《微生物分类》PPT课件

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二.种的定义
种又称物种，是微生物分类学最基本的分类单位。但是至今， 关于种的概念还没有形成一个统一的定义，争论较大。
一般认为：微生物的种是一个基本的分类单位，是一群表型特 征高度相似、亲源关系极其相近、与同属内的其他种有着明显差异 的菌株的总称。
在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作它的具体
(根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程)
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主要以细菌为例介绍微生物分类、命名和鉴定的有关知识
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第一节 分类单元
一.微生物分类单元及等级
界 门 纲
目
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科
属 种
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根据Carl Woese的理论， 现在还在界之上使用
域(domain)
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（把全部生物先分为 古生菌域、细菌域和 真核生物域，域下面 再分界。）
第十一章 微生物的分类鉴定
教学内容 1.了解分类的单元 2.掌握微生物的命名方法 3.了解微生物的分类系统 4.了解微生物的鉴定
分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：
分类、
命名、 鉴定
分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似 性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似 性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进 行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。
Escherichia coli K12
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第二节 微生物的命名方法
微生物名称分为两类：
1）区域性的俗名；是一个国家或地区使用的普通名称，如结 核杆菌（结核分枝杆菌）、红色面包霉（粗糙脉孢霉）；具有大众 化和简明等优点，但不便于国际间的交流。
2）学名；是某一菌种的科学名称，是按“国际命名法规”命 名并受国际学术界公认的通用正式名称。
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菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。由于同种 或同一亚种的不同菌株之间，某些生物学特性可能存在一定差异， 如一些生化性状、代谢产物的产量性状等。因此在实际工作中，除 了注意菌株的种名外，还要注意菌株的名称。
菌株的名称可随意确定，一般都放在学名（即只有属名和种的 加词者）的后面，可随意用字母加编号表示，如：
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通式：学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现在定名人+定名年份
例:(1)枯草芽孢杆菌
Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872 例如:(2)大肠杆菌
Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 例:(3)金黄色葡萄球菌
当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗 传性状又不足以区分为新种时，可将这些菌株细分为两个或更多的 小的分类单元--亚种。
亚种是微生物分类中具有正式分类地位的最低等级。 亚种是在种的加词后写上“subsp.”，再写上具体的亚种的加 词。
蜡状芽孢杆菌亚种：Bacill编u辑spptcereus subsp.mycoides 8
3.中国科学院王大耜的细菌分类系统（1981）
4.美国的伯杰氏细菌分类系统
伯杰氏细菌分类系统第一版1923年出版，至今已修订出版了11 个版本，1984-89年出版的4卷本“伯杰氏系统细菌学手册”（简称 系统手册）是目前国际上最为流行的实用版本。
Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
பைடு நூலகம்
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二.三名法
当某种微生物是一个亚种或变种时，学名应按三名法拼写：
通式：学名=属名+种名加词+符号subsp或var+亚种或变种的加词
符号subsp或var排正体，可省；亚种或变种的加词排斜体，不可省。
例:(1)苏云金芽孢杆菌蜡螟变种 Bacillus thuringiensis (subsp) galleria
(根据现有数据建立系统的过程)
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命名(nomenclature)：根据命名法规，给每一个分类群 一个专有的名称；
(分类系统建立过程中的步骤之一)
鉴定(identification或determination)：借助于现有 的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新 发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的 过程。
代表，故此典型菌株成了该种的模式种，如产黄青霉Penicillium chrysogenum NRRL-Q176。
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三.种以下的分类单元
为了使用方便，在种以下人们又提出了许多分类单元，这些分 类单元不是正式的分类单位，因此，也没有得到国际公认。
1.亚种(Subspecies，subsp.,ssp.)
(2)酿酒酵母椭圆变种 Saccharomyces cerevisiae (var) ellipsoideus
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第三节 微生物的分类系统
一.原核生物的分类系统 二.菌物分类系统
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一.原核生物的分类系统
1.前苏联克拉西尼科夫的“细菌与放线菌的鉴定”（1949）
2.法国普雷沃的“细菌分类学”（1961）
1）培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长 物。
如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。
2）菌株(strain)：菌株是指任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成 的纯种群体及其后代。
从自然界中分离到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微 生物的一个菌株；用实验方法(如通过诱变) 所获得的某一菌株的变 异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。
物种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组成。要求印刷为斜体， 或书写时在学名下划线。学名的表示方法有双名法和三名法两种。
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一.双名法
双名法是指一个种的学名由属名和种的加词两部分组成。
属名的词首须大写，种名加词的字首须小写。
出现在分类学文献中的学名，在两部分之后还应加写3项内容 （均排正体字），即首次定名人（用括号括住）、现名定名人和现 名的定名年份。如在一般书刊中出现时可省后3项。
2.变种(Variety,var.)
变种是亚种的同义词，因易引起混乱，故《国际细菌命名法规》 (1975)已规定它在命名法中没有地位，且不主张使用。
3.型(Form)
是亚种以下的分类单位，仅作若干变异型的后辍。
常见的有生物变异型、形态变异型、血清变异型、致病变异型、 噬菌体变异型等。
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4.常用的细菌分类学术语：