大型复杂网络中的社区结构发现算法

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复杂网络重叠社区结构发现算法研究

复杂网络重叠社区结构发现算法研究

1 引 言
随着 复 杂 网 络研 究 的 逐渐 兴 起 , 复 杂 网络 正 在
既然研究复杂 网络重叠社区结构 的划分 问题 , 先 了解 问题 是什 么 。复杂 网络 是现 实系统 中无 规 则
也 不 随机 的真实 网络 , 它具 有社 区结 构 , 它展 现 了结
点关 系紧 密和疏 散 的特 点 , 而社 区 与社 区之 间 不 是
( , E ) .
定 义4 : 称 V的子集 S = {
, …, { 为一个
收 稿 日期 : 2 0 1 3— 0 3—0 4
作者 简介 : 梁沙沙( 1 9 8 7一) , 女, 汉族 , 内蒙古乌海人 , 2 0 1 0级硕 士研 究生。
1 6
社 区, 其中 ∈ 记社区. s 的结点个数s = I . s 1 .
每类 方 法 出发 角 度不 同 , 得 到 的 结果 和 运 算 效
率也 是有差 距 的 。
同的社 区活动 ; 在生物网络中, 一种蛋 白质可能与其 他 多 种蛋 白质 相互 作 用 共 同提供 生 命 有 机 功 能 J 。
自然 中大 多数 复杂 系统 都可 以通 过数 学 图论 的方式 转 换 成复 杂 网络 , 而研 究 在结 构 中起 关 键作 用 的重

要: 针对 大多数研 究复 杂网络社 区的算法致力于寻找独立不相重叠的社 区结构 , 而在 实际的网络 中 ,
社 区结构往 往是重叠的问题。本文就复杂 网络重 叠社 区研 究现状及相 关算法进行 简述 , 对重 叠社 区发现算法
的展 望及 现 实意 义 进 行 简 要 说 明。
关键词 : 复杂网络 ; 重 叠社 区结构 ; 社 区划分算法 中图分类号 : O 1 8 6 . 1 3 文献标识码 : A 文章编 号 : 1 0 0 4—1 8 6 9 ( 2 0 1 3 ) o 2— 0 0 1 6— 0 4

大规模网络中的社团发现算法研究

大规模网络中的社团发现算法研究

大规模网络中的社团发现算法研究社团发现是网络科学中一个重要的研究方向,其旨在揭示网络中存在的隐藏结构和组织规律。

大规模网络中的社团发现算法研究侧重于解决当网络规模庞大时,如何高效准确地识别和划分社团的问题。

本文将介绍几种主要的大规模网络社团发现算法,并评估其优劣与适用场景。

首先,我们将介绍一种基于模块度优化的算法——Louvain算法。

该算法在大规模网络中具有快速和高效的优势,并在广泛的领域得到应用。

Louvain算法的核心思想是通过优化网络的模块度来划分社团。

它基于迭代过程,通过不断地合并节点,不断提高网络的模块度,从而得到最优的社团划分结果。

然而,Louvain算法的缺点是容易陷入局部最优解,并且在处理大规模网络时,时间复杂度较高。

为了解决Louvain算法的局限性,Girvan-Newman算法被提出。

Girvan-Newman算法采用了基于边介数的思想,通过计算边的介数来度量边对网络社团划分的重要性,然后迭代地删除介数最大的边,直到网络被分成了多个社团。

该算法的优势是可以揭示社团之间的层次结构,并且对于大规模网络具有较好的可扩展性。

然而,Girvan-Newman算法在处理网络嵌套和重叠社团时存在一定的挑战。

除了传统的算法外,近年来,一些基于深度学习的算法也被提出来解决大规模网络中的社团发现问题。

其中,Graph Convolutional Network (GCN) 是一种非常有潜力的算法。

GCN通过学习节点特征之间的关系来刻画网络结构,然后通过多层的神经网络进行社团发现。

GCN具有较好的鲁棒性和准确性,并且可以处理大规模网络。

但是,GCN算法的计算复杂度较高,且对网络的输入表示形式要求较高,需要将网络表示为图结构,这对一些具有特殊结构的网络来说并不方便。

除了上述提到的算法,还有一些其他的方法被用于解决大规模网络中的社团发现问题。

例如,基于聚类的方法、基于拓扑排序的方法等等。

这些算法各有优劣,适用于不同的场景。

大规模复杂网络中的社团快速发现算法

大规模复杂网络中的社团快速发现算法

摘 要 : 的社 团发现算法大多是针对 中等规模 的复杂网络, 现有 而对大规模复杂 网络进行社团发现时时 间花销很大 。 针对这种 问题 , 本文提 出了一种用于大规模复杂网络的社 团快 速发现算法 , 出了模块度 给
及模 块度增量 的定 义。基于这 些定义 给出了一个两 阶段社 团发现算法 。 测试 网络 的实验结果验证 了所 提算法的有 效Байду номын сангаас 。
LI Bo a U t o
(o eeo o ue c ne& T cnlg, u a nvri f r n cec , h nd 10 0C ia C l g f mptr i c l C Se eh o y H nnU i syo t a dSine C a ge 4 5 0 ,hn) o e t As
f r d tc i g c mmu i flr e s ae c mp e ewo k i p o o e n t i p p r T e e d f i o s o d l e r e o ee t o n n t o g - c l o lx n t r s r p s d i h s a e . h s e n t n fmo u e d ge s y a i i a d ic e na d l e r e r ie , o n n r me tlmo u e d g e s a e gv n a c mmu i t c u e d t ci g ag r h w t w t g a e n t e e d f nt sr t r e e t lo t m i t o sa e b s d o h s e - y u n i h t
第 2 卷 第 8期 8
21 0 2年 8月
科 技 通 报

