MPICH 的安装使用和MPI原理分析
MPI安装与运行报告
MPI 安装于运行报告本机运行环境:机器型号:联想G450处理器:Pentium(R)Dual-Core CPU T4200 @ 2.00GHz 运行内存(RAM):2GB操作系统:Windows 7(32 位)程序开发环境:Visual Studio 2008MPI 版本:mpich2-1.3.2p1-win-ia32 安装程序详细安装步骤:1、运行mpich2-1.3.2p1-win-ia32.msi。
安装过程中,会要求设置一个passphrase我的机器上默认的passphrase是beHappy,很有意思的密码。
设置这个东西很重要,一定要记住;下面会说到为什么。
2、安装完之后,不知道下一步怎么进行了。
打开刚才安装的MPICH2的快捷方式目录,发现了一个README文件。
打开之后,发现了MPICH2的使用方法介绍,于是按照其中的指示,我进行了第一个MPI 并行程序的编写。
我使用的是VC++2008首先创建一个新的工程,取名为MPITes。
添加MPI 库的支持:按照README中的指导,应该首先将MPI的头文件目录包含到项目中去。
结果在项目属性中找了半天,也没有找到添加头文件目录的位置,只找到了包含库文件的位置,我安装MPICH2的目录为D:\Program Files\MPICH2将MPICH2的库文件添加到如下面图1所示的位置即可。
最后才反应过来,这个工程还是空的,没有任何文件,可能跟这个有关系吧。
于是,马上新建了一个Cpp文件main.cpp,将老师PPT中的例子程序拷贝进去。
图1果然,新建了这个cpp文件之后,项目属性中多出了C/C++这样一项, 于是,就可以在其中设置包含文件的目录了,相应的配置如下面图2所示图2设置好这些文件之后,编译程序,结果在连接的时候报错,类似于main.obj : error LNK2019:无法解析的外部符号_MPI_Finalize,该符号在函数_main中被引用”这样的错误出现了六个。
MPI安装、设置以及运行
MPI安装、VS设置以及运行一安装MPICH2的安装很简单,按照步骤来就行了。
Intel cluster tool 安装参照install-cluster说明,找到license file即可。
安装完成后在“任务管理器”进程中能找到“smpd.exe”进程说明安装成功。
如下图二VS设置(c语言)首先按照VS步骤新建空项目,编辑源文件。
完成源文件c后,需对其属性进行如下设置才能成功生成exe文件。
1、添加include在工具栏中选择“项目”——“test1属性”,将出现test1属性页,选择“配置属性”——“c/c++”——“常规”,在右侧“附加包含目录”中添加MPI的“include”文件夹,如下图2、添加lib同样在属性页中选择“配置属性”——“链接器”——“常规”,在右侧“附加库目录”中添加“lib”文件夹,如下图3、设置参数同样在属性页中选择“配置属性”——“链接器”——“输入”,在右侧“附加依赖项”中输入“mpi.lib”. 如下图确定,然后退出,完成设置,可以生成exe文件。
三运行生成的exe文件运行exe文件有两种方法,一种通过“开始”——“程序”——“MPICH2”——“wmpiexec.exe”运行,另一种是通过“命令提示符”窗口运行。
但运行前都需要注册,MPI要求电脑设置管理员用户和密码,在注册时采用相同用户名和密码。
设置步骤如下:1、设置电脑管理员用户名和密码2、“开始”——“程序”——“MPICH2”——“wmpiregister.exe”出现如下界面,输入用户名及密码,register,完成注册。
3、在“开始”——“程序”——“MPICH2”——“wmpiconfig.exe”出现如下界面,点击“Scan Hosts”Hosts变成绿色说明注册成功。
下图。
找到由VS生成的exe文件,选择并行处理器的个数,点击“Execute”运行程序。
或者在“命令提示符”窗口中运行。
Dos 命令下1、找到文件路径输入方式,如查找D盘tex文件,2、在命令提示符下运行并行程序tex首先,将生成的程序tex.exe拷贝到mpiexec.exe相同的目录下然后,按下图2找到路径输入命令。
MPI使用操作流程
《mpi使用操作流程》xx年xx月xx日contents •MPI介绍•MPI安装与配置•MPI基本使用方法•MPI并行文件IO操作•MPI并行计算实例•MPI错误处理与调试目录01 MPI介绍Multiple Processor Interface:一种并行计算编程模型,用于多处理器或多线程并行计算。
Message Passing Interface:一种消息传递编程模型,用于分布式或并行计算系统中的进程间通信。
MPI含义MPI标准由美国Argonne国家实验室开发,成为并行计算领域的重要工具。
1993年MPI-2标准发布,增加了对异步通信和动态进程管理的支持。
1997年MPI-3标准发布,优化了并行计算性能和可扩展性。
2008年MPI发展历程MPI应用场景并行数据库MPI可以用于并行数据库系统中的数据分发和通信,提高数据处理速度和效率。
并行图处理MPI可以用于大规模图处理中的并行计算,提高图算法的效率和速度。
高性能计算MPI是高性能计算中常用的并行计算编程模型,被广泛应用于天气预报、物理模拟、数据分析等领域。
