纤维素酶分子结构及作用机理的研究进展
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期 内 仅 对 纤 维 素 酶 的 结 构 域 进 行 拆 分 。 1986 年 Tilbeurgh[2]用 木 瓜 蛋 白 酶 有 限 酶 切 里 氏 木 霉(T.reesei)的 纤维二糖水解酶, 即外切酶分子, 得到两个具有独 立活性的结构域: 一个具有催化功能的结构域 (Catalytic domain, CD), 另 一 个 是 具 有 结 合 纤 维 素 功 能的结构域(Cellulose binding domain, CBD), 两者之 间由一段高度糖基化的linker相连[3- 4]。整 个分子呈 楔 形, 球状核区表示包含催化位点和底物结合位点的 CD区[5]。
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纤 维 素(Cellulose)是 植 物 细 胞 壁 的 主 要 组 分 之 一 , 占 植 物 秸 秆 干 质 量 的40%~50%。它 对 增 强 细 胞 壁 的 机械支撑强度、维持不透水性以及抗逆性有重要的 功 能 作 用 [1]。 纤 维 素 酶 (Cellulase)是 降 解 纤 维 素 的 一 组 酶系的总称, 而纤维素是地球上数量最大但又未得 到充分利用的一类多糖, 微生物对它的降解、转化 是自然界碳素循环的主要环节。近年来随着对纤维 素酶研究的深入, 以及越来越多的性质不同的纤维 素酶的发现, 使得纤维素酶的应用日益广泛。但是 由于对纤维素酶的结构、功能特别是降解纤维素的 作用机制还缺乏足够的了解, 使得对纤维素酶的研 究和高效应用存在很大的局限。由于分子生物学技 术的兴起, 使得人们能在基因水平上对纤维素酶类 多样性的进化起源有了更进一步的研究。
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大多数纤维素酶都是这样, 只有少数微生物和 高 等 植 物 产 生 的 纤 维 素 酶 不 具 有 这 类 结 构 域 , 如T. reesei的 CBHI 就 没 有 CBD结 构 域 。 通 常 认 为 CBD对 高 效降 解纤维素起到关键的作 用, 但T.reesei的CBHI在 没 有CBD的 情 况 下 仍 具 有 水 解 纤 维 素 的 活 性 , 在 T. reesei的EG1的 酶 解 过 程 中 也 观 察 到 同 样 的 现 象 。 此 外 , Humicola insolens 的 EG5 和 Cellulomonnas fimi 的 CenEG都并未发现具有CBD结构, 但仍然具有水解酶 活性。这些实验证明, 在有些外切和内切酶中CBD对 酶 的 催 化 活 力 是 非 必 需 的[6]。 2.1 催化域的结构(Catalytic domain, CD)
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12 No. 7. 2007
专题论述
(1.Colle ge of Food S cie nce , S outhwe s t Unive rs ity, Chongqing 400716; 2.Citrus Re s e a rch Ins titute , Chine s e Aca de my of Agriculture , Chongqing 400712)
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专题论述
纤维素酶分子结构及作用机理的 研究进展
刘树立1, 王 华2*, 王春艳1, 盛占武1 (1.西南大学食品科学学院, 重庆 400716; 2.中国农业科学院柑橘研究所, 重庆 400712)
摘要: 纤维素是自然界中存在最广泛的一类碳水化合物, 同时它也是地球上数量最大的可再生资源。
利用微生物生产的纤维素酶将其转化为人类急需的能源、食物和化工原料, 对于人类社会解决环境污
染、食物短缺和能源危机具有重大的现实意义。综述了纤维素酶的分子结构、作用机理的研究进展。
关键词: 纤维素; 纤维素酶; 分子结构; 作用机理
中图分类号: TS201
文献标识码: B
文章编号: 1005- 9989(2007)07- 0012- 04
P rogre s s of the mole cula r s tructure a nd me cha nim a bout ce llula s e
目前已经 被 阐 明 的 催 化 结 构 域 是T.reesei CBHⅡ 的催化域结构, 它是由α/β组成的筒状结构: 由5个α 螺 旋 和7条β链 组 成 , 活 性 部 位 由 两 个 延 伸 至 表 面 的 环(loop)以形成一个隧道状(tunnel)结构, 长度大约2nm, 包含4个结合位点, 水解糖苷键发生在第2和第3结合 位点之间; Thermomonosporafusca的EG2尽管和T.reesi CBHⅡ属于同一家族, 但在活性部位的组织结构却有 一点显著的不同, 它的活性位点表面没有一个由环 覆 盖 的 结 构 , 因 此 它 更 象 是 一 个 沟 槽(groove)而 不 是 一个 “隧道”[7]。所有属于EG家 族 的 环 结 构 都 缺 失 , 而属于CBH家族的正好相反, 都有一个环结构。普遍 认为, 正是由于CBH拥有这样一个环结构形成的 “隧 道”, 它能连续地催化几个糖苷键的断裂。
1 纤维素酶的作用类型[2]
纤维素酶由三类不同催化反应功能的酶组成, 根据其催化功能的不同可分为: ①内切葡萄糖苷酶 (endo- 1,4- β- D- glucanase, EC3.2.1.4, 来自真菌的简 称EG, 来 自 细 菌 的 简 称Cen), 该 类 酶 能 随 机 地 在 纤 维素分子内部降解β- 1,4糖 苷键; ②外切葡萄糖苷酶 (exo- 1,4- β- D- glucanase, EC3.2.1.91, 来自真菌的简 称CBH, 来自细菌的简称Cex), 它能从纤维素分子的 还原或非还原端切割糖苷键, 生成纤维二糖; ③纤 维 二 糖 酶(3- D- glucosidase, EC3.2.1.21, 简 称 BG), 它把纤维二糖降解成单个的葡萄糖分子。
只有在这三类酶的协同作用下, 最终才能把纤 维素分子降解成葡萄糖。微生物特别是真菌能产生 这类酶的复合物, 从而把纤维素分子降解为葡萄糖 分子为自己所利用。
2 纤维素酶的分子结构
对纤维素酶分子结构和功能的研究是从 20 世 纪 80 年代开始的, 由于 来 源 于 真 菌 的 纤 维 素 酶 大 多 是 糖蛋白, 难以得到完整纤维素酶晶体, 很长一段时
CD体现了催化 活 性 及 对 特 定 水 溶 性 底 物 的 特 异 性, 尽管不同来源纤维素酶的分子量大小差别很大, 但它们催化区的大小却基本一致。
LIU Shu- li1, WANG Hua2*, WANG Chun- yan1, SHENG Zhan- wu1
收稿日期: 2006- 12- 04
*通讯作者
作者简介: 刘树立(1981- ), 男, 硕士研究生, 研究方向为农产品加工与发酵研究。
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Abstr act: Cellulos e is the mos t abundant organic raw material in the world, and it is the only renewable re- s ource that is available in large quantities . S o it has great realis tic meaning for human being to s olve environ- ment pollution, food s hortage and energy cris is that us ing cellulas e produced by microorganis m trans form cellu- los e to energy, chemical material and food. It s ummarizes the progres s of the molecular s tructure and mecha- nis m about cellulas e in this paper. Key wor ds: cellulos e; cellulas e; molecular s tructure; mechanis m