三种经典复杂网络社区结构划分算法研究

三种经典复杂网络社区结构划分算法研究

(ru )或“ c s r” g p ” 团(l t )构成的。 o ue 每个群内部的节点之 间的连接相对非常紧密 , 但是各个群之间的连接相对
来说却 比较稀疏 , 如图 1 所示 。 图中的网络包含三个社 团, 分别对应 图中三个 圆圈包 围的部分。 在这些社团内
部, 节点之间的联系非常紧密 , 而社 团之间的联系就稀
u eu e ee c o o sf lr fr n e f r c m
u i ee t n a o t m ee t n i c a a pi a o s n t d tc o l r h sl ci n a t l p l t n . y i gi o u ci
出现一个更大的 P 。 值 当交换完毕后 , 便找到上述交换 过程 中所记录的最大的 P值。这时对应的社团结构就 认为是该 网络实际的社 团结构。 12 基 于 L pa e图特征 值 的谱二 分法 . a lc 该算法利用网络结构的 Lp c 矩 阵中不为 0的 al e a
G N算法是一种分裂方法[ 8 1 。其基本思想是不 断的
现实生活 中、 交通运输 网、 计算机 网等。网络模型 是描述这些 复杂系统的最 有效模型 。通过对现实系 统 网络模型 的研究 ,人们 发现许多现实系统 的网络 模型是介 于完全规则 和完 全随机之间 的。由于这种
网络是 真实 复杂系统的拓扑抽象 ,因此它被称为复 杂 网络 。
每一 列 的和 均为 0 因 而 , , 向量 I( , ,, ,) L相 = 11l… 1 是
2 三种算 法的对 比分析
从上述三种算 法 的过程来 看 ,al e图特 征值 Lp c a 谱二分法 , e ga— i 算法 和 G K mi n L h n N算法计算 简洁 , 都易于程序实现。 e ga— i 算法的时间复杂度相 K mi n L h n 对于其他两种算法较小些 , 但该算法对 网络中社 区划 分 的准确度不 高 ,适用于小规模 网络社 区划 分 。而

复杂网络局部社区发现算法

复杂网络局部社区发现算法

A Loc a l Co mmu ni t y De t e c t i o n Al g o r i t hm O n Co mp l e x Ne t wo r k
Li Xi ng , Zh on g Zhi n on g ,J i ng Ni ng , Wu Yo ng
wa s p r o p o s e d i n t h i s p a p e r .Th e a l g o r i t h m i s b a s e d o n t he i d e a o f i mp r o v e d l f o w mo d e l ,s t a r t f r o m t h e l o c a l t o p o l o g y s t r u c t u r e o f t h e n e t wo r k . u s e s e q u e n c e r e s u l t s o f n o d e a n d c a r r y o u t n o d e c u t b y n e w l o c a l c o mmu n i t y c u t t i ng p r i n c i p l e
( 1 . S c h o o l o f El e c t r o n i c S c i e n c e&E n g i n e e r i n g , N a t i o n a l U n i v e r s i t y o fDe f e n s e T e c h n o l o g y , C h a n g s h a 4 1 0 0 7 3 , C h i n a ; 2 . Ⅳ 0 . 6 3 8 8 0 U n i t 户 , L u o y a n g 4 1 0 0 7 3 , C h i n a )

