EXPO32中文版操作手册
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
EXPO32 ADC
中文简易操作手册
For Epics XL-MCL、Epics ALTRA
目录
一、 开机步骤与软件主画面说明 1
二、 建立一个新的使用者 5
三、 设定一个新的Protocol与新的Panel 9
设定一个新的Protocol 9
设定一个新的Panel 21 四、 Flow Check 与样品Data的收集26
Flow Check 26 样品Data的收集28 五、 LMD(List Mode Data)分析30
单一LMD Data的分析30
编写打印页FlowPAGE 36
建立一个可以同时分析多个LMD档案的Protocol 39
批次分析44
一、基本开机步骤与软件主画面说明:
1.依常规模式进入Window98系统。
2.双点桌面上,即可激活机器并进入操作软件。
此时您可见到下面的画面:
3.选取您自己的数据夹(若有密码,请在Password处输入),并按下Next继续。
接着您能看到下面的画面:
4.此时您能在左边的窗口选取您即将使用的Protocol,然后按下Finish进入软件。
或不选取任何Protocol,直接按下Finish进入软件。
此时您即可见到软件的工作区(workspeace),如下图:
工作区分成三部份:
a. 工具列(EXPO32 Toolbars):
各种功能的操作工具列,包含
1. 存取工具列
提供开启、储存、打印及一般Windows操作系统下软件编辑功能
2. 绘图工具列
提供绘制分析图形(Dotplot、Histograme)及框选区域(Gating)的功能。
3. 统计
设定各框选区域(Gate)的颜色、选择统计数值、及将数据输出至Winsow Excel。
4. 打印页(FlowPAGE)
提供编辑打印页所需的各项功能。
5. 机器操控
操控机器的各项功能,包括:流速及机器所有的设定值。
6. 批次分析
提供批次分析的各项设定及操控。
7. 工作清单编写
供使用者编辑工作清单的内容。
b. 档案总管(Resource Explorer):
可利用鼠标在此处做切换,让您能够看到您
专属资料夹中的Worklist、Penal、Protocol、LMD Data和HST Data等档案。
另外,您也可以利用鼠标将这些档案直接选取并拖曳至软件的桌面上,以供分析及应用。
c. 工作清单编写区(Acquisition Manager):
利用工作清单工具列您可以在此处编写您即将要收集的样本内容,包括用来收集Data的Protocol、设定参数名、Data存盘的模式…..等等。
二、建立一个新的使用者
在EXPO32 ADC这个软件中,您可以预先设定属与自己的档案资料夹,藉由这个资料夹的设定,计算机会自动的将您在实验中设定的资料和实验时收集的Data储存到您专属的资料夹中,以避免不同使用者之间资料存取造成的混乱。
以下步骤说明如何建立一个属于您自己的资料夹:
1.依常规模式进入Window98系统。
2.双点桌面上,即可激活机器并进入操作软件。
此时您可见到下面的画面:
3.点选程序管理员(admin)后,左下角的Admin按键会反黑,点选它,您能见到下面的画面:
在此您可以新增一个使用者(Add user);
删除一个使用者(Delete user);
或修改已经存在的使用者(Modify user)。
4.点选Add user,您会看到下面画面:
5.键入您的使用者姓名(Username),并键入您的密码(Password),您也可以选择不设定密码。
Privilege部份是用来设定当您使用这个使用者时存取的权限,建议您依照上图勾选。
6.点选Paths,您会看到下面的画面:
当您建立一个新的使用者后,计算机自动帮您在软件的资料夹中
(C:\EXPO_32\User)建立数个您专属的资料夹,用来存取不同类型的档案。
7.您也可以点选键,将档案储存在您另外选定的资料夹中。
例如,如果您想要把LMD档案存在D槽的Data这个资料夹中,您便可以将上列选项改为如下:
如此一来,您所收集的LMD档案就会自动存在D:\DATA中了。
8.设定好后,按下OK键,您会看到一个让您确认的对会窗口
按下OK,您便完成了一个新使用者的设定。
三、设定一个新的Protocol与新的Panel:
设定一个新的Protocol
Protocol是EXPO32这个软件的中心骨架,一个完整的Protocol档案包含您所选取的参数种类,您想要表现的图形,和机器的所有设定值。
叫出一个Protocol后,您可以利用它来收取Data,或分析之前收下来的Data。
一般来说,设定一个新的Protocol分为四个步骤:
a.选择您想要收取的参数,并利用这些参数绘制您想要表现的Flow图形(双参数图Dotplot或单参数图Histograme)(此时可以不用Run样品)。
b.实际Run样品,调整FS、SS的Volts和Gain值,让您在FS/SS Dotplot图中能看到你想要分析的细胞族群。
c.Run阴性控制组(Negative Control),调整各个萤光参数的Volts和Gain值,让阴性控制组(Negative Control)的细胞族群落在萤光图中的第一个对数方格内。
d.Run单一萤光染色的样品调整出适当的萤光补偿值。
*以上所有的设定,都被储存在Protocol这个档案中,日后您若要进行相同的实验时,仅需把以前设定好的Protocol叫出,就可以直接收取您想要的Data。
依照上述的步骤,以双萤光染色的Surface Marker实验为例,作为说明:
a. 选择您想要收取的参数,并利用这些参数绘制您想要表现的Flow图形:
1.进入EXPO32的软件后,点选File/New/New Protocol(如下图),您便可以产生一个新的Protocol(此Protocol的设定值为软件的原始设定值),以此为出发点,我们将其修改为合乎您实验需求的Protocol。
2.按下机器操控工具列中的,您能开启机器设定值控制窗口(Cytometer Control)
3.将Setup Mode的选项勾起。
4.按下Parameter键后,便会出现选择参数的窗口(如下图):
勾选您实验所需要的参数(如上图,我们选择了FS、SS、FL1 Log和FL2 Log 等四个参数),按下OK键,软件会问您是否要储存这个新的Protocol(如下图),输入您想要的Protocol档名后,即完成参数的选择。
此时在档案总管您的资料夹的Ptotocol选项中会出现一个新的Protocol,如下图:
5.回到软件工作区,在绘图工具列中点选Color Dotplot键,您会看到下面的对话窗口:
依照上图,将X轴的参数设为SS,Y轴的参数设为FS,按下OK;您便可以得到一个以SS为X轴,FS为Y轴的Dotplot。
如下图:
点选绘图工具列中的多边形框选或矩形框选,在此图中画出一个区域(计算机会自动将此区域命名为A;您也可以利用鼠标点选A处,将此区域名称更改为您所希望的。
)如下图:
6. 再次点选绘图工具列中的Color Dotplot键,绘制第二个Dotplot:
依照上图,将X轴的参数设为FL1 Log,Y轴的参数设为Fl2 Log,Gate处选为A,按下OK;您便可以得到一个以FL1 Log为X轴,Fl2 Log为Y轴的Dotplot。
如下图:
7.按下存取工具列中的储存Protoco l,将您对这个Protocol所做的修改储存起来。
b.调整FS、SS的Volts和Gain值,让您在FS/SS Dotplot图中能看到你想要分析的细胞族群:
8.待机器暖机完毕后,插入标准样品(未染色的样品,或以Isotype染色的阴性样品,Negative Control)。
机器开始收集Data,并显示在您刚刚设定好的SS-FS Dotplot图上(因为您刚刚已将Setup Mode选项勾起,故现在此时机器所收集的Data并不会储存。
)
9.开启机器设定值控制窗口(Cytometer Control)中的Detector选项如下图:
10.调整FS和SS的Volts和Gain值,直到FS-SS Dotplot的图中能够见到您想要
分析的细胞族群(此时机器仍在收集Data)。
11.调整区域A的位置,框选您有兴趣的细胞族群
以血液样本为例,您可以看到如下面的图形,A框选的区域为淋巴球:
12.按下存取工具列中的储存Protoco l,将您调整的FS、SS设定值储存起来。
此
时即完成FS、SS的设定。
(检机器仍在收集样品)
c.调整各个萤光参数的Volts和Gain值,让阴性控制组(Negative Control)的细胞族群落在第一个对数方格内:
13.继续调整机器设定值控制窗口(Cytometer Control)中Detector选项内FL1、
FL2的Volts和Gain值,如下图
最后使FL1-FL2 Dotplot图中的细胞落在第一个对数方格内,如下图(此时机器仍在收集Data):
15.点选绘图工具列中的四方格选项,将四方格区域的横线定位在上图中细胞区域的上缘,纵线定位在细胞区域的右缘,如下图(计算机会自动将四个区域命名):
16.按下存取工具列中的储存Protocol,将刚刚您所做的设定储存起来。
17.按下机器操控工具列中的放弃键,将出现下列窗口:
选择重复这管(Repeat the tube),按下OK,此时机器停止Data的收集(样品架会下降)。
