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《PUBMED使用方法》课件

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PUBMED的搜索功能和使用技巧
1 快速搜索技巧
使用搜索词时,可以写单词的缩写、同义词以及纳入相关的关键字。
PUBMED使用方法
Welcome to this presentation on how to use PUBMED. Discover the advantages of this platform, tips on searching for articles and much more.
什么是PUBMED?
PUBMED是什么?
PUBMED是运行于美国国家医学图书馆之上的免费文献检索工具,提供了数百万份的医学 文献和研究报告
PUBMED的优势与作用
PUBMED 收录的期刊文献广泛,资源丰富,并且是医学领域权威性很强的检索工具之一, 多国医生和科研人员使用。
注册和登录PUBMED账号
注册PUBMED账号
2 高级搜索技巧
在高级搜索中,可以使用布尔逻辑运算符(AND、OR和NOT),以更精确地定义搜索问 题。
3 搜索结果的过滤
过滤筛选与精简搜索结果相当,可以更快更容易地找到所需内容。
如何阅读PUBMED上的论文
1
选定论文
查找感兴趣的论文,结合年份,作者,期刊等进行检索。
2
查看摘要
确认论文的基本信息并查看摘要,摘要内容包括背景、目的、方法、结果、结论 以及前景。
PUBMED的其他相关资源和服务
NLM

如何使用PUBMED---PPT课件

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与近似的主题词匹配 作为文本词(自由词)检索 在这种情况下,输入的检索词也将在标题 和文摘中检索
作用
将不规范的词语转换成规范的用词对主题词进行
自动扩展检索 这种处理能使检索结果更精确和全面。
期刊转换表
刊名全称 MEDLINE 刊名缩写 ISSN号
著者全名转换表
2002年以后发表的带有作者全名的文章 作者姓名可以采用正常的或倒置的 如:julia s wong wong julia s wong, julia s
预览/索引Preview/Index
Preview(预览)可以在显示条目之前显示所查 到的文献数 通过增加一个或多个单词来修改查询方案。 向下滚动Preview/Index找到“Add to Query or View Index”部分,使用下拉菜单 确定一个搜索域,向文本框中加入词语,单击 Preview可以看到查询结果。 Preview自动使用“AND”运算符来将单词合 为一体,即要求同时查询包含两个词的文献 显示最近三个检索式
著者索引
姓在前,名在后,名字缩写 o’brien jm adams sh pogonka t
如果在6个转换表中都没有
把词组分开重复进行自动匹配直到找到 匹配词为止。 如果还没有找到匹配词系统将把单个词 用逻辑”与”组配并到所有字段中检索。
single cell
("single person"[MeSH Terms] OR ("single"[All Fields] AND "person"[All Fields]) OR "single person"[All Fields] OR "single"[All Fields]) AND ("cells"[MeSH Terms] OR "cells"[All Fields] OR "cell"[All Fields])

《pubmed文献检索》课件

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我的图书馆和个人账户
1 个人账户
在PubMed上,您可以创建个人账户并保存 有用的文献,以便以后查看和组织。
2 我的图书馆
通过我的图书馆功能,您可以将文献保存到 您的个人图书馆中,并与其他人分享和合作。
最佳检索实践
1研究的目标和问题有清晰的了解。
2
步骤二:构建关键词
根据研究目标,构建与之相关的一组关键词和同义词。
3
步骤三:搜索和筛选
使用合适的检索策略,搜索PubMed数据库,并根据相关性和质量对文献进行筛 选和排序。
常见检索错误和解决方案
错误:关键词选择不当
解决方案:仔细选择与研究主题密切相关的关键 词,避免广泛或模糊的词汇。
错误:忽略相关的过滤选项
解决方案:利用高级搜索功能,使用文献类型和 语言等过滤选项来缩小结果范围。
错误:搜索结果太少或太多
解决方案:调整搜索策略,添加或删除一些筛选 条件,以匹配您的需求。
错误:不使用布尔运算符
解决方案:使用AND、OR、NOT等布尔运算符 来优化您的检索策略。
如何评估PubMed文献的可靠性
同行评审
确保您选择的文献已通过同行评 审,这意味着它已经被其他专家 认可为具有高质量和可靠性。
如何进行PubMed文献检索
关键词搜索
通过输入相关的关键词,我们 可以快速找到与我们研究主题 相关的文献。
高级搜索
高级搜索功能允许我们使用更 多的筛选条件,如作者、期刊、 日期范围等,精确地缩小搜索 结果的范围。
文献类型和语言筛选
通过选择文献类型和语言参数, 我们可以进一步细化我们的搜 索结果,以便找到具体类型和 语言的文献。
引用数量
检查文献的引用数量,高引用数 量通常表示该文献在学术界有一 定的影响力。

