细菌的分类及命名[知识研究]
兽医微生物学-细菌的分类及命名
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 – 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 – 如：Escherichia coli
二、细菌的命名
1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The International
Code of Nomenclature of Bacteria)
• 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 • 所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属
名和种名两部分组成，属名在前，第一个字母必须 大写，其余均应小字。整个属名及种名在出版物中 应排成斜体。 如：Escherichia coli 属名+种名
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。
2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法: 待测菌株dsDNA------ssDNA 参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自 身为DNA复性的放射性强度100%
DNA-DNA杂交同源性性 >60%为同种 >70%同一亚种 20~60%为同一属
三、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
细菌的分类与命名
只确定属名， 只确定属名，未确定种名的某一株细菌
Salmonella sp.
只确定属名， 只确定属名，未确定种名的若干菌株
Salmonella spp.
亚种用subsp.表示 表示 亚种用
Pasteurella multocida subsp. septica
第三节 细菌的分类体系
目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 描述了各个属的性状及属内各种的简明比较 。 “国际系统与进化微生物学杂志”（International 国际系统与进化微生物学杂志” Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSEM）是细菌分类命名的世界公认 ） 的权威期刊。 的权威期刊。
第四节 细菌的鉴定
一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。 一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。DNA分子水平的 分子水平的 鉴定主要限于专业实验室或作研究之用 。 1.形态学检查：标本涂片镜检 形态学检查： 形态学检查 2.病原菌分离鉴定 病原菌分离鉴定 分离培养：一般 ℃ 分离培养：一般37℃ 16-24h 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 血清学试验
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。 细菌命名与书写的基本原则。
Escherichia coli 属名 种名 属名+种名 Salmonella pullorum (S. pullorum)
几种不同的书写情况： 几种不同的书写情况：
属名重复出现，可缩写 属名重复出现，
大肠杆菌）； 如：E.coli （大肠杆菌）；
S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌） 鸡白痢沙门氏菌）
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌的分类与命名细菌分类学细菌分类学（taxonomy）是指对细菌进行分类、命名与鉴定的一门学科。
它的任务是在全面了解细菌的生物学特征的基础上，研究它们的种类，探索其起源、演化以及与其他类群之间的亲缘关系，进而提出能反映自然发展的分类系统，并将细菌加以分门别类。
它包括三个方面：分类（classification）、命名（nomenclature）和鉴定（identification）。
一、基本概念1.细菌分类是根据每种细菌各自的特征，并按照它们的亲缘关系分门别类，以不同等级编排成系统。
分类有两种：①以细菌的形态和生理生化特性为依据的表型特征分类法，包括有传统分类法（classical classification）和数值分类法(numerical classification)；②用化学分析和核酸分析，以细菌大分子物质（核酸、蛋白质）结构的同源程度进行分类称种系分类（phylogenetic classification）或自然分类（natural classfication）。
2.细菌命名在分类基础上，给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践和科学研究工作中相互交流成为可能。
按照细菌命名的法规，能保证所有的科研工作者以同样方式给予细菌命名。
3.细菌鉴定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置和已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌的分类地位。
若与已知细菌相同即采用已知菌的名称，不同者则按命名原则确定一个新名称。
二、分类等级细菌的分类等级和其他生物相同，依次为界（kingdom）、门（division）、纲（class）、目（order）、科（family）、属（genus）、种（species）。
细菌属于原核生物界（procaryotae），包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体和螺旋体。
分类等级拉丁字尾比较固定，表示方法如下：目-ales、亚目-ineae、科-aceae、亚科-oideaae、族-eae、亚族-inae。
微生物的分类与命名
微生物的分类与命名微生物是指以肉眼不可见的微小形态存在的生物体，包括细菌、真菌、病毒等多种类型。
对微生物进行分类与命名是为了方便对其进行研究和了解其特性。
本文将介绍微生物的分类与命名，包括细菌、真菌和病毒的分类方法及相应的命名规范。
一、细菌的分类与命名细菌是最常见的一类微生物，广泛存在于自然环境中。
细菌的分类主要基于形态、生理特性、生长条件、代谢方式等多个方面。
1. 形态分类根据细菌的形态特征，可以将其分为球菌（cocci）、杆菌（bacilli）、弧菌（vibrios）、螺旋菌（spirilla）等类型。
其中，球菌为球状或椭圆状，杆菌为长形或短杆状，弧菌为弧形，螺旋菌为螺旋形。
2. 生理特性分类细菌的生理特性也是分类的重要指标之一。
