Epi Info系统概述使用指南
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Epi Info系统概述
EPI INFO
A Database, and Statistics Program for Public
Health Professionals
公共卫生专业的数据库与高级统计分析软件。
特别适用于流行病学调查表资料、临床试验数据的处理与统计分析。
Epi Info Version 6简介
Epi Info Version 6是由WHO与美国疾病控制中心(CDC)共同推出的Epi Info 第6版(The first version of Epi Info was released in 1985)。
适于用调查表形式处理流行病学的数据。
Epi Info Version 6既是一个字处理器又是一个数据库软件,更是一个好用的统计软件包。
Epi Info以问卷式录入数据,可对录入字段的性质、范围和逻辑关系作限定以减少录入差错,其二次录入功能也适用于临床观察数据的录入。
软件可直接地用dBASE数据库,统计功能包括:t检验、方差分析、线性相关与回归分析、秩和检验、CHI-SQUARE检验、Ridit 分析、多元回归分析等。
Epi Info Version 6采用菜单的形式,使用十分方便。
没有硬盘的用户可以在软盘上使用。
Epi Info Version 6的各个模块既可以组合成一个整体使用,又可单个模块使用。
Epi Info Version 6占用的磁盘空间较少但功能齐全。
由于其高度实用,Epi Info Version 6自发布以来,在世界各国得到广泛的使用。
令人欣喜的是这套免费软件鼓励用户自由复制,用户得此软件,参考软件包自带的完整的电子手册,根据程序中提示,最快几分钟就会使用此软件了。
Epi Info Version 5(1988年推出)在117 个国家得到广泛使用,并出版了11种非英文的Version 5 of Epi Info。
该软件的第六版
源程序达8.9megabytes,其中包括全部的tutorials, examples及
utilities, 但主程序仅约占3megabytes。
其近况如下:
Epi Info Version 6 版本信息
--------------------------------------------
Version 6.00 released May 27, 1994
Version 6.01 released August 22, 1994
Version 6.02 released October 05, 1994
Version 6.03 released January 29, 1996
Version 6.04 released May 28, 1996
Version 6.04a released June 1996
Version 6.04b released October 1997
--------------------------------------------- Version 6.04b增加了处理Y2K的程序。
关于技术支持:CDC提供了有关Epi Info的热线。
Phone (404) 728-0545 FAX (404) 315-6440
E-mail EpiInfo@
Epi Info Version 6 Web 向导
访问全球广域网,可以下载更多的有关Epi Info Version 6统计使用指南。
可从WHO 网页或美国CDC的网页上下载这套软件及详细的使用手册及实例。
世界卫生组织的网页地址是:htpp:\\\,美国疾病控制中心的网页详细地址如下:
INTERNET INFORMATION
Epi Info and Epi Map (most recent version of each) are available
on the worldwide Internet using the following access information:
Site: ; UserID: anonymous; Password: logon id
Directory for Epi Info: /pub/software/epi/epiinfo
Directory for Epi Map: /pub/software/epi/epimap
The compressed files occupy 3-4 megabytes for each product.
