甘蓝型特高含油量油菜种质及其主栽品种的指纹图谱构建_赵卫国
甘蓝型油菜高/低含油量近等基因系构建及鉴定
甘蓝型油菜高/低含油量近等基因系构建及鉴定刘紫君;咸拴狮;王耀辉;范建春;王景雪;杜春芳【期刊名称】《华北农学报》【年(卷),期】2016(031)005【摘要】为了探讨油菜种子中脂肪酸代谢调控的机制,发现有价值的高油基因,为高油育种研究提供基础材料,构建了甘蓝型油菜高/低含油量近等基因系。
以高油品系 NJ9为基础试材,连续自交2代后,选择农艺性状基本一致、含油量不同的姐妹系30份,进行连续自交和含油量的选择,最终获得9份拟近等基因系材料。
以来源于芸薹属 DB 公共数据库的156对 SSR 引物对9份拟近等基因系株系材料进行扩增,筛选出32对引物用于近等性分析。
基于32对SSR 引物 PCR 扩增结果,经过遗传相似性系数估算以及聚类分析,结果显示,9份拟近等基因系试材遗传相似性系数均为0.85~0.94,其中,YC13-554和 YC13-559的遗传相似性系数最大,为0.94,确定其为近等基因系。
成熟期农艺性状调查结果,进一步确定 YC13-554和 YC13-559为高/低含油量近等基因系。
结果表明,连续自交和定向选择的方法可用于构建近等基因系,丰富了近等基因系的来源。
【总页数】5页(P129-133)【作者】刘紫君;咸拴狮;王耀辉;范建春;王景雪;杜春芳【作者单位】山西大学生命科学学院,山西太原 030006;山西省农业科学院棉花研究所,山西运城 044000;山西大学生命科学学院,山西太原 030006;山西省农业科学院棉花研究所,山西运城 044000;山西大学生命科学学院,山西太原030006;山西省农业科学院棉花研究所,山西运城 044000【正文语种】中文【中图分类】S56【相关文献】1.甘蓝型油菜双低高含油量恢复系017R的选育 [J], 何惠萍2.春性双低甘蓝型油菜杂交种和亲本指纹图谱构建及杂交种纯度鉴定 [J], 周红伟;姚艳梅;付忠;杜德志3.高产高含油量甘蓝型油菜双低杂交种‘向农08’的选育 [J], 蒋美艳;孙超才;王伟荣;李延莉;杨立勇;周熙荣;刘曼4.高含油量双低甘蓝型油菜新品种浙双72 [J], 张冬青;张尧锋;丁厚栋;赵坚义5.双低甘蓝型油菜杂交种亲本指纹图谱构建和杂交种纯度鉴定 [J], 刘平武;周国岭;杨光圣;傅廷栋因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
甘蓝型油菜一个代表性核心种质的遴选
甘蓝型油菜一个代表性核心种质的遴选任丽平;倪西源;黄吉祥;雷伟侠;曹明富;赵坚义【期刊名称】《中国农业科学》【年(卷),期】2008(041)011【摘要】[目的]分析甘蓝型油菜的遗传多样性,遴选核心种质.[方法]将来自欧洲、亚洲、加拿大、澳大利亚和中国几个不同地区的甘蓝型油菜500余份,按照其品质特点、地理位置、生长习性分组并按比例取样,建立由87个品种组成的预选核心种质.采用EST-STS标记和SSR标记对其进行分析,剔除遗传冗余,选出代表该500余份资源的核心种质并进行分子标记多样性评价和表型特征分析.[结果]在相同的选择背景下,EST-STS和SSR标记的多态性检出率相仿(39%~40%),每对EST引物与SSR引物产生的多态性条带相近.聚类分析在遗传相似系数0.65处把87个品种分成中国和国外油菜两个类群,进一步在约0.70处类群I和类群Il又分别产生中国"双低"、中国"双高"以及欧洲冬油菜和欧洲春油菜各两个亚组.根据遗传多样性分析,剔除遗传相似系数大于或等于0.85的遗传冗余,获得78个品种的核心种质.[结论] EST-STS是一种经济、有效具有功能信息的分子标记,功效与普通SSR标记相仿;遗传多样性和聚类分析结果为甘蓝型油菜4个组的划分提供了依据;78个品种组成的核心种质保留了预选核心种质的遗传多样性和结构,可作为本研究中500余份品种资源的核心种质加以利用和保存.【总页数】11页(P3521-3531)【作者】任丽平;倪西源;黄吉祥;雷伟侠;曹明富;赵坚义【作者单位】杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州,310021;浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所,杭州,310021;浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所,杭州,310021;杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州,310021;浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所,杭州,310021;浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所,杭州,310021;杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州,310021;浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所,杭州,310021【正文语种】中文【中图分类】S6【相关文献】1.中原牡丹品种初级核心种质构建与代表性检验 [J], 李保印;周秀梅;张启翔2.植物核心种质构建数据和代表性评价参数的研究进展 [J], 王建成;胡晋;黄歆贤;徐盛春3.黄麻核心种质的遴选 [J], 徐益; 张列梅; 郭艳春; 祁建民; 张力岚; 方平平; 张立武4.中国菊花品种初选核心种质的代表性检验 [J], 张飞;谢伟;陈发棣;房伟民;陈素梅5.抗大豆胞囊线虫3号生理小种(SCN3)核心种质代表性分析 [J], 段玉玺;周博;陈立杰;吴海燕因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
甘蓝型油菜株高、第一分枝高和分枝数的QTL检测及候选基因筛选
作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2015, 41(7): 1027 1038/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@ DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.01027甘蓝型油菜株高、第一分枝高和分枝数的QTL检测及候选基因筛选王嘉**荆凌云**荐红举曲存民谌利李加纳刘列钊*西南大学农学与生物科技学院, 重庆 400715摘要: 株高、分枝数及第1分枝高是油菜重要的农艺性状。
