简答题11

名词：

1．Degeneracy（简并性）：指密码子的第三个碱基上的变化不会改变它所代表的氨基酸。2．Discontinuous replication (不连续复制)：指DNA 以小片段(岗崎片段)合成然后连接起来。

3．Intron（内含子）：一段DNA片段，它转录但通过将其两端的序列(外显子)剪接在一起而被移出转录本。4．Nucleosome（核小体）：染色质的基本结构亚单位，由200bp DNA和组蛋白质八聚体组成。

5．Operon（操纵子）：细菌基因表达和调控的单位，包括结构基因和能被调控基因产物识别的DNA 控制元件。

6．Shine-Dalgarno sequence（S-D序列）:部分或所有细菌mRNA 上AUG 起始密码之前的AGGAGG序列，与16S rRNA上3’末端序列互补，在核糖体与mRNA结合中起作用。

7．Transcription（转录）：以DNA 模板合成RNA。

8．Coding strand（编码链）：与mRNA 有相同序列的DNA 链。

9．Denaturation of DNA (DNA变性）指它们从双链转变成单链状态，双链分开一般因加热产生。

10．Exon(外显子)：割裂基因中在成熟mRNA 产物中表达的任何片段。

11．Heterogeneous nuclear (hn) RNA不均一核RNA：由RNA聚合酶II产生的核基因转录产物。

12．Lagging strand of DNA DNA后随链：总体上沿着5’到3’方向延伸，但以小片段形式(5’-3’)不连续合成，最后共价连接起来。

13．Melting temperature解链温度：DNA 变性过程中温度范围的中值。

14．Nucleolar organizer核仁形成区：携带编码rRNA 基因的染色体区域。

15．Okazaki fragment冈崎片段：在非连续复制中产生的1000－2000bp 短片段，随后被连接成完整的共价链。16．Polyadenylation多聚腺苷磷酸化：真核RNA转录时，向其3’端加入一系列聚腺苷酸的过程。17．Attenuator弱化子：衰减发生处的一种内部终止子序列。

18．Promoter启动子：结合RNA 聚合酶并起始转录的DNA 区域

19．Renaturation复性：指DNA 双螺旋的两条互补单链重新结合。

20．RNA polymerase RNA聚合酶：使用DNA作为模板合成RNA的酶(正式应为DNA-依赖性RNA 聚合酶)。21．Semidiscontinuous replication复制：一条新链连续合成而另一条链不连续合成的模式。

22．Sigma factorσ 因子：起始必须的RNA聚合酶的一个亚基，主要影响RNA聚合酶结合位点(启动子)的选择。27．Sigma factor：起始必须的RNA聚合酶的一个亚基，主要影响RNA聚合酶结合位

点(启动子)的选择。

23．Splicing剪接：指内含子切除和外显子连接，因此内含子被剔除，而外显子剪接到一起。24．Terminator终止子：转录本后部所代表的DNA 序列，能够引起RNA 聚合酶终止转录。

25．Wobble hypothesis摆动假说：一个tRNA通过与密码子第三个碱基非寻常配对(不是GC，

AT)而识别不止一个密码子。

26．Southern blotting印迹法：指将变性DNA从琼脂糖凝胶转移到硝酸纤维膜从而与互补核算杂交的过程。36．Northern blotting：将琼脂糖凝胶上的RNA转移到硝酸纤维膜上从而能够与互补DNA 杂交的技术。28．Restriction Enzyme限制性内切酶：特异性识别短的DNA序列并且切割双链(在靶位点或别处，

因类型而异)。

29．PCR 聚合酶链式反应：指通过变性与引物退火，在DNA聚合酶作用下使DNA延伸的循环技术，能将目标DNA 序列数量扩增到106倍以上。

30．Okazaki fragment冈崎片段：在非连续复制中产生的1000－2000bp 短片段，随后被连接成完整的共价链。31．Enhancer强化子：是一个顺式作用序列，能够提高一些真核生物启动子的利用，并能够