02MPI安装与配置确认操作系统版本和支持的MPI版本准备MPI安装所需组件和工具确认网络连接和远程访问能力下载对应版本的MPI安装包解压缩MPI安装包执行安装脚本,如`.bin/install.sh`等待安装过程完成,不要手动中断按照提示进行下一步操作,如选择安装路径、配置环境变量等MPI配置步骤进入MPI安装目录下的`etc`子目录编辑`mpd.conf`文件,配置MPI守护进程的参数配置MPI启动脚本,如`mpd.sh`、`mpdstart.sh`等设置启动脚本属性为可执行,如`chmod +x mpd.sh`使用启动脚本启动MPI守护进程,如`./mpd.sh &`确认MPI守护进程是否成功启动,可以使用`ps -ef |grep mpd`命令查看进程状态03MPI基本使用方法MPI运行环境设置安装MPI选择适合的MPI版本并按照说明进行安装。
MPICH2配置和使用
MPICH2配置和使用MPICH2是一个开源的高性能并行计算库,用于构建和管理分布式内存系统。
它是Message Passing Interface(MPI)的一个实现,MPI是一种用于在并行计算环境中进行通信和同步的标准。
MPICH2允许开发者在多个计算机之间发送消息和执行并行任务,以实现高效的并行计算。
本文将介绍如何配置和使用MPICH2来构建一个简单的并行计算应用程序。
一、环境准备2.配置计算机网络在使用MPICH2之前,需要配置计算机网络以便计算机之间进行通信。
可以使用本地网络(例如以太网)或者虚拟网络(例如VMware或VirtualBox)来模拟分布式计算环境。
3.配置环境变量将MPICH2的安装目录添加到系统的PATH环境变量中,以便在命令行中直接调用MPI的相关命令。
二、配置主节点1.选择一个计算机作为主节点,并在该计算机上打开命令行窗口。
2.启动MPD守护进程在命令行窗口中输入以下命令来启动MPD守护进程:```mpd &```3.配置主节点在命令行窗口中输入以下命令来配置主节点:```mpiexec -n 1 mpdtrace -l > mpd.hosts```以上命令将创建一个名为mpd.hosts的配置文件,其中包含了主节点的名称。
三、配置从节点1.选择其他计算机作为从节点,并对每个从节点重复以下步骤。
2.在从节点上打开命令行窗口,并输入以下命令来启动MPD守护进程:```mpd &```3.将从节点加入主节点的计算机网络中在主节点的命令行窗口中,输入以下命令来将从节点添加到主节点的计算机网络中:```mpiexec -n 1 -f mpd.hosts hostname```其中,mpd.hosts是主节点上创建的配置文件。
四、编写并行应用程序1.使用MPI的编程接口使用C、C++、Fortran等编程语言,使用MPI的编程接口来编写并行应用程序。
例如,以下是一个使用C语言和MPI编写的简单并行计算应用程序的示例代码:```c#include <stdio.h>#include <mpi.h>int main(int argc, char* argv[])int rank, size;MPI_Init(&argc, &argv);printf("Hello from node %d of %d\n", rank, size);MPI_Finalize(;return 0;```2.编译并行应用程序在主节点的命令行窗口中,使用适当的编译器来编译并行应用程序。
MPI在大规模并行计算中的应用
MPI在大规模并行计算中的应用一、MPI的介绍MPI(Message Passing Interface)是一种消息传递接口标准,用于在多个计算节点之间进行通信和数据传递。
MPI的出现极大地推动了科学计算和工程计算的大规模并行化和分布式计算。
MPI 有多种实现,如MPICH、OpenMPI和MVAPICH等。
二、MPI的工作原理MPI的工作原理是基于点对点通信,即两个节点之间的通信。
通信方式分为同步和异步两种。
同步通信是指发送方将数据发送到接收端并等待接收端接收,然后才继续执行后续操作。
异步通信则是发送方将数据发送给接收方,而不等待接收端接收,然后就可以继续执行后续操作。
三、MPI在大规模并行计算中广泛应用,如天气预测、生物制药、核物理、空气动力学等领域。
以下是介绍MPI在大规模并行计算中的应用:1. 生物制药生物制药的工艺流程非常复杂,需要处理大量的数据和复杂算法。
MPI可以实现多个生物反应器之间的并行计算,加速反应速率和节省计算时间,同时保证结果的准确性和可靠性。
例如,在DNA分子建模中,MPI可以将一份任务分配给多个计算节点,以提高计算速度。
2. 天气预测天气预测需要处理大量气象数据,包括风速、温度、湿度等。
MPI可以将这些数据分配给计算节点进行处理,以减少计算时间和提高准确性。
例如,在大气模型预测方面,MPI可以将模型分散到多个节点中进行模拟,模拟结果交换并合并成一个预测结果。
3. 核物理在核物理领域,MPI可以实现大规模的数据交换和复杂算法计算。
例如,MPI可以处理以太核物质的模拟和分析,以提高核物理实验的效率和准确性。
4. 空气动力学在航空航天工程中,MPI可以模拟航空器受到的气动力,提高航天飞行器的效率和性能。
例如,在飞机设计方面,MPI可以将模拟数据分配到多个计算节点上进行分析和计算,以提高计算速度和准确性。
四、本文的结论MPI在大规模并行计算中有着广泛的应用,可以提高计算速度和准确性,同时保证数据的可靠性。
并行计算实验报告
实验报告课程名称并行计算机体系结构实验名称并行计算机体系结构实验指导教师纪秋实验日期 _ 2011.4 ______学院计算机学院专业计算机科学与技术学生姓名 _______查隆冬_______ 班级/学号计科0804 /2008011183 成绩 ________ _________并行计算机体系结构实验报告⒈安装Mpich、配置文件、小组互相ping通网络的过程和指令(一)安装Mpich(1)本机插入MPICH光盘,双击桌面的计算机图标->CD-RW/DVD-ROM Drive图标;系统自动挂载cdrom到/media下。
