乙醇脱氢酶―1B(ADH1B)基因的生物信息学分析
乙醇脱氢酶Ⅰ基因敲除的酿酒酵母重组菌构建的初步研究
参考文献:
M为分子量标准(DL 2000,天为时代);泳道l和2均为扩增的样品
分子量为1023bp。
图4
以HyBl和H[yB2为引物扩增转化酵母基因组结果
筛选抗性菌落。结果显示(图3),有部分菌株可以在含 有潮霉素的平板上生长,表明其体内含有潮霉素抗性,
而在空白对照平板上(未涂有100 p g,ml潮霉素)没有菌落 生成。
利用酵母基因组提取试剂盒,提取转化后酵母及野 生酵母的基因组DNA,以HyBl和HyB2引物进行PCR 扩增。结果发现(图4),在酵母基因组上,扩增出本实 验所需要的片段1026bp,说明外源基因已经整合到酵母 基因组上。 2.5 发酵实验
酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)做为传统的乙醇生产菌株,具有乙醇耐受性强,发酵工艺成熟,工业应用范围广泛,与其它微生物比较生物 安全性好等特点。同时,酿酒酵母是第一个基因组完成测序的真核生物,遗传背景非常清楚,由于其体内具有高效的同源重组机制,在分子和基因水平
进行操作非常容易。在实际工业生产中,为了降低发酵工艺成本、实现高效的转化率和产出率,菌种的优劣在整个生产流程中尤为重要。因此,菌种的 选育必须以降低生产耗资与高产出为原则。近年来,依据代谢工程理念,应用分子生物学手段对酿酒酵母进行分子育种是主要的研究方向,其中,尤为 突出的是重组DNA技术。应用代谢工程理念使用基因工程手段对菌种改造过程中,敲除或过表达特定基因可以阐明该基因功能,改变代谢途径,从而提高 目标产物产量。同时,该突变株为进一步探索目的基因的转录调控机制、基因与蛋白质相互作用以及分子信号传导通路等提供了理想材料,并为进一步 从基因和分子水平改进酿酒酵母乙醇代谢途径,构建优良性状高产乙醇生产菌奠定了基础。本研究利用酿酒酵母细胞内的同源重组机制,运用基因敲除 和过表达技术,降低了由乙醛生成乙酸的分解代谢流,并在此基础上增强了己糖代谢率。与原始出发菌株相比,不仅提高了乙醇产量,而且缩短了发酵 周期,提高了发酵产率。研究内容如下:
微生物遗传学
从图3可以看出,ADH在pH值为7.0时较为稳定。
酶的最适作用温度
将酶液与底物分别在20℃、25℃、30℃、35℃、37℃、 40 ℃、 45 ℃、50℃、 55℃下反应一段时间 , 测定 ADH 酶活力 , 结果见图4。
从图4可以看出,温度为37℃时ADH酶活力最高。
酶的热稳定性
将酶液分别经30℃、35℃、40℃、45℃、50℃、55℃、 60℃热处理30 min,测定剩余酶活力,结果见图5。
酶的最适作用pH值
在pH值为4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0、11.0 的缓冲溶液中进行酶活力的测定,结果见图2。
从图 2 可以看出 ,ADH 的最适作用 pH值在 7.0~ 10.0,pH值 约为8.0时酶活力最大。
酶的pH值稳定性
将 ADH置于pH值分别为4.0、5.0 、6.0 、7.0、 8.0、9.0、 10.0、 11.0 的缓冲溶液中 ,30℃保温 2h,测定剩余酶活力 ,结 果见图3。
乙醇脱氢酶乙醇氧化体系是在肝脏中代谢酒精的一条主 要途径。乙醇脱氢酶氧化体系包括醇脱氢酶 (ADH) 和醛脱氢 酶(ALDH)。参与体内乙醇代谢,是重要的代谢酶。 乙醇在人体内的代谢主要靠体内的两种酶 , 一种是乙醇 脱氢酶,另一种是乙醛脱氢酶。前者使乙醇转化为乙醛 ,后者
使乙醛进一步转化为乙酸 ,最终分解为二氧化碳和水,由此可
b
双水相沉淀
双水相系统是指某些高聚物之间或高聚物与无机盐之间
在水中以适当的浓度溶解会形成互不相溶的两水相或多水相 系统。
双水相萃取法近年来已用于对生化物质的分离,其利用
生化物质在互不相溶的两相中的分配系数不同,而使目标分 子浓缩在一相中从而达到纯化的效果。
乙醇脱氢酶Ⅰ类基因全长cDNA的克隆与表达