大规模网络中社区发现算法优化与改进

大规模网络中社区发现算法优化与改进

大规模网络中社区发现算法优化与改进在当今的大数据时代,网络社交已逐渐成为人们生活中不可或缺的一部分。

如何从大规模的网络中发现有意义的社区,已成为一个备受关注的话题。

社区发现算法的优化与改进,为有效识别社交网络中的社区提供了重要的技术保障。

一、概述社区发现算法主要是解决如何在复杂网络中找到聚集在一起的节点集合,即社区。

在研究社区发现算法时,我们通常关注以下三个问题:一是如何定义社区;二是如何衡量社区的质量;三是如何高效地查找社区。

二、社区定义由于社区的定义是比较复杂的,因此社区发现算法面临着难以统一的问题。

社区的定义有很多种,但是常用的定义主要有以下几种:1.密集子图密集子图被认为是一种比较好的社区定义方法。

它通常指的是在网络中一个节点集合,这些节点间的连边密度比较高,而与集合外的节点的连边密度比较低。

2.以节点为中心的社区定义这种方式是以节点的相似性为基础,将节点分为不同的社区。

如果节点之间的相似度较高,那么这些节点将被视为同一个社区。

3.图划分这种方法是将整个网络分割为不同的部分,每个部分都是一个社区。

这种方法通常使用的是传统的图论算法。

由于社区定义的多样性,不同的社区发现算法往往使用不同的定义方法。

社区发现算法需要根据具体的应用场景,选择不同的社区定义方法。

三、社区质量性能评估社区质量性能评估,是评估社区发现算法优劣的重要指标。

评价指标通常包括“社区内的紧密性“(modularity)、“社区之间的分离度”(conductance)和“社区的稳定性”等。

1.紧密性社区内的紧密性是指社区内部节点之间的连边密集程度。

社区内的紧密性越高,则节点与社区之间的联系越紧密,社区的质量越高。

衡量社区内紧密性的指标主要是“模块度”。

2.分离度社区之间的分离度指的是社区内部节点与社区之间的联系程度。

社区之间的分离度越大,则社交网络的分配格局就越合理,社区发现算法的性能表现就越好。

衡量社区分离度的指标通常是“社区分离度”。

复杂网络中的社区发现算法及其应用

复杂网络中的社区发现算法及其应用

复杂网络中的社区发现算法及其应用复杂网络是由大量节点以及节点之间的连接关系构成的网络,在现实中广泛存在于许多领域,如社交网络、生物网络和互联网等。

社区发现是复杂网络研究的重要内容,目的是将网络中相互紧密连接的节点划分为具有相似特征或功能的社区。

社区发现算法是研究者们为了解复杂网络中的结构、功能和演化过程而提出的重要方法。

本文将介绍几种常见的社区发现算法及其应用。

一、模块度优化算法模块度是衡量网络社区结构好坏的重要指标,模块度优化算法就是通过最大化网络的模块度来寻找合适的社区划分。

常见的模块度优化算法有GN算法、Louvain算法和贪心算法等。

这些算法通过迭代地划分社区和优化社区内的连接关系来寻求最优解。

模块度优化算法在社交网络、组织结构分析、蛋白质相互作用网络等领域有广泛应用。

例如,在社交网络中,通过社区发现算法可以识别出不同的社区群体,有助于理解社交网络中的用户行为和信息传播规律,在推荐系统中起到重要作用。

二、基于节点相似性的算法基于节点相似性的社区发现算法认为在网络中相似的节点更可能属于同一个社区。

这类算法包括谱聚类、K均值算法和PSCAN算法等。

这些算法通过计算节点间的相似度来划分社区。

这类算法在生物网络、交通网络、图像分割等领域应用广泛。

例如,在生物网络中,通过基因的相似性来划分蛋白质相互作用网络的社区,可以帮助研究者理解蛋白质之间的功能和调控关系,从而推测未知蛋白质的功能。

三、基于概率生成模型的算法基于概率生成模型的社区发现算法通过建立模型来描述网络的生成过程,并利用模型参数推断网络的社区结构。

常见的算法有LDA、SBM等。

这些算法将网络看作是由不同社区生成的,根据模型参数的估计结果来划分社区。

这类算法在社交网络、金融网络等领域有广泛应用。

例如,在金融网络中,通过基于概率生成模型的社区发现算法可以划分出潜在的金融市场或子市场,有助于金融市场监管和风险预警。

总结起来,社区发现算法在复杂网络研究中扮演重要角色,有助于理解网络的结构和功能特征,为许多现实问题的解决提供了有力支持。

社交网络中的用户社区发现算法详述

社交网络中的用户社区发现算法详述

社交网络中的用户社区发现算法详述社交网络已经成为人们生活中不可或缺的一部分,它们连接了全球各地的用户,使得信息交流、知识共享和人际关系建立变得更加便捷。

然而,随着社交网络的快速发展,用户数量的增加和社交网络结构的复杂化,如何发现用户之间的社区结构变得越来越重要。

社交网络中的用户社区发现算法就是解决这一问题的方法之一。

它的目标是将网络中的用户划分为若干个社区,使得同一个社区中的用户有着相似的特征和互相之间存在密切的关系,而不同社区之间的用户关系则相对较弱。

下面将详细介绍几种常见的用户社区发现算法。

1. Girvan-Newman算法Girvan-Newman算法是一种基于图的社区发现算法,它通过计算网络中边的介数(betweenness)来划分社区。

介数表示了对于网络中的任意两个节点之间最短路径上经过的边的数量。

该算法的思想是不断删除介数最高的边,直到网络中的社区被划分出来。

2. Louvain算法Louvain算法是一种基于模块度(modularity)的社区发现算法。

模块度是一种衡量网络内部连接紧密程度的指标,它对比了网络实际的边连接情况和预期的随机连接情况。

Louvain算法通过迭代地将节点合并到具有最大模块度增益的社区中,直到无法再增加模块度为止。

3. Label Propagation算法Label Propagation算法是一种迭代的社区发现算法,它通过在网络中传播节点的标签来实现社区划分。

每个节点最初被赋予一个唯一的标签,然后在每一轮迭代中,节点会根据周围节点的标签来更新自己的标签。

当标签收敛时,算法停止并将具有相同标签的节点划分为同一个社区。

4. Infomap算法Infomap算法是一种基于信息论的社区发现算法,它通过最小化网络的描述长度来划分社区。

该算法将网络看作是信息传递的通道,社区划分的目标是找到一种最优的信息传递方式,使得网络的整体描述长度最小。

Infomap算法通过迭代地优化信息流动的方式来实现社区划分。

复杂网络中的社区发现算法及其应用

复杂网络中的社区发现算法及其应用

复杂网络中的社区发现算法及其应用一、引言复杂网络是指由多个节点和连接它们的边或者链组成的网络结构,它们通常是由自然界或者人工构建的系统所构成。

例如社交网络,物流网络,交通网络等,复杂网络在现实中应用广泛,而社区发现是其重要的研究领域之一。

社区发现是指在网络中发现数量较少但内部密切联系的子集,它们在某些方面显示出相对的内部一致性和跨度分离,由于社区结构的存在,网络在许多方面具有不同的行为特征和功能特征。

在社交网络中,社区是指具有相同兴趣、活动或者联系的人的子集。

在物流网络中,社区是指共享一些特定的物流资源或者共享某个交通运输方式的城市或地区等。

社区发现在许多领域都具有重要的应用,比如犯罪调查、恐怖主义分析、废柴疫情分析等。

如何高效地在复杂网络中寻找出社区结构是社区发现算法的核心问题。

二、社区发现算法社区发现算法是指在复杂网络中,通过一定的算法设计来寻找网络中存在的社区结构。

社区发现算法分为基于聚类和基于模块化的两大类。

前者是指将节点分为若干个群体,使得同一群体的节点之间关系密切。

聚类算法中,最常见的算法是k-means和层次聚类。

后者是基于网络拓扑结构的特征来刻画社区结构。

这类算法中最常见的是基于最大模块化(modularity-based)的算法。

以下将对这两类算法进行详细的介绍。

(一)、聚类算法1.k-means算法k-means算法是一种聚类分析的方法,其目标是将相似的对象划分为互不相交的k个簇,并使簇内之间的差异性最小化,而簇间之间的差异性最大化。