比如，光合细菌（photosynthetic bacteria）能利用光合作用合成有机物质，厌氧细菌（anaerobic bacteria）能在缺氧条件下生存和繁殖。
3. 生长条件分类根据细菌的生长条件不同，可以将其分为嗜热菌（thermophile）、嗜酸菌（acidophile）、嗜盐菌（halophile）等类型。
嗜热菌适应高温环境，嗜酸菌适应酸性环境，嗜盐菌适应高盐浓度环境。
细菌的命名通常遵循国际细菌命名法规定的规范。
该规范要求使用拉丁文或拉丁化的词根作为细菌的属名（genus），并加上表征特定种类的表名（specific epithet）。
例如，大肠杆菌（Escherichia coli）中，“Escherichia”为属名，“coli”为表名。
二、真菌的分类与命名真菌是一类具有真核细胞结构的微生物，包括酵母菌和霉菌等。
真菌根据其生活方式、营养特性和菌丝形态等进行分类。
1. 营养分类真菌的营养方式主要分为 saprophytes（腐生菌）和 parasites（寄生菌）。
腐生菌通过分解死物质为自己提供营养，寄生菌则寄生于其他寄主生物体上。
2. 菌丝形态分类真菌的菌丝形态也是分类的依据之一。
细菌的分类与命名
细菌的分类方法
传统分类法是临床细菌学检验的基础和依据。这种分
类法的参考书是：
Bergey’s manual of systemic bacteriology
Manual of clinical microbiology
世界畅销书
Diagnostic microbiology
全国临床检验操作规程
中文教科书
标准菌株的用处
(1)标准菌株的典型特征是实验室菌株分 类和鉴定的依据，其种名也是实验室菌 株命名的依据。 (2)标准菌株是临床细菌学检验质量控制 的标准。 (3)在科研中，如涉及细菌，必须使用标 准菌株作为参考菌株或直接使用标准菌 株作为实验材料，否则论文不能公开发 表或不能参加科研成果评定。
2．细菌的命名
(2)数值分类法：分类标记不分主次，而是同等重要看
待（等重要原则）。一般要选用50项以上的生物学特
征作为分类的依据，此分类法是细菌鉴定仪器化、自
动化、电算化的基础和原则，此法称数值分类法。
2．遗传学分类法：CDC分类系统
(1)DNAG+Cmol%测定：用加热变性法测定 两株菌G+Cmol%鉴别 1)不同属:两株菌DNAG+Cmol%相差1015%及以上 2)同属:两株菌DNAG+Cmol%之差<10-15% 3)同种不同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 ≤4-5% 4)同种同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 <2%
因为细菌的分类常使用科、属、种、型等分类单位，
细菌的科、属、种、型的数量大，为满足细菌分类需
要，常要求对细菌的科、属、种等进行命名，如
沙门
福氏志贺菌
志贺菌属 鲍特志贺菌
细菌的分类与命名(最全版)PTT文档
微生物亚种以下的变型分类
亚种以下
生物变型——表示特殊的生化或生理特征
血清变型——表示抗原结构不同 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 形态变型——表示特殊的形态特征
微生物的菌株
菌株(Strain)或称品系 是指同种微生物不同来 源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以 数字、字母、人命或地名等表示
分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的 后代即为分离物
群(Group)
为工作方便而将近似的种或介于
种间的菌株按其形态或结合生理生化、生态特征
归为若干类群。如放线菌中的链霉菌属内的种归
生理生化、G + C mol%、系统发育地位等 5．抗原构造：O、K、H
门（Phylum or Division）
为主——体现了现代分子生物学的研究成 属（Genus）
《伯杰氏系统细菌学手册》 3．生活方式：自主生活，共生，寄生
果 尚未出齐 分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中
细菌的分类与命名
微生物分类鉴Байду номын сангаас目的
分类是人类认识微生物，进而利用和 改造微生物的一种手段，微生物工作者只 有在掌握了分类学知识的基础上，才能对 纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解 其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用 微生物资源提供依据
第一节 微 生 物 分 类 学
微生物分类学(Taxonomy)是一门按微生物类群的 亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元 或分类群（Taxon）的科学
细二胞、形 微态生水物平的的 命色名 素、形状、来源、病名、地名、某科学家的
细菌的分类及命名ppt课件
五、细菌的鉴定 ➢ 纯培养细菌才能进行鉴定。DNA分子水
平的鉴定主要限于专业实验室； ➢ 常规细菌鉴定沿用表型特征检测方法；
有成套检测指标的快速诊断试剂盒 商品化的细菌鉴定试剂盒有Enteotube
系统、API系统、Vitek系统等。 ➢ 有条件的单位可用PCR技术检测鉴定
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1、分类方法 数值分类法：根据细菌的各种性状的数值
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例如 大肠埃希菌的学名全名是： Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
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金黄色葡萄球菌的学名为：
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四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
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2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
巴氏杆菌
拟杆菌
螺旋状菌
钩端螺旋体 蛇形螺旋体 密螺旋体 疏螺旋体
丝状菌
坏死杆菌
MZN染色阴性
布氏杆菌属 鹦鹉热衣原体
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3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写，用 第一个字母，为避免混肴，也可用2个 字母。大肠杆菌(E.coli)
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微生物检验知识之细菌的分类与命名
