ABI3730xl型测序仪日常维护标准操作规程(SOP)
3730测序流程
能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;
蛋白质与染色体DNA不复性而呈絮状,通过离心可
沉淀下来
碱裂法提取质粒操作步骤
菌体的培养
(挑单克隆或加少量菌液在含抗生素的培养基中,37℃震荡过夜培养
菌体的收集
(13000rpm离心1min,使菌体充分沉淀,弃上清)
质粒提取步骤一: 加入200ul I液 ,充分振荡,直到管底无沉菌为止 • 溶液I的组分:1.0M Tris-HCl / 0.5M EDTA, pH8.0,用前按比例加入RNase酶 • 溶液I的作用:菌体悬浮 • EDTA是在溶液I中主要起抑制DNase的作用 。 • 如果缺了溶液I,我们也可以用等体积的水或 LB培养基来悬浮菌体。 • 特别注意:菌体一定要悬浮均匀,不能有结 块。
五 上机操作
ABI 3730xl 自动测序仪外观图
胶泵
废液槽 POP7胶瓶 阳极缓冲液瓶 CCD检测窗口 缓冲液槽 水槽
96个样品自动进样及一体化16板自动进样样品架
已跑完板子放这 待上机样品放这
六 测序结果的分析处理
3730xl Sequence Map
测序结果峰图文件
Thanks!
ABI BigDye 3.1的组成成分
• • • • • • 测序酶 脱氧的dNTP 双脱氧的dNTP(荧光标记) Mg2+ ddH2O buffter
DNA测序模板用量
PCR产物
100-200 bp 200-500 bp 500-1000 bp 1000-2000 bp 2000 bp 1- 3 ng 3-10 ng 5-20 ng 10-40 ng 20-50 ng
RNase酶未加或失活
质粒提取步骤二: 加入300ul II液, 轻柔颠倒5~10次。 • 溶液II的组分: 0.4 N NaOH / 2% SDS; 两种溶 液等体积混合后使用 ,必须现用现配 • 溶液II的作用:裂解作用 • 溶液II在天气冷时会产生絮状沉淀,可温水预热 至沉淀消除。 • SDS是离子型表面活性剂。它主要作用是: a.溶解细胞膜上的脂质与蛋 白,从而破坏细胞膜。 b.解聚细胞中的核蛋白。 c.能使蛋白质变性而沉淀下来。
仪器设备维护规程
仪器设备维护规程一、设备保养1.1 定期检查设备使用情况,如发现异常情况应及时通知维修人员进行处理。
1.2 定期清洁设备表面,避免灰尘或杂物进入设备内部影响正常运行。
1.3 对设备的润滑部分进行定期保养,确保设备运转顺畅。
1.4 处于闲置状态的设备应定期开机运行,以避免长时间不使用导致设备故障。
二、设备维修2.1 当发现设备出现故障时,应立即停止使用,并通知维修人员进行检修处理。
2.2 维修人员应及时进行维修,并在维修完成后进行设备运行测试,确保设备正常。
2.3 对于更换零部件的情况,应选择符合要求的原厂零部件进行更换,保证设备的质量和性能。
2.4 维修后应定期对设备进行检查,确保设备运行正常。
三、设备保管3.1 设备使用完成后,应对设备进行清洁、整理,并存放在指定的场所。
3.2 设备存放时应避免受潮或受热,确保设备的正常使用。
3.3 对于易损耗易损件,应进行分类存放并标记使用寿命,及时更换。
3.4 设备在使用过程中应避免撞击或摔落,保证设备的完好性和安全性。
以上为仪器设备维护规程,希望全体员工能认真执行,保证设备的正常使用。
仪器设备是生产和工作中不可或缺的重要工具,对于设备的维护和保养,是保证设备稳定运行和延长设备寿命的关键。
因此,我们需要严格执行仪器设备维护规程,并进行相关管理和监督。
下面将继续探讨更多的维护内容以确保设备的稳定运行。
四、设备保养记录4.1 设备保养记录应当详细记录设备的维护情况,包括保养时间、内容、维修人员的签字等信息,并进行存档备查。
4.2 所有设备的保养记录应当进行分类归档管理,确保资料完整、准确、可查询。
4.3 对于定期维护和检查,应当在设备维护记录中注明具体的维护日期和维护内容,并进行定期审核和更新。
五、设备安全管理5.1 所有员工在使用设备前应接受相关的安全培训,了解设备的操作要点、安全注意事项和应急处理措施。
5.2 设备维护人员应了解设备的安全操作规程,并保持设备的安全性能,及时排除设备的安全隐患。
ABI测序仪简易使用20100106
评估定位结果: 各道的信号高度应该相差不大,间隔均一 96道毛细管一般为5或6,允许范围为4~8 48道毛细管为9~11) 确认所有毛细管都有信号
光谱校正