(桌面出现新光盘图标XCAT-MPICH2.即挂载成功)(2)Cp /media/cdrecorder/mpich2-1.0.6.tar.gz /usr;本机拷贝mpich2-1.0.6.tar.gz到/usr目录下(3)Cd /usr ;进入usr目录下(4)Tar zxvf mpich2-1.0.6.tar.gz ;解压mpich2-1.0.6.tar.gz到当前目录(5)cd mpich2-1.0.6 ;进入mpich2-1.0.6目录(6)./configure –enable–f90 –prefix=/opt/mpich ;生成mpi的makefile 和设置mpich路径启用f90编译器(7)make ; 编译(8)make install ;将编译好的文件安装,安装结束后在/opt下生成mpich文件夹(9) which mpdboot ; 查找文件(二)配置环境变量(1)打开终端,输入 vi/etc/bashrc(2)在最后一行与倒数第2行之间输入(用insert键输入)export PATH=/opt/mpich/bin:$PATHexport PATH=/opt/intel/cc/10.0.026/bin:$PATHexport PATH=/opt/intel/fc/10.0.026/bin:$PATHexport LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/cc/10.0.026/lib:$LD_LIBRARY_PATH LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fc/10.0.026/lib:$LD_LIBRARY_PATH按esc键退出;输入:wq (保存退出文件)cat /etc/bashrc ;查看文件(三)小组互相ping通网络的过程和指令(1)设置一个MPD节点配置文件在/root下新建 mpd.hosts文件,打开终端输入:cd /rootvim mpd.hosts ;使用vim文本编辑器(按insert键插入)s06 ;本机的主机号s02s12s17s18按esc键退出;按shift键和输入:wq (保存退出文件)cat /root/mpd.hosts ;查看文件(2)将主机名与相应的IP地址绑定打开终端输入:vi /etc/hosts (输入与保存退出步骤同上) 10.10.10.106 s0610.10.10.102 s0210.10.10.112 s1210.10.10.117 s1710.10.10.118 s18(3)设置两个MPD密码配置文件打开终端输入:(输入与保存退出步骤同上) cd /rootvi mpd.confMPD_SECRETWORD=123456cd /etcvi mpd.confMPD_SECRETWORD=123456(4)用绝对模式修改以下3个文件的权限打开终端输入:cd /etcls –l mpd.confchmod 600 mpd.conf ;修改该文件权限为本机可读、可写,同组和其他人没有任何权限cd /rootls –l mpd.confchmod 600 mpd.conf ;修改该文件权限为本机可读、可写,同组和其他人没有任何权限ls –l mpd.hostschmod 600 mpd.hosts ;修改该文件权限为本机可读、可写,同组和其他人没有任何权限(5)检查本组IP是否已互相连通打开终端输入:ping s02 ;s12、 s17 、s18 同上如连通,则输入ctrl+c 退出(6)启动参与与运算的节点1)首先启动本机mpdboot –n 1 –f mpd.hosts ;1为本机2)查看本机是否已启动s06 10.10.10.106若以启动则退出,输入:mpdallexit⒉编译pi.c小组并行计算π值。
mpi原理
mpi原理
MPI,全称为Message Passing Interface,是一种用于实现并行计算的消息传递编程接口。
MPI允许一组计算机(即MPI进程)互相通信和协作,以完成某个含有大量计算或数据处理任务的程序。
MPI的原理比较简单,它是由若干个MPI进程组成的,并通过消
息传递的方式来进行通信和协作。
MPI进程之间的通信可以通过MPI自带的一系列函数来完成,比如发送和接收消息、广播、聚集、散布等。
MPI程序可以运行在单个计算机上的不同进程,也可以运行在网络连接的多个计算机上的不同进程。
MPI进程之间共享数据,但每个进程都拥有各自的独立内存空间,因此MPI程序可以实现真正的分布式计算。
MPI的主要用途是并行计算,它可以用于计算密集型任务,比如
科学计算、数值模拟等。
MPI还支持动态进程管理,可以动态地添加或删除进程,从而更加灵活地适应不同的计算需求。
MPI的性能和扩展性都很好,可以适用于不同规模的计算任务,从小型集群到数千个计算
节点的超级计算机都可以使用MPI进行并行计算。
Siemens MPI协议解析
Siemens MPI协议解析协议名称:Siemens MPI协议解析一、引言Siemens MPI(Multi-Point Interface)协议是一种用于工业自动化领域的通信协议,用于实现Siemens设备之间的数据交换和通信。
本协议解析旨在详细描述Siemens MPI协议的结构、数据传输方式以及相关通信规范。
二、协议结构1. 帧格式Siemens MPI协议采用帧格式进行数据传输。
每个帧由固定的帧头、数据字段和帧尾组成,具体格式如下:帧头:2个字节,用于标识帧的开始。
数据字段:可变长度,用于传输实际数据。
帧尾:2个字节,用于标识帧的结束。
2. 数据格式Siemens MPI协议中的数据按照字节进行传输,采用大端字节序。