本研究利用甘蓝型油菜GH06和P174杂交, F2通过单粒法连续自交至F11构建重组自交系群体, 利用油菜60K芯片对该群体进行基因分型, 构建高密度遗传连锁图谱。
结果表明, 该图谱包含2795个SNP多态性标记位点, 总长1832.9 cM, 相邻标记间平均距离为0.66 cM。
在此图谱基础上采用复合区间作图法(CIM), 检测到3个农艺性状的24个QTL。
其中11个株高QTL分别位于A01、A06、A07、A08、A10和C06染色体, 单个QTL解释5.00%~15.26%的表型变异; 7个第1分枝高QTL分别位于A06、C05和C06染色体, 单个QTL解释5.04%~12.99%的表型变异; 6个分枝数QTL分别位于A03、A07、C01、C04和C06染色体, 单个QTL解释5.95%~8.14%的表型变异。
将156个拟南芥株高相关基因、10个拟南芥第1分枝高相关基因和148个拟南芥分枝数相关基因与QTL对应置信区间序列进行同源比较分析(E<1E–20), 分别找出了20个株高候选基因、3个第1分枝高候选基因以及12个分枝数候选基因。
2个环境中在A07染色体上重复检测到的QTL置信区间检测到与株高相关的候选基因ATGID1B/GID1B和WRI1, A08染色体上重复检测到的QTL置信区间检测到SLR/IAA14和AXR2/IAA72个与株高相关的候选基因。
彩色甘蓝型油菜指纹图谱构建
2022年第16期现代园艺油菜是我国种植最为广泛的油料作物[1],青藏高原海拔高、气候冷凉,植物生长季节短,适宜油菜种植[2],既能保证农业收入,又能增加旅游收入。
因而在休闲农业中得到了广泛运用,种植面积有所增加[3]。
原本大面积种植青稞的地区,现以油菜和青稞相间呈带状或条块状种植,展现出别样的魅力[4]。
油菜作为观赏植物大面积种植时,花色单一,易引起视觉疲劳[5-6]。
近年来,育种学家以同属十字花科的萝卜和诸葛菜为彩色基因供体,通过远缘杂交技术,创制出彩色油菜资源,各大实验室利用这些资源,开展了彩色油菜品种(系)选育工作[7]。
本研究在青藏高原植物资源保护与利用实验室开展了相关研究工作,并选育出多个彩色甘蓝型油菜品种(系)。
在以油菜为主题的休闲农业区,搭配种植不同花色的彩色油菜,营造大面积、多元化的观赏景观,对游客具有更大的吸引力和震撼力,可促进休闲农业发展。
目前,彩色油菜种子市场需求量较大,其质量优劣直接影响观赏价值和经济价值[3]。
因此,快速、有效地鉴定彩色油菜种子的纯度和真实性十分有必要。
形态学鉴定和分子鉴定是鉴定作物品种的常用方法。
形态学鉴定虽然操作简单,但耗时长,易受环境和人为因素的影响[9]。
DNA 分子标记技术是快速、准确、高效的分子鉴定技术,该项技术的发展为育种学家研究作物性状的遗传特性奠定了良好的理论基础,也为品种纯度和真实性鉴定提供了强有力的技术保障[10]。
该技术不受取材部位、取材时间和环境的影响,大大提高了鉴定的准确性,缩短了鉴定时间,是最为科学有效的鉴定品种(系)纯度和真实性的方法。
近年来,分子标记指纹图谱在作物品种鉴定、注册、质量监测及知识产权保护等方面起到不可替代的作用[8],可用于构建指纹图谱的DNA 分子标记方法有多种,如RFLP [10]、RAPD [11]、SRAP [12]、AFLP [13]、ISSR [14]、SSR [7,8,15]、特异性标记[16]等。
利用ssr标记分析高含油量甘蓝型油菜种质资源遗传多样性
1.1 试验材料 试验材料由汉中市农业科学研究所油菜研究室提供,总
共 65份,其中有 50.8%的材料是该所自育材料。在所有材 料中,含油量在 40% ~45%之间的共 23份,在 45% ~50%的 共 32份,还有 10份材料的含油量在 50%以上,属于特高含 油量油菜(表 1)。 1.2 试验方法 1.2.1 样品 DNA提取 采用十二烷基苯磺酚钠(SDS)法[7] 提取油菜基因组 DNA。 1.2.2 DNA检测 油菜基因组 DNA采用 0.8%琼脂糖凝胶 进行检测,电泳条带越清晰 DNA质量越高。 1.2.3 20对 SSR引物序列的 PCR扩增 参照甘蓝型油菜 首选核心引物(表 2)[6],从中筛选出具有较高多态性的引物
12320对ssr引物序列的pcr扩增参照甘蓝型油菜首选核心引物表26从中筛选出具有较高多态性的引物421江苏农业科学2019年第47卷第21期表1供试材料序号及对应的油菜材料名称序号材料名称来源含油量序号材料名称来源含油量1312ahzasi420434中4ahstc5szonxx98rhzasi45512汉3ahzasi469135中4ahstc5d4rf22中4ahzasi497930940821上海4220hstc51d4rf754h16ahzasi4387369816f91frhzasi45055z11ahzasi478237981610rfrhzasi44186szonx3378hzasi4745389816中4ahstc5d4rf22frhzasi45947浙50选系浙江509839希2008fr中2rr11rfrhzasi48808f93欧洲466040h105fr陕西51509中11中9希98avbc2hzasi526441h109fr陕西498010浙72沪16中9希98av中11hzasi491642h16ar11rhzasi510811沪16绵新油19hzasi518443中4ahstc5d4rf11hzasi481612中11荣801hzasi492744中4ahstc5hstc5甘蓝hzasi480313中11青杂早hzasi535245中11q33arhzasi500314f24欧洲482346杂95陕西470915f46欧洲477947h82j24安徽410816中11杨4浙98hzasi487948杂03921四川478217中11中821核选hzasi485749杂03922四川454418芝芥中11hzasi425050dh中杂11油10浙98春c1hzasi500619青杂3ab青海530451n58abr四川469420cyz0201fr陕西492352na油10中9希98av秦10avhzasi456221dgr陕西496453秦7恢702hzasi458622q33ar陕西490454701r湖南422623z79c陕西492355中111浩11hzasi4058242061fr陕西525556华62fr湖北442725s12r陕西488557h6r湖南433726dw4r陕西481358z2r湖北447227杂3000fr陕西483459x98r湖北436828q1