• 从图可以看到,四(或五)色荧光检 测系统的本质是检测四(或五)种荧 光素在其中心发射波长处的信号。由 于每一种荧光素的发射光谱不是锐线 光谱,而是 一种有一定宽度分布的光 谱带。所以一个纯荧光除在它自己光 谱的中心波长处能采 集到信号N1外, 在其他荧光信号光谱的中心波长处亦 能检测到信号而产生信号重叠。为了 校准信号重叠,需知道一种荧光信号 在其他荧光信号处产生的重叠系数。 所以,我们用四(或五)条不同长度 的DNA片断分别标记上不同的荧光 素来计算这些系数。
建立新的Analysis Protocol
Plate Manager:如何建立新的上样板
样品准备与上机
运行上样板
如何控制运行的程序
开始运行一个Run的程序
停止当前运行的板号 和 停止Run Scheduled中其他等待运行的板号 完成当前运行的板号 和 停止Run Scheduled中其他等待运行的板号 停止当前运行的板号 和 继续运行Run Scheduled中其他等待运行的板号
ABI公司 DNA测序仪器的应用
仪器硬件构造 3730XL
各部件功能
电源开关 打开或关闭仪器电源
照明灯开关
进样器按钮 阳极缓冲液杯
打开或关闭仪器内部的照明灯
使进样器抓取缓冲液槽到毛细管针端(或相反) 内装67毫升1X缓冲液,电泳时作为阳极介质 装1X缓冲液,电泳时作为阴极介质 装双蒸水,清洗毛细管用 装双蒸水,灌胶时盛放废胶 泵入胶并将其灌入毛细管 上装有阳极,阳极缓冲液杯装在此处 保证毛细管束的温度均一性和稳定性
测序仪安全操作及保养规程
测序仪安全操作及保养规程测序仪是生物医学研究中必不可少的仪器之一,它可以对生物样本进行多种测序分析,因此必须做好安全操作及保养工作,避免仪器的损坏和人员伤害。
下面将介绍测序仪安全操作及保养规程。
1. 安全操作1.1. 空气净化器测序仪需要在洁净的环境下运行,因此必须使用空气净化器。
安装空气净化器时,必须确保其在运行时没有噪声和振动,并且滤网及时更换。
1.2. 防护手套在操作测序仪时,必须戴防护手套,以避免手部受到样本和试剂的污染或有害物质的触碰。
1.3. 稳定电压测序仪需要稳定的电压才能正常运行。
建议使用稳定电源,避免电压突变导致仪器损坏。
1.4. 合理摆放测序仪应该放置在防潮、通风、干燥的地方,避免阳光直射。
同时,仪器周围应该保持干净整洁,避免灰尘进入机内。
1.5. 规范操作在使用测序仪前,必须确保操作人员已经接受过必要的培训,掌握了正确的操作流程和技术要领。
操作人员必须严格按照操作流程操作,避免操作失误导致仪器损坏或出现安全事故。
2. 保养规程2.1. 定期检查定期检查测序仪可以及时发现故障和磨损现象,避免损坏愈加严重,影响测序质量。
建议每周对仪器进行检查,包括传动部件、管路、散热器、滤网等。
2.2. 定期清洗测序仪的外壳和内部零件必须定期清洗。
渍液等污垢的积累不仅会影响测序质量,还会刺激操作人员的呼吸道和皮肤。
建议每季度对仪器进行全面的清洗,包括内部管路、面板、键盘等。
2.3. 及时更换耗材使用测序仪时,需要使用一些耗材,如滤芯、反应管、注射器等。
这些耗材通常有一定的使用寿命,必须及时更换。
建议根据实际使用情况,合理安排耗材更换时间。
2.4. 动物种类选择在进行测序操作前,必须选择适合的动物种类,避免使用有毒或易感染人的物种。
同时,在收集样本时必须遵守动物保护法律规定,避免非法采集。
3. 总结对于测序仪来说,安全操作和保养工作都至关重要。
仪器的损坏或人员伤害都会对实验产生很大影响,甚至会导致实验的失败。
基因测序仪仪器安全操作及保养规程
基因测序仪仪器安全操作及保养规程基因测序仪是一种非常重要的实验仪器,用于对DNA样本进行测序,是生物科学领域中的关键设备。
为保证实验过程的安全和设备的维护,本文将阐述基因测序仪的安全操作和保养规程。
安全操作规程1.1 实验前在开始实验前,必须检查仪器是否处于正常工作状态,如仪器有损坏或异常状况,则不得进行任何实验操作。
此外,还应该检查下列事项:•样品是否已经准备好,是否已经标注和保存好;•地面是否干燥,工作面是否平整;•是否有足够的试剂和耗材,如:RNA/DNA提取试剂、载玻片、PCR试剂盒等。
1.2 装置和操作在进行实验操作时,一定要遵守以下规定:•严格遵守安全操作规程;•穿着实验室制服和必要的个人保护用品,如手套、口罩、护目镜、实验室鞋等;•实验操作时,应该正确设置仪器参数,如温度、转速、体积等等;•仪器运行时,不要随意接近,保持安全距离;•禁止使用未经确认的试剂和耗材;•实验使用完毕后,应加入清洗操作。
1.3 废弃物管理实验过程产生的废弃物,需按照生物废弃物管理原则严格处理。