该算法可用于分辨噪声、找到一个点集的最优分组、刻画数据集中不同群体的特征等。

在社区发现中,k-means算法可以用来寻找相同兴趣爱好的人群等。

2.层次聚类算法层次聚类是指将所有观测数据首先看做是一组单独的簇,然后逐渐有收缩的方式合并这些簇到一个大的簇,直到得到一个包含所有对象的唯一簇为止。

因此,其层次性很强,对于不同的数据集,其结果也不同。

层次聚类常用于生物分子分类、文本分类等领域,同样也可以用于社区发现算法。

复杂网络中的社区发现算法研究

复杂网络中的社区发现算法研究

复杂网络中的社区发现算法研究一、引言社交网络成为了人们日常交流中不可或缺的一部分,复杂网络中的推荐系统、广告分发、用户画像等问题也得到了广泛的研究。

而复杂网络中的社区结构发现的研究则是在社交网络中最为基础的问题之一。

随着复杂网络的不断发展和壮大,社区发现问题变得越来越复杂和具有挑战性。

社区发现的研究不仅能够揭示社交网络的本质结构,还能够为推荐、广告等应用提供重要的基础数据支持。

二、社区发现算法综述社区发现算法是指在一个无向或有向的、加权或不加权的复杂网络中,找到一些具有内部相似度高、外部相似度低的子集,这些子集被称为社区。

常见的社区发现算法包括基于图划分的方法、基于谱分析的方法、基于模块度的方法以及基于聚类的方法等。

在社区发现研究中,基于模块度的方法是最常用的一种方法。

基于图划分的方法将图中节点划分为若干个子区域,每个子区域即为一个社区。

基于谱分析的方法是基于图的拉普拉斯算子,通过计算图的特征向量来发现社区。

基于模块度的方法是通过定义模块度来测算一个社区的好坏程度,然后将模块度最大的社区作为整个网络的社区结构。

基于聚类的方法是将节点分组成互相影响或接近的部分,以揭示网络数据的内部结构和性质。

三、社区发现算法优化社区发现算法有许多经典的算法,如Louvain算法、GN算法、Leida算法等。

然而随着网络规模的不断扩大,这些经典算法面临着计算复杂度过高、精度不高等问题。

针对这些问题,研究人员提出了许多社区发现算法的优化方案。

1. 分层社区发现优化分层社区发现算法是一种通过把网络划分成多个层级来处理网络的算法。

这种算法不仅能够处理大规模网络的社区发现问题,还能避免算法计算过程中的过度优化问题。

2. 基于采样的算法优化采样是一种常用的算法优化方法。

基于采样的优化方法可以将网络简化为一个小规模的子图,进而提高算法的计算效率。

例如,有些算法可以将网络中的度数较高的节点集合选择为采样的节点,这样可以保证算法的计算效率和准确性。

社区发现Community Detection 算法

社区发现Community Detection 算法

社区发现(Community Detection)算法社区发现(Community Detection)算法用来发现网络中的社区结构,也可以视为一种广义的聚类算法。

以下是我的一个PPT 报告,分享给大家。

从上述定义可以看出:社区是一个比较含糊的概念,只给出了一个定性的刻画。

另外需要注意的是,社区是一个子图,包含顶点和边。

下面我们以新浪微博用户对应的网络图为例,来介绍相应的社区发现算法。

这里在相互关注的用户之间建立连接关系,主要是为了简化模型,此时对应的图为无向图。

当然,我们也可以采用单向关注来建边,此时将对应有向图。

这个定义看起来很拗口,但通过层层推导,可以得到如下(4.2)的数学表达式。

定义中的随机网络也称为Null Model,其构造方法为:the null model used has so far been a random graph with the same number of nodes, the same number of edges and the same degree distribution as in the original graph, but with links among nodes randomly placed.注意,(4.2) 是针对无向图的,因此这里的m 表示无向边的条数,即若节点i 和节点j 有边相连,则节点(i, j) 对m 只贡献一条边。

标签传播算法(LPA)的做法比较简单:第一步: 为所有节点指定一个唯一的标签;第二步: 逐轮刷新所有节点的标签,直到达到收敛要求为止。

对于每一轮刷新,节点标签刷新的规则如下:对于某一个节点,考察其所有邻居节点的标签,并进行统计,将出现个数最多的那个标签赋给当前节点。

当个数最多的标签不唯一时,随机选一个。

注:算法中的记号N_n^k 表示节点n 的邻居中标签为k 的所有节点构成的集合。

SLPA 中引入了Listener和Speaker两个比较形象的概念,你可以这么来理解:在刷新节点标签的过程中,任意选取一个节点作为listener,则其所有邻居节点就是它的speaker 了,speaker 通常不止一个,一大群speaker 在七嘴八舌时,listener 到底该听谁的呢?这时我们就需要制定一个规则。

复杂网络的社区检测算法研究

复杂网络的社区检测算法研究

复杂网络的社区检测算法研究随着互联网和社交媒体的普及,人与人之间的联系日益紧密,形成了庞大而复杂的网络结构,如何有效地对这些网络进行社区检测成为了一个重要的研究领域。

社区检测是指将网络中的节点划分成若干个互不重叠的社区群体,使得社区内部联系紧密,社区间联系相对松散。

在社会学、生物学、信息学等领域中都有着广泛的应用。

复杂网络的社区检测算法分为无监督和有监督两类。

无监督的算法是指根据节点之间的结构和相互之间的关系来进行社区检测,而有监督的算法是指利用已经标注好的社区节点信息来进行有针对性的社区发现。

无监督算法主要有基于聚类的方法、基于模块划分和最大化似然估计等。

有监督算法则主要有非监督学习和半监督学习两种。

综合来看,目前较为常用的社区检测算法主要有以下几种:1. 物理模拟算法物理模拟算法主要依靠物理力学和动力学理论,通过模拟网络节点之间的相互作用以及节点的运动,来推演社区结构。