26份甘蓝型油菜自交系指纹图谱分析
rsl.1 N n epit gw scnt ce . Reut rsi a u be ie f 1 at hn n esuh e[ hn a b iu e eut廿eD A f grr i a o s u td 『 sl]B as anp sn rdl so 廿ees C iaadt o tw s C iah do vosg— i n n r c i n h
v l a l e e fp rnt. hihwa ep u O ito u e s e ilg r p am e o c sa d r h v rain tpe au b eg n so a e s w c sh lf lt n rd e p ca e m ls r sure n i a ito y . c Ke r s Brsia na u n e i e y wo d asc p sibrd ln s;RAP mak r:Ge ei oy r im ;Clseig a ay i D r e n tc p lmophs u trn n l ss;DNA n ep itn i f g r rn ig
林道哲1 , 2董顺文 , 刘朝辉 , 军 , 王 邱有荣 , 缨 , 黄 李首成
(. 1 四川省农业科学 院经济作物研究所 , 四川简 阳 6 10 2 四川农 业大学农学 院, 44 0术学 院 , 四J 成都 6 0 5 4 成 都市青 白江 区农村发展局 , 104; . 四川成都 6 0 0 130)
『 to ]T e g n t eain hp b t e n df rn r s c 印 ib e ie a n lz d b h AP r e e h oo y B s d o h Meh d h e ei r lt s i ew e i ee t a s a n c o f B i n rd l sw sa a e y te R D mak rtc n lg . a e n t e n y
甘蓝型油菜花叶性状的遗传及基因定位
i
华中农业大学 2011 届硕士学位论文
3.1.1 亲本材料...........................................................................................................17 3.1.2 F2 定位群体的构建 ..........................................................................................17 3.1.3 花叶性状调查及遗传分析...............................................................................17 3.1.4 DNA 提取及混合池构建..................................................................................18 3.1.5 SSR 标记筛选及分析 .......................................................................................18 3.1.6 连锁作图方法...................................................................................................19 3.1.7 生物信息分析方法...........................................................................................20 3.2 结果与分析 .............................................................................................................20 3.2.1 花叶性状表现及遗传.......................................................................................20 3.2.2 多态性 SSR 标记 .............................................................................................21 3.2.3 花叶性状分子鉴定...........................................................................................22 3.2.4 紧密连锁的分...................................................................23 3.2.5 遗传连锁图谱及定位.......................................................................................25 3.2.6 定位区域的生物信息.......................................................................................26 3.3 讨论 .........................................................................................................................30 3.3.1 花叶主效基因初步定位...................................................................................30 3.3.2 分子标记辅助选择...........................................................................................30 