新版PubMed文献检索ppt课件

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NCBI成立的主要任务为: 提供生物医学的分析与计算工具,协助研究人员了解生物的语言-DNA在健康与疾病中所扮演的角色 发展新技术协助了解调控健康与疾病的基本分子与遗传过程, 包 括建立储存与分析分子生物、生化与遗传学知识的自动系统;促 进研究与医学社群使用数据库与软件;协调生物技术信息的传递 与 管理;执行以计算机为基础的进阶信息分析过程,用以分析生 物重要分子的结构与功能。
BLAST是一个NCBI开发的序列相似搜索程序,还可作为鉴别 基因和遗传特点的手段。BLAST能够在小于15秒的时间内对整 个DNA数据库执行序列搜索。NCBI提供的附加的软件工具有: 开放阅读框寻觅器(ORF Finder),电子PCR,和序列提交工 具,Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以从 HTTP或FTP来获得。
与分子生物社群互动,利用计算与理论方法提 高实验研究质量。
NCBI组织架构
Information Engineering Branch(IEB)
进行数据表现与分析的应用研究,包括在分子生物、遗 传学与生物化学的计算机储存、管理与检索系统。
设计各种呈现分子生物信息的数据库架构与规格书,包 括核酸、蛋白质与结构信息。
Entrez可以检索的数据库
Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of
Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据 Conserved Domain Database(CDD),蛋白质功能区块保留序列数据库 3D Domains,蛋白质功能区块立体结构数据 Gene,包含许多物种的基因数据库 Genome,包含超过800种物种的基因组数据库 GENSAT,小鼠中枢神经系统基因表现图谱 GEO Datasets,基因表现实验与生物芯片数值结果数据 GEO Profiles,基因表现图谱 HomoloGene,同源基因批注数据库 Journals,期刊文献(包含PubMed) MeSH,医学主题词数据库 NCBI Web Site,所有NCBI网页 NLM Catalog,美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 Nucleotide sequence database,核酸序列数据库(包含GenBank、 RefSeq和PDB等三大序列数据库)

pubmed数据库检索ppt课件

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Web of Science
学科覆盖面较广,不仅限于医学 领域,还涵盖了工程技术、物理 、化学、社会科学等众多领域, 提供引文追踪和分析功能;
Google Scholar
搜索引擎性质,可以搜索到各种 类型的文献,包括学术论文、专 利、会议论文等,覆盖面广泛。
06
PubMed数据库检索应用案 例
临床疾病研究检索案例
总结词
临床疾病研究检索案例
详细描述
PubMed数据库在临床疾病研究方面具有广泛的应用,例如检索关于糖尿病、心 血管疾病、癌症等领域的最新研究成果。通过关键词、主题词、作者等检索条件 ,研究人员可以快速获取相关文献,为临床实践和研究提供科学依据。
药物研发检索案例
总结词
药物研发检索案例
详细描述
在药物研发过程中,PubMed数据库也发挥了重要作用。研究人员可以利用PubMed数据库检索新药 研发相关的文献,了解药物的作用机制、药效学和药代动力学等方面的信息。这有助于加速药物研发 进程,提高新药的成功率和效益。
基础医学研究检索案例
总结词
基础医学研究检索案例
详细描述
基础医学研究是医学领域的重要组成部分,而PubMed数据库在基础医学研究检索方面 也有广泛应用。例如,研究人员可以利用PubMed数据库检索基因、蛋白质、细胞等方 面的最新研究成果,了解生命科学领域的最新进展,为进一步的基础医学研究提供思路
和方向。
提供多种检索方式,支持 关键词、作者、标题等字 段的检索,同时支持高级 检索和模糊检索。
数据库发展历程
01
02
03
04
1996年
美国国家医学图书馆(NLM) 建立PubMed数据库,最初只 收录MEDLINE数据库中的文献。