回收所有可回收的废弃物, 并将有害垃圾和血液等材料封装好,放置到指定位置等待生物废弃物处理。
2. 仪器维护规程不良维护和保养,会降低仪器性能、加快仪器的老化。
为使基因测序仪保持良好的工作状态,确保数据质量和可靠性,应定期进行维护保养:2.1 外部维护每个实验结束后,应进行以下维护:•清洁仪器表面,使用湿布和无刺激性清洁剂进行清洁;•清洁和更换样品仓的胶垫,防止仪器污染或失灵。
2.2 内部维护周期性的内部维护将保证基因测序仪的顺利运行,达到更优异的性能和更长寿命:•定期对反应试管仓进行清洗和消毒,以及更换零部件;•对滤光镜、标准灯和光源进行检查和清洁;•对光路的校正周期性进行检查,保证实验数据的准确性和重现性;•自动贴标纸需要定期清理,避免堆积拖慢系统运行效率;•在雾度过高的情况下,定期清洗纳米硅片,避免污染现象。
3. 仪器保养基因测序仪是非常重要的生物实验设备,为保证其长期稳定运行,我们应该按照以下要求进行保养:•对仪器进行外观检查,检查仪器表面是否有损坏;•定期更换压力表,避免强行使出现故障;•定期进行内部清洁,保证仪器的高性能和长寿命;•定期校准光路,保证实验数据的准确性和重现性;•在非实验时使用防尘罩,保持仪器的清洁和整洁。
3730XL基因分析仪的日常维护
• DELL维修电话:8008580950,8008582437
2011年6月24日星期五
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Thank you !
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每半年或一年要做的事情
• 更换毛细管或根据需要更换。 • 根据需要(如spatial信号变低等)可联系
工程师对机器进行保养
峰的左右不对称,后拖
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2011年6月24日星期五
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电脑的维护和保养
• • • • • •
每周进行一次重新启动 碎片整理 不装第三方软件 注意防病毒 定期备份数据,清理硬盘空间 清理数据库文件:cleanupDB.bat,cleanup processed plate
基因分析仪的日常维护
提
要
DNA测序仪的开机顺序与关机顺序 测序仪的日常维护和保养 测序仪所配电脑的日常维护和保养 测序仪常见故障及其处理方法
2011年6月24日星期五
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开机与关机
2011年6月24日星期五
——好的开头等于成功了一半
2011年6月24日星期五
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测序仪高通量基因分析安全操作及保养规程
测序仪高通量基因分析安全操作及保养规程1. 引言测序仪是一种用于高通量基因分析的重要设备,能够快速、准确地测序DNA或RNA样本。
为了确保测序仪的正常运行,保障实验室安全以及减少设备的故障率,本文档将介绍测序仪的安全操作规程以及保养维护规程。
2. 测序仪的安全操作规程为了确保实验室人员的安全以及设备的正常运行,需要遵守以下操作规程:2.1 实验室安全准备在使用测序仪前,必须确保实验室具备以下安全条件:•实验室空间应符合相关规定,并具备良好的通风系统;•实验室内应设置紧急停止按钮,并确保实验人员熟悉其位置和使用方法;•实验人员应佩戴适当的个人防护装备,如实验手套、护目镜等;•实验人员应接受相关安全操作培训,熟悉相关的应急处理措施。
2.2 测序仪操作步骤在操作测序仪时,应按照以下步骤进行:1.打开测序仪前,确保电源已经接好,且地线连接良好;2.检查设备外观,确保没有损坏或异物进入;3.打开设备电源,并按照设备说明书的要求进行初始化设置;4.准备样品,并按照测序仪的要求装载样品;5.设置测序参数,包括测序模式、测序深度等;6.启动测序仪,并耐心等待测序结束;7.测序结束后,关闭测序仪电源,并进行必要的数据处理和分析。
2.3 测序仪日常维护为延长测序仪的使用寿命,减少故障发生率,需要进行日常的维护工作:•定期清洁测序仪外壳和内部各个部件,注意避免使用含有腐蚀性或破坏性的溶剂;•定期检查和更换测序仪的滤芯和过滤器,确保流体系统正常运行;•定期校准测序仪的温度、湿度等参数,确保测序结果的准确性;•定期备份重要数据,并妥善存放以防丢失。
