mimics新手简易教程

mimics10.01教程--入门级（二）------import 导入

2011-05-11 0:24

1.如上图所示，点击FILE后，菜单里显示两种导入方法：一为open project；二为import images（其中又分为自动导入，半自动导入，手动导入三种）。下文分述之：

①open project：即导入工程文件，mimics的工程文件后缀名为.mcs，安装完程序后，程序自带工程文件demon.mcs，mimi.mcs，femur.mcs等，当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。

②import images

auto-import：自动导入，即我们选定路径及文件后，系统自动导入，此限于mimics支持的dicom文件。点击import images后弹出import images菜单，左上角显示"1"，即第1步，左侧为路径选择栏，右侧为内容，找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后，右侧即显示其中的内容，并默认全部选中状态，可点击下方next（或可选择需要导入的图像，然后点击next），进入第2步，如方才选中的图像参数一致（即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心）则显示为一个部分，如否，则分成几个部分分别显示，然后点击convert。如果定位参数缺失或不能识别则进入change orientation对话框，此时需手动设置图像的方向，移动鼠标至图像中标为"X”的部位，右键单击，选择top或bottom等。设置完成，点击OK。

Semi-automatic import：半自动导入，当导入的文件格式为BMP 或TIFF时，会弹出BMP/TIFF import对话框，以设置部分参数，见下图：

一般手动更改红色箭头所标示的Slice Distance，Pixel Size 数值，然后点击OK即可，，如导入错误，则说明其余数值有变动，应向CT扫描人员索取变动信息并填入，余同前。可预先preview。

manual import：手动导入，当在import images菜单的第一步时，将对话框下方的manual import选中并点击next，

当导入的文件为多个时，则弹出下图对话框，将其中内容填写后点击ok即可。可预先preview。

说明：File header Size 头文件大小，mimics可自动计算。如需手动填写，可有公式计算，此处从略。

Exam Information中：

1) Slices：医用扫描一般为横断面成像，默认选择Axial（轴视图）。

Image Information中：

2) Size：是图像的大小。

3) Slice Distance：层距。

4) Pixel Size：像素的大小，可从像素间距得出。如像素间距为0.8398x0.8398，则此处填0.8398.

Pixel Properties中：

5) Type: 选择Signed short或者Unsigned short。

当导入的文件为一个文件时，比如一些裸数据文件，如（/网站，然后点击Download New Dataset后可下载）stent16.raw文件，弹出如下图示：

说明：File Structure中：

1) File Header Size：指图像文件头部的大小。裸数据文件没有头部信息只包含像素，所以填0 。

2) Number of Images per File：是指裸数据文件中一共包含的图像数。

mimics10.01教程-- help之中文翻译--中文帮助--mimics

tutorial-Mimi--Windowing

2011-05-11 12:09

Windowing

视窗调整

First of all, we have to adjust the contrast of the images displayed in the different views. Contrast enhancement is a very good tool for selecting parts with different intensities, e.g. bone vs. brain tumor. This action can be performed at any time.

首先，我们需要在不同的视窗中调整图像的对比度，对于选择不同密度的选区来说，对比度增强是一个很好的工具。举例来说，如骨与脑肿瘤。这个功能在任何时候均可使用。

You can change the contrast in the corresponding tab of the Project management. The contrast tab shows the histogram of the project with a

line representing the “window”. The gray values or Hounsfield units below the start point of the line will be displayed in black. All gray values above the end point of the line will be displayed in white. The gray values in between the window will be mapped on a shade of gray.

你可以在相关工具栏里更改工程管理的对比度。对比度工具栏将工程以直方图方式显示，并以一条线代表了视窗的调整。比这条线起始点低的灰度值或亨氏单位被以黑色显示，反之，比此线结束点高的以白色显示。居中的灰度值以灰色的明暗显示。

You can change the window size by clicking your left mouse on one of the points and dragging it to its new location. To move the window select the line and drag it to its new position.

你可以左键点击起始点或结束点中的一个并将其拖动到新的位置来做视窗的调整。也可点击代表视窗的那条线并拖动至新位置来调整。

You can also choose one of the predefined “windows” by selecting the appropriate scale from the menu on the bottom of the tab.

你也可以通过挑选此栏底部的适当的刻度值，来选择视窗调整的预设值。

The following steps will describe the necessary actions to achieve a nice segmentation mask. A segmentation mask is a collection of pixels of interest that constitute an object you wish to work on. One can create several -dependent or independent - masks, each displayed with their own identifying color. Usually several masks will be needed to obtain a final segmentation object that contains the information that is needed.

下面的步骤将描述必要的命令，以便于更好地进行蒙罩分割。分割后的蒙罩即为你感兴趣的像素集，它包含着你希望处理的对象。你可以建立几个独立的或非独立的蒙罩，每个都可以以可辨识的颜色来显示。通常蒙罩应为包含所需信息的分割图像。

mimics10.01教程--入门级（三）------Windowing 视窗调整

2011-05-11 12:58