3.3.3 生物信息预测...................................................................................................30 参考文献 ............................................................................................................................31 致 谢................................................................................................................................38 附录 ....................................................................................................................................39 1.CTAB 小样法提取 DNA.........................................................................................39 2.CTAB 小样法试剂配制...........................................................................................39 3.PAGE 胶制备...........................................................................................................40 4.电泳 ..........................................................................................................................41 5.显影 ..........................................................................................................................41 6.垂直胶(6%PAGE)检测试剂配制 ......................................................................41
甘蓝型油菜DH系主要性状及SSR分子标记分析
甘蓝型油菜DH系主要性状及SSR分子标记分析赵卫国;王灏;赵小萍;田建华;同小莉;李殿荣;李保军;赵亚军;王爱娜【期刊名称】《西北农业学报》【年(卷),期】2013(022)011【摘要】对173份甘蓝型油菜DH系材料主要农艺性状、品质性状以及SSR分子标记的分析表明,DH系系内性状表现高度一致.农艺性状中,分枝高度的变异系数最大(26.39%),株高的变异系数最小(9.42%);品质性状中,芥酸含量变异系数最大(62.86%),含油量的变异系数最小(5.10%).SSR分子标记分析发现,DNA谱带符合1∶1分离规律.【总页数】5页(P32-36)【作者】赵卫国;王灏;赵小萍;田建华;同小莉;李殿荣;李保军;赵亚军;王爱娜【作者单位】陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105;陕西省杂交油菜研究中心,国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,陕西大荔715105【正文语种】中文【中图分类】S565.4【相关文献】1.甘蓝型油菜DH系的SSR遗传多样性研究 [J], 焦德丽;徐亮;姚艳梅;杜德志2.甘蓝型油菜DH群体10个主要农艺性状的遗传分析 [J], 黄吉祥;汪义龙;倪西源;任丽平;曹明富;赵坚义3.甘蓝型油菜DH系产量及产量相关性状的主成分分析 [J], 塔娜;梁五生;王灏;陈文杰;田建华;穆建新;关周博;赵小萍;罗斌;栗茂腾4.油用牡丹主要相关性状与SSR分子标记的关联分析 [J], 张琳;王佩佩;韩雅祯;许龙伟;王瑞博;刘艺平;孔德政5.甘蓝型油菜DH群体主要品质性状相关性及主成分分析 [J], 赵卫国;王灏;穆建新;关周博;李保军;赵小萍;陈文杰;塔娜;朝红波;罗斌;栗茂腾因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
甘蓝型油菜高含油量恢复系1521C的选育及应用
刘创社 等 : 甘蓝型油菜高含油量恢复系 12 5 1C的选育及应用
甘蓝 型 油 菜 高含 油量 恢 复 系 12 5 1C的选 育 及 应 用
刘 创社 黎 亚萍 , 许 , 伟 刘绚 霞 董振 生 。 ,
(. 1 西北农林科技大学农学院 , 陕西 杨凌 720 ; 2 陕西省种子管理站 , 陕西 西安 7 0 1 110 . 106 3 陕西省勉县 良种场 , 陕西 勉县 740 ) . 220
1 2 形 态特 征 .
高 油 连 续 选 择 , 成 黄 籽 双 低 高 含 油 量 恢 复 系 12 育 51C ( 85 ) 4 .% 。育成 的 12 51 C耐寒抗冻 , 适应性 广, 用其 育成适 宜
陕 西 不 同 生 态 类 形 的 油 菜 品种 4个 , 油 1 陕 2和 陕 油 1 7适 宜 陕
01%, . 3 硫甙 含量 3 .4 ̄ lg 含油量 4 . 3 。 03 / / , mo 2 5%
2 1 1 产 量表现 ..
西北农 林科 技 大学 油 菜研 究 中心 19 97年利 用 双 低 油 菜杂 交 种 杂 油 7 7作 母 本 , 籽 低 芥 酸 油 菜 宁 油 黄
1 优 良株 系作 父本 , 行 有 性 杂交 , 择 优 良可 0号 进 F选 育株套 袋 自交 , 部种 植 , 全 F 继续 选株 套袋 自交 , 3 F 发
Br e i g a d Ap lc t n o so e i e 1 21 C wih e d n n p i a i fa Re t r r L n t o 5 Hih Oi Co t n n Br s ia n pu g l n e ti a s c a s.