该算法的优点在于适用性非常广泛,不需要预先定义社区属性和数量,能够自适应地根据网络结构进行社区划分。

缺点则在于需要大量的计算资源和时间,同时对于大规模的网络划分效果不一定理想。

2. 聚类算法聚类算法是指将相似度高的节点聚集成同一个社区,计算相似度的方式可以采用距离、相似矩阵等方法。

其中最常用的聚类算法是k均值算法、DBSCAN算法和层次聚类算法。

聚类算法的优点在于实现简单,速度快,而且能够处理大规模网络,缺点则在于对于不同的距离度量方式和初始的聚类中心选择会产生不同的结果。

3. 模块度最优化算法模块度最优化算法是指最大化网络划分后社区之间的模块度值,即增加社区内部联系,减少社区之间的联系。

这种方法适用于任意大小的网络,具有较高的准确性。

其中最著名的算法是Louvain算法和GN算法,它们分别通过迭代优化来实现社区最大化。

此外,基于模块度的算法还有LPA算法、SA算法和ILOF算法等,它们通过不同的方式求解社区划分问题,能够优化不同的划分目标。

社区检测算法在复杂网络中的应用研究

社区检测算法在复杂网络中的应用研究

社区检测算法在复杂网络中的应用研究在当今数字时代,人们日常生活中的社交网络和互联网已经成为人们分享信息、获取知识以及互相交流的重要平台。

复杂网络是指由大量节点和连接构成的网络结构,其中节点代表个体,连接代表节点间的关系。

社区是指网络中节点之间紧密连接、内部联系密切而与外部联系较弱的子网络。

社区检测算法是指一类用于自动发现复杂网络中社区结构的计算方法。

本文将探讨社区检测算法在复杂网络中的应用研究,为相关研究和实际应用提供理论指导。

首先,社区检测算法在社交网络中的应用已经得到广泛的关注。

社交网络是一种由用户构成的复杂网络,用户之间通过关注、好友、粉丝等方式进行连接。

社区检测算法可以帮助我们发现社交网络中的不同用户群体,从而更好地理解和分析人们在社交网络中的行为模式。

比如,通过社区检测算法可以发现在某个社交平台上活跃的用户群体,并对其进行精准的定向推送广告信息,从而提高广告的点击率和转化率。

其次,社区检测算法也在生物信息学中有着重要的应用。

生物信息学是研究生物大分子序列、结构、功能以及相关生命活动的学科。

复杂网络在生物信息学中的应用主要集中在蛋白质相互作用网络的分析上。

蛋白质相互作用网络是指由蛋白质相互作用关系构建的复杂网络,可以帮助我们揭示蛋白质之间的相互作用关系,从而对蛋白质的功能和机制进行研究。

社区检测算法可以用于发现蛋白质相互作用网络中的功能模块或者蛋白质复合物,从而帮助我们理解生物系统的功能和调控机制。

此外,社区检测算法还可以应用于推荐系统中。

推荐系统是一种根据用户的历史行为和偏好,向用户提供个性化推荐的技术。

复杂网络在推荐系统中的应用主要集中在用户行为模式的分析和相似用户的发现上。

社区检测算法可以帮助我们发现用户行为模式之间的关联性,从而为推荐系统提供更加准确的推荐结果。

例如,通过社区检测算法可以确定用户所属的社区,然后将同一社区内的用户推荐相似的物品或者内容,提升推荐系统的准确性和个性化程度。

复杂网络中的社区发现算法比较

复杂网络中的社区发现算法比较

复杂网络中的社区发现算法比较一、前言复杂网络是一种具有复杂拓扑结构的网络,节点和边的数量庞大,存在着多种复杂关系。

社区发现算法则是针对复杂网络中节点间具有相似特征的子集,对其进行划分的算法。

而在复杂网络中进行社区发现的任务则是寻找到节点之间相互依存的关系,并将它们划分成相对独立的社区,从而帮助我们更加深入地理解网络上节点之间的关系。

本文将对当前常用的几种复杂网络社区发现算法进行比较。

二、常见复杂网络社区发现算法1.谱聚类算法谱聚类是一种运用矩阵理论和谱分析思想进行聚类的算法。

在社区发现领域中,谱聚类算法主要可分为两个步骤:(1)构建邻接矩阵在谱聚类中,我们可以选择不同的邻接矩阵作为图的表示。

最常用的是无向相似矩阵和无向邻接矩阵。

无向相似矩阵表示的是节点之间的相似性,而无向邻接矩阵描述的是两个节点是否具有连线。

此外,还有一种常用的邻接矩阵是度矩阵,常用于无权重网络。

(2)特征向量分解通过对邻接矩阵进行特征向量分解,可以得到对应的特征值和特征向量。

这里,我们只需要选择最大的 k 个特征值所对应的特征向量(k 为聚类的数目),构建新的矩阵,并对该矩阵进行聚类即可。

谱聚类算法具有聚类效果好、鲁棒性强、可解释性好等优点,在实际应用中受到了广泛的研究。

2.模块度最优化算法模块度最优化算法是一种基于性能指标进行社区发现的算法。

然而,由于在多重社区中互相重叠的交叉节点的存在,这使得社区中存在着多条连边和节点连接的情况变得更为复杂。

模块度最优化算法通过计算各个社区中的模块度值,以确定最合适的社区划分。

模块度的计算基于两点之间的边权重与该点所在社区内节点度数之和之间的差值。

3.基于标签传播的社区发现算法基于标签传播的社区发现算法用于检测网络中的聚类结构,其应用范围包括社交网络、推荐系统等领域。

在这种算法中,每个节点都会初始化一个标签,然后将其“传播”到它的邻居节点。

同时,它还会与其它节点交换标签,并根据标签的相似性与其他的邻居节点进行交换。

大型复杂网络中的社区结构发现算法

大型复杂网络中的社区结构发现算法
HU in , J a DONG eh a, Yu - u YANG n ・l Big rl