乙醇脱氢酶Ⅰ类基因全长cDNA的克隆与表达周文婷;崔羽;王晓燕;张永红;李世荣;李景鹏【期刊名称】《东北农业大学学报》【年(卷),期】2007(038)005【摘要】Ⅰ类乙醇脱氢酶(ADH)在乙醇的肝代谢中发挥重要作用,由ADH1,ADH2和ADH3组成.根据序列数据设计一对引物,利用RT-PCR同时克隆乙醇脱氢酶Ⅰ类基因全长cDNA.测序后的cDNA被克隆在表达载体pTYB11上并在大肠杆菌中稳定表达.纯化获得的酶通过其在340 nm处吸光值的变化进行酶活性测定.经检测重组ADH1,ADH2和ADH3的酶活力分别为2.0±0.3,0.8±0.2,1.5±0.2 U·mg-1.【总页数】4页(P624-627)【作者】周文婷;崔羽;王晓燕;张永红;李世荣;李景鹏【作者单位】东北农业大学生命科学与生物技术中心,哈尔滨,150030;东北农业大学生命科学与生物技术中心,哈尔滨,150030;哈尔滨医科大学附属第四医院检验科,哈尔滨,150001;东北农业大学生命科学与生物技术中心,哈尔滨,150030;东北农业大学生命科学与生物技术中心,哈尔滨,150030;东北农业大学生命科学与生物技术中心,哈尔滨,150030【正文语种】中文【中图分类】Q786【相关文献】1.乙醇脱氢酶Ⅰ类基因全长cDNA的克隆与表达 [J], 周文婷;李景鹏;崔羽;张永红;李世荣2.白鸡冠茶树CsPPH基因全长cDNA克隆与表达分析 [J], 周喆; 陈志丹; 吴全金; 徐一岚; 孙威江3.人类PKNOX_1基因一种新剪接型全长cDNA的克隆与表达分析 [J], 倪斌;李麓芸;殷照初;邹永华;李辉4.牡丹类psDHN-YSK_2基因全长cDNA的克隆与表达分析 [J], 张扬;盖树鹏;刘春英;郑国生;华芳霞;张玉喜5.人类基因国际协作研究组成功克隆出2.1万多个人类功能基因全长cDNA中国科学家完成其中1.8%的功能基因克隆工作 [J],因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
乙醇脱氢酶―1B(ADH1B)基因的生物信息学分析
乙醇脱氢酶―1B(ADH1B)基因的生物信息学分析摘要:本研究通过对ADH1B编码基因产物的亚细胞定位、信号肽、疏水性等预测,分析其基因编码蛋白的功能。
结果显示,ADH1B编码基因产物为亲水性蛋白,不具备信号肽和跨膜结构。
二级结构以α-螺旋与无规则卷曲为主。
序列分析表明,ADH1B 基因编码产物很可能在免疫应答中起到关键作用。
关键字:ADH1B基因;生物信息学;结构与功能乙醇脱氢酶乙醇氧化体系是肝脏中代谢酒精的一条主要途径。
乙醇脱氢酶氧化体系包括醇脱氢酶(ADH)和醛脱氢酶(ALDH)。
国内外研究发现ADH和ALDH都是多个同工酶组成的大家族,现有研究已发现ADH包括ADH1A、ADH1B、ADH1C、ADH4、ADH5、ADH6和ADH7共7个基因。
根据ADH同工酶的电泳泳动度、动力学特性、对酒精的亲和力和是否受四甲基吡唑的抑制将ADH分为5种类型,ADH1A,ADH1B和ADH1C为I型,ADH4,ADH5,ADH7和ADH6分别为Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ和V型。
ADH1B 和ADH1C还具有基因多态性。
1 分析原理与方法从GenBank数据库中获得ADH1B基因及其同源蛋白质基因;采用DNAMAN及DNA Star软件预测分析理化性质;用ProtScale在线软件分析疏水性和亲水性;采用SignalP3.0预测蛋白信号肽;用PSORT Ⅱ软件进行亚细胞定位分析;用在线分析软件PBIL和SWISS―MODEL预测二级和三级结构。
2 分析过程与结果2.1 ADH1B基因编码产物的理化性质用Bioedit及DNA Star分析软件对乙醇脱氢酶-1B(ADH1B)基因编码产物的理化性质进行预测,由ADH1B基因的氨基酸组成可知,ADH1B基因编码375个氨基酸,组成中最多的氨基酸是Val(缬氨酸),所占比例为10.40%;在pH7.0环境下其电荷量偏低、为-13.732;其理论分子量为39.833 kD,理论等电点为8.53。
乙醇脱氢酶I基因敲除的酿酒酵母重组菌 构建的初步研究
2008, Vol. 29, No. 02食品科学※生物工程210收稿日期:2007-01-15基金项目:黑龙江省科学技术厅青年基金项目(QCO4C33);黑龙江省教育厅一般项目(10551233); 黑龙江大学青年基金项目(QL200435)作者简介:葛菁萍(1972-),女,教授,博士,研究方向微生物学。