数据类型包括整型、浮点型、字符串等,具体格式如下:整型:4个字节,采用有符号补码表示。
浮点型:4个字节,采用IEEE 754标准表示。
字符串:以ASCII码形式表示,以NULL字符结尾。
三、数据传输方式1. 主从模式Siemens MPI协议中,数据传输通常采用主从模式。
主站负责发起通信请求,从站负责响应请求并返回数据。
主站和从站之间通过MPI总线进行数据交换。
2. 帧序列Siemens MPI协议中的数据传输采用帧序列的方式。
主站发送请求帧,从站接收并返回响应帧,主站再接收响应帧。
帧序列的具体流程如下:a. 主站发送请求帧:主站发送帧头,数据字段(包含请求数据)和帧尾。
b. 从站接收请求帧:从站接收到请求帧后,解析数据字段中的请求数据,并根据请求执行相应操作。
c. 从站发送响应帧:从站发送帧头,数据字段(包含响应数据)和帧尾。
d. 主站接收响应帧:主站接收到响应帧后,解析数据字段中的响应数据,并进行相应处理。
四、通信规范1. 地址分配Siemens MPI协议中,每个设备都有一个唯一的地址,用于在总线上进行通信。
地址由主站进行分配,并通过配置文件或编程方式进行设置。
2. 数据传输Siemens MPI协议支持多种数据传输方式,包括读取数据、写入数据和数据交换等。
MPICH的安装使用和MPI原理分析
MPICH的安装使用和MPI原理分析MPICH是一种开源的、可移植的并行计算库,它实现了MPI(Message Passing Interface)标准。
MPI是一种用于并行计算的通信协议,可以在分布式计算环境中实现不同计算节点之间的数据交换和通信。
MPICH提供了一套API,使得开发者可以方便地利用MPI进行并行计算。
下面将介绍MPICH的安装使用和MPI原理分析,以帮助读者更好地理解和使用MPICH。
一、MPICH的安装使用1. 安装准备:在安装MPICH之前,需要确保系统中已经安装了必要的编译器和依赖库。
通常情况下,需要安装C/C++编译器、Fortran编译器和相关的开发库。
4.配置编译选项:进入解压后的MPICH目录,执行以下命令配置编译选项:./configure --prefix=<install_path>其中,<install_path>是指定MPICH安装的路径。
5.编译安装:执行以下命令进行编译和安装:makemake install6. 配置环境变量:将MPICH的安装路径添加到系统的环境变量中,以便系统可以找到MPICH的可执行文件。
可以在.bashrc或者.bash_profile文件中添加以下内容:export PATH=<install_path>/bin:$PATHexport LD_LIBRARY_PATH=<install_path>/lib:$LD_LIBRARY_PATH其中,<install_path>是MPICH的安装路径。
7.测试安装:执行以下命令测试MPICH是否安装成功:mpiexec -n <num_processes> <executable>其中,<num_processes>是指定并行计算的进程数,<executable>是指定要运行的可执行文件。
Linux环境下的MPICH
1.1.1Linux操作系统下的环境搭建1.1.1.1 l am-mpiMPI是一种消息传递编程模型,并成为这种模型编程的代表和事实上的标准。
MPI是一个库而不是一门语言,因此对MPI的使用必须和特定的语言结合起来进行,如科学与工程计算领域的FORTRAN语言、目前广泛使用的开发语言C等。
LAM(Local Area Multicomputer)是免费的MPI实现,由Ohio State University开发。
配置并行环境之前几点说明:1.安装Linux系统(RedHat 9.2)2.安装网卡驱动(因为实验室的机群系统dellPE2850服务器无法自动识别网卡,需要手动驱动网卡。
普通机器RH可自动识别其网卡的机器.网卡驱动在自带的Server Assistant 光盘中:)步骤:#cd /mnt/cdrom/pexxxx/network/r82795该文件夹下,有网卡驱动的压缩包,将其拷贝到 /root下,解压#tar -xzvf *进入解压后的文件夹:#cd /root/Intel_LAN_72_RHLinux_src_A00/e1000/e1000-5.2.17.10/src , #make install安装后,重起机器。
3.在重新启动过程中,系统会自动识别新硬件,此时需要对网卡的相关信息进行配置修改网络配置文件如下:1)修改文件 /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0 ,修改IP、网关等信息:DEVICE=eth0 设备名称BOOTPROTO=staticONBOOT=yesIPADDR=192.168.0.109 IP地址NETMASK=255.255.255.0 子网掩码NETWORK=192.168.0.0 可选写BROADCAST=192.168.0.255 可选写GATEWAY=192.168.0.1 网关2)配置DNS,需要修改 /etc/resolv.conf 文件nameserver 210.47.208.8 DNS服务器地址3)修改 /etc/sysconfig/network文件,指定主机名NETWORKING = yesHOSTNAME = node064)修改 /etc/hosts 文件,对主机名加以解释,加入:192.168.0.106 node06完成上面几步后,网络基本配置完成,此时需要重启机器,或重新开启网络服务:可以使用命令:#reboot 重启机器#service network restart 重新开启网络服务注:每台机器都配备两块网卡:eth0、eth1,如果网卡驱动、网络配置后网络仍然不通,需要关闭eth1,而只启用eth0。