( . c l fIf r t nEn ie rn , in x ie st fS in ea dT c oo y Ga z o 41 0 1 Fa ut o no mai gn eig Ja g i y o Unv ri o ce c n e hn lg , n h u3 0 0; y
区发现算法虽然性 能优越 ,但 所需要 的计算量却很大 ;更为
关键的是 ,很多算法不是针对 异构数据集 。这说明复杂 网络
中社 区发现 的研 究还远没有成为体系 , 还有很多工作待完善。
“ 区”具有重要 的实 际应 用价值 ,如社会 网络中的社 区 社 可能代表 的是根据兴趣或背景而形成的真实 的社会 团体 ,引
通过 算法对 比分析 ,证 明该算法在 时间复杂度上可以提高一个数量级 。 关键词 :边 聚集 系数;社 区结构 ;社 区发现
Co m u iy S r c u eDic v r g rt m m n t t u t r s o e yAl o i h i r ea d Co p e t r n La g n m l x Ne wo k

个是每个节点的度以及整个 网络 的平均的度 ;还一个就是
中圈 分类号: P0. T31 6
大型复杂 网络 中的社 区结构 发现 算法
胡 健 ,董跃华 ,杨炳儒
( 江西理工大学信息工程学院 ,赣州 3 1 0 ;2 北京科技大学信息工程学院 ,北京 l0 8 ) 1 400 . 003 摘 要 : 大型复杂 网络 中 自 在 动搜 寻或发现社 区具有重要的实 际应用价值 。 该文把超 图模型 以及基于此 的聚类算法应用到社区结构发现 的 领域 。对于简单 图的社 区结构发现 ,引入边聚集系数的概念 , 出基于边 聚集 系数 的社 区发现 算法 。将 安然 邮件数据集作为测试数据集, 提

复杂网络上的社区发现算法研究

复杂网络上的社区发现算法研究

复杂网络上的社区发现算法研究社区发现算法是一种旨在寻找网络中功能上相关或密切相关的节点组成的群体的算法。

在复杂网络中,社区是指由相似节点或连接组成的密度高、联系紧密的子集。

社区结构广泛存在于不同的复杂网络中,如社交网络、蛋白质相互作用网络、交通路网等。

社区发现算法旨在帮助我们理解网络的结构,发现网络中的隐藏结构和特征。

本文将从复杂网络和社区发现的基础知识开始,概述常见的社区发现算法,并分析它们的优缺点。

1. 复杂网络基础知识复杂网络是指具有复杂性质、结构和动力学的非线性系统。

它由多个互相连接的节点和链接组成,网络中节点和链接的数量通常呈幂律分布。

复杂网络的结构通常表现为集群化和小世界特性。

集群化是指网络中存在着由相似节点组成的局部群体,这些群体结构严密,内部交流频繁。

小世界特性是指大多数节点之间只需要通过少数中介节点就可以建立联系。

复杂网络中的社区是一种具有密度高、联系紧密的节点子集,社区内有着显著的相似性与集中度差异。

在社区内部节点之间联系的强度与社区外部节点之间联系的弱度则呈现出明显的分明性。

2. 常见社区发现算法(1)基于模块度最大化的社区发现算法(Modularity-based)基于模块度最大化的社区发现算法是一种基于用户定义的子图而被划分到社区中的算法。

算法的目标是最大化模块度,即将节点分配到社区时所导致的链接数的增加与预期值的差距最小。

在这种算法中,社区发现的成效可通过模块度计算来衡量。

(2)层次聚类算法(Hierarchical Clustering)层次聚类算法是一种通过递归层次划分,并同时保留了局部和整体结构性质的算法。

聚类过程不断地从原始集群中剥离最小的聚类子集,形成一棵树状表示,其中根节点表示整个网络,叶节点则表示最小的聚类。

树状结构本身可用于挖掘不同尺度上的社区结构。

(3)基于Louvain算法的社区发现算法(Louvain-based)Louvain算法是一种快速发现社区结构的常见算法。

复杂网络中的社团发现算法综述

复杂网络中的社团发现算法综述

复杂网络中的社团发现算法综述随着社会网络的日益发达,社交网络成为了现代社会的重要组成部分。

然而,这些网络往往都是由大量的节点和边构成,而且具有非常复杂的拓扑结构。

对于这样的复杂网络,如何有效地发现其中的社团结构一直是研究的热点之一。

社团结构是指在网络中存在一些密度较高、连通性较强的子图,其中节点之间的联系比较紧密,而与其他社团的节点则联系较松散。

社团结构的发现可以帮助我们了解网络中的相互作用关系,为社交网络的数据挖掘和信息推荐提供基础理论和方法。

社团发现算法按照算法思想的不同,可以分为基于模型的方法、基于聚类的方法和基于图分割的方法。

其中,基于模型的方法是使用概率模型描述网络,然后利用统计学方法推导出社团结构;基于聚类的方法是将网络中的节点聚类成若干个社团,每个社团内节点之间的相似性要求较高;基于图分割的方法则是将网络切分为若干个部分,使得每个部分内的节点之间的连通性要求较强。

下面将分别介绍一些经典的社团发现算法:1. 基于模型的方法(1) 随机游走社团发现算法(Random Walk Community Detection Algorithm,RWCD)RWCD是基于随机游走模型的社团发现算法,它将节点的相似性定义为它们之间的转移概率,然后使用PageRank算法迭代计算各节点的权值,在一定阈值下将权值较高的节点聚合成社团。

RWCD算法可以充分利用网络中的拓扑结构,对大型网络具有较好的扩展性。

(2) 右奇社团发现算法(Modularity Optimization Algorithm,MOA)MOA算法是一种基于模块度优化的社团发现算法,它将社团内节点的连接强度与所有节点的连接强度相比较,然后计算模块度值,寻找最大模块度值时的节点聚类。