E-mail:gejingping512@yahoo.com.cn*通讯作者:平文祥(1959-),男,教授,学士,研究方向微生物学。
E-mail:wenxiangp@yahoo.com.cn乙醇脱氢酶I基因敲除的酿酒酵母重组菌构建的初步研究葛菁萍,宋 刚,孙宗祥,凌宏志,蔡柏岩,刘松梅,平文祥*(黑龙江大学 微生物黑龙江省高校重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150080)摘 要:本实验根据酿酒酵母乙醇代谢途径,构建一株低乙醇产量的酿酒酵母基因工程菌株,以满足人们对低醇啤酒的需要。
利用抗性基因筛选基因敲除突变体的方法,通过引物L1和L2扩增潮霉素B基因(两翼与酿酒酵母同源),按常规醋酸锂法转化酵母细胞后,筛选标记与酵母adh I基因发生同源重组,得到一株ADH I酶活性降低的工程菌株。
发酵实验结果表明,转化菌株乙醇含量平均值为1.8%(V/V),较原始菌株低了65%。
说明转化菌株体内乙醇生成途径受到干扰。
关键词:酿酒酵母;基因敲除;乙醇脱氢酶IPreliminary Study on Deletion of Saccharomyces cerevisiae Alcohol Dehydrogeniase I GeneGE Jing-ping,SONG Gang,SUN Zong-xiang,LING Hong-zhi,CAI Bai-yan,LIU Song-mei,PING Wen-xiang*(Heilongjiang Key Laboratory of Microbiology, College of Life Science, Heilongjiang University, Harbin 150080, China)Abstract :The main purpose of this research is to construct a low alcohol producing strain according to the alcohol metabolicpathway of Saccharomyces cerevisiae, so as to satisfy the people who prefer to drink low-alcohol beer. Hygromycin B resistantgene was used to screen mutants with adh I gene knocked out. After Hygromycin B resistant gene was amplified with primersL1 and L2 (the flanking fragments were complement with Saccharomyces cerevisiae gene), it was transformed into yeast HDY-01 by LiAc method and the alcohol dehydrogenase I (ADH I) in Saccharomyces cerevisiae was deleted through homologousrecombination. A transformant was obtained with low ADH I activity. The fermentation tests showed that the average alcoholcontent of the transformant is 1.8%(V/V), 65% lower than the origin one. The alcohol metabolic pathway in this transformantis interfered.Key words:Saccharomyces cerevisiae;gene deletion;alcohol dehydrogenase I (ADH I)中图分类号:TS2625 文献标识码:A 文章编号:1002-6630(2008)02-0210-03啤酒是以麦芽为主要原料,添加酒花,经酵母发酵酿制而成的,是一种含二氧化碳、起泡和低酒精度的饮料酒[1]。
