蛋白质-蛋白质相互作用

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蛋白质相互作用

荧光共振能量转移 (FRET)
原理：FRET在蛋白质相互作用研究旳基本原理是分别将bait蛋白、prey蛋白与相应旳供体荧光基团(如ECFP)和受体荧光基团(如 EYFP)融合优点：能检测到瞬时、较弱旳蛋白质相互作用；能同步检测到两蛋白旳细胞分布和作用位点。缺陷：光谱可能存在重叠，影响试验成果
研究蛋白质相互作用旳生物信息学措施
DD构造域4. SH构造域
相互作用区域是蛋白质相互作用旳构造基础
Interaction Domain-Structral basis for protein interaபைடு நூலகம்tion
PH构造域6. EH构造域
蛋白质相互作用旳试验技术
Chapter 2
9
蛋白质相互作用研究措施
酵母双杂交系统(Yeast two-hybrid system, Y2H)
串联亲和纯化(Tandem affinity purification, TAP
原理：老式旳TAP 标签蛋白由 Protein A、TEV蛋白酶可剪切序列和钙调蛋白结合肽(Calmodulin-binding peptide, CBP)构成。AP技术经过两步亲和纯化来降低非特异性蛋白结合。
蛋白质之间旳相互作用与其所具有旳特定构造域密不可分。经典蛋白质相互作用旳构造域是一种具有结合专一性旳独立折叠元件，能够插入新旳蛋白质中并保存结合靶部位旳能力。它们旳相互作用多是经过2个多肽表面几何构型和静电力而相互连接。
PDZ构造域LIM构造域DD构造域SH构造域PH构造域EH构造域
相互作用区域是蛋白质相互作用旳构造基础
谢谢大家！
生物信息学措施
02
蛋白质相互作用数据库
生物信息学措施
利用生物信息学措施能够从已知数据库中分析比较未知蛋白质旳功能及其有关旳相互作用蛋白。

蛋白质相互作用

蛋白质相互作用与代谢性疾病
蛋白质相互作用在心血管疾病中发挥重要作用，如动脉粥样硬化的发生和发展。
心血管疾病
蛋白质相互作用也与自身免疫性疾病的发病有关，如类风湿性关节炎和系统性红斑狼疮中的免疫细胞信号转导。
自身免疫性疾病
蛋白质相互作用与其他疾病
蛋白质相互作用的干预策略
06
基于小分子的干预策略
总结词：通过小分子调节蛋白质相互作用，改变蛋白质复合物的组成或活性，从而调控细胞功能。
蛋白质相互作用与神经退行性疾病
肥胖症
蛋白质相互作用也与肥胖症的发生有关，如脂肪细胞分化、脂肪代谢等过程中的蛋白质相互作用。
非酒精性脂肪肝
蛋白质相互作用还涉及非酒精性脂肪肝的发病机制，如脂肪酸氧化和甘油三酯的积累。
糖尿病
蛋白质相互作用在糖尿病的发生发展中起到重要作用，如胰岛素与其受体之间的相互作用和信号转导。
蛋白质磷酸化修饰对相互作用的调控
去乙酰化酶抑制剂可以抑制去乙酰化酶的活性，从而增强乙酰化修饰的作用，促进蛋白质相互作用。这些抑制剂在癌症治疗和其他疾病治疗中具有潜在的应用价值。
乙酰化是一种通过将乙酰基团添加到蛋白质的特定氨基酸残基上，如赖氨酸和精氨酸，来调节蛋白质活性和功能的过程。这种修饰通常由乙酰化酶和去乙酰化酶催化。
结构生物学方法
VS
通过计算机模拟蛋白质的动态行为，预测蛋白质相互作用的模式和稳定性。
序列比对和进化分析
通过比较不同物种间同源蛋白质的序列差异，推断相互作用的可能性和进化关系。
分子动力学模拟
计算生物学方法
蛋白质相互作用网络
03Biblioteka 通过将两个蛋白质分别与两个转录激活因子融合，在酵母细胞中检测它们之间的相互作用。