甘蓝型油菜均隆油5号特征指纹图谱构建和杂种纯度鉴定
甘蓝型油菜均隆油5号特征指纹图谱构建和杂种纯度鉴定史慧娟;赵昭;阳治国;杨朋娜;王茂林【摘要】利用SSR和SRAP分子标记技术分别对甘蓝型油菜细胞质雄性不育均隆油5号亲本和F1代进行研究,从240对SSR引物、255对SRAP引物中分别筛选出11对和8对多态性好且子代含父母本特征条带的引物,从中选出5对SSR引物(CB 10057、Na 10-D 03 A、Na 12-E 02、CB 10364、CB 10179)和5对SRAP 引物(Me 1-Em 10、Me 6-Em 3、Me 6-Em 11、Me 6-Em 19、Me 6-Em 20)作为核心引物,用于F1代杂种纯度鉴定.结果表明,SSR和SRAP两种分子标记所测杂交种纯度分别为97.7%和100%,与田间纯度调查结果具有高度的一致性.从11个SSR标记和8个SRAP标记中分别选出5个SSR和3个SRAP标记组成分子标记组合,构建了均隆油5号油菜亲本、F1代及其它市售42份油菜品种的特征指纹图谱,实现了对不同品种的特异性鉴定.在此基础上建立的数字指纹图谱比对程序实现了对特定品种(品系)指纹图谱的比对分析,可作为杂种纯度分析及假冒伪劣种子判定的参考.【期刊名称】《种子》【年(卷),期】2014(033)008【总页数】5页(P16-20)【关键词】甘蓝型油菜;杂种纯度鉴定;SSR标记;SRAP标记;指纹图谱【作者】史慧娟;赵昭;阳治国;杨朋娜;王茂林【作者单位】四川大学生命科学学院,成都610064;四川大学生命科学学院,成都610064;四川大学生命科学学院,成都610064;四川大学生命科学学院,成都610064;四川大学生命科学学院,成都610064【正文语种】中文【中图分类】S565.4油菜是重要的经济作物,在人民生活和工业生产方面都有着广泛的用途。
我国油菜杂种优势利用途径主要为细胞质雄性不育杂交种,其中以波里马和陕2 A为主,而这2个不育系都属于低温敏感型,在低温条件下雄蕊易形成微粉导致不育系自交产生假杂种,这是影响杂交种纯度的主要原因。
甘蓝型油菜种质群体油和蛋白质含量变异及相关性分析
关键词: 甘蓝型油菜;油含量;蛋白质含量;相关性分析
DOI编码: 10.16590/ki.1001-4705.2019.06.091
中图分类号: S565.4
文献标志码: A
文章编号: 1001-4705(2019)06-0091-04
甘蓝型油菜(B.napus,AACC,2n=38),是 我 国 三 种 油 菜 类 型 之 一 ,也 是 籽 粒 产 量 最 高 的 一 类 ,主 要 种 植在我 国 的 长 江 中 下 游 流 域 。 [1-2] 丰 产 性 高、抗 逆 性 强、抗 病 力 好 和 适 应 性 广 是 甘 蓝 型 油 菜 的 重 要 特 征 。 [3-4] 我国的甘蓝型油菜种质资源匮乏,加强 甘 蓝 型 油菜种质资源的引入 及 筛 选,对 推 进 基 因 资 源 的 开 发 和充分利用,进一步 保 障 油 料 作 物 的 安 全 性 及 促 进 西
相关关系,其 相 关 性 系 数r= -0.65(p<0.01)。 通 过 本 研 究, 筛选出了部分优异 的 种 质 材 料,例 如 高 油 含 量 材 料“林 编12-71”
和“浙 油 50”、高 蛋 白 质 含 量 材 料 “林 编 13-62”和“4E006”及 高 总
含 量 (油 + 蛋 白 质 )材 料 “林 编 12-230”和 “AC21”等 。
收 稿 日 期 :2018-12-15 基金项目:国家自然科 学 基 金 (31560422);贵 州 省 科 学 技 术 基 金 (黔 科
合J字[2015]2052号);国 家 教 育 部 留 学 回 国 人 员 科 研 启 动 基金(教外司留[2015]1098号);贵州大学博士人才引进 基 金 (贵大人基合字[2014]14号);贵州省生物学一流学科建 设 项 目(GNYL[2017]009)。 作者简介:万 薇 (1995—),女 (土 家 族 ),贵 州 铜 仁 人;在 读 硕 士 研 究 生 ,主 要 从 事 油 菜 育 种 与 改 良 ;E-mail:76632182@。 通讯作者:田恩堂(1979—),男,山 东 潍 坊 人;副 教 授,主 要 从 事 油 菜 分 子 育 种 工 作 ;E-mail:erictian121@。
甘蓝型油菜几个种子物理性状与含油率的相关、回归和通径分析
摘要: 选用 6个遗 传特 性 和种 子含 油量 不 同的 甘蓝 型 油 菜品
系, 用完全双列 杂交配制成 3 采 0个 正 反 交组 合 , 种 子 含 油 量 对
其种皮较薄 , 木质素、 纤维素含量较低 J 。因此 , 许 多油菜育种者把选育黄籽品种作为提高油菜种子高含
油量 的重 要育 种途 径 。然 而 , 些 非黄 籽 类 型甘 一 蓝 型油菜 也表 现 出较 高 的含油 量 , 中双 1 如 1号 ( 国审 油 20 00 种 子含 油率 高达 4 .4 , 0 83 ) 90 % 其种皮 为黑 色 ; 蓉油 1( 6 国审 油 200 2 的种 子含油 率 为4 .5 , 0 82 ) 6 8 % 其 种子 颜色 为黑 褐 色 。史仕 军等 曾分 析 指 出 , 菜种 子 油
问题探讨
赵 勤 等: 甘蓝型油菜几个 种子 物理性状与含油率 的相关 、 回归和通径分析
・
问题 探讨 ・
甘蓝 型油菜几个种 子物理性状与含油 率的相关 、 回归 和 通 径 分 析
赵 勤 。 曾德 志 , 郭世 星 , 李 壮 , 牛应 泽 ( 四川农 业大 学农 学 院 , 成都 6 l3 ) 110
C reain, g e so n ah An l sso e e a i h s a h rce sReae o r lt o Re r sin a d P t ay i n S v r lMan P y i lC aa tr lt c
wih S e lCo tn nBr sia n pu t e d Oi n e ti a sc a sL.