不对称催化醇脱氢酶的生物信息学分析
J . N LO N JN U V ̄ IYO 】 O ̄ A R F AN I G N1 t T F DW V 2 d. 8No2 21 .朋 02
一
1 65
不 对 称 催 化 醇 脱 氢 酶 的生 物信 息 学 分 析
T c n lg e h oo y,Ch n a ma e tc lUn v riy,Na Jn 2 0 0 Ch n ) ia Ph r cu ia ie st n i g, 1 0 9, ia
AB TRACT: J TI To a a y e a d p e itt e p y ia n h m ia h r ce it s o c h l e y r g n s ( S OB EC VE n lz n r d c h h sc la d c e c lc a a trs i f Alo o h d o e a e ADH ) c d fo Rh d c c u r t r p ls M E r m o o o c s y h o o i . e THODS Th e u n e a ay i n h e i e so a o l g d l g o es q e c n l ssa d t r e dm n i n l mo o y mo ei f h n ADH sc r wa a — re u y m u tp eb o n o ma is t o s i o lwi g a p c s sg a e t e , r n me b a et p lg c l t u t r s y r p o id o t li l i i f r tc o l n f l b o n s e t : i n lp p i s t a s m r n o o o ia r c u e ,h d o h — d s b ct r h d o h l iy e o d r t u t r f ADH ,t r e d me so a t u t r s p e it d b o l g o ei g. i i o y r p i ct ,s c n a y s r c u e o y i h e - i n i n ls r c u e wa r d c e y h mo o y m d l n RE—
酒精代谢相关酶基因检测 项目简介
酒精代谢相关酶基因检测项目简介一个人的酒量85%是先天决定,而不是后天训练的,机体摄入的酒精90%以上在肝脏内主要靠乙醇脱氢酶(ADH)和乙醛脱氢酶(ALDH)进行代谢。
对酒精代谢相关酶基因检测:可以发现ADH1B和ALDH2基因的多态性,评估人体内乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶的活性高低,从而评价个体对酒精的耐受性。
检测结果的临床意义1、检测基因型为ADH1B*2/*2(有活性),ALDH2*1/*1(有活性),那么酒精在体内就可迅速变成乙酸而代谢排出,也就是真正的“酒篓子”。
2、检测基因型为ADH1B*1/*1(无活性)或ADH1B*1/*2(活性降低),ALDH2*2/*2(无活性)或ALDH2*1/*2(活性降低),那么乙醇主要靠肝脏里的P450慢慢氧化,易伤肝,经常会突然烂醉如泥。
3、检测基因型为ADH1B*2/*2(有活性);ALDH2*2/*2(无活性)或ALDH2*1/*2(活性降低),此类人群能迅速将乙醇转化成乙醛,乙醛使心率加快,外周血管扩张,心排血量增加,面部潮红,而乙醛只能依靠肝脏里的P450慢慢代谢为乙酸。
基因型与酒精耐受性关系1、基因型为ADH1B*1/*1:乙醇转化为乙醛的速度慢,容易导致酗酒。
2、个体对酒精的耐受性主要受ALDH2基因型的影响:基因型为ALDH2*1/*1:对酒精耐受性高基因型为ALDH2*1/*2:对酒精有一定的耐受性基因型为ALDH2*2/*2:对酒精敏感,没有耐受性标本采集要求1、EDTA抗凝全血3-5ml,2~8℃保存,当天送检。
2、送样时,请写清楚送检单位、姓名、性别、年龄、联系方式、科室等基本信息。