MOA算法的思想简单易懂,但需要耗费大量的计算资源。

2. 基于聚类的方法(1) K-means社团发现算法K-means算法是一种常用的聚类算法,它将网络中的节点分成K个组,每个组是一个社团。

复杂网络中社区检测算法的研究与优化

复杂网络中社区检测算法的研究与优化

复杂网络中社区检测算法的研究与优化近年来,随着互联网的飞速发展和数据的爆炸式增长,复杂网络的研究逐渐成为一项热门的研究领域。

复杂网络是由大量节点和连接构成的网络系统,包括社交网络、生物网络、物流网络等。

其中,社区结构是复杂网络中的一个重要属性,它能够揭示网络中具有紧密连接和相关性的节点群体。

因此,社区检测算法的研究与优化对于揭示复杂网络的内部结构和功能具有重要意义。

社区检测算法的研究旨在寻找网络中的紧密连接的节点群体。

这些节点共享相似的特征、兴趣或功能。

社区检测可以帮助我们理解网络中的相互作用和动态演化。

然而,由于复杂网络的规模庞大和复杂性,社区检测面临许多挑战。

首先,复杂网络的规模庞大,节点数量可能达到上亿。

传统的社区检测算法在大规模网络中的计算复杂度很高,无法满足实时性和效率的需求。

因此,研究者们提出了一系列基于近似计算和分布式处理的社区检测算法。

其次,复杂网络的结构和动态性使得社区检测任务难以完成。

网络中的边缘节点、噪声和重叠社区都会对算法的准确性和鲁棒性造成挑战。

因此,研究者们提出了许多方法来提高算法的准确性和鲁棒性,例如基于密度、模块度、谱聚类等的优化算法。

另外,复杂网络中存在异质性和动态性。

节点和边缘的属性和连接可能随时间和环境的改变而变化。

传统的社区检测算法无法应对这种异质性和动态性。

因此,研究者们提出了一系列基于时间序列和动态模型的社区检测算法。

为了解决上述问题,研究者们不断对社区检测算法进行改进和优化。

其中,基于深度学习的方法在社区检测领域取得了一些重要的突破。

深度学习算法可以通过学习网络中节点的表征向量,并基于这些向量进行社区划分。

这种方法能够在保证准确性的同时,减少计算复杂度,提高算法的效率和可扩展性。

此外,在社区检测算法的研究中,网络的结构信息和节点的属性信息被广泛应用。

结构信息包括节点之间的连接关系,例如邻接矩阵、相似矩阵等。

属性信息包括节点的标签、特征向量等。

将结构信息和属性信息进行融合,可以提高社区检测算法的准确性和鲁棒性。

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—92—大型复杂网络中的社区结构发现算法胡 健1,董跃华1,杨炳儒2(1. 江西理工大学信息工程学院,赣州 341000;2. 北京科技大学信息工程学院,北京 100083)摘 要:在大型复杂网络中自动搜寻或发现社区具有重要的实际应用价值。

该文把超图模型以及基于此的聚类算法应用到社区结构发现的领域。

对于简单图的社区结构发现,引入边聚集系数的概念,提出基于边聚集系数的社区发现算法。

将安然邮件数据集作为测试数据集,通过算法对比分析,证明该算法在时间复杂度上可以提高一个数量级。

关键词:边聚集系数;社区结构;社区发现Community Structure Discovery Algorithmin Large and Complex NetworkHU Jian 1, DONG Yue-hua 1, YANG Bing-ru 2(1. Faculty of Information Engineering, Jiangxi University of Science and Technology, Ganzhou 341000; 2. School of Information Engineering, University of Science and Technology Beijing, Beijing 100083)【Abstract 】The automatic search and community discovery in large and complex network has important practical applications. This paper applies the hypergraph based model and cluster algorithm in community structure discovery, introduces the concept of Edge Clustering Coefficient(ECC) to community structure discovery of simple graph and proposes an algorithm of community discovery based on ECC. Enron e-mail data sets are test data sets, through comparative analysis of algorithm, to prove that this algorithm can significantly improve the time complexity. 【Key words 】Edge Clustering Coefficient(EBB); community structure; community discovery计 算 机 工 程Computer Engineering 第34卷 第19期Vol.34 No.19 2008年10月October 2008·网络与通信·文章编号:1000—3428(2008)19—0092—02文献标识码:A中图分类号:TP301.61 概述复杂网络中社区发现(community finding)的研究起源于社会学的研究工作。

能够在大型复杂网络中自动搜寻或发现“社区”具有重要的实际应用价值[1],如社会网络中的社区可能代表的是根据兴趣或背景而形成的真实的社会团体,引文网络中的社区或许代表的是针对同一主题的相关论文,万维网中的社区或许就是讨论相关主题的若干网站,而生物化学网络或者电子电路网络中的社区可能就是某一类功能单元。

发现这些网络中的社区有助于更有效地理解和开发这些网络。

与社区发现相关的成熟理论包括图论以及模式识别。

Wu 和Huberman 的研究成果[2]以及Newman 和Girvan 的研究成果[3]使得复杂网络中的社区发现成为近几年复杂网络领域的一个研究热点并形成了复杂网络中的一个重要研究方向。

Newman 和Girvan 把社区发现问题定义为将网络节点划分成若干组,使得组内的节点之间连接比较稠密而不同组节点之间的连接则比较稀少。

Newman 和Girvan 在其研究中提出了基于边介数(edge betweenness)概念的分割方法,尽管该方法计算量很大,但由于其性能优越而成为社区发现研究的重要参考模型。