3. 结论本文档介绍了测序仪高通量基因分析的安全操作规程和保养维护规程。
通过遵守这些规程,可以保障实验室人员的安全,减少设备的故障发生率,提高测序结果的准确性和可靠性。
实验室人员在使用测序仪时必须严格遵守相关规程,确保实验的顺利进行。
3730XL 测序仪器操作指南说明书
3730XL 测序仪器操作指南开机:(1)打开显示器和电脑的电源开关,按键Ctrl+Alt+Delete ,输入密码125;(2)打开仪器电源开关,仪器初始化过程中电源旁指示灯由黄色闪烁20秒变为绿色;(3)双击打开桌面上Data Collection 软件,等待Service Console 窗口中的指示灯全部变成绿色后,DC 软件打开弹出。
关机:(1)与开机顺序相反,先点击Service Console 窗口上Stop ALL 按钮,等4个绿色小方框都变为红色圆圈时即可点击“X ”,关闭Run 3730 Data Collection 软件;(2)关闭仪器电源;(3)关闭电脑主机。
测序模板导入:(1) 当Data Collection 软件打开后,点击GA Instruments 3730, 点开“+”号;(2) 然后点击plate manager ,点击import 导入已经编辑好的模板(E:/plate manager ),最后点击open 就ok 了。
E: Plate manger (如何编辑模板)A. Copy 上一个编辑好的模板,按当天日期修改文件名(如20150630)B. 双击点击“是”(激活窗口点“关闭”)C. 将打开的EXCEL 表格中Container Name 和ID Plate 改为文件名(20150630)D. 将Sample Name 先修改为blankE.按列的顺序依次输入A1H1……A2H2,以此类推,空白孔不改,仍为blankF.点击左上角保存,点击是,跳出窗口G.点击右上角“X”关闭,跳出的窗口点击“不保存”运行程序:(1)打开Data Collection软件中的run schedule search advanced plate ID start with(例如20150630找到相应的测序表)点击add Done;(2)当软件左上方三角星由灰色变为绿色时,点击ok就开始运行程序,大约测序反应需要2.5小时,微卫星分析需要1小时。
ABI 3730xl测序仪简介-01
基因分型
2008年基因分型样本量为30000个; STR,SNP,CNV遗传标记
测序的原理
DNA测序的双脱氧链末端合成终止法. Sanger法测序的原理:
用DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种链终 止核苷酸为止。 每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱 氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸 (ddNTP)。 由于ddNTP缺乏延伸所需要的3‘-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地 在G、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种 dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱 基的链终止产物。 它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率 变性凝胶电泳分离大小不同的片段进行检测。
- 氩离子激光光源; 氩离子激光光源; 实现实时的、空间连续的测量;可以保证返回的光信息能够达到探测的量级。 激发波长为488nm和514.5nm 毛细管规格: 毛细管规格 96道毛细管 道毛细管 毛细管长度: 毛细管长度 50cm 凝胶的规格: 凝胶的规格 POP-7液体分离胶 液体分离胶 配套的试剂: 基因测序(BigDye3.1v和5×Sequence buffer) 配套的试剂 基因测序 和 × 基因分型(Liz120, Liz500, ROX500) 基因分型
SNP遗传标记在SnapSHot反应的结果
原理: 单碱基延伸,单碱基测序.利用延伸引物对PCR产物进行单个碱基的延伸,并引 入尾部的荧光.其荧光的颜色及其荧光出现的位置进行区分其基因型 SnapSHot技术优点: 可以研究样本量少,snp位点多,位点间物理距离较远的SNP检测.