3、注意事项:该项目血液标本不得使用肝素抗凝,避免标本凝固。
临床项目收费标准。
乙醇脱氢酶应用研究现状及前景5.3课件
一、简介 二、发现 三、物化性质 四、乙醇脱氢酶的类型 五、临床意义 六、研究现状 七、展望
一、简介
乙醇脱氢酶
(Alcohol dehydrogenase, 简称ADH),大量存在于人和 动物肝脏、植物及微生物细胞 之中,是一种含锌金属酶,具 有广泛的底物特异性。乙醇脱 氢酶能够以烟酰胺腺嘌呤二核 苷酸(NAD)为辅酶,催化伯醇 和醛之间的可逆反应: CH3CH2OH+ NAD+→ CH3CHO +NADH+ H+。在人 和哺乳动物体内,参与体内乙 醇代谢,是重要的代谢酶。乙 醇脱氢酶氧化体系包括醇脱氢 酶(ADH)和醛脱氢酶(ALDH)。
6.2、乙醇脱氢酶的初步分离及其酶学性质的研究
化学与生物工程
吴桂英 2009/06
以硫酸铵为沉淀剂,采用盐析法对乙醇脱氢酶(ADH)进行了初步的分离 纯 化,ADH比活力从粗酶液的0.464 U.mg-1提高到1.198 U.mg-1,纯化倍数 为2.582。研究了ADH的基本酶学性质,其最适作用pH值为7.0~10.0,pH值 为8.0时酶活力达到最大,pH值为7.0时酶较为稳定;最适作用温度为37℃,温 度为30~40℃时酶活力较为稳定,温度超过45℃后酶活力急剧下降。
三、物化性质
ADH的最适作用pH值在7.O~10.0,pH值 为8.O时酶活力达到最大,pH值为7.0时酶 活力较为稳定;
ADH的最适作用温度为37℃,温度为30~40℃ 时酶活力较稳定,温度超过45℃后酶活力急剧 下降。
四、乙醇脱氢酶的类型
4.1、人类的乙醇脱氢酶 4.2、酵母与细菌中的乙醇脱氢酶 4.3、含铁乙醇脱氢酶 4.4、其他类型的醇脱氢酶 进一步的醇脱氢酶类属于五重酶(quinoenzymes),并且需要 醌型辅因子结合电子,这种酶的典型例子是甲醇的甲醇细菌脱氢酶。
乙醇脱氢酶基因检测方法
乙醇脱氢酶基因检测方法嘿,你知道不?前几天我在学校听老师讲了一个超厉害的东西,叫乙醇脱氢酶基因检测。
哇塞,这到底是啥玩意儿呢?咱一起来瞧瞧呗!检测乙醇脱氢酶基因,那可不是一件随随便便的事儿哦。
首先呢,得去医院或者专门的检测机构。
医生会拿一个小棉签,在你的嘴巴里轻轻刮一刮,就像我们平时吃棒棒糖,不小心把糖粘在嘴巴里,然后用舌头去舔那个感觉差不多啦。
刮完之后,这个小棉签就被送去实验室啦。
在实验室里,那些厉害的科学家叔叔阿姨就开始用各种神奇的仪器来分析。
他们就像侦探一样,要找出我们身体里关于乙醇脱氢酶基因的秘密呢。
那做这个检测有啥要注意的呢?哎呀,可不能在检测前吃一些奇奇怪怪的东西,要不然就会影响检测结果。
就好像你考试前不好好准备,那肯定考不出好成绩呀!而且一定要听医生的话,让你干啥就干啥,可不能调皮捣蛋哦。
这个乙醇脱氢酶基因检测到底有啥用呢?嘿嘿,用处可大啦!比如说,有些人喝酒就容易脸红,那可能就是他们身体里的乙醇脱氢酶基因有点不一样。
通过这个检测,就能知道自己适不适合喝酒。
这就像你买鞋子,得知道自己的脚多大,才能买到合适的鞋子呀!如果知道自己不适合喝酒,那就可以避免喝酒带来的不舒服和坏处。
多好呀!我还听说了一个实际案例呢。
有个叔叔,他以前不知道自己的身体情况,老是喝酒。
结果每次喝完酒就难受得不行,脸红得像个大苹果。
后来他去做了乙醇脱氢酶基因检测,才发现自己不适合喝酒。
从那以后,他就再也不喝酒了,身体也变得越来越好啦。
我觉得这个乙醇脱氢酶基因检测真的好棒呀!它能让我们更好地了解自己的身体,做出更正确的选择。
就像有个魔法棒,能帮我们找到身体的秘密宝藏呢。
咱可不能小瞧了这个检测哦,说不定啥时候就派上大用场啦!。
乙醇脱氢酶-1B(ADH1B)基因的生物信息学分析
乙醇脱氢酶-1B(ADH1B)基因的生物信息学分析
杨泽禹;张碧亮
【期刊名称】《卷宗》
【年(卷),期】2014(4)4
【摘要】本研究通过对ADH1B编码基因产物的亚细胞定位、信号肽、疏水性等预测,分析其基因编码蛋白的功能。
结果显示,ADH1B编码基因产物为亲水性蛋白,不具备信号肽和跨膜结构。
二级结构以α-螺旋与无规则卷曲为主。
序列分析表明,ADH1B基因编码产物很可能在免疫应答中起到关键作用。