PubMed检索攻略PPT精选课件

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PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMed Unique Identifier) 。
MEDLINE: PubMed主体部分,记录均标有[PubMedindexed for MEDLINE]
In Process Citation: 又称PreMEDLINE,记录均标有 [PubMed-in process]
4
47
输入检索信息
点击“Search”
例:检索《病毒杂志》(archives of virology)2009年发表的《基因稳定性与连 续性分析》(genetic stability and linkage analysis)这篇文献
PubMed
1
主要内容
一、PubMed概述 二、PubMed检索途径与使用方法 三、 循证医学文献检索
2
一、PubMed概述
简介
PubMed是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine , NLM)下属美国生物技术 信息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)研制的基于Web的文献数据库
40
确定主题词
41
选择副主题词
添加到检 索框检索
主题词加权 检索选项
42
检索结果
43
例:通过主题词途径,检索有关心肌梗塞 (myocardial infarction)预防 (prevention and control)方面的文献。 要求主题词加权、不扩展检索
添加到检 索框检索
勾选加权检索、 不扩展检索选项
1971年正式建立了该系统的联机系统,称为“MEDLARS 联机检索系统”(MEDLARS online),即MEDLINE系统

第五章pubmed使用指南1PPT课件

第五章pubmed使用指南1PPT课件
PubMed使用指南
1
整体 概述
一 请在这里输入您的主要叙述内容

请在这里输入您的主要 叙述内容
三 请在这里输入您的主要叙述内容
2
主要内容
一、PubMed概况 二、 PubMed数据来源 三、 PubMed主页介绍 四、 PubMed检索方法 五、 PubMed的检索结果处理
3
PubMed 概况
➢ MeSH表 期刊刊名表 短语表 作者索引
➢ 如果在以上4个表中都找不到相匹配的词,PubMed 将把短语分开,以单词为单位,分别重复以上的 过程,检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍 找不到相匹配的词,则用单个词在所有字段查找, 各个词之间也是AND逻辑关系。
11
逻辑运算符
①逻辑“与”运算AND: 检索式写成A AND B,表示文献中同时包含检索
⑵ 带有双引号” ”作为短语检索:”cancer therapy”;
⑶ 带有连接号”-”作为一个词组检索:interleukin-6。
(4) 一 个 或 多 个 检 索 词 ( 系 统 默 认 空 格 为 AND 检 索 )
如:placenta growth oxygen genbacev o
➢ 限制检索字段:如liver cancer[ti] ➢ 通配符( ? ) ,如: “en?oblast
6
PubMed数据来源
➢ Record Suppled by Publisher - 出版商直接向PubMed提供电子记录。包括 MEDLINE未收录的部分记录。记录中用 [PubMed-as supplied by publisher]标记表示。 另外这些记录每天都向PREMEDLINE中传送, 则改为[PubMed-in process]。

【医学PPT课件】PubMed检索指南

【医学PPT课件】PubMed检索指南
龄(Ages )、文献子集限定(Subsets ) 自由词可以结合以上各种限定进行。
限 定 检 索 窗 口 全 貌
添加作者检索
添加期刊检索
限定记录有全文、免费全文或 摘要
文献发表时间限定
记录添加到PubMed时间限定
限定记录有全文、免费全文或 摘要
人类与动物限定 性别限定
文献语种限定
文献子集限定
Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等 字段
Title/Abstract [TIAB]
四、PubMed检索功能
检索
1、自由词智能检索
在检索框中键入一到多个单词,如键入: vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)
SubHeadings 副主题词
对一个主题词的多个方面进行修饰限定 的词,又称限定词。
特征栏功能介绍-Clipboard
(四) Clipboard功能介绍
将每次满意的检索结果暂时保存至此 最后集中处理(下载存盘或发E-mail) 最多500条记录,断开连接后保存8小时
(五) Details功能介绍
Details:显示计算机响应的本次检索式。
点击“URL”
/entrez/query.fcgi?cmd=Pu reSearch&db=pubmed&details_term=effect%5BAll%2 0Fields%5D%20AND%20%28%28%22magnetic%20r esonance%20imaging%22%5BTIAB%5D%20NOT%2 0Medline%5BSB%5D%29%20OR%20%22magnetic% 20resonance%20imaging%22%5BMeSH%20Terms% 5D%20OR%20MRI%5BText%20Word%5D%29%20A ND%20Review%5Bptyp%5D%20AND%20%222005/0 2/13%2000.01%22%5BEDAT%5D%20%3A%20%222

