
PubMed 检索方法
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