MPICHPBS使用指南使用指南使用说明mp使用指南使用说明mp
MPICH&PBS使用指南一、MPI编程 (1)二、MPICH下编译和运行 (3)三、PBS环境下运行 (4)一、MPI编程1、MPI编程函数介绍MPI实际上是一个提供并行程序消息传递机制的函数库,有40多个函数,常用的有6个基本函数。
下面以C语言为例简单介绍这些函数。
(1)MPI_Init函数定义:int MPI_Init(int *argc, char ***argv)功能:用命令行参数初始化MPI环境输入:argc、argv—表示命令行参数,同C语言的main()函数参数格式,argv中包含欲并行运行的进程数输出:返回值—非零/零表示初始化是否成功说明:该函数必须为程序中第一个调用的MPI函数示例:MPI_Init(&argc, &argv); // argc、argv引用的是mian()函数的参数(2)MPI_Finalize函数定义:int MPI_Finalize (void)功能:结束MPI程序的运行,指结束MPI环境的使用输入:无输出:返回值—非零/零表示结束MPI环境是否成功说明:该函数必须为程序中最后一个调用的MPI函数示例:MPI_ Finalize ();(3)MPI_Comm_size函数定义:int MPI_Comm_size(MPI_Comm comm, int *size)功能:得到总进程数输入:comm 通信域句柄(系统默认的为MPI_COMM_WORLD,也可自己定义)输出:size,即通信域comm内包括的进程数整数(4)MPI_Comm_rank函数定义:int MPI_Comm_rank(MPI_Comm comm, int *rank)功能:得到本进程的进程号输入:comm,该进程所在的通信域句柄输出:rank,调用进程在comm中的标识号(5)MPI_Send函数定义:int MPI_Send(void* buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dest, int tag, MPI_Comm comm) 功能:发送消息给特定的进程输入:buf 发送缓冲区的起始地址(可选类型)count 将发送的数据的个数(非负整数)datatype 发送数据的数据类型(句柄)dest 目的进程标识号(整型)tag 消息标志(整型)comm 通信域(句柄)输出:无(6)MPI_Recv函数定义:int MPI_Recv(void* buf, int count, MPI_Datatype datatype, int source, int tag,MPI_Comm comm,MPI_Status *status)功能:接受别的进程发过来的消息输入:count 最多可接收的数据的个数(整型)datatype 接收数据的数据类型(句柄)source 接收数据的来源即发送数据的进程的进程标识号(整型)tag 消息标识与相应的发送操作的表示相匹配相同(整型)comm 本进程和发送进程所在的通信域(句柄)输出:buf 接收缓冲区的起始地址(可选数据类型)status 返回状态(状态类型MPI_Status)2、MPI程序示例MPI程序中必须包含MPI库的头文件,C语言头文件名为mpi.h,FORTRAN语言头文件名为mpif.h。
安装和设置mpi并行环境
安装和设置mpi并行环境3月31日,系统(主节点)因为安装mpich崩溃,开始重新安装系统和部署globus,此次安装决定先安装mpich,成功之后再按照globus。
经过反复试验,(花了不少心思去找版本问题,其实理论上mpich不应该有这么多版本问题的,猜想也有可能是之前与globus冲突所以系统崩溃了),觉得以下的版本是比较适合的,并且已经安装成功。
所以赶紧把这部分内容写下来备份,免得下次到处找。
安装之前请确认以下几件事:linux版本:redhat9.0,内核信息与之前相同所用mpich版本:mpich2-1.0.8安装之前,设置hostname和ip地址,与之前一样系统已经安装了gcc安装过程中使用root用户安装mpich步骤:1,创建SSH信任连接(在root目录下)(1)更改hosts文件,加入需要进行计算的机器#vi/etc/hosts打开hosts文件,更改如下:127.0.0.1 localhost.localdomain localhost 192.168.1.100 192.168.1.101 .(2)在生成SSH秘钥对//一路回车即可产生.ssh文件[root@chunli root]#ssh-keygen-t rsa Generating public/private rsa key pair.Enter file in which to save the key(/root/.ssh/id_rsa):Enter passphrase(empty for no passphrase):Enter same passphrase again:Your identification has been saved in/root/.ssh/id_rsa.Your public key has been saved in/root/.ssh/id_rsa.pub.The key fingerprint is:6c:61:a8:3f:a2:e0:9c:e7:8a:1b:49:76:a1:ce:e0:e9***************//查看是否有.ssh文件夹[root@chunli