pubmed检索方法ppt课件

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医学文献数据库成质立信的息原,因同是时为 亦已可故连的结参到议生院物议分员类C数la据u库de查P询ep生pe物r发分现类 全文电子期刊库计信算息信。息处理方法对生物医学研究的重要性,因此,在 人基类因孟 图德 谱尔遗传1部目下9门前:88之,年N一11C。月BI4提日供成的立公N开CB(I。OpNeCnBAI是ccNesIHs)底数下据的库NL包M括的如 DNA与蛋白质序列 3D蛋白质结构 NCBI分类学
匹配器
• Journal Database-期刊库
• Batch Citation Matcher-多篇引文 • Clinical trails-对公众提供临床科研
匹配器
的当前信息
• Clinities-Entrez程序设计公用程序 ,诊断,病因,预后
7
(三)PubMed与MEDLINE
+ Not MEDLINE 出版商提供的电子文献中MEDLINE不收录的数 据。出版商一般提供的是整本期刊的信息,一 部分数据每日将被添加到PreMedline中去,若有 部分没有被MEDLINE收录,PubMed仍保存。每 条记录标有[PubMed-as supplied by publisher]。
- 累积了2200多万篇文献,年收录文献约40万篇,涉 及37个语种,回溯至1950年的数据涉及60个语种。数据库 47%为美国本土出版的文献,90%为英文文献,79%的文献有 著者撰写的英文摘要。
4
- 是一个免费的生物医学文摘数据库,约10%论文提 供全文(PMC),大部分论文提供指向全文提供者(付费 或免费)的链接。 + 学科范围:
1
一、 数据库概况 二、 检索体系 三、 结果处理 四、 PMC
2
/pubmed/

pubmed检索教程PPT课件

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文献相关注释
基金编号
基因符号
期编号
资助调研者
资助调研单位
国际标准期刊号
美国立医学图书馆识别号
美国医学文献数据库
1
.
2013.4
2020/5/19
一、数据库概况
(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)
(二)收录学科内容:
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文 献。
包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺 学、基础研究;临床、护理、公共卫生、卫生政 策发展或相关教育活动的内容。
三、PubMed 基本检索规则
刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如:Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
输入刊名检索发表在该刊上 的文献(限定出处字段SO)
18 .
2020/5/19
PubMed记录字段说明
MEDLINE 收录,逐步转为In Process, Indexed状态。
Not MEDLINE:PubMed 收录,MEDLINE不收录,一
直标注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed]
13 .
2020/5/19
二、PubMed的检索功能
高级检索 检索指南
stroke[ti] thrombolysis[ti]
16 .
2020/5/19
三、PubMed 基本检索规则
著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
思考题:中国学者的名字该如何转换呢? 如: 闻玉梅 卢正宏