13010G
13263A
测序服务安全操作及保养规程
测序服务安全操作及保养规程前言测序服务是现代分子生物学研究的重要手段之一,对生命科学和医学的发展有着重要的意义。
然而,在使用测序服务的过程中,也存在着各种潜在的危险和风险。
为了保障使用者的生命安全和数据安全,必须建立完善的操作规程,遵循标准化、规范化的实验操作流程,在日常使用中进行常规保养和维护,保障设备的正常运转。
安全操作规程1. 实验前的准备工作在进行实验前,必须确认实验室符合相关操作规范的要求,必须配备并佩戴符合要求的个人防护设备。
在实验开展前,需要进行以下的准备工作:•检查设备和试剂的质量和数量是否符合要求;•检查电气设备、仪器仪表、电源等是否正常运转;•确认使用的试剂具有合理的保质期和存储条件;•确认实验操作者熟悉操作流程,配备必要的工具和检测设备;•阅读操作手册,了解试剂的危险性以及操作的注意事项。
2. 实验中的安全措施在实验操作过程中,遵循以下原则,确保操作的安全可靠:•使用符合标准要求的试剂和试管,维护操作平稳、安全、可靠;•严格遵守操作流程和数据标准,确保测序数据真实可靠;•确保电气设备和仪器仪表的运转正常,避免设备故障导致损失;•在操作过程中,佩戴符合要求的个人防护设备,如手套、口罩、安全镜等;•对实验操作场所进行严密管理,锁定危险物品的存放处,确保实验室安全。
3. 实验后的工作测序完成后,需要对实验室进行清理和消毒工作。
同时,要将数据及资料进行归档,必要时进行备份。
•将阳极和阴极的电缆拔下,关闭电源;•关闭气源和窗子,检查所有仪器设备,检查空调是否正常运转;•将使用过的试剂分类储存,并储存在特定储存柜中;•对操作台、插座及周边环境进行消毒清理;•对生成的数据及文件进行整理归档,必要时进行备份。
设备保养规程为了保证测序仪器设备的正常工作,应对设备进行常规维护,并在必要时进行更换部件。
具体保养规程如下:1. 日常保养日常保养包括仪器设备和周边环境的日常检查和清洁。
•对测序仪器进行日常清洁,保证其轨道、焦点、视窗和反射器等反光面干净;•根据操作人员的反应情况,调整仪器的色温和亮度;•定期清理周边环境的灰尘、杂物等,保证仪器工作环境的整洁。
测序仪产品图片安全操作及保养规程
测序仪产品图片安全操作及保养规程概述测序仪是基因组学研究中非常重要的一种工具,它能够对DNA进行快速高效的测序,大大提高了基因组学研究的效率和准确度。
在测序仪的日常使用中,涉及到产品图片的查看和管理,这项工作需要注意一些安全操作和保养规程,以确保测序仪的正常运行和保持长期的有效性。
本文将介绍测序仪产品图片安全操作及保养规程,帮助用户正确地使用和维护测序仪,以保证其良好的工作状态和长期的使用寿命。
图片安全操作1.在使用测序仪时,不要随意更改或删除已有的产品图片。
如果需要更新或添加图片,应在相关人员的指导下进行操作,确保图片正确有效。
2.所有涉及测序仪的产品图片均应妥善保存和备份,不得随意删除或移动,同时要保证图片的完整性和可用性。
3.对于需要共享给他人的图片,应注意加密和权限控制,仅授权给有关人员使用,严禁随意外传或泄露,以避免不必要的风险和安全问题。
4.在处理产品图片时,应注意数据的准确性和完整性,不得随意修改或篡改数据,以避免对后续实验和研究的影响,同时也要保护测序仪的正常工作和稳定性。
保养规程测序仪是一种高性能的实验设备,需要经常保养和维护,才能保持其良好的工作状态和长期的有效性。
以下是测序仪的保养规程:清洁测序仪外观和内部1.在进行测序工作前,需要先清洁测序仪的外观,去除灰尘和杂物,以保持干净整洁。
2.经常对测序仪内部进行清洁和消毒,定期更换滤网和除湿剂,确保仪器内部干燥、洁净、卫生。
3.对于液体泄漏等情况,应立即清理,并及时维修,防止损坏测序仪,并且避免对下一批次的实验造成影响。
维护测序仪核心部件1.定期对测序仪的核心部件进行检查和维护,确保其正常工作和长期的有效性。
2.注意定期更换使用寿命较短的部件,如滤膜、离心管、电极等,避免损坏对测序仪的正常工作。
3.注意保养灯泡、电源等重要部件,及时更换老化部件,保证测序仪的长期使用寿命。
结论测序仪是基因组学研究中必不可少的一种实验设备,合理安全地操作和维护测序仪的产品图片,是确保测序仪正常工作和长期有效的关键步骤。
基因测序仪维修安全操作及保养规程