微生物检验知识之细菌的分类与命名细菌如何分类你知道吗?你对细菌的分类了解吗?下面是yjbys小编为大家带来的关于细菌的分类的知识，欢迎阅读。
一、微生物在生物化学分类中的地位(一)细菌与原核生物界细菌、衣原体、立克次体、螺旋体、放线菌、支原体归属于原核生物界其分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种(二)真菌与真菌界真菌是真核细胞型微生物，归属真菌界(三)病毒与病毒界病毒没有典型的细胞结构，归属于病毒界病毒的分类等级依次为科、属、种二、细菌的分类单位、系统和命名(一)细菌的分类单位细菌的分类等级为界、门、纲、目、科、属、种。
临床细菌检验常用的分类单位是科、属、种。
种是细菌分类的基本单位。
形态学和生理学*状相同的细菌群体构成一个菌种;*状相近、关系密切的若干菌种组成属;相近的属归为科，依次类推。
标准菌株：具有该种细菌典型特征的菌株在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据标准菌株也可作为质量控制的标准(二)细菌的命名采用拉丁文双命名法：属名(名词大写)+种名(形容词小写)(印刷用斜体)例:Mycobacteriumtuberculosis中文名:种名+属名例:结核分枝杆菌(三)细菌的分类系统目前*上普遍采用伯杰分类系统。
也有采用CDC(美国疾病预防和控制中心)分类系统。
三、细菌的分类方法(一)生理学与生物化学分类法1.传统分类法原则：生物的基本*质主次原则。
按细胞形态、革兰染**、鞭毛及代谢特点作为较高一级分类依据。
科、属、种的分类主要依靠生化特*和抗原结构。
2.数值分类法原则：细菌的基本*质同等重要原则采用标准化、成品化和配套生化反应试剂条，检测细菌的数十个生理生化特*。
*阳*结果—数字—电子计算机进行计算—比较、测定相似度—区分细菌的种群—确定细菌亲缘关系(二)遗传学分类法以细菌的核*、蛋白质等在组成上的同源程度分类。
目前较为稳定的遗传学的分类方法有下列几种：1.DNAG+Cmol测定，简称G-C比。
细菌的分类和命名
Medical Microbiology）医学微生物学（细菌生理学Bacterial Physiology学习目标●掌握：两个规律、三培养基、四个分期、五类条件和六种产物。
●熟悉：繁殖所需的营养物质，细菌对体内、外环境的广泛适应性，细菌的免疫系统，人工培养细菌的用途，细菌的分解代谢及其生化反应和用途，以及细菌分类和命名细菌在体外生长繁殖所需的五类条件细菌个体和群体的生长繁殖规律细菌群体的生长曲线的四个分期三种不同物理性状的培养基及其接种方法和用途细菌合成代谢产生的六种特殊的代谢产物及其医学意义补充学习和理解细菌的分类和命名Bacterial Classification and Nomenclature1. 细菌分类学（Bacterial Taxonomy）的定义●是对细菌进行分类的学科，是认识细菌最基本的方法，建立历史悠久且不断发展；包括三个相互关联的领域:细菌的分类（classification)：依据细菌特性的相似性,对细菌分类并建立分类的理论基础和方法细菌的命名（nomenclature）：给予细菌特定的分类等级和名称细菌的鉴定（identification)：鉴定细菌的特性并将其分类2. 细菌的分类层次和定义●属(Genus) ：由性状相近、关系密切的若干菌种组成;●种(Species)：由生物学性状基本相同的细菌群体构成; 生物真核生物域古生菌域(Archarea Domain):原核生物界(Kingdom); 2门。
未发现病原菌细菌域(Bacteria Domain):原核生物界(Kingdom); 24门(Phylum); 纲(class),目(order),科(family),属,种型(Type)：同一菌种的各个细菌，在某些特性方面仍可有差异，如抗原结构不同分血清型（serotype);对噬菌体的敏感性不同分噬菌体型（phage-type); 生化反应差异分生物型（biotype);等。
细菌的分类及命名
细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并 按照亲缘关系分类，以不同等级编排系 统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传 统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法，称种系分类或自然分类。
2、细菌命名：在分类基础上，给每种 细菌一个科学名称，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位。
产芽胞
梭菌 芽胞杆菌 炭疽杆菌
抗酸染色阳性
分支杆菌 牛分支杆菌和禽分支杆菌 鼠麻风杆菌 副结核分支菌
无芽胞
棒状杆菌 化脓放线菌
抗酸染色阴性 马红球菌
产单核李氏杆菌
猪丹毒杆菌
丝状或树枝状
MZN染色阴性
牛放线菌 粘性放线菌
MZN染色阳性
星形奴卡菌 刚果嗜皮菌
革兰氏阴性细菌
球菌/球杆菌
耐瑟菌 生摩拉菌 不动杆菌
292230革兰氏阳性细菌革兰氏阳性细菌球菌杆菌丝状或树枝状葡萄球菌链球菌粪肠球菌微球菌mzn染色阴性mzn染色阳性牛放线菌粘性放线菌星形奴卡菌刚果嗜皮菌抗酸染色阳性抗酸染色阴性芽胞杆菌炭疽杆菌分支杆菌牛分支杆菌和禽分支杆菌鼠麻风杆菌副结核分支菌棒状杆菌化脓放线菌马红球菌产单核李氏杆菌猪丹毒杆菌31革兰氏阴性细菌革兰氏阴性细菌球菌球杆菌杆菌mzn染色阴性mzn染色阴性弧状杆菌中等大小杆菌螺旋状菌丝状菌弯曲菌弧菌不动杆菌肠杆菌科假单胞菌波氏杆菌放线杆菌嗜血杆菌巴氏杆菌拟杆菌钩端螺旋体蛇形螺旋体密螺旋体疏螺旋体坏死杆菌布氏杆菌属鹦鹉热衣原体
四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
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着研究的深入科属的划分会发生变动
专业知识
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1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 （ strain ） 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
专业知识
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一、细菌分类学——对细菌进行分类， 命名与鉴定的 一门学科。
任务：
•在全面了解细菌生物学特征的基础上， 研究它们的种类，探索其起源，演化以 及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细
专业知识
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例如 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
专业知识