130份甘蓝型油菜种质分子身份证的构建
达 到 用 最 少 的 引 物 组合 区 分 不 同 品 种 的 目的 。
关键 词 : 甘蓝型油菜 ; 种 质资源 ; S S R; 核心 引物 ; 分子身份证
摘要: 为准确 区别油菜种质 , 从分布于油菜 1 9个连锁群 上的 4 6 3对 S S R引物 中 , 筛选 出 3 3对扩增清晰 、 稳定
的多态性 引物 , 并用其分析 国内外 1 3 0份甘蓝型油菜材料 , 共检测 到 1 9 1 个 等位变异 , 每对 引物的等位变异数 变幅 为 3~ 9个 , 平均为 5 . 7 8 7 9 ; 有效等位变异数 ( ) 变 幅为 1 . 9 0 6 8~7 . 4 7 9 0 , 平均为 4 . 7 3 0 7 ; 多样性 指数 ( ) 变幅
中国油料作物学报
Ch i n e s e J o u r n a l o f Oi l C r o p S c i e n c e s
2 0 1 3 , 3 5 ( 3 ) : 2 3 1—2 3 9 d o i : 1 0 . 7 5 0 5 / j . i s s n . 1 0 0 7—9 0 8 4 . 2 0 1 3 . 0 3 . 0 0 1
Hale Waihona Puke MA L i n , L I U H a i —z h e n , L U X u—z h o n g , N I J i n— l o n g , Z HA N G X i a o —j u a n , Y AN G J i a n— b o
( 1 . I n s t i t u t e o f R i c e R e s e a r c h , A n h u i A c a d e m y f o A g r i c u l t u r a l S c i e n c e s , H e f e i 2 3 0 0 3 1 ,C h i n a ; 2 . I st n i t u t e f o C o t t o n R e s e a r c h , A n h u i A c a d e m y f o A g r i c u l t u r a l S c i e n c e s , A n q i n g, 2 4 6 0 0 3 ,C h i n a )
甘蓝型油菜特大籽粒新种质创制及评价
3 Y n a n i gi l rlTcn l yPo oi et , n ig6 0 0 , hn ) . u n nf nn A r ut a eh oo rm t nC ne f nn 5 6 0 C ia i g c u g o ri Abta tA t e w yh bi w s ba e s ger a r p n sr c: re— a y r a t n dui al m t esr g—tp u yu8 H ) ee c n h d o i n y u i y eH ao ( 8 ,L gnya d
C HEN W e IJn—fn i,L i e g ,HE Ai u UO Ya —h a ,L h—qn HAO Ka —qn , ig ,Z i i MA F n U F n a g ,Z e g ,DON Y n—sn G u o g ,W A NG ig—qa Jn io
。
( .n uta r e ac stt o u n nA a e yo r utrl c ne, u m n 5 2 5 C i ; 1Id s il o R s r I tue fY n a c dm A il a i c K n i 6 0 0 , hn r C p e h ni f gc u Se s g a
.
s n e d ih v r5. a d s e s we g to e 0g,we e d s o e e r m r ic v r d fo DH i e ft e h b d.Amo h m ln so h y r i ngt e
甘蓝SNP标记开发及主要品种的DNA指纹图谱构建
摘要:【目的】搜集 生产上的主要甘蓝品种,构建基于 SNP标 记的品种指纹 图谱 ,为鉴定甘蓝 品种的特异性、 真实性提供依据。【方法】首先,利用 5O个甘蓝高代 自交系的重测序数据,与甘蓝参考基 因组 (02—12)进行 比对 筛 选 SNP位 点。挑选 多态性较好、在染色体 上均匀分布的 SNP位 点,并将其转化为 KASP标 记,利用 KASP平 台对供试 材料进行检测 ,得到 59个甘蓝品种 的基 因分型数据。根据基 因分型数据,筛选 出多态性信息含 量 (PIC)高、无基 因型数据缺失且在 染色体上均匀分布 的标记作为构建指纹 图谱 的核 心标 记。将核心标记的分型结果转化为 二元编码 数据 ,获得甘蓝品种 SNP—DNA指纹 图谱 。在 59个 甘蓝 品种中随机挑选 15个 品种 ,另外增加 5个未推广的新组合用 于构建人工虚 拟混合群体 ,并利用此群体对甘蓝 品种指纹鉴定技术进行验证,检测核心标记构建的 SNP—DNA指纹图 谱 的准确性与可靠性。【结果 】利用 重测序数据 与参考基 因组 (02-12)进行 比对 开发 SNP标记 ,最终获得 2.54 X 1 0 个 SNP标 记。从中筛选 出 500个 SNP位 点用 于 KASP标记开发 ,平均每条染色体上 55.6个。500个 SNP位 点中有 442 个成功转化为 KASP标记,转化成功率为 88.4%。KASP平台检测结果显示,在 442个 SNP标记中,有 25个位点的未 分型材料数 >5,在后续分析中去除。剩余 417个 SNP位 点的 PIC值 的变化范围为 0.12一O.38,平均值为 0.36,表 现为 中度 多态性 在 59个供试甘蓝 品种中,全部 417个 SNP位点的杂合度大于 30%的有 57个 ,占所 有品种的 96.6%。 