生物学中的蛋白质相互作用

生物学中的蛋白质相互作用生物学是一门研究生命现象的科学，其中最基本的单位是细胞。

而蛋白质是细胞内的基本分子，它们在细胞内担负着各种各样的功能，甚至可以说是生命的基础。

在细胞内，蛋白质与蛋白质之间相互作用，进而调节和控制着细胞的生命现象。

而这些相互作用的本质，就是蛋白质相互作用。

蛋白质相互作用可以分为许多种类，最常见的就是酶-底物互作用、配体-受体互作用、蛋白质-蛋白质互作用等。

这些互作用通常涉及到蛋白质的空间结构和化学性质，其中最为关键的就是氨基酸残基之间的相互作用。

氨基酸残基是构成蛋白质的基本单位，它们通过不同的键和相互作用连接在一起，形成了蛋白质的空间结构。

蛋白质的功能往往取决于其空间结构，而氨基酸残基之间的相互作用则是维持蛋白质空间结构的重要原因之一。

常见的氨基酸残基相互作用包括疏水作用、离子键、氢键、范德华力等。

其中，疏水作用是最为普遍的一种相互作用，它可以使得氨基酸残基在水中更倾向于聚集在一起，从而促进蛋白质的折叠和稳定性。

而离子键、氢键等相互作用则可以提供更多的交错和穿插方式，进而使得蛋白质的空间结构更加多样化和灵活。

除了氨基酸残基之间的相互作用外，蛋白质之间的相互作用也是生物学中不可或缺的一部分。

例如，许多酶就是由多个蛋白质组成的复合体，它们之间的互作用可以调节酶的活性和催化效率。

同样，许多细胞信号途径也是由多个蛋白质组成的复合物，它们之间的相互作用可以促进信号传递和细胞功能的调节。

在研究生物学中的蛋白质相互作用时，科学家通常会利用许多实验手段进行研究。

例如，X-射线晶体学可以用来测定蛋白质的空间结构，核磁共振技术则可以用来研究蛋白质之间的相互作用。

此外，还可以利用生物芯片技术、蛋白质亲和层析技术等工具来探究蛋白质之间的互作性质和生物学功能。

最近几年，人工智能技术的发展也为研究蛋白质相互作用带来了新的突破。

例如，深度学习、机器学习等技术可以用来预测蛋白质之间的相互作用，并探究它们的生物学功能。

蛋白质蛋白质相互作用

– Limited number of genomes
• Zheng et al. 2002
– 更多的基因组能够获得更多的功能相关蛋白结果 – 对于系统发育方法预测蛋白功能的准确性可能有基因组数量上限。
Discussion
• 参考基因组的数量确实能够影响预测能力
– 数量较少的基因组:18 or 35 – 多一些的基因组 :86 – 更多的基因组 :162
种的基因组。
这些选定的参考基因组用于其后的计算
系统发育谱的局限
➢ 仅能预测拥有全基因组序列的物种. ➢ 对于一些关键蛋白和共有蛋白中，由于在
多数物种中没有系统发育树差别，而无法判断蛋白之间的相关性。
电子预测蛋白质相互作用方法的评估
评估PPI 数据的重要性
• 假阴性和假阳性
– 蛋白质相互作用的动力学本质. 蛋白表达和相互作用模式在不同生物学条件下是不同的,而目前所有的实验方法或计算方法都不能做到动态检测或预测, 因此只能对真实存在的蛋白质相互作用, 得到一个粗略的描述
– 把一个配体通过化学交联的方法结合在固相载体上，让蛋白混合液流过固相载体，能够与配体结合的分子具有较高的亲和力，通过适当的洗脱条件将亲和力弱的分子洗脱掉，这样与配体亲和力较高的分子就被纯化了出来。
– 纯化出的分子随后用凝胶电泳的方法分离，用质谱的方法鉴定是什么蛋白。
Eur. J. Biochem. 270, 570-578 (2003)
Mirror Trees Method
该方法的假设前提是：相互作用的蛋白可能是共进化的。方法是：计算包含不同物种的蛋白质家族间的进化距离，构建各自相应的进化树，在进化树之间相似性距离的基础上，构建镜像树，然后由镜像树之间的相似性距离和蛋白质在镜像树上的位置确定蛋白质之间的两两相互作用。

蛋白质互相作用

蛋白质互相作用蛋白质是生物体中最重要的有机物之一，它在细胞的结构和功能中起着关键的作用。

蛋白质的功能多种多样，其中一个重要的方面就是它们能够互相作用。

蛋白质互相作用是指两个或多个蛋白质之间发生的相互作用过程，这种相互作用可以是直接的物理接触，也可以是通过介导分子的参与。

蛋白质互相作用的形式多种多样，下面将介绍几种常见的蛋白质互相作用方式。

首先是蛋白质之间的结合作用。

蛋白质可以通过结合形成复合物，这种结合可以是非特异性的，也可以是特异性的。

非特异性结合是指蛋白质之间的结合是非选择性的，主要由静电相互作用和疏水作用驱动。

而特异性结合是指蛋白质之间的结合是选择性的，通过特定的结合位点进行结合。

这种结合可以是酶与底物的结合，也可以是抗体与抗原的结合。

其次是蛋白质之间的相互调节作用。

很多蛋白质在细胞内发挥作用时需要与其他蛋白质发生相互作用来调节其活性或功能。

例如，激酶与磷酸酶之间的相互作用可以调节信号转导通路的活性，从而影响细胞的功能。

另外，蛋白质可以通过与转录因子的结合来调节基因的转录水平，进而影响细胞的功能和发育。

蛋白质还可以通过互相激活或抑制来调节彼此的活性。

例如，一些酶可以通过与其他蛋白质的结合来增强其催化活性，这种现象被称为酶的激活。

另外，一些蛋白质也可以通过与其他蛋白质的结合来抑制其活性，这种现象被称为酶的抑制。

蛋白质互相作用还可以通过形成蛋白质复合物来实现信号传递。

在细胞内，许多信号分子需要通过与蛋白质的结合来传递信号，从而触发下游的信号通路。

例如，细胞表面的受体蛋白质可以通过与配体结合形成复合物，从而激活下游的信号通路，影响细胞的功能。

总的来说，蛋白质互相作用是细胞内各种生物功能的基础。

蛋白质之间的相互作用可以调节蛋白质的活性和功能，进而影响细胞的生理和病理过程。

深入研究蛋白质互相作用的机制和调控方式，对于理解细胞的功能和疾病的发生机制具有重要意义。

希望通过今天的介绍，大家对蛋白质互相作用有了更深入的了解。

蛋白质相互作用

荧光共振能量转移 (FRET)
原理：FRET在蛋白质相互作用研究的基本原理是分别将bait蛋白、prey蛋白与相应的供体荧光基团(如ECFP)和受体荧光基团(如 EYFP)融合
优点：能检测到瞬时、较弱的蛋白质相互作用；能同时检测到两蛋白的细胞分布和作用位点。缺点：光谱可能存在重叠，影响实验结果
Interaction Domain-Structral basis for protein interaction
相互作用区域是蛋白质相互作用的结构基础
1. PDZ结构域
2. LIM结构域
Interaction Domain-Structral basis for protein interaction
免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation, Co-IP)
原理：利用抗体和抗原之间特异性的识别和结合，通过亲和纯化，分离出抗原蛋白和单克隆抗体。优点：保留蛋白质的修饰和结合状态，同时所需的样本量较少。缺点：Co-IP特异性较低
双分子荧光互补 ( BiFC)
原理：将荧光蛋白分成两个无独立功能的片段，分别与 bait 蛋白和 prey 蛋白融合表达。优点：能简单方便地通过观察荧光鉴定蛋白质相互作用缺点：不能实时反应蛋白质的结合和分离情况。
临界值内。如果两个结构域中至少有五个原子的距离在 5 Å 之内，那么这两个结构域之间存在相互作用。
Full Atom Contact (FAC) PSIMAP 方法 Sampled Atom Contact (SAC) PSIMAP
最精确
节约时间和搜索空间
Bounding Box Contact (BBC) PSIMAP
9

蛋白质相互作用和调控与表达调控之间的关系是什么

蛋白质相互作用和调控与表达调控之间的关系是什么蛋白质是生物体内起重要作用的分子，它们在细胞内参与了众多生物过程的调控和传递信息的功能。

蛋白质相互作用（protein-protein interaction, PPI）在细胞内起到了至关重要的作用，它能够调节蛋白质的结构、功能和位置，并参与到诸如信号传导、代谢调控、细胞周期等生物过程中。

蛋白质相互作用是指两个或多个蛋白质分子之间通过物理或化学交互作用而形成的复合物。

这些相互作用可以是直接的，也可以是间接的，通过其他辅助因子的参与。

蛋白质相互作用的结构包括蛋白质与蛋白质之间的非共价键相互作用，如氢键、范德华力、电荷相互作用等。

这些相互作用能够使蛋白质以特定的构象相互作用，并在细胞内形成特定的功能模块。

蛋白质相互作用的调控与蛋白质的表达调控密切相关。

在细胞内，蛋白质的表达调控是通过转录水平和翻译水平的调控来实现的。

在转录水平上，包括转录因子、信号分子、环境激素等调控因子的作用，它们能够调控蛋白质基因的转录速率和转录的有效性。

而在翻译水平上，包括核酸结构、转录后修饰等因素的参与，它们能够调控蛋白质的翻译速率和翻译的准确性。

蛋白质相互作用的调控与表达调控之间的关系可以通过多个角度来解释。

首先，蛋白质相互作用的调控可以影响到蛋白质的表达水平。

例如，一些转录因子在与其他蛋白质相互作用后能够增强或抑制其转录活性，从而影响目标基因的表达水平。

这种相互作用可以通过改变转录因子的亲和力或稳定性来实现。

其次，蛋白质相互作用的调控也可以影响到蛋白质的翻译水平。

举例来说，一些蛋白质在与其他蛋白质相互作用后能够影响到其翻译的速率和准确性，从而影响到蛋白质的表达水平。

此外，蛋白质相互作用的调控还可以通过改变蛋白质的功能、结构或位置来实现对表达调控的影响。

蛋白质相互作用可以使蛋白质产生构象变化，从而增强或抑制其功能。

此外，蛋白质相互作用还可以使蛋白质与其他蛋白质、DNA或RNA结合，从而改变其结构和位置，进而影响到其表达及功能调控。

关于异源二聚体

二聚体是蛋白质-蛋白质相互作用的一种形式,它可以定义为两个有关的亚单元组成一个蛋白质-蛋白质复合物.如果组成二聚体的两个有关的亚单元是相同的则为同源二聚体,反之为异源二聚体.二聚作用是调节信号转导的一种常见形式.发生二聚作用的蛋白质彼此接近,使得它们可以相互作.二聚作用还有另外一个重要意义,即它不仅仅是简单地将相互作用的分子拉近,而且它还能使底物与酶的活性位点以更适合催化作用的方位相互楔合,这就大大增加了反应速度.配体诱导受体二聚作用的机制有多种,有的配体本身就是二聚体,它们含有两个结合受体的表面.比如,PDGF是以二硫键连接的二聚体,有三种不同的异构体:A链同源二聚体，B链同源二聚体和AB异源二聚体.A链以高亲和力与PDGF受体a 亚基结合;B链以相同的亲和力与 a 和b 亚基结合.因此,AA产生a －a 受体同源二聚体,AB产生a －a受体同源二聚体和a －b异源二聚体,BB则产生所有可能的组合.这里所说的是亚单元,即组成某一整体的其中一个部分,该部分单独存在时可能是一个具有独立功能的单位,而不是亚基.当然由一个亚基组成的蛋白质就等同于这里所说的是亚单元.二聚作用是蛋白质-蛋白质相互作用的一种形式.在调节信号转导方面,二聚作用一般具有一下作用或功能: 1 接近和定向:发生二聚作用的蛋白质彼此接近,使得它们可以相互作用.最普通的例子就是下面将论述的细胞表面受体的二聚作用,它激活了细胞内信号转导通路.不仅如此,受体二聚作用还能够将与受体结合的蛋白质拉近.比如,有一些激酶与细胞因子受体的胞内域非共价地结合,受体二聚就激活了它们的磷酸化作用.胰岛素就是一二聚体,以用胰岛素受体信号的激活为例,在与配体结合前,胰岛素受体的两条链都有不同的,很高的局部浓度;但是,它们都只有低效的体积摩尔浓度,因此不足以发信号.因此,在结合配体并发信号时,它们之间需要重新定位,这可以通过两条链在细胞膜上以二硫键连接,形成二聚体来实现.所以,二聚作用既改变了胰岛素受体的局部浓度,又改变了它们之间的方位.2异源二聚的差示调节作用:二聚蛋白质通常隶属于其成员能够交互二聚的蛋白质家族.如果一个蛋白质有许多个二聚搭档,则所形成的各种二聚体将会有完全不同的功能.此时,在细胞内这些蛋白质的相对浓度,和它们之间相互作用的相对强度将决定谁是最主要的二聚体品种,当然,这也决定了它们产生的生物学的结果将会如何.这就是二聚作用的差示调节.3增强专一性相对于单体而言，二聚作用的结果一般会形成更大的蛋白质相互作用表面。

蛋白-蛋白相互作用研究方法的原理

¾ are on/off or temporary in nature ¾ typically require a set of conditions that promote the interaction. ¾ be strong or weak, fast or slow
Capturing these momentary contacts to study which proteins are involved and how they interact is a significant goal of proteomics research today.
蛋白质-蛋白质相互作用研究法的原理简介
张海燕 20101102
Why study protein interaction?
¾ Genome sequences identify tens of thousands of genes: linking these to 200-300 core biological processes will make their study manageable.
饰） ¾ Certain cofactors or additional proteins needed, and etc.（需有额外蛋白或
共因子才能结合的蛋白）
Technique Extention 1
yeast mating type
Transformation is improved by using a and αhaploid.
¾ Recently developed and/or improved technologies and methodologies make studies of large complexes more feasible and informative.

蛋白相互作用

百泰派克生物科技
蛋白相互作用
蛋白相互作用是指两个或两个以上的蛋白质形成蛋白质复合体或多蛋白网络的现象。

单一的蛋白质难以发挥复杂的生物学功能，通常需要多个蛋白相互结合实现复杂的细胞学功能。

生物体内的蛋白质-蛋白质相互作用主要以3种形式存在：形成多亚
基蛋白质四级结构（血红蛋白4个亚基的装配）、蛋白复合体（病毒外壳）以及瞬
时蛋白质-蛋白质相互作用。

研究蛋白相互作用的方法有很多，可以分为体外和体内两类。

体外的方法主要有蛋白质亲和层析、免疫（共）沉淀、（GST）Pull down、蓝色非变性胶技术（BN-PAGE）亲和印迹、蛋白芯片、核磁共振谱分析等。

体内的分析方法包括酵母双杂交、共聚焦显微技术和流式细胞分析技术等。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台结合Nano-LC提
供蛋白质互作分析服务技术包裹，可对IP、Co-IP样品及GST融合蛋白Pull-down
等纯化样本中的蛋白/蛋白混合物的质谱鉴定分析，欢迎免费咨询。

蛋白质相互作用研究方法

•免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation, Co-IP)
•双分子荧光互补(Bimolecular fluorescence
complementation, BiFC)
•荧光共振能量转移(Fluorescence resonance energy
transfer, FRET)
荧光共振能量转移(FRET)
BD
UAS
AD
lacZ
两种待检测蛋白(X、Y)分别和AD、BD 融合表达, X与Y之间的相互作用就可以将BD和AD在空间结构上重新联结为一个整体而与报告基因的上游激活序列（upstream activation sequence）结合，进而发挥激活转录的功能，使受调控的报告基因得到表达。
UAS
且易出现假阴性。
谢谢
•免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation, Co-IP)
•双分子荧光互补(Bimolecular fluorescence
complementation, BiFC)
•荧光共振能量转移(Fluorescence resonance energy
transfer, FRET)
免疫共沉淀
两种蛋白在细胞内发生相互作用时会形成两种蛋白的复合物，这样就可以先用一种蛋白的抗体把免疫复合物沉淀下来，然后用另一种蛋白的抗体进行Western blotting 检测。
免疫共沉淀
优点：可以保留蛋白质的修饰和结合状态，同时所需
的样本量较少,实验成本较低，减少了纯化步骤，能检
测到瞬时和较弱的蛋白相互作用；缺点：Co-IP特异性较低，洗脱混合物中往往含有较多的非特异结合蛋白。因此，Co-IP 检测到的潜在相互作用蛋白需要通过BiFC、FRET 等其他方法进一步验证。

蛋白质相互作用研究方法

L/O/G/O
Thank You!
基本原理：将TAP标签融合到目标蛋白上，然后经过两步亲技术进一步分析鉴定。
优点:操作方便、结果真实，兼具融合蛋白亲和色谱法和免疫共沉淀两种技术的优点，避免了非自然条件下的蛋白质相互作用和杂蛋白的干扰。T AP能保留蛋白复合物在细胞内的修饰和结合状态。
蛋白质-蛋白质相互作用研究方法
1.体内研究方法（in vivo）
（1）酵母双杂交系统(Y2H) （2）生物分子荧光互补技术（BiFC）（3）荧光共振能量转移法（FRET)
2.体外研究方法（in vitro）
（1）免疫共沉淀法（co-IP）（2）GST融合蛋白pull-down技术（3）串联亲和纯化（TAP）技术（4）蛋白质微阵列（Protein microarrays）
引言
目前，越来越多的高等植物基因组序列被测定出，但很多基因的功能尚不明确。基因功能的研究必将定位的蛋白质功能的研究中去，然而，蛋白质功能的发挥不是凭借单个蛋白质独立执行，而是依靠蛋白质与蛋白质相互作用(protein-prot ein interaction,PPI)执行其功能，忽略蛋白之间的结构和功能联系，很难全面了解蛋白质的功能。为更好地揭示蛋白质的功能，必然要通过蛋白相互作用研究方法来阐明植物蛋白作用的复杂网络系统。大规模的蛋白质相互作用技术对于准确理解蛋白质功能、揭开各种细胞活动的奥秘具有重大的意义，势必会引导蛋白质组学的发展进入一个全盛时期
生物分子荧光互补技术（BiFC）
基本原理：将荧光报告蛋白按照规则分成没有荧光的两个片段作为标记分子，将标记分子分别与诱饵蛋白和捕获蛋白融合并在细胞内共表达，只有在诱饵蛋白和捕获蛋白发生相互作用的情况下，两段不完整的荧光报告蛋白才会形成完整的报告蛋白，发出荧光。优点:能检测到活体内蛋白质间相互作用发生的时间、位置、强弱,以及所形成蛋白质复合体的稳定性,特别适用于在生理条件下实时、直接、快速地对细胞内瞬时的、弱的蛋白质相互作用进行动态检测.可以在多种细胞内进行，不依赖外源的荧光素或显色剂等,能够直接报道蛋白质相互作用在细胞中发生的位置，追踪蛋白相互作用的动态过程，利用多彩的BiFC 系统还可在1个细胞内研究多种蛋白质间的相互作用，是目前最灵敏的PP I检测方法。缺陷:多个BiFC系统对温度敏感，融合蛋白必须为可溶性表达，表达量过高会引起非特异性。

蛋白质的相互作用研究方法课件.ppt

蛋白质的相互作用研究方法课件
四、Bimolecular Fluorescent Complementation
蛋白质的相互作用研究方法课件
蛋白质的相互作用研究方法课件
五、Yeast Two－Hybrid Systerm
蛋白质的相互作用研究方法课件
1.原理酵母双杂交系统由Fields和Song等首先在研究真
蛋白质的相互作用研究方法课件
蛋白质的相互作用研究方法课件
2008年诺贝尔化学奖
蛋白质的相互作用研究方法课件
GFP主要应用: • 对活细胞中的蛋白质进行准确定位及动态观察
可实时原位跟踪特定蛋白在细胞生长、分裂、分化过程中或外界刺激因子的作用下的时空表达, 如某种转录因子的核转位、蛋白激酶C的膜转位等。
GFP基因与分泌蛋白基因连接后转染细胞, 可动态观察该分泌蛋白分泌到细胞外的过程
GFP基因与定位于某一细胞器特殊蛋白基因相连,就能显示活细胞中细胞核、内质网、高尔基体、线粒体等细胞器的结构及病理过程。
膜蛋白的移动（Fluorescence Recovery After Photobleaching FRAP ） • 蛋白之间的相互作用（FRET） • 报告分子将GFP的基因连在特殊的启动子的后面，可以检测基因表达的时间和部位。
容易检测分子量小
Douglas Prasher was the 不需要其它底物
first person to realize the potential of GFP as a tracer molecule.
Douglas Prasher 1992 克隆了GFP基因
蛋白质的相互作用研究方法课件
核基因转录调控中建立。典型的真核生长转录因子，如GAL4、GCN4、

蛋白质与蛋白质的相互作用

蛋白质与蛋白质的相互作用蛋白质是由@-氨基酸按一定顺序结合形成一条多肽链，再由一条或一条以上的多肽链按照其特定方式结合而成高分子化合物。

蛋白质在酸性、碱性、酶等发生水解，在水解的过程中生成多肽，但水解的最终产物都是氨基酸。

蛋白质还有盐析、变性等性质。

蛋白质与蛋白质的相互作用是功能复合物的基础（如线粒体内膜呼吸链)。

蛋白质的表达水平、存在方式及相互作用等直接与生物功能相关，在所有生命活动中，蛋白质之间的相互作用是必不可少的，它是细胞进行一切代谢活动的基础。

蛋白质的相互作用能产生许多效应，例如它可以改变蛋白质的动力学特性、形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、使蛋白质失活、改变蛋白质对其作用底物的专一性等等。

蛋白质与蛋白质相互作用的研究方法较多，目前比较成熟的，有酵母双杂交技术（Y2H）、噬菌体展示技术（PDT）、融合蛋白沉降技术、亚细胞共定定位、免疫共沉淀技术、荧光共振能量转移技术、表面等离子共振、蛋白芯片技术（抗体与蛋白质整列技术）以及融合蛋白亲和色谱法等。

目前，应用于蛋白质的相互作用的研究方法有生物物理学、分子生物学、遗传学等方式。

一、酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重要方法。

其原理是当靶蛋白和诱饵蛋白特异结合后，诱饵蛋白结合于报道基因的启动子，启动报道基因在酵母细胞内的表达，如果检测到报道基因的表达产物，则说明两者之间有相互作用，反之则两者之间没有相互作用。

将这种技术微量化、阵列化后则可用于大规模蛋白质之间相互作用的研究。

在实际工作中，人们根据需要发展了单杂交系统、三杂交系统和反向杂交系统等。

Angermayr等设计了一个SOS蛋白介导的双杂交系统。

可以研究膜蛋白的功能，丰富了酵母双杂交系统的功能。

此外，酵母双杂交系统的作用也已扩展至对蛋白质的鉴定。

二、噬茵体展示技术在编码噬菌体外壳蛋白基因上连接一单克隆抗体的DNA序列，当噬菌体生长时，表面就表达出相应的单抗，再将噬菌体过柱，柱上若含目的蛋白，就会与相应抗体特异性结合，这被称为噬菌体展示技术。