基因测序仪维修安全操作及保养规程前言基因测序仪是医疗科技领域的重要设备,用于对人体基因进行分析研究。
作为一种精密的科学仪器,基因测序仪的使用和维护需要遵循一定的规程和操作流程,以确保安全和精度。
本文将从维修、操作和保养三个方面,详细介绍基因测序仪的安全操作及保养规程。
维修规程1.维修前准备在进行基因测序仪的维修和维护时,必须保证电源已断开。
从设备中拆出任何元器件或连接时,应该首先断电。
确保设备已经完全关闭并拆除电源线后,才可进行其他的操作。
2.使用正确工具在维修过程中,应该使用适当的工具和设备。
使用不当的工具可能会导致设备有缺陷的情况,甚至会对使用者造成伤害和设备的质量问题。
3.使用原厂备件在更换故障部件和执行维修时,应使用相应的原厂备件和工具。
不推荐使用任何非原厂备件,因为这些备件未经过严格测试,另外,如果使用非原厂备件,可能会发生损坏和损坏扩大的情况。
4.维修记录在进行维修和维护的过程中,需要对工作步骤和结果进行逐一记录。
记录应该包括维修日期、维修人员、维修部件、所需时间和维修后的测序仪和组件的表现。
安全操作规程1.保持设备干燥在使用测序仪之前,应该确保使用环境干燥,以免水分对设备造成损害。
如果测序仪不干燥,有两种方法可以解决:第一种是为测序仪提供足够的通风和空气流动;第二种是使用一个泡沫箱或盒子将测序仪包装,以保持干燥状态。
2.避免使用不当电源测序仪必须接到正确的电源插座,且仪器标定的电源容量不能超过电源的承载范围。
如果测序仪不能正常运作或出现电器的异常情况,应立即停止对该仪器的使用和维修。
3.系统着装和个人防护为了保持操作人员的安全,每位操作人员应该穿戴防护设备。
这些设备包括塑料手套、滑动防磨破绽衣物和安全鞋,以防止磨损和摩擦。
同时,操作人员应该避免接触敏感部位,如眼睛和嘴巴,并且应戴护目镜和口罩。
4.操作前注意机器灭菌在开始任何基因测序仪操作前,定期进行设备的灭菌过程。
设备灭菌应遵循厂家的建议和其他相应的使用规程,以确保设备的干净和无菌。
测序仪遗传分析仪安全操作及保养规程
测序仪遗传分析仪安全操作及保养规程随着遗传分析技术的不断发展,测序仪遗传分析仪在科学研究和生物医学领域中的应用越来越广泛。
随之而来的问题是如何正确地进行操作和保养,以确保设备的安全性和可靠性。
本文将简要介绍测序仪遗传分析仪的安全操作和保养规程。
安全操作规程1.遵守操作手册。
首先,用户应当认真阅读测序仪遗传分析仪的操作手册,并按照步骤进行操作。
操作手册中包括重要的安全说明和维护建议,用户必须遵守这些说明,以免发生安全事故或设备故障。
2.熟悉设备结构。
在操作测序仪遗传分析仪之前,用户应该熟悉设备的结构、部件和参数。
掌握这些信息有助于正确地进行操作,并避免不必要的损坏。
3.使用合适的工具和材料。
用户在进行维护和维修时,必须使用合适的工具和材料,以防止对设备造成不必要的损坏。
4.避免使用损坏的设备。
用户必须确认设备在运输和使用过程中没有受到损坏,如果发现损坏,应该立即停止使用。
5.使用防静电手环。
测序仪遗传分析仪灵敏的电子元件对静电电荷非常敏感。
在操作前,用户应戴上防静电手环,并将设备放在防静电工作台上。
6.定期清洁和维护设备。
设备在使用的过程中会积累灰尘和污垢,影响设备的运行。
用户应该定期清洁和维护设备,以确保设备的可靠性和使用寿命。
7.警惕设备的异常情况。
用户在使用设备时应始终保持警惕,及时发现设备的异常情况,并做出相应的处理。
保养规程1.定期清洁设备。
设备使用一段时间后会积累灰尘和污垢,影响设备的性能和寿命。
用户应该定期清洁设备,以确保设备的可靠性和使用寿命。
2.定期更换耗材。
测序仪遗传分析仪需要一些耗材,如电极、滤芯、滤网等。
这些耗材使用一段时间后需要更换,用户应该按照操作手册中的说明更换这些耗材。
3.注意存放和运输。
设备在存放和运输过程中需要注意防震、防水和防静电。
存放时应该放在干燥、洁净和防尘的环境中,运输时应该采取防震和防静电措施。
4.定期进行保养。
用户应该定期对设备进行保养,清洁设备和更换耗材。
ABI 3730xl测序仪简介-01
SNP遗传标记在SnapS利用延伸引物对PCR产物进行单个碱基的延伸,并引 入尾部的荧光.其荧光的颜色及其荧光出现的位置进行区分其基因型 SnapSHot技术优点: 可以研究样本量少,snp位点多,位点间物理距离较远的SNP检测.