【总页数】1页(P388-388)
【作者】杨泽禹;张碧亮
【作者单位】重庆邮电大学,重庆 400065;重庆邮电大学,重庆 400065
【正文语种】中文
【相关文献】
1.高分辨熔解曲线分析技术检测ALDH2和ADH1B基因多态性 [J], 姜树朋;童永清;赵锐;李艳
2.葡萄乙醇脱氢酶基因Ⅲ的电子克隆及生物信息学分析 [J], 武雪;黄晓丽;王喆之
3.ADH1B和ALDH2基因多态性与相关疾病研究进展 [J], 张晓敏;刘静;高世超;杨婷婷;王培昌
4.过表达ADH1B基因HepG2.2.15细胞株的建立 [J], 冯薛烟;丁向春;雒夏;董辉;赵志军;马丽娜;海龙;胡彦超
5.乙醇脱氢酶(ADH)家族生物信息学分析 [J], 石之光;叶磊;巩鹏涛;赵德刚;柳参奎
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松材线虫乙醛脱氢酶家族生物信息学分析
松材线虫乙醛脱氢酶家族生物信息学分析第一篇范文:松材线虫乙醛脱氢酶家族生物信息学分析松材线虫是一种有害生物,可以导致松树病害,对森林资源造成严重影响。
乙醛脱氢酶家族是松材线虫中一个重要的酶家族,其在生物代谢过程中起着关键作用。
本文对松材线虫乙醛脱氢酶家族进行生物信息学分析,以期为松材线虫的研究和防治提供参考。
一、乙醛脱氢酶家族概述乙醛脱氢酶(Alcohol Dehydrogenase, ADH)是一类具有催化乙醛氧化为乙酸的酶,广泛存在于生物体内。
乙醛脱氢酶家族包括多个成员,它们在生物代谢、信号传导等方面具有重要功能。
二、松材线虫乙醛脱氢酶家族成员鉴定三、松材线虫乙醛脱氢酶家族基因结构特征松材线虫乙醛脱氢酶家族成员的基因结构特征分析显示,这些基因均具有典型的启动子区域和编码区,且编码区由多个外显子和内含子组成。
通过比较不同成员的基因序列,我们发现它们之间存在一定的保守性,同时也具有一定的变异。
四、松材线虫乙醛脱氢酶家族成员功能预测五、结论第二篇范文:探索松材线虫乙醛脱氢酶家族的奥秘乙醛脱氢酶家族,听起来是不是觉得有些陌生?其实,这个家族在松材线虫的研究中起着非常重要的作用。
今天,我们就来揭开这个家族的神秘面纱,一起探索它在松材线虫世界中的独特地位。
首先,我们要了解乙醛脱氢酶家族的基本情况。
这个家族的成员都具有一个共同的功能,那就是催化乙醛氧化为乙酸。
听起来好像很简单,但这个过程中涉及到很多生物代谢、信号传导等方面的知识,对于维持生物体的正常运作至关重要。
对于这些家族成员的功能,我们还可以进行进一步的预测。
虽然目前还没有直接的实验数据支持,但是通过对乙醛脱氢酶家族在其他生物中的研究,我们可以推测这些成员在松材线虫的生长发育、适应环境等方面可能具有重要作用。
总结一下,我们从乙醛脱氢酶家族的新视角出发,揭示了它在松材线虫中的重要地位。
这个探索过程不仅让我们对乙醛脱氢酶家族有了更深入的了解,而且为我们的研究提供了新的思路和方向。
运动发酵单胞菌乙醇脱氢酶基因的克隆及在大肠杆菌中的表达
运动发酵单胞菌乙醇脱氢酶基因的克隆及在大肠杆菌中的表达陆坚;韦宇拓;黄鲲;黄日波【期刊名称】《工业微生物》【年(卷),期】2004(034)001【摘要】采用PCR技术,以基因组DNA为模板克隆得到运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)乙醇脱氢酶(alcohol dehydrogenaseⅡ)基因adhB,连接到表达载体pSE380上,得到重组质粒pSE-adhB.将此重组质粒转化到大肠杆菌菌株DH5α中,重组菌株经IPTG诱导后,在乙醛指示平板检测到乙醇脱氢酶活性.SDS-PAGE电泳结果显示出明显的40KD特异性蛋白质条带.重组菌株经诱导培养,每毫升发酵液酶活力为5u.【总页数】4页(P17-20)【作者】陆坚;韦宇拓;黄鲲;黄日波【作者单位】广西大学生物技术实验中心,广西,南宁,530005;广西大学生物技术实验中心,广西,南宁,530005;广西大学生物技术实验中心,广西,南宁,530005;广西大学生物技术实验中心,广西,南宁,530005【正文语种】中文【中图分类】Q81【相关文献】1.O139霍乱弧菌LPS基因和O抗原基因在大肠杆菌中的克隆表达及O抗原基因结构的初步研究 [J], 曲殿波;刘传暄;马清钧2.