其 中,品种 ‘豫生早熟牛心’ 的杂合度 最高 ,为 67.8%。最终筛选 出 50个 SNP位 点作为核心标记 ,并利用这些标 记 构建甘蓝主要 品种的指纹 图谱。50个核心位 点的 PIC值 的变化范围为 0.35一O.38,平均值为 0.36,其 中位 点 Bol2-56 的 PIC值 最高。基 于核心 SNP标记 的聚类分析结果表明,59个 品种的遗传相似系数为 0.43—0.98。利用人工虚 拟混 合群体对核心 SNP标记进行 了验证,结果表明,利用核心标记可对甘蓝品种 的特异性和真实性进行有效鉴定。【结论 】 基于甘蓝 自交系重测序数据进行 比对,共获得 SNP位 点 2.54×1 0 个;从 中筛选获得 5O个核心 SNP标记用于构建 59 个甘蓝品种 的指纹 图谱,并采用人工虚拟混合群体对核心 SNP标记进行 了验证。
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植物遗传资源学报2011,12(6):904-909Journal of Plant Genetic Resources甘蓝型特高含油量油菜种质及其主栽品种的指纹图谱构建赵卫国,王灏,李殿荣,田建华,赵亚军,李保军,王晓东,王爱娜(陕西省杂交油菜研究中心/国家油料作物改良中心陕西油菜分中心,大荔715105)摘要:选择特高含油量资源7份,与中国各油菜主产区具有代表性的主栽品种16份,利用SSR 多引物组合法开展指纹图谱构建研究。
选择多态丰富、图谱清晰稳定且来自不同连锁群的引物28对,对所有材料进行指纹图谱分析,共获SSR 指纹条带302条,其中多态性条带为279条,每引物所获条带6 16条,平均10.79条,平均多态率92.38%,通过指纹图谱将所有材料有效地区别开来。
用非加权类平均法(UPGAM )聚类分析显示,高油材料之间以及高油材料与主栽品种之间遗传距离均有较大差异,在遗传距离0.171处可将23份材料分成9个类群,其中7份高油材料分处4个类群,遗传距离差异显著;而其他8份主栽品种被分别聚类在另外5个类群中,主栽区域特别明显;所有材料间皆具有丰富的遗传多样性,其中高油材料与主栽品种间遗传差异更大。
关键词:甘蓝型油菜;特高含油量;SSR ;指纹图谱构建Fingerprinting Construction of Brassica napus Germplasm with Super-high Oil Content and Main Rapeseed CultivarsZHAO Wei-guo ,WANG Hao ,LI Dian-rong ,TIAN Jian-hua ,ZHAO Ya-jun ,LI Bao-jun ,WANG Xiao-dong ,WANG Ai-na(Shaanxi Hybrid Rapeseed Research Centre /Shaanxi Rapeseed Branch of National oil Crops Genetic Improvement Center ,Dali 715105)Abstract :In this paper ,we selected 7rapeseed germplasms with super-high oil content and 16main rapeseed cultivars from different planted regions to construct their fingerprinting by SSR molecular markers.Using 28SSR primer pairs from different linkage groups ,we totally got 302SSR bands from all materials ,279of which are poly-morphism bands ,each primer amplified 6-16bands with 10.79bands on average ,the average of polymorphism rate reach to 92.38%.By this way ,we could distinguish all the materials effectively.UPGAM analyzing revealed that there were large differences among the high oil content germplasms also between the high oil content germplasms and the main cultivars.At genetic distance of 0.171,the 23B.napus could be divided into nine groups ,in which the super-high oil content germplasms were divided into four groups ,and 8main cultivars were divided into five groups.All the materials had the most abundant genetic diversity ,especially there were large genetic differences be-tween the super-high oil germplasms and the main rapeseed cultivars.Key words :Brassica napus ;High oil content ;SSR molecular markers ;Fingerprinting 收稿日期:2011-02-23修回日期:2011-07-25基金项目:国家“863”项目(2011AA10A104);陕西省自然科学基金项目作者简介:赵卫国,研究实习员,主要从事油菜生物技术的研究。