root]#ls-a..fonts.cache-1.gtkrc.recently-used..gconf.gtkrc-1.2-gnome2.rhn-applet.conf anaconda-ks.cfg.gconfd.ICEauthority.ssh.bash_history.gnomeinstall.log.tcshrc.bash_logout.gnome2install.log.syslog.viminfo.bash_profile.gnome2_private.metacity.Xauth ority.bashrc.gnome-desktop.nautilus.Xresources.cshrc.gstreamer.pyinput.xsession-errors(3)进入.ssh目录[root@chunli root]#cd.ssh(4)生成authorized_keys文件[***************]#cpid_rsa.pubauthorized_keys(6)建立本身的信任连接//按提示输入yes(三个字母要打全)[***************]#cd.[root@chunliroot]#The authenticity of host'(127.0.0.1)'can't be established.RSA key fingerprint is ec:c9:1c:5a:d6:98:5d:48:fd:7b:58:b3:b3:05:05:78.Are you sure you want to continue connecting(yes/no)?yes Warning:Permanently added''(RSA)to the list of known st login:Wed Mar 31 18:55:59 2010(7)设置第二个节点(grid1的root目录下)#ssh-keygen-t rsa生成.ssh文件夹//注意不要多键入空格从拷贝。
MPI安装与运行报告2
Ubuntu系统下mpich2的安装。
把老师给的“mpich2-1.3.2p1.tar.gz ”解压到我的用户目录下。
一、首先进入解压后mpich2文件的根目录,运行配置操作:./configure--prefix=/home/<USERNAME>/mpich2-install |& tee info.txt ,结果报错如下:"No Fortran 77 compiler found. If you don't need to build anyFortran programs, you can disable Fortran support using--disable-f77 and --disable-fc. If you do want to buildFortran programs, you need to install a Fortran compiler suchas gfortran or ifort before you can proceed."于是按照提示修改命令,改为./configure --prefix=/home/east/mpich2-install --disable-f77 --disable-fc |& tee info.txt,结果又提示没有找到C++编译器:“configure: error: Aborting because C++ compiler does not work. If you do not need a C++ compiler, configure with –disable-cxx”考虑到以后应该会用到g++,于是根据提示用“sudo apt-get install g++”命令进行了安装。
然后再次运行配置命令,终于成功完成。
二、运行make命令”make |& tee info.txt”,经过了漫长的等待,看到提示”Make completed”的时候,终于松了一口气。
MPICH2安装及MPI简介
MPICH2安装及MPI简介2009-02-16 19:02:38| 分类:HPC | 标签:mpich2的安装 mpi |字号大中小订阅ZHI 2008-12-14MPICH2的安装●下载MPICH2包mpich2.tar.gz●解压缩# tar xfz mpich2.tar.gz●#mkdir /tmp/root/mpich2-1.0.8●#cd /tmp/root/mpich2-1.0.8●#/root/Desktop/mpich2-1.0.8/configure --prefix=/usr/local 2>&1 | tee configure.log//其中root/Desktop/mpich2-1.0.8/为解压后MPICH2路径●#make 2>&1 | tee make.log●#make install PACKAGE=mpich-1.0.8 2>&1 | tee install.log●#make installcheck PACKAGE=mpich-1.0.8 2>&1 | tee installcheck.log测试安装是否成功#which mpiexec#which mpd //默认程序管理命令default process manager#which mpicc#which mpirun注:如果不是安装在/usr/local目录下,则还需设置环境变量。