龋病替代疗法中乙醇脱氢酶基因在大肠杆菌中的表达 [J], 柳静;黄洋;张颖丽;周春华;欧阳红生;逄大欣3.运动发酵单胞菌丙酮酸脱羧酶基因的克隆及在大肠杆菌中的表达 [J], 陆坚;韦宇拓;黄鲲;汪嵘;黄日波4.香蕉中4条乙醇脱氢酶基因的克隆及表达分析 [J], 贾彩红;王卓;李建平;刘菊华;苗红霞;张建斌;金志强;徐碧玉5.大肠杆菌K-12转醛醇酶基因talB的克隆及在运动发酵单胞菌CP4中的表达 [J], 管于平;刘成;邹少兰;吴经才;张敏华因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
血清乙醇脱氢酶活性测定及其临床意义
血清乙醇脱氢酶活性测定及其临床意义卓孝福【期刊名称】《上海医学检验杂志》【年(卷),期】1998(013)002【摘要】本文建立一种用自动生化分析仪双试剂法检测血清乙醇脱氢酶(ADH)活性的方法。
同时对100例肝功正常者与9例原发性肝癌、10例肝硬化、40例肝炎患者测定血清该酶活性。
在反应体系中,NAD+和乙醇浓度分别为10.0mmol/L和25.0mmol/L,缓冲液为pH9.00的0.1mol/L甘氨酸-NaOH溶液。
ADH对NAD+和乙醇的Km值分别为1.67mmol/L和3.03mmol/L。
批内CV为0.7%~5.4%。
肝功正常者血清ADH活性为1.4±1.2U/L。
原发性肝癌为11.4±2.5U/L,肝硬化为4.6±1.5U/L 和肝炎为5.5±1.6U/L。
这些患者血清ADH活性显著高于肝功正常者。
原发性肝癌患者血清ADH活性显著高于肝硬化和肝炎患者。
这种简便、准确、灵敏的测定ADH活性方法可用于临床常规分析。
【总页数】3页(P84-86)【作者】卓孝福【作者单位】福建医科大学检验系【正文语种】中文【中图分类】R446.112【相关文献】1.大肠癌患者血清I型乙醇脱氢酶活性变化及意义 [J], 祝旭清;王国祥2.一种测定乙醇脱氢酶活性的循环催化流动分析法 [J], 王恒;李永生;高秀峰;田甜;林玉莲3.酶法血清乙醇测定试剂盒的初步评价及临床意义 [J], 陈金来;刘毅;郭姝;李忠信4.血清乙醇脱氢酶活性测定及临床应用 [J], 胡建强;刘凤兰5.血清乙醇测定试剂盒的初步评价及临床意义 [J], 丁玉仙因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
酒精脱氢酶表达
酒精脱氢酶表达
酒精脱氢酶(Alcohol dehydrogenase,ADH)是一种酶类蛋白质,能够催化酒精在生物体内的代谢过程。
ADH的表达水平受到多种因素的影响,包括基因表达、环境因素、药物等。
在基因层面,ADH的表达受到ADH基因本身的调控,以及其他相关基因的影响。
例如,ADH基因的表达受到转录因子的调控,如NF-κB、AP-1等。
此外,环境因素如温度、pH值、氧气浓度等也会影响ADH的表达。
在药物层面,某些药物可以影响ADH的表达。
例如,酒精、乙醇等物质可以刺激ADH的表达,而一些药物如丙磺舒、丙磺舒利福平、丙磺舒利福定等则可以抑制ADH的表达。
总之,酒精脱氢酶的表达受到多种因素的影响,需要综合考虑多种因素来确定其表达水平。
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乙醇脱氢酶―1B(ADH1B)基因的生物信息学分析
摘要:本研究通过对ADH1B编码基因产物的亚细胞定位、信号肽、疏水性等预测,分析其基因编码蛋白的功能。
结果显示,ADH1B编码基因产物为亲水性蛋白,不具备信号肽和跨膜结构。
二级结构以α-螺旋与无规则卷曲为主。
序列分析表明,ADH1B 基因编码产物很可能在免疫应答中起到关键作用。
关键字:ADH1B基因;生物信息学;结构与功能
乙醇脱氢酶乙醇氧化体系是肝脏中代谢酒精的一条主要途径。
乙醇脱氢酶氧化体系包括醇脱氢酶(ADH)和醛脱氢酶(ALDH)。
国内外研究发现ADH和ALDH都是多个同工酶组成的大家族,现有研究已发现ADH包括ADH1A、ADH1B、ADH1C、ADH4、ADH5、ADH6和ADH7共7个基因。