E-mail :zhaoweiguo0517@ 通讯作者:王灏,副研究员,主要从事油菜生物技术研究。
E-mail :wangzy846@sohu.com 优良的种质资源是作物品种得到不断改良提高的基础。
中国是世界第一油菜生产和消费大国,但是多年来油菜品种生产的含油量却长期徘徊在40%左右[1],比国际上含油量较高的国家如加拿大油菜子低2 5个百分点。
虽然我国春油菜产区油菜子含油量相对较高,达45.78%(干基),但仅占我国油菜子总产量的10% 15%[2]。
据中国农业部油料及制品质量监督检验测试中心对2000-20056期赵卫国等:甘蓝型特高含油量油菜种质及其主栽品种的指纹图谱构建年全国冬油菜测试的327个新品种含油量的检测结果,平均含油量为40.64%。
按目前中国油菜种植面积和平均油菜单产水平及价格,油菜子含油量每提高一个百分点,相当于每hm2增产37.5kg菜子,按中国油菜的种植面积700万hm2计算,每年将增加26.25万吨油菜子,可多榨出10万吨优质菜油,可增创经济效益近9亿元人民币。
因此提高油菜的油份含量已成为油菜育种的重目标[3],也是提高油菜生产效益的关键[4-5],并具有巨大发展潜力。
20世纪80年代以来,油菜育种重点目标多致力于油菜脂肪酸组成和脱脂后饼粕中硫苷总量和组成成分的遗传改良[6],对油菜高含油量育种及其研究较少,一方面可能与种质资源的含油量不高有关,另一方面也与高油品种不高价的市场导向和不够重视有关。
目前在中国要通过品种审定,单位面积的产量和产油量已作为同等重要的量化考察指标,引入审定标准,并在品种推广应用过程中得到越来越多的重视;因此,油菜高含油量方面的相关研究和品种选育近年已发生很大改变,通过审定的品种含油量正在显著提高,高含油量种质资源相继涌现,油菜种质资源的含油量水平不断被刷新,从原来含油量50%左右,到2007年的54.72%[1],再到陕西省杂交油菜研究中心经过15年不懈的努力,最终创造的特高含油量资源含油量达到60%左右,此项含油量突破性的成果由全国十多个大学和科研单位专家组成的以中国工程院院士傅廷栋和官春云为主任委员的鉴定委员会通过鉴定。
这些信息不仅展现了油菜含油量水平提高的巨大潜力,而且也提出了如何有效保护和充分利用这些资源,为高含油量育种服务等重要问题。
要利用资源,首先要了解资源,从分子水平理清种质资源材料间的遗传关系、指纹差异等,并在此基础上再进行深入研究和育种应用以及其后的知识产权保护等无疑具有重要意义。
目前进行指纹分析的方法虽然较多,但技术成熟,方法可靠,结果清晰,可以准确鉴定生物个体之间的差异[7],在成本效率和操控难易程度等上SSR技术更显优势[8]。
SSR标记具有可操作性、精确性、可靠性、鉴别能力强、不受环境影响和高度自动化等优点,使其成为判别植物新品种的较理想技术,对于保护我国名、优、特种质及育成品种的知识产权和育种家们的权益等均有重要应用价值。
SSR分子标记技术已经广泛应用于玉米[9]、大豆[10-11]、水稻[12-13]、谷子[14]等农作物指纹图谱构建和遗传多样性的研究。
SSR标记在油菜的研究中起步较晚,但发展较快,已应用于种质资源多样性分析、指纹图谱构建和纯度分析[15-20]。
因此,本研究利用SSR分子标记技术,对部分甘蓝型特高含油量油菜种质资源和中国主要油菜生产区主栽品种的指纹图谱构建进行方法探讨,也为有效保护和充分利用这批珍贵的特异油菜种质资源,保护知识产权,维护育种家的切身利益提供保障和科学依据。
1材料与方法1.1材料供试材料为陕西省杂交油菜研究中心通过不同生态穿梭育种、多基因聚合及小孢子培养等多种育种技术所获的7份甘蓝型油菜特高含油量种质和16份正在推广应用的甘蓝型油菜品种(表1)。
表1供试材料名称及来源Table1Name and their sources of the tested materials编号No.名称Name来源Source含油量(%)Oil content品种类别Category ofvarieties1M1陕西60.70育种材料2M2陕西59.10育种材料3M3陕西58.90育种材料4M4陕西61.40育种材料5M5陕西58.79育种材料6M6陕西59.10育种材料7M7陕西61.30育种材料8中油821湖北40.00常规品种9蓉油4号四川40.00杂交种10德油4号四川37.85杂交种11德油5号四川39.49杂交种12油研10号贵州46.00杂交种13秦优10号陕西42.76杂交种14宁杂11号江苏43.34杂交种15丰油701湖北41.67杂交种16中双11号湖北49.00杂交种17荣华油2号陕西40.29 45.42杂交种18华油杂10号湖北39.7 41.12杂交种19浙双8号浙江45.86常规品种20滁油1号安徽40.28常规品种21新油杂6号新疆45.00杂交种22浙双6号浙江39.78常规品种23浙双3号浙江42.90常规品种509植物遗传资源学报12卷1.2方法1.2.1SSR 分析体系300对SSR 引物来自The Plant Biotechnology Centre ,由上海Sangon 公司合成。
SSR 反应体系为20μl :10ˑBuffer with (NH4)2SO 42.0μl ,25mmol /L MgCl 21.5μl ,10mmol /LdNTP0.4μl ,5UTaqDNAPolymerase0.2μl ,2.5μmol /L 引物1μl ,20 80ng 模板DNA1.0μl ,ddH 2O 12.9μl 。