生物信息学 蛋白库查询

1、对该段序列进行同源性搜索

首先进入www.espasy.ory点击进入Resources A..Z 点击如下图

点击BLAST 输入蛋白质序列

搜索得到同源性分析如下3图示：Score分值越大，相似性越高。E值越小，匹配度越好。所以蛋白序列应与p04626相似性高匹配度好

二、对该段序列进行基本性质分析：蛋白质的氨基酸组成、等电点、相对分子质量、亲水性、疏水性、消光系数、信号肽、跨膜区域等。

氨基酸组成

等电点、相对分子质量

消光系数

亲水性、疏水性

打开/protscale

如下图（网速慢，读图等好久都读不出来）

TMPred 跨膜区结构预测，打开/software/TMPRED_form.html输入已知序列

三、分析该段序列的MOTIF

四、对该段序列进行三维结构的分析选择符合条件的一个同源建模

5、分析该序列所代表蛋白的修饰情况、所参与的代谢途径、相互作用的蛋白，以及与疾病的相关性。

蛋白质的修饰后翻译

蛋白质的相互作用

所参与的代谢途径，相关疾病