d. 调整光补偿(Compensation):
18.分别插入单染的样品(在本例中为FL1:FITC;FL2:PE),进行光补偿调整:
以FL1单染样品调整FL2-%FL1
以FL2单染样品调整FL1-%FL2
19-a.您可以利用机器设定值控制窗口(Cytometer Control)中的Compensation选项来调整补偿值,如下图
19-b.或在机器设定值启控窗口(Cytometer Control)内勾选QuickCOMP选项
此时您可以在FL1-FL2 Dotplot图的两侧看到调整萤光补偿的滚动条,如下图:
直接拉动滚动条,您也可以做萤光补偿的调整。
20. Run FL1单染样品调整FL2-%FL1,如下图:
No Compensation Compensation set OK
20.按下存取工具列中的储存Protocol,将刚刚您所做的设定储存起来。
22. Run FL2单染样品调整FL1-%FL2,如下图:
No Compensation Compensation set OK
20.按下存取工具列中的储存Protocol,将刚刚您所做的设定储存起来。
21.按下机器操控工具列中的放弃键,选择重复这管(Repeat the tube),按下OK,此时机器停止Data的收集(样品架会下降)。
22.去除机器设定值启控窗口(Cytometer Control)中Setup Mode的勾选,并将Max. events设定为10000,如下图:
23.选取File/workspace preference中的Plot Display,勾选show % in region,如下图:
24.再按一次储存Protocol,将刚刚您所做的设定储存起来。
25.此时,您已经完成这个Protocol的设定,您可以开始利用此Protocol来收集双染色(FITC and PE)样品的Data。
如下图:
26.将鼠标移至Dotplot的左下角,按下出现的符号,您可以看到计算机对此图的统计数值:如下图:
27.如果您想要看其它的统计值,请选择Analysis / Select Results,您便可以重新选择您想要看的统计数值,如下图
设定一个新的Panel
如果您分析的样品常常必须进行同一组实验(如一血液样本,同时要做下列五项实验1.CD45/CD14、2.IgG1/IgG1、3.CD3/CD4、4.CD3/CD8、5.CD3/CD19、
6.CD3/CD16+56),此时您可以预先编写并储存一个合用的Panel,待您要进行这组实验时,只消将这个Panel从档案中叫出,便可以直接进行。
1.我们以Coulter triCHROME这组kit为例子,说明如何设定一个新的Panel:
从File/New/New Panel进入Panel编写精灵:
2.输入Panel名称和Panel的管数:
3.按下Next:
Protocol Settings:
在此处您可以选择您想用那个Protocol来收集您第一管实验的Data,您也可以选择是否要用这个Protocol的机器设定值(Volts、Gain、Compensation等)来跑这管Data。
Region Settings:
在此处您可以选择是否要用上面选用的那个Protocol中的Region来收集这一管的Data,您也可以选择其用他Protocol中的Region来收集这一管Data。
Instrument Settings:
在此处您可以选择是否要用上面选用的那个Protocol中的机器设定值来收集这一管的Data,您也可以选择其用他Protocol中的机器设定值来收集这一管Data。
Parameter Names:
您可以在此编写您选用的参数名称,通常我们在此将参数编写成抗体和萤光染剂的名称。
按下Next
4.重复上面的步骤,直到4管都编写完成。
现在,您就可以用这个您已经编写好的Panel插入您的工作清单中。
四、Flow Check与样品Data的收集:
Flow Check
1.依常规模式进入Window98系统。
2.双点桌面上,即可激活机器并进入操作软件。
此时您可见到下面的画面:
3.选取您自己的数据夹(若有密码,请在Password处输入),并按下Next继续。
接着您能看到下面的画面:
4.请您在左边的窗口选取Flow check这个Protocol,并按下Finish进入软件。
或不选取任何Protocol,直接按下Finish进入软件。
此时您可进到软件的工作区(workspeace),如下图:
(若您上一步骤没有选取Flow check这个Protocol,您可以在左侧的档案总管中利用鼠标点选,然后在您的Protocol资料夹中,将Flow check这个Protocol拖曳到软件的桌面上。
)