Files:
EPI604_1.EXE About 1.2 megabytes
EPI604_2.EXE About 1.4 megabytes
EPI604_3.EXE About 1 megabyte
Epi Info Version 6系统的安装
从下载 EPI604_1.EXE(1.2 megabytes)、EPI604_2.EXE(1.4 megabytes)、EPI604_3.EXE(1 megabyte),将三个文件复制到临时子目录,如c:\EITEMP;然后执行这三个自动解压缩文件,此后产生许多文件,其中包括INSTALL.EXE。
运行INSTALL以便安装EpiInfo,请使用窗口中(I)nstall option,安装时的缺省目录为\EPI6 及\NETSS 。
统计计算器(Statistical Calculators)
STATCALC and EPITABLE
EpiInf经典实例介绍:用统计计算器STA TCALC计算卡方值。
四格表或行列表的计算Tables (2-by-2 to 2-by-10) ,请看实例子:
表-A两组大白鼠发癌率的比较
───────────────────
组别例数发癌数未发癌数
───────────────────
治疗组71 52 19
对照组42 39 3
───────────────────
X2=6.48 P=0.847
两组大白鼠发癌率的比较比较,差异有显著性意义。
计算方法:从EPI6主菜单运行STATCALC。
选择"Tables" 后按回车键<Enter>,如图2-7所示。
图2-7
选择Tables功能后,屏幕显示如图2-8。
屏幕上有四个格子,可进行2 2表分析,将相应的数据键入就行了。
注意,第一列为患病Disease(+),第二列为未患病Disease(-),行是暴露因素,有表示为Exposure(+),无表示为Exposure(-)。
输入一个数字后,按回键为认
可。
图2-8
现在我们将例子中的数据输入四个格子,如图2-9窗口中所示。
图2-9
计算:<F4>是进行计算的键。
在四个格子内输入数据后,按<F4>键,即可得到分析结果。
软件提供的卡方有非校正卡方(Uncorrected Chi-Squares),M-H卡方,以及校正卡方(Yates correcte Chi-Squares)。
本例取Uncorrected Chi-Squares=6.48,P值(P-values)=0.0109238。
屏幕上提示:按<Enter>继续,按<F10>完成。
见图2-10窗口。
图2-10
计算校正卡方
我们将下面的例子计算校正卡方。
表-B 穿新旧两种防护服工人的皮炎患病的的比较
─────────────────────────
组别例数阳性数阴性数
─────────────────────────
新 15 1 14
旧 28 3 7
─────────────────────────
X2=2.94 P=0.0865334
两组大白鼠发癌率的比较比较,差异无显著性意义。
首先输入数据,如图2-11所示。
图2-11
输入完数据后,按<F4>键,获得分析结果,如图2-12所示。
除了提供的卡方有非校正卡方(Uncorrected Chi-Squares),M-H卡方,以及校正卡方(Yates correcte Chi-Squares)外,程序自动算出单、双侧的精确概率值(Fisher exact)。
本例取校正卡方Yates correcte Chi-Squares =2.94,P=0.0865334。
亦可采用Fisher exact 2-tailed P-value:0.0648706。
按<F10>键完成。
图2-12
我们将下面的例子计算精确概率。
表-C 两型慢性布氏病的PHA皮试反应的比较
─────────────────────────
组别例数阳性数阴性数
─────────────────────────
活动型 15 1 14
稳定型 10 3 7
─────────────────────────
P=0.2668
两组大白鼠发癌率的比较比较,差异无显著性意义。
首先输入数据,输入完数据后,按<F4>键,获取分析结果。
如图2-13所示。
统计量有非校正卡方(Uncorrected Chi-Squares),M-H卡方,以及校正卡方(Yates correcte Chi-Squares),单、双侧的精确概率值(Fisher exact)。
本例取Fisher exact 2-tailed P-value: 0.2667984。
按<F10>键完成。
图2-13
用STATCALC计算3-by-2 tables卡方
表-D 三个地区花生黄曲霉素B1污染率的比较
─────────────────────────
组别例数污染数未污染数
─────────────────────────
甲 29 23 6
乙 44 14 30
丙 11 3 8
─────────────────────────
X2=17.91 P=0.00012931
录入数据,如图2-14及图2-15窗口中所示。
图2-14
图2-15
输入完数据后,按<F4>键,获取分析结果。
如图2-16所示。
卡方Chi-Squares=17.91,P-Value=0.00012931。
图2-16
按<F10>键结束。
返回主菜单。
STATCALC 计算2-by-3 tables卡方
表-E 某地两组松毛虫病患者型别构成的比较
────────────────────────────
组别例数皮炎型骨关节型软组织炎型混合型
────────────────────────────
儿童 188 50 48 18 72
成人145 105 10 7 23
────────────────────────────
X2=70.14 P=0.0000000
输入数据,如图2-17窗口所示。
图2-17 继续录入数据,如图2-18窗口所示。
图2-18 计算结果如图2-19窗口所示。
图2-19
EPITABLE的使用方法
EPITABLE是由Denis Coulombier编制完成。
Epi Info 的早期版本没有这个模块。
这组程序中的help file 备有详细的使用方法。
按 <F1>键可查阅此文件。
这组程序比STATCALC功能更强,更多。
最适于总结性资料(summary data entered on the computer screen)的统计分析。
STATCALC与EpiTable被称为流行病学统计计算器(epidemiologic calculator )。
STATCALC包含的功能EpiTable内都有。
这两个统计计算器非常方便地用于流行病学、临床科研、新药研究的统计分析,有利于流行病的直观教学。
列联表资料的卡方检验
我们用下面的例子计算卡方。
表-RC1 不同期次矽肺患者肺门密度级别分布
矽肺期次例数肺门密度I级 II级 III级
──────────────────────
I期 245 43 188 14
II期 169 1 96 72
III期78 6 17 55
X2=163.01 P=0.0000
两组肺门密度与矽肺期次有关。
统计学差异有显著性意义。
从EPI6主菜单运行EPITABLE。
选择"EPITABLE Calculator" 后按回车键<Enter>,如图2-28窗口所示。
图2-28
如图2-29窗口所示,进入“Compare”菜单,选择“r x c data table”命令。
以进行列联表卡方检验。
图2-29
在“Chi square”卡方检验对话框内选择所需的行列数。
点击“OK”按钮。
图2-30
在图2-31所示的窗口中的表格内输入上表中的数据。
数据录入完毕后鼠标点击“Calculate”按钮。
图2-31
下图窗口显示出计算结果。
X2=163.01,P=0.0000。
图2-32
单向有序R C列联表资料的Ridit分析
医学研究中有大量的数据属等级资料。
分析此类资料,不可以用行列卡方处理,而用Ridit(relative to an identified distribution unit)分析法来处理比较合适。
以下说明Z值(又
叫U值)的精确计算方法的调用过程。
我们用下面的例子计算Ridit分析的mean ridit及Z 值。
表-ridit1 复方江剪刀草合剂与胆麻片治疗效果比较
───────────────────────────
组别总例数无效好转显效控制
───────────────────────────
江剪刀草3300 760 1870 670 30
胆麻片 94 9 51 21 13
───────────────────────────
Z=2.421 P=0.015
胆麻片组平均Ridit=0.624,大于复方江剪刀草合剂,统计学差异有显著性意义。
从EPI6主菜单运行EPITABLE。
选择"EPITABLE Calculator" 后按回车键<Enter>,进入“Compare”菜单,选择“Trend Ordered data (Rdit)”命令。
以进行Rdit分析。
如图2-29窗口中所示。
在如下所示的“Trend Ordered data (Rdit)”话框内选择并确定等级数。
点击“OK”按钮。
如图2-33窗口所示。
图2-33
输入数据。
在“Reference”列内输入标准组数据,即复方江剪刀草合剂的疗效数据,在“Comparison”列内输入比较组数据,即即胆麻片合剂的疗效数据。
点击“Calculate”按钮完成计算,结果显示,Mean ridit=0.624,z=2.421,p value=0.015。
图2-34
Epi Info™ 2000简介(最新版本为Epi Info™ 2004,2004年发布)Epi Info 2000运行在Windows 95, 98, NT, and 2000等操作系统。
其程序仍兼容以前DOS版的Epi Info数据文件。
功能上有很大的扩充。
Epi Info 源程序用Visual Basic, V ersion 6重新编写。
Epi Info 2000 Version 1.0.x于2000年8月3日首发,2000年8月29日发行修改后的版本。
Epi Info 2000中的MULTLR 与KMSURV 程程序内可进行logistic regression 与Kaplan-Meier survival analysis 。
Epi Info 2000可与Epi Map 200配套使用,功能全面,强大。
难得的是,这么一个强大的数据处理与统计分析软件包仍可免费使用,用户可随意COPY,可从INTERNET上下载。
Epi Info 2000源程序经压缩处理后仍有41.7M (文件名:All in 1.zip),有二种方式下载。
如下图所示,用户可选其中一种方式。
用户拨号上网或专线上网后,在INTERNET EXPLORER的地址内输入/epiinfo。
如图2-35窗口所示。
图2-35
用户可选用下载Epi Info 2000或下载Epi Info 6。
图2-36
图2-36
点击“Epi Info 2000”下的“Downloads”,出现如下图窗口所示界面。
图2-37。