微生物的分类和鉴

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枯草芽孢杆菌
Bacillus subtilis (Ehrenberg)Cohn 1872 缩写:B.subtilis或Bac.subtilis Bacillus sp.表示尚未定种名的芽孢杆菌(芽孢杆菌 的某一种) Bacillus spp.表示一批尚未定名的芽孢杆菌(若干芽 孢杆菌)
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微生物分类学的新手段
分子生物学 微生物基因组学:以基因组为基础进行分类 新种(Species nova,sp.nov或nov sp.)
指权威性的分类鉴定手册中从未记载过的 一种新分离并鉴定过的微生物
Corynebacterium pekinese sp.nov AS 1.299 北京棒杆菌AS 1.299新种
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“三名法”-亚种或变种命名
Trinom inalnom enclature
属名+种名加词+(subsp.或var.)+亚种(变种) 加词
实例
1.苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种
Bacillus thuringiensis subsp. Galleria 2.酿酒酵母椭圆变种 Saccharom yces cerevisiae(Var)ellipsoideus 3.卵形脆弱拟杆菌
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种的概念
种:最基本的分类单位; 微生物种的定义的不明确性
种的性状(可交配标准、形态学) 分类的大起大落变化 微生物的遗传本质和分子进化 分类人的思想倾向、技术条件,研究条件 的重要性
种的概念 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
学名(Scientific Name, Scientific nomenclature) 菌种的科学名称,是按照“国际命名法规”进命名 并受国际学术界公认的通用正式名称,由拉丁词或 拉丁化的词组成 林奈的“双名法” Binomial nomenclature 三名法 学名的其他只是一个微生物学工作者必须牢记常 用常见的微生物学名
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双名法Binominal Nomenclature
学名 属名:首字母大写,斜体字 种名加词:小写,斜体字
(首次定名人):正体字,用括号扩住 现在定名人:正体字 定名年份
实例
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双名法的实例
大肠埃希氏菌
Escherichia coli (Migula)Castellaniet chalmers 1919
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内容
第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 二、学名 三、几个概念
第二节 微生物在生物界的地位 一、生物的界级分类学说 二、三域学说及其发展
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内容
第三节 各大类微生物的分类系统纲要 一、Bergey氏原核生物分类系统纲要 二、Ainsworth等人的菌物分类系统纲要
第四节 微生物分类的鉴定的方法 一、经典分类鉴定方法 二、现代分类鉴定方法
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几个数字
生物种数:150余万种 微生物种数:15万-20万(已记载的)
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微生物分类学 Microbial Taxonomy
生物分类学
一门按生物的亲缘关系把它们分门别类的排成各 种分类单元或分类群的科学。
种(Species)
基本分类单位,指一群在形态、生理方面彼此非常 相似或性状差别微小的个体。或是一群表型特征高 度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种有着 明显差异的菌株的总称
菌株(Strain)
某条件、地区分离到具体菌株。它是由一独立分离 的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代, 典型菌株(TypeStrain),模式株(TypeSpecies) 实例:Bifidoboacterium bifidum ATCC 29521
Corynebacterium crenatum sp.nov AS 1.542 钝齿棒杆菌的 AS 1.542新种
种的分类地位举例 资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
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二、微生物的学名
俗名(Common name,Vernacular name) 结核杆菌:结核分枝杆菌 红色面包霉:粗糙脉胞菌
双名法的实例
➢Mycobacterium tuberculosis (Zopf) Lehmannet Newmann 1896
➢Clostridium acetobutylicum McCoy,Fred, peterson et Hastings 1926
➢Bifidobacterium bifidum (Tissier)OrlaJensen 1923
命名(Nomenclature):是按照国际命名 法规给予有机体一个科学的名称
鉴定(Identification):是指确定一个新分 离物是否归属于某个已命名的分类单元的 过程。
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第一章 通用分类单元
分类的级别
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一、种以上的系统分类单元
七级分类单元(Taxon,Taxa,Category) 界(Kingdom) 门(Phylum) 纲(Class) 目(Order) 科(Family) 属(Genus) 种(Species)
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以啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是: 真菌门Eumycophyta 子囊菌纲Ascomycetes 内孢霉目Endomycetales 内孢霉科E.domcetaceae 酵母属Saccharomyces 啤酒酵母S.Cerevisiae Hansen
分类学任务 分类:宏观的战略工作 鉴定:微观的战术行工作 命名:开拓性的创新工作
微生物分类学的发展
经典分类学 微生物系统学(Microbial Systematics)
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微生物分类学 Microbial Taxonomy
分类(Classification):是指根据相似性或 亲缘关系,将一个有机体放在一个单元中
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