5.按下机器操控工具列中的,您便能开启控制机器设定值的窗口,如下图:
6.此时,若机器已暖机完毕(当机器上RUN的按键已呈绿色),即可将装有Flow check Beads的样品管插入样品架中收集Data。
7.当机器收集Data时,您可以利用机器操控工具列来控制流速、操控机器重新开始、暂停、继续、停止和放弃。
8.待Data收集完毕后(您可以在最大细胞数的窗口内调整您想要收取的细胞数)机器会自动停止,样品架会自动下降,机器所收集的LMD Data 也会自动储存到您专属的LMD资料夹内。
9.此时,将鼠标移动到FS、FL1、FL2、FL3、FL4 单参数图(Histograme)的左下角,开启统计数据栏,记下XHP-CV和X-main值。
10.XHP-CV值应在3以下,每次所测得X-main值的差异应在+/-5%之间,以确保之后所做的样品分析的可信度。
若XHP-CV和X-main值不在标准范围内,请进行Prime和Cleanz的动作后,重新再跑一次Flow check,若无法改善,请即刻通知Beckman Coulter公司的工程师。
当Flow check完成后,即可进行您样品Data的收集。
收集样品Data:
1.按下工作清单编写工具列中的新工作清单,您可以得到一个空白的工作清单编写区,如下图:
2.利用工作清单编写工具列中的按键,您可以开启一个事先储存好的工作清单,
也可以插入一个事先编写好的penal,或是插入一管可由您指定protocol的
tube,在此,请您根据您实验的需求,编写合乎您实验的工作清单(您也可以在此编写参数的名称,在此编写的参数名称会连同你的Data一同储存在LMD档案中)。
3.工作清单完成后,利用鼠标将工作清单编写区的滚动条移至最右侧,您可以看到工作清单最右侧的选项,在此您可以设定LMD文件名的储存模式。
直接点选后会出现下面的设定窗口:
选择您所想要的文件名模式后,按下OK即完成设定。
在此,如果您有勾选Sample ID选项,您便可以在关闭此窗口后,在工作清单编写区内,输入您的Sample ID,此ID便会一起储存到您Data的档名内。
4.完成工作清单的编写后,您即可进行样品的分析。
如果您使用的是手动上机模式,请您依照工作清单上的顺序,将您的样品依序送上样品架上进行Data的收集。
如果您使用的是自动上机模式,请您依照工作清单上的顺序,将样品依序排列在自动上机盘上,置入MCL后,关上盖子,并在工作清单编写区内的处输
入您使用的上机盘号码,按下机器上Auto的按键,机器便会依序进行Data的收集。
五、LMD Data分析
此份文件分为4个部份:单一LMD Data的分析
编写打印页FlowPAGE
建立一个可以同时分析多个LMD档案的Protocol
批次分析
单一LMD Data的分析:
1.依常规模式进入Window98系统。
2.双点桌面上,即可进入Data分析软件。
此时您可见到下面的画面:
3.选取您自己的数据夹(若有密码,请在Password处输入),并按下Next继续。
接着您能看到下面的画面:
4.此时您能在左边的窗口选取您即将用来分析Data的Protocol,然后按下Finish 进入软件。
或不选取任何Protocol,直接按下Finish进入软件。
此时您即可见到软件的工作区(workspeace),如下图:
工作区分成三部份:
a. 工作区(Workspace):
您可以在此处绘制或编辑您想要浏览的各式图形,并可以将编辑好的工作区储存成一个Protocol,以供类似的LMD Data分析使用。
b. 工具列(EXPO32 Toolbars):
各种功能的操作工具列,包含
存取
绘图
统计
打印页(FlowPAGE)
批次分析
c. 档案总管(Resource Explorer):
可利用鼠标在此处做切换,让您能够看到您专属资料夹中的Worklist、Penal、Protocol、LMD Data和HST Data等档案。
另外,您也可以利用鼠标将这些档案直接选取并拖曳至软件的桌面上,以供分析及应用。
5.用鼠标点选档案总管(Resource Explorer)中的Protocol ,您能看到在您的资料夹中所有的的Protocol,选取您要用来分析Data的Protocol,并将它拖曳至工作区中。
注意:我们通常利用收集这个Data的Protocol来分析这个Data,但在分析Data 时,我们常会对Protocol做一些修改(例如加入打印页(FlowPage)、或将Protocol 修改成能同时分析数个Data的模式),所以建议您将收集Data的Protocol拖曳到工作区后,将它另外存成一个专门用来分析的Protocol,以免影响日后Data的收集。
