酶作用机理
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物的结构互相吻合,但酶的活性中心是柔 性的而非刚性的。
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
当底物与酶相遇时,可诱导酶活性中心的 构象发生相应的变化,其上有关的各个基团达 到正确的排列和定向,因而使底物和酶能完全 契合。
当反应结束产物从酶分子上脱落下来后, 酶的活性中心又恢复成原来的构象。
三、酶催化的高效性的机理
一、酶与活化能
酶的催化机理
碰撞、有效碰撞、活化分子、
活化能:活化分子所有的最低能量(Ea)与 分子的平均能量(EA)之差。分子由常态转 变为活化状态所需要的能量称为活化能。
一、酶与活化能
酶的催化机理
二、酶与底物作用机理
中间产物学说
酶的催化机理
催化机理目前较满意的解释是:
中间产物学说
又叫 过渡态学说
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
此学说很好地解释了酶的立体异构专一性, 但不能解释酶的活性中心既适合于可逆反应的底 物,又适合于产物,也不能解释酶专一性中的所 有现象。
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
诱导契合学说 (Induced fit Hypothesis)
1958年 D.E.Koshland提出 酶分子活性中心的结构原来并非和底
丝氨酸羟基
亲电子基团
—CH2—S H
半胱氨酸巯基
—CH2— HN N
组氨酸咪唑基
羧肽酶A催化 作用的模式
三、酶催化的高效性的机理
如 胰凝乳蛋白酶 chymotrypsin
酶ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ化的高效性
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
(5) 活性中心是低介电区 某些酶的活性中心穴内是非极性的,这种
低介电环境甚至还可能排除水分子。
二、酶与底物作用机理 中间产物学说
酶的催化机理
酶与底物通过形成中间产物使反应沿一个低 活化能的途径进行。
E+S
ES
E+P
二、酶与底物作用机理 中间产物学说
酶的催化机理
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
Sumary-中间产物学说
❖ 底物S与酶结合形成中间产物ES S与E的结合导致分子中某些化学键发生变化,
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
(4) 共价催化
某些酶在催化反应时,本身能放出或吸取电子 并作用于底物的缺电子或负电子中心,并与底物形 成共价连结的共价中间物,使反应活化能大大降低。
按照酶对底物所攻击的基团的不同,该催 化方式又分为亲核催化(nucleophilic catalysis) 和亲电子催化(cetecrophilic catalysis)。
这样,底物分子的敏感键和酶的催化基团 之间就会有很大的反应力,加速反应的进行。
OH
COO NH2 S
O
His HN NH+
HN N..
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
❖ 有时,酶活性部位上有几个基团分别作为质子 的供体和受体,同时进行酸碱催化—— 酸碱共 同催化
如 His的咪唑基
在中性条件下,有一半是酸形式、一半是 碱形式。因此既可进行酸催化,又可进行碱催 化。
所以咪唑基是酶分子最有效、最活泼的一 个功能基团。
酶催化的高效性
(2) “张力”和“形 底物与酶结合
变”
诱导
酶分子构象变化
底物分子的敏感键 产生“张力”和“形变”
有利于
敏感键断裂
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
(3) 酸碱催化
❖ 酶活性部位上的某些基团可以作为质子供体(或质 子受体)对底物进行酸或碱催化—— 酸碱催化
❖ 在酶的活性中心上,有些基团是质子供体(酸 催化基团),可以向底物分子提供质子,称为 (酸催化)
酶催化的高效性
(1) 邻近效应和定向效应
对于双分子反应,底物结合到酶的活性中心好象
❖ 两个底物分子相邻近,大大提高了底物的 有效浓度—— 邻近效应
❖ 底物分子还在活性中心“定向”排布,有 利于原子轨道的重叠 —— 轨道定向,使分 子间反应近似于分子内反应
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
三、酶催化的高效性的机理
❖ 有些催化基团是质子受体(碱催化基团),可 以从底物分子上接受质子,称为(碱催化)
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
酶分子中作为酸碱催化的功能基团
表3 2 酶分子中作为酸碱催化的功能基
氨基酸种类 酸催化基团( 质子供体 )
碱催化基团( 质子受体 )
Glu, Asp Lys Cys Tyr
COOH NH3+ SH
三、酶催化的高效性的机理
(4) 共价催化
酶催化的高效性
前者是指酶攻击底物的基团是富电子的, 这些基团首先攻击底物的亲电子基团(亦称缺 电子基团)而形成酶—底物的共价复合物。反 之,酶的缺电子基团攻击底物分子上富电子基 团而形成酶—底物共价中间产物。在酶的共价 催化中,亲核催化较为常见
亲核基团
—CH2—O H
呈不稳定状态,亦即活化态,使反应活化能降低。
❖ 复合物ES转变成酶与产物的复合物EP
❖ EP裂解,生成产物
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
锁钥学说 (Lock and key Hypothesis)
1890年 Emil Fischer as a great organic chemist led to the notion of an enzyme resembling a “lock” and its particular substrate the “key”. 酶和底物的结合状 如钥匙与锁的关系。底物分子或其一部分象钥匙一 样,专一地楔入到酶的活性中心部位,即底物分子 进行化学反应的部位与酶分子活性中心具有紧密互 补的关系。