通过编辑.bashrc文件修改环境变量#vi .bashrc修改后的.bashrc文件如下:# .bashrc# User specific aliases and functionsPATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin" //新增加的#Source .bashrcmpd配置文件中设置密码#cd $HOME#touch .mpd.conf#chmod 600 .mpd.conf //权限设置为只有自己有读写权限在超级用户下:#cd /etc#vi mpd.conf写入secretword=jsi 并保存#chmod 600 /etc/mpd.conf单机测试#mpd &#mpdtrace//显示本机名为成功#mpiexec –n 1 /bin/hostname#mpdallexitSSH配置●修改所有机器上的/etc/hosts文件为如下内容127.0.0.1 localhost.localdomain localhost10.10.1.190 node0110.10.2.190 node02……●创建SSH密钥(root目录)#ssh-keygen –t rsa //其中-t rsa指密钥类型。
mpirun例子 -回复
mpirun例子-回复MPICH和Open MPI是两个常用的可移植消息传递接口(MPI)库。
在大规模并行计算中,MPI是一种关键的编程模型,它允许多个进程在不同计算节点上通过消息传递进行通信和协调。
MPI的实现库可以通过不同的方式来管理线程和进程之间的通信,其中mpirun是一种用于启动MPI 应用程序的工具。
在本文中,将详细讨论mpirun的功能和用法,以及如何使用mpirun来执行并行计算任务。
首先,我们需要了解一下MPI的基本概念。
MPI是一种消息传递编程模型,它允许不同进程之间通过发送和接收消息来进行通信。
在MPI程序中,通常会有一个主进程(通常称为“根进程”或“主节点”)和多个工作进程(通常称为“工作节点”)。
现在,让我们来了解一下mpirun工具的用途和功能。
mpirun是MPI中用于启动并行程序的命令,它负责在不同计算节点上启动MPI进程。
mpirun可以根据需要启动任意数量的进程,并使它们能够相互通信。
mpirun通常会自动在网络中各个计算节点上启动MPI进程,并确保进程之间可以相互通信。
mpirun的用法非常简单。
一般来说,可以通过在终端中使用“mpirun -n <num_processes> <program>”的命令来启动MPI应用程序。
其中,-n选项指定要启动的进程数量,<num_processes>参数是一个整数,代表要启动的进程数量。
而<program>参数则是指定要运行的MPI程序的可执行文件。
在命令行中使用mpirun启动MPI应用程序的一个典型例子是:“mpirun -n 4 ./my_application”。
这个例子中,我们假设要启动一个由4个进程组成的MPI应用程序,而这个应用程序的可执行文件是“my_application”。
执行这个命令后,mpirun会自动在4个计算节点上启动MPI进程,并确保它们之间可以相互通信。
MPICH NT 1.2.5安装使用简要说明
MPICH NT 1.2.5安装使用简要说明注:本文档仅供在单机单处理器上进行MPICH学习实验参考,使用开发编译环境为VC++ 6.0,有关多机环境下或是采用其它编译器的配置请自己查询或搜索相关文档。
需要注意:1.该版本MPICH NT在以命令行方式执行程序时工作目录所在分区文件系统格式不能是NTFS,否则会产生“无法建立xxx.tmp文件”的错误,请在执行mpirun之前检查一下当前分区格式。
2.由于MPICH NT在执行程序时会有网络访问的动作,所以如果机器上装有防火墙,请注意做好相关配置(或是暂时关闭防火墙),以免MPI不能访问网络造成程序执行出错的结果。
安装使用简要过程如下:(1)先安装VC++ 6.0,安装过程略。
(2)下载MPICH NT 1.2.5的安装包,双击执行安装程序,按提示一步步安装,过程非常简单。
(3)打开VC++,在[工具]—[选项]里将MPICH NT的相关目录加进Include和Lib搜索路径当中。
(4)新建或打开一个已存在的工程,编写一个简单的MPI程序。
在MPICH的安装路径的SDK\Example\nt子目录下就有几个简单的例子。
(5)在工程打开之后,打开[项目]—[设置]菜单,在“Link”页面中加入“ws2_32.lib”以及“mpich.lib”和“mpichd.lib”二者之一,后者主要是调试时使用。
(6) 对工程进行编译和链接,生成可执行文件。
(7) 接下来是执行mpi 程序的过程,MPICH NT 1.2.5提供了两种执行方式,其一是其于图形界面的guiMPIRun ,另一种是基于命令行的mpirun 。
a) 使用图形界面执行mpi 程序(如要在NTFS 分区上执行mpi 程序则只能采用这种方式)。
在[开始]—[程序]—[MPICH]—[mpd]中打开“mpirun ”,填入相应的可执行程序,选择需要启动的进程数,点击“Run ”按钮即可开始程序的执行,窗口下半部分是相应的输入输出信息。
mpi配置与
登录注册mpi配置以及lammps并行安装Mpi配置与安装MPICH2是MPI(Message-Passing Interface)的一个应用实现,支持最新的MPI-2接口标准,是用于并行运算的工具,在程序设计语言上支持C/C++和Fortran。
最近因为有项目需要的计算量比较大,所以就学习使用了M PICH2,在此根据网络上查询的相关信息和我自己的实际使用经历,分别总结一下M PICH2在window s和linux下基本的安装使用方法。
软件下载MPICH2的主页是/mpi/mpich2/index.htm,在这个页面上就能找到各平台最新版本MPICH2的下载地址,其中还包括源代码,我在开始作这个项目的时候最新版本是windows版mpic h2-1.0.5p2,源代码mpic h2-1.0.5p4。
