Materials Studio Linux 集群安装手册(比较详细)
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Materials Studio Linux集群安装手册
一、安装Linux操作系统,进行系统配置
一般都建议最小化安装,不用安装图形界面。下面我以red hat enterprise linux 6.0 x86-64在AMD Athlon(tm)64 X2 Dual Core Processor 4400+ 电脑上的安装为例。rhel6.0的安装过程和windows差不多,一路下一步(或Next)基本就ok了,在您要进行哪种类型的安装?你如果是第一次安装,是新硬盘的话可以选使用所有空间,并勾选下边的查看并修改分区布局,然后下一步,你可以看下大概的分区情况,在Red Hat Enterprise Linux 的默认安装是基本服务器安装。如果对Linux不太熟的话,最好选择软件开发工作站(或Software Development Workstation),这样基本上把要用的软件都安装上了,然后再选上下边的现在自定义(或 Customize now),再下一步,然后把所有能选上的软件都选上,再一路下一步。安装完以后,创建一个非root用户,比如创建一个msi用户,root和msi用户密码设的简单一些比较好,别一会儿你自己都忘了,我是root和msi用的一个密码,当然将来你自己真正组建集群用于计算的时候再设置复杂一些,这样课题提高系统的安全性。
gcc
glibc-2.3.4-2.43 (32-bit and 64-bit)
libgcc-3.4.6-11 (32-bit and 64-bit)
libstdc++-33-3.4.6-11 (32-bit and 64-bit)
compat-libstdc++-33-3.2.3-47.3 (32-bit)
hpmpi-2.03.01.00-20090402r.x86_64
这几个补丁,好像除了hpmpi-2.03.01.00-20090402r.x86_64和
libstdc++-33-3.4.6-11 (32-bit)没有装上之外,别的都给你装好了。这里要说的是,这些补丁每个节点都要装,千万记住。你可以用命令: rpm -qa|grep gcc 查询,当然你要查libstdc++就要用命令:rpm -qa|grep libstdc++了。对于hpmpi-2.03.01.00-20090402r.x86_64和libstdc++-33-3.4.6-11 (32-bit)的安装可以用命令rpm安装,首先切换到这两个软件包所在的目录下,执行下列命令,格式如下:
rpm -ivh libstdc++-33-3.4.6-11.i386.rpm
rpm -ivh hpmpi-2.03.01.00-20090402r.x86_64.rpm
注意,这里都是在root 用户执行的操作,
二. 为msi 用户添加sudo 命令使用权限,运行命令 su root ,输入root 用户的登录密码后,使用vi 命令进行下面的修改: 在root 权限下,运行命令:vi /etc/sudoers
#在root ALL=(ALL) ALL 这一行下面添加一行msi ALL=(ALL) ALL 然后运行命令::wq !
#在命令模式下,强制执行存盘退出操作
注:修改后,则成功添加msi 用户使用sudo 命令的权限,在往后的安装中可方便进行提权操作。
三. 于各节点安装HP-MPI ,安装方法:
a. 挂载MS 安装光盘,对应系统版本进入下列相应目录进行安装,下面是版本信息:
1 2 3 :UNIX/Linux/hpmpi/ for older IA32 Linux
:UNIX/Linux_x86_64/hpmpi/ for IA32 Linux systems with x86_64
:UNIX/Linux_IA64/hpmpi/ for IA64 Linux.
b. 安装时需要使用root 用户进行安装,终端运行su root 后输入密码登录为root ,使用下面安装命令:
1 :rpm -ivh /UNIX/Linux_x86_64/hpmpi/hpmpi-2.03.01.00-20090402r.x86_64.rpm c. 安装后出现下面提示即成功安装
四.查看各节点网络状态,修改主机名
可以使用ifconfig命令,查看各个节点的网络状态。rhel6.0开机后网络是处于禁用状态,要激活网络接口,可以使用命令:ifcf g eth0 start或ifup eth0。一般情况下rhel6.0在安装的过程中都可以认出主机的网卡,如果由于网卡太新没有认出来,那就需要到网卡官方网站下载Linux网卡驱动程序进行安装了,网上教程很多很容易掌握。使用hostname指令设置主机名。在命令行中输入下面的命令:hostname msinode1
注意:使用hostname指令设置的主机名称仅在系统重新启动前起效,重启系统后将使用原来的主机名称。如果希望启动系统后生效,则需要修改文件“/etc/hosts”。
五. 配置SSH免认证登录,配置过程:
a. SSH免认证登录的配置:
i. 测试是否已经安装SSH,于终端(Terminal)中输入ssh local host后回车,若出现下面提示:
则表示已经安装SSH。若提示失败,则需要放入安装光盘进行安装。
ii. 于终端中输入ssh-keygen -t rsa,此时它会提示你生成SSH的密钥。
iii. 此时无须设置密码,你只需要点击回车就可以了,生成的公钥和私钥会保存~/.ssh/目录下。
iv. 进入目录~/.ssh/(命令:cd ~/.ssh/),运行命令:
1 :cp id_rsa.pub authorized_keys,将公钥进行复制。
v. 同样地,在其他节点上运行上面的命令,将各节点中得到的autho rized_key中的内容复制出来,汇总到一个文件中,命名为authorized _key,并放置于各节点的~/.ssh/目录下(覆盖原有文件)。
#可以在xp下使用WinSCP软件进行管理,就像处理word文档一样复制粘贴就行了,每个节点的authorized_key内容在汇总的authorized_key里各占一行。