如下图我们将2 color.PRO这个Protocol拖曳到工作区后,利用File/Save Protocol
As将它存成2 colorAna.PRO专供分析使用:
6.点选档案总管(Resource Explorer )中的LMD
,您可以看到存在您专属资
料夹中所有的LMD Data 档案。
选取您要想要分析的档案,拖曳至工作区中的
Protol内,您便可以看到分析后的结果,如下图:
7.接着,您可以再拖曳其它的LMD Data到这个Protocol中,旧的Data便会被新的取代。
8.打印这个分析结果。
选择存取存取工具列中
的打印功能,您可以看到下列画面:选择您想要打印的模式(图形(Plot)、统计数值(Statistics)或打印页(FlowPAGE)),按下OK即可。
编写打印页(FlowPAGE):
打印页(FlowPAGE)好比一张A4的打印纸,我们可以在分析的Protocol中预先编写排好版的打印页,待LMD Data拖曳至Protocol后,您只要打印这张打印页,便可以得到您想要的排版模式。
1.点选打印页工具列中的插入一
个新的打印页,您会得到一个空白的打印页;选择工作区中您想要放在打印页中的图形,并将它拖曳到打印页中,这个图形就会出现在打印页中,如下图:
2.利用打印页工具列中的工具,您可以在打印页中编辑文字、插入图标并排列这些图形成您想要的样子(编写方式和
Window PowerPoint类似):
3.按下存取工具列中的储存Protoco l,您编写的打印页便会储存成Protocol的一部份;当您下次再将这个Protocol叫出时,这个打印页会同时出现在工作区中。
注意:打印页上的图形和工作区中的图形是同步的,所以当您拖曳一个新的LMD Data到工作区时,打印页中的图形也会随之更新。
建立一个可以同时分析多个LMD档案的Protocol
有时候我们会同时将数个LMD Data放在同一个Protocol中分析比较,这时我们必须将原来只能分析一个LMD Data的Protocol进行修改:
在此,我们以建立一个能同时分析4个档案的Protocol为例子作为说明:
1.将只能分析一个LMD Data的Protocol拖曳至工作区。
2.拖曳第一个要分析的LMD Data到这个Protocol中。
3.点选Fl1/FL2的DotPlot后,选择Plot/Duplicate Plot:
4.这时候会开启一个和工作区中FL1/FL2完全相同的DotPlot;利用鼠标直接将原来DotPlot中的十字区域拖曳至新的DotPlot中,新的DotPlot中将会出现和原来DotPlot中位置完全相同的十字区域,但软件会自动将您新的区域附上新的名字。
如下图:
一步骤中复制出来的DotPlot中,如下图:
这时,我们会在新的DotPlot中看到第二个LMD Data的分析结果。
6.重复步骤3到步骤5,您便可以在一个Protocol中,同时看到四个不同档案分析的结果,如下图:
7.编写这个 Protocol的打印页,如下图:
注意:打印页中的分析结果和工作区中的分析结果是相对应且同步的。
8.按下存取工具列中的储存Protoco l,现在这个Protocol便能用来同时分析4个LMD Data。
9.重新开启这个Protocol,这时您可以直接(不需再按Ctrl键)将您要分析的4个
LMD Data拖曳到各个DotPlot中。
如下图:
批次分析(AUTOMator):
利用上述的Protocol,以拖曳的方法,我们能在同一个工作区中同时分析数个LMD Data,也能将这些分析结果打印在同一张报告单上。
此外,我们能利用批次分析这个功能,一次选取数个LMD Data后,让软件自动在上述的Protocol中进行分析。
1.拖曳能同时分析数个LMD Data的Protocol到工作区中。
2.点选批次分析工具列中的批次分析设定
,您会看到下面的画面:
3.点选增加档案(Add Files),在档案选取窗口中选取要分析的LMD Data(选取的档案数目必须是这个Protocol能分析的档案数目的倍数;例如上述的Protocol
能同时分析4个档案,所以您必须选取4、8、12…..个档案。
)如下图:
4.按下OK,您会看到下面的画面:
在窗口中间,能看您到选取的8个档案,软件用打印符号将其分成2个批次,
您可以在下面勾选打印的格式,或选择不打印(若选择不打印,会出现不打印的符号)。
另外您也可以利用鼠标在左边的符号处设定:当软件分析完一个档案时是要继续分析、暂停5秒再分析,还是停止分析。
5.设定完后,按下OK,您会回到工作区的画面。
6.在工作区的批次分析工具列中,按下开始
分析,软件就会依照您的设定,自动分析和打印。
此时画面中央会出现分析的状况,如下图:
桌面上的图形也会依着正在分析的Data而改变。