对于一般简单图的社区发现,也可以称之为基于图的聚类,把具有相同或者相似属性的有共性的节点聚合到一起,形成一个个的聚类[2]。

这方面的方法有很多,最常用的有G-N 算法、谱二分法和层次聚类法。

尽管人们对复杂网络的社区发现问题已进行了大量的研究,但是仍然存在一些目前无法解决的基本问题[4],如社区的概念虽然大量使用,但却缺少严格的数学定义;大多数社区发现算法虽然性能优越,但所需要的计算量却很大;更为关键的是,很多算法不是针对异构数据集。

这说明复杂网络中社区发现的研究还远没有成为体系,还有很多工作待完善。

2 边的聚集系数定义为了刻画描述一个网络,通常有这样几个角度,一个是这个网络中点与点之间的距离以及整个网络的平均距离;另一个是每个节点的度以及整个网络的平均的度;还一个就是节点之间聚集的情况,点的聚集系数这个概念是用来体现对于某个节点A 来讲,如果B 和C 都是A 的邻接点(朋友关系),那么B 和C 两者之间也有邻接(朋友)的可能性。

定义1 某节点n 的聚集系数(node clustering coefficient) ()C n 如下定义:(1)假设某节点n 的度是k ,则该节点的这些邻居之间可能形成边的最大数是:()(1)/2T n k k =−(2)()E n 表示图中这些邻居之间实际的边的个数,则 ()()/()C n E n T n =定义2 一个网络的聚集系数为这个网络中节点的聚集系数的平均值。

如图1所示,节点1的度为5,所以与它相连接的5个顶点之间最多存在54/210×=条边;而实际上另外5个顶点相互之间存在6条边,所以节点1的聚集系数是6/100.6=。

基金项目:国家自然科学基金资助项目(60675030)作者简介:胡 健(1967-),男,副教授、博士,主研方向:数据挖掘,智能信息检索;董跃华,副教授;杨炳儒,教授、博士生导师 收稿日期:2008-08-01 E-mail :euguenehu@—93—123546图1 求凝聚系数示例图G-N 算法借助点介数的概念,引入了边介数的度量方法,类似的也借助顶点的聚集系数,来引入某一条边的聚集系数(Edge Clustering Coefficient, ECC)概念。

假设有一条边ij E ,其顶点为i 和j ,考虑网络中是否有以及有多少个另外的节点k 与i ,j 都相邻,即存在另外5条边jk E ,ik E 与ij E 形成三角环(即边数为3的闭合路径),若一个三角环包含一条连接不同社区的边,则该三角环中的另2条边中的某一条仍然连接这2个社区的可能性将很大。

但是由于连接不同社区的边非常稀少,因此包含一条给定的连接不同社区的边的三角环可能很多。

因此,将一条边的边聚集系数定义为包含该边的三角环所占比例:1min(1,1)ij ij i j z C k k +=−−其中,i k ,j k 分别表示节点i 和j 的度;ij z 表示网络中实际包含该边的三角环的个数。

上式中的分母表示包含该边的最大可能的三角环的个数。

在图1中,边3,6E 的节点3n 和6n 的度数分别是5和4,则最多形成min(51,41)3−−=个三角环,而包含3,6E 的三角环有3个1,3,6∆,3,4,6∆,3,5,6∆,所以,3,61C =。

3 ECC 算法描述首先给出关于简单图中社区的定义,一个社区V 实际上是整个网络G 中部分子图,即V G ⊂。

对于V 中的一个节点i ,用i k 表示该节点的度数,而在计算该节点的度数时,其邻接点分为来自V 内部(即,()in j V i i j k V A ∈=∑)和V 外部(即,()out j V i i j k V A ∉=∑)2个部分,所以有()()()in out i i i k V k V k V =+。

下面给出一个社区的紧密程度在2个级别上的定义。

定义3 如果在一个社区V 中,每个节点的()in i k V 都大于()out i k V ,即()()in out i i k V k V i V >∀∈ 则称该社区是强连接社区。

定义4 如果在一个社区V 中,所有节点的()in i k V 之和大于()out i k V 的和,即()()in out i ii Vi Vk V kV i V ∈∈>∀∈∑∑ 则称该社区是弱连接社区。

在本实验中,只有满足上述2个定义的子图才作为一个社区,从开始的整个图,不断地去除边,不存在满足上述定义的社区时便停止程序。

整个方法步骤与G-N 算法类似,都是基于去边,但不是根据边介数选择要去除的边,而是根据边的聚集系数这一新指标。

下面是该算法步骤:(1)计算整个图中的每一条边的聚集系数ij C ;(2)把其中聚集系数最小的边ij E 去除掉;(3)重新计算以i 和j 为顶点的所有边的聚集系数,其他的边不需要重新计算;(4)返回步骤(2),直到网络中不存在任何符合上述定义的社区。

4 实验及算法分析以安然公司邮件数据集[5]作为测试数据集。

首先进行预处理,导入到MySql 数据库中后,分别用数据库中的几个表保存响应信息,经过统计,在网络上与安然公司150个领导人有邮件联系的共计87 474人,其中公司内部有34 885人,外部有52 589人。

参照其他邮件数据集预处理的经验,对整个网络进行限制,规定只留下满足如下条件的人员:(1)这个人的邮件总数超过30,而如果2个人的互通邮件总数超过 6封才在2个人之间画一条边,另外同时对于任意存在边的 2个节点之间的这条线,依据两者之间的邮件数可以作为这条边的权重。

显然通过限制每个人的至少邮件总数以及5个人的至少邮件总数,可以调整整个网络的大小。

Prefuse [6]是一个基于Java 的网络可视化工具包,用这个软件把结果显示。

通过调整每个人互通邮件的最少数量,得到不同大小的图。

然后用ECC 算法进行社区分析后,部分截图见图2。

对于一个含有n 个节点m 条边的图,整个算法的运行时间为42(/)O m n ,而G-N 算法的时间复杂度是2()O m n 。

本算法与常用的4种算法的时间复杂度进行了对比(见表1)。

对于稀疏图,本算法计算速度要比G-N 算法快一个数量级。

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