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
当底物与酶相遇时,可诱导酶活性中心的 构象发生相应的变化,其上有关的各个基团达 到正确的排列和定向,因而使底物和酶能完全 契合。
当反应结束产物从酶分子上脱落下来后, 酶的活性中心又恢复成原来的构象。
三、酶催化的高效性的机理
一、酶与活化能
酶的催化机理
碰撞、有效碰撞、活化分子、
活化能:活化分子所有的最低能量(Ea)与 分子的平均能量(EA)之差。分子由常态转 变为活化状态所需要的能量称为活化能。
一、酶与活化能
酶的催化机理
二、酶与底物作用机理
中间产物学说
酶的催化机理
催化机理目前较满意的解释是:
中间产物学说
又叫 过渡态学说
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
此学说很好地解释了酶的立体异构专一性, 但不能解释酶的活性中心既适合于可逆反应的底 物,又适合于产物,也不能解释酶专一性中的所 有现象。
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
诱导契合学说 (Induced fit Hypothesis)
1958年 D.E.Koshland提出 酶分子活性中心的结构原来并非和底
丝氨酸羟基
亲电子基团
—CH2—S H
半胱氨酸巯基
—CH2— HN N
组氨酸咪唑基
羧肽酶A催化 作用的模式
三、酶催化的高效性的机理
如 胰凝乳蛋白酶 chymotrypsin
酶ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ化的高效性
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
(5) 活性中心是低介电区 某些酶的活性中心穴内是非极性的,这种
低介电环境甚至还可能排除水分子。
二、酶与底物作用机理 中间产物学说
酶的催化机理
酶与底物通过形成中间产物使反应沿一个低 活化能的途径进行。
E+S
ES
E+P
二、酶与底物作用机理 中间产物学说
酶的催化机理
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
Sumary-中间产物学说
❖ 底物S与酶结合形成中间产物ES S与E的结合导致分子中某些化学键发生变化,
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
(4) 共价催化
某些酶在催化反应时,本身能放出或吸取电子 并作用于底物的缺电子或负电子中心,并与底物形 成共价连结的共价中间物,使反应活化能大大降低。
按照酶对底物所攻击的基团的不同,该催 化方式又分为亲核催化(nucleophilic catalysis) 和亲电子催化(cetecrophilic catalysis)。
这样,底物分子的敏感键和酶的催化基团 之间就会有很大的反应力,加速反应的进行。
OH
COO NH2 S
O
His HN NH+
HN N..
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
❖ 有时,酶活性部位上有几个基团分别作为质子 的供体和受体,同时进行酸碱催化—— 酸碱共 同催化
如 His的咪唑基
在中性条件下,有一半是酸形式、一半是 碱形式。因此既可进行酸催化,又可进行碱催 化。
所以咪唑基是酶分子最有效、最活泼的一 个功能基团。
酶催化的高效性
(2) “张力”和“形 底物与酶结合
变”
诱导
酶分子构象变化
底物分子的敏感键 产生“张力”和“形变”
有利于
敏感键断裂
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
(3) 酸碱催化
❖ 酶活性部位上的某些基团可以作为质子供体(或质 子受体)对底物进行酸或碱催化—— 酸碱催化
❖ 在酶的活性中心上,有些基团是质子供体(酸 催化基团),可以向底物分子提供质子,称为 (酸催化)
酶催化的高效性
(1) 邻近效应和定向效应
对于双分子反应,底物结合到酶的活性中心好象
❖ 两个底物分子相邻近,大大提高了底物的 有效浓度—— 邻近效应
❖ 底物分子还在活性中心“定向”排布,有 利于原子轨道的重叠 —— 轨道定向,使分 子间反应近似于分子内反应
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
三、酶催化的高效性的机理
❖ 有些催化基团是质子受体(碱催化基团),可 以从底物分子上接受质子,称为(碱催化)
三、酶催化的高效性的机理
酶催化的高效性
酶分子中作为酸碱催化的功能基团
表3 2 酶分子中作为酸碱催化的功能基
氨基酸种类 酸催化基团( 质子供体 )
碱催化基团( 质子受体 )
Glu, Asp Lys Cys Tyr
COOH NH3+ SH
三、酶催化的高效性的机理
(4) 共价催化
酶催化的高效性
前者是指酶攻击底物的基团是富电子的, 这些基团首先攻击底物的亲电子基团(亦称缺 电子基团)而形成酶—底物的共价复合物。反 之,酶的缺电子基团攻击底物分子上富电子基 团而形成酶—底物共价中间产物。在酶的共价 催化中,亲核催化较为常见
亲核基团
—CH2—O H
呈不稳定状态,亦即活化态,使反应活化能降低。
❖ 复合物ES转变成酶与产物的复合物EP
❖ EP裂解,生成产物
二、酶与底物作用机理
酶的催化机理
锁钥学说 (Lock and key Hypothesis)
1890年 Emil Fischer as a great organic chemist led to the notion of an enzyme resembling a “lock” and its particular substrate the “key”. 酶和底物的结合状 如钥匙与锁的关系。底物分子或其一部分象钥匙一 样,专一地楔入到酶的活性中心部位,即底物分子 进行化学反应的部位与酶分子活性中心具有紧密互 补的关系。