我们的项目是一个C entOS版linux下的程序,所以最终是要在linux下运行的,但是又舍不得windows,于是就打算可能的话就在windows下写程序,用M inGW加windows版的MPICH2编译调试,通过后再到wmware虚拟机组成的简单集群作测试。
所以,为避免不必要的麻烦,就要统一一下windows和linux下的MPICH2版本,而且不打算用最新的,因此决定用mpic h2-1.0.5版。
但是,如果在主页上找的话是没有以前旧版本下载的链接的(至少我没找到),只有最新版本的http和ftp下载。
这难不住我等有心之人,既然提供了ftp 下载,那咱就直接到他ftp服务器上找,最新源代码链接的地址是ftp:///pub/mpi/mpich2-1.0.5p4.tar.gz,把后面文件名去掉就应该是文件的ftp存放路径,把这个路径直接写到浏览器地址栏里回车(偶用的是FireFox2),就能看到他们服务器上这个目录的文件列表,里面就有1.0.5版的windows安装文件和源代码包,分别为ftp:///pub/mpi/mpich2-1.0.5-win32-ia32.msi 和ftp:///pub/mpi/mpich2-1.0.5.tar.gz。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
MPI_Init (*argc,*argv);//初始化MPI环境
MPI_Comm_size (comm,*size);//返回同组内进程数
MPI_Comm_rank (comm,*rank);//返回该进程在组内的进程号,从0开始
MPI_Send(buf,count,datatype,dest,tag,comm);
将结果exe程序拷贝到MPICH2\bin目录下,运行mpiexec程序,在Application内添加要我们运行的exe程序。选择进程数目,然后Execute,就会显示多个进程的执行情况。
MPICH
MPI过程就好像一个几步的过程调用,通过初始化,设置进程数,运行进程,进程间发送和接受消息,结束这些步骤来完成。
}
MPI_Bcast(&n,1,MPI_INT,0,MPI_COMM_WORLD);
h=1.0/(double) n;
sum=0.0;
for(i=myid+1;i<=n;i+=numprocs)
{
x=h*((double)i-0.5);
sum+=f(x);
}
mypi=h*sum;
if (m2-1.3.2p1-win-ia32.msi,填写passphrase,默认为behappy,选择默认路径安装。
运行wmpiregister,注册当前的管理员用户。
使用建立和编译MPI程序:新建一个项目,设置项目属性,将MPICH2\lib目录添加到C++连接的library path内,将MPICH2\include目录添加到C++链接的Include Path内,在程序属性的链接器->命令行中添加mpi.lib,编译和生成程序。
MPI_Get_processor_name(processor_name,&namelen);
fprintf(stdout,"Process %d of %d on % s\n",myid,numprocs,
processor_name);
if (myid==0)
{
n=10000;
startwtime=MPI_Wtime();
MPI_Send(&mypi,1,MPI_DOUBLE,0,myid,MPI_COMM_WORLD);
else
{
pi=0.0;
pi=pi+mypi;
for (j=1;j<numprocs;j++)
{
MPI_Recv(&mypi,1,MPI_DOUBLE,MPI_ANY_SOURCE,
MPI_ANY_TAG,MPI_COMM_WORLD,&status);
//向目标进程发送buf内的count个datatype数据
MPI_Recv(buf,count,datatype,source,comm,status);//接收消息
MPI_Finalize ();//结束
MPI
#include"mpi.h"
#include<stdio.h>
#include<math.h>
double f(double x) {
return(4.0/(1.0+x*x));
}
int main (int argc,char * argv[])
{
int done =0,n,myid,numprocs,i;
double PI25DT=3.141592653589793238462643;
double mypi,pi,h,sum,x;
fflush(stdout);
}
MPI_Finalize();
}
pi=pi+mypi;
}
printf(“pi is approximately %.16f,Error is %.16f\n”,
pi,fabs(pi-PI25DT));
endwtime=MPI_Wtime();
printf(“wall clock time=% f\n”,endwtime-startwtime);
double startwtime=0.0,endwtime;
int namelen;
char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
MPI_Init(&argc,&argv);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numprocs);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid);