细菌的分类及命名[知识研究]

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例如 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
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金黄色葡萄球菌的学名为：
菌加以分门别类。
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细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并 按照亲缘关系分类，以不同等级编排系 统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传 统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法，称种系分类或自然分类。
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2、细菌命名：在分类基础上，给每种 细菌一个科学名称，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位。
研究细菌的种系发生关系主要采用三种 方法：
1）测定DNA碱基(G+C)mol％
2）核酸分子杂交
3）16SrRNA寡核苷酸编目
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1）DNA碱基G+C%比例的测定
简称GC比 （G+C）%=—G—+C———×100%
A+T+G+C
亲缘关系相近的种ＧＣ比也相近， ＧＣ比差别大亲缘关系必然远 种内差距2.5~4.0％, 种间>5%, 属间 差距>10%
金黄色葡萄球菌的学名为 命名年份
Staphylococcus aureus Rosenbach
1884 属名葡萄球菌 种名金黄色 命名人的姓
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恶臭消化链球菌的学名
改名者
Peptostreptococcus foetidus （ Veillon ）Smith
属名消化链球菌 种名恶臭 原命名者
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四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的
作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有
应用价值。
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2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
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三、细菌的命名
1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The
International Code of Nomenclature of Bacteria)
学名用拉丁文，遵循“双名法”。 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分
组成如：产气荚膜梭菌（Clostridium perfringens）
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6、如果是新种，在新种的拉丁文学名之 后还要加上“sp.nov。”，nov是novel 的缩写。 例如Lawsonia intracellularis gen．Nov. sp . Nov.，译为：胞内劳 森菌，新属新种。
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7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是 subspecies的缩写， 例如Pasteurella multocida subsp．septica，中译名为多杀性巴 氏杆菌败血亚种。
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2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法:
待测菌株dsDNA------ssDNA
参照菌株，同位素标记的ssDNA
检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自
界 Kingdom (拉：Regnum)
门 Phylum (拉：Phylum))
纲 Class (拉：Classis)
目 Order (拉：Ordo)
科 Family (拉：Familia)
属 Genus（拉：Genus）
种 Species（拉：Species）
科及科以上的划分在细菌不太完善，且随
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
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3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写，用 第一个字母，为避免混肴，也可用2个 字母。大肠杆菌(E.coli)
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5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
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一、细菌分类学——对细菌进行分类， 命名与鉴定的 一门学科。
任务：
•在全面了解细菌生物学特征的基础上， 研究它们的种类，探索其起源，演化以 及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细
着研究的深入科属的划分会发生变动
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1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 （ strain ） 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
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二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界， 现在划为：原核生物
古菌 细菌
在兽医微生物中，古细菌不占重要 地位
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2、细菌还包括
衣原体、立克次氏体、霉形体、 螺旋体、放线菌等→对动物和人 具有致病作用
蓝细菌、紫色光合细菌等
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3、细菌的分类单元
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
属名在前，字首字母要大写，其余小写
整个属名及种名在出版物中应排成斜体
中文译名，种名在前，属名在后
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2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 如：Escherichia coli