PUBMED使用指南 PPT课件

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比较一下分别输入 zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au]; "zhang y" [au] 检索结果的区别。
3、刊名检索:可用刊名全称或缩写、ISSN号, 再加上刊名子段限定符,如:输入 J Tradit Chin Med [ta] ,然后敲回车或点击Go,系统
#20 Search #1 OR #3 OR #4 OR #5 OR #6 AND #1811:14:5416
#19 Search "sun bl"[AU]11:13:15
43
#18 Search sun bl[AU]11:12:59
43
#17 Search #6 NOT #111:07:4011
("Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p16"[Mesh] OR "Genes, p16"[Mesh]) AND "Ovarian Neoplasms"[Mesh]
CDKN2蛋白质:细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2
#1 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p16 [Mesh]
网上查询PUBMED数据库
1、PUBMED 词汇自动转换功能:例如:在键入 “Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示 ("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]),看一下主题词是什么?所用词汇是否合适? 然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检 中的篇数、所用时间。也可点击“limit"进行检索。 检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号 进行强制检索词检索。 2、著者强制检索:作者用双引号括起来 "zhang y" [au];
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
为MEDLARS最大的使用频率最高的数据库。
8
一、PubMed简介
1983年:随着光盘技术的发展, MEDLINE光盘数据库建成,并得到了广 泛的应用。 1997年9月26日, MEDLINE网络版开通, 取名PubMed,并向全球免费开放。
9
一、PubMed简介
很多医务工作者宁可在每次检索时都 花上成倍的时间,却不愿花上几个小时去 认真研究一下PubMed。"君欲善其事,必先 利其器",PubMed就好像一把功能强大的枪, 你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以 发射子弹,更重要的是,你要知道如何利 用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到 及至。
印刷版 1879 联机版 1971 光盘版 1983 网络版 1997
13
MEDLINE数据库简介
收录范围:收录7538种(2009.10.11) 权威期刊,包含50种语言,涉及70多个国家 (其中中国48种),约40万篇/年,已经累计 2100余万篇。内容涉及生物医学各个领域; 85%原文为英语。
10
一、PubMed简介
3.Pubmed的特点
收录生物医学权威期刊最多
世界上70多个国家的7000多种权威期刊
多种检索方法,多条检索途径 时效性极强(每周更新) 回溯年代久远(1948年至今) 利用MeSH作为转换词表,标引质量高 部分文献可以免费获取全文 检全率、检准率高
4.2 PreMEDLINE
是一种由正在加工处理中的文献记录组成
的数据库,这些新记录还未被标引,暂时 存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新, 经过标引(增加主题词、文献类型、数据 库存取号等字段)以后转入Medline,一旦 记录被转入到Medline数据库,就被从 PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标
有[in Process]标记。
16
New Data
Collect
Pre-Medline
Process 最新信息
一周以后
PubMed
Medline
17
4.3 Publisher-Supplied Citation
(出版商提供的书目信息) 出版商直接向PubMed提供的非 Medline收录的电子刊物,如: Science或Nature中的地质学文献 等。每条记录标有[ as supplied by publishers]标记。
目前MEDLARS已拥有40多个数据库,其 中最重要、最大、且发展最早的为 MEDLINE(MEDLARS ON LINE) 生物医 学数据库
7
一、PubMed简介
1971年: MEDLINE正式建成联机数据库,
并通过MEDLARS开展国际联机检索服务。 自MEDLINE投入联机检索服务以来,一直成
PubMed文献检索
1
教学内容
一、PubMed简介 二、检索规则与常用检索技术 三、检索方式与途径 四、检索结果处理 五、注册 六、练习题
2
一、PubMed简介
1.PubMed基本情况 2.PubMed的由来 3.PubMed的特点 4.PubMed的数据收录范围 5.PubMed主页
11
一、PubMed简介
4.PubMed的数据收录范围
MEDLINE PreMedline Publisher supplied citations (出版商提供的书目信息)
与NCBI其它数据库的链接
12
4.1 MEDLINE基本情况
出版:美国国家医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)。
3
一、PubMed简介
1.PubMed基本情况
PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息 中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户 提供服务的生物医学文献检索系统,是继 MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之 后推出的一种网络免费检索方式。
4
一、PubMed简介
包括2,100多万篇来自MEDLINE和其他
21
与NCBI其它42个数据库的链接
22
PubMed主页 /pubmed
高级检索入口
页面介绍
基本检索输入框 个人空间
Pubmed简介
检索指南
检索工具: 特定文献检索
临床咨询 专题咨询
其他资源: 主题词数据库
期刊数据库 临年至今 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
14
MEDLINE数据库简介
学科范围:
基础生命科学 生物科学 组织学 心理学 农业 医技工业学
临床生命科学 解剖学 化学与药物 社会医学 医技设备学 医学信息学
使用词表:MeSH(医学主题词表) 15
生命科学期刊的生物医学文献
最早可回溯到1948年 提供部分全文和其他相关资源的链接
5
一、PubMed简介
2.PubMed的由来
创刊:最早可以追溯到1879年美国NLM编 译出版的医学文献检索刊物《医学索引》 (Index Medicus, IM)。
6
一、PubMed简介
1964年:为了实现IM的自动化编辑出版, NLM开发了“医学文献分析与检索系统” ( Medical Literature Analysis and Retrieval System, 简称MEDLARS).
18
[PubMed-indexed for MEDLINE]
[PubMed-as supplied by publisher] [PubMed-in process]
19
PubMed与MEDLINE的区别
20
4.4与NCBI其它数据库的链接
Nucleotide:DNA序列数据库 Protein:蛋白质序列数据库 Genome:基因组序列数据库 Structure:分子结构模型数据库 OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库 PMC: PubMed中心,免费全文期刊检索
24
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词,PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换,然后进行检索。 ① MeSH表:包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表: 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表:文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表: PubMed所收录的的作者姓名组成。
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