根据ADH同工酶的电泳泳动度、动力学特性、对酒精的亲和力和是否受四甲基吡唑的抑制将ADH分为5种类型,ADH1A,ADH1B和ADH1C为I型,ADH4,ADH5,ADH7和ADH6分别为Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ和V型。
ADH1B 和ADH1C还具有基因多态性。
1 分析原理与方法
从GenBank数据库中获得ADH1B基因及其同源蛋白质基因;采用DNAMAN及DNA Star软件预测分析理化性质;用ProtScale在线软件分析疏水性和亲水性;采用SignalP3.0预测蛋白信号肽;用PSORT Ⅱ软件进行亚细胞定位分析;用在线分析软件PBIL
和SWISS―MODEL预测二级和三级结构。
2 分析过程与结果
2.1 ADH1B基因编码产物的理化性质
用Bioedit及DNA Star分析软件对乙醇脱氢酶-1B(ADH1B)基因编码产物的理化性质进行预测,由ADH1B基因的氨基酸组成可知,ADH1B基因编码375个氨基酸,组成中最多的氨基酸是Val(缬氨酸),所占比例为10.40%;在pH7.0环境下其电荷量偏低、为-13.732;其理论分子量为39.833 kD,理论等电点为8.53。
2.2 ADH1B基因编码产物疏水性,亲水性预测
分析蛋白质的疏水性/亲水性由ExPASAy服务器的Protscale分析软件,采用K―D法预测。
分析氨基酸的得分可知。
多肽链第62位的亮氨酸(Leu)具有最高的分值(2.267),疏水性最强;第249位的赖氨酸(Lys)具有最低的分值(―2.244),亲水性最强。
整条多肽链表现为亲水性,因此可推断乙醇脱氢酶1B 是一种可溶性蛋白。
2.3 ADH1B基因编码产物的信号肽
采用丹麦技术大学生物序列中心开发的强大的信号肽检测工具SignalP对ADH1B基因编码产物进行分析,程序利用神经网络模型进行信号肽分析,并得到3种C、Y、S值计算结果。
分析知:ADH1B基因编码产物曲线的c值为0.11、Y值为0.123、S值为0.153。
基本可以推断ADH1B基因编码产物不存在信号肽。
利用TMHMM寻找ADH1B基因编码蛋白序列中是否有跨膜区域。
由图5可知,ADH1B基因编码产物序列的1-375都位于胞外,据此推断,BCRho3基因编码产物不含有跨膜结构域。
2.4 ADH1B基因编码产物亚细胞定位
通过PSORTⅡ工具预测ADH1B基因编码产物的亚细胞定位,结果表明,其分布在细胞质的可能性为39.1%,分布在细胞核的可能性为17.4%,分布在内质网的可能性为8.7%,分布在高尔基体的可能性为4.3%。
因此可推断,ADH1B基因编码产物主要在细胞质中发挥生物学作用。
2.5 ADH1B基因编码产物结构功能预测
通过Protfun软件预测ADH1B基因编码产物的功能,结果表明,该蛋白可能作为免疫应答来发挥作用的可能性最大,为0.406。
由此推断,ADH1B可能在免疫应答过程中具有调节作用。
2.6 ADH1B基因编码产物的二级与三级结构预测
采用PBIL分析软件预测ADH1B基因编码产物的二级结构。
结果表明,ADH1B基因编码产物主要由21.81%α-螺旋、22.61%延伸链和55.32%无规则卷曲组成。
由此可推断,α-螺旋与无规则卷曲是ADH1B最主要的蛋白质二级结构元件,延伸链则散布于整个蛋白质中。
应用Swiss-Model程序预测ADH1B基因编码产物的三级结构,以PDB数据库中的1u3u为模型进行同源建模,结果α-螺旋主要在内部,具有较大优势,无规则卷曲环包在外,构成具有球状蛋白。
3 结论
ADH1B由375个氨基酸组成,整条多肽链表现为亲水性,而且该蛋白没有信号肽,这与亚细胞定位预测结果该蛋白主要在细胞质中发挥生物学作用相符。
该蛋白没有跨膜结构,与三级结构分析的结果相符。
功能预测分析表明,ADH1B蛋白作为免疫应答来发挥作用。
本研究对大多数类型的预测均采用了多
种不同软件,它们预测的一致性具有较高的可信度,分析结果为深入研究ADH1B蛋白的分子结构及其功能奠定了基础,为今后进一步研究ADH1B基因的功能作用提供资料参考。
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