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金黄色葡萄球菌的学名为：
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
专业知识
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3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写，用 第一个字母，为避免混肴，也可用2个 字母。大肠杆菌(E.coli)
专业知识
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5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
专业知识
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6、如果是新种，在新种的拉丁文学名之 后还要加上“sp.nov。”，nov是novel 的缩写。 例如Lawsonia intracellularis gen．Nov. sp . Nov.，译为：胞内劳 森菌，新属新种。
专业知识
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7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是 subspecies的缩写， 例如Pasteurella multocida subsp．septica，中译名为多杀性巴 氏杆菌败血亚种。
专业知识
4
二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界， 现在划为：原核生物
古菌 细菌
在兽医微生物中，古细菌不占重要 地位
专业知识
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2、细菌还包括
衣原体、立克次氏体、霉形体、 螺旋体、放线菌等→对动物和人 具有致病作用
蓝细菌、紫色光合细菌等
专业知识
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专业知识
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3、细菌的分类单元
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
界 Kingdom (拉：Regnum)
门 Phylum (拉：Phylum))
纲 Class (拉：Classis)
目 Order (拉：Ordo)
科 Family (拉：Familia)
属 Genus（拉：Genus）
种 Species（拉：Species）
科及科以上的划分在细菌不太完善，且随
专业知识
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四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的
作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有
应用价值。
专业知识
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2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
属名在前，字首字母要大写，其余小写
整个属名及种名在出版物中应排成斜体
中文译名，种名在前，属名在后
专业知识
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2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 如：Escherichia coli
金黄色葡萄球菌的学名为 命名年份
Staphylococcus aureus Rosenbach
1884 属名葡萄球菌 种名金黄色 命名人的姓
专业知识
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恶臭消化链球菌的学名
改名者
Peptostreptococcus foetidus （ Veillon ）Smith
属名消化链球菌 种名恶臭 原命名者
专业知识
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2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法:
待测菌株dsDNA------ssDNA
参照菌株，同位素标记的ssDNA
检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自
专业知识
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三、细菌的命名
1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The
International Code of Nomenclature of Bacteria)
学名用拉丁文，遵循“双名法”。 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分
组成如：产气荚膜梭菌（Clostridium perfringens）
菌加以分门别类。
专业知识
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细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并 按照亲缘关系分类，以不同等级编排系 统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传 统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法，称种系分类或自然分类。
专业知识
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2、细菌命名：在分类基础上，给每种 细菌一个科学名称，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位。
研究细菌的种系发生关系主要采用三种 方法：
1）测定DNA碱基(G+C)mol％
2）核酸分子杂交
3）16SrRNA寡核苷酸编目
专业知识
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1）DNA碱基G+C%比例的测定
简称GC比 （G+C）%=—G—+C———×100%
A+T+G+C
亲缘关系相近的种ＧＣ比也相近， ＧＣ比差别大亲缘关系必然远 种内差距2.5~4.0％, 种间>5%, 属间 差距>10%