山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷与人血清白蛋白 相互作用的研究

毕业论文（设计）

题目:山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷与人血清白蛋白

相互作用的研究

姓名：何鑫

学号：P112014541

学院：化工学院

专业：制药工程

班级：2011级制药工程（1）班

指导老师：齐燕姣

2015年月日

目录

摘要 (3)

关键词 (3)

ABSTRACT (3)

1.前言 (4)

1.1黄酮类化合物的基本信息 (5)

1.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷简介 (5)

1.2.1山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷结构 (6)

1.2.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷基本结构解析和官能团鉴定 (6)

1.2.3山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷性状 (6)

1.3蛋白质的结构的基本信息 (7)

1.3.1蛋白质的一级结构（primary structure） (7)

1.3.2蛋白质的二级结构（secondary structure） (7)

1.3.2.1 α-螺旋结构（Alpha helix） (8)

1.3.2.2 β-折叠结构（Beta sheet） (8)

1.3.2.3 β-转角结构（Beta turn） (8)

1.3.2.4 无规则卷曲结构（random coil） (8)

1.3.3 蛋白质的三级结构（tertiary structure） (9)

1.3.4 蛋白质的四级结构 (9)

1.4人血清白蛋白分子（HSA）简介 (9)

1.4.1人血清白蛋白分子的基本结构 (9)

1.4.2人血清白蛋白分子的功能 (10)

1.4.3人血清白蛋白分子与药物结合位点 (11)

1.5分子对接简介 (11)

1.6 Sybyl软件简介 (12)

1.6.1 Sybyl/base模块 (12)

1.6.2 FlexX模块 (12)

1.6.3 Csore模块 (13)

2.实验部分 (13)

2.1蛋白质结构的处理 (13)

2.2配体小分子的处理 (15)

2.3山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与1H9Z初步分子对接 (15)

2.3.1山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子在HSA（1H9Z）中结合位点的分析 (16)

2.3.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与HSA结合位点氨基酸氢键相互作用力的分析

(18)

2.3.3对接结果采用Csore模块进行打分结果 (19)

2.4山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与1N5U初步分子对接 (20)

2.4.1山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子在HSA（1N5U）结合位点的分析 (21)

2.4.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与HSA结合位点氨基酸氢键相互作用力的分析

(22)

2.4.3对接结果采用Csore模块进行打分结果 (23)

2.5通过与不同复合物结构对接前后山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子构象 (23)

3.结果与讨论 (25)

4.展望 (27)

参考文献 (28)

山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷与人血清白蛋白分子相互作用的

研究

专业：制药工程姓名：何鑫指导教师：齐燕姣

摘要采用计算机虚拟筛选的方法，从人血清白蛋白分子复合物结构（1H9Z）（1N5U）出发，利用SYBYL-X 1.2软件进行分子对接研究，通过基于受体的药物设计的方法进行分子对接，Csore模块进行数据分析并且分析山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与人血清白蛋白分子对接的位置及相互作用，证实山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子能被人血清白蛋白分子储存和运输。本文的研究为药物的快速设计及避免许多繁重的试验过程提供了精确的理论依据，为进一步进行药物小分子的官能团的修饰和结构提供部分参考。

关键词人血清白蛋白分子山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子分子对接

ABSTRACT

Adopt the method of computer virtual screening, from human serum albumin (1 h9z) molecular composite structures (1 n5u), using SYBYL molecular docking studies - X 1.2 software, through the drug design method based on receptor molecular docking, Csore module for data analysis and analyze resurrectionlily phenol - 7 - O - alpha - L -

buckthorn indican molecular docking with human serum albumin molecules of position and interaction of confirmed resurrectionlily phenol - 7 - O - alpha - L - buckthorn indican can be human serum albumin molecules storage and transportation. In this paper, the research for drug testing process of the rapid design of and avoid many heavy provides the theoretical basis of the accurate drug molecules for further modification and structure of functional groups to provide some reference. Keywords:Human serum albumin molecules

Kaempfevol-7-O-α-L-rhamnoside Molecular docking

1.前言

中药作为我国的国粹，已经有5000多年的历史，但是由于其药物主要成分不明确，药物分子结构及作用机制不清晰，因此在国际上普遍得不到承认。近年来，随着分子生物学的不断发展，中药药理学的研究领域逐渐从传统经验传承模式转变成从细胞及分子水平研究其活性成分和药动学、药效学机理，这一研究对于更好地解析中药的有效成分和药理作用具有十分重要的意义。药物分子与生物活性大分子相互作用的研究一直是药理学、分子生物学、临床医学、药效学、天然药物化学等诸多领域研究的重点，其中又以药物小分子与蛋白质和核酸的研究最多[1-4]。药物小分子与蛋白质或者核酸结合就形成了复合物结构，这些复合物结构中表明了药物小分子与蛋白质或核酸相互作用的方式、亲和力的大小及对药物进行筛选的依据等。目前还没有得到山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷/HSA复合物结构，因此两者的作用