在启动子任何方向以及任何位置(上游或者下游)作用。

32．Cap (帽)：是真核生物端的结构，在转录后通过末端5 GTP的磷酸基团和mRNA的末端碱基而引入。增加的G(有时是其它碱基)是甲基化的，产生了的结构。

33．Coding strand (编码链)：与mRNA 有相同序列的DNA 链。

34．Lariat (套索)：RNA 剪接过程中的中间结构，其中有由-键形成的带尾巴的环形结构。35．positive supercoiling正超螺旋：双链以两条链缠绕的方向形成的超螺旋。

37．Telomere端粒：是染色体的实际末端，DNA序列包括简单的重复单位以及突出的、可形

成发夹结构的单链末端。

38．Genetic code基因序列：DNA(或RNA)三联体与蛋白质中氨基酸的对应关系。

39．Consensus sequence共有序列：当许多实际序列比较时，每个位点上的碱基能够代表最常出现的碱基理想序列。

40．Replication fork复制叉：双螺旋DNA 两条亲本链分开使复制进行的部位。

问题：

1．Remember the major features of B-DNA . B型DNA的结构特征：

（1）、两条相互独立、反向平行、互补配对的单链DNA分子以螺旋方式相互缠绕，形成右手螺旋（2）、带有负电的戊糖-磷酸骨架在分子的外侧，碱基则堆积于螺旋的内部

（3）、双链间靠氢键相互作用形成碱基对，相邻碱基对之间相距0.34nm

（4）、碱基平面基本与螺旋轴垂直

（5）、螺旋轴穿过碱基对，大沟宽而略深，小沟窄而略浅

2．Describe the properties of nucleic acids(including chemical, physical, spectroscopic, thermal properties)核酸的物理、化学、光谱学、热力学性质

核酸的理化特征：

稳定性：核酸螺旋的稳定性是疏水作用和堆积在碱基对间的偶极矩作用的共同作用结果

酸效应：强酸条件下核酸可水解为碱基、糖和磷酸，中度的酸性可使嘌呤的糖苷键水解而产生脱嘌呤核酸。

碱效应：强碱条件下DNA和RNA因其碱基的互变异构态的改变以及特异氢键被破坏而变性。强碱条件下，RNA也易发生水解。

化学变性：某些化学试剂，如尿素和甲酰胺，在中性条件下能够破坏堆积于碱基间的疏水作用而使DNA 和RNA变性。

黏性：DNA分子很细长，因此其溶液具有较高的粘性。

浮力密度：DNA的密度约为1.7g/cm3，可以通过氯化铯密度梯度离心法加以分析和纯化。

核酸的光谱学和热力学特征：

紫外光吸收：核酸因含有共轭的苯环而吸收紫外光，核算中的芳香族碱基在260nm处具有最大光吸收。

减色性：由于碱基在疏水环境中的堆积造成双链DNA相对于单链DNA吸收值减少的现象称为减色效应。

核酸定量：A260/280比值可用于估计双链DNA样品的纯度。对于纯DNA该比值为1.8，若比值大于1.8，则意味着有RNA污染：若比值小于1.8则意味着有蛋白质污染。

热变性：升高温度可使DNA和RNA变性。

复性:降温可使DNA复性，但仅当这一过程进行的足够缓慢时才能使互补链退火而形成完全的非变性双链DNA.

3．Describe several reasons why the major groove have more information than the minor groove为什么大沟比小沟有更多信息，列出一些原因？

①大沟由碱基对糖苷键的广角（240°）的一侧形成的，它的宽度为2.2nm，而小沟是由窄角（120°）

的一侧形成，宽度仅有1.2nm，从大小来看，大沟就可比小沟容纳更多的信息

②大沟为蛋白质的结合处和基因的调控处，因而含有更多的信息

③大沟处的A-T,T-A,C-G,G-C的有关基因的分布各不相同，可以提供与蛋白质识别的丰富信息4．What is closed circular DNA, positive supercoiling and negative supercoiling.什么是闭环DNA、正超螺旋和负超螺旋？

①闭环DNA:自然条件下，DNA每条互补链自身的3’端和5’端连成环状，而且两条互补链之间螺旋

相互缠绕所形成的DNA结构

②正超螺旋：按DNA双螺旋相同方向缠绕而成的超螺旋称为正超螺旋

③负超螺旋：按DNA双螺旋相反方向缠绕而成的超螺旋成为负超螺旋

5．DNA in the cell is commonly negatively supercoiled, why?为什么细胞中的DNA中的通常是负超螺旋？