13010G
13263A
不同测序片段分析
200-250bp(36cm)
300-350bp(36cm)
500-650bp(36cm)
不同测序片段分析
150bp-300bp(50cm)
STR遗传标记的测序结果
AC
具有Ploy-A的片段序列
A
基因分型
原理:在一端引物上标记特定的荧光,通过PCR产物长度大小, 检测基因型. 内标选择: 1、荧光.(引物上物加的荧光的类型)
12406G
4833T 10646G 4491C
7028T
12705T 14569G
5301T 15607A 9824A 5178A
4715T 5417G 3010T 4216T 663A 11719A
3730xl的总结
基因检测:
2008年对4万个样本进行测序 检测碱基数达到2千4百万个 现可检测的PCR产物长度为600-1000bp
主要用途( 主要用途(三)
1、原始数据分析 、 数据收集软件 (随机配置) Data Collection v3.0 Auto-analysis with GeneMapper® v4.0 Seqencing analysing® v5.2 2、基因测序及分型的运行时间 、 96样本 1000样本 1小时40分钟 10小时 (3130xl需要6个小时)
- 氩离子激光光源; 氩离子激光光源; 实现实时的、空间连续的测量;可以保证返回的光信息能够达到探测的量级。 激发波长为488nm和514.5nm 毛细管规格: 毛细管规格 96道毛细管 道毛细管 毛细管长度: 毛细管长度 50cm 凝胶的规格: 凝胶的规格 POP-7液体分离胶 液体分离胶 配套的试剂: 基因测序(BigDye3.1v和5×Sequence buffer) 配套的试剂 基因测序 和 × 基因分型(Liz120, Liz500, ROX500) 基因分型
ABI的使用维护及校准标准操作程序
A B I7300的使用维护及校准标准操作程序1、目的:ABIPRISM7300型核酸扩增荧光检测仪能够正确和正常的使用,保证扩增及结果分析的标准化、规范化。
2、适用范围:ABIPRISM7300型核酸扩增荧光检测仪。
3、操作人:段建平蔡果4、操作程序4.1操作方法4.1开机顺序:先开电脑,待电脑完全启动后再开启定量PCR仪主机,等主机面板上的绿灯亮后即可打开ABI7300系统软件,进行实验。
4.2创建荧光定量PCR检测文件:4.2.1双击7300SystemSoftware软件图标。
从File菜单中选择New(或单击工具栏中的“新建”按扭)4.2.2在NewDocument窗口中,Assay项选择“AbsoluteQuantification(StandardCurve)”,选择“完成”,就会出现一个96孔的空白面板。
4.2.3双击此空白面板中的任一方格,就会弹出“WellInspector”。
4.2.4在“WellInspector”窗口单击“AddDetector”就会弹出“detectormanager”窗口。
4.2.5点击“File\New...”,就会弹出“newdetector”菜单4.2.6在“newdetector”窗口进行样本信息输入:1)在“Name”可以输入:按自己的喜好输入易于区分的name。
2)在“ReporterDye”选择所用试剂探针所采用的报告基团如:FAM3)在“QuencherDye”选择所用试剂探针所采用的报告基团如:TAMRA4)在“Color”点击右边颜色小方格后可以按自己的喜好选择颜色。
5)设置好之后点击OK会回到“detectormanager”窗口4.2.7在“detectormanager”窗口依次点击“AddToPlateDocument”、“Done”。
4.2.8完成了Detector的设置;会重新回到“WellInspector”菜单,请做如下设置:1)在“PassiveReference”选折None;2)在“Use”下的小方框中打勾;3)在“SampleName”一般在参考标准品反应孔中习惯性的输入:试剂批次号如:HBV2006018。
