生化北医
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生化大题汇总
※参与DNA复制的主要酶和蛋白因子有哪些?各有什么功能?
拓扑异构酶:松解DNA的超螺旋。
解链酶:打开DNA的双链。
引物酶:在DNA复制起始处以DNA为模板,催化合成互补的RNA短片断。
DNA聚合酶:以DNA为模板、dNTP为原料,合成互补的DNA新链。
连接酶:连接DNA片断。
DNA结合蛋白:结合在打开的DNA单链上,稳定单链。
※ DNA复制有何主要特点?
半保留复制,半不连续合成、需RNA引物,以dNTP(A,T,C,G)为原料,新链合成方向总是5’->3’,依赖DNA的DNA聚合酶(DDDP)
※ DNA复制的高保真性主要取决于哪些因素?
DNA复制的高保真性取决于三个方面:1、DNA双链碱基的严格配对与DNA聚合酶对配对碱基的严格选择性;2、5’->3’外切核酸酶的即时校读作用;3、对DNA分子中的错误或损伤的修复机制。
※真核生物DNA复制在何处进行?如何进行?
在细胞核内。
复制分为以下几个阶段:1、起始阶段(DNA解旋解链及引物合成):DNa拓扑异构酶、解链酶分别使DNA解旋、解链,形成复制叉,在起始点由引物酶催化合成RNA引物;2、DNA 合成阶段:以DNA的两条链分别作为模板,dNTP为原料按碱基互补原则(A-T,C-G)在RNa引物引导下,由DNA聚合酶催化合成DNA新链(分前导链和随从链);3、终止阶段:水解RNa引物(polI),填补空缺(polI),连接DNA片断(连接酶)。
※何谓反转录?在哪些情况下发生反转录?写出主要酶促反应过程。
以RNA为模板在反转录酶的作用下合成DNA的过程叫做反转录。
反转录可发生于:1、在RNA病毒感染宿主细胞甚至致癌过程中;2、在基因工程中,以mRNA为模板合成cDNA。
病毒RNA(反转录酶dNTP)->RNA-DNA杂化链(RNA酶活性)->cDNA单链(DNA 聚合酶活性)->cDNA双链
※概述DNA的生物合成。
DNA的生物合成包括DNA半保留复制,DNA损伤后的修复合成和反转录
DNA复制是以DNa的两条链分别作为模板,以dNTP为原料,在DNA聚合酶作用下按照碱基配对原则合成互补新链,这样形成的两个子代DNA分子与原来DNa分子完全相同,一条链来自亲代,另一条链是新合成的,故称为半保留复制。
在某些梨花、生物学因素作用下DNa链发生碱基突变、缺失、交联或链的断裂等损伤后,可进行修复。修复方式有光修复、切除修复、重组修复与SOS修复等。切除修复:1、核酸内切酶从损伤处的5’端切开,出现正常的3’端;2、核酸外切酶水解已打开的损伤DNA段;3DNA聚合酶以互补的DNA链为模板,dNTP为原料,5’->3’方向合成新的DNa片段;4、连接酶连接形成完整的DNA链。
以RNA为模板在反转录酶的作用下合成DNA的过程叫做反转录。反转录在病毒致癌过程中起重要作用;在基因工程中可用于以mRNA为模板合成cDNA的实验。
※催化磷酸二酯键形成的酶有哪些?比较各自不同特点。
有DNA聚合酶、RNA聚合酶、引物酶、反转录酶、连接酶和拓扑异构酶。
酶反应时限底物反应结果
DNA聚合酶DNA复制或修复合成模板DNA、引物、dNTP 合成互补DNA新链
RNA聚合酶转录或RNA复制DNA/RNA模板、NTP 合成RNA新链
引物酶复制起始阶段起始点DNA模板、NTP 合成RNA引物
反转录酶反转录RNA模板、dNTP 合成互补DNA
连接酶DNa复制或修复合成双链DNA中相邻片段合成DNA长链
拓扑异构酶DNA复制起始超螺旋DNA 解旋
DNA复制后松弛态DNA 重新形成螺旋
※比较复制与转录的异同
模板均为DNA,都需要聚合酶催化反应,聚合过程都是在核苷酸之间形成3’,5’-磷酸二酯键,合成方向都是5’->3’,都遵从碱基配对规则。
不同点包括:复制使子代保留亲代的全部遗传信息,方式为半保留不连续复制;转录只是按照生存的需要表达部分遗传信息,方式为不对称转录。聚合酶分别是DNApol和RNApol,原料分别是dNTP和NTP,碱基配对RNA将A->T改为A->U,复制产物分别为DNA和RNA。※何谓不对称转录?用实验证明之
在双链DNA中只有一股单链作为模板;另外在同一条单链上可以交错出现模板链或编码链。用核酸杂交方法:用热变性将DNA双链打开,并分离成两股单链分别与转录产物RNA杂交,由此鉴定出哪条链上的特异区段是转录模板。另外可以进行核酸序列测定。
※试比较原核生物与真核生物RNA聚合酶有何异同?
※举例说明转录后加工的主要类型。
mRNA中主要有:1、剪接-去除内含子拼接外显子;2、末端添加核苷酸:5’端加7甲基鸟嘌呤核苷三磷酸,3’端加多聚腺苷酸尾;3、化学修饰:甲基化;4、RNA编辑:某些mRNA 转录后还进行插入、删除和取代一些核苷酸残基方能生成具有正确翻译功能的模板。
※讨论原核生物RNA聚合酶各亚基的功能和在转录中的作用。
原核生物RNApol有α、β、β’、σ、ω亚基,还有一个ρ因子。σ亚基和ρ因子分别是起始和终止因子;α亚基决定哪些基因转录;β亚基在转录过程中起催化作用;β’亚基结合DNA模板起开链作用。转录起始时需全酶结合模板,这种结合十分稳定。转录延长只要核心酶,且与模板结合较松弛以利于酶向模板下游移动。
※参与原核RNA转录的成分有哪些?它们的作用?
四种核糖核苷酸:RNA合成的原料。
σ因子:辨认DNA上转录起始点。
RNA聚合酶核心酶:以DNA为模板,催化四种核糖核苷酸按碱基互补配对原则形成磷酸二酯键。
ρ因子识别某些RNA上转录终止部位。
※蛋白质生物合成体系由哪些物质组成,各起何作用?
蛋白质合成过程就是mRNA翻译的过程,需要mRNA作模板,氨基酸为原料,tRNA作搬运氨基酸的特异工具,核糖体作装配机。核糖体大亚基具有转肽酶活性,可催化肽键形成。这一合成体系还需各种氨基酰tRNA合成酶对氨基酸进行活化;起始因子、肽链延长因子、终止因子RF等多种蛋白质因子参与核糖体循环;ATP、GTP供给能量;Mg、K等无机离子参与合成。
※何谓遗传密码?哪些密码子不代表氨基酸?在mRNA任何部位的AUG是否都代表起始信号?
mRNA分子内,每三个相互邻近的氨基酸构成的三联体,按其特定排列顺序,在蛋白质生物合成中可被体现为氨基酸或肽链合成的终止信号者,统称遗传密码。其单个密码字,称为密码子。密码子共有六十四个,六十一个密码子分别代表各种氨基酸。另有三个密码子(UAA、UAG、UGA)为肽链合成的终止信号,不代表任何氨基酸。密码子AUG不仅代