蛋白质与蛋白质相互作用的技术

蛋白质与蛋白质相互作用的技术
蛋白质与蛋白质相互作用的技术主要包括酵母双杂交技术、免疫共沉淀技术、荧光能量转移技术、噬菌体展示技术等。

这些技术可用于研究蛋白质之间的相互作用，从而深入了解生命活动的机制。

1.酵母双杂交技术：这是一种有效的筛选蛋白质相互作用的方法，尤其适用
于大规模蛋白质之间相互作用的研究。

通过将目标蛋白与报告基因连接，在酵母细胞中检测报告基因的表达，可以确定目标蛋白与其他蛋白的相互作用。

2.免疫共沉淀技术：利用抗体与抗原之间的特异性结合，将目标蛋白与其他
相关蛋白一起沉淀下来，然后通过Western blot等技术对沉淀的蛋白质进行分析。

通过这种方法可以检测到目标蛋白与其他蛋白质的直接相互作用或者间接相互作用。

3.荧光能量转移技术：一种高灵敏度的检测蛋白质相互作用的方法。

该技术
利用荧光物质标记目标蛋白，通过检测荧光物质之间的能量转移，来间接检测蛋白质之间的相互作用。

4.噬菌体展示技术：将外源基因插入噬菌体外壳蛋白基因的技术，使外源基
因编码的蛋白质与噬菌体外壳蛋白融合，并在噬菌体表面展示出来。

通过该技术可以筛选与目标蛋白相互作用的蛋白质，并对相互作用进行定量分析。

蛋白质和蛋白质相互作用

蛋白质和蛋白质相互作用蛋白质和蛋白质之间的相互作用，这可真是个有趣的话题哦！想象一下，咱们的身体就像个大派对，蛋白质们就像那些跳舞的小伙伴。

每个蛋白质都有自己独特的舞步和风格，有的喜欢摇摆，有的则喜欢转圈，反正都是为了搭配得天衣无缝。

你看啊，这些蛋白质不光是为了装饰的，它们可都是干活的能手。

比如说，肌肉里的肌动蛋白和肌球蛋白，它们就像一对默契的舞伴，密切合作，让我们能够动得像风一样自由。

再说说免疫系统里的抗体，它们就像超级英雄，专门来对付那些不速之客。

每当细菌或者病毒来捣乱，抗体们立马就上场了，找到目标，像鹰眼一样精准无误。

这可不是随便的相遇哦，它们之间的相互作用就像老朋友见面一样自然，真是“情投意合”！每个抗体都有自己擅长的领域，像拼图一样，找对了位置，才能把事情办得妥妥的。

说到这里，蛋白质之间的互动有时就像恋爱一样，开始时小心翼翼，生怕碰到对方，但一旦熟悉了，就能碰撞出火花。

比如，酶和底物之间的关系。

酶就像是化学反应的催化剂，没它们的帮忙，反应可就像牛顿的苹果一样，难以掉下来。

这种“配对”也真是讲究，得要形状合适，才能顺利结合，不然就像试图把圆形塞进方形的盒子里，结果只能是闹笑话。

再来聊聊信号传递吧，这就更有意思了！细胞之间通过蛋白质来传递信息，像传递小纸条一样。

想象一下，一个细胞说：“嘿，你知道吗？外面来了个坏蛋！”然后通过一系列的蛋白质传递到另一个细胞。

这个过程简直像过家家，有些蛋白质负责接收，有些负责转发，分工明确，毫无混乱。

就好比一个社区的警报系统，谁碰到了坏事，立刻就会有信号传递到每个角落。

这时候我们还得提到转录因子，它们可是调控基因表达的高手。

想象一下，转录因子就像一个乐队的指挥，挥舞着指挥棒，决定哪一段乐曲该被演奏。

只有在适当的时机，适合的蛋白质才会被“召唤”出来，参与到各项工作中。

它们就像精确的时钟，每个时刻都有不同的“乐章”，整个过程如同一场精彩的表演，让人目不暇接。

而在细胞膜上，受体蛋白又是另一种风景。