ABIxL基因分析仪操作流程
A B I3500x L基因分析仪操作流程一、标准测序反应(一)质粒测序标准实验流程1.对质粒DNA的质量和浓度要求纯度:OD 260/OD 280= ~,用量:每反应150~300 ng。
2.测序PCR 反应标准反应体系:3.测序产物纯化:使用Edge Bio收集柱进行纯化。
(1)离心850g,3min柱子,弃掉收集管,换新的EP管。
(2)将待纯化样品加到柱子中间,注意不要加到离心柱侧壁上。
(3)离心850g,3min,弃掉柱子,即得纯化产物。
(4)取10 μL Hi-Di Formamide加入96孔板中,再加入10 μL待测样品,振荡混匀离心。
(二)PCR 产物测序标准实验流程1.对PCR 产物的要求纯度:OD 260/ OD280=~,用量:每反应10~100 ng。
强烈建议在测序前,先纯化PCR产物。
2.PCR产物的测序PCR 反应标准反应体系:3.测序产物纯化:方法同上。
二、上机测序(一)启动系统1.打开电脑,检查电脑右下角处3500监控状态是否正常启动。
2.打开3500 xL仪器电源,等待仪器自检,指示灯由黄色变为绿色即为自检完成。
3.启动电脑桌面Data collection software。
4.检查维护提醒:浏览维护提醒,若已完成点击。
5.检查耗材状态:点击“Refresh”,更新后检查仪表盘上各种耗材的状态(POP7、ABC、CBC和毛细管),若指示针在可用范围内则可继续,若在指示针在红色区域中,则需更换耗材后再继续。
6.仪器预热:点击仪表盘上的“Start Pre-heat”按钮预热炉子和泳道。
(二)放置待测样品1. 检查确保橡胶隔板均通透后,将其小心盖在加有待测样品的96孔板上,注意孔对孔盖好。
2. 将板子放入板架中,盖好固定盖,确保所有孔都一一对齐,即组装好测序板子。
3. 按仪器的TRAY按钮,使托盘出仓,之后将组装好的板子放入自动采样器中,注意有标记的一侧面对操作者。
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检查胶瓶中的胶以确认有足够的胶完成实验
每天或每次实验前
检查泵胶块和下胶块以确认其未松动
每天
清洁仪器表面、实验台表面
每天
检查毛细管旋钮,连接管螺帽和阀门以防止泄露
每天
每星期
维护工作
频率
使用Change Polymer向导换胶
每星期或需要时
检查旧毛细管的储存条件
每星期
使用注射器抽取20ml去离子水,清洗泵头的密封圈
每次实验前
更换溶液槽中的Buffer和水,确认槽的外围是干燥的
每48小时或每20个runs
更换water和waste溶液槽中的水,确认槽的外围是干燥的
每天或每20个runs
检查泵上下block、连接管、胶管和各通道中是否有气泡,使用Bubble Remove向导除去气泡
每天或每次实验前
检查毛细管的取样末端以确认其未损坏
每星期
使用去离子水浸泡胶垫,用自来水冲洗后再用去离子水洗一遍
每星期或需要时
每月
维护工作
频率
运行Water Wash向导,不管有无气泡,冲洗毛细管端口
每月或需要时
检查旧毛细管的储存条件
每月或需要时
每年
维护工作
频率
对机器内部进行除尘清洁,光路校正等整体保养
每年或需要时
需要时
维工作
频率
清洁漏液托盘
需要时
更换毛细管
需要时
去除毛细管末端已经干掉的胶,使用双蒸水湿润的无纤维布
需要时
使用无屑的棉球沾上无水乙醇轻轻擦拭毛细管检查窗口两端
每季度或空间、光谱校正时
ABI3730xl型测序仪日常维护标准操作规程(SOP)
每天
维护工作
频率
确认溶液槽中有足够的缓冲液和水
每次实验前
确认样品板被正确组装
重要!固定器和橡胶垫的孔必须对齐,否则会损坏毛细管
每次实验前
确认样品板牢靠平整地固定在托架上
重要!永远不要使用弯曲的样品板
每次实验前
检查阳极缓冲液杯中缓冲液的量,确认其溢液孔畅通且面朝仪器前方